|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000107_pilon:401929..411894+ Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13472.1.p1 ID=MSTRG.13472.1.p1|Name=MSTRG.13472.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9966bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107_pilon:401929..411894+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAAATCGAGTGCGTTTGCGCAGTCGTGGTGCAATCAAATATGGGGCATTT
TTTCTCGCACATGAGTCTTTTTACCACATAGTTGTTGGCGAGAGAGAAGT
TGAAAGACATATCTCCAGTTTAAAATCAGTCAAGATGCAAATCTTTGTGC
AGGGACAAGAAACTAATGTTTATGATGTCAGCCCATCAGTCTCTGTTGCT
GATTTGAAAGAATTAATCGCCTTCAGAAGTGGTGTACATGCTGAAAACCA
AGTTTTGACATATGCTGGACGTGCCTTGGAAGATGAAAATGCCCTTTCAG
CTTACGAACTTGCTGCTGAATCCACCATTTCTCTTGGTCTCCGAATGCTT
GGaggtaaaattttcaattataattggGTGAGGCAGGGAATATTGGAGGG
TAAAGAGCTAAAATACAGCCAAATATTTTGGAGGATCTGATGTGTTTggg
ggaggggggTTTTGGAACTTCAATGGCAAGGCTGGAGCTGACTTTTTctt
ctattatttttctttatatcacCACATTTCTATTCAAAAAGCTTTCATTT
TACAGTCTATTGATTCTGTTTGTTGTTTTCACTTGTGTCTACCATCTTga
ttaggggtcactcacatatcgattcttcccacgactaacgtcaaattgac
gctaatttgaaaacccccccacccccacctcttaacgtcaaagttcaaaa
attatcaaaactctaaattttctgCTTCACTTTCATCaatgtttcgtcag
ccatctttattTTCGCTACGGCTTGCTCAGGCAGAGACTTTTTTAAGTCG
GAAAAACGTCGGATTTTTATAAGTATAATATAGTCCCAGCTTTATCCCAC
TTTTAGTGAaccttcctataccttttgtccttcagaaaagcCAAAAACAT
TAGCCTTAATCCTTTGCTTGCAgctcctgtagccagtagtgtgaccccct
gtattatTCATTTTAATTCGACACCACTTTTCTCGCCACCATCTTGAATT
TAtgtcactttcgctttctctagtccaataagacacgGCGATTTGAGTCA
CGTGAGTCAAATTGcgtgtcttattggactagagaaagtgaaagtgaaat
ccCACGATCtaattggatgaaaaaattattgtgtGAACTGGGGCTGAATa
taattctcattttaaattcaagatggcggcaagaAAAGTACGTCTTTTTG
CTTTGgaaaaaatgttgtaaattctggttgattttaaggttttttcctCT
TCTCTCATTTACTTTGATTAGTATaggcttcttcaattttttgggAAGGT
AAgtttataaaagttatttgtttttcggtgtgACTCTAGCGTAGCTTTTC
AAATGTTCCGATAGATTTGATTTTCGCCCGACTCATGgtttgaaaatcca
tttttccgacgttttttttgccgaccgaccgactcgttttttagacctaa
aaacgacgcgaacacaagttatttgtgatgccCGCCTTAGTTCTAATTAG
GAATATTTACAAGCGTAATAAtttcccgcacttttttatccgcgcttttt
ttcttcttgtcgccacctgtgtttttttactttgttcATTCATTGGTGTG
TAGATAGGGCAATACACCCGCGTTTGTTTTTGTCGCGGGTAATAGAACAT
TTTTCTAAATGTCATAACTCAAGACTCCATCCATATTACtgtatcaaact
