MSTRG.13144.2.p2 (mRNA) -

Overview


Name	MSTRG.13144.2.p2
Unique Name	MSTRG.13144.2.p2
Type	mRNA
Organism	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000102_pilon:1115600..1172613+
coding sequence from alignment at sc0000102_pilon:1115600..1172613+

mRNA from alignment at sc0000102_pilon:1115600..1172613+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR

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>MSTRG.13144.2.p2 ID=MSTRG.13144.2.p2|Name=MSTRG.13144.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=57014bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000102_pilon:1115600..1172613+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AATTATAGTCTGTCAAGTTTTAccttgataatgtttttttacaagcattG
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ATGAGTTGTGGTGATAGTATTCAGGTGACCTACCATCTGGCACACAACGC
Tgttacaacgttcatctaacgttatatgtacgttgtgaacattagattaa
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TTATCAGTGAtttttttCACGAGGCCCGACAACTTTTATGTGTTCCCTTT
GAGTTCATTTGAAGTTATCATTTTGAAATAACTActcaattaaaggtttt
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TGAAATcttatccttttgtatttagaaTGTAAGGTATTTTTCAATACTCA
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TAAGTGAATAATTTAGGTTTTTGATATATATTGAGCAttttttgcctttt
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AGGATCCGCCCACGtttatctattttttcaaaattttattatattatgaa
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ttttcgaggaAACTTGTtttgcgtgtattaaatttcaggattcactaaat
tgggcactttcaaaaagtgggaataaGGCAAGAAAATGACAGATttcgct
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CGGAACTTTTGTCAACATTATTTATTGTATAACTTAACatacaaaaacgt
caatttttcgccttaaaaatgccatttctcagcaccaggtggtcgaaact
taacaaataatccc

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000102_pilon:1115600..1172613+

