MSTRG.1327.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.1327.1.p1
Unique NameMSTRG.1327.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000006_pilon:1809890..1829425-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.1327.1.p1 ID=MSTRG.1327.1.p1|Name=MSTRG.1327.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=19536bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:1809890..1829425- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GGTGTTTCAACTTTATTGGCGATACGCAACGCCTTGAAAATTAAGGAGGA TAAATTAGTAACGGAACAAAATGGCGGAGATAATAACGACAGTTTAATTA CGTCATGTCTAATGTTTGACTACCAGAATAACGACGAGTTGAATTTTGAT GAATTTGCTTGTATCGCGAAATTAAATGCTTTGAATGTTGAAGCTGTTGT TGCACACTCGGATTCAAACATCAAAGAGTTCAGGTGAGGAAATTTTTAGG AAGGCTACCAAACCTATGTTAGTAAATATTTTTTTAACAAGAACCTCAAA AATTTTTCTTATACTGTACTATATTCTGATACCATTATTGATTCATAATA TTGCACCTCTTTTTCAACAAGGAACCTTTTCTCAAACCAGAGCGCTATTT GCACCACTTTTGACAATTTTGATAGACTGATGGATGTCACTTGATACAAT CGGGATGCTAAGGGACTGGGACTGAGTTTGCCCTTTTTTAAAGAGGAACT TGTTTTGAGTAATCAATTTATTTATTCAAATTTCAAGGAGATATTATCCC CAGCAAGATTTCTTACTAATCTTTCTGGTAGACGGACGGGCTTTACCGGG GCTGTGACGAATGACTTACAGTATAATTGAGATCCAATATCCTTTAGGCC TCTCTTCTTAAACTCTTGCAAAAACGAGCTACCATAACTAGTTAGAAAGA GGGCATCTTTATCATGTCTCTTAAGACATTATGTACGTCATAAATTCGCT TTGGTTTTTCTTTAATTATATATTGATATAGCCTATAAATCAGTGATTTC ACTGTCTAAAACAATAAATGACTCACAACTCTCTTTTCTAGGAGAGACAT CAAGCTCTCTTGTCAAACGGACAGTCGAATATGCGTTTGCTATTACACTT CCAACGACCTCTTCCAGTGTTCCGGTTCCTATTTTACATTAGTCGGTGGA 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TGAGAAAGAAAAGCAGCGTCCGGTGGTGGTCAAAAAGGGCTCTTTTCCTG GTGTTTTTCTACCAAAAAGGCTGATTTTACCTAAATTTCAGTGATTTCAG GAGGGGCAGTGTCGGATAACCGGACGCTAAAAGGGCATAAAAAATGGCCT GTGACAAATAACTACTCATGAGTGATAGGATTATTGTTACTGAAATAAGA CTGGGAGAAACTCAATTAACAGATCTTCATTTACGCGGGGCTTTTAAAGT GTATATTGTTGTAGTCTTACGGTCTTGTAACCCTGTTTCCACAATACAAA CTCGGTCAGAAACGGAAATTTACTATTCTAAGCCTGAAAAGTAAGGTTGA CTTATTTTAATCTGGATATTTTGTGTTGACAAATGATTTGTTTTCTTATT TTCTCTTACTGTTTAGAATTCAAACTGGGTTATTTTCTTTTGGAGAAAAG TGAAAAGAAAGCTTCCATATTATTGAACATCAACAAAAAGATTTCTGTCT TGTTAAACGCTCCCGATGAACATTATGAGAAATTATGTAACATGAAAGAT GATTGGGAAATGTGGTTAATATCTCCACTATCCACATCTAGAAAAGATGA CATCCTCAGACTTGCGGTTGATAATATTATGGAGATAATAAAGAAACAAA CTTTAAGAACAGTCCGTGTCAAAGAAGAGCAAGCTAAGTTAACGTACAAA CAAGGCAGTTTAGTTGACTCGCTAACAAAAACAAAAATTTTCCCTGTAAT TGAGAAATTCGTATCGAATATGAATAATGATTCCTTATCGAAACTAACAA TTTTCTCCGAATGGGTCTTAGAGACCGTCTTCATTATGCGAAAAAGTGAT AAAAACAAAAACAAATTTGCTGCTCCTACAAAGAAAAAGAAAAAGAAGTT GGTTCGTACTAACGTTAATATGAACACTTTCAACAACACGACAATGTTAG