MSTRG.13125.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13125.2.p1
Unique NameMSTRG.13125.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000102_pilon:819354..867976-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13125.2.p1 ID=MSTRG.13125.2.p1|Name=MSTRG.13125.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=48623bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000102_pilon:819354..867976- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AAGTAGAAATAGATGGAAAGGACAAAATATTAAGTTATCAGGTATGTAAA CCAAACCAAACAACCATTTTGTTTTAGCACGATAGTCTTGCCGAAACCCC TCTGAACATGCAAGAAACTACCTTATCGGTCCTTTTTACGCCGGCCCTTA TTGGCATTTTTTTTTTTTGGGCTCGTGGCGTAATAAGGGCCGGTGTTTGA TACTGAAAGATGACATTTTAATGTAAATTTTAGTTAATACTGTTTTGATG CCTGAATAGCAGTTTTTACAAGCTTTGGCATTATTTACGGCCCTAATTGG CGTAAGCCCAAAATTAGGCTGTGGCGAAATAAGGGCCGGCGTAAAAGGGA CCGGCGTCAAATTAGGGCCGACGTTCAATTAAGGCCGGCGTAAAAAGTGC CGGTAAGGTAGATGAAAATCAGACCACGCGAATATTTGAGATGTTCCTCT TTTCTAATGATCAGTAATGGCCACTTTCGGAAAGGGGAAAAACGGTGTGA TTTGCTTGTACCAGATACTGCCCTTTTTTCAACATCGTCCGTTTGTAACT TTTAACAAATATCCCCCACCAGAAATCTTGGGGGATGATTGACTTAACTT GAAGTCATGTCAGTACTGTTTCAAAGAACTGACGTCACTTCAATCTAAAG CAACTCAACCATTTCACAGTCGGAATGAATCACGGGTAATTAGGACTGGT TGCGCTCTAGTACCGACGCTTTGCGACTGTGAAATAAAAATCTGACCAAC AAAGTAATTGAAAAATCGTGCGGTTGGAAAGTTTAGCCGAAGACCATGTT CGCACGTGACGGTTGTGTTCCGCTCCGAAACGGAATGAAGCCATTATATT GGTTAGAAGTGACGTAACACTTGAATGTAACCGATAGAATGGCTCATTTG GTTTTTGAGCGAAAAAGAACCGTCACGTGCGAACATGGTCTTCGGCTAGA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000102_pilon:819354..867976-

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CGCTATTGGGTTTATCCGTTGTTGACACTCTTTATTTCTGCTGCAGAAAT
TGGTCTCGATCAATTGGAACACAAAGAACCAGCATATCCCGACCGCGAGC
AATACACACCTGACAGGACTGACCAGATCTTAGACGATCTTTTCTTAAAA
GATACCGGAATGTATGCATACGATAATCGGGCATCGCAAAACAGCGGAGC
TTTCGATAACCGGGAATCAAGAAGAGATGGGAATGAACAATTTGCAAAAT
ATTGATTCACCTTGGTGCCGGCTTTTGGGCAGCCATCGCAAGTCCATTGT
TTCGAAAAACCGGGGGTATCATTTATGATGTTAGCAAATACAATTTGCAG
ATGTTTGGTTGGCACTTGTTGGCAGCGGTAGCCATCTTTGTGTGGAGTGG
TCTGACTGTCTTCTTGGTACTCATATTCTTCGTGTTCGCAAGATCCATTA
AATACAGTGGCCGAGAAGGTGGCGATTTCAGTGCTTTCAAACGATTACCT
AGCGTACAGTGCATTCGTCGTGGGAGTGATAGGTGGTCTCGCCTTCACTG
TATGGAGCGCGCTTTTACAATTATGTCGAATTGACGATCCAACTGACTCT
GCAGCAGTTGATGCTAGTAGGATATTTCCTGGCTGTCATCAGTTTGCTAG
CCAAACAACAGACAGGTAAAAGACACTTAGCCAACAGCCTTCTGGCGGCT
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TGATCGATCATCGACTAAAGCTCTCATCAACGGAAGCATCTCTGGTTTGG
ATGACGGGGGAGCGGCGTGGATTCACGTGCTCAGTGGTAGTGTGAGTTTG
ATCGGAACAATTTTGTTGGCGCCACGAAAAGATCGACAGGGAAAGAAATT
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CCACTGGACAAAACATCCGGAAGGTTGGTTGAAATCTGGCATCGAAGTAG
AAATAGATGGAAAGGACAAAATATTAAGTTATCAGATGTTGGTGCTGGTG
TTATGTAACAGTGGTTTTGTTTCACGCATGCGCTATTGGGTTTATCCGTT
GTTGACACTCTTTATTTCTGCTGCAGAAATTGGTCTCGATCAATTGGAAC
ACAAAGAACCAGCATATCCCGACCGCGAGCAATACACACCTGACAGGACT
GACCAGATCTTAGACGATCTTTTCTTAAAAGATACCGGAATGTATGCATA
CGATAATCGGGCATCGCAAAACAGCGGAGCTTTCGATAACCGGGAATCAA
GAAGAGATGGGAATGAACAATTTGCAAAATATTGATTCACCTTGGTGCCG
GCTTTTGGGCAGCCATCGCAAGTCCATTGTTTCGAAAAACCGGGGGTATC
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GGCAGCGGTAGCCATCTTTGTGTGGAGTGGTCTGACTGTCTTCTTGGTAC
TCATATTCTTCGTGTTCGCAAGATCCATTAAATACAGTGGCCGAGAAGGT
GGCGATTTCAGTGCTTTCAAACGATTACCTAGCGTACAGTGCATTCGTCG
TGGGAGTGATAGGTGGTCTCGCCTTCACTGTATGGAGCGCGCTTTTACAA
TTATGTCGAATTGACGATCCAACTGACTCTGCAGCAGTTGATGCTAGTAG
GATATTTCCTGGCTGTCATCAGTTTGCTAGCCAAACAACAGACAGGTAAA
AGACACTTAGCCAACAGCCTTCTGGCGGCTGAAGGTGCCGCTTTGGTATC
