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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000001_pilon:2562799..2582508+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.132.1.p1 ID=MSTRG.132.1.p1|Name=MSTRG.132.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=19710bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001_pilon:2562799..2582508+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
tgattcaagatggcagacggaaaaacactgattttggagaaaagtGAACA
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TCTGTTGTCCTCATCGgcgtgttgttgttgttgtcgttgaTTCTCAGGTT
TCTTGTAGATTTTCCATTTCTGCGCGTCTCTTGTGATGGTTCGATCTGGT
CGTGATGCTGTGATTTGGTGTCCATTGATTGAGATGACTTCATATGGCGA
TGGGTCGAAGGGTGGTTTGGATTTGGTGCTCTTTTGTTTCAGGAGAACAG
TGTCACCAAGCTGGATGTTGTGATGCTTGACGTATGGCTTGTTGTCTTTG
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GATGTCTTTTCTGCTGGCTGTTTCATCTTGCTGTGGTAGACGTGAGTGGA
ATTTTCTGCCAAACAGGAGCTCTGCCGGTGCCTTTCCGGTTGTTGGGTGT
GGTGTGGCGCGGTACATCTGTAGAGTCTTGTTCAGCTCTGCTTTGGGATC
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TTTTCCATTGAAAGGTGGGCCGTTGTCCGTTTTCAACCGTTTGCAATAAC
CGTGTCTTGTGAATATGTCATCAAACGCCTGGATGTTGTGTTCTGATCCT
GTCCCTTTTACCACTGCTACTTCTGGATATCTTGACAGTTCGTCTATCAC
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GTTTCTGCCAAGGTTCCTCCGGTGGTGTGGAAGGTGTGTTGGGGTCGCGA
TGCTTCGTCTCTGTTGAGGCTTGGCATGCCAGGCATCTTTGCACCGCGTC
TTGTATGGCCTTGTCCATCAATGGGAACCACAATCTTGACCGCATGTATC
GTTTCATCATGGTTTCTCCTGGGTGTCCTTCGTGTGCTATGTCAATGAGA
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GATTTGACTCCCTCTCATGATGACGCCATTTTCGACCGATAGCTCTTTGT
AAATTCTGTTGTTGACTTCTGATCCAGATGGCGGCTCTGATCTGCCTTTT
GAGATGTCTTCTATGAGTTGTTGGTAGTGTGGATCACTTTGAGCAGCCTG
TCTGATGGTGTCGATGTCAATCGCCGGTGTTGTGTTGTTGAGGTTGATTT
TCCGTACTAGAATGGTTGTTCCAATATCGAAGCCTAGATCGTCTTGTTCC
ATTTCTGTGAGGTGGGATATCGGGTTCGGGTGTCTGCTGCCATAGTCGCA
TGGCATTTCTTTCCCCTTCAGGTAGCGGAGATTGAATTGGAGATCTTGAA
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TTGTAGATTGGAATGAGAGGTTCATGGTCTGTCCATGCTGTGAATTGACT
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TTTCTCTTTCAATTGGGCTGTATCGTTGTTCAACATCGGTTAGAGCTCTG
CTGTTGTGGTCTATCGGAACCCACATACCTTCTCCCCTCTCCTGGTAGAT
GCTTGCCTGGATTCCTACCTCTGATGAGTCCGACACCACGTGAGTCTTTT
CATTGGGATCGTACGCTTGTAGAGTCGCTGGATCGTCTAGGATTTGCATC
AGCGTCTGGTATGCAGTTTCCTCTTCTTCCTGCCAGCGGAATTTCTCCCC
