MSTRG.13190.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13190.1.p1
Unique NameMSTRG.13190.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000103_pilon:688566..702874-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13190.1.p1 ID=MSTRG.13190.1.p1|Name=MSTRG.13190.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14309bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000103_pilon:688566..702874- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CTTTTATTAAATAGACATAAAAGAGTACCTGCTTGTTCAATACGCAAAGT AATTTCACTCGTCGTGATATTTTTTTTCTATATTTTGTAGTTCATGTTGA AAGGTGTGTGATCAATCAGAATTGTGAAGCGACTAGATTTTGGAGAAAAT GTAAGTACTGTAGTCTTTTTCATTAACCTTTCAAAGCCGCTGTCTTTTTT TGAAAAAGGCCAAAAAGTTCATCATTTTTTTCTGGAAATTTATTCTTTCA AAGGCGATTTCTCGACCAGGACGAACGATTCAGATATCAACTTTGGTATC GTTGGAGAGCCCTTTCTCTCAGCTACAAAAAATAGCAGATTTTTTTTCTC TGAATCGCAAGTGGTCAGGAGTTATGACCAAAAGACTGTGTATCGGTAAA ATGGCCTTTTCAAAACGTATATATACGTATTCTGGCTTCTAAGGGTTAAG ATTCTCTACATTAACTCGGCCAGGGGATCAAGAAATACCTCTCTTTGTAG TTTTTAAAGAAGGTGAAACAACTTTTTAAATATTGTGACAACTATTTGAC GTAGCTTGAGATTTAAAATTCTTGATTGAAAATGGATTATGATAACCCCA ACAAACATGTTGATGTTCATGAAAAATCTTTTATAACCATAATACTTCTA AACCTTTGAAATGGTTCTTGCATTACTGTATAAGGTTAAACACAGAAGAA CTTAGTTTAGAGGATTTTGGAAGAAGTCTGTAATTAATCTTGATTAATTA ACAAATGATTACTTTATACTATAAAGCTATTAACATGTTTCTGACAACAC GTGTCTTGTTTGAAATTATTATTTCTATAATTTTCGTTACTTTAACCGTG ACGATAACAAAGCCAGCTGTATCATTAGTTTGAAAAAGTTGATTCAGGCT TTACCATTGAATAACAAAAATAATCTTCTTAAAAAACAAAACAGAAAATC 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GTTTTGTTACCTCTTAATGGATTGTATTTCATTTCAGAAGAAGAAAGCAA GAAATTGAACAATAACACACTATGGCATCATCAAATCGTTCCAGCATGTC ATCTATTACGAAATTGCATGAAGATGAAGATCTCGATCTTTTAGATCTTC TAGAAAAAAACGGTATCCTTCTACAATGTGAAGTCAACCCTCAAAATACG AGATTTTCCGACAAATCAACATCCTGTTCAACTCGATCGTCGTATGCAAC TATTTCACCGACTCCCGACGACAATTATTACGAGTGTTTTGATTATACGG ACGAAGAGAAAAAACGACCGGACTCGGATGAAGAATCAGTCGGAACAGAC GATGATTTGGTTACTATTCATCACGACGAACGAACGCGTGTTGAGAGAGA AGAAGTGAAGCAAAACATCTGCCACAATGTGAAAGCAAAAGAAAATGAAA ATGATTCAAACATACAACAAAGGTTTATTGAAACGAATGGAATAGAAGAG AGAAGAAGAAATTTATTCTGCTTTTGTTCAACAACGTGTCTCGTAAAATA CCTAGGTGTTTTGTTATTCTTAGTTGGTGTTCTCTACGCGTTCAGTATTT GGAGTTTTCTTCAACTGGCTCCTGCTTCGACCTTCAATTATGTTCAAGGA CCTCTTCCAATCTGTTTACCATGTACGACGGTAGGTAGTCTGTTTTTTCT TTATTCTTATGATTATTCTATTGTCTGTATTTTTATCGACTTGTACGCAT GCGTTGTTCTATTATAATATGATTTTCATATTACGAAAGTCATTCTATAT TATAACATTACTAGTCCCTTATATGAGTTGTCATTGAATTCAAGAACTTC CATCTTTAGGATTTTTCGTTTCTGAAGTCTCCATACACCCCAGACTTATT