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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000106_pilon:811791..822978+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13420.3.p1 ID=MSTRG.13420.3.p1|Name=MSTRG.13420.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11188bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000106_pilon:811791..822978+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTACAACTTTGACACTACGCTtgcatttctattgttttatattgAGTGA
TTTTTACTACGGGAAACTATTTGGCAGCTTTATTGCTTATTAGTTGGTTT
TTCAAAGTTGTACTTTTTCGATAGGTATGCACTTTCTGTCTTGTTCTTGC
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AACCAGAGTAAGCTGCTTGGCAGCTTATTGCTTCGGAAgaaaaggttggt
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TAAAAATAATcttgtttttatcattttgcgGTTTCAGCTTTGTATATTTT
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TTGggttattttgatgtttttcataTATGTCGGAACCTGTTCAAATGATT
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TCTATTGTCACTTATTCACTTGGTTTTactacatttttattttgaggTAT
GTAGCCGTGATTAATAAgatcaaaatagttttttttctaaattagtACTG
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tTGGTTTTGGGGTGCCCTTTCGCTTGCGCAAGGGAAAAGCTCTGGGACCG
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ATCTTTAAAATAGTCTAAAATTTCCGTTTTAAATCTTGCTAATTTCGTTT
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TCTTTGGGCCGTGTAATAATGATCATTTCTCTCTAGAAAATCATTCAATT
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TGCCTCGACGGCTGCAATAGTTAGGATTGAAcaggtctttttttaaatta
gcaATTTCTCTGCGAAATTATTAAAACCATGGATTTCCGGTTTTCGGTGG
TAACGGCTAAGTGCTGGTTGGAAATCATgctctttttttgcttttcattA
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CACCATAGAATTCGGCAattgaacctaagaatgccaaattttagagcatt
tttacctGTAAATTTCCAATTATCCCTCAGCAATgctaaaagctttcaca
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GGATTGGATCCTAATCTAAGAATATACCGTAAAATATTAAGAtgattttc
agcctaaaaatgtccttaaaattttcttattttcaccatctgTTGGGTAT
TTTTGTGGGATTTTCTAAGAaaatgggtgttttagagtctgcgaaACCTT
GAATATTCTTGTCACGTTCTTAATATTTGActtcaaagccttatgttcga
TTTCCATCTGAAATGACTTGACGTGAGCGGACGCAATTTTTGAGGCCGAT
TCGCATTCTTCATACCAGAACAAATCAGAGGGGGCTGTcggcttttttat
aagaacaaactatgtaagaacataaggcttcgatggccaagatgttaagg
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ttcataagaacatggacaaaaatactcaaaaaaggcgttataagaacatg
ttacgacatttttaggcttaaaactcaaaaagttaagaacatccgaagtc
ttcaaaaattttggatgttttataaaaaaaacgtgtacttgggAAAACTT
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atttgttcaaattaagaaaatttcgagttatggggcaaggtttataagac
attcTTAACTGAAGGGACGGTAAATCTGGTttaagttaaagagactctac
tgttcGCGAAAACCAGTGAAAGGAATTCCGATTAAAGGCTTCCGAACTAA
TTCCTTTTCACACATCGCTTGTTTAGGTTTGTCGGAATTTTTCTTGGTGT
ACTAATTACAGTCCTCTTTCCTTGACACGATTCTTTTGATTAATAAACGC
GTATCACGGCTCATCAAAGCTTCTCAGACAATTAataacttttcttttgt