CTTCTTCAACAATTTGCGAAGCGGTGCGGTAGTGTCTTCATATGTTGTGT
GTAGTTTGTTGTCGAATGTGAACTTCGCATTGTACTGGCAAGCCATCAAC
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ATTGTGCCATTCTCTTTACAACGATCCAGGAATGCTGCGAGGTTTCTGTA
ATGTTCCTTGTAGTCTCTTCCGTAGACTAGGATGTTGTCATGCAATGTGG
TGACGCCTTGGAGGCCAGCAAATGCTTTCCGTATCTCGTTGTGGAAGACG
CCGCTTGAGGCTGTGGGTCCAAAATACAGCCTCTCCATTCTGTGAAGGCC
CTCGTGTGTTTGAAAGATGCTCTTGTCTTTGGATTCTTTGTCTAGCTGAA
GTTGATGGTAACCCCAGCCCATGTCCATTTCACTGAAAATCTTCGCTTCC
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CTTCATCCCCGCATTGCGTGGTGTGTTGTCTATGTTCATCCTGATTTGAC
CATTGCTTTTATCTGTTATCACCACGTTCATCACGCAGTCATAGCTTTCT
CGTGGGTCCACATCCGTTATCACTCCCTGTGTTCTCAGAAATTCAAGGAG
TTTGCTGACTTCGCCTTGATAGTGGATTGGAACGTTGCGAAATGGTGGTT
GCTTTGGCTCGAATTCTTCTTCATAGTTGAGGTGGATGGGCTTCGTTCTG
ATGCATCCAATTTTGTTGTCGTCGAAGACTAGACCTCGGTATCCGTCGAC
AAGTTTCAGTATCTTTTCGATCTCTGTTGGGTCTGCTTCGTTGCTGTCTG
GACGTGTTTCGACTTGTATCCCAAGGTTGTCTCTGATGAGTTGGGGAATC
CTCTTGATTGCACTTGTGTCTTGTGTTCGGGGGCTCTTTCCTTCCTTGTT
GAAGGTGATGAATCCTAGGTGTTCTGCGTCGTTGTCTCCGAGTAGCGGTT
CTGGTTGAAAACCGTCCACAACATATACTTTGCTATTGATCTTGCTTCCT
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TGAAGATCCCCATGCCCTGAGTATGATGTCCGGCTCTTCCAGGGGTCCCA
TGGTGTTGCTATAGTGTTCAGGTGTGATGATGGTGTGCTGGCTACCTGTG
TCTGCGAAGAGGGTGTGTTTTGTGCCGCCTATCTTGACATCGACCCATTT
GTCTGCTGGCTTAGTCACCTTCTTTATGGCAGTGAGTGTAGTAGGTTCTT
GGTTCGAGTCATTTCGCTTCAATGTTGTAAAGTAATCTGCGTTGATTCTT
TTGACCGTCTTCTTTCCAGGACAAATAGGAGTTCTGGCAAAATGGTTCTT
CCCACCACATGTGAAGCATTCTTTGCCATTTGCTGGGCATCTCCCTGACT
GATGGCTGGAGTTGCATCGGTTGCAAGATCCTTTGTGTCTGTTGCTATAC
TTTCCTGCCTTTTTGAGCTTCATTACTTTCAGGGATTCAATCATCTCGTC
TATCTCCTCTTGTGTCATACTATCTTGATTCATTTCGTGTCGAACACGTT
TGACATGTGTTGTCTTGTCCAGGCTGTGGGCGTCGTCTCGGCCTGCTTCT
CGTGCTTGGCCCCATCTTGAAAGTTTCTCTAGGTTTGGATCCTCCGCAAG
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TTATAGCTTCCTCTGTGGTGTAAGGTTTCTTGTCAAAGTTCAGGGACTTG
GCCTTCTTTTCGAGATCTAGAAGGAAGTCACCCCACGTTCGTGTTCCTTG
TTTGGTCCCCAGAAGCTGGTGCATGGCCATTGTTCGATTGACCATACGTC
TCAGATAGTAACGTAGCCGTTCAATAGTCTGCATGTAGGTGGGTGCAGCT
TCTGGGTTTGCTTCTGCACCTTCCCCATTTGCTTGTGCACCTTCTTCGTT
TGCTCGGGCTCCTGTGTTGAGGTGTGATCTCTCTGCACGAATCAACTCAA
CCATCTCTGGTCCTCCCCAAGTTTTCAGGAGGATGATCTTTTCTTTGTCT
TCTGTTACACCAATGTAGTCCATCCTGTTTTCTGCATCATCGAGCCATTC