ttcaaaatttgctCTACACACTAAATTCTTTCATTGGAGGCTGATAAGAA
TCTGcggaaatttgtatttttggaaaaaaactggaaattcgatatatatt
cttaattaggattgaaaaacaaagggataatcctaattaagaaagtctgt
gcgatcgaaaaaaaatttgcttaatTAGGATAGAACTCCTAACTGACAGT
GGAATGCACATTTTCctgggccatttctgagaagttgaAATTACGGGAAA
GTCTTATTAACCATTAACCAATATACTCCTAATAAACCATGCCATATCTT
TACATctgttactttaatgggataaactttcgcagggattaatttttgct
gatttcgcggatttgggtgtcatccgcgaaaatccgttaaatatttctaa
tcaaaactcaaaatatgtcaagtAAAcattttgaatggttacttgcatca
aaaaaGCGCAAACAATGTGTAATTCAACAACCAATGTGCATGATTTGACA
TTATAAAGatacaaaattgtgaaaataggcccaaccgcgaaatttaatcc
ccacgaaATGTTATCCAATTAAATTAATAAGCTCATTACATTGTTGTACA
GAAGAATTCAATTTCAATATATTAACttaatcatagtcattataaaaaca
caggTCTGGaagcatagtgtcctccagggtttgttcccccccaccaaatt
cttagatcatcatcaatgtgaaaaaatttttcaaaaatattcattcaatc
aaaagatatcaaaGAAAGTTTATTGCTGGTTGACTCTATAAAATAGTAAA
AACTGGTAAAAAACGACAAAAAAACAGCCTTTTGTCGATCAACCAGCAAT
AAACTTTGtttgatatcttttgattgaatgaatatttttgaaaaattttt
tcacattgatgatgatctaagattgaagagtcactcctgtgaaaatggta
attataccacatttctacaaaaagttgatttttttcttcttcatttttca
ttttcattttcctttttttctcgatttttttacttgataatgtTCCACTC
GCAAATATTTTAACAAGCActtaatcgcaacttgattcaaactctatcaa
aagttacagccatttttttctctccagctgcaaattatttcgagacagac
tttaagagcattttcaattataaattgtcaattacccccaagtaaggctc
actcacTCCTTTgtcaaaaatgccattttactTGAGACGTACGTATTAAA
TGTttaatctagtctgaattaggatcctaacctaagaatgctgtaagaat
attttaggatgattttctcaaaaaagttaagaatatccatgatgaaatgg
atttacaccattcttataaaaaaagcgtgtatgtaataaaggtccgaacc
aaacgatttgaattcgaaattttcttcaactgaTGGGGGGataaaaaagt
acgtacttaccagggggGTACAGCTATTTGCGTACGCTTGTGTACAGGGG
AGGGGGtactcaatttttgacattttaatgtgGACGACCCCTAATGGAAA
ATATATCCAACCCTTTTCTACATGTTTGCAGAAACATGTTAATTTCCCTA
GTTATAAAACAGATActgcatttaaaaaaagagaaaataatccATTTTTC
CAACATTTCAACTGACTCATGTTTTTACCTATAAACTACGCGAatacaag
ttatttgtgatcaTGGCCAGTCATGGCCTAAGTACATATTAAAACATCCT
GAGAAAAATTAGTCTTTCTAATAAAGCTGTTCAGCAGAAAAATTAAGCCA
AAAGAGTATTGTTTCCGGAAATGTTGGTGACAAAAAATACTTGCCCAgct
taaatcttttttttcatttttgaaattagtATGGTAGATTAgaagatcaa
acaaaatcaaaacaagtaaaagtattgttttaagacaagcaaagaaaaga
agaaaaaaataaaaaaaatcggtTGATGTCTGGAAAAATATCTACCTTGG
TATTTCTGTCTGTACATTATTAATTAAAGTGTACAAACTTTTATGTGTAC
