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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000105_pilon:640312..653721+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13348.3.p3 ID=MSTRG.13348.3.p3|Name=MSTRG.13348.3.p3|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13410bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000105_pilon:640312..653721+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
cactTTTAGTTTTagagagtgaagaattgatataaaaaagaagtgaagaa
gagatgtaaattgagaaaatgaagagaatTTTGGTGGCAGAGCTGTTCCT
GATACAACTCTTCGTTCTTTCATCCGCAGGAGAAAAGGTATGATGCATTT
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TGTTGAGAAAATTGTGGAAAACCGTCATGTCTATGGGGTAGTAAACATGT
GGCTTGGgtgacaaaaaattgaaatctcaAAGGGTAGATCTTTGAGAAAA
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ACGTGGGCAATGTAGACCCACCACTTTTTAATTATACTaatctataaaat
aaacaataaagaaATATAATATCAACATCAACATTCCCCATCTATGTACG
AGTAACATTAAGATCAAAACCAAGACAACAGCCACATGGCGACGCTGAAG
CTGTGTCAAAAACATAAGCACAACATAACATAGTGTCAAGGCACCATACC
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ATCAATACTGTTTTCACTACCATAGACATATTGTTCAACAAATATCAACc
gaatcaaatatttcaaacaacCAATCATAAAACGAATGACTACAACTACA
TAGCGACGCTGTAGTTGCATCGACCAGCTTCAAGGACTGCAGTGAGTTTG
GTTGGATCAGCACCTAGTTTGGTTAGGCAACCTGCTAACTGTAACTTTGC
TGGAACCCATTTGATACAATTCAACTCTTGTCTGGACATCACTTCTTTGA
TGATTGAGATATCAACTGTAAGACGGTGTTCGTCAGACATTGTAGTTGAA
TGTGCGtttttttGATGAAGAGATTCGTTTTCAGTGATTACTCGAATCTT
GACAGAAGTGCAACTCACCATTTGAGCGAGGGTGCGTGAGATACAGTAGG
GGGAATCCAAGGCGGCAACCATTGCACTGGTTTTTGCAGCTATAGTACTT
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AACACGCTGGAGCACTTTGTTGGAATTTATAATGTTCTCTACCTTTGGTG
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TGTCTCTTCCTTGGTACAGTTTGATGACTTTTACATTTGTTCATTTGTTG
ACAGTTCCAGGGAATAGCGTCGATAGAGTTTATGTAACCAAATTGATCGA
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AAGTTACGTGATGCTGTTCGGCCTGTCGTAAATTTTccacacaatttttg
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CATGGGCTTGAATAATTCCTGTAAGGTCATCATGTTCATCAATGAAGTAG
AAGATTCCGTAATCTATGGCAGATCTCTGACAGTCGAGCAATTTAAGTTG
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TTTCTGGTACATACCCATCTACCGTTTAATCTGGGTTGTCCGATGTCGGC
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TGGCTTCCAGAAACACGTCAGAAACTGTTTGTGCGACACATGTGACATAG
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CCTGGACATTTTGCCAGTTACGGTTTACGCCACCCTTTTTTCCTGCAGGA
CCGAGAATTTTAACTTTGTTCCAATCACTGTCAAAGTAACGAAAACCGAC
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AACAGCTGGTCTCGGAATGGTAGGCTTGTATCGTTTACAGACAAGACATT
TCTCTGAGTGGCGCTTTAAAACATCGATGAGCTCTTTGTCTGGATTGTCA
