MSTRG.13394.7.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13394.7.p2
Unique NameMSTRG.13394.7.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000106_pilon:206259..242276-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13394.7.p2 ID=MSTRG.13394.7.p2|Name=MSTRG.13394.7.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=36018bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000106_pilon:206259..242276- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTGAATTGAAGTTCTCCAACTTTCAAAACATAACCCTAGATTAAAAATAT TGACCTCTTTAATGACCTTCAATACTTGAAATGAACTGTGCTTTATAACA TTTCCTTTCTATGATAAAAATAACTTTAATAAAATCCTAAGTCACGTTTC ATCTTTGTGTAGTTGTGTCATGTTAACCTTACACAAAGCACCCACTTTTA TGGTCCTGTTTTGAAAACCTTATTAAAGCTGGTTAGATGGGAGTAGAAAA TCATGTTATTTGCATACATTCGCGCATCGTATATTGGTAGAATTGTTAAA AGAAGCTACAAAGAGGTGGGTATCAAAAATTTGTCAGATGAGTTGGAGTT TTTATAAGATACTTTAATAATTGGTCATTTAAGTAATAAAAATGACGCCT TTTTTAGAAAAAGTAACAAAATTGTTTTATTACTGGTTAGCGACCAACCA AATCAAATAAGAGCTTTTAAAAACTCCATCACGTCCCAAATTTGTAATGA GGAACTTGTTGTTTCAATCAAATCTCATTGTTTTGTAGGATTTTTCAGTG ACATCTGACGAGTAATTATTTTTTTTAAAGATTTTTGCCTTCAAATGTTT TTCTTGCCAATCTAGAATTTTTCAATTTCATTTAAATCTTAATTTCGTTC TCTTTCTAGCTTTTGAACGACAAAGAGCTGAATCCACCAGACTTGTTATG TTTGGCTGGTCGAATCTACAAGGATAAATATTATGCTTCCAATTTCACGG ATGACAAGTGTCGAGATGAGGCCATCAAATGGTGAGAAATATTTATTTTA TTGATATGTCTTATTGGTTAATATCTTGCCCGGGGGGGGGGAGGTAAGAG GTTTGCGAATGGACGGGTATGTCCGAGCCAAAGTTTGACCCTTAGAGAGA CGAAAATTTTTTGACATTTTTACCACCTTAGAGACTATTTCCCCAAGAAT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000106_pilon:206259..242276-

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TGCAGCAGAAAGGATGTTTTTATTGAATCCACCACCATGGTATTTGAGAT
CGATCATACAAGATTTGGAAGTCATCAAACATAAAATACACGCTTGTGAA
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CATCAAATGATGTTATTTGCATACATTCGCGCATCGTATATTGGTAGAAT
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GTTGATCCGCGAGAAATGGGGCCCATTGATCGATAACGAGGGAGCAATGG
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ACCTTTGCACGAGGAGATTGCGCTGCACCGGGAAATCAATCACAAAAATA
TCGTACGTTACATTGCATCGCGTAGTGAAGATGGTTTCACCAAGATCTTC
ATGGAACAAGTACCTGGAGTATGAATATGAGATCGATCATCAAGGAAATC
GCGTGGTATTAGGTCGTGGTTCATTTGGTACGGTATACGCTGCACGTAAT
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GATACTCGATTTCTGGTATGACGTTGAACGGGCTTATTGGTCGCCGTGGG
CATCTTCAAGACATTCAACAGTTCTGGATAGTGGGTCGTTTCATATTGAT
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TGTTTTTATTGAATCCACCACCATGGTATTTGAGATCGATCATACAAGAT
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GGAGAGTGAGGTACAAAACATCGTTTGAAATCCAACCATCAGATTTCTCA
GGATGCAACTTGGCGATTATGTTGGTTGCAGCTGGTCATTCTTTCCTCCA
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CCAGACTTGTTATGTTTGGCTGGTCGAATCTACAAGGATAAATATTATGC
TTCCAATTTCACGGATGACAAGTGTCGAGATGAGGCCATCAAATGATGTT
ATTTGCATACATTCGCGCATCGTATATTGGTAGAATTGTTAAAAGAAGCT
ACAAAGAGCCCTCTTTATTTTAGGAAGTTTATCAACGTTGATCCGCGAGA