>MSTRG.13144.2.p2 ID=MSTRG.13144.2.p2|Name=MSTRG.13144.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=28119bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000102_pilon:1115600..1172613+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTTCCACAACTAACGGTTGGACAAAAGAAAATTCGATTCTGCGCAA
TGAGAATGATGCTTCGAAAGGGGATTACtctattttcaaatatattgaTG
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TCGTTTACACAAACTTCATCTAATCTTGACAACGTCCACCTGATTCACAA
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GATTCCCATATCTAGGTGATCCATCCAAAGGACGTGCTCTCTTGACAACA
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CAATCGTAATCCAGCACCTTGGATGAATGATAATGTCAAAAGTCCAGGCT
CTATTTGGTACTGGTTAAATGAGAATGATTGTAATATTGATTATGCTAAA
GTGGATGGAGGTTTCAGTACTTGGTCAACATGGTCAAAATGCTCATGGTT
CTGTGGCCAAGGAACACAAAAAAGACATCGACTCTGCAACAATCCCATCC
CCAAGTGTGGTGGTGATGAGTGCCCTGCGTCACAATCTTTAGAAGAAACT
CAATCATGCCAAGGACCTTGTGACGTCTCCAAAATCACCACATTCGACAA
TTCCTTTTGTTTGGAGCCTGAGACTGGTCAATGCAATCCATCAGACGGCA
CTGTCATCAAATACCGATCAACAACTTCAcattgcaaaaatgaagactCT
GATTTCATCTTTAATCGTGATACTGGGAAATTGATTCATAAATGCAGTAA
AAAACCTGTGTGTATCAAAGATCAGTCTACAGGCTGGGGAGTATCTCTGG
TTGTCAACTCTACTTGTAAAGAACCAACTAGTGATTTGAATCTGGCAAGG
ACTTATTACGACAGTGTTCAATTTTCAACCAAATGTTTAGAAGCTTCAGG
AGGAACACCAAGAGATGGGAGAACCGTTATAACATGGAATCAATGTTCAG
AAGACAAAAGACGATTGGTCTTCCCAACCATTGCAATAGGAAAAGTTAAG
GTATCGAAGTACGAGTTCAGTGTAACTACAATTGACGAAATTGCTAAGCA
TCAAAGTTATCCGGATTCACCAACAAAAACGGGTCGTATTGACAATCTGG
AGCTGACCAGAAATATTGGAGCTAATTATGTTGCCCGACTTCAAACATAC
TTTGTTGCACCTCAATCAGGTGTATATCGTTTTGTTGTGTCGTGTGATGA
TCAAGGCGATTTGTATCTCTCAACGGACACTCAAGCTACCAACAAACGAA
AAATCATTTCTGTCGCTTCATGGAATAGTTTCCACCAATGGGACAAacat
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CATGGAAGGTGTTTTCAATGAGAATACTGGTGGTGATCATTTCTCAGTTG
GAGCTTACCTGCCGGATGGTTCATCTTTGTTACCTGTTACTAACCACTAT
CTGGATGAATTTTAAATGGTTTCCACAACTAACGGTTGGACAAAAGAAAA
TTCGATTCTGCGCAATGAGAATGATGCTTCGAAAGGGGATTACtctattt
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GATTACATGCTCGAAGCCAACAGTGTCGATTCAAACGGTGGCATATTTTC
GTTACCGGTTGATTTTACACTCTTGAATTGCCCGCCAAAAGACAAAAAGC
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TGGGTTCGTGAAGGAGGAAGCCGCAAATCTTGTAACGATATTAAGATCAG
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TGGACACTGTTGGTGGCTTCCAATAACAAAGGATGGAGCGCTCAACAGGT
TTTGGAGCGTAACATCAACCGACCATCATTATACAACGATTATTCCATTT
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AACAATCCCATCCCCAAGTGTGGTGGTGATGAGTGCCCTGCGTCACAATC
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aaatgaagactCTGATTTCATCTTTAATCGTGATACTGGGAAATTGATTC
ATAAATGCAGTAAAAAACCTGTGTGTATCAAAGATCAGTCTACAGGCTGG
GGAGTATCTCTGGTTGTCAACTCTACTTGTAAAGAACCAACTAGTGATTT
GAATCTGGCAAGGACTTATTACGACAGTGTTCAATTTTCAACCAAATGTT
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AATCAATGTTCAGAAGACAAAAGACGATTGGTCTTCCCAACCATTGCAAT
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AAATTGCTAAGCATCAAAGTTATCCGGATTCACCAACAAAAACGGGTCGT
ATTGACAATCTGGAGCTGACCAGAAATATTGGAGCTAATTATGTTGCCCG
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TGTCGTGTGATGATCAAGGCGATTTGTATCTCTCAACGGACACTCAAGCT
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GGTGGCTTCCAATAACAAAGGATGGAGCGCTCAACAGGTTTTGGAGCGTA
ACATCAACCGACCATCATTATACAACGATTATTCCATTTTGAATCGAGCC
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CGCCAAGCTTAGACGGCATTGGGGTGGTATATGGAGAGCACCTATCGAAT