AGAATGCTTTTCAACAAAATATGGTCCCATATTGATGGGGAGAAACTTTT
GTTTATGGTTATTTGTCTCAAAtcttaagtttaaaaaaataatttgtctt
GAGTTCAACTTACTTGGCATCCCTCTTTCAAtatcatttctttgttttca
atgttatccttcatttttcaataaCTTGAGTTCTTAAAATGATGATTGAA
ATTTAAAGCATAGTTCAGCAGAACAATTATGTTGAAATATATTTCGCCCC
TATCTGATGGAattctgtttggattttaactaattctgtatttctctttc
aattttattttgatttttcatttatctaCCTTAAGAGAACCAATTTTCAG
GGTTGAAGGATTTtggatatttctttcattttcctatagATTTTTCCAAT
GTCTCTTTGAAAAATGGCCAAATTGTAATTTGCGGGCtctaataattaaa
aaaaagtcatttcctGCGAAAATTAGTACTTTTAAGGTATATATTGAGTT
CTTTAAATGATGATTGAAATATAAAGCATAGTTCAGCAGAACAATTATGT
TGAAATACATTTCGCCCCTATCTGATTGGAACTCTCCTAGATTTCAACTA
ATTCTGTATTTctctttcaatttcattttgattttatcttGCATTTATCT
ATACATTGTGTTCTTTAAATGATGATTGAAATATAATAAAGCATAGTTCA
GCAGAACAATTATGTTGAAATACATTTCGCCCCTATCTGATTGGAACTCT
CCTAGATTTCAACTAATTCTGTATTTCTCTTTCAATTTGATTTTATCTTG
CATTTATCTATACATTGTGTTCTTTAAATGATGATTGAAATATAATAAAG
CATAGTTCAGCAGAACAATTATGTTGAAACATATTTCGCCCCTATCTGAT
TGGAACTCTCCTAGATTTCAACTAATTCTGTATTTCTCTTTCAATTTGAT
TTTATCTTGCATTTATCTATACATTGTGTTCTTTAAATGATGATTGAAAT
ATAATAAAGCAAGTTTTCCAAACAATTATGTTGAAACATATTTCGCCCCT
ATCTGATGGAACTCTGTTAGATTTCAACTAATTCTGTATTtctctttcaa
ttttattttatcttgcATTTATCTATACATTGTGTTCTTTAAATGATGAT
TGAAATATAATAAAGCATAGTTCAGCAGAACAATTATGTTGAAATACATT
TCGCCCCTATCTGATTGGAACTCTCCTAGATTTCAACTAATTCTGTATTT
CTCtttcaatttgattttgattttatcttgCATTTATCTATACATTGTGT
TCTTTAAATGATGATTGAAATATAATAAAGCATAGTTCATCAGAACAATT
ATGTTGAAACATATTTCGCCCCTATCTGATGGAACTCTGTTAGATTTCAA
CTAATTCTGTATTtctctttcaattttattttgattttatcttgCATTTA
TCTATACATTGTGTTCTTTTAATGATGATTGAAATATAATAAAGCATGGT
TCAGCAGAACAATTATGTTGAAATACATTTCGCCCCTATCTGATGGAACT
CTGTTAGATTTCAACTAATTCTGTATTtctctttcaattttattttgatt
ttatcttgCATTTATCTATACATTGTGTTCTTTAAATGATGATTGAAATT
TAAAGCATAGTTCAGCAGAACAATTATGTTGAAATATATTTCGCCCCTAT
CTGATAGAACTTTATCCTAAAACAAGTTAAAACAATTCCTTATGCtctct
ttcaaaatttctcacAACATTGAGTTAGCAACTTATAAATTAAACCAAAC
CTATAGAATTCTCCTTTGATAATTACTCCAAGCTTTATCAGTCTTtagta
atagacgatatcggctatacataaaaactcagatttgacccccgagaatt
cctcacaatgctttgtgcggaaaaaattcaaaacaattgaaagttaaaat
gggccatatttggtttgattttttattttgacatgtgacatttgttttga
ttttgtatcccgctgcatacggtttgtttattaattttgtcAGTACTTTT