ttcgaattaatttcttctttaattGACCTGCAATTAGCcatgtttttgaa
tgtttaatGACATTTTTCGATGTGTCTTTTATTGGATAGTTGATAGgttg
tttttgctttttgttGTTGAGAGTATAAGTGAAGACTGGTTGTATGGATT
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TGTGAATGAGTTGTGGAAAAGTAAGGGTTCATTCATTCTTCCTTTTACAC
GTTTATTGTAGAtatttttttgaggaaattttattctcaactcattattt
ttttaatccaaCACATAGAAAGCTCTACATTTTACTCACTCGATTCTTAT
CTAGAAACTTACAGTATGTTCTAGAAACTTCCTTTAAAGTATGTGAATGT
AATCTCAGATATGCTTCTGATAAAAACGAAGAAATTACTTACTTAGGCTG
AAATTAAACCAAtgttatgaaaataaaaattctaataatATCTCATTCTT
AAGTAATATCTTAAATAAAAGTGAAGAagatcttcatttcttttttcccc
gaCAATTTCAGTCTACAAGATTTGTCCTCATTTTTAACGAGATAGATCAC
CCGCttttcctagttttctgtattttctttttctcgttttttcaTTCAGG
TACGtctttgaaagttttgttaGCAGAAAGTACATTTTGGTTCGACCTTG
AACAATCTTGGAATAAGGTAAGACAATTTCGTTTCCTTTatctcatttta
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GTTTTATCGTGCAGTAAACGCAGCAAAAAAGTTTTTCAGTGTTGCAACTT
TTCCGTCTGTAGACGGATATCCGTCCAGTTGAGATACAAATATATCATTT
CCGTCTTGCCAGTAAGAGGGTTTTTGGTTCAAATGACCATCTAATCCTAA
GGTTTCCGTCCATATTCACAAAACCTAGTTGCAACACTGGTTTTTACAAT
ACTATAAGTAAGTAAGTCTGCGACCGCAGTTggaggcgacccgaaggctc
ctttttcgatagctgtctacccgaaggtaggagagggcgctactatttct
ccctggattgctccacttacccttgatccttctcttaattgctgagcatc
tagcagagaggtatcaagtactattttgggaatttttggtatgacccggc
ttagggttgaacccacaaccttgcgaaccgtagccggatgttctaccact
gcactacggtcgctataCCACAATACTATAATATATTTAACGACCGTAAA
CAATCAATTACGCAGAGGCATCCACCCTCCCTAGATAACTTCAAATTGTt
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GCATATATTTAACGGCCGTAAAAAATCAATTACGCAGAGGCATCCACCCT
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TTCTCCAATCAAAATCATTTCCGATCGCCCCAATCTGACAGTCTAATTCT
TAGAGCTTTTCAAATAGTCTAATTGTTTCTCTCCATCGTTTTTGAAATCG
CGAGTATTTTCGGGTGGGAGTTTAGCAtttttttCTCGAACGTTTTGATT
AATTATCCGTCACTTTGATTTTTTCGCTTAATCGATGGTGTAAATGTGAT
TTTAAAAGCGAAAACTGCATTTTAAGTGGTCATTAATTGAGGGAAATATA
AACACTGATAATTCtcagtttttcttataagaacttTGTGAACTGCTTAA
GGAATTTAAAGCACTCGTCTTCGTATAGACTTTTGAGGATGTTTTTGGGG
GACTCCTAGTAAGATACTTGAGTGGTATTCTAGCAACTCTATTCGATATC
AGCTACAGTAAACGAGAAAATATTCACGAATTAATGAAACTGTTAAGATA
TTTGAAACACGCAACTACTTGCTTACTCCTATAGtacgcgttttttataa
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tgttcttattttctccattttgtgaccatttttattcattttcctaaaaa
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TTAGACCACCATTTTAGTTTCGTCCGTAATTATTTTAGTGATAAAATCTC
CTTTTAAATGATCATTTTTAAACGGTTACATAATTCAAGATATTGTATCT
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ACCTTTAGTATAGTGCCTATTTTTCCCGTTAAAGTGATAATCTACGTATA
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TTATCTCACAGGAAATTCGCTCTTACCTACAAATCCCTGTTTTTCTACTA
ACTAACAGATTACCGACGtgtcttttataagaacttatTTCAAAAGTTCT
TGTTTTATGTTGGCAAAATTTTGGCTTTATGCTTGCAGAAAAACgttcaa
ttttaaacttttacgtTGTCTTTCCTCGAGGATGAAAAAACGAGCGTTta
