MSTRG.13330.1.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13330.1.p2
Unique NameMSTRG.13330.1.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000105_pilon:422682..440058-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13330.1.p2 ID=MSTRG.13330.1.p2|Name=MSTRG.13330.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=17377bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000105_pilon:422682..440058- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ATTAATTCGCATTCTGTTTAGATCATTCATCTACCATCCATAAAACGTTG AAAGCACGAACAAGTTGGTCATCGATTGAAACCACCGACTCTTCCTCAGG GATCGGTTCTCATAACTCTCTCAACTCGCACCATCTTCGGTCAGGCCACT CATCAACAACCACGCTACCTAGCAACTATTGCCATAGCAACAGCAGTAAT GAATCCGAGGGAATCGAGCACGACTTCCCCGATCCAGACCATGTCGGTAA TTATCCGCTACCCCCGCCCATGGATTTCAATACGCCAATGAAATACGGTA ATGACGCCGGCAAATACGCCACAATTGATCGCAGTCATTTCCGACGTAAT CAGCGGTTGACGTCAAGCTTACGTGAACAGAACGGAGGTATCAAGCAACG ATCAAACAGTTTCGGGGAAAACGAAAACCCGTTTCCGGATTACAAAATGA ATCTGCCGAAAAACAAGATGAACACTATTGCAAGGACAGCCTTTCCCTCA AACACAAACGGCTCGTCTAATGGCCGACCAACCATTTACAATCTCTTTGA TCAACAAACAGCCGCTGAACTTCGAAAGAAACTCAGTCCAACTTCCTCAC CCGTCAAAGCTACAGCACCACCCTTACCGAGACGTAATTCAACATCCAAT CACGCCCCTCCACCCACCACCCCAAAACCGAAAAGCCCTTACAAACGATC AATGACATTACAAACGATGAGGGCGGAACCGAAGGCGTTCACAGAAGATA ACGAGCCCGAAGTGGAGGATATTACGCCTGGTTCCTTTCAAGATGAGCTC AACAAACGCCGCCTCACAATTCGTAGAATGAGTGCCACCAAAAAACCGGA AGGCTCTGTCGGTCCTTATATTTGAACTGAACTGGACTGACCGATGATCA CTAACCCGAGTCCGTAAATTACACACATGTGTTGTTAGTATTTGGTTTCC AATGGAAACTGACGGTGGAGGAGAAGAAGGTGAATTCTTTCTTTAAGCCT CCTGGCTAGCGAGGATCTGCTCTTGGGATCCTCAGCAACTTATTTTGAGA AGGTCCACTTCAAAGAAAGTGTTTTTTAAATTTATATCGCCAGTGACTTT ATGGTGTATGGTAGCAAAACGGTAAAGATTAATAAGTGCAATAGGACTAG AAATGCACTCGAAAATATCACAAATATAATGAAATACAGACACATCGAAT GTCTGGTTGAACTGAGAGATCTTGAGTTGATATTTCGAATGGTTGATGTA TCCAAGCTACGGGCACATTAAAAACGGTTACTTATTTTATCACATAAGCG TGTTTTTAAAATAGCTTTAAATTAGTATTAATATTTAGCCTTCGATCTAT ATATATTCTACACTCACGTTATTTTAAAAGCAGAGAACCATAAACTAAAA TTGTAGACTAATTTTGTTTTGTTTTATGCAGTGGACACATTTTTTTAGTT TTTTAAACAATTTTTTCATAGTTATTATTTCAAGCTTTTACAATCTTTGG GGGGTTTTTAGTTACTCTTTGTGGATCTTAGATACATTTTCGCCCTTCGC AACTCATTAACTTCATTAACAAATCTCACCCTTTACGCGTTAGGATTACA TGTTGAGCTCATCCCGCCCCCGCCCTCACCCTTCACCCACCCGGTAACAA CGAGGCAGCGTAAGTTCAATTCTGCTGGTTAGAATTGGGCGGCTGTGTTG CTGTTCTCCTTAAGCTGTCTTGTTTGTCTTGCTCGTGGAATGATTCTCTT CCTTCTATTTAGGTAGGATTGCTTGTTATTTTTCATTGTTGAGTTTTGTA AAATATCTTATATAATTTTTTTTTTTTTCAAATCTCTTTAATCACCAAAA TACTTGGTATAATAATATATAATAATATATCATTGAATATCTTCCTTCGG TATTTTGATTATTGATTTGTAATTATCGGTACGGTACGCTTACATGGTCT GCATTCACATGACTTTGGCTAGTTTCTAGTTTCTCAGACTGATATCTATC GAATTATGTCACCATAACTTTCATGAAGTCCTACGAGGTTTTGCTACCAA TTTGCAACCGTTTGCGTTTTATTTTGTTGTTTTTATTCTCAGAAAGTTAT AATTATTTATGTTTTTGACAATTAGAAATTGTTTATTTTTACACTTTTTC CTTCATATTATTATTGTATAAGAAGAT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000105_pilon:422682..440058-

>MSTRG.13330.1.p2 ID=MSTRG.13330.1.p2|Name=MSTRG.13330.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=606bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000105_pilon:422682..440058- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGATTTCAATACGCCAATGAAATACGGTAATGACGCCGGCAAATACGC
CACAATTGATCGCAGTCATTTCCGACGTAATCAGCGGTTGACGTCAAGCT
TACGTGAACAGAACGGAGGTATCAAGCAACGATCAAACAGTTTCGGGGAA
AACGAAAACCCGTTTCCGGATTACAAAATGAATCTGCCGAAAAACAAGAT
GAACACTATTGCAAGGACAGCCTTTCCCTCAAACACAAACGGCTCGTCTA
ATGGCCGACCAACCATTTACAATCTCTTTGATCAACAAACAGCCGCTGAA
CTTCGAAAGAAACTCAGTCCAACTTCCTCACCCGTCAAAGCTACAGCACC
ACCCTTACCGAGACGTAATTCAACATCCAATCACGCCCCTCCACCCACCA
CCCCAAAACCGAAAAGCCCTTACAAACGATCAATGACATTACAAACGATG
AGGGCGGAACCGAAGGCGTTCACAGAAGATAACGAGCCCGAAGTGGAGGA
TATTACGCCTGGTTCCTTTCAAGATGAGCTCAACAAACGCCGCCTCACAA
TTCGTAGAATGAGTGCCACCAAAAAACCGGAAGGCTCTGTCGGTCCTTAT
ATTTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13330MSTRG.13330Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13330.1.p2.exon10MSTRG.13330.1.p2.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13330.1.p2.exon9MSTRG.13330.1.p2.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13330.1.p2.exon8MSTRG.13330.1.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13330.1.p2.exon7MSTRG.13330.1.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13330.1.p2.exon6MSTRG.13330.1.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13330.1.p2.exon5MSTRG.13330.1.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13330.1.p2.exon4MSTRG.13330.1.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13330.1.p2.exon3MSTRG.13330.1.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13330.1.p2.exon2MSTRG.13330.1.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13330.1.p2.exon1MSTRG.13330.1.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13330.1.p2MSTRG.13330.1.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000105_pilongenomesc0000105_pilon:422682..440058 -