MSTRG.1325.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.1325.2.p1
Unique NameMSTRG.1325.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000006_pilon:1788656..1800268-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.1325.2.p1 ID=MSTRG.1325.2.p1|Name=MSTRG.1325.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11613bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:1788656..1800268- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGAGCAAAGAACGAAGTTGTGCGGCAGCCATTATGCTTCGAATAATTTGC AGACTCTACAATAGACTCATAAACCTTAGGTCAGGAAAATTAACCATGTT GTAAACAAATCAGAACGATGCAAGATGGCGGATGAAACAGGTTCAAGAAA TGAAAATAATCTTGAAGGAAACATAAAAAAGCAAGGGAAATTTTCAACAA AATGGTACCATTGTCATGCCAAACTAGAAAAAGACTGCTTTGTGTATAAA AGGGCAGATAAGGTACTTATCATTTTTCACTCTTTTCATTTTATTTCCCA TCATAGCTAGCCGACGTGCTAGTAGTGCTAGCCTATATTTTTACCGTACG TAGACTAGTTGGTCTATAATGTAATGTCAACACCCCTCTTCTTATTTCGA CACCCTTCTTTGGAGATTCGAATAATAGGAAAGTGGGACTCGCTTATTGA AACAACTTGTCTTTGCTTAACTTTCAGAGAGGAAAAAACTTTCTTCTATT CTATCTATATCCAGCTATATCAGTAGTGATTCCTTTAAGAGGCCATTTAT TTAAGAAAGGGGTGTTATATCATAAATGAATTATGTAAGTAAGTGATATT TTAAGTAACAAGTTCATTAACAATTTTATTTTGAAGTTTGTTTTTAAAAA CAGAACCCCCGTGCTATATGATAATCTCATTTTCTTAACTTATGGACCCA TTTGGAAGTCTTTACAATTGTAATACAGATAATTTGGCAGTGTAGTTGCA GCCTATACAAGAATTGGAATCTAAAGTCTGAAGTCGTAACTCCTTGTCAG TGACCCCGCAGATAAGTTTTTAGTTGGCAGACACTGACTTTAGGTTGGTT TGGAAATCGTTTTATTTTGAAATGTAATCTTCACTTTAGATGAATACTTT TATTTATTTGGATTCATGAAAGGTTTAAGGTTTGTTTACTTTTTATTTCA 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ACTTGAAAGTTGGAAACAAAATAAAACGTGCAGCAGCCAAAATCAACCAA CCAAAATTTGTCATTCAATTCCCGAGACAGCGCTTCGATTTTTAAGGCCT TGTTTATACGCTAAAGTAAAAACAATTCCGCACATGTAAATGGGTCATTG TTTGAGGTCCGGCGAAATTTCCGGGAGATAGCCTATCCGGCGGTGCGCGG ATCTAGGTGGGTTCCGCCTCCCCCGTAGATCTTTTTCTTGGGAAATTGAT CTTCAAATTAGTTTTCAAGGTTGGCTTGGCTCAAATTTTTTCATCTATGG CTTAAATTTTAGGCAATTTCTCAAAGCGCCGGGTTATTTTTTCATGAATC TCCTTAGAAGTTTTGCGGCGCATTTCTTTGCTTGAGAGTCAAGTAAACGA TATAGCGCTTTCGCATCATTAATCTTTGATACGCATTTTGGCGGGACGCT AGTGTGACTAACTGTTTAGCCAATCTAGGGGGTAAAAAATCTGAAAATTT