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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000102_pilon:1115600..1133455+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13144.4.p1 ID=MSTRG.13144.4.p1|Name=MSTRG.13144.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=17856bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000102_pilon:1115600..1133455+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
gaTGAAGAAGGGCGACATCAATTTATAAGAGTCGATGATCATGTCAACAA
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TGTGTTTCTCATATATTGTGCAGAATGTCTAGAacataacctgagatcag
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ttgagttccttataaacgtgttccttataaaaaaaaacgtgtagatattt
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TTTTCCGAATGATTGTTTTACCGATCACGCTcaagtagatatcaattata
tatgtgggaaaaatcaaaatataatagccgcattctttttcaccgttcaa
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AGAGACCATATCATTATTTCGAATATTGAGCGACCAAGAATACACGTTTt
acatgttcttaaaatgttcttattttcagtattttttgagcattttgatg
taatttcttaagaaattgcatgtttttaagtctccaaagccttagaatgt
tcttagaatgttcttaaatttttggacctggaagccttatgttcttatat
agtttgttcttataaaaaaaaacgtgtagtgcaACCAAGGTGCGCGTGGA
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TGTTTCATGGGTGGATCCAAGTAATTATATTTCgttgataacatttttta
aacgcATTGATTGATTTCAACAAACGCATtgactttttatcaaaattatt
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ATAATATAtaaggtgaaaataaaaaaaaatgtagtgtttccggaaatcga
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AATCCCAGATAATTTTAGTCCAGGGTTTTAAATGATCAGTTTAGGATTTT
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CAGACTGAACCTGTATTGCAAGGAAAAATCTCCTTGCAGGAGCGTTACCT
ACGCCAGAAGtcttaaacaagcagcaaaaatatcataagctagactgtgg
aaaaagtttaacgcttggattcccaggctagggaTTTTCGTGAAAAAGTT
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TGCTACTGTGTTTTCTGAGCACTCGAATCACGGATTGTGAAACTATACTG
AGCTTTGTATAAAACCTGGAGACCCGGTTTCTCAATCTGAGCCAAGCTAA
ATATTTTGATCAATCAATAGCATTATAATATATCAAGATGTCTAGATGTA
CTTTTCCCTAACTTGTAatgtaaaggccggtctccacttgcgcgcgctgc
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cagcgcgcgcaagtggagaccggccttaacgcAGTTtgactccgatcaaa
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AAAATAATTTCTTTGACTGTAGTACGTACAACTTTCTGAtgatttgtttt
gtgttttccAGTGTGACAATTCTAACGTATTTATGTCATTATATTGTact
aattttttccaaaaccatAGCCAATTTTACATCGATGCGGTAATGGTATC
AAGGATCCCGGAGAAGAATGTGACTGTGGTACCGAGGAGGTTAGTATTTT
AATAGaagattttcatcttttttataTCTGAAGAAGCTAATCAAATTTCA
AGAAACACAAGCAATTTTGCCACATCATATGACAACAATCAAATGACCAA
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GCTAAAaaatactctgtaccagagtttCCTCACGTTTATAGCTTCGTAGT
GCACTCTGTGGTGTGtgttgtctgtttgataaaaaattcccgtatgGAGA