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ACGACGGATTCGTTTAGCAGCAGATTCTCTTCTCTTGTGGTGTCATTTCT
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TCTATCATCAGGATAATTTCGTTTGTCCTTTTGGCGTTATTGCTTCCAAG
CTACGTACGAATCATATTCCTCTGCAGAGGTAAATAGTGGTTTCTGCTTC
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ttatggcAGAGTTGCCAAAGTACTTTTTCAGAGCTTTTTTCGCTTGCTCA
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AAATCTGAGTCCGATAGATTAGCATCGCACAGTAGGTTTAGTCCGTGCAC
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TCATACATCATTATGTattgttcaatatttttgatCATCTTTTCTAGCCA
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ttgtaaTGTTTCTCAAATAGGGCAATGACAGCTCTGCGACCAGACTCTCC
TTTCATGTCGTCTGTGTCTAATGTGTCAAAGATCTGATGAGGTATCTCAC
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TCTTTCCAGGCCTTGGCTTCTCGGAGCTATATCGTAAACTCTTTGTTCTT
TTCATCCCACAGTGGTGTTTTAAAAATCCAGTTGCCATGATGAACCACCC
GCTGCTACCATGAAAGACTTGGTGAAATATATACGTTTGCAATGTAAAAA
CCCACCACTGTGTAATTATACTaatctataaaataaacaataaagaaACA
TAATATCATTTCATATCAACACTATCCACAAATAATTgccagtggaaaca
agaatgtctGTAAATTCTGACAGTCAAATACAattgtggaattttttttt
tgtttatttaagcattaagagaatcaaaagcgctatatttgaatgtattt
tttggttgaaaaaatcgcgatttttagcagttaattttgcgattaaaaaa
tgacctttttttctacttatgctataacattcatttttacaccagtggta
gttcaacctttaGGTAAAGAAAGTTGTCGAATTTCAaggtaaaaagaaaa
gaagctcTTAagagcacttttctgtgaaacatcatcaaatctccaaattt
ttaataaaaatgggGGTAgtgatgataaaacagtttACGATTTCTTTAAT
AAATAGCCAAACTGCTTAGTGTTTTGAGAATCAGCAAGGTTCTTTAATTA
CTTAAAATAACAAAGACaatagttctatttatactgagacggaaaaatcg
tctgagacgagtagtttgtaaaatgtgatctgtggaggagatcctattta
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tgctcgtcgCAGTATAAATAAAACTAATGTAAGTTCAATATGAAATTCaa
attgccttaaaaaattgaaagtgttCCATCACTCTTTCCTTCATCTGCCT
TTCGGTAAAATGGATTCTAAACGAAATGATCAATAATACCAATCAACACT
TCCCAACTATTAATTgtactgttcaaaaaagataacataacccccgtttc
aattaaattttttaaatcaattttttaaatatctttcagACATGTTTCGA
AGACGCTGCCAGTATCCTTGGTGAATATGACAGTCTGTTAGCAGGACGAA
TCACCTTTAAGGATGTCTATCTAAACATGCCACGAATGAATGAGGAGAGG
TTTTTTGAACTGATGGAAAATTTCACTTCAAATGGGACTTCTTACACCAC
CAGGGGGACAAGGTATGCTGCAGATGATTCTTCTGTTCTTTGAAATGAAC
GGATGTTCTGTaataattgatgtttttttgtgAGAGGAAAATTAAGGAGA
AGTCTGGTTAAtcaattttggtattttggaaagaaaaacgTTTCTGAAAA
TTCATGTATCTAAATTTTTGTCATTGCTTTAAACAAAAAAGTCTTTGATA
TCTTCATGTCAGAAAGTCTACAATTCTATTCTAGCCAACCAGCACAATCT
AAAGGTTTCAGACCTGAATAGTCAGGTGTTTAAAGGCTGAAAAGGTAGTG
ACTTGGACTTCTAACTTTTGAATACTATGTTCCTTTGCAGTGATTGGCTA
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AAAGAAAAAGTTGAGCGCAGGCTATACCGCAATATCCAACTCCAAGGATG
AActctttcaatattttgacaaatatgaAAGTAAGAATGTTTTGTTATTG
GTTGATTAACCTTTTCCTTGGGTTTTGTTTGGAATGGAAGTCACTTTGGA
TGAGGATGAACTCTCATTGTGAAGCGCTAACATCACAACTATTGCCAAAA