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GTATCGGCCCAAGTGCGGATGGATCATTCTTTGGTGGTGCTGCAGCTGCC
GCAGCCGGAGCTGCTTGCTGTAGCTGACCGCCAGTGATAGCTGCCATAAG
TGTCTGGAATTGTTCAGGACTGAAATTCATCTTGAACTGCGTTGTTCGTA
TTAGACAGGAAAAGGAAAGGTCTTACCTACAACGACCAGGGCACACCTGG
TGTGATGAAAGTTTCAGTAAGACTATGACGtgtctttcttcttttccttg
atCACGTGTCTTGTGAAGTCGTCTCCTGTGCTATGTTGGCAGCGTCTTGA
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ACGTCCAAGTCTTTCTTCTGGATCAAGTCTGTCAGTGTGTTGTGTCTGTG
TCCAGTTTCAGCTAGTGGTCTTGTGTGTATCACTATATGTATCTTGTTTC
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TGTccccaaagtcccacctaaagaaattaactcccaccttaacttgtttc
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AAAAAAGGCTAAGACCAAAGCAACCAGACGACATTCACCTTATTCCCGAT
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aatttcccgcaaaagtacAATTTCCATTTCTTGGAAATTCATCCaatctt
gttttttaaatttctcaaacTTAGGGCCCCctacaatattttttcattag
GGGTCCCCTAAATtctaggggtcacctaaattctCAGGGGCCACCTAGCA
CCTGCTTATAAGCGATGGAAACCAATTCCTGCCTAGAATCTTACTCACAA
TAAATTGACACATACGTTTGTTTCGTTGAAAGGCATTGTCTTGTGGTTCC
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TTTCTAATAACTAGTTGATTTATCACTTATTATGGGCTATTCTCCTAATA
GCCGTGCAATTGTCACTTGTCTATCTGTCTGTCTTACTCTTGGCACATAG
CCGGCAAAGCGTCTGTGTCTTGGCATATATCAACCGCCAAGTTTTTGAGC
TGATAATAACGTGGTCGATATTCCTAAGATGTTACGCAATGTTCGATACT
GTAAAGGCGGGTAAAGGGAACAGTGAGTGGTTCCTTCCGGAATGGAGAGT
TCTCTTATAAtcgacttgaaaaatatttatacaaaaatcttttaattccT
ATGGATGAGGACTGATCTTTTGTGATTGTCCTGATGCATAACTCTTGCCC
TAAAGAGCAAAACAAGGTGTTCTCTGAGGAGCCAACGTAGAGAACGTGCA
AGGCAAAACTGCTGCACCAAACAGAAGTTCCATCCaagttagactggagt
cgtttataatgcgtataatactaataataccaatactaataataataata
cgggatttagtttgtataaactaaaatcgttccattcattactttttgct
ttatttctactatgtataaattagtcgtctagcttgctagactacatcCG
AGTATAAATATGACAATTTTTATAactaacaaaaatataaaacttcttct
tttgaTGGTCTTGGCCCTTGTTTTATTGTATTGATGACATGTTCTTTTAC
TGCTTTCCGTATCTCGTAAGTCATCCTTTGTCGCATATTGTCGTAAACAA
AAAAGAGATAAAATCAAATATAATTAAAATGGTTGCAAATATTTGCTAAG
TATGCTAACAAGAGTCAAAAGACCGAGTGATCTGCACACGGCTTGTCAGT
CCTTTTGAATAGTCCCAGACTCAATGCTTATGCATACGTGAAAAATATGT
TTGCATAGGAACGGAAGGAAAACAATTCCAAACATCTTCGAACGTCGGAA
ATTTAAGTGATGTTGATAATTGTGGATAAATCTTCAAATGTAActcaggc
caggggggggggttcaggcaGTTGATCCAGAACACTATGCCTGTTTTAAC
CGTGGtggtccattttcaaatttctataaggcgagaccaatttgattggt
tgttttacgggcccgaccgaccctgaaattccaaacgtcgaaataagaat
aaaattgattttggtagtacatttttattttcatagctttatagactgcc
