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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000105_pilon:640306..653721+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13348.2.p2 ID=MSTRG.13348.2.p2|Name=MSTRG.13348.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13416bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000105_pilon:640306..653721+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
attttacactTTTAGTTTTagagagtgaagaattgatataaaaaagaagt
gaagaagagatgtaaattgagaaaatgaagagaatTTTGGTGGCAGAGCT
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TGCTCATACATCTTTCATCGGGATAGTTTCCATCCACCTCTCGCATAGCT
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TAATTACTTAAAATAACAAAGACaatagttctatttatactgagacggaa
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CTGCCTTTCGGTAAAATGGATTCTAAACGAAATGATCAATAATACCAATC
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TTATTGGTTGATTAACCTTTTCCTTGGGTTTTGTTTGGAATGGAAGTCAC
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TTCAAACATTTGACTCCCCAAACCCTTGATAATCACAAAGCTTGACTTCT
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ttgagTAAGATTGGGTACGAGAATGTTCCGCTGGTCAGAGTCCCTTTTTT
AGgatctgaagatatctgacagggtcccaaatttacaaATCTTCACGaag
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TCTTATAACGTGTATCATTAATTGAAATGAGggatttgaattttcttttc
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GAtagttacccccgtctttgtgcTTTTGAATTTCAGAAACTTAATTAGCC
TGATTAGTAAGTTTTAAATAAGAGATCTTGAAGTTTCAATCTAAAATTTG
AATGGCCAGGggttaatacaatcattggatttctaaACGAAACAAGTTAC
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TGGGTTGTCACTTTGGTCTATCCAAAGTAGGAGCTACTCAAAATTgggct
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tcTTGTAGATATTTAAACCCCTGGCCCCTGGATATCcccttttgaacaaa
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ATATGTGAATGCGAAATTTTTTAAGACTTTTGGTTGACAGTAGAAAACCA
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GCAATAATACCAGAACTCATTGTCCAACTTTCAGGATATCGTATTTACCA
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ACATGTTCGATTTCAAGACGCAGAGTTTTTGGCGTAACCGCTATTTGATG
GTTTGGGAGGCGAACAAAAAACGTATAGAACAAAGGTTGAAAGAAACAGG
CCGGAGTTTGGATGATATGGATGCGATTAACGAACAAATTAGACCATGGA
TGAGATACGTCAGGGTAAGATGACGATTTCGTACCAACTTGCATCAGTTT
ACGATTTTACTGATCGATTTCGACTCGAGCTGagcttttcttaatttttt
gaaattttcaggcttatttGATCTTACGATGTTCCTAAAAAggggtttaa
aatctgttaaagtATGTACTTTCTTTGTAATTTCTGAAATTGGAGGCTTT
AGGGTtagttcttaatttgttcttaagttttggccaattttcagcctcgt
gttcttatataaaaaataaggaACTTGGATCGAGTTTGTGATTTTACTAA
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CTTTTCAGGACGGTGATAGGACTTTTCTGTGAGTTCTTTTCAGGACGGTG
ATAGGACTTTTCTGTGAGTTCTTTTCAGGACGGTGATAGGACTTTTCTGT