catcaaaaaaaaagttttgttcatTTGGAGCGCCAAATTTCAGTTCTTAC
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TCCAAAATCCTTAACTCGCAAACAAAGCAACCGATTTTAATTCATGCTTC
GGATATGTTTCTTTGTGCGCGTTTTTGTTTACTCGAGATTTTATTTGTTC
GCGCGTGATCTTCTTGTCAGGCATTCAACCCGCCTTTTCAGTCGGCTTAT
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TATCATTAGACGCGCTTAAGTTGTCAAGTGATGGTTCGTAGTTGAATTTA
CGAGTGGATACAATTAATTTCTTGAAGAACTGaagaattttgatttgatt
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GAGAAGGTGAGATTGTCTTTCGTTTTATGTGAGTGCGGGTGCACGGCGAG
TCATGTGGGTGTTTTTGTGAACAAAATTTCCCTGTAATAAAGAACGCGAA
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GTACTAAATTAGATATATTTAAtcattaaaatttacaaaaattccatGAA
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GTCATCCCCCTCTCCTTTTCTCATGCTCTCCTTTCTAAGGTTGTAATCTG
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TTACTCAATGGGCTTATAAACGGTTAGTTTCTCTTAAGGGTTTTACAATG
TCTTGGCTCGGGACGTTTTTTCAGTAAATGGATATAACCATGGCGACTAA
CCGAACTATCTGTTATTCTGCAGGGTACTGTAAATAGAAAACAAATGGTT
TGAAAATCCCAAGTAAACTTACATTCGTTGTAGTTGTTATACCCGTCCTC
TACTTGTCAATTGTATGAGATTTTTGTATGTCATGGTATCATTTAAATCT
TGTATTTCTCTTTACATTTTCAGGCATGATGAACACGCCAAGACCAGTCC
CAACCATTGCTGATGATTCAAATTTCAGCAGAAAGAAGAAATCACTCTTG
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TAGTCGTATTTTCCGCCATCGACGCGGTTCAACGCCCGGTGCCCATTCAG
TTAGCTTCAGAAAATCCGAAGTGCAAGGAGACGTTAGTATGACAAGCCCA
TTATACAAGACTTACGATCAATTGTATTTTGATCAATGTTTCACCAAATT
ATCAAAAGTGGGCGTCGGCTCTTTCGGAGAAGTATGGAAAGTTCAAAGCA
AGGAGGATGGAAAATTATACGCCATTAAAAAGTCACGTGATCGTTTCCGT
GGAGACTTCGATCGTAAACAACGCTTGGAGGAAGTCAATAAAAGTGAGCG
GATCCAGGGCCACTGTAATTGCGTGTATTTCCATAAAGCGTGGGAAGAGC
TAGACTATTTGTATATTCAATACGAATTGTGCGAGATGAGCCTGAAAGAT
TATGCCGAAAAAGTGCAATCGGTCGAGGAGAAAGAAATCTGGAAAATGAT
CATCGATTTTTGTTACGGGCTTAAACATCTTCACGATGCTAACCTTGCCC
ACATGGACATTAAACCGGCTAATTTGTTTCTTGGTCGTGATGGCAACTAT
AAGATTGGAGACTTTGGATTGGTTGTTGAGTTAACACGTGACGTTGATGC
TATGGATGGTGATTCCAAATACATTGCACCTGAACTTCTTGAAGGAACTT
TCTCAAAAGCAGCTGATATCTTTAGCTTAGGTATCACTGTTTTGGAACTG
GCATGTAGTCTTGAATTACCGAACGGAGGACCTTTGTGGCAACGTTTGAG
ACAAAAGCAATTGCCAAACAAATTCACCACTGGTTTATCGGATGATTTGA
TTCTCTTAATCTCCTCTATGATGGATCCAAATCCTTCGAATCGACCAACA
GTTGACCAAATCCTCCGAATGCCGTGCGTACGTCAAGTCAATACACGGCG
TCCACCAATCAGTACTTACGTCTCAACAATCACGCAACCGTTCTTTAGCC
TATGGTTCTACTTTATGTGGATGTTAACGTCAATTACGTCATTCTTCAAA
CGTGATTACCGTACACAGAGCTCACTTCATCACATGAGAGAAATAAAGCG
ACCGAGAACTCCTTCTCCAAGGACCAGTGTCTTTGGCGAGGAAGGATGCA
CTCCACTTAATACTCATAGCAAAGCCCAAGAATCACTTTCATCGCAGATC
GAGACGACAGTGTTTTCCTCTCCAGCTAAGCGATCACAACAAAAGCTACG
TGCAAACATGGTTAGCcctcttttcaacaaaaacagtCCTTTATTCAGAC
CTATGTTTAACCAAAGCAAGTCACAAGAATCGTCCCCAAGTGGTCTATTT
GGCGAGTCACCTATAACCAGAGACAGTTCCAAAAGCAGTAGTAGAAACAC
TAGTATGGATAGTCCCGACCTAACAGACTGCTCACCGCAAACTGGCACGG
TGAGTGAACGAATTGTCCGCTCGCGGTTGTTTACATGTTCTAGTGACGAG
