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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000006_pilon:2078695..2089455+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.1340.6.p1 ID=MSTRG.1340.6.p1|Name=MSTRG.1340.6.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10761bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:2078695..2089455+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ctttaattgacggactactttaattgatgGACTACTTTGAACTTGatgga
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ATTCTCTTTGTTCGGTAATGCTTGAGCCtttttttCTCTGAGCTTTCTGT
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AATTGGATAAACAGAAATTATGATTTGTGGAGCTACTAAAACTTCGAAAT
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TAACCATCAAGGAAACTACATTAACAACAAAGCTAGCATTGATCTATTTG
AAATATTGATACCTTTGGAACTTAATACCACCTGCAGAACTGactattga
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CATTCTTAGCTCCGTTGTGGTGTGGGCTATATTTAAAACAAAGGTGTGGA
CTTCACAATCGACGAGGCTTATTTTGATTGCATCTGTTATCGATATTGTC
GGCTCATTGGTCAAAAACTTTTGCATCTCGCTTTATGTGGCTTCAAGTGA
GAATTTAGCATGTCCTACCAAGAATGTTTTACTATCTGTTGCAGTTTCAT
TATCTTACGGTCATTTTTTCATGACGGTTGTTATATCGTTTGATCGATTG
ATGCATATTCTATTTCTAAACAACTATGTTACAAAGTTCAACTCCAAAAG
ATGTAACTTGGTCTTACTTACAGCCCTTGTACTACAAATTTTGCAAACTG
TATTATATGGTATAGGCTCAAGTAGCGCTAATGCTGGGGAAGGCTCTAAA
TTGACTTTACCTATTCATGTTATATCTTATATAGCATGCATATCATTTTA
CGGTACATCTATAATGAAGCTCAGAAGCATCATTGGTTCTAACCTTTCAA
ACGATTCTCGAAGCTTGACAAAAATGGCATCCATATATATCATTATCTAT
TTAGCACAGAGTCCCTTGATTATTTTTCAAGTATTGATCTTGAAAAGTTC
TATACATTTTCAAGCGTGGCATGTTAGTATAATAAGTTTCACAGCTTTTT
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CCTCAGCAATCAGATTAAAAAAGGGACTGAAATTTATGCTATTTACACCA
GCATAAAAGTTTTACTTTCATgggtttaatttttttgaaaattattaaat
gATACTCGCTTGGGGAGGGAATCCGAAGGAAAAGACGAATTTTACTCACG
TAAACTTTTGCCGTCAACTCTGCAAATGAAATCACAGATCTCTTTTCTTA
CTTTAGAACTCAACTCTGGTGTTGCACAATGTGGATGCGTTTCCTGTTGG
TATTTCTAAACATTTCCCGTCAATTGATTCGTTACTTCTCATTGATTCTC
ACATACAAAATTGTTATGGTGGTATTGAGAAACTCCAACACTTGACCACA
CTCAAATTGAAGGTAAATAATAACATTGTAATAGTGCTCCTCGTCGCATA
CATCGCGTGATTGTTCTAACTGAAATTTGTACGAGTCTCaatcccagggg
ggggggtttctaggggttcgaaataccgttttcccgtcaaaatttttgct
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GAAAGGAAGTTTTTATTCTCTTTATTttgcaagagcaaaaaatgtaaagg
aggatggaattgaaaaaattttgaaagaaaatctgTTCGgatttgttagt
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AGGAAGGACGGAAAGTTGTTTTCACTTTCCTGCAGGAATAAAATCTCACC
ATTTTTTATtctgaaagagaaaaataacAGCGCCTAAATTCTAAATTTGT
CTTTCACATTCGCCTATTTTCACATCTAAAAAAGAGAAGTGACGGGAAGC
TAGCAGAGCAGTAGTTAaattcaaaacttgaaaaattatttattccCTAT
TTTCGTTCTTCAGAAATGTTGCTGTTCCAATATGTCCCTTAGAAGTAAAC
AACTGAGAGTTTTAGACATCTCTGAAAACAACATCACTAATTTATTTGGT
TTGTCCGAATTGCAATTTCTTTCCTACCTTGACGCGTCAGATAATCGAAT
CTCGAAAATCA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000006_pilon:2078695..2089455+ >MSTRG.1340.6.p1 ID=MSTRG.1340.6.p1|Name=MSTRG.1340.6.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1026bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:2078695..2089455+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
attgGATCCCATCAAACGAAAAAATCGAGTTGTCATAAGAACTCAACTCT
GGTGTTGCACAATGTGGATGCGTTTCCTGTTGGTATTTCTAAACATTTCC
CGTCAATTGATTCGTTACTTCTCATTGATTCTCACATACAAAATTGTTAT
GGTGGTATTGAGAAACTCCAACACTTGACCACACTCAAATTGAAGAAATG
TTGCTGTTCCAATATGTCCCTTAGAAGTAAACAACTGAGAGTTTTAGACA
TCTCTGAAAACAACATCACTAATTTATTTGGTTTGTCCGAATTGCAATTT
CTTTCCTACCTTGACGCGTCAGATAATCGAATCTCGAAAATCattgGATC
CCATCAAACGAAAAAATCGAGTTGTCATAAGAACTCAACTCTGGTGTTGC
ACAATGTGGATGCGTTTCCTGTTGGTATTTCTAAACATTTCCCGTCAATT
GATTCGTTACTTCTCATTGATTCTCACATACAAAATTGTTATGGTGGTAT
TGAGAAACTCCAACACTTGACCACACTCAAATTGAAGAAATGTTGCTGTT
CCAATATGTCCCTTAGAAGTAAACAACTGAGAGTTTTAGACATCTCTGAA
AACAACATCACTAATTTATTTGGTTTGTCCGAATTGCAATTTCTTTCCTA
CCTTGACGCGTCAGATAATCGAATCTCGAAAATCattgGATCCCATCAAA
CGAAAAAATCGAGTTGTCATAAGAACTCAACTCTGGTGTTGCACAATGTG
GATGCGTTTCCTGTTGGTATTTCTAAACATTTCCCGTCAATTGATTCGTT
ACTTCTCATTGATTCTCACATACAAAATTGTTATGGTGGTATTGAGAAAC
TCCAACACTTGACCACACTCAAATTGAAGAAATGTTGCTGTTCCAATATG
TCCCTTAGAAGTAAACAACTGAGAGTTTTAGACATCTCTGAAAACAACAT
CACTAATTTATTTGGTTTGTCCGAATTGCAATTTCTTTCCTACCTTGACG
CGTCAGATAATCGAATCTCGAAAATC
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000006_pilon | genome | sc0000006_pilon:2078695..2089455 + |
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