MSTRG.1329.3.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.1329.3.p2
Unique NameMSTRG.1329.3.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000006_pilon:1856339..1876904-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.1329.3.p2 ID=MSTRG.1329.3.p2|Name=MSTRG.1329.3.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=20566bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:1856339..1876904- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ACTGAACCCATCCCATTGATGTTGTTGTCAACTGCATTGTTTATATGACG GAGAAACCATGGTAACGTTTGTTTGGAAGTGTTTCAAAATGGCGGGGAAA GCTGTGTCGAAGGAATCCAATGATAATCAACATCTTCGTCGTCCAAGAGT AAACTCACTTCGTAGACGTTCTTCACACCGATTGAAGGCGCCACACTTTC CCAACTCAAGTTCAAAGTGAAACGAAACTATTCATTTTTTGGTATTATGT TGATATTTTCTTGTGACCGACGAATGATAAAGTTTACTAATAGACTGGAC GAAAAACCACGAAAAAGAAGAGAATTGTATGGCGATACTACACACAGTAC ATGAAAATATTTGAATGTTCATCGAAGCTCATTTTAAATATAAGTCTAAT AGTTATTGAATTGAAAGGAAAGCCAGAGAAGGGAGATGGAGTGGGATAAA AAATTGTTTCATGAAATGAAATGTAACTGGTGATATTTGTAAGAAACGTG TCGTTTGCTTATTCTTGATAAGCGTAAGTCAAGATTACGTCATTTTCCCT ATCGGAAACACCTGAAAACACCGGTATTCAACCCCTGAGTGTTAATAAAA AATAGCAACACAGGGGTCAAATTCCGTTTATTCGGGTGTTTCCGATATGA AAAATGACGTAAACTTGACGCACGCATATCAAGAATTGCGTAGATAAACT GTAACCTAGATAAAGTGTTTGTTTATCAAGGGTCGAGTATTTCTGTGCTT GTCTCGTTTAATTTTCAAGGGTAATCTGCTACTTATGTTTCAGTGTGTTC AGAAAAAAAGCAGGGATGACAAAATGTACAGAATAATCGCCATTATTGTT TTTGAAGTGTTCATTCTTTTCCTCTTTCAAACAAACATCGGGTTAAAAGA TTCTAGAATATTTGCAGTTTACACTATCTAATTCGACCTTCTTCTATTCA GTACGCTCCCTTATTCGATGAAAATCAAATTTTAGAGAGCGTCCACTGTA TCCACAAGTTCTGTACTTTTATCTTCTGGACACATATGTCTCTATATTGA TAAGTTAATATTGCAATGCTGGGATTAATATTTGGACAATAATGACGTAT CATTCTGAAATTTCAAATTTCGTGTAAAATTTTACCTCAATCTTATCCGC TATAAGAATTTTCAGATGTCAAAAAAAAAGATGTTAATTTTAAAGTTGCT TTTGGCTAAGTTTTGGTAAATTCGCCACTTGATCCCTTCTCGGAATTTTT AAACGCTGTTTGATTTAACTAATGTGCGATAGCTTCAAAACATCATAATA TGAGATATTTTGTACTTGTTATTAAAAGGAAGAATTTTAGGAGAATTATT TTCATTACTACTCTAGAAAATTTTGACATCGGACTGGTATTTGTCTGTTT AAAAAATTTCCTAGCTAGGTATCTAGTCTTTTTTTTTTCATTGATGATGA GTATATTTTGTTTTGCTCTAAAAAAACTTTTTTTTTTGTTAGTCTTTATA AATTAATTTTAAAAATCTAGGTCAAATTACATTTACTTAGTTTTTAAAAC CGAGAGCGAGTTCACACTAAGGAATCCAGTGCAGGAAATTTATTTTTTAA TTGCATTTTTTAGAAAGATTCCATCCCCTTCCTCCCTGTGTCAAGGTTAC TTAGGTTGCGGTTGATTTTCGCAAGTCTGATTTAACAGTTTTGCAATTGT TGCACCTTTTTCGTGGGGAAATTTATTATGGAAATGATTGATTGTCATGC AAAAACTCACAATTCTCCTCATTGGTGCAAAGTTTATTTCAAGAGTTTCA AGAGTTTCAACAGATAGAAATTTTCAAAATAACTTTTTAAAATATCGATT CTATGTCATCCAATGCCCCCTTCCTCCTGTTTAGAACCCCACGGAAATCC CACAAAAGAATTTTTTAAAGAAATGGTAGATGTTTTTATTTATTATTATT ATTGTACACGCCCGTGGAATTCGACAAGAACGAAGATGGCTGCCAAGAGA AATATCGAGCGATAAGTTAATTTTTTTTTCTTATGATATTAATTTACAAA AAACCCCTAATAATGTTTTTTTTCACCATAAATTTTGATTGTGAGCTATT ATTTTTTAATATCTGTACTAAAGTAAATTAGCCCTCATTTTGTAAGTTTT TTTTTGCTTTCAACACAAATTCAGTCCCTATTTTTTTAAACCGATCAAAA AGGTGACCGTGTTTTGAATTTTAGAATTTTAAACTGAAAATGAGTACAAA AATCTCCCTTTTGGAATAAAACAGAACTAAGATAGTCATGATCGACTATA TTCTTGGAATTTTATGTTAGAAATTTTATTTGGGAGGCCTTAGAAAGTAA AATTGCGATGCTCCTTTTTGATTGGTTGAAAAAAATAAACAAAACAATTA CAACATTATAATTCTGACAACCAATAGGAAAATAGTTTTTTACGTTGCCA AAAAATAATATTAAGTTGTAACACCATTTATTTAATTTTGTAAACTATTG AATAAATATACGGGTG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000006_pilon:1856339..1876904-

