MSTRG.13408.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13408.1.p1
Unique NameMSTRG.13408.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000106_pilon:593810..617631-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13408.1.p1 ID=MSTRG.13408.1.p1|Name=MSTRG.13408.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=23822bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000106_pilon:593810..617631- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000106_pilon:593810..617631-

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GTTTCCGCCATCACGCTTCTTTTGGTTTGGTTCCGCTTGTACAAGACGTT
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GTCAATCAAATGGAAATTGTACGGTAAACGACGTGCAATCATTAGTAACC
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ACGGGAGAACACCGTTACATCTTGCAGCTGCAGTCAATTATGAAGAAATG
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AAAGTATCCGAAGTAAAGGAACTTTTATTTGGAGTCAACATTGATGATAG
TGTTGAACTAGCATCTCTAACAAGTCGACAAAGTAATTCATTTCGTAGCC
GAAATGGTGGTAATCATGATATATTAAAACGAAAAACATTAATTCCTGAT
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GATGTGAACCATCGGGACCAGTACGGGAGAACACCGTTACATCTTGCAGC
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GGGTGAAGAGCAGACACCTCTTCATTATGCAGCACGATACGATTCAGTAG
AAGCAATGAAAGTTTTGATACAAGCTGGTGCTATGATCGATGGTGTAGAT
TTCTTAAATCGAACACCCTTACACGTGGCAGCTGAAACAGGATGGGTTCT
GGTGAAGATGATACAGATGTGGTCAACCTTGCGTTCGTTGAATCTCTATT
AAACGCTGGTGCTAGTATGAACTACCCTGATGTTTATGGTCAAAGTATTT
TCTTTGCTGTAGTACGTGACTGGCACATTGACGTCGCAAGGTTTGCCATT
GAAAAAGGAGCCGATGTGAACCATCGGGACCAGTACGGGAGAACACCGTT
ACATCTTGCAGCTGCAGTCAATTATGAAGAAATGGTGGCATTTATTATTG
CTAATGGAGATGCCTACTGCAGGAGGAGCCAATAATAGCGGTGTTCGTGG
CTTCTTTACAAATTTCGCCAATTACACTGGTGAAAAAGTATCCGAAGTAA
AGGAACTTTTATTTGGAGTCAACATTGATGATAGTGTTGAACTAGCATCT
CTAACAAGTCGACAAAGTAATTCATTTCGTAGCCGAAATGGTGGTAATCA
TGATATATTAAAACGAAAAACATTAATTCCTGATGAACTACAACACGAGG
ATATTTACGAACAGTATGCAGAATACGATTGTTCTCGTAATCTTGTCGTA
AGTTCGACGACGCTTTTTCGTAAAGGCCCGATTCCGATCGAACATTTATC
ACATCAAGAACAGAATCGTCTTTCAAAACGTGGCTGCTTGTTAGAGTGGA
ACGATGCACAACGTCAGACGTCTGACAATCATCTACCTTACATTGACCCT
AGTAGTAAGAGTTTGCTGACTTACTTTGCAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13408MSTRG.13408Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13408.1.p1.exon11MSTRG.13408.1.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13408.1.p1.exon10MSTRG.13408.1.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13408.1.p1.exon9MSTRG.13408.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13408.1.p1.exon8MSTRG.13408.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13408.1.p1.exon7MSTRG.13408.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13408.1.p1.exon6MSTRG.13408.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13408.1.p1.exon5MSTRG.13408.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13408.1.p1.exon4MSTRG.13408.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13408.1.p1.exon3MSTRG.13408.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13408.1.p1.exon2MSTRG.13408.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13408.1.p1.exon1MSTRG.13408.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13408.1.p1MSTRG.13408.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000106_pilongenomesc0000106_pilon:593810..617631 -