ACTTTATTATTCAGATAAAATGGAGTTTCTTAGAACTCCTCTGTTTCAAA
CATTTGACTCCCCAAACCCTTGATAATCACAAAGCTTGACTTCTTGCGCC
TTTTTTGCAAATAATTGACTCAAatattccgggggggggggcacttgagT
AAGATTGGGTACGAGAATGTTCCGCTGGTCAGAGTCCCTTTTTTAGgatc
tgaagatatctgacagggtcccaaatttacaaATCTTCACGaagtgtatc
tgacagggtcaacttttGGTTATTTCTGACAATTTTCGGGCTagaaattg
gaaatttttttcattctttcattctGACAGGATCCCAATAAATTACCAAA
CATTCGTATTTGgcagggtctatttttcaaaCTCTAGGCACATCCCTGTC
GGcagtcaaggtcagtgcccctcccccccccccgggggaaaTATTCTTAT
AACGTGTATCATTAATTGAAATGAGggatttgaattttcttttcttcagg
tGATGACAATAGTTACTTTTTCAAGATGAGAATTGAAGGCGCTTTCCCTC
GACAATGGATCATTGAGAAATTATCATATCGAAGAGGTAATGTTTAGTTG
CCTTTCTTTCCCTTAGGCTGCACGTGGCCCCTTTGACATGTTTTGAtagt
tacccccgtctttgtgcTTTTGAATTTCAGAAACTTAATTAGCCTGATTA
GTAAGTTTTAAATAAGAGATCTTGAAGTTTCAATCTAAAATTTGAATGGC
CAGGggttaatacaatcattggatttctaaACGAAACAAGTTACCCCGAA
TTTCGGGTagctctcggacgggaattttacacacgattagcatcccctat
atcaaaactaatcagaagggatgcgtgcagcctattTCATTTCCTGGGTT
GTCACTTTGGTCTATCCAAAGTAGGAGCTACTCAAAATTgggctttccca
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gaacatcctggatatccactcttaaaaatatgctcaacccctggatatcg
tattttttacttgaaaaggcactttaccccctggatatccgctctcTTGT
AGATATTTAAACCCCTGGCCCCTGGATATCcccttttgaacaaaaatcgt
taaccccctggatatccgatatcctcaacacgAACTATTACGACacaaaa
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GAATGCGAAATTTTTTAAGACTTTTGGTTGACAGTAGAAAACCACCAAAA
GACAAAATCCTAAGTTTCTATCGAATAATCATAGAAGAAATCTGACCTTG
AACGTTCATTACAGGGAAAAAGAAAGTAGTTAAATGCGGTGCTTGCAATA
ATACCAGAACTCATTGTCCAACTTTCAGGATATCGTATTTACCAAAGTGG
TGACGATGCTTTCTCATTGAAAGCCTGGCTCACCACCAAATATAACATGT
TCGATTTCAAGACGCAGAGTTTTTGGCGTAACCGCTATTTGATGGTTTGG
GAGGCGAACAAAAAACGTATAGAACAAAGGTTGAAAGAAACAGGCCGGAG
TTTGGATGATATGGATGCGATTAACGAACAAATTAGACCATGGATGAGAT
ACGTCAGGGTAAGATGACGATTTCGTACCAACTTGCATCAGTTTACGATT
TTACTGATCGATTTCGACTCGAGCTGagcttttcttaattttttgaaatt
ttcaggcttatttGATCTTACGATGTTCCTAAAAAggggtttaaaatctg
ttaaagtATGTACTTTCTTTGTAATTTCTGAAATTGGAGGCTTTAGGGTt
agttcttaatttgttcttaagttttggccaattttcagcctcgtgttctt
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TGTTTTCTTTCTCGAATGTTTTCTTTCTCGAATGTTCAGACCAAACTTTT
CTGTGAGTTCTCTTCTAGACGGTGATAGGACTTTTCTGTGAGTTCTTTTC
AGGACGGTGATAGGACTTTTCTGTGAGTTCTTTTCAGGACGGTGATAGGA
CTTTTCTGTGAGTTCTTTTCAGGACGGTGATAGGACTTTTCTGTGAGTTC
TTTTCAGGACGGTGATAGGACTTTTCTGTGAGTTCTTTCAGGACGGTGAT
AGGACTTTTCTGTGAGTTCTTTTCAGGACGGTGATAGGACTTTTCTGTGA
TTTCTTTTCAGGACGGTGATAGGACTTTTCTGTGAGTTCTTTTCAGGACG
GTGATAGGACTTTTCTGTGAGTTCTTTTCAGGACGGTGATAGGACTTTTA
GATATTTGTGTGTATTGTAGATTCAACGTAGTTATTCTGTTGGGAAAAAG
ATCCTCTTGATAAAAATCAAACAGTAAAAAGTTACTCAGATtctagtttt
tttcttttgactgtGGTGCTGTAAAAATATCACTTCTTGATGACTTTCTA
CAAAAGTTTCTTGATTCCCTTTCCATTGCACTTTCTTTTAGGATTATAAC
