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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000103_pilon:790192..798206- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13196.4.p1 ID=MSTRG.13196.4.p1|Name=MSTRG.13196.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8015bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000103_pilon:790192..798206- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTAATTGCATTCAAATGACACATACCCTTAAGGTATTTTTTGTTCAAGGC
AACGGGACTCTCAACGGGATTTTCAACCGTTATTAAATCTAATTTTGAGG
TATATCTACCTGCTTGGTGTTACTTTAATGAATTTAAATGGCAATCAAAC
TAAACCAAACTTACAATCCCTTTCGTTCATTCACTCCAATAAAACAAAAC
GAGAATTGTTCCCGTTATATTTTTCCTGTCCTACACATTCCTAAGTTTCG
AAATAAGATTTCGAAATAAGAGTTTTTTTATTGTTAGTACTTTTTAGTCG
ATTTCAAACTTCACACCCCTGTATCACTGCTATTCCCAAGTTTAGTTGGA
TATGGCGTTGCTCGCCCTTTCATACCACCTTTTTTTAGCACAGCTATAAA
AACGACGATCGCTAATTGACATTATAAGGGCTTGAAGTCGGGAGATTTTG
CATTAAAGGGTGGGTTTTATAGTTTTCCACAATGGCATACTATAATCATG
TCAGATGATGTTTAAGACCAAATTTTTAATTTAAGCCGAAAAATTTGAGT
GAAGTTTTGTGTCAAATGACATGGTATTAAATTCAACAGCGCAATACAGT
GAAATAAACGGAGTGTGGATTAACCGTTGGAAGTTTTTTTTCTCTTGTAT
GAAAATTATTTTTGGGAGGATTAGCAGAATACTATGGACTGATACCCAGT
CTCTTTCTTCCGTTCGATGATAAAGTTAATTCATTAGGATGGATCGCATT
TAATTAGCTTTTATTTTTGTCATATTTTTTATAATGCTACCATGACTCTC
CATTTCAACAGCATTAAGACTAAAGTAATTGGTTAAAATACAAAAAATAG
GAGAATTTAATTCGTTAACAATCGAGTATCACACACAACACAACATTTGC
AATAAAAACATGGAAAAAATAGATTTTTTTAATCTATTCTTTTGAAAATA
TCATGCATTTTTTGTCAGCGCTAAATTAAGATGAAAATGTAAAGATAAGA
AAAAAAGAGCATTTTTTAACAAAAGGACTGAAAATAGCCGCGATTTGTAA
GTAAGAAGGGAAGGGAAATCGTCAAATTATATGAACGGTATTAAAGAGGG
TTTAAAAACTTGCTAATCAGTTCTTTTAAGAAATTCTTTTCTCATTATTG
CCAACCACTCTTTTTAGCGCACAAAAGTTCTTATTGTCATTCGGGTAACT
TAACTGGTCTGTTTTTCTATTAAAAAAACATTTTTTTAATATTCTTTTTT
TTTTGCGTTTTATTGTCAAATTGAGAAAATCGGACCGGGGGATTTGAGCC
TTTTTTGATTTCATTTCATTTGACGATGAGGTTATTTTTGACTTTTAAGT
GAAGTAATGAATTCGTTTAATTCATTGATGGTAGTGATGTGAAGTGGAGG
TCAAAAAGCAAAAATGTTTTGAGACAGACTTTATGTTTATCGGTTAGTAG
TTTGCGATGTTCTTCACTGATATGTTTTTTCCTTATCTGTGCTGGAAGGA
GAGCAAAGTGCATTTAAAGGACGAAGTGAAACTTTAAGATTGATAGATAC
GTTAGTCAAAGTCTTGAATTTGAAAAAAGAGTACTTAAAAACGCAAAGCC
AACTTTTATTAGAATTCACGGTTTTTTTCATTGTAATGTAGAAAAAAATC
CTAGACATAGTTATCAACAAGGATTTTTTTTCTGCGCTTTGGAATTTAAG
AACGTGTTAACATTTTCTCTTTCGTAAACTTGAGTCGTATTCGCGTTTTG
TTTTTAAGTTTCTTATTTATTTTTTAGCGAAATGAAAGGAAAATTCATAA