AATGGGGCCCATTGATCGATAACGAGGGAGCAATGGCTTTTTATACACAG
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AGATTGCGCTGCACCGGGAAATCAATCACAAAAATATCGTACGTTACATT
GCATCGCGTAGTGAAGATGGTTTCACCAAGATCTTCATGGAACAAGTACC
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TAGTGGGCAGCATATCAGCACCTATTCTTGACAATGTTGATGGTGATGAT
GTTCTTGTTGACCAAGATGCTCTCGAATACGTTTAAAAAAGACAATCGAT
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GGTATGACGTTGAACGGGCTTATTGGTCGCCGTGGGCATCTTCAAGACAT
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GAGATGTGTCCAGAGCTTGTCTTGCAGCAGAAAGGATGTTTTTATTGAAT
CCACCACCATGGTATTTGAGATCGATCATACAAGATTTGGAAGTCATCAA
ACATAAAATACACGCTTGTGAAGAGAGCCACGAGGAGGAGAGTGAGGTAC
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GATTATGTTGGTTGCAGCTGGTCATTCTTTCCTCCAATCAGATGAATTGC
AAAGAGTGTCTTTTGAACGACAAAGAGCTGAATCCACCAGACTTGTTATG
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TGTCAAATATCTGCCAAGTACAACCTTTGCACGAGGAGATTGCGCTGCAC
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GAGATCGATCATCAAGGAAATCGCGTGGTATTAGGTCGTGGTTCATTTGG
TACGGTATACGCTGCACGTAATCTCTCAACAAATGTTACAATGGCTGTCA
AAGAAATTCCTGAAAAAGACACAAGGTTTCAAGATTTAGTGGGCAGCATA
TCAGCACCTATTCTTGACAATGTTGATGGTGATGATGTTCTTGTTGACCA
AGATGCTCTCGAATACGTTTAAAAAAGACAATCGATGTTTGTTTCTATAC
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AAAAAGAAAATTCACAGTTGGAGTTTTCACGCGTCAGATATTCGGGGTAT
AAGTTTATTCGATTATGGCACGCCATACCACCTTGTGGAAAAAATCACAC
CGAAAAATGCAAGGTACTCTTACAAGACCCTGGGAACGACTTCATACCAA
GTTACATTGTTGTTGGTTCGGACAATAAAGATTCTGTACCGGACAGTGCT
CAAACGGTTTCAATGAAACATAATTATTGGCAAGAATGTATCTACAAAGC
GGCCACTGACTGTGAAGTTGACGATACTCGATTTCTGGTATGACGTTGAA
CGGGCTTATTGGTCGCCGTGGGCATCTTCAAGACATTCAACAGTTCTGGA
TAGTGGGTCGTTTCATATTGATTAGTGTTCTTGCAAGAGATGTGTCCAGA
GCTTGTCTTGCAGCAGAAAGGATGTTTTTATTGAATCCACCACCATGGTA
TTTGAGATCGATCATACAAGATTTGGAAGTCATCAAACATAAAATACACG
CTTGTGAAGAGAGCCACGAGGAGGAGAGTGAGGTACAAAACATCGTTTGA
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CAGCTGGTCATTCTTTCCTCCAATCAGATGAATTGCAAAGAGTGTCTTTT
GAACGACAAAGAGCTGAATCCACCAGACTTGTTATGTTTGGCTGGTCGAA
TCTACAAGGATAAATATTATGCTTCCAATTTCACGGATGACAAGTGTCGA
GATGAGGCCATCAAATGATGTTATTTGCATACATTCGCGCATCGTATATT
GGTAGAATTGTTAAAAGAAGCTACAAAGAGCCCTCTTTATTTTAGGAAGT
TTATCAACGTTGATCCGCGAGAAATGGGGCCCATTGATCGATAACGAGGG
AGCAATGGCTTTTTATACACAGCAGATTGTTGAAGGTGTCAAATATCTGC
CAAGTACAACCTTTGCACGAGGAGATTGCGCTGCACCGGGAAATCAATCA
CAAAAATATCGTACGTTACATTGCATCGCGTAGTGAAGATGGTTTCACCA
AGATCTTCATGGAACAAGTACCTGGAGTATGAATATGAGATCGATCATCA
AGGAAATCGCGTGGTATTAGGTCGTGGTTCATTTGGTACGGTATACGCTG
CACGTAATCTCTCAACAAATGTTACAATGGCTGTCAAAGAAATTCCTGAA
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TGACAATGTTGATGGTGATGATGTTCTTGTTGACCAAGATGCTCTCGAAT
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CGATTTTCAACTCTTCTTTTGTACGCCACATCATCGAAAAAGAAAATTCA
CAGTTGGAGTTTTCACGCGTCAGATATTCGGGGTATAAGTTTATTCGATT
