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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000106_pilon:788905..795148- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13419.1.p1 ID=MSTRG.13419.1.p1|Name=MSTRG.13419.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6244bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000106_pilon:788905..795148- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) GCATCATCAAACAACCAAAAGAATAAAATCTTTGTTGAAGGAAAGTATGT
ACAAAGGGAAAAACAACCCCCAGTAAAACAGAGTTAAATATTTTGGTAAG
AGGTACTAAGTGTATAGAGCCTAGTTTTAATGCTGAGAGCTGAATTTTCA
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TTTGTTTAACACCAGGACTAAATAACCTTGAACGCTATTGGTTTGATTTT
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TTGAATATCACAAAGGAACACATTTACCATTGGCTATTGTTGCTTGGGTT
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AAGGAAAATCATTTTATTTAATTTTCCGCTTTGTCATGTTTGCTGGTTTT
TTAGCTTTTGGTGAATTTTATTTGTCACCAGGGAGAAATTTATTAATGAC
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TTGATTGGTGTTCTTACTGAAGATGTAATTGATAAAGATGCATGGCAAGC
TTGTTTGATCGAGGTTTTAATGTATATTCCATTTGCTGGATTTGTTGTAT
GGATAATCTATTTCATCCACTCGCTCAATTGTGCCAGGAAATTTCGCCAA
TGGATTTCTTCTTCAACCATCGTTACTACATTACATGGCTGTTTTACCAA
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GGTATTTTAAAGCCTTAAAATGTTCTTAACATGTTCTTATAACATTTTGG
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GTGGTATTTTCCTATGAACATCACCTAAAACTTTTTAAGGCTCCAACTTA
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AGCAAAATTCAATCTACCTGTCACCAAAAATGAACAACTTAGTATCATTA
CTTTATATCTTAACTTTTAACTTTTCAAGTATTTTATTTCTTGAAAATAT
CTTTCCAGCGAAACCCTGCAAATAGCTTCTATTACCATTCATATACTTCA
CATCGAATCTAAGCACTGATCTTCTAAAGGGCTAATTTCTATTGAGTCCT
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GTTTGTCTATTTTTCAGCTCCAAACTCGGTAAACACTGACGATGGTCCAA
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TTTTTTTCTTTGTATGACATAGTAAAATAATATTTTTAATTTGTATGAGC
ATTTCTTATGAGCATTTCTTATGATAAATTTATCGATTTATATGATTATT
TTAACGATTTTTGGATTCTATTTTTCGATGAATGGGGATATTATCAGTTT
ATATAAACTACGTAATTGGCCCTTCCATTAATTTCATGCCTCTTTATACT
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GTTAACAGATTTGATTGTGATTAATACTTCCATATTTTTATGGCTGGGGA
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TTCAAGAATATTTTTTGCGTTCATAAACTTTCACCTAAGTTGTTTGATGT
TTCATTCATACTTCAAGTTTCAAGGCTCAGTGCAATGAGTAGTTAAATAT
TTTTTATCTAGTAAAATCAATTTACCTTTTTTTAAGTTCGTTAGTTCAAA
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ATGATACTTAGTTTTTTATCTAATTATATTAATTAGTTTAGGTTTTTCAG
TTGGAAACCTGGGTACATCTGGTCTAATATTTTATGATGATAAGTCCTCC
TGTTTAATCTACTTGGAAATTGGCCAGGGGGCAGTGGGTTTACTAAAAGA
CTCTTAAAGTTGCGCCTTTACAGCAAAACAATCTGAATTTTCGAGCAATA