TAGCTGTACTGTATTCATTTCTCGTCAGTATTATCAGATAATCGTTTACT TTAAAAGAGGGTGTGTACCTAAGTTCGTTTTTTTCGTTAGATACTTTTTA AAAAAGTTCAAATTTGAGTTCGGAATTAGGAATAAGCATTTTTTGTTGAA CCCATTTTTTCGATCAACAAAATTAGAGGTGAAGTTTTCCTTTCCTATTT ATAGAAGGGTTTACACACAACAGCGGTTCAATCCTTATGCTTTTTGCTAC CTCTCTCGCTTCCAAGGGCTTCCGCCTTATAAAAAATTTCAACATTTCCA TAAGAAAAAGAAGTATGAAAAGCAGAAAATTTTATAAAACAAAAAAGAAA ATGATATCTACTAATTCTTTTTCGCACTGTTTTTTTACTTCATAAGTTTT AATTTCTTTTCTTCTTCAATCTTTTCTTCTTCTCCCTCTTTCTCTCTCTC TATGTTTATATGCTTCAGTTGATATTACCTTATGAACTTCTTTTCTTTTG TTCCGGTTAATTTGTTATGGTGACTCAGCACCCTGAGATGTAATAAGTGA CTCACTCTAAAAAATCTCTCCACATCATTATTACTGACTTTTTTCAAAGT CTTAAAAAAGATTCTTGGCCCAATTAATCAAAATTTATCTCTTCTCTTTC CTCTTCTTCTTCGATTACATAGATTTATTGATTTTCCAGAACTTCTCGTT TTGATAATTCACATTGGCATTGCTCATCCTATACATGCATCAATAAACAA AATATTAAGAACATTTTAAGAACATTTTGAGGCTTTGCGAACTCTAAAAC ACCCGATTTTTTTGGAAAATGAAAGAAAATACTCACAAAATGGAGAAAAT ATAAAAACAAAAAATATTTTTAGGCTTAAACTCAAAAAGTTAAAAACATC CGAAAGCTATTAAAATTTTGGATGCTCTTATAAAAAAGGGTGTACTGGGT CCATACATCACATCGTCGTACACATGACTAAAAATAAGTGTCTTAGAAAA 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ATATGGATTTTTTATCAATTTCTTTCTTCAGGTTTTGTTTGTTTTGGTGT TATCAGTAGCATGTACATTATTCTGTGGCTTCAGTCTTATCTATCTCATT GGTGTTATTCAAGATTCACTTCATCAGCTCAATGGATGCAGCTTTGACGA ACTTGATCGTATTTGCTCCTGTTATGGTCCTAATCACAAGATCTTCAAAT TTGCTGAAAACTTAGGTTGCAATGCTGTAAAAGACAAACTGAAGGAGCTA GCTTATGGTGTCAGCATCTTGTTTGGTGTCGGATGTTTAATCTCCCTGGC AACAGCGACGGCTGCCGGTTTTTTGTTATGTCGCGAACGACGTAATCGAA ATCACCGAGTGGTAAGTTTCTTTGTTGTTTAAGTTTTTTTATCCCTTCAT GACGTTCATGGTACCCAAGGTCAATTGTGGTGTGTACATAGTTTCGCAGT TGATGGAAATTTTTTCACATGAATTTAATTTTGCATTAGTAAAACAAGAA TTATTCAGTATTTGACCTAAAAATGCTGATTTTGTGTTTTCCAAAGTCAA GATAGATGACAAGTTGAAATCTCCTAAATGGGTTCTTACACGTCAAAATT CTATTGTTTTGCGGCTTAAAAAGTGCAAATTGAATATTTAGCTTTGGAAA AGAGTTAAACAGAAATATTTAGAGCCATAGAGGTTTTGTCCAGTTTCGTG GAAGGCATCTAGATGCACCAGATAAACCCTGATCGCTCCTTTAGAAGTCT TTTGCTTCATCTATACTGGTTAAAAGAATTACTTTGCGACCCGACATTGA CTAGGAGCTGTTTAGAATAAGAAAGTTTACTCCCTATTGCGCCTTCTCTT ATTAAATACTTGTGGATCCCTAAAAAAGTCTCTAGGTATCCCCGAAATGG AATCAGAATCCCCAAGATGTTGTATTTCTGAAAGAGAATTCTGAATTTAC CATAAACTCTTTCTAATTCGAAGTTCCATTTATTCTAATCATGCGAGTTG TTATCCTTTTGGATCCCTTAGCTTAGAATTAGAAATTGCTTACTAAAGAT TCACTCTTTAATTTTAACCCTACTCTATATCGAACACAACTTATTGTCTT GAAGAGGGAACTTGTAAGAAATTTTATCCTCCTCTTCTCTTACTATAGGA ATACACGAGATCAAGACTCGAGCGTGGATCGACAACCGTTCAAAATGAAT CAGCCGTCAAACACGACAATAAAACACGACACAAGAATGACGTTCACGAA GAAAATGACGACGACAATGATATCTCTGAAACACATAGACTAGCTGCTCA