GTCCCTTTAAGGGTACGGTCTTAGTTCttttttcgatgaaaattttttca
gtgtcaaaaaatttttttttgcattatttGGTGTAAATTTTGGTGCTCTT
TCTGATGAGCTATATCCCGAAGTGTATaaaagatgcaaaaatcgcaaaaa
tgcaaaaaactcCGCATATTTTAATCCCTATTGACTGAAGTTATTGTGCG
AGAAATAAATAGTCGTAAAAAATAGAGGATTTAAAGAGAAGATTTAAATT
GAATAAGTTTCAAAAAGGAACACTCCATCACAgtgttattttaaaaaata
tttaacgtTATTAAAAAGAAAGTAGTTTATCTGTAAGATTAGTTACTAGA
CACGAGAATAGGGAAATCATCTAATAAAAATATGGGTAAAAAACGGAAAA
CAAACCTATTTGCTTCAACAACCGGTCGAAAGAAACGAAAGACGAGTGTG
CCTTGGAAGGCCAAGGAGATCGAGGAACGTAAAGAACTCACACTGGCTAT
TCCTGGTTTACTCCAAAAGACTCTGTTGCCAATGAAAGTGttccaaagaa
aaagtttgcaaTTGATGACTACGAAGTCGAATTATCTGACGACGATTGTG
ACCCTGACAAGACGAGTCCAAGTAACTGGATAATTTCTTTACAATCCCTA
CAATCCGCATTAAACGAAAGTGCCGTATGCCGTACTTGCTTGCAACCAAT
TCAAATCACTGAAACAGAAAGTCGCAGAGCTGGGCTAGCAACAACATTTT
CAATCTCTTGTATGAACGATTGCGATTCTAAATCTTTTGAGACGTCACCT
AAAGTCGGACGTATTCACGAGGTGAACAAAAGTAGTGTTTTAGCTACTAC
AAGCAGAGGGACGAAGTAAAGCTGCGTCGCAAAAAGACCAGAAGGGCAAA
GTGCAAGAAACAAGATGCATTTCTACACGAAGAGGGTACCCAATACAAAT
CAGGTCACTTTTACGTTTCGGAGAAACCAAAAACAACGAAACAgaagaaa
ccaaggcgtcaaacgaaaacaaaagcaagtaagcccaaacaagcgaaaac
aaaaggtaaacaacaagcatcatcaaagaaacaaacgaaaaaaaatatta
cgacgaaccagaaaaaaactagcaaaaaggcaacaccatccaaaaaagct
gcattacccaaaaaaaaCGTATCAAGAAAACGTTGAAGCTTATGATATAG
GTCATTGTGGCGCTagggagaatttcaatatttcgtATTTCTAGgtatat
tttgaaagaaaaagaaagatttttgaaagtaattttcctcgtttaaaaaa
agatgttcttgtaaaaagtaTGGatcgaaagatttttgaagctCTCCTTC
TCTGTGCTCCATTGAAGGTTTAAAGTGtctctctctctctcGATTTTCTA
TTATATGATTTTCATAATAGAACAAAGAAAGAATAGTTTTTAATCTTTCC
ATTCACTTTAATAATAAAGGAATTAAATTTTTCGGTAAAGATCAAAGGAA
gacaaaatcttgaaatatttcagaacTTCAATTTCTCGAAAAATGCACTG
AACCTCGCAACTTTGAAAGGTTAATGTCCAGACTCTGATTGGTGGATATT
TTTGAAACCTACGTCATTCGAAAGAGGAAAGTCTGAACAGGAAAATCGTG
CCAGCATTTATTGAATAAGGGCTTTGTTTCTGGAGAAAATCGagttcaaa
gttcaaaaatgggtTTTAAACAGTGAAGAATGTTCAATAGTAAATATCTT
TTGAACGAGGCCCTAATTACGTAAACGCTAgtacgatttttttcttcaaa
gcaaTGGCTATCAGATGACGTATTTCTCGTTAAAATCCGTTCAGCCAATT
CCGTACATTAACCTCTGGAAGTTCAAAGGTCGAAGTTTTTTAATGTATCA
TAGCTCATCATCAGgacaaactttttaaatataaagtATACATTTTGAAA
GCTTAGTAGTAATACTTTCAGCTAATGAAAaccgtttttcaaaaaaaatc
atttaaaaagaaataaaccaatttttttcaaatgaccaatgaaCTAAGAC
CGTACCCTTAAGTTTACAAGTATTTCCAATGATGATTGAAATATAAACAT