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CAGCATCGTATGTGGATTATTGGGAATATGGTACCATTATCTCCAATATA
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CTCAATCATGCCAAGGACCTTGTGACGTCTCCAAAATCACCACATTCGAC
AATTCCTTTTGTTTGGAGCCTGAGACTGGTCAATGCAATCCATCAGACGG
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CTGATTTCATCTTTAATCGTGATACTGGGAAATTGATTCATAAATGCAGT
AAAAAACCTGTGTGTATCAAAGATCAGTCTACAGGCTGGGGAGTATCTCT
GGTTGTCAACTCTACTTGTAAAGAACCAACTAGTGATTTGAATCTGGCAA
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GGAGGAACACCAAGAGATGGGAGAACCGTTATAACATGGAATCAATGTTC
AGAAGACAAAAGACGATTGGTCTTCCCAACCATTGCAATAGGAAAAGTTA
AGGTATCGAAGTACGAGTTCAGTGTAACTACAATTGACGAAATTGCTAAG
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GGAGCTGACCAGAAATATTGGAGCTAATTATGTTGCCCGACTTCAAACAT
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ATCATTTCTCAGTTGGAGCTTACCTGCCGGATGGTTCATCTTTGTTACCT
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CGATATTAAGATCAGAGGCTTTCACAAAGGAAAGACTGACTACAAGGATG
GTTTCTACATGCTGAAAGATAATTTAAACATTTACTGTGATATGGAAACC
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AATATGGTACCATTATCTCCAATATATCCAATCGTAATCCAGCACCTTGG
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GAATGATTGTAATATTGATTATGCTAAAGTGGATGGAGGTTTCAGTACTT
GGTCAACATGGTCAAAATGCTCATGGTTCTGTGGCCAAGGAACACAAAAA
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CCCTGCGTCACAATCTTTAGAAGAAACTCAATCATGCCAAGGACCTTGTG
ACGTCTCCAAAATCACCACATTCGACAATTCCTTTTGTTTGGAGCCTGAG
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CAGTCTACAGGCTGGGGAGTATCTCTGGTTGTCAACTCTACTTGTAAAGA
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ACCGTTATAACATGGAATCAATGTTCAGAAGACAAAAGACGATTGGTCTT
CCCAACCATTGCAATAGGAAAAGTTAAGGTATCGAAGTACGAGTTCAGTG
TAACTACAATTGACGAAATTGCTAAGCATCAAAGTTATCCGGATTCACCA
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TAATTATGTTGCCCGACTTCAAACATACTTTGTTGCACCTCAATCAGGTG
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GAATAGTTTCCACCAATGGGACAAacatgaaaaacaaaaatcaggACCAA
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ATCTTTGTTACCTGTTACTAACCACTATCTGGATGAATTTTAAATGGTTT
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GTGTCGATTCAAACGGTGGCATATTTTCGTTACCGGTTGATTTTACACTC
TTGAATTGCCCGCCAAAAGACAAAAAGCCTGTCTTACAGAAGAAGTTTGG
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TGATATGGAAACCACGCCTAATGAAGGATGGACACTGTTGGTGGCTTCCA
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GTGGTGATGAGTGCCCTGCGTCACAATCTTTAGAAGAAACTCAATCATGC
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TTTGGAGCCTGAGACTGGTCAATGCAATCCATCAGACGGCACTGTCATCA
AATACCGATCAACAACTTCAcattgcaaaaatgaagactCTGATTTCATC
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GTGTATCAAAGATCAGTCTACAGGCTGGGGAGTATCTCTGGTTGTCAACT
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GACGATTGGTCTTCCCAACCATTGCAATAGGAAAAGTTAAGGTATCGAAG
TACGAGTTCAGTGTAACTACAATTGACGAAATTGCTAAGCATCAAAGTTA
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CCTCAATCAGGTGTATATCGTTTTGTTGTGTCGTGTGATGATCAAGGCGA
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CTGTCGCTTCATGGAATAGTTTCCACCAATGGGACAAacatgaaaaacaa
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TGCCGGATGGTTCATCTTTGTTACCTGTTACTAACCACTATCTGGATGAA
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GCGCAATGAGAATGATGCTTCGAAAGGGGATTACtctattttcaaatata
ttgaTGATTTAAAGTTTAAAGATCCGGCTGAGACTTCTTTCGATTACATG
