MSTRG.1325.1.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.1325.1.p2
Unique NameMSTRG.1325.1.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000006_pilon:1773889..1800268-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.1325.1.p2 ID=MSTRG.1325.1.p2|Name=MSTRG.1325.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=26380bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:1773889..1800268- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGAGCAAAGAACGAAGTTGTGCGGCAGCCATTATGCTTCGAATAATTTGC AGACTCTACAATAGACTCATAAACCTTAGGTCAGGAAAATTAACCATGTT GTAAACAAATCAGAACGATGCAAGATGGCGGATGAAACAGGTTCAAGAAA TGAAAATAATCTTGAAGGAAACATAAAAAAGCAAGGGAAATTTTCAACAA AATGGTACCATTGTCATGCCAAACTAGAAAAAGACTGCTTTGTGTATAAA AGGGCAGATAAGGTACTTATCATTTTTCACTCTTTTCATTTTATTTCCCA TCATAGCTAGCCGACGTGCTAGTAGTGCTAGCCTATATTTTTACCGTACG TAGACTAGTTGGTCTATAATGTAATGTCAACACCCCTCTTCTTATTTCGA CACCCTTCTTTGGAGATTCGAATAATAGGAAAGTGGGACTCGCTTATTGA AACAACTTGTCTTTGCTTAACTTTCAGAGAGGAAAAAACTTTCTTCTATT CTATCTATATCCAGCTATATCAGTAGTGATTCCTTTAAGAGGCCATTTAT TTAAGAAAGGGGTGTTATATCATAAATGAATTATGTAAGTAAGTGATATT TTAAGTAACAAGTTCATTAACAATTTTATTTTGAAGTTTGTTTTTAAAAA CAGAACCCCCGTGCTATATGATAATCTCATTTTCTTAACTTATGGACCCA TTTGGAAGTCTTTACAATTGTAATACAGATAATTTGGCAGTGTAGTTGCA GCCTATACAAGAATTGGAATCTAAAGTCTGAAGTCGTAACTCCTTGTCAG TGACCCCGCAGATAAGTTTTTAGTTGGCAGACACTGACTTTAGGTTGGTT TGGAAATCGTTTTATTTTGAAATGTAATCTTCACTTTAGATGAATACTTT TATTTATTTGGATTCATGAAAGGTTTAAGGTTTGTTTACTTTTTATTTCA 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TGGAGTTGGTCGAGGCTTTATAGTAATCGTTTAGACTTTGTCTGTAGTTT TTTTAGGCCGGGATCTACTTGTTATCTATTTTTCAGACAGATATTATCAA AGAGTGTAGCTTACAAAAAGTCATATATGTAAATTAGATTTACGTCTACT GGATTATCAATAAACCAACGCTTTCTCCCATGTTTGTTTATATTCGAGAT CGGTTTTGTTTTTAGTTTTGATGGGCTGAAAGAAAAGCGAAAGTATTTTT AGCCATACTTTTAACCTCAAAAAATTATACACTCCATTTTGAAAAATAAT ATTTAATTTTGATTTCCTAGTTTACCTAAAATTGAACTTTTTTGAATAAG ATTTTGAGGTCCTCACTACTGCTAGATTTCTTGAGAAATACTCACACGTT TGCAGTTTAGATAATTTTGTATCGTCTAATTCTTGTAAAACTTCCTGGTA TTTTAGACTTTAGCTACAATGTTATTATCCTGTCTGTCTGTCTATCTATC TATCTGCGTAATCTTTTCCCGACTAGTTCAGACACGTTAGGCAGTTTCAA AGTAGATTTTAGAACATCAATCATATTAAGTTTATACTTTTCTTTACTTA TAGGTCAAAACGAAACTTGTGCTACTTGTTGACGTCTCATTGGAGCACAA CGAAGAAAAAGATTGTATTTTTACCATCATCGACTCTAAAAGGAAGAACA AGAAACTCATCTTCAAAACGCAGACCCCAGAGGAGTGCAAACAGTGGTTG GAGGCTATCTTCGAAGCTATACTTGAAAGTAAAGAAAGCTCTCAACGTCA AGGAAACTCAGAAGCTTGTTCCATCCAATAACACAACGTAAGACCTCTTT