ATGTGCAATTTCTCCTGGATTTGCTGAAATTTCCACTCTTATAGTGCATT
TATCGAAAGTTAACCCTTACACTGCATTTCATTTCTGCTTTCTTGAAAAA
ACATACACTTTGTGCGGCGGGCACATATCCGTCGGTCAATTTTGCCTGAC
CCATCCACCGGGGTAATTAACGCATTCACACAATGAATCGCTAGAAATGG
AAACTTCCCCTTATGTTTTAAAATACTTTTTTCACACGCATCAACGTTAT
GACGTTATTTGTTTTTTTTAAGATTCTTCAAATATTAATCAAATTGTTTT
CTCCAATGAAATTTATTTTCTGAAACTTGGATTTATATGTAGTCCTGAAG
TCCTCTTCCAGCATAAACCTCTGATTGAATAAGAAAGGATTTTT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000106_pilon:788905..795148- >MSTRG.13419.1.p1 ID=MSTRG.13419.1.p1|Name=MSTRG.13419.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=10404bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000106_pilon:788905..795148- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) CTCCAAACTCGGTAAACACTGACGATGGTCCAATTTTCATTACAGATAAA TGAGTATTTGGTTTGCTACTTCTCTTATTTGGAATTTCTCATTTCACAAA TGCTGATAAAGAACAATGTTCAAGTGATAAAATAATTAGGGATAAAATAC ATGTTGGTTTACATCCAGAGCAAAATTCATCATCATGTCTTCCGTATGAC CCATTGACAAGATCATATAGCTGTCCCAATCTTGATAGTGCTTTAAAAAT TAAAGATAAATTGGCATACAAATGTATCATCGTGTATAGAAACCAAACAA TTACTGAATCGCATTTTTTATCATCTTCTGATGTTTTCAGTTTGATTTTG ACATCAAATGACACTCAGATAAAAATTGGATTTTATAATATTAATGTTTC GCTTACATTTAAAGATTGCAATGATATTCGTATATTTGGATTCATTTTTT TTGAAGAAGATGAATCGACCACTGAAAACAATACTAGAAAAGCTTTGAGT TTTCCTGGTATACAGAACCTTCAAATTCATCAAGTCACTTTCAATGGATT TCATGGACATGCTCTGTCAATATCAAGTATGAAAAGTGGTGTTATAAATC TGACAGAAATACAAATGTTTGGTATTGGAGGCCAAACTTTATCAAAGGGC CTTTATATTGAGTTATCTGGTAGCGATTTACAGTTAATTATTAAAGATTC TAGCTTTATTCAACTTTCAGACCAATCCAATTATACTTTAACCGCTGACT GTGGAAAAGGTGCTGGAGTTTTTATACTGATACGAAATAAGATGAGAAAC TCACAAATAACTTTGGTCAACAACATATTCAAACAAAATAAAGCTTCTTT CGGCTCTGCTCTATATGGTGAGATATCAGGTCTAATTGAAAATGTTCAAA TAGAAGTTCATAACAGTTCATTTATTTTGAATGAAGCTACTTTTTCAGGA GCTGGCATTTTGTTTAAAAAGACAAAAGAAGATACAGAACGTACACTCCC AATTAATTCATTAAAATTAGATGCATTGAATTTTGAAGGAAATGTAGCAA ATAAAGGAAAAGGAGCTGCTTTGTCTCTTTGGAACCTGCGGTATATCATT CAAAAAAATGAAATATTGAACTCTAAATTTATGCACAACGAAGCACTGTT AGCCGGGGATATTTACATTGTCCGTGGCTTTACTACACTTGATAATGTTA ACACGTCAGAATCTAAACAGAAATCATCAAAAAACAAAGTTATGAACTAT GGAAGCATTGTCGTCCATGATACAAAGCTTACTATTCATAAAGCTTATAT GCATGACCACAAGGGATCTGCTATAATTTTAGACTTTTCAGAGCTCTATA TACAGGGTCAGGTCAGAATAACAAACAATACTGCGTTCAATGGCGGAGGA ATAGCACTCTTTAAAAATTCGATCATCCATTTAACAGATAGCTCTGATTT GAATATTTGGTCTAACACTGCAAATGAAAGTGGTGGTGCTGTATATGTCT CGCCCGCCTATTTTGGTAAATGTTTCTTCCAAAATTTGCACCATTTCAAG GGAAATGTCAAATTATCGTTTAATCAATCACCTAATGGTAGTGCAATATA CACAAAGACTTTGCGAGGTTGTGCTGAATATCCTAAAGACATGAAATCTT ACCAACACATATTTAGAAATTTGACAAACTTTACTATAGACTGTTCAAAG AAAGCAAGATCAAGTTGTATTGCAACAGATGCAAATAGTATTGAAGTACA TTATGATGAATGGAATAATACACAACCAGGTGTCCGGTTTCCAATAAATA