MSTRG.13390.2.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13390.2.p2
Unique NameMSTRG.13390.2.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000106_pilon:157797..194139-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13390.2.p2 ID=MSTRG.13390.2.p2|Name=MSTRG.13390.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=36343bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000106_pilon:157797..194139- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CAAAAATGGTAAAAACCTCAACGTTCTGCAAGCAGAGCCAAATTAGGACA ATTAAATTAGGATCCTGCATTGATATTATGACCCTAAATGTCTTAACAGT CGTTTAAACGTACGGCCCACAGTATTGCCCGAACACTTTCGGGTCATGCT CGGGTCAAAATAGCAAATCATCTTTTTTTTCACAAAATCTTGGATTTTCG CCTCCGAAGACCTGACCTGAACATTCACAGGCAAGTTCGGGTCATGTTCG GGACTATTTCAAGCTCAAAATCGTCAATACCGTGTACACTTTTTACTAGG ATTGTGAGGATTTCGTGCTACCCAAAGGCTTACCAATAACATCCAGGATG ACTGCTCATTCCATTGACCCATACAACGGAAATTCTTTGGAACAAATGTC TTCATTTGGTCATTAACTTTCTACATTAACATTTATAGATAATTTTTATG GATTTTTGGATTGAAAATATTTTTAACTTTTGATAAATAAAGACTTGGGG ACACGAGAAGTTTTTTTCGAGTTGGTGCAACGCAACATGCTCTATCCCAC CAACACAAGAAAAAAGTGCGTGTCCCATGGTTTCTTTTTTGTTTCATGGT ACAAAAAGTGAGGGAAATACCCAAAAGACACGCTGATTTTGTCCCAGGGT CAAAAGTGAGATTTCACTTTTAATGATAGAAAATAGAAAAAATGGGGTGG AGATACGAGAAAGCGTTTCAGGTTGGTGGGATGAAGCATGTTGCATTGCA CCAACGCGAAAAAAACTTCTCGTGTCTTCCAGTCTTTATTTATCAAAAGT TAAAAATATTTTCAATTCAAATATTTTTCCTTAAGTTTTGAAATGGAGAA TTTTTCTAACGTGTAATTGCTTTTGTATTTTGAAATTAGTTTTTGAACCA CATTTTTTCTAGGATTTTTTTTGATTTCGTAGAATTAGAATTCGCGAGTT TGAGTGCCATTCTTGAAATAAGCCCACGATAGAAATGTAAAAGTACGTGG AACACGAAAATTATTGGCATATGAGGATTCAATTTAATTACCAATATTTC ATACAGTGTGTCCCGAAAAAGAGTATCGAGTTCGAACATTATTCTGAGTA GGAGGTTGTTGCGTGTGTTTAACAAAATGCACAATAATTGTTTTTACCAA CAGTCATTATGATTAAAAATAATTAACTCTCTTTACAATTTTC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000106_pilon:157797..194139-

>MSTRG.13390.2.p2 ID=MSTRG.13390.2.p2|Name=MSTRG.13390.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3945bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000106_pilon:157797..194139- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AATCCCTACGATCAGTTGTGGTTGTTCTTCGGTACTGAGACAATATCTCG
AAACTTGTACCAGAGAGTAACCCATCACGTTTTATACTGGTCACTAAAAC
GGGACATATATGTATGTTCACCTCTGACCTTTGTTTATCAAAAAAACTTC
ATATGGAAGATCCACTGGAAACATCACTTGATGAGGTCCCGAAAAAGAGA
CGAACTAAACTATGGGTGACAGACTGTGTGTGCATCAAAGAGCTGAATAA
GCTGGTCATTTGTACCGCTAATCGTGATTTACAGATTTTTGATTTGTCAA
CGCCACATTGCTCACAACAATTTCAACTTTATGATTGATTGGAGGAAGCG
TGGCATTATATCATGGGATGATGTTTGTTCATATTTCATTCTTGAAAGTA
AAGATTCTGAAGAAGTGATTGACAAACAATCAGCATTTGTCAGTCAACCT
CACATCGTCAAATTCTCTACTTTAAAGCTCATTTACCAGAAAAGAAAACC
ATCACCAAAAGGAAATTATTCTTGAGAAGCATCACCTTGAGTTACTTTTA
ATTGAATTCAAAAATGGCAGTAGTAGTCGTGCTGGTTCCAAAGCTAGTGC
AAAATCCTCATTGTCTCCAACTGCAAAACAAATGGATTGTGAAACATTCA
GTCAAACATTATCAGAGATTATCAAAAGAGATGGTTTGATCCAGAATGAT
GATTTGATCAACAGCAGCTGTCAAATGCTGTTCAAAAAGATGATAAATGA
AGCAACACAAGAAAACAATAACAAAGAAGTTCGGAAAGAAATCCCTACGA
TCAGTTGTGGTTGTTCTTCGGTACTGAGACAATATCTCGAAACTTGTACC
AGAGAGTAACCCATCACGTTTTATACTGGTCACTAAAACGGGACATATAT
GTATGTTCACCTCTGACCTTTGTTTATCAAAAAAACTTCATATGGAAGAT
CCACTGGAAACATCACTTGATGAGGTCCCGAAAAAGAGACGAACTAAACT
ATGGGTGACAGACTGTGTGTGCATCAAAGAGCTGAATAAGCTGGTCATTT
GTACCGCTAATCGTGATTTACAGATTTTTGATTTGTCAACGCCACATTGC
TCACAACAATTTCAACTTTATGATTGATTGGAGGAAGCGTGGCATTATAT
CATGGGATGATGTTTGTTCATATTTCATTCTTGAAAGTAAAGATTCTGAA
GAAGTGATTGACAAACAATCAGCATTTGTCAGTCAACCTCACATCGTCAA
ATTCTCTACTTTAAAGCTCATTTACCAGAAAAGAAAACCATCACCAAAAG
GAAATTATTCTTGAGAAGCATCACCTTGAGTTACTTTTAATTGAATTCAA