GATGTATGACATTTGGTTAAAAAGTCGTGAAATAAAAATAAAAAGAAGGA
ATAAGGATAAAAAAAAGTGGTTTTGGAAATAAAAGTGAGGTTGGAAAAAG
GATTTTTTGCTTAAATAAAGTGTTTTTTACCGTATTTTAGTTATGTTGAA
GGAAAGAAATTAAAGTTAAGAGCTAAAATCGCTTAATAACCTGGATTAAA
TAGCTTTCCTTTGAAGATGTCCCTTTCGCCTGTGATGAAATCAAATGAAA
AATTTTTAAGTCTCAAAATTTTTTCGTTCTTCATACTTAATTTCGTAGAT
TTTTTTCTTTCGCCGTGTTTTTTTTGTACGCTTGAAAAAGTTTTTTTTTT
TTTTATGAAAAAAATATTCTCGATATTTTTATCATATGTAAGGGAATTTT
TAACAAGTTTTTAAAGAAAGTCTATTGTAAGATAAAGTAAAAACTGAGTG
AACAATTTTAGTTTTTGAATCATCACCATCGTAATTTTATTGAATTTTGA
GAATTTATTATTTTTATGTTTAGCTTAAATCTCTCTAACTTTTTAATAAA
CACCGTTTTTTATGTGGTGTTATAGATAAGTATACTTTAAAATCGACTTT
TGAAAAAAAGTAGAATTAGTCGCGATGACAATAAAAAATGCAAAATTCAT
CTAAAAGGCCTTGATTTTGAAATACCGCTATTTTCACAAGTACAAAAAAG
GAAAGAAAATCATTCTAAATAAATCAAAATCTTTTTTTGAAATAAACTTT
TATTACCTTTATAATTAAGGTTTAAACGTCATTTTTGTACAGCATATTCT
GAAAAGAAATGACCTTTGGTATAGTAGGTTGATTAAGTTTTTNTGCAATC
AGCAAAATCATCAGTTAAATATTTTCCACCGAATTTTTTTATTTTATTTT
TTTATTAGTACTTGTTAATTGATTTAAAACTCTACACCCCTGTATCACTG
ATATCTCCAAGTTCAGTTAGATATGGCGTTGCTTGCCCTTTAATCGCCAC
AACACTTATTTCCCATTCAGAACACGTGACTCGTGCGTTTTTCAAATAAA
GGAGCTTCTGTTCTGCGGTTGCAAACTTCGTTTTACTTGGAAATTTAAAA
TAAATTCCCGAATAAAATAAATTCACCTCAAAAAGAGGCAAATTATTGTT
CATTTTAAGATGTTTTAACGGTTTAACGAGTTCTTTACGGTCTTTTTAAA
CCCGACGAATGTAAAATTTCATGGAGTTTTTTGTTGTTGTTCATTAAAAA
GGTGAATGGTTGAATCAATAAAGGTCTTTATGTGGAATAAAAAGGTCTCA
AGGTGTAAAGTAAAAAAGAAGTATTTTACGAAATTTTTACTGTTTTGCAA
ATTCACTTTGGAAGGTAAAATTCATGCTTCCAGTGCAAATGGCACACGCA
CTAAGTTTTGGTACCGTTGTTGTAGTAAAGTTTTTGTTTGATAGTTTTTT
TGTGATGATATCTTTTAACAGACAGACCCTCTTTTTCATTTTGTATTTTC
AATAATATTTCTATTTCAAAAATTTGCGATTTTTTGGTTTAATTTTGAAA
TAGTTTCTCGGTTTAATACTTTGTTTCAATCTTCCTCGAAAATATTTTAA
TATATGTTTTCCTTTTCCTTTCTAATGAAACTCTCTTTTTTTTACGTGTA
ATAATTTCCCTTGTTTTTGTTTTTGTATATTTTTTCAGTCTTTTCGCCCA
GCTGGAAGCCTTAATACTGGACAAGTATTTTTCTCGTTTTTTGGTCTAAA
TTTTCTTTCTTTTATATCCTTTATATCATAAAAATGCGGAATAAAATTTA
AACGATCTACTTGTAGTATTTTTTTTGCCAATCACTGTTGAGTTTAGAGT
AGCCCCTTCATCAAATTTTAATGAGTCTATGAAAAATTCGCGTTTTTAGT
ACGGTTTGCATAGTTCCGTTAAAAAAGCTCGCTCTGTATAAAAAGGATGA
GGAAGTAAAATAAAAATATTATAAAAGAAACATTTAAAAGTAGATTTTAG
TTCGAGGGAAGGCTTTATTATCTAGAAAAAAACGCAAAGAGATTTTTTGG
TCGTATTTTGTACTTCAAAGGTAAAGAGAATTTAAATTTAAATTTCTTCT
TTTATTGTCTATGTTCACTAACGATTTTTTTGCGTTTACTAAAAAGTTGA
CTTGGGTATAAATTATTGATCACCAAATCTTTAAGTATTCGCTTGTTTTT