AGTTTAGCAgaacaataatgttgaaataTGTTTTGCCCCTATCTGAGAAG
AAGTCAAACCCCCTCAGAGAAAATGAGAAGGAAACTGATGATGTCAAATT
CTTCAATATTTCAATCCCCTTATTCTACACTACATGTCTTTTTATAATCT
TACAAAacatatggcaaaaatttaagcataatAAGCTAAGCATTACATTG
AACCTACGACAAGaggattttcttgattttgggTTGGATTTTACAAGTTT
TCGGAATTTACTAAAAGTTTGCTCATCCTTCGTCCTAAGCATCTCCGAAC
CTGTTTTCTAAtgcatgcttataaaaaacatgtagcaaTTTTGGGAGTTT
AGCTAATTTACATTATTAATTTGTTTTCAGGTAAAGTCCACGGTTCCTTA
GCTCGTGCTGGAAAAGTCAAGGGACAAACTCCAAAGGTAAATCATCCATG
TTTTTGCTCtcaaggcgagaccaatttgattagttgttttacagGCCCGA
CCAACCCTGAAactcttaaaataaaaataaaattgattgtggtatcttta
ttttcattgtttcacaGAATTCAGAATTTTGGTAgcttttccaaggtttt
gagaattttatattcaatttttgattttatccatgagttcgaccttttta
tatctatttagtattttttGATAAGATGTACtcagtttttgctgcctttt
aggagattttatatgtgaaattcttcttttattttattttttcgccgacc
gaccctcttttttgggtagcttggcccataaaacaacaaattaaactGGC
TTCGCCTAAAGAAATTAAACATTCTGCTAGTTTTTTAAAGGCTGCTTTAA
ACAAAAAGAAGGGGAGTCTTTCTTAACCAAGTTAAAACGTGCTGTTTGCG
GAAAGGTCATTATTAAAGTCCAAATTGTCCTTTGAATGATCCTCCTtgta
aatatctttccaacggtgtataaccTAGATTTTAATcgttttgtcaattt
ttatgatacattgggcttttccaaggggttgatttgatgtttgtccaggg
gtataacccgtgtccagggggtttaaaatcaaaatgtccaggggtaattc
atgaaaaaaataatatatcctccaccccccatgaacggattttttctgga
agagcccattctaaATTCTTACAAACTGAACTGTAAAAGTTTTCACTTGT
TTTAGatattacaaaataaaaatttttctctcCCGCGTCCTGGTGGTATA
AAAACATGATATGTTTGAGTACTCTTAGGTCCTTataaggaccccccccc
cccccccgtttattatttttaagaatattttcagctgtcaaagagaaggc
tccttattttgctcttaatagcctgattttagctagtctacacaatagac
agatccaggcttttaagccttactcttggtctataggcgcTGCTATAgcc
ggccactagtgacccccaccgggaattgcttattaataggtttaaacata
atagacaacattcacaaaagatgtttatcaatagagattttaaataaaag
aatatttaaaacacagctgattggcttaggtttcgaaactctattgtttc
attaaaacctcagtgcgcatgcgatttatctggaaaatttcaatattcaa
aacaagagcagtgctcatagcccgaagagtaggagttttacgctcgaaac
gaaggaagatatgacgtagcctagattttagcctatatttaccttatttt
tggggtttcagaagtacaatttccaacccccccccccggcaattagcccc
ccccccccccccccccgtttatttggcacctaagagtaattgtTATGGAA
ACTTTCTATACTTTTTTCTTGTTCAGGTTGACGCACAAGAAAAGAAGAAG
CCAAAGACCGGTCGTGCCAAGAGACGTCAACAATACAACTCCCGTTTCGT
CAACGTTGTCGTTATCCCAGGACGTAGACGTGGACCCAACTCCAATGCTT
AATTTTCCTgtgtaatataaaaaaatcggaaaactAGAAACCAATCGTCA
TTCCTTCTTCCTATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000107_pilon:401929..411894+ >MSTRG.13472.1.p1 ID=MSTRG.13472.1.p1|Name=MSTRG.13472.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1602bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107_pilon:401929..411894+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AATCGAGTGCGTTTGCGCAGTCGTGGTGCAATCAAATATGGGGCATTTTT
TCTCGCACATGAGTCTTTTTACCACATAGTTGTTGGCGAGAGAGAAGTTG
AAAGACATATCTCCAGTTTAAAATCAGTCAAGATGCAAATCTTTGTGCAG
GGACAAGAAACTAATGTTTATGATGTCAGCCCATCAGTCTCTGTTGCTGA
TTTGAAAGAATTAATCGCCTTCAGAAGTGGTGTACATGCTGAAAACCAAG
TTTTGACATATGCTGGACGTGCCTTGGAAGATGAAAATGCCCTTTCAGCT
TACGAACTTGCTGCTGAATCCACCATTTCTCTTGGTCTCCGAATGCTTGG
agGTAAAGTCCACGGTTCCTTAGCTCGTGCTGGAAAAGTCAAGGGACAAA
CTCCAAAGGTTGACGCACAAGAAAAGAAGAAGCCAAAGACCGGTCGTGCC
AAGAGACGTCAACAATACAACTCCCGTTTCGTCAACGTTGTCGTTATCCC
AGGACGTAGACGTGGACCCAACTCCAATGCTTAAAATCGAGTGCGTTTGC
GCAGTCGTGGTGCAATCAAATATGGGGCATTTTTTCTCGCACATGAGTCT
TTTTACCACATAGTTGTTGGCGAGAGAGAAGTTGAAAGACATATCTCCAG
TTTAAAATCAGTCAAGATGCAAATCTTTGTGCAGGGACAAGAAACTAATG
TTTATGATGTCAGCCCATCAGTCTCTGTTGCTGATTTGAAAGAATTAATC
GCCTTCAGAAGTGGTGTACATGCTGAAAACCAAGTTTTGACATATGCTGG
ACGTGCCTTGGAAGATGAAAATGCCCTTTCAGCTTACGAACTTGCTGCTG
AATCCACCATTTCTCTTGGTCTCCGAATGCTTGGagGTAAAGTCCACGGT
TCCTTAGCTCGTGCTGGAAAAGTCAAGGGACAAACTCCAAAGGTTGACGC
ACAAGAAAAGAAGAAGCCAAAGACCGGTCGTGCCAAGAGACGTCAACAAT
ACAACTCCCGTTTCGTCAACGTTGTCGTTATCCCAGGACGTAGACGTGGA
CCCAACTCCAATGCTTAAAATCGAGTGCGTTTGCGCAGTCGTGGTGCAAT
CAAATATGGGGCATTTTTTCTCGCACATGAGTCTTTTTACCACATAGTTG
TTGGCGAGAGAGAAGTTGAAAGACATATCTCCAGTTTAAAATCAGTCAAG
ATGCAAATCTTTGTGCAGGGACAAGAAACTAATGTTTATGATGTCAGCCC
ATCAGTCTCTGTTGCTGATTTGAAAGAATTAATCGCCTTCAGAAGTGGTG
TACATGCTGAAAACCAAGTTTTGACATATGCTGGACGTGCCTTGGAAGAT
GAAAATGCCCTTTCAGCTTACGAACTTGCTGCTGAATCCACCATTTCTCT
TGGTCTCCGAATGCTTGGagGTAAAGTCCACGGTTCCTTAGCTCGTGCTG
GAAAAGTCAAGGGACAAACTCCAAAGGTTGACGCACAAGAAAAGAAGAAG
CCAAAGACCGGTCGTGCCAAGAGACGTCAACAATACAACTCCCGTTTCGT
CAACGTTGTCGTTATCCCAGGACGTAGACGTGGACCCAACTCCAATGCTT
AA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000107_pilon | genome | sc0000107_pilon:401929..411894 + |
|