CTACCTGGTTGTTATTCTGGCCGTACGCGCATAAGAAATTTGATTCGAAC AGTACGTCACTCTCTGAATGCATTGAAAACGATTTAAAAATATTTCCATC TAAATTGGTAGAGACTTTTCATCATCAAATGGATTTTGTTATCAAAGTAG TTCAATCTTCTACTATGAATGTTGTCAAAAGGAAAGCCAGAAAAAATGGA ACTTTGCCACATGGTTTATGATGATTTTTCTTATTTTATTCTAGCTTGAT GAACCTTTTCATAAATAACGTTACGAACATCACTTGCGTCGTTTTGACTT CCTATTTACAAAAAAATAATTTAACCATGTCTCATGAGACATAATCACCA TGGTAATTGTTTGAATACAAGGCAAGTGATGTTCGTGACGTAATTTATGA AAAGGTCTACTAGCTGTATTTTTATTGTTTCTCTTTAGGTTATCTTTCCA ACGAGATTTTTTTTCAAGACTTTTGTTTTTGGAATATACGTCTTTTAAAT TTAATATTAGAAGAAAGTAAAGCTTCGATGCCAAAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000006_pilon:1809890..1829425-

>MSTRG.1327.1.p1 ID=MSTRG.1327.1.p1|Name=MSTRG.1327.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5787bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:1809890..1829425- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AATTCAAACTGGGTTATTTTCTTTTGGAGAAAAGTGAAAAGAAAGCTTCC
ATATTATTGAACATCAACAAAAAGATTTCTGTCTTGTTAAACGCTCCCGA
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TAATATCTCCACTATCCACATCTAGAAAAGATGACATCCTCAGACTTGCG
GTTGATAATATTATGGAGATAATAAAGAAACAAACTTTAAGAACAGTCCG
TGTCAAAGAAGAGCAAGCTAAGTTAACGTACAAACAAGGCAGTTTAGTTG
ACTCGCTAACAAAAACAAAAATTTTCCCTGTAATTGAGAAATTCGTATCG
AATATGAATAATGATTCCTTATCGAAACTAACAATTTTCTCCGAATGGGT
CTTAGAGACCGTCTTCATTATGCGAAAAAGTGATAAAAACAAAAACAAAT
TTGCTGCTCCTACAAAGAAAAAGAAAAAGAAGTTGGTTCGTACTAACGTT
AATATGAACACTTTCAACAACACGACAATGTTAGCTACCTGGTTGTTATT
CTGGCCGTACGCGCATAAGAAATTTGATTCGAACAGTACGTCACTCTCTG
AATGCATTGAAAACGATTTAAAAATATTTCCATCTAAATTGGTAGAGACT
TTTCATCATCAAATGGATTTTGTTATCAAAGTAGTTCAATCTTCTACTAT
GAATGTTGTCAAAAGGAAAGCCAGAAAAAATGGAACTTTGCCACATGGTT
TATGAGAGAGACATCAAGCTCTCTTGTCAAACGGACAGTCGAATATGCGT
TTGCTATTACACTTCCAACGACCTCTTCCAGTGTTCCGGTTCCTATTTTA
CATTAGTCGGTGGATATTCCAAAGAGAAAGATCTGGTCCTGCTTTTTGAT
GCTTCCAGTCATAAAATTCCACCATTTTGGATACCGTTACCAATACTGTT
CAAATCCATTCAAAGCAAACCGATCGATGAGACTAATATAAAAGATGACG
ACATTCACACCGAGGCTTGATCGAATCATTGAAGATGAAGAATCATCAAA
ACATCCAGATGATCCAATCGATTTTGATGATAATATTTTGGAGGAATATG
ATTTGCTGACGGAACAAGATTTATTCATTGCTCTTGAGATCAATCCGAAG
AAATTCAAAGATGGCGAATACTTAAATGGTGTTACTTATAAGAAAGATGG
TGACGATCAAAGTGAAGATGACGATTCGAATTTTACGGAATCCGGTGATG
AATTTGATGGTTGCCATAGCAACGGGCCAAGCACCCTTAGTAACGGACAT
AATGGCGCTGTAGATCACTTTTCGAAATTACATAGTGGGACTCAGGCTAA
GAATTTTGAGATTATGCAACGTTATCAATCACCAATAGACTGTGTTCGTA
ATACTTCGAGTAGTGCTGACTCGGCAAATAATGACGAAGTATCAAGTATG
ATCAGTGATTCATCCAGTTTATCCAAAATTTCACGACGACGTAAAATATC
TGGTCATTCGAATCCATTTTCACCGATAACGCGTGGTCAAGATTTGTTGA