TATCTATGCCAGATGAACTTGGACATGAACAATCTTCCCCATTAATAGTA AGCATAGAAGAGGGAAATGTTCAATTCTCAAATGGCACAAAGTTCAGTGT GATCAATAAAAGCTATTTACCATCATTTATTGGGGATCCACATAACCAAT TCGACTTGAAGATCTATTCAAATTCATATCTCAGTACAACGTTAAAATCT CTTAAGCTACATGATTGTGATTGGTACCAGAAATTTAATCCCAACAAAAC TAGATGTCAATGTAAAAGATTTGCTGATGATAACGTCAAATGCTTAGAGA AAGAACTTTATACAACAGAGGATAAATGGGTTGATGGTGATACCTCTTAC AACTGCCCAAAAGGATACTGCACATGTCACTATAACCCGTTGGTAAAATT CTGTAAATATAATAAGAAAAGTAGATGTGATGAGACAAGGAAAGAAAACT CTACTCTTTGCAGTCAATGCAAAGAAGGTTTATCTGTAGTTGCAGGAAGC ATCAAATGTTATAATTGCAGTGGGGATCATAATGGTATTTTAAACCTTTT TTTGATAACTTCAGTGATTGACCTATTAGTCGTTGTTGGTATTCGTTTGT TGAATTATGAGAATTACGCAGCATATTTGGTTCCTGTAATTTTCTCTTAT CGCATGGTGGCACCACTCTTGAGAGACACACCGCTTAAACTTTGCTCAAT AATGCGAATAATTGTATCATTATTTGACCGGAATGAAGAAGGTATTGATC AGAATTATATTTGTTTAACACCAGGACTAAATAACCTTGAACGCTATTGG TTTGATTTTATCTCAATCTTTTCATGGCCACTTGTTTATTTGATTACAAG CTTTATCATTTGGGTTTTACAAATATCAACAAGGTCATGTGAAAAGTTGA AACTTAAAATTCCACGAGATTCTCAATTTCGAACTCAAAGTATCATTGCC CACATAATGTTTTTCGAATTTCTGGAGTTTGCATTTGGAGTTTTACACTA TATTTCTATCAAAGATGAATATGGCAAATGGTCGTGCAGAGTTTTTGCTT ATGCTGATGTTGAATATCACAAAGGAACACATTTACCATTGGCTATTGTT GCTTGGGTTGTGATTTTAGTGGTGTTAATATATCTGTTCCTTTCCTACTA TGATGATTGTTTCACAAAGATAAAAATCTTCTTCAGGTTTCAAAAGATTT GTTATAAAGAAGGAAAATCATTTTATTTAATTTTCCGCTTTGTCATGTTT GCTGGTTTTTTAGCTTTTGGTGAATTTTATTTGTCACCAGGGAGAAATTT ATTAATGACATTGGTTCTTATGAGTTTGTTGGCCGTCCAAGTTTATTTTA TGCCCTACAAAAACAATTGGTTTAACTGGTTTGAAATAATAATATTAACA AATTTGATATTGATTGGTGTTCTTACTGAAGATGTAATTGATAAAGATGC ATGGCAAGCTTGTTTGATCGAGGTTTTAATGTATATTCCATTTGCTGGAT TTGTTGTATGGATAATCTATTTCATCCACTCGCTCAATTGTGCCAGGAAA TTTCGCCAATGGATTTCTTCTTCAACCATCGTTACTACATTACATGGCTG TTTTACCAAATCAGCTAATGTCAAAAAATTACGCCAGTGCTTTTCTAAAG 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CGTGCAGAGTTTTTGCTTATGCTGATGTTGAATATCACAAAGGAACACAT TTACCATTGGCTATTGTTGCTTGGGTTGTGATTTTAGTGGTGTTAATATA TCTGTTCCTTTCCTACTATGATGATTGTTTCACAAAGATAAAAATCTTCT TCAGGTTTCAAAAGATTTGTTATAAAGAAGGAAAATCATTTTATTTAATT TTCCGCTTTGTCATGTTTGCTGGTTTTTTAGCTTTTGGTGAATTTTATTT GTCACCAGGGAGAAATTTATTAATGACATTGGTTCTTATGAGTTTGTTGG CCGTCCAAGTTTATTTTATGCCCTACAAAAACAATTGGTTTAACTGGTTT GAAATAATAATATTAACAAATTTGATATTGATTGGTGTTCTTACTGAAGA TGTAATTGATAAAGATGCATGGCAAGCTTGTTTGATCGAGGTTTTAATGT ATATTCCATTTGCTGGATTTGTTGTATGGATAATCTATTTCATCCACTCG CTCAATTGTGCCAGGAAATTTCGCCAATGGATTTCTTCTTCAACCATCGT TACTACATTACATGGCTGTTTTACCAAATCAGCTAATGTCAAAAAATTAC GCCAGTGCTTTTCTAAAGCAGATGCTTAAAAATAAGCTCCAAACTCGGTA AACACTGACGATGGTCCAATTTTCATTACAGATAAATGAGTATTTGGTTT GCTACTTCTCTTATTTGGAATTTCTCATTTCACAAATGCTGATAAAGAAC AATGTTCAAGTGATAAAATAATTAGGGATAAAATACATGTTGGTTTACAT CCAGAGCAAAATTCATCATCATGTCTTCCGTATGACCCATTGACAAGATC