TTTGTCAACCTTAGATCTCAATTTTTCAAGTATCTTCTCTCGAGCAAGCT
TGACTTAAGTTAGAAATTTTACTGTCAGGCAAAAAGCTTATTTTATGGAA
TTTGTCATATAAAAGAGAAAAATTTTGCGGTCATCTCAAATTTAACTTGA
CGAAAGTTTTGTGATAGAAAAAAAGTGATTTCTTTTTTTAAATTAGATTT
AAAACCCCTTCTGGTTTTCAGTTTAAAGGTAAATTGATATCGACAATAAG
TTTATGCACCAAGATACCGAATTTCAACAGTGTGTAGGCTATTGAAAGAA
TTTTTAATGCAGGCTATTGTGAGGTCAGGCTACATATTAATGATATGTTT
GGCTTTGGTTTAATTTTGAAAGGAGGCAACCATTGAGTTTATTGGTTAAT
TATCGCTTAATTTGCCGTTACAGTCGCACAATATATTTTCAATTGTTCTT
TAGAAATTTTACGGTTATAAACAAGGTATTTCGATGTTTAAATTTGAATT
GGTTTTTCTCAAGCTCCGAGATGTGACAACGTTAGAACGGAGTAATACGA
ACAAAGTCTCTGAGATATGAAAAACTATATTTTCGCGGTTTTGAATAGAA
TTACAGTTTTCTATAGAGCAAGTTAAGTCAATTGATACTTTTTATGAATT
CAGATTTTAGTTGAATTGAATGTAGTTCATATTTCAGCATATTGTATTCT
CGTTTCGCGAAAATAATATCCTCTAAAAAGCCACAGAGATTTTAACTGTA
ATGGAATTTAACTATCTTTTGTTGAAAAAGCGTAAAAAAACGCGAATATA
ATAAAGTCTTTGTTATAAAGATTCTTTGTCTTTATGCTAAAACAATCCAA
TAACGATTTGTTAACTTTTTTGTACTATTACAGAAAAAGAAAGAAATTGT
CGAAAAATTTCGTGGTTTTTTTTTGTTATGATGAAGGAGCGTTAGCAGTA
ATCTGCTGTGGAAACTTCTTTTTTCAATCTTTGCTAATTTGTTAAAAATT
GAACGTAAAAGAGGGAATGAACAAAGAATTGTTATTTTTTTCGCTGTATT
TTATTTTTTTGATATTATCACTTATCTGGTTTTCACAAAACTAAAAAGAA
ATGGGGTCGCTAAAATAAGTTGAACTAAACTCGAACACAAGAAATGAATT
TTTATTTAGTTTTTTACGTTTATCTTCAAGTAAAAACCACAATCGCAAAA
TAAGAGAAATTTTCTCGATTAGAAAAAAAAACTGATGGTTGTTGGTCCTC
TTGATTCTGATTATATTTGAGGATGGGAAATAAGTTTTTCTAAAAGACCA
AAAAAGAGGGAGTTTTTACTAAAATTATTTCGCTAATTTCCTTTTGGTTT
ATAGGGTTGATTAGATCGTTTAATGAAGTGGGATGTGATTAAAATGGTCT
TGAAATGACCGTCATGACGGTTTTATTCAATTTTATGTGTGGCCTTGGTT
GAGGGTGACACTTTCTTCAGATATTCATGCCTGCTGCCAAAAGATGTGGA
GATTTTGAACGCAATTCTACTTTTCTGACGTAATTCTCTTTTTTTCTCGT
TCACAGCAAAAGAAAACAACAAATTACGACAATAACACAACACGCACCAA
CTTATGACAACAAAGCACAATGTCGGCAGCAACCATTGCATTAAGTGCAT
TACCATCCATGTTGAATGGTGATTTATCGACTCCGTCACCACCACAAATC
GCCGTCATTGACGATCATTACATTGATTCTGACGAAGTTGAAGAGAACCA
ATCAACGAATCATATCGACAACATTGAAGACGCAGACCAAACGTCACGTG
ATTCTCCATCTCTGGTCGAGCGACCTTCCATGTTATCCGATCGACCTTCG
ATGCTATCGAAACCGACATTTGTAGCACGACCAAGCATGTTAGGAGAAGG
AGCAGAAGATTTATCCCGTGATATGGACGATGATGACTCCAGTTCACATG
ATGGAACCTCAAACAACAACACCGTTAAAATCCCACACAAACGTGGCAAA
CGAAAGAAATATCAAAAGTACACGCCTGAAGACCGAATAGCTATCGGCAA
ATACTGTTTTGAGCACGGACCAGCTGCTGCACGTAAAGCCTTTCAAGGTC
GCTACCCAGAGATGAGTGAAAGTGTGACAAGAGGTTTTCGTGATAAATAC
AAGCAGATGATCGGGGAATCAGCTGTCTATGAGTTCGAGCAAAGGAGACA
GAAAGAACTACAGAACAGTTACACAGCTCCTCCTCGTGGTCGCCCACGCA