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GGTTCGGACAATAAAGATTCTGTACCGGACAGTGCTCAAACGGTTTCAAT
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AAGTTGACGATACTCGATTTCTGGTATGACGTTGAACGGGCTTATTGGTC
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TATTATGCTTCCAATTTCACGGATGACAAGTGTCGAGATGAGGCCATCAA
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GTTACATTGCATCGCGTAGTGAAGATGGTTTCACCAAGATCTTCATGGAA
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CGTATATTGGTAGAATTGTTAAAAGAAGCTACAAAGAGCCCTCTTTATTT
TAGGAAGTTTATCAACGTTGATCCGCGAGAAATGGGGCCCATTGATCGAT
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GTTTCAATGAAACATAATTATTGGCAAGAATGTATCTACAAAGCGGCCAC
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TATTGGTCGCCGTGGGCATCTTCAAGACATTCAACAGTTCTGGATAGTGG
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ATTCAACAGTTCTGGATAGTGGGTCGTTTCATATTGATTAGTGTTCTTGC
AAGAGATGTGTCCAGAGCTTGTCTTGCAGCAGAAAGGATGTTTTTATTGA
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GCAAAGAGTGTCTTTTGAACGACAAAGAGCTGAATCCACCAGACTTGTTA
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GGATGACAAGTGTCGAGATGAGGCCATCAAATGATGTTATTTGCATACAT
TCGCGCATCGTATATTGGTAGAATTGTTAAAAGAAGCTACAAAGAGCCCT
CTTTATTTTAGGAAGTTTATCAACGTTGATCCGCGAGAAATGGGGCCCAT
TGATCGATAACGAGGGAGCAATGGCTTTTTATACACAGCAGATTGTTGAA
GGTGTCAAATATCTGCCAAGTACAACCTTTGCACGAGGAGATTGCGCTGC
ACCGGGAAATCAATCACAAAAATATCGTACGTTACATTGCATCGCGTAGT
GAAGATGGTTTCACCAAGATCTTCATGGAACAAGTACCTGGAGTATGAAT
ATGAGATCGATCATCAAGGAAATCGCGTGGTATTAGGTCGTGGTTCATTT
GGTACGGTATACGCTGCACGTAATCTCTCAACAAATGTTACAATGGCTGT
CAAAGAAATTCCTGAAAAAGACACAAGGTTTCAAGATTTAGTGGGCAGCA
TATCAGCACCTATTCTTGACAATGTTGATGGTGATGATGTTCTTGTTGAC
CAAGATGCTCTCGAATACGTTTAAAAAAGACAATCGATGTTTGTTTCTAT
ACGTTCACAATTCAGACGATTTTCAACTCTTCTTTTGTACGCCACATCAT
CGAAAAAGAAAATTCACAGTTGGAGTTTTCACGCGTCAGATATTCGGGGT
ATAAGTTTATTCGATTATGGCACGCCATACCACCTTGTGGAAAAAATCAC
ACCGAAAAATGCAAGGTACTCTTACAAGACCCTGGGAACGACTTCATACC
AAGTTACATTGTTGTTGGTTCGGACAATAAAGATTCTGTACCGGACAGTG
CTCAAACGGTTTCAATGAAACATAATTATTGGCAAGAATGTATCTACAAA
GCGGCCACTGACTGTGAAGTTGACGATACTCGATTTCTGGTATGACGTTG
AACGGGCTTATTGGTCGCCGTGGGCATCTTCAAGACATTCAACAGTTCTG
GATAGTGGGTCGTTTCATATTGATTAGTGTTCTTGCAAGAGATGTGTCCA
GAGCTTGTCTTGCAGCAGAAAGGATGTTTTTATTGAATCCACCACCATGG
TATTTGAGATCGATCATACAAGATTTGGAAGTCATCAAACATAAAATACA
CGCTTGTGAAGAGAGCCACGAGGAGGAGAGTGAGGTACAAAACATCGTTT
GAAATCCAACCATCAGATTTCTCAGGATGCAACTTGGCGATTATGTTGGT
TGCAGCTGGTCATTCTTTCCTCCAATCAGATGAATTGCAAAGAGTGTCTT
TTGAACGACAAAGAGCTGAATCCACCAGACTTGTTATGTTTGGCTGGTCG
AATCTACAAGGATAAATATTATGCTTCCAATTTCACGGATGACAAGTGTC
GAGATGAGGCCATCAAATGATGTTATTTGCATACATTCGCGCATCGTATA
TTGGTAGAATTGTTAAAAGAAGCTACAAAGAGCCCTCTTTATTTTAGGAA
GTTTATCAACGTTGATCCGCGAGAAATGGGGCCCATTGATCGATAACGAG
GGAGCAATGGCTTTTTATACACAGCAGATTGTTGAAGGTGTCAAATATCT
GCCAAGTACAACCTTTGCACGAGGAGATTGCGCTGCACCGGGAAATCAAT
CACAAAAATATCGTACGTTACATTGCATCGCGTAGTGAAGATGGTTTCAC