GACGAAGACTTTGATTTACAAAGAGTTCCTAAAAACCTTATGAGTAGTTT
TAAAGAAGACTCTGAGTAATGttcttttatttctcttttAGTCTTGTTAT
TTCATTGTAAATTTATAGTGGGATGATTCAGAATAACTATTGCTCTTACT
CATTGCGAGTCCCCCCTCCCCATTTCCCACCCTTTTTGTAACTTCACCCC
ATTGAAAAACCCGTATAAAATGAACCATTTTTTGTAAATCTCTCGTGTCT
CTtcagggtcaaatttttccctttttctcttTACCCCACTGTTTCCCAAT
AGAATTATAGATATATATTAGATTAGAAACTACAAATTTTGGGTTGACAt
tttttttAGATATAGTTGCTTCGTTTATATggagttgatttttctttgga
aaaagttttttgtaaatattgatgtgtttgtttatattttgtttatCATG
ATGTTGCATTTCAAATatggtatttttttgtttcgaac Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000106_pilon:811791..822978+ >MSTRG.13420.3.p1 ID=MSTRG.13420.3.p1|Name=MSTRG.13420.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1644bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000106_pilon:811791..822978+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATGAACACGCCAAGACCAGTCCCAACCATTGCTGATGATTCAAATTT
CAGCAGAAAGAAGAAATCACTCTTGAACGACAGTCTATATGCGCCACGTT
CACCCGTCAAATCAGCACCGCCCATTAGTCGTATTTTCCGCCATCGACGC
GGTTCAACGCCCGGTGCCCATTCAGTTAGCTTCAGAAAATCCGAAGTGCA
AGGAGACGTTAGTATGACAAGCCCATTATACAAGACTTACGATCAATTGT
ATTTTGATCAATGTTTCACCAAATTATCAAAAGTGGGCGTCGGCTCTTTC
GGAGAAGTATGGAAAGTTCAAAGCAAGGAGGATGGAAAATTATACGCCAT
TAAAAAGTCACGTGATCGTTTCCGTGGAGACTTCGATCGTAAACAACGCT
TGGAGGAAGTCAATAAAAGTGAGCGGATCCAGGGCCACTGTAATTGCGTG
TATTTCCATAAAGCGTGGGAAGAGCTAGACTATTTGTATATTCAATACGA
ATTGTGCGAGATGAGCCTGAAAGATTATGCCGAAAAAGTGCAATCGGTCG
AGGAGAAAGAAATCTGGAAAATGATCATCGATTTTTGTTACGGGCTTAAA
CATCTTCACGATGCTAACCTTGCCCACATGGACATTAAACCGGCTAATTT
GTTTCTTGGTCGTGATGGCAACTATAAGATTGGAGACTTTGGATTGGTTG
TTGAGTTAACACGTGACGTTGATGCTATGGATGGTGATTCCAAATACATT
GCACCTGAACTTCTTGAAGGAACTTTCTCAAAAGCAGCTGATATCTTTAG
CTTAGGTATCACTGTTTTGGAACTGGCATGTAGTCTTGAATTACCGAACG
GAGGACCTTTGTGGCAACGTTTGAGACAAAAGCAATTGCCAAACAAATTC
ACCACTGGTTTATCGGATGATTTGATTCTCTTAATCTCCTCTATGATGGA
TCCAAATCCTTCGAATCGACCAACAGTTGACCAAATCCTCCGAATGCCGT
GCGTACGTCAAGTCAATACACGGCGTCCACCAATCAGTACTTACGTCTCA
ACAATCACGCAACCGTTCTTTAGCCTATGGTTCTACTTTATGTGGATGTT
AACGTCAATTACGTCATTCTTCAAACGTGATTACCGTACACAGAGCTCAC
TTCATCACATGAGAGAAATAAAGCGACCGAGAACTCCTTCTCCAAGGACC
AGTGTCTTTGGCGAGGAAGGATGCACTCCACTTAATACTCATAGCAAAGC
CCAAGAATCACTTTCATCGCAGATCGAGACGACAGTGTTTTCCTCTCCAG
CTAAGCGATCACAACAAAAGCTACGTGCAAACATGGTTAGCcctcttttc
aacaaaaacagtCCTTTATTCAGACCTATGTTTAACCAAAGCAAGTCACA
AGAATCGTCCCCAAGTGGTCTATTTGGCGAGTCACCTATAACCAGAGACA
GTTCCAAAAGCAGTAGTAGAAACACTAGTATGGATAGTCCCGACCTAACA
GACTGCTCACCGCAAACTGGCACGGTGAGTGAACGAATTGTCCGCTCGCG
GTTGTTTACATGTTCTAGTGACGAGGACGAAGACTTTGATTTACAAAGAG
TTCCTAAAAACCTTATGAGTAGTTTTAAAGAAGACTCTGAGTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000106_pilon | genome | sc0000106_pilon:811791..822978 + |
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