TATAGTGACCGTTTAAAAAAAATATTTTGAATCCGAAATTTGATTTTTTG ATGCTGTCCTATAGCAAATTATAATCGGGTTTGTAAAAGGTTTATTCTAG GTTTCAATTTTGCATTATTTTAGCGTCTCTCATTTTTAAAAGTAAGGCAG AAGCTTTAAACTCATTGTTCAAACAGACCTAAAGCCTTTAACAGAAGGCA TAAAACTACAACCATTTATTTTCAAAACTCTGGGAAAATGGTCTAAAAAT CTTTTAATTACACGCTTTTCACGGGACAATTGAATCTGAAAAAAAAAGAT TCCTGAGACAAAGATGGGAAATCAAGACATTTCCAAGAAAGTATTTATCT GATGTTTAAGAAAGCTCTTTTGGCAAAGGATAATTAGATCTTCTGAAGAT TTGAACCTTAATTTTTCGAGCAATAAGAACAACTATTCCTAAGTCACAAT TTGCTGGTTGTTATAAAAGCAGCGTGTAGAAGATTTCTATTTTTTAAATA AATTGAGGAGATGGGATTATCAATGCAGTAAGTATCTATGCAAACAGTGC CTCTAGGAAAATACAAGTCTCCTCCGAGAATTATTATTTGAAGGTATTCT CACTAAGTCATGTGCCTTCTGTTCTACACTAATCGTGCACTAGCATGTTT TCGTGTTTCGTACTTTTTTATGCCACTCTGTTTATTATACTCTCATGAAG AAATGTCTAGTTGTTTGAACTATAATGTAAAGATGTTGTCTTTTTCATGG TTTATTTGCAAAACTGTTGTCACCTTTGTCGAGCGGTTAGCATTTTATCA GATTTTTTTTAATACACGTGACCTTATATTTTGTATTTATAAGAAACTCG TGTTAACCTTTATTCTGAGTTAAGACATGTCAAAGTAAGGTACATTTTTC AAAGCCGAAAAGTGGCTCATTTTCAAAAAAGGAAATCCCCCCCTGAAGTA CCAAAACCTTTTTTCCGAATTTTTAAATATGTTGAATTACAGTATTCTTT CAATCTTCGAATCTTATATCTAACCATGTAATATTTTCCCGATTCTTATA TCTAACCTTCAGGTATTCTGATGCGATATATCCCCGATCAAATTTCATTA TTTAGCTTATGAGTTTCTCAACTTCCGGAGATCACACAACAAGGAAAATC TCATCTCCTAAGCGTTAGATATTTTAATCCATACATAGCAACTATACATT GTAACAACGATAAAGGGTTGATAAAACTTTATACCCGTTCATTGGCAATT TTAAAAATCCCTTGAAAACAGCTCTCGAATTTCAGGTCGGCATTCGGCAG TGCCGACCTAAAAGCCGACCAAAGAGTGCGTATGGTCGGCAGTTCATTGC CGACCATATTCATTGATTCTCTCGGCAGCCGACCATAAGTTATCTTTTAG GTCAGCAAAGCCGACCTTAACAGCAAAAAGTATTAAAAGAGCCGTAGCCT TTAATCAACTTTGCCGACCTAAAATATAGCTCAGATCGGCATTGCCGACC TAAAAACAAGCTTAGGTCGGCAAAATTTTGCCGGCCTTCGGCCGGATTTG GACGGCACTTACGTGCCGACTTACTTTTACTTGAATTTCGAGGGCTGGAA AATATCTGTAAAATTTTAAATTCAAACTATCCAAAATCCTGGTAGATTGT TAGCCTAATCCTGTATCTGACTTTGTTGTTACTTTCCCTGAGATGTCCGT TTAGTGTCGGTCTTATGGTGCCATGATAAAGATTTTTTATTTTTTTGCAG CACAATGGCAAGCGCTCGTCCACCCTCAACTGATGGATATGACCGCCCAC CACGTCCGCCCTCTTCCCTCTCTATGATGTCGACCGCCTCTTCTTTCACT TCACAAGCGCTCGATCGTTTGTCCGAAATGAATAAATGTCCGAAATGTAA TGAACAAATCCGTGACCCTAGAATGTTACCATGTCATCATACCTTTTGTG CTGATTGCATTCGTGAAATGATCGGGTGAGAGTTTCATTTTAGCCTGAAC GTCAATTGTATTACACGTTTTTTTTTTAATAAGGAACCTTATCTTTGCTC TGAGCCTGGAGTTCCTTATTTTTACAGAGAACTTCAGCCTCAAAGTTCCT TGTCGAGTTCCTTATTTACATAGCTGCTAAGTTTGAATAACCATCTCTTA CTGTTCCTTAAAACTTGTTTTCTTATTCTCAGCCTGAGTTCCTTAACAAT TCCTTATTTTTTGGAACATTTTCAGCCTCGAGTTCCTTACAAACGTGTTC CTTATAAAAAAAACAACGTGTACTTCAAATGACCAATTAGTGAAGTATCT TATAAAAACTCCAGCTCATCCCGAGTTTGATTTCTCTCCGTTCCTAAAAG