aatttttcaaaattttagtagtttttctaggggggggtttcagggggtac
ccgattccgtaattccgccaattttttctccaatttccgtcacacAGTct
ttaaattgaaccaaaattccgtcaccgaaaattcctttgaaattcaatat
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cgccaaattccgccactccgtccgaaaaaagggccgattccgctcctccg
ccaaccatgaaacccccccccctttctaaggttttgagaattttatgttt
aatttttcattttatccgtgaattcgactttttgtgtctttttagtttct
atttcgtatttttgtctgctgcctttttaggaaattttatgggtgaaatt
ctacttttggaTCATCTATTCCagttttaaaaattcttgaGGGCCTTTTT
CATTAGCAGATATATAGGCTGGTGGCCAATTTCTTTTGTTCTCGGGATAA
GAGTTTTCAAAACTATAAACTCTTCTTTATTTAGAAATCGTATTTTCAAT
ACTTTGGGAGCACTCAGGGATTCTAGAATTCCAGTCTTCGACCAGCACTA
ACCTAGCACAGCCTAGCACTGCTATTTTTGGACATTTGTTTGAAAGAGCT
CTATTTCTTGATAAATGTCATCGTGAGTGACTGTTTTGATTTTGGGTCAC
TTTGATATTACTGCATGCAGAAAACTCAGTTTGAAGACTGTTGGAGCGCT
TAAGGATTGCCTATTCCATTTATTCCTACATTTACAAGGTTTGAAAATGG
AACGTCTAATCCTGTAAAGCTTGtgattttgaacaataaaaTGCAAGAAT
ACGAGAGAGTTGTTAATAATGAGTCGCTCAGCAATATCTTAGTTCTGAAA
AAGAGCtttttaggataaagaaaatacttattttttcattttcctcaaac
tttgaaagttttttatttggaaTTAGGGACAATATAATATCCTTGGAGAT
GATTGCCAGAGTCTCGTAATAGATAGAAAcagaaaatctttatttttgga
ATATGTGATCCATCACTGCTCgaatagaaaaaaatacatgTATACAATCc
gattttgcatctttgtggaACTTTTTATCCAATAATGCTGATTTTTCTTT
CCGTCAGaccaaaaaaactgtttttgacgaaaattaAGTGTCAGGTTttc
gccaaaagtgtaaaaaatacCGACATAACACAACTTTGTAGTTTTAAAca
gacatttttttcaaaaatcaaaaatcagtCCATGCTAAGCAGAGTAAACA
GTATCTGCTTCAACATTATAAAATGGTTTAACTGACTTTTTCTAGGCCAA
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AAGACAATGGTGTCAGGTATGGTTAAACTCCTTTCTTATTATAAAATGTT
TAAGCAGGTAGACAGGTTTTTGTGAGGAGGAGTGGACTGAGTTCCATTCT
CATATTggtatttcagttaattttctgAACACACCTTAAGCCGCATTTTT
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TGGATTCCTTTATAACATTCTCATGGTTATAAGTGGTATGAGTTTTATTT
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AATATATTTC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000001_pilon:2562799..2582508+ >MSTRG.132.1.p1 ID=MSTRG.132.1.p1|Name=MSTRG.132.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1488bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001_pilon:2562799..2582508+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ACGTACAGGCTTGCGTTATCGGTTCCTCTTTATCGTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000001_pilon | genome | sc0000001_pilon:2562799..2582508 + |
|