CAAGATCTTCATGGAACAAGTACCTGGAGTATGAATATGAGATCGATCAT
CAAGGAAATCGCGTGGTATTAGGTCGTGGTTCATTTGGTACGGTATACGC
TGCACGTAATCTCTCAACAAATGTTACAATGGCTGTCAAAGAAATTCCTG
AAAAAGACACAAGGTTTCAAGATTTAGTGGGCAGCATATCAGCACCTATT
CTTGACAATGTTGATGGTGATGATGTTCTTGTTGACCAAGATGCTCTCGA
ATACGTTTAAAAAAGACAATCGATGTTTGTTTCTATACGTTCACAATTCA
GACGATTTTCAACTCTTCTTTTGTACGCCACATCATCGAAAAAGAAAATT
CACAGTTGGAGTTTTCACGCGTCAGATATTCGGGGTATAAGTTTATTCGA
TTATGGCACGCCATACCACCTTGTGGAAAAAATCACACCGAAAAATGCAA
GGTACTCTTACAAGACCCTGGGAACGACTTCATACCAAGTTACATTGTTG
TTGGTTCGGACAATAAAGATTCTGTACCGGACAGTGCTCAAACGGTTTCA
ATGAAACATAATTATTGGCAAGAATGTATCTACAAAGCGGCCACTGACTG
TGAAGTTGACGATACTCGATTTCTGGTATGACGTTGAACGGGCTTATTGG
TCGCCGTGGGCATCTTCAAGACATTCAACAGTTCTGGATAGTGGGTCGTT
TCATATTGATTAGTGTTCTTGCAAGAGATGTGTCCAGAGCTTGTCTTGCA
GCAGAAAGGATGTTTTTATTGAATCCACCACCATGGTATTTGAGATCGAT
CATACAAGATTTGGAAGTCATCAAACATAAAATACACGCTTGTGAAGAGA
GCCACGAGGAGGAGAGTGAGGTACAAAACATCGTTTGAAATCCAACCATC
AGATTTCTCAGGATGCAACTTGGCGATTATGTTGGTTGCAGCTGGTCATT
CTTTCCTCCAATCAGATGAATTGCAAAGAGTGTCTTTTGAACGACAAAGA
GCTGAATCCACCAGACTTGTTATGTTTGGCTGGTCGAATCTACAAGGATA
AATATTATGCTTCCAATTTCACGGATGACAAGTGTCGAGATGAGGCCATC
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AAAAGAAGCTACAAAGAGCCCTCTTTATTTTAGGAAGTTTATCAACGTTG
ATCCGCGAGAAATGGGGCCCATTGATCGATAACGAGGGAGCAATGGCTTT
TTATACACAGCAGATTGTTGAAGGTGTCAAATATCTGCCAAGTACAACCT
TTGCACGAGGAGATTGCGCTGCACCGGGAAATCAATCACAAAAATATCGT
ACGTTACATTGCATCGCGTAGTGAAGATGGTTTCACCAAGATCTTCATGG
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GGTATTAGGTCGTGGTTCATTTGGTACGGTATACGCTGCACGTAATCTCT
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TGGTGATGATGTTCTTGTTGACCAAGATGCTCTCGAATACGTTTAAAAAA
GACAATCGATGTTTGTTTCTATACGTTCACAATTCAGACGATTTTCAACT
CTTCTTTTGTACGCCACATCATCGAAAAAGAAAATTCACAGTTGGAGTTT
TCACGCGTCAGATATTCGGGGTATAAGTTTATTCGATTATGGCACGCCAT
ACCACCTTGTGGAAAAAATCACACCGAAAAATGCAAGGTACTCTTACAAG
ACCCTGGGAACGACTTCATACCAAGTTACATTGTTGTTGGTTCGGACAAT
AAAGATTCTGTACCGGACAGTGCTCAAACGGTTTCAATGAAACATAATTA
TTGGCAAGAATGTATCTACAAAGCGGCCACTGACTGTGAAGTTGACGATA
CTCGATTTCTGGTATGACGTTGAACGGGCTTATTGGTCGCCGTGGGCATC
TTCAAGACATTCAACAGTTCTGGATAGTGGGTCGTTTCATATTGATTAGT
GTTCTTGCAAGAGATGTGTCCAGAGCTTGTCTTGCAGCAGAAAGGATGTT
TTTATTGAATCCACCACCATGGTATTTGAGATCGATCATACAAGATTTGG
AAGTCATCAAACATAAAATACACGCTTGTGAAGAGAGCCACGAGGAGGAG
AGTGAGGTACAAAACATCGTTTGAAATCCAACCATCAGATTTCTCAGGAT
GCAACTTGGCGATTATGTTGGTTGCAGCTGGTCATTCTTTCCTCCAATCA
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ACTTGTTATGTTTGGCTGGTCGAATCTACAAGGATAAATATTATGCTTCC
AATTTCACGGATGACAAGTGTCGAGATGAGGCCATCAAATGATGTTATTT
GCATACATTCGCGCATCGTATATTGGTAGAATTGTTAAAAGAAGCTACAA
AGAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13394MSTRG.13394Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13394.7.p2MSTRG.13394.7.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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