ATATAGCTGTCCCAATCTTGATAGTGCTTTAAAAATTAAAGATAAATTGG CATACAAATGTATCATCGTGTATAGAAACCAAACAATTACTGAATCGCAT TTTTTATCATCTTCTGATGTTTTCAGTTTGATTTTGACATCAAATGACAC TCAGATAAAAATTGGATTTTATAATATTAATGTTTCGCTTACATTTAAAG ATTGCAATGATATTCGTATATTTGGATTCATTTTTTTTGAAGAAGATGAA TCGACCACTGAAAACAATACTAGAAAAGCTTTGAGTTTTCCTGGTATACA GAACCTTCAAATTCATCAAGTCACTTTCAATGGATTTCATGGACATGCTC TGTCAATATCAAGTATGAAAAGTGGTGTTATAAATCTGACAGAAATACAA ATGTTTGGTATTGGAGGCCAAACTTTATCAAAGGGCCTTTATATTGAGTT ATCTGGTAGCGATTTACAGTTAATTATTAAAGATTCTAGCTTTATTCAAC TTTCAGACCAATCCAATTATACTTTAACCGCTGACTGTGGAAAAGGTGCT GGAGTTTTTATACTGATACGAAATAAGATGAGAAACTCACAAATAACTTT GGTCAACAACATATTCAAACAAAATAAAGCTTCTTTCGGCTCTGCTCTAT ATGGTGAGATATCAGGTCTAATTGAAAATGTTCAAATAGAAGTTCATAAC AGTTCATTTATTTTGAATGAAGCTACTTTTTCAGGAGCTGGCATTTTGTT TAAAAAGACAAAAGAAGATACAGAACGTACACTCCCAATTAATTCATTAA AATTAGATGCATTGAATTTTGAAGGAAATGTAGCAAATAAAGGAAAAGGA GCTGCTTTGTCTCTTTGGAACCTGCGGTATATCATTCAAAAAAATGAAAT ATTGAACTCTAAATTTATGCACAACGAAGCACTGTTAGCCGGGGATATTT ACATTGTCCGTGGCTTTACTACACTTGATAATGTTAACACGTCAGAATCT AAACAGAAATCATCAAAAAACAAAGTTATGAACTATGGAAGCATTGTCGT 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AGAAAAGTAGATGTGATGAGACAAGGAAAGAAAACTCTACTCTTTGCAGT CAATGCAAAGAAGGTTTATCTGTAGTTGCAGGAAGCATCAAATGTTATAA TTGCAGTGGGGATCATAATGGTATTTTAAACCTTTTTTTGATAACTTCAG TGATTGACCTATTAGTCGTTGTTGGTATTCGTTTGTTGAATTATGAGAAT TACGCAGCATATTTGGTTCCTGTAATTTTCTCTTATCGCATGGTGGCACC ACTCTTGAGAGACACACCGCTTAAACTTTGCTCAATAATGCGAATAATTG TATCATTATTTGACCGGAATGAAGAAGGTATTGATCAGAATTATATTTGT TTAACACCAGGACTAAATAACCTTGAACGCTATTGGTTTGATTTTATCTC AATCTTTTCATGGCCACTTGTTTATTTGATTACAAGCTTTATCATTTGGG TTTTACAAATATCAACAAGGTCATGTGAAAAGTTGAAACTTAAAATTCCA CGAGATTCTCAATTTCGAACTCAAAGTATCATTGCCCACATAATGTTTTT CGAATTTCTGGAGTTTGCATTTGGAGTTTTACACTATATTTCTATCAAAG ATGAATATGGCAAATGGTCGTGCAGAGTTTTTGCTTATGCTGATGTTGAA TATCACAAAGGAACACATTTACCATTGGCTATTGTTGCTTGGGTTGTGAT TTTAGTGGTGTTAATATATCTGTTCCTTTCCTACTATGATGATTGTTTCA CAAAGATAAAAATCTTCTTCAGGTTTCAAAAGATTTGTTATAAAGAAGGA AAATCATTTTATTTAATTTTCCGCTTTGTCATGTTTGCTGGTTTTTTAGC TTTTGGTGAATTTTATTTGTCACCAGGGAGAAATTTATTAATGACATTGG TTCTTATGAGTTTGTTGGCCGTCCAAGTTTATTTTATGCCCTACAAAAAC AATTGGTTTAACTGGTTTGAAATAATAATATTAACAAATTTGATATTGAT TGGTGTTCTTACTGAAGATGTAATTGATAAAGATGCATGGCAAGCTTGTT TGATCGAGGTTTTAATGTATATTCCATTTGCTGGATTTGTTGTATGGATA ATCTATTTCATCCACTCGCTCAATTGTGCCAGGAAATTTCGCCAATGGAT TTCTTCTTCAACCATCGTTACTACATTACATGGCTGTTTTACCAAATCAG CTAATGTCAAAAAATTACGCCAGTGCTTTTCTAAAGCAGATGCTTAAAAA TAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000106_pilon | genome | sc0000106_pilon:788905..795148 - |
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