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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000103_pilon:530973..549770+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13182.1.p1 ID=MSTRG.13182.1.p1|Name=MSTRG.13182.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18798bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000103_pilon:530973..549770+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
tttcagagaaaaaaatataatagaaaaatcaaaatagacaaaaaaatgGA
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TATTGCGAGAGTTGGTCCTGTGAAGCTCTCACAAAGGGGAGATTGTGTAT
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GTACCTTACTTTTACtcatatttattgattttttttatttggtaaGAACA
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TTTTATTTGCTGCTTTAACTTATTGCACGATTTAactaaataaattgaaa
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TTCTCTTTTGTTccccctaaaaatgttcttttagcATTTAATGATGTTTT
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ATGATATGGTGAGAcaatctttttcaatcagttttTGTCCGAAAGAAAAT
TTCCCTCCCCCTTCAATGATCTATAGAAAATTACAGTCAACTATCCCTAA
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GTGTCCTTCAAATGACTGGTGCGGAAGATGTCCTCGCTTATTCACTTATC
CCACCCATCATTGGCAAGCTTCTCCTAGATGCTAATGATGGAAACCTGTC
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ACGTTTTACCTAATGAtttcaaaatcgatttttctGCTTTCCTGAGTAAT
GTCATGAATGTTTCATCAGCCTCTATCCAATACACTGAAACTCAAATGCG
AGGGCTTTACAATGTGGTTACCAATGCGACGCTTCTGGGTGTCAGCGGTG
CCGCTCCATCAGCCAATTGTTCTACAGATCCATCACAAGCTGATTGTCTA
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AGTTGTAGCTGACGGTAAAAACGTTACAGACGATGCCACTTTCCTGGCAT
TGTATGGAGCTATTGGTGCCTTGTTTTGTCCAAATACTACATACACTTGC
CTGGATACCGTATCAGATGTAAATATGATTGGTTACATTGTAGGCTACGT
GACTCAATATTTACCACAAATAGTTATTGAACTAGCTATTGATCATAAAA
ATTACGGGCTTTTAACACAGAGAACACACAAGGAGATTGCGTCGGGTTAC
TTTTTGACTGAACTAGTATTTCCAGGTTTTGAGAGGGGGATTCCGGTACC
CGGTTTTGTACCTAATGATGCGGACGTAGATGAAGCGCTAAAAACAAAAC
TCTACAATGAAGTGTACACATGTGGTGTTCCTTCTAAAACAGAGTTCACA
TGGGCAAGTAAGTAGATTTCAGTAGATAGTAGATTTTacctttttcaaat
ctttttagaTAATCTTGGGATTCAAAAGTTCAGTAATGTTCCAATAAAGC
TGAGAAAATAGTTTGGAAGCTAATGAACTACTAATGTTAAGGGTACACGA
TGGTCAATTGACTATCTGAACAAAATTTGTTATAGATCGTTATGCCTTAC
TTTTTGGTTAAAACGATTTGTatagattttcaaaatggcggcttACTCAA
CGACTATGacgtaattttcaaaaagtacaaTAAAACTTCAATGAGTAAAC
ATGCCAAATTGAATAACTTTCACATAACAAAAAATAGAGCTCCTTAAAGC
CCTCCCCCGTAGGTTTAAAACCATGCATCATTTTGTTGATTTATCGTTTC
GTTGAGTAATTATGCCTAtttacatttttggacctaccccggtggggtag
ggTCCTaaaaattaaccgatgtccgtccgttcgtctgttcgtccgttcgt
ccgttcgtccgtctgttaccagcttttctcaggattggctcattagtttt
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agacctctacgaAACTGCAGGTAGTATaaaaggagcacgaatccgttagt
ggatgcaagcagcctacttttgtttggaaaaagtgacgaatttttttgTC
ACAAGACGAAATTCTTACATCTTGTCAGAGAACTAAAACTCAGGTCATCG