AGTACAAAGTCACCGATGAAACCAATAAACCATACAATGGACAGATATCA
CCTCCGCTCAATACACAAGTTGTAAAGGACGAATATGCACGGTATCATCA
ACGAAATGGCGAACGCCCGGCATTCCCATTAGAAAGCACCCACAGACGCC
CGGCCTTTCATGAAATTGAAAAGGATCACCCACGATTCATGAAGATGACA
TTAGAAGATCAATTAAGAATCGGTCGATATTGCTCGCATCATGGCGTCAT
GAAAGCATTGCAAGAGTTCCATAAAGAATACCCTGGGATCAGCGAATCGA
TCATTTTCGATTTCCACAAACAATATCAACGCCACAAACAGGAGCAAGAC
CTTCAACAGAGACGCGCAGGATATCGATCACCACCCAACACGCATGTGCA
TGATTATCCTACGCAACCACAAGTGTTTGTCTTAGAAGGTGATCAAATGA
CAGGACCAGGTTCGACAGGTTCCGCCAAAACGAATGGCATGGTTTCACCA
CGTGGCGATGAAGAGCGAACATCTAATCACAGTTCGCCTTCTGTTTCACC
AAAACAACATCATCCACCAGAAGAAAGAAGACTTTCTCCTCCTTATGCAC
GTTCACCACGAAGTGAAAGTGAGTCTCCACCTTACAGACCATTCGAACAT
CCACCTCATCAAAAAGAAGAAGGTGTTGAACGTCATCGCTCACGCTCGCC
ACCCGTGCCCCGCCATCGATCTCGATCTCCGCCTCACAATAGATCACCAT
CAATGCGCTCTTCTCCGAGCATTCCACATAACGCAAATTCCGCCATTACA
TCACATCCATCCGTAATTGCACCACCTATCATACACTATCCAAGACCGCG
GCCACACTCACCTAGACATCATTCACCACCGCCGACTTTCAACGGTCACC
TCCATCGCTCGATTAGCGAAAACGCCCGACTCCGTGAATATGACGTAATA
CCACCACGCATAAATGGTTACGCGGCTGTAGAGTATCCTTATGATCGCAA
AGATTTGATTGGGAAACCGATTGGCAGTATAAACCCACAAAGTGGGCGAA
GCAAACGATTCAAATACCAAAAATATACACCCGAAGATCGGTATAATATC
GGGAAACTTTGCAACGATATCGGATTAGGTGCTACAGTGAAAGTATACAG
AGAACAATTTCCACGCTTGAACGAAAGCGTTGTACGCACGTTTCGTAATA
AATATAGAGAACTTTTAGAGAAGGGAGGAGGTATCCCAGCTACCGAGACC
ATCGAGCGCAAGCCAAGCCGTCGATCAATATCAACTTTAATTGAAGGTGA
AGTTGTCTCACAACTTAAACAATTTCATTCTTCACAAATTGAACTAAGTG
AGAATTTTGTGATTGCTGTTGCAGAAAATATCATGGCAACCAAACACCAT
AAAGAGGCTGAAAACATTAAAGGAATTATTACTAAAGAATGGGCAAACTC
GTTGCTGTGGAAACATAAATTGTTAGACAAACCATCTGGTAATGTACAAG
GGGTATGTTGTGAACGATGCAAAACTATTTTGGTATGTCCGAAATGTCCA
AATTAAAACTTTAACTGTCCAAAATATAAAATTTAGTTTTAGTTTCTCAT
AGTTATATGATAAATAGATGTTTTTTTTATTTTTATAGAGTTTTATTCTA
TATTAGCAATTTTTCAACTCAAAAGAATTGAAACTTTGCGACAGGGATAG
ATCAACTAGGTTTGAATTGAACTTTTTAGTGTTTGGTAAATACCGTTCCA
TAAAGAAGTATTTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000103_pilon:790192..798206- >MSTRG.13196.4.p1 ID=MSTRG.13196.4.p1|Name=MSTRG.13196.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2187bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000103_pilon:790192..798206- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCGGCAGCAACCATTGCATTAAGTGCATTACCATCCATGTTGAATGG
TGATTTATCGACTCCGTCACCACCACAAATCGCCGTCATTGACGATCATT
ACATTGATTCTGACGAAGTTGAAGAGAACCAATCAACGAATCATATCGAC