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tcggtcggtttgaaaaatctcaaatgagaaaagacaataacAACAAACGC
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ttaaatagGTTTAATAGCAATAATAGACTTTTAGTTAGGTGTTTTCGCAT
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ATCAATCatataattcaaaataaaaaaaaaatcatacaacTTACTTTTTA
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GAACAATGTTACGTAAGTTTGatattgtaattattttttttagatttccc
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gaaaaaattgcttgcgtaaacgaaagtgacacacaaacagaaaacagaca
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ATTGATTTTGCATCATTAGTCAATTTGTTGGTTGATGATTCCATAAAAGG
GGCAAACCTTTGGATTCCTAGCTATTCTCcttctaaaaactaaaaaatcc
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TGAATCAAGGACTTGCTGACAATTACAAACCGGTTGCACTCACTTCCCAT
GTATCGAAAAAAGGCCAACATACCAAACTTTAGTTTTGATGATCAAATGA
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AAACCTGTTAATACCAAACACTAAAGCATCTGGAGGGGGTGCTCTTTGAC
AAGAGGGTCCTCTTTTGTTATAAACTCCCTCCCCACAAGTGCAAGAGACA
TGACCAATTGCTCAAAAGACCTCTTCAAAAAACATTTAGTCATCTCCCTA
GCAACATCACCCGACGAGCCACTGCTTGCCAACAATTTCCACCTTAGGCA
AGCTAACtcgagatgccttggagtttttacaagatacttcactaattggt
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ctctaGTTTCGTAAAGAAGGCACGTTGTGTCGAAAAGCAACCAGCAATTG
TGATGTGGATGAGTATTGTACTGGTGATTTCCCCATGGTAAGTTTTGATC
ACAGTAGAAACTTGAACCTCTCTATTACTCGAATATCTTCTCGAAATAGT
TTAtttgtcccttcagttaacaatgccttataaacatAAATAAGTAAGTA
AATTATAGTCTGTCAAGTTTTAccttgataatgtttttttacaagcattG
CTTTTGATGGCGAAAAGAAAGATTCAAAAGTTATTAACGTTTAATCTAGA
GATGTTACTGGACAGGGGACTGTGCTACCGCCGAGGTGGATCACCTAGTC
TATCTTTAAAACATCGAAATAAAGGAACTTATTTAGACCGCGGAAtttgt
acagtggagtctccatgaCTCGAAAACCCACTCGATTTATAGTATTCact
ttaataataatttttttcagtgtCCAGTCGATAATGTAGCACAGAATGGT
ATGAGTTGTGGTGATAGTATTCAGGTGACCTACCATCTGGCACACAACGC
Tgttacaacgttcatctaacgttatatgtacgttgtgaacattagattaa
cgttaaaacaacgttgcgtgccagctgcGTATTCTTTACCGATTGTAGCG
GCAATTTTCCCTCCCAAGAAAACACTCTTTAGATTTTCCCTTTGAACTTT
TCCTATATCTTCTCctaatattttgaaagtcttttaatATAACTGcgcag
tgtgtcccaaaaaagcggaaagttttttataaataaagtaaaatcctcat
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cgagtttgaacatgcgattgagtagaaaagtttgtgtgtgttatcgctaa
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CCTATTtaatcatcttgggaattgaacCAATCGCTTACTTCAATTATCCT
AAACTCACTTTAGATAatgatttttaagaattttattttataaaaaatac
gaCACGGGACACGCTGCACACATTGGTATCAAATTGAAAACAATACAGTC
TTATCAGTGAtttttttCACGAGGCCCGACAACTTTTATGTGTTCCCTTT
GAGTTCATTTGAAGTTATCATTTTGAAATAACTActcaattaaaggtttt
atttttacataagtatgttcccgtttcatatcagacacatattttatatc
agaGCAGTgtttgcctattgttatattatgatgatataagcaaaaaaaaa
tgtttttcttttcttttttctgactaatcttgctccacatccgtgtcaat
