MSTRG.13322.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13322.1.p1
Unique NameMSTRG.13322.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000105_pilon:294577..308234-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13322.1.p1 ID=MSTRG.13322.1.p1|Name=MSTRG.13322.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13658bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000105_pilon:294577..308234- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GTAGTTTTGTCCATTTTCCTAAGAAATAGGGTGTTTTAGACTCTTAACTT GTTCTGGATATTTTGGCCATTGAAGGTTTATGTTCTGGTATAGTTAGTTC TTATTAAAATAAAAACGTGTAGCGACTACAAAATGCTAGCGATTTTTGTG ACATCTCATAGTATGAACCCCCCCCCTTTTTTAAGGGGGGGGATCCGAGT TTTCAAGGAAGGCTTTATAGGGGGGATGGGCAAATTTTCCAGTTAAAATG GGGGGTTTGAGCTTATAGGGGGGGGGGGGTCAATAAAAAGGGGGGGATAG TAATTTTTGGTTAAAAAAAATTCTTATTTTCTTATTTTTCCTAGTTTACT ATTATAGTTTACTTTTATTTGCGGTTTTGTGGAATTACGATGCGCGATCC AACGATTCACACGAGGCGCGATGCAAAGATCCATGCATATATTATGTTAA TTATTCTAATTAGCACGAATAAGTTTTCATTGCGAGCTACAAAAAAAAAA AAAAAAGAGGGGAATAATTTATCATAAAATAAAAACTATATCTTCTGTGT AGAAAAAAACAAAATTGATAGCGAGAAAAAAAATGTTAAAATGAAAGAAA AAGCCTTGACGTCATAGATAGGTTTTGGCGCGAAAAATCTATATTAAACA CAACTCATTTTTTACGTTCATTATTTTGTAAGAAAAGTGATAAGGTAAAT AGGAATCATGGCTACATTATTACTTGGCAGTTCTTATAAAAGCCCTTCAC AACTGAATTGCAACTGGGCTTTTATTTATTTCATCTTTTTCTTGTTGATG AGCAGGTGAATTAATTTGATCTTTTCTCAAAAAGGTGGTTGAACCGCGCT CTTCAGTAAAAAACGTCTTTCTACTTACAAACATTGTAATTTTTGTTTAT AACCCTGTCTAATCCAATTCATTTGTTGGTTTAATCGGAGAACGTTTTTT TTTTTTAGATAAAAGCAAAAAGGTTACAAGACATTCAATTCAAAGCAGGG CAAAAAGTTTATGTTGTGATTTGATTTGATTGTCGAGGTTAAAATATATA CACGCATACTTTACATTGGTTTTCCAGAAATACAAAAGAAGGAATTAAAA TTATGTGATTACTAAAACCTGTAAATGCATAATTAGAATAATTAACATAA TATATGCATGGATCGTGCATCGTGCATCGTGAATCGTTGGATCGCGCATC GTAAATTACACAAACCGGTTTATTTGCTAGTGTTTTCAAGTTCATTGACT ATTGGTACGAATTCACACTGAAAAATATATTTCATTCATCAAAATTCTTC CCCAATACTGGGAGTACAAATTATATGCTGGGGGCTCGGACCCCTGTAAA TGGTGCGGGATCAAAAAAATTTAAAAATAGGGGGGGGGGTGAAATATTAA TGGGGGGTTCAGACCCCTCTGCACACTATGCATCTTTCTCGTCAAAATGT TTGTTTAATTCAATTCATTAAGTGTTGATTGAAAGATTACCACCCACCCA TCCCGAAACCTCTCTTTTTATATTTACCAGCGTTTTATCGTGGTTTAAAT CTGCGATTTTTGTGTTAGAGTACTACAAAATGCAAGTACTTTATAGAGAC TTTCGTCGGTTTTCACTATATGGATCCTCAAAGAGCGTGAATTTTCCAAG CTTTGACTTCACAATCTCCTTTTTAATCAGCCCTGTGGACAGCCCAAACA GCGGCGGATCTGAGGGGGTTCAAATGGTTCAGCTGAACCACCCCAACCCT