TATAGTTTGAAATCTGGTTTAATTCCTTAGTTAGGAATGAGCAACTTTTC GAAATAAGTATAATTTAAAAACCAGAAGGAAATACATGCCAATGGTCACA TGCCCTACGAGGTCTAAATAGACGTAGAGAGTGTCTACTGCACATTTTTT TATATTCATAATTGGGCAAACATCTACTCAGAATCAAGTTTGGTAGTTCC TTGGTCCATCAGAATGTATTTTGAGCAAACAAAAAAACATTGTTTGCTTT ATATCTCTGAGTGAATAAGTAGTTGTTAGGGTGTCACTTTCTTTCCTCTT TGTCTCTTATTATAAAACTTTCGAAAGTGAAAGAATTTGATACTTAGTCA ATCCGCACAGCTTGAGTGCTGTTTTTTAGACAGGGACTCATAATTATAGT AGTCTGGTATGGGGATGAGTTTTAACTTGATATTGTTGGAAACTGTATTT TCTACATTGATAAAATGGAACCATTCATTTTAATTCAATAGGCGTTGAAC GTTCTTCTTAATTAGAAAATGGTGAAATTAAGAATATTTTAAGAAGATTT TTAGGCTTAAAACTCAAAAAGTTAAGAATATCCGTGTACACTTGACCCAT TTTAAGCCTCTAACTCCTCGACAAGAATCAGGACAATTTTTCTAAGATAT CGCTTATTTTGCAACAAAAAGTAAATTCTTTTTTAGTTCTGCTACACGGA ACGAATTCTTATGTCCACTTGATCGAACCACAATCGCTGTCCCGCCTCTC GGAATGGATGCGTTTCCGCCGGATAACCGCATGAAAGAATTGGAAAACAT TCGAATTGATCTAGAACAAAGTCTTGTTTTGGAAGACCCTGAAACCGCAG ATCTTGACATTAATTTGGAAAGTTTGAATAAGGGAGTCAAAGATATTGAA CATTCATCAGCTATGGCTCAACACGAAGTCAATACCATGTTCGAAGCTAT TCAAAAATCTTTGAAAAAGAAACAGGATTCTTTCATTCAAGATATTCGAC GTAAAAGTCGACGTCAAATCAGTTTGTTAGAATTTGAAAAATTCCGTCTA ATCGAGACAAAGAAATTTCAAAACGAGCAGTTGATGGGTGATTCATCGTT TTATGAAGAAGAAATCATTGAACCTTTCAATCGCGGTCAGTCTATAAACA CGTCAACCCCGCCCTCCCCTGTATCATTCCGTAGCCGCAATCACCATTAC AACAGTTCAACATCAAGTGAACCAAGGCTAGCTCTTTTAGCCTGTCACAT TGGTCAACAACATATCGAATTTAACGAGACTGAAGGCGGGTTAACTAGAC TGGAAGAACAAGTGGAGAAACTAGGCAAAGTGACTTGTGACTTCGATTTG AAAGTCAAACTGGATAGAAATTTGTTAACGTTAGATGAATTTCCATTTGG TATGAAAGTTGGTGGTAACGATTCCTTTGAGTGGCAACCAAGTCAACCTA AAGGTAAGAACGGGTTTTTCTATTAATTAAAACCTTATTTTACCGCTATT CTAACGGCGTCAAGTTACAACAAGCTCCTTCAAATACAATGGAGTCCAGT GAAATCTCTTTAACTCAAACCCCTACAACTCGAATGTGCTCTTTAACTCA AACAATTATTATGGTCCCTTAACTTTAAAATGCCTTAAAAACCCTACTTC ATATCTCGTTTATTTCCTTAATTCGAATAAATTTTATTTCCCGTGTGTGT TCGAGTTATGAAGACTTCACTGTGCAATAACTTTCAAATGCATTAAAAAC AAAGGTTTCTTTTTCATCAGAAATTTGTCGATTTTTCTGTTGACGATTCG ATAAAGATGAAACTTAGAGTACTATAATTCAAATTTTGTTTTTTCTTGTA CACTGTATGAAGCTCTGGTCCTGATCATCGAGCACTCTTTGATGTAATCA CCTATCACTTATTGATATAGATTTTTCTGGAAATGATTAAAACGTAATAA AACCAGGTAAAGACATGCGATTTAATCAAATTCCAATGTTTTGTATTGTA TCTTCTCAAACCTCTATAGGGCTTTGTAGACGATCACCGACTTCCATTCT AATGGTCAGCAGTGGTAAAAGTGAGGTCATTGAAATGGATAACTCATTCA ATGTCGTCTGCCGTATCTCTGGACGAAACGTTTTCAGTAACAATATATCC GACGTCGCCTCCTCCAACGGTTATATATATGTCGCTGATGCTGGAGCGTG TCAAGTTGTCATGTTGAGTAAAGACGGCACACTCGTGAAACGGTTCGGAA AAGCAGGCACTGGTGCACAAGAATTTAAACGACCCAACGGCCTTTGTGTT