>MSTRG.1329.3.p2 ID=MSTRG.1329.3.p2|Name=MSTRG.1329.3.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=417bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:1856339..1876904- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTATCATCAGGACACCCACGAAGAACATTTTAAACTATTTTCATTTCT
TTATAAAAAAACCTTAATTTTTCGTTTAAGTCGATCACTTGGTGAGGAAG
CTCAGCCAACGGGCAAACCGCGCTCGCTGCGCTTCACATGGAGTATGAAA
ACCACCAGTAGCATGGACCCGGCAGATATGATGGCGGAAATCAAACGCGT
TCTCGACCTTAATGGATGCGACTATCAGCAGAGGGAGAAATTCTTGTTAT
TCTGTATACACGGAGACCCTTATGAGAGTTCACTTGTCCATTGGGAAATG
GAAGTGTGTAAACTACCACGACTATCATTGAACGGTGTTCGCTTTAAGCG
TATCTCTGGCTCTTCCATAGCATTTAAGAACATTGCGTCCAAAATTGCAA
ATGAGTTACAGCTATAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1329MSTRG.1329Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1329.3.p2MSTRG.1329.3.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1329.3.p2.exon17MSTRG.1329.3.p2.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1329.3.p2.exon16MSTRG.1329.3.p2.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1329.3.p2.exon15MSTRG.1329.3.p2.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1329.3.p2.exon14MSTRG.1329.3.p2.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1329.3.p2.exon13MSTRG.1329.3.p2.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1329.3.p2.exon12MSTRG.1329.3.p2.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1329.3.p2.exon11MSTRG.1329.3.p2.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1329.3.p2.exon10MSTRG.1329.3.p2.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1329.3.p2.exon9MSTRG.1329.3.p2.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1329.3.p2.exon8MSTRG.1329.3.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1329.3.p2.exon7MSTRG.1329.3.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1329.3.p2.exon6MSTRG.1329.3.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1329.3.p2.exon5MSTRG.1329.3.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1329.3.p2.exon4MSTRG.1329.3.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1329.3.p2.exon3MSTRG.1329.3.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1329.3.p2.exon2MSTRG.1329.3.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1329.3.p2.exon1MSTRG.1329.3.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000006_pilongenomesc0000006_pilon:1856339..1876904 -