MSTRG.13212.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13212.1.p1
Unique NameMSTRG.13212.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000103_pilon:955584..1025501-

Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13212.1.p1 ID=MSTRG.13212.1.p1|Name=MSTRG.13212.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=69918bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000103_pilon:955584..1025501- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TAACTGCCAAAAGGGGTGGTGTATACAGAATTTTGGAAGAAAAAAGGTGT ATTAACTGTTTTCAAAACGAGAATTTTCCCCCCACTGCGGTTGACCTACT CCATAATTTGTTAAAAGGGGTGGTGTATATTTTCAAATTTGCAAAATACA GTTAGTACACCTGTGTACTAACTGCCGAAAGGGGTGGTGTATACAGAATT TTGGAAGAAAAAAGGTGTATTAACTGTTTTCAAAACAAGAATTTTTCCCC CCACTGCGGTTGACCTACTACATAATTTGTTATATTTTTATTTGTTTGAA AGTAGTTAGTGGTAAAAACCTGGTAAAGACAGGTAAAAACGTAAAAATAC ACCTCATAAAACCTCCCTGGGGTGTGAAATTCACCTGGAATGCACCGTAG AGAGACGGATCCTTATTTTGGGGGGGGTGGTATATATATTGAGCAAGGTC AAAGACAGTTAGTACACGGTGTACTAAGTGACAGGGGGTGGTGGTGGGGT ACAGATTTTTCCAAAAATCAGTTAGTACACATAGTGTTCTGTACTAACTG CTTGCCCCCCCCCCTGTT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000103_pilon:955584..1025501-

>MSTRG.13212.1.p1 ID=MSTRG.13212.1.p1|Name=MSTRG.13212.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1830bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000103_pilon:955584..1025501- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ACAGTTAGATTATTTTACAGACCCCGACTTGAAATTGAAAGTTCAAGCGC
TTGTGCAGAAGAAAGAGTCGAGCTTGAAACGAAACCAAAACATGAAGTGT
GTATACAACGTCCAAACAACGTTCGAGAATTTGCAGCCGATCAAAACTCG
AATGGGGAATGAGAAATATTTGCGAGAACATCCGGAAATTGATTGCTTGA
TTTCCAGTTTTGTCAGTGTTTTAACTGTCTTAATTTTTACTTAGATATTT
GTACAAAGAAATACAAAAAAATAACAATTTTTAAGATGAACGACAAAAGC
GCAATCGAGAAGAATGATATTGGAGCTTTGACAGATGACCAACAATCCAA
ATTGAATACATTTAAAACAGTTAGATTATTTTACAGACCCCGACTTGAAA
TTGAAAGTTCAAGCGCTTGTGCAGAAGAAAGAGTCGAGCTTGAAACGAAA
CCAAAACATGAAGTGTGTATACAACGTCCAAACAACGTTCGAGAATTTGC
AGCCGATCAAAACTCGAATGGGGAATGAGAAATATTTGCGAGAACATCCG
GAAATTGATTGCTTGATTTCCAGTTTTGTCAGTGTTTTAACTGTCTTAAT
TTTTACTTAGATATTTGTACAAAGAAATACAAAAAAATAACAATTTTTAA
GATGAACGACAAAAGCGCAATCGAGAAGAATGATATTGGAGCTTTGACAG
ATGACCAACAATCCAAATTGAATACATTTAAAACAGTTAGATTATTTTAC
AGACCCCGACTTGAAATTGAAAGTTCAAGCGCTTGTGCAGAAGAAAGAGT
CGAGCTTGAAACGAAACCAAAACATGAAGTGTGTATACAACGTCCAAACA
ACGTTCGAGAATTTGCAGCCGATCAAAACTCGAATGGGGAATGAGAAATA
TTTGCGAGAACATCCGGAAATTGATTGCTTGATTTCCAGTTTTGTCAGTG
TTTTAACTGTCTTAATTTTTACTTAGATATTTGTACAAAGAAATACAAAA
AAATAACAATTTTTAAGATGAACGACAAAAGCGCAATCGAGAAGAATGAT
ATTGGAGCTTTGACAGATGACCAACAATCCAAATTGAATACATTTAAAAC
AGTTAGATTATTTTACAGACCCCGACTTGAAATTGAAAGTTCAAGCGCTT
GTGCAGAAGAAAGAGTCGAGCTTGAAACGAAACCAAAACATGAAGTGTGT
ATACAACGTCCAAACAACGTTCGAGAATTTGCAGCCGATCAAAACTCGAA
TGGGGAATGAGAAATATTTGCGAGAACATCCGGAAATTGATTGCTTGATT
TCCAGTTTTGTCAGTGTTTTAACTGTCTTAATTTTTACTTAGATATTTGT
ACAAAGAAATACAAAAAAATAACAATTTTTAAGATGAACGACAAAAGCGC
AATCGAGAAGAATGATATTGGAGCTTTGACAGATGACCAACAATCCAAAT
TGAATACATTTAAAACAGTTAGATTATTTTACAGACCCCGACTTGAAATT
GAAAGTTCAAGCGCTTGTGCAGAAGAAAGAGTCGAGCTTGAAACGAAACC
AAAACATGAAGTGTGTATACAACGTCCAAACAACGTTCGAGAATTTGCAG
CCGATCAAAACTCGAATGGGGAATGAGAAATATTTGCGAGAACATCCGGA
AATTGATTGCTTGATTTCCAGTTTTGTCAGTGTTTTAACTGTCTTAATTT
TTACTTAGATATTTGTACAAAGAAATACAAAAAAATAACAATTTTTAAGA
TGAACGACAAAAGCGCAATCGAGAAGAATGATATTGGAGCTTTGACAGAT
GACCAACAATCCAAATTGAATACATTTAAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13212MSTRG.13212Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13212.1.p1MSTRG.13212.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13212.1.p1.exon5MSTRG.13212.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13212.1.p1.exon4MSTRG.13212.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13212.1.p1.exon3MSTRG.13212.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13212.1.p1.exon2MSTRG.13212.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13212.1.p1.exon1MSTRG.13212.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000103_pilongenomesc0000103_pilon:955584..1025501 -