TTTAGTACATAAAAAAAAACAAAGACCCTTTCTTCAAGTGAAATCTAGTT TTCTGATCGAAACTGATTTTTCTTTTTGGTCATATCTCGATATTATTTTA CCAGGGGTTGTATGCATGTGGCGTGCGTTTCCGTGGTGTGCGCGACAAAC TTAGCTTTCTCCGCGCTAAAAAATCTTTAGGTTATGTGTATACGGCGTAG CTAGCTTTTCCGCGCTGTAAAAAATCTTTGTTATGACTTTTTTTTGCGGG ATTAATATCTAGCTGTGTTCTGTGCTAGGAAAATCTTTGATTTTGAACCT GGTTCAGAAAATGCATCCAGTGAAATGGCAAATTTGAGGTGGTTCAAGGA AATTCTCGAAAATACGAGACGAGACCGACCGTTTTGAGCGTAAAAGATTC TCCTACAAAAATAACTTTAAGTCGCATGTCGTCGCCGGCAAAATATTGAA ATGATTTGAAGGGTAGCCATTCGTACGGCAAACGACCTCACTTCTCTGCA AGCGTTCAATGCAGTGTTTTAAAGAAAGGAATTGAAGTCCTGAAAAGTAG TAATAATCAGGCAATTACTTATCTTTTTGAGGACATTTTTGGTTCAATTT AATCAGTAAATTTGAGAATCACACAACAATATCAATCAATGTATGATGAT TTTGACAAAGACTCTGTGTGATGGAATTTTTATCTGCTTTTGTTTGATGT GGTGAAGAGTGACGAAAGAGAAAGACTTTCATTCTGAGGAAACATTTTTG TTTTGGTTTATCTTTAGAAGAAAAGCATTCATGCCAACAAAAACAAAACT TAAATCAATTTTGCTTGATAAATGAAGTTTGGAATTTATTTATGGGAAAG GACTTATTTGTGAATATTTGGTGGAAGTTTATCGTGTCTTGAATATAATC ATGAATTTACGTTTGGCTCTTCTCCCATCATCGGGCATCGGGAATATCAC GGGGAAAATCTACCTAGCTACATATGGATCACGAGATTTGCGATTGGCTA TACGTTTCGAGAGATTCTTCTCCCATCATTGGAAATTGATGAATTTCACA TTGCTACGTTTCGAGAGATTCTTCTCCCATCATTGGACATTGATGAATTT CACATGGAAAAAAAGCTAGCTAGCTTTATTTTTGAAAACTATTATAGAAA AACAAAACAAAATTGTATATTTTCGCCCACGTCTTTAGAGCTTCAGCGTA CTGGGCCAGAAAATACACAATCTGTTATCAGGTTATATAACAGAGACAGG AAGAAAGGTTAGGGAACAACATTTTTAGCAATTTGATTGAATTTGGTTGA AGAATGAAATTTCTGGAAAGGTGAACCTTCATGCATGCTTCAAGATAATG TAAAGCGAGGAAATATTTTTGGTTTCGTCATGTCATAATAAGAGAGAGTT CATACCACTTTATACTTGCAAAACAAAACTAAGATTACTTTTACGTGATC ATATGAAAATATGGTGTACTTTTATACAAAAAGAGACATTGGTGACCTCT GAAAAAATTACCCTCTTGTGCTTAATTGTAGGTGGACATTTTGCAATTTT TTGGAAAAAATCACCCAATTAGCATTTTGTAATGACCTCTAATTTATCAA ATTTTCCTGATAAAGTGCCAAACCTTCATTTTCCTTGAGTTTTTTGGGAA AATCACCCCAAAATCATGAAATGATATATTACAACAATCTCTACCAAAAG AATTATAAACAACACTCCATACAATTGTGAAAGTTGAAAAAGTGCTTTCC TACAGATTGTTGATGATTACTGTTAGTACCTTTAATAATGCTTAAAAACA TCAAACTTTTTACTTTCAATGTAAAAATTTCTTTTTTATGAGATTATTCA TCTAATTTGACAGCTAGAATTTCTTGAGTCTATTTGCACATAAAACACAT TATATATCAGTACTCATGGTGTACTCCACTTTTTGGCAATCTTTTATTTT TCCATCTTAAGAATATTGTATTCCCTTACATACGTATTATATAAATAATC TCCTTTATTTTTTAACTTGATCACTGTTTTCAAAATATTATCCATTTCTG GTTTTATAATGTAAACATACTCAACATGAAAAGTTTTTGCTTGATTGTCA GCCAATTAATTCGCTACAAAGAAATTCCATAAAAAATGGTTATAAGAATA AATTATGGAACTTTTTTACTATGTTTTAAATATTCACGAAATGAAACTGA AGTGTGATAAATTGTCTTATTTTTTCTTCAAACTTTTCTTCAAAACCATT