GATAGTAAAGGAAGAGTGATCGTGTCTGATTCACTGAACCACCGTGTTAA AGTGAGTAATCTCGTGGTCGGCTTGTTATTGTCATTCCACCCTCTATTTC TCGTGAAAATTTCATTCCGAATTCATGATATTCACGACGTAATGTTTTTT TACGGAAACGGAAATAACTCGGTTTTAGCCAGTAGTGGCAAATTTAAACT AGACAAAAGTTGTATAAAATTTGCCACTACTGGCAAAAACCGGGGTCTTC CCGTAGAAAACATTACGTCATGAATATCACGTTAATAGTAGTTCTTTGAT CCTTGATTTTCATGAGTAGCTATTAAGAATTAGGAAATTTCACTTTTTCT AACAAATCTTAAGTTCAAAACTTATTTTTTCGTTTTTTACTGGCAACTTT TCTAGTCTGGTTATAATTTCGATTGACCTCAATATGTATTGGAACAACGT CAATAGTACAGTCCATAGTAATATTCAACACATATTATTTTATTCAGATC TTGTCACCGGACCTGAAGACCGTTATCCTCACTATCACAAACGACCGGAA AAAGTATAAAGAAGCCGGGCGCTTCAGTTTCCCGTATGGCGTAGCGTGTG ACAAAGAGGATAATATCTACATCGTGGATACGAATAACAAACGCTTAGTA CAAATCAGTAAAGATGGCAAATTCTTGAAAGAAATCTACCCAGCAGGTTT GTACCTCTCTGTTAAAGTTTGATTTTCAAAGCCAAGGCAACTAAAATTAC TAAACCTTTCAGGGATTTTTCTAAGCACTTTTGTCCGTATACTGGCTAAA TTTAAGATTGAGTTTTTGAAACTAAATCCAAAATAAATGAGGATTTTTGT GAAATTAACCTTTTTCGTTGTTTATGAGCAACAATAACTAATTATTAGTT TTTGAAAGCTTCACCCTCTGAACACCCACAAGATCCCCAGCTTCATCAAT GTACAGCTTTGCTGAGCAAGTCCCCTTTCAGGCATATTAGAAATTTAATC CAAGTTTACAAAAACGGCCCCAGCTCAAAGTGCTTAAAAAATCGCAGTTT TAAATTTCTATGGTTGAATAGAGGATTCAAACACTACGAGTCTGAAAGCT TGGTACATAAAGGTCTTTTACATTGAACCTATCAACTGCCACCGTTTTAA TGGACCACGATTGAACAAAACTAAGTGAGTATGTAGCCAGAGGGCCGACA AAGAATGTTTTTGCGACTGCAGGCAAGGGCAATAGGAAGGCTTATTTTCG GATATCCTTATTTTCTATACTCCTAGGTGCCAAATAAACGGGCCCCCCGC TTGTTAATTTTTCGATTTTTTCCAAACACCCCCCCCCTTTATTAATTTTT GAAAAAATTCCCAGCTACAAAAAGGAAAATTCCTTGTTGTACTCTAGAAA GCCTAAATTTAGTCTATTTTGACCGTTTTTAGGGTTTTTAAGAGGTCCAT TTTCCAACCCCCCCCCCTCCCCGGTAATTAGGTCCCCCCCCCCCCCCCCG TTTATTTAATTTGAAAATTTTTTCCAACCCCCCCCCATTTATTCGAACCC CCCCGTTTATTTGGCACCTAAGAGTAACTACTTTAATGGGAGCTCATTCG CAAAATTCAAGGTTTCTCAGGGATTTAATTACGCGAACGGCACTATTAGG AGTGATATTTTAAAATTTTGTGCCTTTTACTGCCAACTCATGTATATTTG GATATATTTGGACGTATATACGGATGCGTTTCATTGATGCTAAGTAAACA TTTAAAAAATAGTTTGTTTGACACTTTGTTTAAAAATATTTTGCAGATTA GGACTTTCCGAATTTCGATTGGGATTTAAATTCGCAGATGACATCCAAAT CCGAAAAATTTTGTCCCATTAATATAGTATATTAGTGCTACTATAAGCTT AGCAATAGTGTCGATGCATCAAAGGTATTAAAAAAGAATGATAATTATTT CTTATATTTCACTTTCCTGTCAGACATGGCAGATCCTCGTTGTGTGGCCG TCACGTCCGACCATCGTATCTTAGTCACCGATCGTGAGAACGCTCAACTA TTGATCATTGATCTTCACACGAACACGACGACACGCGTGTCGGGAATCAC GGACAGTCACGGTCGTGAAATCACCTTCAAACAACCGTACGGTGTTGTGG TTGATGGTACGGATAAAGTTTACGTTTCGGATATTGAGCGCAATGCATTA TTTGTACTGTAATATTTGGGTGAGGATGACATGTACTGTTAGCAGTTGAT TCTCTTTAATTCAATCTTAAAGGGAACAAACATTTTACAGTAAACTCTTG CTTACTCGAACTTCTATTATTTGAATCTTTCTATAATTTAAACTTCTTTC