AAAAATATTTGAGCAATTACGAAGGTTATGAGTTTGATTCGAAAAACGGC
CGTAAAATATTCGTGAAAGCCATTTTGAAAAAATACATGACAATGTATTA
CGTCATTTCCCCGCCCCAGATCACTGCAGCAGATCTTGATAATAGTGGTG
TTTCAACTTTATTGGCGATACGCAACGCCTTGAAAATTAAGGAGGATAAA
TTAGTAACGGAACAAAATGGCGGAGATAATAACGACAGTTTAATTACGTC
ATGTCTAATGTTTGACTACCAGAATAACGACGAGTTGAATTTTGATGAAT
TTGCTTGTATCGCGAAATTAAATGCTTTGAATGTTGAAGCTGTTGTTGCA
CACTCGGATTCAAACATCAAAGAGTTCAGAATTCAAACTGGGTTATTTTC
TTTTGGAGAAAAGTGAAAAGAAAGCTTCCATATTATTGAACATCAACAAA
AAGATTTCTGTCTTGTTAAACGCTCCCGATGAACATTATGAGAAATTATG
TAACATGAAAGATGATTGGGAAATGTGGTTAATATCTCCACTATCCACAT
CTAGAAAAGATGACATCCTCAGACTTGCGGTTGATAATATTATGGAGATA
ATAAAGAAACAAACTTTAAGAACAGTCCGTGTCAAAGAAGAGCAAGCTAA
GTTAACGTACAAACAAGGCAGTTTAGTTGACTCGCTAACAAAAACAAAAA
TTTTCCCTGTAATTGAGAAATTCGTATCGAATATGAATAATGATTCCTTA
TCGAAACTAACAATTTTCTCCGAATGGGTCTTAGAGACCGTCTTCATTAT
GCGAAAAAGTGATAAAAACAAAAACAAATTTGCTGCTCCTACAAAGAAAA
AGAAAAAGAAGTTGGTTCGTACTAACGTTAATATGAACACTTTCAACAAC
ACGACAATGTTAGCTACCTGGTTGTTATTCTGGCCGTACGCGCATAAGAA
ATTTGATTCGAACAGTACGTCACTCTCTGAATGCATTGAAAACGATTTAA
AAATATTTCCATCTAAATTGGTAGAGACTTTTCATCATCAAATGGATTTT
GTTATCAAAGTAGTTCAATCTTCTACTATGAATGTTGTCAAAAGGAAAGC
CAGAAAAAATGGAACTTTGCCACATGGTTTATGAGAGAGACATCAAGCTC
TCTTGTCAAACGGACAGTCGAATATGCGTTTGCTATTACACTTCCAACGA
CCTCTTCCAGTGTTCCGGTTCCTATTTTACATTAGTCGGTGGATATTCCA
AAGAGAAAGATCTGGTCCTGCTTTTTGATGCTTCCAGTCATAAAATTCCA
CCATTTTGGATACCGTTACCAATACTGTTCAAATCCATTCAAAGCAAACC
GATCGATGAGACTAATATAAAAGATGACGACATTCACACCGAGGCTTGAT
CGAATCATTGAAGATGAAGAATCATCAAAACATCCAGATGATCCAATCGA
TTTTGATGATAATATTTTGGAGGAATATGATTTGCTGACGGAACAAGATT
TATTCATTGCTCTTGAGATCAATCCGAAGAAATTCAAAGATGGCGAATAC
TTAAATGGTGTTACTTATAAGAAAGATGGTGACGATCAAAGTGAAGATGA
CGATTCGAATTTTACGGAATCCGGTGATGAATTTGATGGTTGCCATAGCA
ACGGGCCAAGCACCCTTAGTAACGGACATAATGGCGCTGTAGATCACTTT
TCGAAATTACATAGTGGGACTCAGGCTAAGAATTTTGAGATTATGCAACG
TTATCAATCACCAATAGACTGTGTTCGTAATACTTCGAGTAGTGCTGACT
CGGCAAATAATGACGAAGTATCAAGTATGATCAGTGATTCATCCAGTTTA
TCCAAAATTTCACGACGACGTAAAATATCTGGTCATTCGAATCCATTTTC
ACCGATAACGCGTGGTCAAGATTTGTTGAAAAAATATTTGAGCAATTACG
AAGGTTATGAGTTTGATTCGAAAAACGGCCGTAAAATATTCGTGAAAGCC
ATTTTGAAAAAATACATGACAATGTATTACGTCATTTCCCCGCCCCAGAT
CACTGCAGCAGATCTTGATAATAGTGGTGTTTCAACTTTATTGGCGATAC
GCAACGCCTTGAAAATTAAGGAGGATAAATTAGTAACGGAACAAAATGGC
GGAGATAATAACGACAGTTTAATTACGTCATGTCTAATGTTTGACTACCA
GAATAACGACGAGTTGAATTTTGATGAATTTGCTTGTATCGCGAAATTAA
ATGCTTTGAATGTTGAAGCTGTTGTTGCACACTCGGATTCAAACATCAAA
GAGTTCAGAATTCAAACTGGGTTATTTTCTTTTGGAGAAAAGTGAAAAGA
AAGCTTCCATATTATTGAACATCAACAAAAAGATTTCTGTCTTGTTAAAC