TATTTGCTCTTTTATCTATGGCTTTCTCAAAAACATTTTCTGCAAGAACA ATGAATATATAAAAGAATATACACCAAACAAGCAGTTCTGAGCATGCTCT GGGTGTCTGTTTTATCAAAATAAAAGGTTAAACCAAAGAAATATAATACT AACTATATTTGCGTTTTATGAACGTTTTGTGTGATAAGATTGAAAAGAAG AAACTAGATGTGCGCAATTGCAGTTAGGGAATTTCCCAATGTATATATGA ATATCACCACAAACGATTATTACACGTTCAGCATCTGGCTGTTCAAGCCG GGTCAAAAAAAAACTGGCCTACCGCCCTCCTTTCAACGCATGGGACCATT CAAAAAGTACGTACGAGGGGGAGGGGGTCCTTGAGGAGAAGTACGTACGC TCGTAATTTTTCCTAAACTGTCTTTTTTGAGAGAAAAACGCAATATTTTC ACATCAAAAAATGGTTTTTGCGATTGTTATTTTTCATTTCTCCTTTGGTA TTTTTGTTCATCTTATAGAATCTTTTAATTTCTTGAGACTTTGTTATAAA TACGATTGGATACCTACATATTCTACTGTTAGAAGAGTTACAAGTTTCGA CTTTGGTTAGGGGGTGTACTAAAAAGCGTACGTACGTTGAAGGGGGTACA CATAAAGCGTACAAGGGGGGAGGGGGGGTCAAAAATTTGCCATTTTCGAA CGTACTTTTTGAATGGTCCCCCGCTGAGGCCTATGTTTGGAGTTCATAGG TAATGGGAACTGCAGACGTGCAGGCGCTCATTAACGTCCCCCATGTTGAA TGGAAAAAGGTGACACCGCCCAAACAGGGCTGGTGCAAAATTTACGCCCA AAACGTTTGTTCCGAAATGTTTTTTTTGAAAAGAGATTTTTGAACCCCCT CAGAAAAATCCCAGATCCGCCTCTGCCAAATAAATACAATAAATGCCTGT TTGCAAAAACCTCAATATCTAATATAAATAGGGGGCACTGGATTCAAAAA CGACCGTACGTGCGGCCCAAAATAAGGTCTTTGAAATCGGACCCTTACGG TGCACTTTCTTGAAGAATTTTGAGCATTTTCAGGCAAAATATGGTTCAAA ATTTTACACCCTTAGAGTGCACTTTTTTCATCTTTGCTCATTTCGACCCT TACAGTTCATTTTGGGAAGCTTGGAAAAGGGATCCATAAGGGCCGCACGT ACAGTAGGTCGTTTACCTTGAGTGCCCCCCCCACCCGGGCGCCCATCAGA CTGTCGTGAAAGAAATGCCTATCTTAAATCTCAAACTTTTTGTTTTCAGG TGGTCACGCGCCAATGTACGATCTTCCCGACGTGGAATCCACTAATCAGC TTGCTGCTCAAGTTTATGAGAACAATGGAATTGTGTGTGCTGTTTGTCAT GGTACTGCCGGTAAGATGTTCATTAGTTACCTTAAGCATCTAGGACGGCA GGATTAAACAAAAAGAAAGCCCTTAGGGATTAAATTTTGGATCGCAGCTA GATTCTATTTTTTCATATCGATTTTCTCATGAGAATAGTGAATTTTAATA GGGTAATTATTAGTCGTTTTCAAATCTTAAGACAACATAAAAATTATTTT TTAACGTCGTCTTTAGAACGAAGACGGTAAAGGAAGAGTACAATAGTTTT AAATGACATTAATCCGTCGAGAATTATAACATAATTTTTTACAAAAACTT TTAGCTACATTTTAAATTTGTCTGCGTGCTATCAAATTTAGATAAAATCA GACAAAATCGGATAAATTTAGCAATTTGATTTTAAGATTTACTTCACTTC CTATTTCAATTCGGCGTTTTATGCTAAAGGTCTCTATCACTTCAATTTCA ACAGATAAACGTGTCTTTCTGTACCATGATTTTATCTCAAGCTATCATAA TTGATTGAGTTATGACAACTTGGGGGGGGGGTTCAATCTTTCGTCTTTTC TAACGTATAAATAAACATGTACCTGTTAAATTCTCAAAAGATCCAAAATG TGGTCAATATCATTATAATAAACTTTGATCTCGCAGTTACATTACAATGT CTGCACTCCAAAAATGTAGGTTTCAAGTTTGACGATTTCTACAACACATG GTCATTGTCAAAAGGGCAAATCTCAAAATTAGTATCTTAGAAAAGTGTGA ATTTTTGATAAAGAGATTCGGCCTTGGGTCATGTAGATGAATCTCTCCTC