ccaatttgaaaaagcttgtgagttaaaattgatgagtaagcaaacgatgt
gactcttattaaaaaaaccttttaccCTTCAACCAATCATGACACAAGAT
TGAAATcttatccttttgtatttagaaTGTAAGGTATTTTTCAATACTCA
GGTAATAGACATCAAGCGAAATTAAAATAGTTGTTTTTGAATAGTTCAGG
TAAGTGAATAATTTAGGTTTTTGATATATATTGAGCAttttttgcctttt
acaaaaacacttatttatttcgttgttttgtttttactgtcagatgattt
ttggtacaaagtcAAGGAGCCGTGAAACCATTACTAAGCTTTCGCATCAC
ATTACTGCTCGATATTTTCGTATTGAACCAAAGCACTGGAAAGGTACTGG
CGAAAGCGATTGGGCTTGTTTGAGAATGGAAATGTACGGATGTTCACCAG
ATATAGGTAATCGAGTTAAACATGTTCACCAGATATAGTTATCGAGTTGA
ACATGTTCACCAGATATAGGTAATCGAGTTAAACATGTTCACCAGATATA
GGTAATCGAGTTAAACATGTTCACCAGATATAGGTAATCGAGTTAAACAT
GCTCACCAGATATAGGTAGTCGAGTTAAACGTTTTTTCCGTCGCTGATCA
CATATTTTTCTGTCTCTGCCCTGGTTGTTCTTTCCTGAAACCATATACTA
ACTTTTTACAGAACTCATCATAGTGAAAGGTAACTTAAAGAAACTCTAGA
AGTAATCCTAAGTAGATGGGTTCTCATTTTCGGACCACCCTGATCTTATT
AGGATCCGCCCACGtttatctattttttcaaaattttattatattatgaa
aaaaattccgtACCCTCACCCCCCttttttttactcgaaccccccccccc
ttttatttgGGACCTTAGGGTATGGTTTTGGTTCATTAATTCCATTAACT
TACAAATTAATGCacgcaccctcccctaccttcgcgtagacagctatacg
aaaagggaaccttcgactgcggtcgcaaacttacttacttaaagcAACAC
CTTCGTCACGACGTCACGTCTCAGATTTATgtcctatcacgcatcacgtg
ATAAATAAATTATAGGGgaaaatcactcgaaaaatggtgcACGAgattta
tggtttatttttgatttatgattcatttatgatttatttatgatttattt
atgatttatttatgatttatttttgatttattttttatttatgatttacc
TTACTGGTATTAAATTTCGTGggttacaaaatttcgcgattcgcgaaatt
ttttcgaggaAACTTGTtttgcgtgtattaaatttcaggattcactaaat
tgggcactttcaaaaagtgggaataaGGCAAGAAAATGACAGATttcgct
tgaaacacaacgtattgggtgtaaaaataccaaaaatagtaacaaaacta
gtgacaaaaatagtacctaagtataacaataaatattttcgattttttga
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AACCTGCGAAATGTTGtaacccgcgaaatttaataccaataaggtattta
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tttataaaactgtgtacgagatttattttagtgatttgccGCTCGTCGGT
TATAACTATGATTCATTTTTGTTTAGTGAATGTGGCAACACCTATTTCAA
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Agggggggcaaaatttgtgtaggagagtagatttttatgacacagtaatt
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TGGTGGTGATAATTTTGAATCGCAAAAAaggttagtacccggtactataT
TCTGGGGTTTGGGTGGGCGTTTGACTTATTTCAAGCTAGTACCTTGAACT
GAATTTCGATATTTGGTGGGTAAAATGGGTACAAAAATCTATCAATCTTG
GCAATTCAGAATTCATTCCcgaaaaaaatcagattttatttaacggaaat
ttatttttcgatgttcatattttcctaattttgaaaaatcaaattgtCAC
AAAAGATTTACAGAAAAAGATTAGTCTATGGGTACTAAAAAAGGGGTGGT
GGCACCTAAGTGGGGGTATCTAAGACAAATATTTCTGAAATTAGAGTTAG
TACTCTATGGGTTAGTACCGTGCGGTTGTACCTCCCCCTGCATTGGGTAA
TTATTTTACGATATTGCCCTCATAAACAGTAAGTAAAGTTTTAATATTAA
CCTCTTTCAAAGAGATAAAATTCATGTTTATTTCCTTTCCTTTCACAGAT
TTGGATTGTAATCACAATCGAATGTTGTTTGACTACAAATCCGATGGTAC
CATGATTCATCATTGCAGTGGTAAAAAGATTTGTCAGGATGCTGATGGGT