AACATTGAAGACGCAGACCAAACGTCACGTGATTCTCCATCTCTGGTCGA
GCGACCTTCCATGTTATCCGATCGACCTTCGATGCTATCGAAACCGACAT
TTGTAGCACGACCAAGCATGTTAGGAGAAGGAGCAGAAGATTTATCCCGT
GATATGGACGATGATGACTCCAGTTCACATGATGGAACCTCAAACAACAA
CACCGTTAAAATCCCACACAAACGTGGCAAACGAAAGAAATATCAAAAGT
ACACGCCTGAAGACCGAATAGCTATCGGCAAATACTGTTTTGAGCACGGA
CCAGCTGCTGCACGTAAAGCCTTTCAAGGTCGCTACCCAGAGATGAGTGA
AAGTGTGACAAGAGGTTTTCGTGATAAATACAAGCAGATGATCGGGGAAT
CAGCTGTCTATGAGTTCGAGCAAAGGAGACAGAAAGAACTACAGAACAGT
TACACAGCTCCTCCTCGTGGTCGCCCACGCAAGTACAAAGTCACCGATGA
AACCAATAAACCATACAATGGACAGATATCACCTCCGCTCAATACACAAG
TTGTAAAGGACGAATATGCACGGTATCATCAACGAAATGGCGAACGCCCG
GCATTCCCATTAGAAAGCACCCACAGACGCCCGGCCTTTCATGAAATTGA
AAAGGATCACCCACGATTCATGAAGATGACATTAGAAGATCAATTAAGAA
TCGGTCGATATTGCTCGCATCATGGCGTCATGAAAGCATTGCAAGAGTTC
CATAAAGAATACCCTGGGATCAGCGAATCGATCATTTTCGATTTCCACAA
ACAATATCAACGCCACAAACAGGAGCAAGACCTTCAACAGAGACGCGCAG
GATATCGATCACCACCCAACACGCATGTGCATGATTATCCTACGCAACCA
CAAGTGTTTGTCTTAGAAGGTGATCAAATGACAGGACCAGGTTCGACAGG
TTCCGCCAAAACGAATGGCATGGTTTCACCACGTGGCGATGAAGAGCGAA
CATCTAATCACAGTTCGCCTTCTGTTTCACCAAAACAACATCATCCACCA
GAAGAAAGAAGACTTTCTCCTCCTTATGCACGTTCACCACGAAGTGAAAG
TGAGTCTCCACCTTACAGACCATTCGAACATCCACCTCATCAAAAAGAAG
AAGGTGTTGAACGTCATCGCTCACGCTCGCCACCCGTGCCCCGCCATCGA
TCTCGATCTCCGCCTCACAATAGATCACCATCAATGCGCTCTTCTCCGAG
CATTCCACATAACGCAAATTCCGCCATTACATCACATCCATCCGTAATTG
CACCACCTATCATACACTATCCAAGACCGCGGCCACACTCACCTAGACAT
CATTCACCACCGCCGACTTTCAACGGTCACCTCCATCGCTCGATTAGCGA
AAACGCCCGACTCCGTGAATATGACGTAATACCACCACGCATAAATGGTT
ACGCGGCTGTAGAGTATCCTTATGATCGCAAAGATTTGATTGGGAAACCG
ATTGGCAGTATAAACCCACAAAGTGGGCGAAGCAAACGATTCAAATACCA
AAAATATACACCCGAAGATCGGTATAATATCGGGAAACTTTGCAACGATA
TCGGATTAGGTGCTACAGTGAAAGTATACAGAGAACAATTTCCACGCTTG
AACGAAAGCGTTGTACGCACGTTTCGTAATAAATATAGAGAACTTTTAGA
GAAGGGAGGAGGTATCCCAGCTACCGAGACCATCGAGCGCAAGCCAAGCC
GTCGATCAATATCAACTTTAATTGAAGGTGAAGTTGTCTCACAACTTAAA
CAATTTCATTCTTCACAAATTGAACTAAGTGAGAATTTTGTGATTGCTGT
TGCAGAAAATATCATGGCAACCAAACACCATAAAGAGGCTGAAAACATTA
AAGGAATTATTACTAAAGAATGGGCAAACTCGTTGCTGTGGAAACATAAA
TTGTTAGACAAACCATCTGGTAATGTACAAGGGGTATGTTGTGAACGATG
CAAAACTATTTTGGTATGTCCGAAATGTCCAAATTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000103_pilon | genome | sc0000103_pilon:790192..798206 - |
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