AACGAGATGAAAGGGCCAATTTCCTTAATAAAGGCTAATATCGTAGGGAG ATTCTTGATATGATGCTAAGAGACTCATTTTTGTTGCTTTGACAACGACG ACATGCTGTAAAATCGTTTCTTGCAGGCATTGTCAACACTAAACTATCTA ACGGACAATATTTGATTGCCGGACGAAAAGTGACGTCATTTACAAACGAG GAAGAGAATCAAGTTCAACTGATGCCATTCATGCCATTTCCATTACAAAC AAAGCTGTCCGAGAATGGAGGTGAATTTGTAGAGAGTTCACCTTGGTCGA CGAATGTCACAGTTGATGGTCGATTAATTTGTGGTCAGAATCCTCAATCT GCAACTCTAATGGCTGAGGAGGTTGTTAAAGCTGTCAAAGCTTTATAAAT GATCATGGGTTAGCCGGCGAAGTAACGAATTATCGTACTACATTTTTCAA TACTTAGTATCATATCTTTCTAATATATTGTGTACACTTTTTGATCATTT CTACTTCTAGATAATTTCATGAAAGATAAGTCATAGAGTTCCTTAAACTT TTTACCTACTGTGATGAACTTGTATTTAGGGCGAATTATTTTGTTATTTT CAATGTATACTATTTAGTTAATTGTTGATTTTTTAGGTATTTTCTATTTT GATACACTTCACCCACGCAACTGATATTTATGATTATTGATATATTCTAA ATTTTTCTAATTATTTGTCATTATGTCATTATTTAGACAAAATATAGATC CATTTTCTGCATTGTATACATCTTTTATAAGCAGTAAATTCTCAAAGCAC CTTAGCTG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000105_pilon:294577..308234-

>MSTRG.13322.1.p1 ID=MSTRG.13322.1.p1|Name=MSTRG.13322.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2748bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000105_pilon:294577..308234- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GCATTGTCAACACTAAACTATCTAACGGACAATATTTGATTGCCGGACGA
AAAGTGACGTCATTTACAAACGAGGAAGAGAATCAAGTTCAACTGATGCC
ATTCATGCCATTTCCATTACAAACAAAGCTGTCCGAGAATGGAGGTGAAT
TTGTAGAGAGTTCACCTTGGTCGACGAATGTCACAGTTGATGGTCGATTA
ATTTGTGGTCAGAATCCTCAATCTGCAACTCTAATGGCTGAGGAGGTTGT
TAAAGCTGTCAAAGCTTTATAAGTGGTCACGCGCCAATGTACGATCTTCC
CGACGTGGAATCCACTAATCAGCTTGCTGCTCAAGTTTATGAGAACAATG
GAATTGTGTGTGCTGTTTGTCATGGTACTGCCGGACGCAGGCAGCGGTGA
TATGTTTGGAGATGACCAAAGTTGCAAGAAACTTTTAGCGGATCAAGAAG
CACTAGCATTGATTGAGAATACACAAGTTGCCAGCGATGTGGACTTCAAA
CAATACAAAATCGTATTCTTTCCAGATGGTCAAAGTCCTTTTCATTTATT
CCAACCACGAGGATTTAGGAACCACTGGTAAAAAGACAGGTTGGTATCTG
CCAGAAGTTGCACATCCTTATTATGTGTTCAAAGATGCTGGTTTTGAGAT
TGAAGCTTGCAGCCCCAAAGGTGGAAAGTGCCTGATGGCATTGTCAACAC
TAAACTATCTAACGGACAATATTTGATTGCCGGACGAAAAGTGACGTCAT
TTACAAACGAGGAAGAGAATCAAGTTCAACTGATGCCATTCATGCCATTT
CCATTACAAACAAAGCTGTCCGAGAATGGAGGTGAATTTGTAGAGAGTTC
ACCTTGGTCGACGAATGTCACAGTTGATGGTCGATTAATTTGTGGTCAGA
ATCCTCAATCTGCAACTCTAATGGCTGAGGAGGTTGTTAAAGCTGTCAAA
GCTTTATAAGTGGTCACGCGCCAATGTACGATCTTCCCGACGTGGAATCC
ACTAATCAGCTTGCTGCTCAAGTTTATGAGAACAATGGAATTGTGTGTGC
TGTTTGTCATGGTACTGCCGGACGCAGGCAGCGGTGATATGTTTGGAGAT
