MSTRG.13264.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13264.1.p1
Unique NameMSTRG.13264.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000104_pilon:493605..532373-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13264.1.p1 ID=MSTRG.13264.1.p1|Name=MSTRG.13264.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=38769bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000104_pilon:493605..532373- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000104_pilon:493605..532373-

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TTCCTCTTTTTATCACCAGTGAACGAATACCACAAGATTTCGGCTTTGAA
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TCGTAACAATACATTATCATGGGTTCAAATGATACGACTGGCTTGTTGTA
TTTCCAAAGGTTTATCATTCTTACACAGAGAAACCAATAAAGCTTTAGAG
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AGAAATTTATGAGCTACTTGGAGAACACCCTAATGTTGCCAAGCCTTGGT
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TCAAACAAATGATTGATTCTGAACAAAATAGTTACCACGACTCTTCGAAT
TCGTCCAGAGAATGCTTAATGTTGATTAGTCAAAATACTGACTTAGTAGT
TCCCAGTTCACGTAGTGACGTTTATGATCCAAAGTTGGTTACTACGGTCA
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CTTACACAGAGAAACCAATAAAGCTTTAGAGCCGAAATCGAAACAAGAGA
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GTTTTGCTGTTGTTTACACTACACACAAAATTAGTAAAAGACGACGGCAG
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GCAGAGGAAACAACTGTAATAAACTGTTGGTCACCAATCCACAGACGCAA
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CGCCCTCGTGTGTTTTGAATCGCCTCAAACAAATGATTGATTCTGAACAA
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GTGCATGGTTACGTTTGTGTCAAACAATATCGACCGCAATTCCCTTCACA
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CTGGCGGATTTTGGTTACGCTCTACGGTTGAAAGGAAAATATTTGAATGG
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TGTTGGGATCAGGAGGCGGACGCCCGTTTGACGCCCTCGTGTGTTTTGAA
TCGCCTCAAACAAATGATTGATTCTGAACAAAATAGTTACCACGACTCTT
CGAATTCGTCCAGAGAATGCTTAATGTTGATTAGTCAAAATACTGACTTA
GTAGTTCCCAGTTCACGTAGTGACGTTTATGATCCAAAGTTGGTTACTAC
GGTCAAAAGTTGAATGGTGAAGTTCCAGAATGTCTTTTACCGTTCGAAGA
GGAATTAGGGTCTGGTCCATCCGTCAACAAAGTGCATGGTTACGTTTGTG
TCAAACAATATCGACCGCAATTCCCTTCACAATGGATTCAAAACAATATG
GTTGGCTCACCTCGTTACATGGCACCTGAAATGCTTGACGGATCCATTAT
GCAACGTGATTGGGTGACAGCATTCAAACAAGCTGACTGTTACGGTCTAG
CTTTATTGTTGTGGGAATTGAGTCGCAGATGTAGAGATATTATTGACATA
GATGGTTCGTCGAAAGTCAGCATTGCTCATCGTGACTTGACAAGTCGTAA
CGTGTTAATGAAAAAAGATGGCACCTGCGTTCTGGCGGATTTTGGTTACG
CTCTACGGTTGAAAGGAAAATATTTGAATGGAAAATTTCCTCTTTTTATC
ACCAGTGAACGAATACCACAAGATTTCGGCTTTGAAGGAATCATCGTAAT
GGAATATTACACACAAGGATCACTTCTTAATTACCTTCGTAACAATACAT
TATCATGGGTTCAAATGATACGACTGGCTTGTTGTATTTCCAAAGGTTTA
TCATTCTTACACAGAGAAACCAATAAAGCTTTAGAGCCGAAATCGAAACA
AGAGAAAACCAAGAACTCGACCATGTTTCTGACAGCGATCATATCCTCTG
TGACATTCTTTCTGATTGTGTTTTGTTTTGCTGTTGTTTACACTACACAC
AAAATTAGTAAAAGACGACGGCAGCCGAACCGTGATAACCAATCGTTGAT
GATGCGTACTGAATTGTTATTACCAAGTCCTAAAACAATGTCAGATGAAG
CTCTAGATAACATCATGAGAGGGAATCTAATTCACCAAGGAACCATTAGT
GCTGTCCGACTGGCAACGTTAGACGGGAAAGAAGTTTCAGTGAAGATTTA
TCAACCACGCAGTAAAAACCAATGGACAAATGAGAAAGAAATTTATGAGC
TACTTGGAGAACACCCTAATGTTGCCAAGCCTTGGTCACGATTGGAAGCC
TGAAAAGAACATCACCAAAACAGATTTCCTGCAAATACACAAATCGGAAT
GGGGGTACTTCAATAAGTAGAACAACATTTTGTCCAGAAGATTCAAGTTG
TGTGGCTCTAAGATTATACAAACACCAACCGTCTACCGGGTGGGTGGAAG
AAAGAGAATATAAAGGTTGTCTTCCAACGTTTTCCAAAAATAAGAAACTC
TACAAAGATATGGTGTGTCCTAAAAAACCTGATCTAACTGGATTTTGCTA
CCTACAGAAGTTGACAGCTTATGTGCAAAAAGACTCTAATCGCCAATATT
TATATTGTTGCTGCAGAGGAAACAACTGTAATAAACTGTTGGTCACCAAT
CCACAGACGCAATGGCCTGAGACCAATGTTGCTTGAATTATTCAAAATAT
CACTACTGATAGCCATGGTTAAAACACAAGGGAACTCTAATTTGGATT
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13264MSTRG.13264Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13264.1.p1.exon14MSTRG.13264.1.p1.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13264.1.p1.exon13MSTRG.13264.1.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13264.1.p1.exon12MSTRG.13264.1.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13264.1.p1.exon11MSTRG.13264.1.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13264.1.p1.exon10MSTRG.13264.1.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13264.1.p1.exon9MSTRG.13264.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13264.1.p1.exon8MSTRG.13264.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13264.1.p1.exon7MSTRG.13264.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13264.1.p1.exon6MSTRG.13264.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13264.1.p1.exon5MSTRG.13264.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13264.1.p1.exon4MSTRG.13264.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13264.1.p1.exon3MSTRG.13264.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13264.1.p1.exon2MSTRG.13264.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13264.1.p1.exon1MSTRG.13264.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13264.1.p1MSTRG.13264.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000104_pilongenomesc0000104_pilon:493605..532373 -