CGTGATGAGGCTCgaaagaatttcgaaaaatcatGGAATGCATTCGGTGC
TAAACGAATCTTAtcacaaaaacaatttcaggaaGAATATCTGTGAGTTT
TTAATTTTCGTAAGTTTTACATTTACTGATAATATCTAGAAAGTTGCGAT
AAATTTTTCGCTTGATAGCTTTAGTATCGCACTTTATCAAACTTTACttc
cttcatttttattttaagtcTTATCACACTTTTGATACAGCTTCCGtttt
tttGGTAAATTACTTTCTATGTTAAAGTGCATCATAGCACTTGTAAGTAA
GTAAGAATGTTAATTAAAGTTTTTCTGCGTTTCATTTGCCGTTTCAGTGG
TTTACTACACAACGTGACGTCACAAATGCAACCCTACTTTAAAGATAACA
CCCTTCTCTGGACTCAAGAAATATTCAATAGCTGGATTGGTTTGTTTGGC
ACCCCCAATCATTATTGCTACCCTGATGTTCCTTTTAATGCTGCCGAGGC
GAACACCTTGCCCAACTTTCTACGCTTGAAAATCAAAGTAGTGTCTGTAA
GTTTTTCCGTATTAACTGCTGAACTTCGTATAAACCCTGCGGACACGCAG
TTTCTCGATTCCGACCAACTAAAATCCTTGAACGAAGTTTTCTTGGAACT
GATACACAAATGGTATCACTACTCAATAGTGGTGTAATGCAAAGAAAGCG
CTAGGTCTaccactgggcgaaataagagatttccaatgctgaaaatatct
tgaaaatgtgATATTTCCATACACATtagtaaatatggaaatatgacttt
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ATGTTCGAAGGGTGAAAACATCAAGCAAAACTTTTGGCTATTGTCTGCAG
TATCGTTCATTACAATGCTCTATTACTTAACCATGGTCTGAGTATAATGT
ACTGTGTTTAAAATTGACTTCTTGCAGTTCGTAAAGTTAACGATCCACGG
CTGGTCTATGGTATGGGATAAATTCCATTTATTGGTTTTCATGAACCTTG
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AAAGGACAAAGCTTAAAGCACTTTCGTATTTAATGTAAGATTAGAACAGG
ACCAGAAGAGACCTTTGCGTCTCTGAATGGCGCTTGCTAAGTCAATCTTT
gaggttgaaatttcaaatgatTATTTTGgatcaaatttatattttttaca
gtGGAGAAGATTTGCGTCTGAGCGCAATACTTGCTCGGAAATAAACCCAG
GATAGTGTGAATAGTACACTTGTTATGAATTGGAAGAGTTGAAAAAGCAG
AAGATTAAATTCCAGTTCTACTCAAgggtcccgctaagggtccaagggtA
AAAGTCGGGTGACACAGATCCGTCCGCTGACAACCCAAGTACCCTGCCGG
GAAAGTCCCTGAAAGAGTTGAAAAAGCAGAAGATTAAATTCCAGTTCTAC
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GTCCGCTGACAACCCAAGTACCCTGCCGGGAAAAAATTTCCGTTTTTGAT
AAGTAAGGAGCTGGATACAAGGGAATACTCTtaaattcgatattttcaag
tCTCAGATTTTGTACAAATATTATATATTCTTAATTATATGgctgattac
atttagcttagaaaTGTAAGGAAGGAGCGGGGTGATTAACCCGTAATAGC
CCTGCTGTAATCAACCCGCGAAAAGAGAAAAGCAATTCAAATAATTTCAT
TGATTAGTTGtcattcgaacttctattaagtgacaaaaataaaaaggagc
tttgaaaaaaataaacaaaaatgtgaacaaaaatgtgaacaaaataagta
aaaaGGAGGAGTGGCCGAATTTTAATATACCCATAATAATTACTGAGGTT
Aaacataccaggataatcacgacgacggacgaaaatgtaaaaggctagtg
aaaatatgaaatttgattggttgaaacccactagcctgttaaattttcgt
tcgtcgtcgtgattttgccgatttacttaacctcactattaacGAGGAAT
AACATGGTCGTTCGGATGATTGTGGGAATAATAGCCCcttgtttcattga
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caatgaacctcgggactatcccaaatcaccctccaaaccatgttattaca
TATCTTAGTATTTTAACATTATGTTTTGGTTCGTGGAATTTATTCTCGTC
AGGACCCCTCGATTATGTTCGTTCCTTCATCAGCAAGGTTTATTACGTAA
CATTGGTCATACATTTATTTATCAGGCCTCGCTGGAAGATGTTGTAATTC
CCGATGTCCTTGTTCTGTTGTTTGAAGTCGAATTAATGGTATTGACTTTT
CTCAGGACCCCTCGATTATGATGCAAGAACATAATAGGTGATGCATTCGA
ATTCCAAAATGCGATGATATGTGTCACAAAATCGAACAAATCTTTATACT