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AATATTTGTCAACCCTTACAAAACCGAACATAGTTAAACTTTGGGTTCGT
GAAGGAGGAAGCCGCAAATCTTGTAACGATATTAAGATCAGAGGCTTTCA
CAAAGGAAAGACTGACTACAAGGATGGTTTCTACATGCTGAAAGATAATT
TAAACATTTACTGTGATATGGAAACCACGCCTAATGAAGGATGGACACTG
TTGGTGGCTTCCAATAACAAAGGATGGAGCGCTCAACAGGTTTTGGAGCG
TAACATCAACCGACCATCATTATACAACGATTATTCCATTTTGAATCGAG
CCAACAAAATGAAATCTCTCTCCAAAAATTCTACCTTTAAATACATGTTG
GACGCCAAGCTTAGACGGCATTGGGGTGGTATATGGAGAGCACCTATCGA
ATACTCGTTTACACAAACTTCATCTAATCTTGACAACGTCCACCTGATTC
ACAAATTCAGTGATTGGGCTTACGAAGCAAATTGGTATAGCTCTCCGCAA
AAACGATTCCCATATCTAGGTGATCCATCCAAAGGACGTGCTCTCTTGAC
AACAGCATCGTATGTGGATTATTGGGAATATGGTACCATTATCTCCAATA
TATCCAATCGTAATCCAGCACCTTGGATGAATGATAATGTCAAAAGTCCA
GGCTCTATTTGGTACTGGTTAAATGAGAATGATTGTAATATTGATTATGC
TAAAGTGGATGGAGGTTTCAGTACTTGGTCAACATGGTCAAAATGCTCAT
GGTTCTGTGGCCAAGGAACACAAAAAAGACATCGACTCTGCAACAATCCC
ATCCCCAAGTGTGGTGGTGATGAGTGCCCTGCGTCACAATCTTTAGAAGA
AACTCAATCATGCCAAGGACCTTGTGACGTCTCCAAAATCACCACATTCG
ACAATTCCTTTTGTTTGGAGCCTGAGACTGGTCAATGCAATCCATCAGAC
GGCACTGTCATCAAATACCGATCAACAACTTCAcattgcaaaaatgaaga
ctCTGATTTCATCTTTAATCGTGATACTGGGAAATTGATTCATAAATGCA
GTAAAAAACCTGTGTGTATCAAAGATCAGTCTACAGGCTGGGGAGTATCT
CTGGTTGTCAACTCTACTTGTAAAGAACCAACTAGTGATTTGAATCTGGC
AAGGACTTATTACGACAGTGTTCAATTTTCAACCAAATGTTTAGAAGCTT
CAGGAGGAACACCAAGAGATGGGAGAACCGTTATAACATGGAATCAATGT
TCAGAAGACAAAAGACGATTGGTCTTCCCAACCATTGCAATAGGAAAAGT
TAAGGTATCGAAGTACGAGTTCAGTGTAACTACAATTGACGAAATTGCTA
AGCATCAAAGTTATCCGGATTCACCAACAAAAACGGGTCGTATTGACAAT
CTGGAGCTGACCAGAAATATTGGAGCTAATTATGTTGCCCGACTTCAAAC
ATACTTTGTTGCACCTCAATCAGGTGTATATCGTTTTGTTGTGTCGTGTG
ATGATCAAGGCGATTTGTATCTCTCAACGGACACTCAAGCTACCAACAAA
CGAAAAATCATTTCTGTCGCTTCATGGAATAGTTTCCACCAATGGGACAA
acatgaaaaacaaaaatcaggACCAATCAAATTGATAGCTGGACAGAAAT
ATTACATGGAAGGTGTTTTCAATGAGAATACTGGTGGTGATCATTTCTCA
GTTGGAGCTTACCTGCCGGATGGTTCATCTTTGTTACCTGTTACTAACCA
CTATCTGGATGAATTTTAA

Gene-mRNA-Prot

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.13144	MSTRG.13144	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.13144.2.p2	MSTRG.13144.2.p2-protein	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.13144.2.p2.exon1	MSTRG.13144.2.p2.exon1	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.13144.2.p2.exon2	MSTRG.13144.2.p2.exon2	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.13144.2.p2.exon3	MSTRG.13144.2.p2.exon3	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.13144.2.p2.exon4	MSTRG.13144.2.p2.exon4	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.13144.2.p2.exon5	MSTRG.13144.2.p2.exon5	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.13144.2.p2.exon6	MSTRG.13144.2.p2.exon6	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.13144.2.p2.exon7	MSTRG.13144.2.p2.exon7	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.13144.2.p2.exon8	MSTRG.13144.2.p2.exon8	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.13144.2.p2.exon9	MSTRG.13144.2.p2.exon9	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.13144.2.p2.exon10	MSTRG.13144.2.p2.exon10	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
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MSTRG.13144.2.p2.exon12	MSTRG.13144.2.p2.exon12	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
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Position

The following features are aligned


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MSTRG.13144.2.p2 (mRNA) -