GAGTTCTTTTCAGGACGGTGATAGGACTTTTCTGTGAGTTCTTTCAGGAC
GGTGATAGGACTTTTCTGTGAGTTCTTTTCAGGACGGTGATAGGACTTTT
CTGTGATTTCTTTTCAGGACGGTGATAGGACTTTTCTGTGAGTTCTTTTC
AGGACGGTGATAGGACTTTTCTGTGAGTTCTTTTCAGGACGGTGATAGGA
CTTTTAGATATTTGTGTGTATTGTAGATTCAACGTAGTTATTCTGTTGGG
AAAAAGATCCTCTTGATAAAAATCAAACAGTAAAAAGTTACTCAGATtct
agtttttttcttttgactgtGGTGCTGTAAAAATATCACTTCTTGATGAC
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TATAACCGTGATGAGGCTCgaaagaatttcgaaaaatcatGGAATGCATT
CGGTGCTAAACGAATCTTAtcacaaaaacaatttcaggaaGAATATCTGT
GAGTTTTTAATTTTCGTAAGTTTTACATTTACTGATAATATCTAGAAAGT
TGCGATAAATTTTTCGCTTGATAGCTTTAGTATCGCACTTTATCAAACTT
TACttccttcatttttattttaagtcTTATCACACTTTTGATACAGCTTC
CGtttttttGGTAAATTACTTTCTATGTTAAAGTGCATCATAGCACTTGT
AAGTAAGTAAGAATGTTAATTAAAGTTTTTCTGCGTTTCATTTGCCGTTT
CAGTGGTTTACTACACAACGTGACGTCACAAATGCAACCCTACTTTAAAG
ATAACACCCTTCTCTGGACTCAAGAAATATTCAATAGCTGGATTGGTTTG
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CGAGGCGAACACCTTGCCCAACTTTCTACGCTTGAAAATCAAAGTAGTGT
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ACGCAGTTTCTCGATTCCGACCAACTAAAATCCTTGAACGAAGTTTTCTT
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aattaaaagtttttaatcgtgaacgataaatgcagcagcagaatcattgg
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cgctataacacaTCCCTGTTTACAGTTACgactttcaaagatttttacaT
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GAAAATGCGCGGATCCTGGCCAAAAGTGTCAAACACAGTACGAACGATAT
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ATGTTGAAAGGACAAAGCTTAAAGCACTTTCGTATTTAATGTAAGATTAG
AACAGGACCAGAAGAGACCTTTGCGTCTCTGAATGGCGCTTGCTAAGTCA
ATCTTTgaggttgaaatttcaaatgatTATTTTGgatcaaatttatattt
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AGATCCGTCCGCTGACAACCCAAGTACCCTGCCGGGAAAAAATTTCCGTT
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AATAGCCCTGCTGTAATCAACCCGCGAAAAGAGAAAAGCAATTCAAATAA
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GAGGTTAaacataccaggataatcacgacgacggacgaaaatgtaaaagg
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AGGAATAACATGGTCGTTCGGATGATTGTGGGAATAATAGCCCcttgttt
cattgaaaacatttcgaAATAGCCCTTACTCCGTtcaggctattttgaaa
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CTCGTCAGGACCCCTCGATTATGTTCGTTCCTTCATCAGCAAGGTTTATT
ACGTAACATTGGTCATACATTTATTTATCAGGCCTCGCTGGAAGATGTTG
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ATTCGAATTCCAAAATGCGATGATATGTGTCACAAAATCGAACAAATCTT
TATACTTCCAGTATGTGATGAAACCGCTAGCGTAACAAACGCCATAAGCA
GCCAGCGGCATCCAACACACCACAAAAATGATGAAAGATTTGATGCAGAA
ATTCAAGAATCTTTTCTCTGCTTTATTGAAGGTTTTCTTCTTTGTTTCGT
CTTGAGCCCCTGCTGTATCGTTTTGTTGAGCATTTCTGAGAGTTCTTCGC
TTCAACGTTCTCAAAATGACAGCATAAGAAATGGTGATCAGAAAAGCGGT
GATGAAAATAACCAGAGGTGTTTTGATGTACTCTTTCTCATGGTCGTTGA