TCCAGTATGTGATGAAACCGCTAGCGTAACAAACGCCATAAGCAGCCAGC
GGCATCCAACACACCACAAAAATGATGAAAGATTTGATGCAGAAATTCAA
GAATCTTTTCTCTGCTTTATTGAAGGTTTTCTTCTTTGTTTCGTCTTGAG
CCCCTGCTGTATCGTTTTGTTGAGCATTTCTGAGAGTTCTTCGCTTCAAC
GTTCTCAAAATGACAGCATAAGAAATGGTGATCAGAAAAGCGGTGATGAA
AATAACCAGAGGTGTTTTGATGTACTCTTTCTCATGGTCGTTGACTGCTA
TGTTATGTAGAATTATAGCCAGGACGGTTAACGCCCAAATTGCAACACAG
ATGATGCACTTTTTGCTCCATTCCAGCATGTTATAATACATAGGTTTCTT
GACAGCCAACACTCTTTCCACCGTCAAAGCAGCCAATGTCAGGACGGAGA
CATACAGAGAAATGTAAATCATTTTAAGCTGAAAGAAAAGTCTGTATTTG
GGGTCAACTCCATTGTTTTGTTCTGCCAGCTTCAAGATTTTGACCATTAA
GATGAAGACACCAAGAATGATATCTGAAACAGCCAAATTCAAAATGTAGA
CGGTAGATTTGACTCGATCCATAATTTTATGTTTGAAGATGAACCAAATC
TCGATGATGTTAAGGATGATCATGAGACAAGCGGTCAAAGGGCTTAACAC
CATGAATAAAAACGTCTTGAAATccatcttttatcttttttggaTTGAGT
GGTGGTTTTTGCATATATTTGAACTGTAAGAATAaagatcaaaataaaat
cttaaataCCCTGCATTACCGGTAGATAAAATCCAGCATGGAGCACCATT
TAAGAGTTCCCCACCCTTCCAGCTGAGTTCCTAATCACATCATCATGCGC
CAAAATAATTACGATGTCAGAAATATTCTCTCATCATGCATCACGCTGTC
AAATCGCCAACAGAGGCCTAATCACACCCATGCAAACCTCTACATCATTA
TTTAGCAAATCCATTCAAAAACGTTCTTATAAATTCCCCATTTCTCGACC
CTCAAAAGGCTAAATTAACAGCAAGATAGTCTCAATAAGGGTTATataat
tcatgaaaatttcgGCTTTTTCCTTTATTTAAGCCGCTGTGAAGACCCTC
CAAAGGCTCCACCGCCAGAAGTCGGGTGgtacatacccgtcatctcgcaa
acctagtaccccccccatATTAAAATCTAAGGGAAAGTCTGAATTTCATG
AAAATCGTTTACCGCAAGATGaaattaatttgtaaatttcGTTTcccctg
aaatatttttttcttctacaTTTGTGAAATCAAAGATCAAAGGTTTGACT
CCCAGGTTTT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000105_pilon:640312..653721+ >MSTRG.13348.3.p3 ID=MSTRG.13348.3.p3|Name=MSTRG.13348.3.p3|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=684bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000105_pilon:640312..653721+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCAACCCTACTTTAAAGATAACACCCTTCTCTGGACTCAAGAAATATT
CAATAGCTGGATTGGTTTGTTTGGCACCCCCAATCATTATTGCTACCCTG
ATGTTCCTTTTAATGCTGCCGAGGCGAACACCTTGCCCAACTTTCTACGC
TTGAAAATCAAAGTAGTGTCTAATCCCGGTGAAACGTGGACGGCAGAAAA
TGCGCGGATCCTGGCCAAAAGTGTCAAACACAGTACGAACGATATCGGAT
TATGTTCGAAGGGTGAAAACATCAAGCAAAACTTTTGGCTATTGTCTGCA
GTATCGTTCATTACAATGCTCTATTACTTAACCATGGTCTGAATGCAACC
CTACTTTAAAGATAACACCCTTCTCTGGACTCAAGAAATATTCAATAGCT
GGATTGGTTTGTTTGGCACCCCCAATCATTATTGCTACCCTGATGTTCCT
TTTAATGCTGCCGAGGCGAACACCTTGCCCAACTTTCTACGCTTGAAAAT
CAAAGTAGTGTCTAATCCCGGTGAAACGTGGACGGCAGAAAATGCGCGGA
TCCTGGCCAAAAGTGTCAAACACAGTACGAACGATATCGGATTATGTTCG
AAGGGTGAAAACATCAAGCAAAACTTTTGGCTATTGTCTGCAGTATCGTT
CATTACAATGCTCTATTACTTAACCATGGTCTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000105_pilon | genome | sc0000105_pilon:640312..653721 + |
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