GTTCGCTTTGAAAAGGACTGGATATTTTGGTGATCGATCATCGACTAAAG
CTCTCATCAACGGAAGCATCTCTGGTTTGGATGACGGGGGAGCGGCGTGG
ATTCACGTGCTCAGTGGTAGTGTGAGTTTGATCGGAACAATTTTGTTGGC
GCCACGAAAAGATCGACAGGGAAAGAAATTTCGTCCAGTTGGCGGAAACT
TGACCCCCGTGTTATATATCCTTTTGTGATCCACTGGACAAAACATCCGG
AAGGTTGGTTGAAATCTGGCATCGAAGTAGAAATAGATGGAAAGGACAAA
ATATTAAGTTATCAGATGTTGGTGCTGGTGTTATGTAACAGTGGTTTTGT
TTCACGCATGCGCTATTGGGTTTATCCGTTGTTGACACTCTTTATTTCTG
CTGCAGAAATTGGTCTCGATCAATTGGAACACAAAGAACCAGCATATCCC
GACCGCGAGCAATACACACCTGACAGGACTGACCAGATCTTAGACGATCT
TTTCTTAAAAGATACCGGAATGTATGCATACGATAATCGGGCATCGCAAA
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CAATTTGCAGATGTTTGGTTGGCACTTGTTGGCAGCGGTAGCCATCTTTG
TGTGGAGTGGTCTGACTGTCTTCTTGGTACTCATATTCTTCGTGTTCGCA
AGATCCATTAAATACAGTGGCCGAGAAGGTGGCGATTTCAGTGCTTTCAA
ACGATTACCTAGCGTACAGTGCATTCGTCGTGGGAGTGATAGGTGGTCTC
GCCTTCACTGTATGGAGCGCGCTTTTACAATTATGTCGAATTGACGATCC
AACTGACTCTGCAGCAGTTGATGCTAGTAGGATATTTCCTGGCTGTCATC
AGTTTGCTAGCCAAACAACAGACAGGTAAAAGACACTTAGCCAACAGCCT
TCTGGCGGCTGAAGGTGCCGCTTTGGTATCGTTCGCTTTGAAAAGGACTG
GATATTTTGGTGATCGATCATCGACTAAAGCTCTCATCAACGGAAGCATC
TCTGGTTTGGATGACGGGGGAGCGGCGTGGATTCACGTGCTCAGTGGTAG
TGTGAGTTTGATCGGAACAATTTTGTTGGCGCCACGAAAAGATCGACAGG
GAAAGAAATTTCGTCCAGTTGGCGGAAACTTGACCCCCGTGTTATATATC
CTTTTGTGATCCACTGGACAAAACATCCGGAAGGTTGGTTGAAATCTGGC
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GGTGCTGGTGTTATGTAACAGTGGTTTTGTTTCACGCATGCGCTATTGGG
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CAATTGGAACACAAAGAACCAGCATATCCCGACCGCGAGCAATACACACC
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CGGGAATCAAGAAGAGATGGGAATGAACAATTTGCAAAATATTGATTCAC
CTTGGTGCCGGCTTTTGGGCAGCCATCGCAAGTCCATTGTTTCGAAAAAC
CGGGGGTATCATTTATGATGTTAGCAAATACAATTTGCAGATGTTTGGTT
GGCACTTGTTGGCAGCGGTAGCCATCTTTGTGTGGAGTGGTCTGACTGTC
TTCTTGGTACTCATATTCTTCGTGTTCGCAAGATCCATTAAATACAGTGG
CCGAGAAGGTGGCGATTTCAGTGCTTTCAAACGATTACCTAGCGTACAGT
GCATTCGTCGTGGGAGTGATAGGTGGTCTCGCCTTCACTGTATGGAGCGC
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ATGCTAGTAGGATATTTCCTGGCTGTCATCAGTTTGCTAGCCAAACAACA
GACAGGTAAAAGACACTTAGCCAACAGCCTTCTGGCGGCTGAAGGTGCCG
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TCGACTAAAGCTCTCATCAACGGAAGCATCTCTGGTTTGGATGACGGGGG
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AAAGGACAAAATATTAAGTTATCAGATGTTGGTGCTGGTGTTATGTAACA
GTGGTTTTGTTTCACGCATGCGCTATTGGGTTTATCCGTTGTTGACACTC
TTTATTTCTG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13125MSTRG.13125Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13125.2.p1MSTRG.13125.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13125.2.p1.exon10MSTRG.13125.2.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13125.2.p1.exon9MSTRG.13125.2.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13125.2.p1.exon8MSTRG.13125.2.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13125.2.p1.exon7MSTRG.13125.2.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13125.2.p1.exon6MSTRG.13125.2.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13125.2.p1.exon5MSTRG.13125.2.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13125.2.p1.exon4MSTRG.13125.2.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13125.2.p1.exon3MSTRG.13125.2.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13125.2.p1.exon2MSTRG.13125.2.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13125.2.p1.exon1MSTRG.13125.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000102_pilongenomesc0000102_pilon:819354..867976 -