GCTCCCGATGAACATTATGAGAAATTATGTAACATGAAAGATGATTGGGA
AATGTGGTTAATATCTCCACTATCCACATCTAGAAAAGATGACATCCTCA
GACTTGCGGTTGATAATATTATGGAGATAATAAAGAAACAAACTTTAAGA
ACAGTCCGTGTCAAAGAAGAGCAAGCTAAGTTAACGTACAAACAAGGCAG
TTTAGTTGACTCGCTAACAAAAACAAAAATTTTCCCTGTAATTGAGAAAT
TCGTATCGAATATGAATAATGATTCCTTATCGAAACTAACAATTTTCTCC
GAATGGGTCTTAGAGACCGTCTTCATTATGCGAAAAAGTGATAAAAACAA
AAACAAATTTGCTGCTCCTACAAAGAAAAAGAAAAAGAAGTTGGTTCGTA
CTAACGTTAATATGAACACTTTCAACAACACGACAATGTTAGCTACCTGG
TTGTTATTCTGGCCGTACGCGCATAAGAAATTTGATTCGAACAGTACGTC
ACTCTCTGAATGCATTGAAAACGATTTAAAAATATTTCCATCTAAATTGG
TAGAGACTTTTCATCATCAAATGGATTTTGTTATCAAAGTAGTTCAATCT
TCTACTATGAATGTTGTCAAAAGGAAAGCCAGAAAAAATGGAACTTTGCC
ACATGGTTTATGAGAGAGACATCAAGCTCTCTTGTCAAACGGACAGTCGA
ATATGCGTTTGCTATTACACTTCCAACGACCTCTTCCAGTGTTCCGGTTC
CTATTTTACATTAGTCGGTGGATATTCCAAAGAGAAAGATCTGGTCCTGC
TTTTTGATGCTTCCAGTCATAAAATTCCACCATTTTGGATACCGTTACCA
ATACTGTTCAAATCCATTCAAAGCAAACCGATCGATGAGACTAATATAAA
AGATGACGACATTCACACCGAGGCTTGATCGAATCATTGAAGATGAAGAA
TCATCAAAACATCCAGATGATCCAATCGATTTTGATGATAATATTTTGGA
GGAATATGATTTGCTGACGGAACAAGATTTATTCATTGCTCTTGAGATCA
ATCCGAAGAAATTCAAAGATGGCGAATACTTAAATGGTGTTACTTATAAG
AAAGATGGTGACGATCAAAGTGAAGATGACGATTCGAATTTTACGGAATC
CGGTGATGAATTTGATGGTTGCCATAGCAACGGGCCAAGCACCCTTAGTA
ACGGACATAATGGCGCTGTAGATCACTTTTCGAAATTACATAGTGGGACT
CAGGCTAAGAATTTTGAGATTATGCAACGTTATCAATCACCAATAGACTG
TGTTCGTAATACTTCGAGTAGTGCTGACTCGGCAAATAATGACGAAGTAT
CAAGTATGATCAGTGATTCATCCAGTTTATCCAAAATTTCACGACGACGT
AAAATATCTGGTCATTCGAATCCATTTTCACCGATAACGCGTGGTCAAGA
TTTGTTGAAAAAATATTTGAGCAATTACGAAGGTTATGAGTTTGATTCGA
AAAACGGCCGTAAAATATTCGTGAAAGCCATTTTGAAAAAATACATGACA
ATGTATTACGTCATTTCCCCGCCCCAGATCACTGCAGCAGATCTTGATAA
TAGTGGTGTTTCAACTTTATTGGCGATACGCAACGCCTTGAAAATTAAGG
AGGATAAATTAGTAACGGAACAAAATGGCGGAGATAATAACGACAGTTTA
ATTACGTCATGTCTAATGTTTGACTACCAGAATAACGACGAGTTGAATTT
TGATGAATTTGCTTGTATCGCGAAATTAAATGCTTTGAATGTTGAAGCTG
TTGTTGCACACTCGGATTCAAACATCAAAGAGTTCAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1327MSTRG.1327Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1327.1.p1MSTRG.1327.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1327.1.p1.exon4MSTRG.1327.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1327.1.p1.exon3MSTRG.1327.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1327.1.p1.exon2MSTRG.1327.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1327.1.p1.exon1MSTRG.1327.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000006_pilongenomesc0000006_pilon:1809890..1829425 -