AGAAGTCATGTGAAAATGTCAATGTGGGGAGTTTATTTGTTCTACAATAC
GTAGCGTTATTTGGAAGTCGCACATAAGGTCTACCTATAGCATTGGCTCT
ACAACTGCAATTTCTCCATAGCCTCGAGGAAATTTTCGTGCTTCATTTCG
AATGAAATAGATAACTTTCTCAATATCTTTTCCATTTTATCCCAATTCta
tcctaaaaattttcacattatATTTCTCATTCTATCCCAGCATTCAATAG
AACCGATCACTGGGTCAGCAATCGAAGTTGTCAACCGTTTACAACTCAAT
ACATATCTGACTCCGGCAATGTTGTCTTCACCACGCATGAAACCATACAA
CGTCAGTTATGTTGAACACAATACAACTGGTGTAACCAAACCTTTCCCAA
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ATGGATAAGGTAAGTGTTATATAACTTATGACAGATAGGTATGTGTAGCT
CAAATATCTAGAGGCTAGGCCTTTTTTCTTAATTCAAACGTAAATATTCC
ATCCCAATCGGAAATTATACCGATTCCGATTTTGAGGGATCTCAGGTGGG
ATGAGACGGAATTTTAAGGGGTCTAAAAACAAACGTTATCTAGAAGACAA
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TTGACACCAATAATTAGCTTCTTTTATGAAACAGTTTAGCACTTTACGAA
ATTTAAGTTTGGAATTCCTCGatttttaattaaattattCTCTTTTCCAC
AGCTATTAAGTGCAGTCAGAGCAAGTTGTATGGCTATTGTTATTGGTCCT
TTGATTGGAGTGATTATCTTCTTAATTGCTGGTTATTGCTATTGGAAACG
AGTAAAACGAGGCTCGTCTGTCGACGCAAGTGAGGTTGGCAAAAGTACGA
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GCATGACTTAACATTCATTCCCGGGATAAAACATTTTTGGCGCATTTCAA
GGATCCCTCCGCTGTTTTTTACGGGCATAccggcaaaaaaattttttg Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000103_pilon:530973..549770+ >MSTRG.13182.1.p1 ID=MSTRG.13182.1.p1|Name=MSTRG.13182.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3375bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000103_pilon:530973..549770+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgGAGATTAAAGAAGCCTGTTTATCCTACTCCATCGTCAGCCTGGTGTA
TCAAATCACTATCATTACCATTATGTATTTGTGTAACATCTCACCAATTA
GTTCGAAAAGTATTACAACTTTTCTCATGGTTTTTATACCCCTGTCAATG
ATAGGATGTTATGTTTTGATCAAGTTGCTTCACTCCAAAGTTTCAAGtat
caagaaaagaaaagacaGCTTTTCAGAGGTGATGTTGTTGGTATTTACAT
TGGCGTCGTTTCTTGCTGGTTCAGTCCTGTTTCACGTGGTATCGATACTA
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GTTGTGTTCTGCATTGACCGTTGTTCCATTGTTTATCACTCATGATGGAC
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ATGGGCAGGAGCTTTCCCAATCCCTTTGGACTGGGATCGAGATTGGCAGA
CTTGGCCGATAACTTGTTGTATTGGGGCGCTATCGGGACAAATAGTGGGA
TTatgtttttccattttgtcATGTGCGGGTATTATACCAAGTAGCCCGCC
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TGCTTCACTCCAAAGTTTCAAGtatcaagaaaagaaaagacaGCTTTTCA
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CCTGTTTCACGTGGTATCGATACTACTTGGAGCTCCTCTTATTGAAAATG
TAGAAGAAACGTTTTCACTTTCAATGTTGTGTTCTGCATTGACCGTTGTT
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TCCTGAAACTACaTATGTACAGGATTCATTATCAGACTGTATCAAAATGG
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TTatgtttttccattttgtcATGTGCGGGTATTATACCAAGTAGCCCGCC
AAACTGGAAAAATAAGATCACTTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000103_pilon | genome | sc0000103_pilon:530973..549770 + |
|