TCTGTCCCTCGGCCCTAACAATGATGGACCCTGCGGGTGTCACTGTGTAC CAAAATATCTCTATTAAAAAGTTTTTCCGTCTCACAGAAAAAAACTGCTT TGACCACTACATCCCACGCTCTAAAGGGGATGGATCCGCAGGATTATATG CCTTAGCAATGATGATCGGTTATGAGATTAACGCTAATCTCGCCCAAAAA AACAATTTGAAACCCGTTAATTCCTTTTTTCCCGATTTTCAAGTCCGACT ATTCATTGTAGACCATATGGAAGCATCAAAACAAACCAGCGGAGCTTTTG TGAAGTGAAAAAGAGGCTTAGGGCAATCAAATATCCGTTTACCGCCTTTT TCTAAGGAAAATTCCGCCCTCTCGGACTGTTTCGTTCAAACAGAAAATTC TTTTTGCCCAATCGACCGACCGACCCACTTTTTTATGGTTGGAATGACAG GAACCAAGGGATTTTTCACAAACGGCCTAAGGAAGGATGTGGAAATTAGA AGATGGGTATCGACATTAAGACTTACTTACAGTATTATTAGGATAGTTTA TGATAAAATCTTTCTTTTTAATTTTTGCAGGCAAAATCGTTTAGAATTTC TGTTGATCCTCACTAAAATATAGGGAGAGTTGGATTCTGCTGTATTCTGA TCGAAAAAAATACTGAAAAACTTTTGTATTATAATGAATGTGCAACGTTT CCAGTGGTGGTTAGAAATTCTGATGAAAATCCATGTACTTTCGCAAAATG CGTCAGAAATTCCACTCTTATTTTTGCCAATTTTAATTCAATTGTCTTAG AAATTCATACATTTTCTTCTCTCGCCTTGGAAATTTTGAATTTTGCTGAA AACTTTTGCCCTCAGAAAAAATCCCAAGTCCTCCACCCCCTGTAACAGAC AAATTCTGGAATGGCGCTTTTGAGGCCCATTATTGCAACTGGGTAAATTG CACCAAATCTGTACCATGGGTGATGGGTTTGTAAACAAGACAAACTGTCT TCAAATTTCCATAGAAGTAGATGTGTTTTAGGTCTTAGAACTTGAGTTTT TGTGGATTTTGTACTGTGGCAGAAGGTATCACTATCAGTAAGAACTAAGT CATTTTTTGATACTTTGTTTCGTCTTTATTGAAATATTAGCAAAACTCTG TGACCGATGGGACGTCCTATCCATCACGCTTGTCTTTTATTCACTCAATT TTAAACTTGGCTTTCTAAATTCTTTTCAATTTTATGAAAAAACAACAAAA TTGTGTCCCGTCTGTCACACATTTTCAGTTACAGTATATTAAGGGCTTAG AAGAATGATACACATGACAGAAAGAAGCATGAAGATATTGGTGCATATCA TTTAGCTTCATTAGAGATGGGTTATAAGTTTACTCCCATGACAAATTATT TTAGCATCCAGGAATTCTTGAGCTAGTAATTAGCTAGCAGTAAACTTTTA ATTGCTAGAATCAATTTTATGAGATGTTCTATAAAATAGTTGAGTTTCTT CTCACCATGCTCCGGGTGAAACAACAACATCAGGCTTTGTAAAGGAGTTG TTGCTTGTGATCACCCATGAAAATAATTGCATATGATGACTCCATCTTGA TGTCTATAGCAGTCTCCCTCTTTTTTGAATAAACGTACCATTGTCTTTAA GATAATGTTCTTCATTATATTAGCACAGTGAGCTCTAAGAGGGTTCCGGA AGGGGTACCCCCTGCCGCTAAAGAGCCTTACGGACTTTTGTCATGGGAAA GATTTCAGTACATCCCTACAACATTCTGATGTGCATAAAATAGCATCCTC AGGATCCTCAGGCAACTTTGTATAGAATGCAGCTTACAGAGAAAATCATT TGTTTCTTTAACGACTTTAATGACTTCACCTGCTCAGCAAGGAGTTAGAG GTGGATCAACAAACTCTGAAATATTTTCTGTGAAATAACCAGAATTAGAA