GACCAAAGTTGCAAGAAACTTTTAGCGGATCAAGAAGCACTAGCATTGAT
TGAGAATACACAAGTTGCCAGCGATGTGGACTTCAAACAATACAAAATCG
TATTCTTTCCAGATGGTCAAAGTCCTTTTCATTTATTCCAACCACGAGGA
TTTAGGAACCACTGGTAAAAAGACAGGTTGGTATCTGCCAGAAGTTGCAC
ATCCTTATTATGTGTTCAAAGATGCTGGTTTTGAGATTGAAGCTTGCAGC
CCCAAAGGTGGAAAGTGCCTGATGGCATTGTCAACACTAAACTATCTAAC
GGACAATATTTGATTGCCGGACGAAAAGTGACGTCATTTACAAACGAGGA
AGAGAATCAAGTTCAACTGATGCCATTCATGCCATTTCCATTACAAACAA
AGCTGTCCGAGAATGGAGGTGAATTTGTAGAGAGTTCACCTTGGTCGACG
AATGTCACAGTTGATGGTCGATTAATTTGTGGTCAGAATCCTCAATCTGC
AACTCTAATGGCTGAGGAGGTTGTTAAAGCTGTCAAAGCTTTATAAGTGG
TCACGCGCCAATGTACGATCTTCCCGACGTGGAATCCACTAATCAGCTTG
CTGCTCAAGTTTATGAGAACAATGGAATTGTGTGTGCTGTTTGTCATGGT
ACTGCCGGACGCAGGCAGCGGTGATATGTTTGGAGATGACCAAAGTTGCA
AGAAACTTTTAGCGGATCAAGAAGCACTAGCATTGATTGAGAATACACAA
GTTGCCAGCGATGTGGACTTCAAACAATACAAAATCGTATTCTTTCCAGA
TGGTCAAAGTCCTTTTCATTTATTCCAACCACGAGGATTTAGGAACCACT
GGTAAAAAGACAGGTTGGTATCTGCCAGAAGTTGCACATCCTTATTATGT
GTTCAAAGATGCTGGTTTTGAGATTGAAGCTTGCAGCCCCAAAGGTGGAA
AGTGCCTGATGGCATTGTCAACACTAAACTATCTAACGGACAATATTTGA
TTGCCGGACGAAAAGTGACGTCATTTACAAACGAGGAAGAGAATCAAGTT
CAACTGATGCCATTCATGCCATTTCCATTACAAACAAAGCTGTCCGAGAA
TGGAGGTGAATTTGTAGAGAGTTCACCTTGGTCGACGAATGTCACAGTTG
ATGGTCGATTAATTTGTGGTCAGAATCCTCAATCTGCAACTCTAATGGCT
GAGGAGGTTGTTAAAGCTGTCAAAGCTTTATAAGTGGTCACGCGCCAATG
TACGATCTTCCCGACGTGGAATCCACTAATCAGCTTGCTGCTCAAGTTTA
TGAGAACAATGGAATTGTGTGTGCTGTTTGTCATGGTACTGCCGGACGCA
GGCAGCGGTGATATGTTTGGAGATGACCAAAGTTGCAAGAAACTTTTAGC
GGATCAAGAAGCACTAGCATTGATTGAGAATACACAAGTTGCCAGCGATG
TGGACTTCAAACAATACAAAATCGTATTCTTTCCAGATGGTCAAAGTCCT
TTTCATTTATTCCAACCACGAGGATTTAGGAACCACTGGTAAAAAGACAG
GTTGGTATCTGCCAGAAGTTGCACATCCTTATTATGTGTTCAAAGATGCT
GGTTTTGAGATTGAAGCTTGCAGCCCCAAAGGTGGAAAGTGCCTGATG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13322MSTRG.13322Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13322.1.p1MSTRG.13322.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13322.1.p1.exon4MSTRG.13322.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13322.1.p1.exon3MSTRG.13322.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13322.1.p1.exon2MSTRG.13322.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13322.1.p1.exon1MSTRG.13322.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000105_pilongenomesc0000105_pilon:294577..308234 -