GGTTGCATGTCTCTTCCACATGTGGAGCTGAAGAATCTAAATTTAATCGA
ACTCAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000102_pilon:1115600..1133455+ >MSTRG.13144.4.p1 ID=MSTRG.13144.4.p1|Name=MSTRG.13144.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2028bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000102_pilon:1115600..1133455+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATCATGTCAACAATATCCAACACATGCTTAAAAAAGGCTCATTCTTT
GatgatttttggtacaaagtcAAGGAGCCGTGAAACCATTACTAAGCTTT
CGCATCACATTACTGCTCGATATTTTCGTATTGAACCAAAGCACTGGAAA
GGTACTGGCGAAAGCGATTGGGCTTGTTTGAGAATGGAAATGTACGGATG
TTCACCAGATATAGTGAATGTGGCAACACCTATTTCAACGGTCGATTTGT
ATTATCACAGTCGAATGTGTATCACGCCAAATATTACCAATGATGATGAA
TGTGCAGCGATCCCTGATGGCACCAAGTTGATTTACAAGCAAATGCCAAA
TTTGGATTGTAATCACAATCGAATGTTGTTTGACTACAAATCCGATGGTA
CCATGATTCATCATTGCAGTGGTAAAAAGATTTGTCAGGATGCTGATGGG
TGGTTGCATGTCTCTTCCACATGTGGAGCTGAAGAATCTAAATTTAATCG
AACTCAGATGATCATGTCAACAATATCCAACACATGCTTAAAAAAGGCTC
ATTCTTTGatgatttttggtacaaagtcAAGGAGCCGTGAAACCATTACT
AAGCTTTCGCATCACATTACTGCTCGATATTTTCGTATTGAACCAAAGCA
CTGGAAAGGTACTGGCGAAAGCGATTGGGCTTGTTTGAGAATGGAAATGT
ACGGATGTTCACCAGATATAGTGAATGTGGCAACACCTATTTCAACGGTC
GATTTGTATTATCACAGTCGAATGTGTATCACGCCAAATATTACCAATGA
TGATGAATGTGCAGCGATCCCTGATGGCACCAAGTTGATTTACAAGCAAA
TGCCAAATTTGGATTGTAATCACAATCGAATGTTGTTTGACTACAAATCC
GATGGTACCATGATTCATCATTGCAGTGGTAAAAAGATTTGTCAGGATGC
TGATGGGTGGTTGCATGTCTCTTCCACATGTGGAGCTGAAGAATCTAAAT
TTAATCGAACTCAGATGATCATGTCAACAATATCCAACACATGCTTAAAA
AAGGCTCATTCTTTGatgatttttggtacaaagtcAAGGAGCCGTGAAAC
CATTACTAAGCTTTCGCATCACATTACTGCTCGATATTTTCGTATTGAAC
CAAAGCACTGGAAAGGTACTGGCGAAAGCGATTGGGCTTGTTTGAGAATG
GAAATGTACGGATGTTCACCAGATATAGTGAATGTGGCAACACCTATTTC
AACGGTCGATTTGTATTATCACAGTCGAATGTGTATCACGCCAAATATTA
CCAATGATGATGAATGTGCAGCGATCCCTGATGGCACCAAGTTGATTTAC
AAGCAAATGCCAAATTTGGATTGTAATCACAATCGAATGTTGTTTGACTA
CAAATCCGATGGTACCATGATTCATCATTGCAGTGGTAAAAAGATTTGTC
AGGATGCTGATGGGTGGTTGCATGTCTCTTCCACATGTGGAGCTGAAGAA
TCTAAATTTAATCGAACTCAGATGATCATGTCAACAATATCCAACACATG
CTTAAAAAAGGCTCATTCTTTGatgatttttggtacaaagtcAAGGAGCC
GTGAAACCATTACTAAGCTTTCGCATCACATTACTGCTCGATATTTTCGT
ATTGAACCAAAGCACTGGAAAGGTACTGGCGAAAGCGATTGGGCTTGTTT
GAGAATGGAAATGTACGGATGTTCACCAGATATAGTGAATGTGGCAACAC
CTATTTCAACGGTCGATTTGTATTATCACAGTCGAATGTGTATCACGCCA
AATATTACCAATGATGATGAATGTGCAGCGATCCCTGATGGCACCAAGTT
GATTTACAAGCAAATGCCAAATTTGGATTGTAATCACAATCGAATGTTGT
TTGACTACAAATCCGATGGTACCATGATTCATCATTGCAGTGGTAAAAAG
ATTTGTCAGGATGCTGATGGGTGGTTGCATGTCTCTTCCACATGTGGAGC
TGAAGAATCTAAATTTAATCGAACTCAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000102_pilon | genome | sc0000102_pilon:1115600..1133455 + |
|