ATTACTGCCCCCCCCCCGCTTGAACACTGTGCAAAATGAATTTTTGGAAG TAATAGAATCGAACCAAACGGGGTTGTCAGCAAAAAAAGAAACCCATCGT AACTTAAAAATTATGTTTCCTGGTAATAAGATGACTGTCTCCATTCCTGA AAACCTCCTCATACTATGTCTTCCAATATCTTCAAGTTGAGTAGATGCTT CTTGGAGATAATCTTTCCGATCTCACTAGTGTTTTAAAAAGTGGTTTCAT ATTCTATGTAATAGTACAGCTTAACTTTCCTGATGAATATACAGTATTTT CATGATAAATGTCTATGTGAAGTTGATCTATATATCGCATTTTTTGAGGT TAACTTGTAAAATATAAATCGTTAATCTTGATGTGCTGGCGTTTCTTTAA TTCATATTTATTACGGATTATACCTGAGATGTCTGTAAGAGACATTTCTT TGTCCATTAACAAATGGTCTATTCGTATATATTCAGTTATATCATACATG TTTAAAAAGAATAAAATTAATTTCATGACAGGCATGATGTGAATTTCAGG ATACAGCCCTAAATCACATTCCTCAACCGTTTTTAAATTGCATCAAGTGT TTTTTACAGCATCGGCGTCTCCGAAAAGTCTTATACATTGTAATGGGATA TCTTTTCTTCTGGATATCATCTCTTTAATCTCACCAATTGTATAATCATC TTGTACCATGATAACAAAGGTATAGGATTCAATCTTGTTCATTGATCTAT TATAAAAAGGCCTTGTTATTTTCACTTCATAAGGTCTTTTAACGACCACT ACGTTGAATTCAAAATCACTCAAAGATAATCTTGAATATTTCGCTATTAC AGTAAAAATGGAACTGCAAACTTCGTCAATTTTTTGTCCTCTGAATAGTA TTATTTGATCGTTATTTTGTATATTGTAAGTCCTTTGGATATAATGTTTT ATGGAAATGATTTTATCATAGTGAATGACATCCATGTAATCAATCTTTGA CAAGAACCTCAATCTGAAGGTTGTAATTGGTGAAATATTGTTTTCTGTTA ACCAGTTTTCAACTTCGAGTAATAACTTGATCATGATTGTCAATAAGTAC TTGATTTTTGTTGCTGATTCAATAGCTGCATTGATGTGTCTGGATATTAG TGATGATCTCACACGAATCACTCTCTCTCTGATCCAATAACTTGAATTTC TAATTCTTCTTCGGTTTCAGAGTGATCTTTATTTGAAGTAGTTAACAACG TTGTTTCGTAGTTTTTTAATATTTTTATATAAGGTTGTACATCATTTTCA GACCAAAACATTTTCTGGCTCTCAAGTTTATATATACAAATGCATAGTGC GGAAAAGGAGTCTGATCCCCCCTTGTTAAATGATCCCCCCTTCTTGGCAT CCCCCCAACCTTTAAAAATGCCTATCCTCCAAGGGTTTTGGGCTAAATTT TCGAAAATATAGTGTATAGTGCAATCCGATAATCCCATTCTTCTTCTTCT TATTCTTTCTTGCTTCTTGTTGACTCAGACTACTCGAACAGAAAAACTTC CTTTCATGCAGACCAAATTTCATAACAGTGCTGGAAAATAAACTGCAATA TAATGTAAGCCCTCCCCCTTCTTAAACTACTACTACTATTTTTTAATGAA AATTTCTTCACTTTTTTGGAATATGTTATCCCCCTTAAGAAAGGGGGGGG GGGTGTCCGAACTATGAAATATCAGACTTCCATGAAATGACTTGTGTTTA CATTAAATTAGAAATTGCAGACAAGAAAAATCAGCGTTCTGAATGCAACG TTAGCGTCAACACTTGTTTATTCATAATATGCATCACTGCAATGTCTTCG ACACTATGTCACTTGCAACCAATCAGCTGCTGGGTCAGCGATGTAATGTT ACAAGGCATTGCAGTGGTGCAAATCATGAATTAAAGTAATTAAATGCTAG