CTGCTATGTTATGTAGAATTATAGCCAGGACGGTTAACGCCCAAATTGCA
ACACAGATGATGCACTTTTTGCTCCATTCCAGCATGTTATAATACATAGG
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CATTAAGATGAAGACACCAAGAATGATATCTGAAACAGCCAAATTCAAAA
TGTAGACGGTAGATTTGACTCGATCCATAATTTTATGTTTGAAGATGAAC
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TAACACCATGAATAAAAACGTCTTGAAATccatcttttatcttttttgga
TTGAGTGGTGGTTTTTGCATATATTTGAACTGTAAGAATAaagatcaaaa
taaaatcttaaataCCCTGCATTACCGGTAGATAAAATCCAGCATGGAGC
ACCATTTAAGAGTTCCCCACCCTTCCAGCTGAGTTCCTAATCACATCATC
ATGCGCCAAAATAATTACGATGTCAGAAATATTCTCTCATCATGCATCAC
GCTGTCAAATCGCCAACAGAGGCCTAATCACACCCATGCAAACCTCTACA
TCATTATTTAGCAAATCCATTCAAAAACGTTCTTATAAATTCCCCATTTC
TCGACCCTCAAAAGGCTAAATTAACAGCAAGATAGTCTCAATAAGGGTTA
TataattcatgaaaatttcgGCTTTTTCCTTTATTTAAGCCGCTGTGAAG
ACCCTCCAAAGGCTCCACCGCCAGAAGTCGGGTGgtacatacccgtcatc
tcgcaaacctagtaccccccccatATTAAAATCTAAGGGAAAGTCTGAAT
TTCATGAAAATCGTTTACCGCAAGATGaaattaatttgtaaatttcGTTT
cccctgaaatatttttttcttctacaTTTGTGAAATCAAAGATCAAAGGT
TTGACTCCCAGGTTTT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000105_pilon:640306..653721+ >MSTRG.13348.2.p2 ID=MSTRG.13348.2.p2|Name=MSTRG.13348.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3810bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000105_pilon:640306..653721+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGAATTGAAGGCGCTTTCCCTCGACAATGGATCATTGAGAAATTATC
ATATCGAAGAGGATATCGTATTTACCAAAGTGGTGACGATGCTTTCTCAT
TGAAAGCCTGGCTCACCACCAAATATAACATGTTCGATTTCAAGACGCAG
AGTTTTTGGCGTAACCGCTATTTGATGGTTTGGGAGGCGAACAAAAAACG
TATAGAACAAAGGTTGAAAGAAACAGGCCGGAGTTTGGATGATATGGATG
CGATTAACGAACAAATTAGACCATGGATGAGATACGTCAGGGATTATAAC
CGTGATGAGGCTCgaaagaatttcgaaaaatcatGGAATGCATTCGGTGC
TAAACGAATCTTAtcacaaaaacaatttcaggaaGAATATCTTGGTTTAC
TACACAACGTGACGTCACAAATGCAACCCTACTTTAAAGATAACACCCTT
CTCTGGACTCAAGAAATATTCAATAGCTGGATTGGTTTGTTTGGCACCCC
CAATCATTATTGCTACCCTGATGTTCCTTTTAATGCTGCCGAGGCGAACA
CCTTGCCCAACTTTCTACGCTTGAAAATCAAAGTAGTGTCTAATCCCGGT
GAAACGTGGACGGCAGAAAATGCGCGGATCCTGGCCAAAAGTGTCAAACA
CAGTACGAACGATATCGGATTATGTTCGAAGGGTGAAAACATCAAGCAAA
ACTTTTGGCTATTGTCTGCAGTATCGTTCATTACAATGCTCTATTACTTA
ACCATGGTCTGAATGAGAATTGAAGGCGCTTTCCCTCGACAATGGATCAT
TGAGAAATTATCATATCGAAGAGGATATCGTATTTACCAAAGTGGTGACG
ATGCTTTCTCATTGAAAGCCTGGCTCACCACCAAATATAACATGTTCGAT
TTCAAGACGCAGAGTTTTTGGCGTAACCGCTATTTGATGGTTTGGGAGGC
GAACAAAAAACGTATAGAACAAAGGTTGAAAGAAACAGGCCGGAGTTTGG
ATGATATGGATGCGATTAACGAACAAATTAGACCATGGATGAGATACGTC
AGGGATTATAACCGTGATGAGGCTCgaaagaatttcgaaaaatcatGGAA
TGCATTCGGTGCTAAACGAATCTTAtcacaaaaacaatttcaggaaGAAT
ATCTTGGTTTACTACACAACGTGACGTCACAAATGCAACCCTACTTTAAA
GATAACACCCTTCTCTGGACTCAAGAAATATTCAATAGCTGGATTGGTTT
GTTTGGCACCCCCAATCATTATTGCTACCCTGATGTTCCTTTTAATGCTG