TCACCTCAGACAGGAGAGAACTGAGACTAGTCAACCAGCTAACACTTCTC AACGTACAAAACTTTATCACGCAAAGCGAGATTCTAAAAGGCATAAGAAT AGACACAGCCACAAAACACAACAACTACTTAAACAAAGGGATCCATCTAA AAATACAAAGATTACGTCAGTTGCTACCCAGACCCCTAATTACATGATAC CAGTCTCCTCTTTAATGTATGACGTCATCGATCCGAACACAGAGCATCAC CATGGGAACGAAAGTGAAGATACATACAGTGAACTTAGCATAGATGCCAC CCTCAGTCCGCCCTCTTATACAGAGGCGGTCAAGGTTCTTAAAAAAGATA AATATTGAAGATGGGATCGCTTTATGGACGAGAATGACGTAAACCAAAAT GTTTTAAACTAGATGCAACATTGGTCCAATTCATAAAAGAAAGTTTTGGG CCCAAAAGAAGGCGTTTATTTTTTCCTCTTTTTTGTACATAGACCTTTCA TGTATATAAAATGCCAGAGAGATTGTGAGACTGAGAGTGAAAGGAGGGGA GAGGGTCTTATAAATAAAAGCAAAAGAATATATTTAGTATTTTTACCGTA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000103_pilon:688566..702874-

>MSTRG.13190.1.p1 ID=MSTRG.13190.1.p1|Name=MSTRG.13190.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6108bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000103_pilon:688566..702874- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TCAACGTACAAAACTTTATCACGCAAAGCGAGATTCTAAAAGGCATAAGA
ATAGACACAGCCACAAAACACAACAACTACTTAAACAAAGGGATCCATCT
AAAAATACAAAGATTACGTCAGTTGCTACCCAGACCCCTAATTACATGAT
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ACCCTCAGTCCGCCCTCTTATACAGAGGCGGTCAAGGTTCTTAAAAAAGA
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AAAAAAACGGTATCCTTCTACAATGTGAAGTCAACCCTCAAAATACGAGA
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TTCACCGACTCCCGACGACAATTATTACGAGTGTTTTGATTATACGGACG
AAGAGAAAAAACGACCGGACTCGGATGAAGAATCAGTCGGAACAGACGAT
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AGTGAAGCAAAACATCTGCCACAATGTGAAAGCAAAAGAAAATGAAAATG
ATTCAAACATACAACAAAGGTTTATTGAAACGAATGGAATAGAAGAGAGA
AGAAGAAATTTATTCTGCTTTTGTTCAACAACGTGTCTCGTAAAATACCT
AGGTGTTTTGTTATTCTTAGTTGGTGTTCTCTACGCGTTCAGTATTTGGA
GTTTTCTTCAACTGGCTCCTGCTTCGACCTTCAATTATGTTCAAGGACCT
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GCGTGGATCGACAACCGTTCAAAATGAATCAGCCGTCAAACACGACAATA
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CAACTACTTAAACAAAGGGATCCATCTAAAAATACAAAGATTACGTCAGT
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ACGTCATCGATCCGAACACAGAGCATCACCATGGGAACGAAAGTGAAGAT
ACATACAGTGAACTTAGCATAGATGCCACCCTCAGTCCGCCCTCTTATAC
AGAGGCGGTCAAGGTTCTTAAAAAAGATAAATATTGAGTTTTGTTTGTTT
TGGTGTTATCAGTAGCATGTACATTATTCTGTGGCTTCAGTCTTATCTAT
CTCATTGGTGTTATTCAAGATTCACTTCATCAGCTCAATGGATGCAGCTT
TGACGAACTTGATCGTATTTGCTCCTGTTATGGTCCTAATCACAAGATCT
TCAAATTTGCTGAAAACTTAGGTTGCAATGCTGTAAAAGACAAACTGAAG