GTAATGTTAATTAGATGATGTCTTTCCTATTTTGCAGTCTTAAGGAAAAA GTACTTAAGTGACTCACCTTAAAGGAGATCTTGGCGGAAAGAAAATTTGG CGGATTTGGCGGATTCGGCAAGAATTAAGTTCCCGCCAAAATTTCTTTTT TTCGCAATCCGCTAAATTAAACTTTTTGAAAATATGATCTCTTTTATGGT GTTTTTGCATTTTTTTTGCTGTTTTTACGCCATTTTAAGGATAACTTTTT CAGCAAACGCCAAATTGAATTCCCGCCAAATTTAGTTTTTTCGTCCATCC GTCAAATTAAATTCCCTCTAAAAAACTTTTTCGGCCATCCGTCAAATTAA ATTCCCGTCAAAATTTCTCCCTTTAAGGTATTAGATATCAAGGTATTATC AAGGGAAGGTTTTTGAGGCTTTGAAATTTACACTATTAAAAATATAACCT GAAAAAAAGCATTGCAAAAGTTTGAAATTTGGGAAAATATGACATCATTG AATTATTTAGCAATTAGGGACCTTCACTTGTTGAAATTGCACTGTGAGTG TAATAAAATATTGCCTGAAAAAGGAAATGAAAAAAAATCATTCCATAGGT ATTCAACTTAGGAATAAGTGGGCAAAATCAAATCTGACTATTCTTTAATT TTTACCGGTCACTCCAAAGTTTTTAACCTAAACTGAAGTACAAGTTCGAC ATCGGTATTTATTACGGTTGATAACAGAGAAGCAACATCATACGAAATAC GAAAACATTCTTGGCTTATCTATGAAAAACATTAACAACCTTTATTGCGG TTTCAAAGTAATTAATATAAAAATGCTTACTTGCAATTTTTTCCCTATCT TTTGGCATCAAAATAAGTTTTGAAATTCTTCATATGCTTTTAATTGATTC GTTTTTGTGTTGGTTAAGAAGTAAAAAAACCTGGTTTTATATCTAAGTTA GAAGAGTGTTCATGTACATTTCATTAAATTTAGATATAAGGGGTCAGTTG AAAATGTTGGGTACCCAATTTGTTACCCAAGTTTGGCTACCTATTTGGGT ACTGGAAAAATGGCGAATCAGCGCTATCAGGGAAATCCAAGCACTTAAGC CTGCACCTATTCAAATTTACTAGAGAATTGAGTCGTGTCTTTTATCATTC TTTTTCCAGAAATTAAAGTAGAATTTGCTAAAAGGATTTTGGAAAGTAAC ATATACATTATGCTACAATGGGTTTATTGTGACGGTGTTCTTTGCCACTC TGATTTTTTACATCCGAATTTAAAAAGTTTTCTTATATTTTCTTCCAGAA ATTGATCTAGAATTACTTAAAGATCACGAAATAAAGTATCACACATTATG CCAGAATGGATATACACTTGTGAAGATGTTCTCTGCCAATGATCAAACCG TGCATCCTTCTTTTAATACTGATACCCAGAGTCCACAAACCAAAATTCAT ATATTCAATCGACCTAATCATAATGTGGTATTTTTTAATTTCATTTTCGA ATCGTTACCAACATTATCAGACATAAAACAAAAGATTCAAAAGACTCTTC CAATTCCAAGTGATGATTTACTGCTCTTTGAATATGACGGTCCCTGTAGT ATAGAAAGTTTGGTCCTGGAAGAACCTGTGAAAGCTTTGCATGTGAACAA TGAACGTAAACCTGCTTTAAAATTTCTTTTGGTTATTCGTGGGAACACAA CAATTGGCATTGTAAGAGAACTTTTCTTTGAAACTCTTGATGAAATAGAG ATCCAAGTGCTTGGCTCACATACGCATTTTAAGGTGGAGACGATAAGAAG ATTGCATTTTATCAAAACAGCAATTGTATCAAAATTTAATATCCCTTTGG GAAATCTAGCATTATTAACTAATGATGGTATAGAAGATTATGAAGATTAT GAACCTATTCCTTATGATGCAAACGTGTCTTTAGCAGTTATAGGAGATGT