CCGAGGCGAACACCTTGCCCAACTTTCTACGCTTGAAAATCAAAGTAGTG
TCTAATCCCGGTGAAACGTGGACGGCAGAAAATGCGCGGATCCTGGCCAA
AAGTGTCAAACACAGTACGAACGATATCGGATTATGTTCGAAGGGTGAAA
ACATCAAGCAAAACTTTTGGCTATTGTCTGCAGTATCGTTCATTACAATG
CTCTATTACTTAACCATGGTCTGAATGAGAATTGAAGGCGCTTTCCCTCG
ACAATGGATCATTGAGAAATTATCATATCGAAGAGGATATCGTATTTACC
AAAGTGGTGACGATGCTTTCTCATTGAAAGCCTGGCTCACCACCAAATAT
AACATGTTCGATTTCAAGACGCAGAGTTTTTGGCGTAACCGCTATTTGAT
GGTTTGGGAGGCGAACAAAAAACGTATAGAACAAAGGTTGAAAGAAACAG
GCCGGAGTTTGGATGATATGGATGCGATTAACGAACAAATTAGACCATGG
ATGAGATACGTCAGGGATTATAACCGTGATGAGGCTCgaaagaatttcga
aaaatcatGGAATGCATTCGGTGCTAAACGAATCTTAtcacaaaaacaat
ttcaggaaGAATATCTTGGTTTACTACACAACGTGACGTCACAAATGCAA
CCCTACTTTAAAGATAACACCCTTCTCTGGACTCAAGAAATATTCAATAG
CTGGATTGGTTTGTTTGGCACCCCCAATCATTATTGCTACCCTGATGTTC
CTTTTAATGCTGCCGAGGCGAACACCTTGCCCAACTTTCTACGCTTGAAA
ATCAAAGTAGTGTCTAATCCCGGTGAAACGTGGACGGCAGAAAATGCGCG
GATCCTGGCCAAAAGTGTCAAACACAGTACGAACGATATCGGATTATGTT
CGAAGGGTGAAAACATCAAGCAAAACTTTTGGCTATTGTCTGCAGTATCG
TTCATTACAATGCTCTATTACTTAACCATGGTCTGAATGAGAATTGAAGG
CGCTTTCCCTCGACAATGGATCATTGAGAAATTATCATATCGAAGAGGAT
ATCGTATTTACCAAAGTGGTGACGATGCTTTCTCATTGAAAGCCTGGCTC
ACCACCAAATATAACATGTTCGATTTCAAGACGCAGAGTTTTTGGCGTAA
CCGCTATTTGATGGTTTGGGAGGCGAACAAAAAACGTATAGAACAAAGGT
TGAAAGAAACAGGCCGGAGTTTGGATGATATGGATGCGATTAACGAACAA
ATTAGACCATGGATGAGATACGTCAGGGATTATAACCGTGATGAGGCTCg
aaagaatttcgaaaaatcatGGAATGCATTCGGTGCTAAACGAATCTTAt
cacaaaaacaatttcaggaaGAATATCTTGGTTTACTACACAACGTGACG
TCACAAATGCAACCCTACTTTAAAGATAACACCCTTCTCTGGACTCAAGA
AATATTCAATAGCTGGATTGGTTTGTTTGGCACCCCCAATCATTATTGCT
ACCCTGATGTTCCTTTTAATGCTGCCGAGGCGAACACCTTGCCCAACTTT
CTACGCTTGAAAATCAAAGTAGTGTCTAATCCCGGTGAAACGTGGACGGC
AGAAAATGCGCGGATCCTGGCCAAAAGTGTCAAACACAGTACGAACGATA
TCGGATTATGTTCGAAGGGTGAAAACATCAAGCAAAACTTTTGGCTATTG
TCTGCAGTATCGTTCATTACAATGCTCTATTACTTAACCATGGTCTGAAT
GAGAATTGAAGGCGCTTTCCCTCGACAATGGATCATTGAGAAATTATCAT
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TTTTTGGCGTAACCGCTATTTGATGGTTTGGGAGGCGAACAAAAAACGTA
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ATTAACGAACAAATTAGACCATGGATGAGATACGTCAGGGATTATAACCG
TGATGAGGCTCgaaagaatttcgaaaaatcatGGAATGCATTCGGTGCTA
AACGAATCTTAtcacaaaaacaatttcaggaaGAATATCTTGGTTTACTA
CACAACGTGACGTCACAAATGCAACCCTACTTTAAAGATAACACCCTTCT
CTGGACTCAAGAAATATTCAATAGCTGGATTGGTTTGTTTGGCACCCCCA
ATCATTATTGCTACCCTGATGTTCCTTTTAATGCTGCCGAGGCGAACACC
TTGCCCAACTTTCTACGCTTGAAAATCAAAGTAGTGTCTAATCCCGGTGA
AACGTGGACGGCAGAAAATGCGCGGATCCTGGCCAAAAGTGTCAAACACA
GTACGAACGATATCGGATTATGTTCGAAGGGTGAAAACATCAAGCAAAAC
TTTTGGCTATTGTCTGCAGTATCGTTCATTACAATGCTCTATTACTTAAC
CATGGTCTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000105_pilon | genome | sc0000105_pilon:640306..653721 + |
|