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GATCTTTTACATAAGCACCTACCCAATAGAAGATATATTTTACTTATGGC
ATCATCAAATCGTTCCAGCATGTCATCTATTACGAAATTGCATGAAGATG
AAGATCTCGATCTTTTAGATCTTCTAGAAAAAAACGGTATCCTTCTACAA
TGTGAAGTCAACCCTCAAAATACGAGATTTTCCGACAAATCAACATCCTG
TTCAACTCGATCGTCGTATGCAACTATTTCACCGACTCCCGACGACAATT
ATTACGAGTGTTTTGATTATACGGACGAAGAGAAAAAACGACCGGACTCG
GATGAAGAATCAGTCGGAACAGACGATGATTTGGTTACTATTCATCACGA
CGAACGAACGCGTGTTGAGAGAGAAGAAGTGAAGCAAAACATCTGCCACA
ATGTGAAAGCAAAAGAAAATGAAAATGATTCAAACATACAACAAAGGTTT
ATTGAAACGAATGGAATAGAAGAGAGAAGAAGAAATTTATTCTGCTTTTG
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GTGTTCTCTACGCGTTCAGTATTTGGAGTTTTCTTCAACTGGCTCCTGCT
TCGACCTTCAATTATGTTCAAGGACCTCTTCCAATCTGTTTACCATGTAC
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ATGAATCAGCCGTCAAACACGACAATAAAACACGACACAAGAATGACGTT
CACGAAGAAAATGACGACGACAATGATATCTCTGAAACACATAGACTAGC
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AAGAATAGACACAGCCACAAAACACAACAACTACTTAAACAAAGGGATCC
ATCTAAAAATACAAAGATTACGTCAGTTGCTACCCAGACCCCTAATTACA
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TGCCACCCTCAGTCCGCCCTCTTATACAGAGGCGGTCAAGGTTCTTAAAA
AAGATAAATATTGAGTTTTGTTTGTTTTGGTGTTATCAGTAGCATGTACA
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ACTTCATCAGCTCAATGGATGCAGCTTTGACGAACTTGATCGTATTTGCT
CCTGTTATGGTCCTAATCACAAGATCTTCAAATTTGCTGAAAACTTAGGT
TGCAATGCTGTAAAAGACAAACTGAAGGAGCTAGCTTATGGTGTCAGCAT
CTTGTTTGGTGTCGGATGTTTAATCTCCCTGGCAACAGCGACGGCTGCCG
GTTTTTTGTTATGTCGCGAACGACGTAATCGAAATCACCGAGTGATGATA
TTTACTGGTCTGATTGCCTTAGTAACAGATCTTTTACATAAGCACCTACC
CAATAGAAGATATATTTTACTTATGGCATCATCAAATCGTTCCAGCATGT
CATCTATTACGAAATTGCATGAAGATGAAGATCTCGATCTTTTAGATCTT
CTAGAAAAAAACGGTATCCTTCTACAATGTGAAGTCAACCCTCAAAATAC
GAGATTTTCCGACAAATCAACATCCTGTTCAACTCGATCGTCGTATGCAA
CTATTTCACCGACTCCCGACGACAATTATTACGAGTGTTTTGATTATACG
GACGAAGAGAAAAAACGACCGGACTCGGATGAAGAATCAGTCGGAACAGA
CGATGATTTGGTTACTATTCATCACGACGAACGAACGCGTGTTGAGAGAG
AAGAAGTGAAGCAAAACATCTGCCACAATGTGAAAGCAAAAGAAAATGAA
AATGATTCAAACATACAACAAAGGTTTATTGAAACGAATGGAATAGAAGA
GAGAAGAAGAAATTTATTCTGCTTTTGTTCAACAACGTGTCTCGTAAAAT
ACCTAGGTGTTTTGTTATTCTTAGTTGGTGTTCTCTACGCGTTCAGTATT
TGGAGTTTTCTTCAACTGGCTCCTGCTTCGACCTTCAATTATGTTCAAGG
ACCTCTTCCAATCTGTTTACCATGTACGACGGAATACACGAGATCAAGAC
TCGAGCGTGGATCGACAACCGTTCAAAATGAATCAGCCGTCAAACACGAC
AATAAAACACGACACAAGAATGACGTTCACGAAGAAAATGACGACGACAA
TGATATCTCTGAAACACATAGACTAGCTGCTCATCACCTCAGACAGGAGA
GAACTGAGACTAGTCAACCAGCTAACACTTCTCAACGTACAAAACTTTAT