ACCAACAGAAACTATAAGTTGGTTAACAGAGAATGACATAACACCAATCA CAACCTTCAAGTTGAGGTTTTTGTCAAAGATCGATTCTTTGAATATTACG GAATACCATACAGTCAGTGCCATAAAGGATTACATTGAAATTCAATATAA AATACGACGCAGTGACCAGATTATATTATTTAAAGGTAGAGAAACGAGGG AACGTCAGTCGGTGTTCAGCTTAATGGTGACTGAGCCTTTTAGTGAATTC GGATTGGATGTTGTTGTCGTTAAGAAGCCATTTGAAGTGAGATTGATTCG ATTGTATGCGGATAAATATTCACGAGAAGAATTTCCAATCACAGCTTTAG ATTCAAATACTATTGGCGAAATTAAAGAGAAAATCTCAAATGAAATAGGC TTTCCAATAAGTCATATAAAACTTTTCAGTGATGCTGAAGGCTTTAAAAC ACTTGAGGATGATTCGAAAACAGTTGAGGAATGTGATTTAGGACTATATC CAAAAATCTGGATGAAACCAATCGTACACGTGTATGTTACCTTTGCTGGA CTTACTCCAGAATTAAGAGTTTCTCACTACGAAGTTCTTGAGGAACACTC AACTTTGGGGGATGTAATAATGAGAATAAGGAACGCTCATAATTTAAAGA AAAATCAACAGATAGAAACTAGAGATGTAATATGGGGTCATTTATTAGAT CCAGCCGTTTCTTTGGTGTCTGAATCACAAATACGGGCTACTGTTTATCC GTTACCTAAGAGATCTTGTAATGTTATGTAATGATGGCTTTTAGATTTTT ATGAAAAAAAACACTCCTGTTGCATTTACAAACCAAACCAAACTTCTAAT TGACTCTGTCATTTCCGCGCCTTCTCTATTATCCGAAAAAGAATACAGTA AAACCTCTAATATTAACGGACAATTCTATTTTTTCCTCGGCCATTTCTTA GTCAAATCCTCCTAAAAACGTTTCCAAAAGGCGGACTAAGTTTTTGCACG AAATGGCCGAAACCCTACTTTTTCCTCTCTAATTAGCGGACATCGACGGT CAAACTGGTCACAGACTTTAAAAGATTAGACAGAATTGATTTATAATGAT AGTTAGATTTATAAGTTATTGTCAACTGAAGGGACCATGAAAGTTTTTTA GAGTTAAGGAGACATTGGAGTTATAATGGTTCGAGTTTCCACTGTATTCA ACTGGGTAAATAACTTTCGGAACGTTGTTTTTTAGTATCTACGTGTAATT TCATGCATTCTTCGTGTAACCTTATAACCTTGCTATGTTTCGTGTATGTA TTGTGTTCTTACATTTTACTTATTATATTTTTAGTTCTAAACATTGAAAT AAATTAAATAACAAATTTTAAGAGATGGCAATAACTCTCGAAGATGTGGT TAGTATCGTTGAAAGAGCAAAGCAAAAGCTTGATGTATTGTTCGTCTCTG TACAAATGCCTGAATCTCATGGTTTAACTCATTGTCTCATTGTACTGGGA AATATGAACAGTGCTATCAGTCGTGCTCCAAAAGACCTTTGCCATCTCCT AACCCCGGAGAAAATTTTGACTTTGAAACTTGCTGCCTTACTTCACGAAG CTGATGACCACAAGTTTTTCAAAGGAAGTGTCGATTTTGAAAATGCGAAA CGGATTTGTGAAGAAGTTATCCCTGAGAATGTTGATAATAAGAAAAAAAT CATTACGGATGTAGTGAAGATGATTTCCTATGTTTCTGCATCAGTTAATG GGAACAGTGTACCGGGAGATGCCAAAGCTGACCCCACCTTTCTATGGCCA CGTTATTGCGACAGGCTAGAATCTATTGGTGTGATAGGAGCTGTTAGGTG TTATCAATATAACACAGAGGTAGGGGCACCCCTGATGGTAGCATCTACTC CTCGTCCAGCTACAGTGTCAGAACTATGGGACCAAGTCAAAGAAGAAAGA