AAATGGCAGTAGTAGTCGTGCTGGTTCCAAAGCTAGTGCAAAATCCTCAT
TGTCTCCAACTGCAAAACAAATGGATTGTGAAACATTCAGTCAAACATTA
TCAGAGATTATCAAAAGAGATGGTTTGATCCAGAATGATGATTTGATCAA
CAGCAGCTGTCAAATGCTGTTCAAAAAGATGATAAATGAAGCAACACAAG
AAAACAATAACAAAGAAGTTCGGAAAGAAATCCCTACGATCAGTTGTGGT
TGTTCTTCGGTACTGAGACAATATCTCGAAACTTGTACCAGAGAGTAACC
CATCACGTTTTATACTGGTCACTAAAACGGGACATATATGTATGTTCACC
TCTGACCTTTGTTTATCAAAAAAACTTCATATGGAAGATCCACTGGAAAC
ATCACTTGATGAGGTCCCGAAAAAGAGACGAACTAAACTATGGGTGACAG
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TCAACTTTATGATTGATTGGAGGAAGCGTGGCATTATATCATGGGATGAT
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TAAAGCTCATTTACCAGAAAAGAAAACCATCACCAAAAGGAAATTATTCT
TGAGAAGCATCACCTTGAGTTACTTTTAATTGAATTCAAAAATGGCAGTA
GTAGTCGTGCTGGTTCCAAAGCTAGTGCAAAATCCTCATTGTCTCCAACT
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AAATGCTGTTCAAAAAGATGATAAATGAAGCAACACAAGAAAACAATAAC
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AGGTCCCGAAAAAGAGACGAACTAAACTATGGGTGACAGACTGTGTGTGC
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GATTTTTGATTTGTCAACGCCACATTGCTCACAACAATTTCAACTTTATG
ATTGATTGGAGGAAGCGTGGCATTATATCATGGGATGATGTTTGTTCATA
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TACCAGAAAAGAAAACCATCACCAAAAGGAAATTATTCTTGAGAAGCATC
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AATGATGATTTGATCAACAGCAGCTGTCAAATGCTGTTCAAAAAGATGAT
AAATGAAGCAACACAAGAAAACAATAACAAAGAAGTTCGGAAAGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13390MSTRG.13390Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13390.2.p2MSTRG.13390.2.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13390.2.p2.exon21MSTRG.13390.2.p2.exon21Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13390.2.p2.exon20MSTRG.13390.2.p2.exon20Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13390.2.p2.exon19MSTRG.13390.2.p2.exon19Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13390.2.p2.exon18MSTRG.13390.2.p2.exon18Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13390.2.p2.exon17MSTRG.13390.2.p2.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13390.2.p2.exon16MSTRG.13390.2.p2.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13390.2.p2.exon15MSTRG.13390.2.p2.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13390.2.p2.exon14MSTRG.13390.2.p2.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13390.2.p2.exon13MSTRG.13390.2.p2.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13390.2.p2.exon12MSTRG.13390.2.p2.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13390.2.p2.exon11MSTRG.13390.2.p2.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13390.2.p2.exon10MSTRG.13390.2.p2.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13390.2.p2.exon9MSTRG.13390.2.p2.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13390.2.p2.exon8MSTRG.13390.2.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13390.2.p2.exon7MSTRG.13390.2.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13390.2.p2.exon6MSTRG.13390.2.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13390.2.p2.exon5MSTRG.13390.2.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13390.2.p2.exon4MSTRG.13390.2.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13390.2.p2.exon3MSTRG.13390.2.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13390.2.p2.exon2MSTRG.13390.2.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13390.2.p2.exon1MSTRG.13390.2.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000106_pilongenomesc0000106_pilon:157797..194139 -