AAGTCCACGTCAAGGAGAAACCCTTTCTATACTTCGAACCTCTCATTAAT TCGAACAAATAAGATTCCCTGTTCGTTCGTTAATTAATTTCATGGTCAAA GTGAATAATGAGTAATCAGGACCATCACACACCGAAATGACTTAATGTTG TACGAAAATTTTTGAAGGTTTTTGCGTTTCGACCAAATTTTGGGATAGCT ACATTTTGATGTGAATCTTTACGCGAATCTTTTCGGGTTTGGTTTCTCTA TGTAGAAGGAATTGAAACTTATTTCCATTACTTAGGCCATAGTATAAGAA AGCCGCGGCTGGAATGATAACGTCTGAATTTCTGTTGTTCTATCTCTGTC GTATTTGATGACTATTTGTTGATCAAGAAATCAGTAATGTAGCATCTTTA ATGGTAAATTTTATTGGTTTTTCGTTAATAATTACTTCTCACTGCGCTTT AGACATTAATGATATGCCCTTGATACACTT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000006_pilon:1773889..1800268-

>MSTRG.1325.1.p2 ID=MSTRG.1325.1.p2|Name=MSTRG.1325.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=732bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:1773889..1800268- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTCAAAACGAAACTTGTGCTACTTGTTGACGTCTCATTGGAGCACAACGA
AGAAAAAGATTGTATTTTTACCATCATCGACTCTAAAAGGAAGAACAAGA
AACTCATCTTCAAAACGCAGACCCCAGAGGAGTGCAAACAGTGGTTGGAG
GCTATCTTCGAAGCTATACTTGAAAGTAAAGAAAGCTCTCAACGTCAAGG
AAACTCAGAAGCTTGTTCCATCCAATAAATGGCGGATGAAACAGGTTCAA
GAAATGAAAATAATCTTGAAGGAAACATAAAAAAGCAAGGGAAATTTTCA
ACAAAATGGTACCATTGTCATGCCAAACTAGAAAAAGACTGCTTTGTGTA
TAAAAGGGCAGATAAGGTCAAAACGAAACTTGTGCTACTTGTTGACGTCT
CATTGGAGCACAACGAAGAAAAAGATTGTATTTTTACCATCATCGACTCT
AAAAGGAAGAACAAGAAACTCATCTTCAAAACGCAGACCCCAGAGGAGTG
CAAACAGTGGTTGGAGGCTATCTTCGAAGCTATACTTGAAAGTAAAGAAA
GCTCTCAACGTCAAGGAAACTCAGAAGCTTGTTCCATCCAATAAATGGCG
GATGAAACAGGTTCAAGAAATGAAAATAATCTTGAAGGAAACATAAAAAA
GCAAGGGAAATTTTCAACAAAATGGTACCATTGTCATGCCAAACTAGAAA
AAGACTGCTTTGTGTATAAAAGGGCAGATAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1325MSTRG.1325Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1325.1.p2.exon7MSTRG.1325.1.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1325.1.p2.exon6MSTRG.1325.1.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1325.1.p2.exon5MSTRG.1325.1.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1325.1.p2.exon4MSTRG.1325.1.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1325.1.p2.exon3MSTRG.1325.1.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1325.1.p2.exon2MSTRG.1325.1.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1325.1.p2.exon1MSTRG.1325.1.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1325.1.p2MSTRG.1325.1.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000006_pilongenomesc0000006_pilon:1773889..1800268 -