TGGAAGCAGTACCAAAATGGAGGGAACAGTCAAAGTATGATGGATCATTA TTATGATAAACTTCTCCATATTGCTAAACTGGATCCAGGAGTTGTGAGAA ATGATTTTCTAGTAGAGGAAGCTAATAAAAGAGTCCAACCTTTGATTGAT ATTTGCTTGGAATCTGGGAGGACTGGCAAAGCACCTGTAGAATCTCTAAA GAAACTTGAGAAATCGTTGACTTAAGAAAATGAAGACGACTTAGAAAATA TAAGTTTTTTTGGATTTATGTTATACGTTTTTGTTATTTTTAGGTTATAT ATATGACAATGAAAAGATATGCAAAAATATTTGTACCGAGGTCAATTATT TTGTCTATTTTTATTTTTCGTTATCATGGAGATGTTTTATCTTTGGAGAA GCAAGTTCATTTCATGATTTACAACGACTCTGACTTGTGCATGTGTATCA AATTACATCCAAC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000006_pilon:1788656..1800268-

>MSTRG.1325.2.p1 ID=MSTRG.1325.2.p1|Name=MSTRG.1325.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=801bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:1788656..1800268- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAATAACTCTCGAAGATGTGGTTAGTATCGTTGAAAGAGCAAAGCA
AAAGCTTGATGTATTGTTCGTCTCTGTACAAATGCCTGAATCTCATGGTT
TAACTCATTGTCTCATTGTACTGGGAAATATGAACAGTGCTATCAGTCGT
GCTCCAAAAGACCTTTGCCATCTCCTAACCCCGGAGAAAATTTTGACTTT
GAAACTTGCTGCCTTACTTCACGAAGCTGATGACCACAAGTTTTTCAAAG
GAAGTGTCGATTTTGAAAATGCGAAACGGATTTGTGAAGAAGTTATCCCT
GAGAATGTTGATAATAAGAAAAAAATCATTACGGATGTAGTGAAGATGAT
TTCCTATGTTTCTGCATCAGTTAATGGGAACAGTGTACCGGGAGATGCCA
AAGCTGACCCCACCTTTCTATGGCCACGTTATTGCGACAGGCTAGAATCT
ATTGGTGTGATAGGAGCTGTTAGGTGTTATCAATATAACACAGAGGTAGG
GGCACCCCTGATGGTAGCATCTACTCCTCGTCCAGCTACAGTGTCAGAAC
TATGGGACCAAGTCAAAGAAGAAAGATGGAAGCAGTACCAAAATGGAGGG
AACAGTCAAAGTATGATGGATCATTATTATGATAAACTTCTCCATATTGC
TAAACTGGATCCAGGAGTTGTGAGAAATGATTTTCTAGTAGAGGAAGCTA
ATAAAAGAGTCCAACCTTTGATTGATATTTGCTTGGAATCTGGGAGGACT
GGCAAAGCACCTGTAGAATCTCTAAAGAAACTTGAGAAATCGTTGACTTA
A
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1325MSTRG.1325Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1325.2.p1MSTRG.1325.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1325.2.p1.exon2MSTRG.1325.2.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1325.2.p1.exon1MSTRG.1325.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000006_pilongenomesc0000006_pilon:1788656..1800268 -