CACGCAAAGCGAGATTCTAAAAGGCATAAGAATAGACACAGCCACAAAAC
ACAACAACTACTTAAACAAAGGGATCCATCTAAAAATACAAAGATTACGT
CAGTTGCTACCCAGACCCCTAATTACATGATACCAGTCTCCTCTTTAATG
TATGACGTCATCGATCCGAACACAGAGCATCACCATGGGAACGAAAGTGA
AGATACATACAGTGAACTTAGCATAGATGCCACCCTCAGTCCGCCCTCTT
ATACAGAGGCGGTCAAGGTTCTTAAAAAAGATAAATATTGAGTTTTGTTT
GTTTTGGTGTTATCAGTAGCATGTACATTATTCTGTGGCTTCAGTCTTAT
CTATCTCATTGGTGTTATTCAAGATTCACTTCATCAGCTCAATGGATGCA
GCTTTGACGAACTTGATCGTATTTGCTCCTGTTATGGTCCTAATCACAAG
ATCTTCAAATTTGCTGAAAACTTAGGTTGCAATGCTGTAAAAGACAAACT
GAAGGAGCTAGCTTATGGTGTCAGCATCTTGTTTGGTGTCGGATGTTTAA
TCTCCCTGGCAACAGCGACGGCTGCCGGTTTTTTGTTATGTCGCGAACGA
CGTAATCGAAATCACCGAGTGATGATATTTACTGGTCTGATTGCCTTAGT
AACAGATCTTTTACATAAGCACCTACCCAATAGAAGATATATTTTACTTA
TGGCATCATCAAATCGTTCCAGCATGTCATCTATTACGAAATTGCATGAA
GATGAAGATCTCGATCTTTTAGATCTTCTAGAAAAAAACGGTATCCTTCT
ACAATGTGAAGTCAACCCTCAAAATACGAGATTTTCCGACAAATCAACAT
CCTGTTCAACTCGATCGTCGTATGCAACTATTTCACCGACTCCCGACGAC
AATTATTACGAGTGTTTTGATTATACGGACGAAGAGAAAAAACGACCGGA
CTCGGATGAAGAATCAGTCGGAACAGACGATGATTTGGTTACTATTCATC
ACGACGAACGAACGCGTGTTGAGAGAGAAGAAGTGAAGCAAAACATCTGC
CACAATGTGAAAGCAAAAGAAAATGAAAATGATTCAAACATACAACAAAG
GTTTATTGAAACGAATGGAATAGAAGAGAGAAGAAGAAATTTATTCTGCT
TTTGTTCAACAACGTGTCTCGTAAAATACCTAGGTGTTTTGTTATTCTTA
GTTGGTGTTCTCTACGCGTTCAGTATTTGGAGTTTTCTTCAACTGGCTCC
TGCTTCGACCTTCAATTATGTTCAAGGACCTCTTCCAATCTGTTTACCAT
GTACGACG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13190MSTRG.13190Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13190.1.p1.exon10MSTRG.13190.1.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13190.1.p1.exon9MSTRG.13190.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13190.1.p1.exon8MSTRG.13190.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13190.1.p1.exon7MSTRG.13190.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13190.1.p1.exon6MSTRG.13190.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13190.1.p1.exon5MSTRG.13190.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13190.1.p1.exon4MSTRG.13190.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13190.1.p1.exon3MSTRG.13190.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13190.1.p1.exon2MSTRG.13190.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13190.1.p1.exon1MSTRG.13190.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13190.1.p1MSTRG.13190.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000103_pilongenomesc0000103_pilon:688566..702874 -