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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000102_pilon:802497..816984+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13124.1.p2 ID=MSTRG.13124.1.p2|Name=MSTRG.13124.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14488bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000102_pilon:802497..816984+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGAAATTAATGATGAATATCTTGACGGCATATTTTACCATGTTGCCGCAA
TAGACGTACGTTATAGTGGACAGGATGATTGTGGGAATGGCGTAAAAGAT
GGTCAATATTTTACCGAGTGCTGATCGTGTCACCATCCGTCCATAACCTG
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TCTTGTAACAGTCAGATTAATTTTCAAGTCGTTTTTAACGCATTTTCACG
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TCAAACTGGGTAAACCCCAACCCACTTTCAAAACAACCCTGAGGCGTTTA
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ATCGTAATTTTTTGCAAGTATCGTCGAAAATTGAGAATAAAACGTACGTA
TTACAGTGAAAGCTAGTGTTAGCCGACTTTTGAGGTTTATTAAAGTAGGG
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Aagtttgtacatgtttttttttttataagcaagtttatgccccttggtca
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TGTATACTCAGAACCATCTGTTTTTCGTCTTGGAACTTTTCATGAAAAGA
GAGTCTCTAACGAGTTTTTCATAACACTGTAGTCCCACTGTAGTATACAT
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ACCAATTGTGGTATCTGTTGAAAACAGACTTTTTATTAACTGCTAATAAA
GAAGAAGAGGAAAAACTTTCGTACTTTTATCTGAATCTATCccattttat
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aaagattgacaaaaaaaatttaaaagaaaaaaagatttatccgaagtaat
caatctcccaaaaaacaaaatttgaaaccaTTTATATCTTTAACCGAAAG
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gacattgtgacttttgaccaaCCGGACAACAGATataaccccccggacaa
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TTTGCCCCCAaacagggcaaattttttagattttcactaccccacccccc
ccccccccccccccggacaatatattcAATATCCTCAACCATGCACGAAA
AtttttggaagagcccattgtcaAAAATTCACTGGAAGTGTGATTAAAAG
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gctatcgtccgtataatatattcATAGTGGGAAcccccccccTAACTTTA
gggggggTTGgaggttttcagaaaaatttaagcagTGGGGGTTAGCCTGC
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AACACATCATTATCTCACAACTTGTCTTGAGGCTCGCATGAAAGAGcctc
atttgtttttttttttgtttttcaaaatgaaattaacTTGGTTCCTTGGG
AGCAATAGTAGTGCTTTTACAAgaattttctcgagattagtTAAGTGTTA
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TTTAACCTTCTATGGCTATTTGAAATACTGAAACAGATTATTTTGAAGAT
TGTCGGAATCATCCCTTTCACagtgagaaatttcaaatcatcaCGGGAGA
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GAgattgataaaaataattttgtgtttttaaaaAGAGAGCAAATTCTCAG
TGTGTTCACAACTCGGTGACAGGACAATTACccaattacccccccccccc
gacaatTACCCCCAGACAATTGCGCCCAGACAATTGCGCCCAGACAATTG
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TCAACTGCCTCATTTCCCTATAATCATTTAAATCCAAAATATGTCAACAT
TTATGGTGatcaaataactcaattttagccttaatgttcttataaaaaaa
ctaatgtttggaatttcctgattttttttgaagatattttgtgAAGTttt
gtgaatgaaaattaatttttggtcACACATGTTTGTTTTACAGTGGTTGT
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AAGGGAATTTattttttaggggggggggtaattgtcccgggggcaattgt
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GGCTCTTTAAAAAAGGGgatttgattggattgattgattgattggattga
ttgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgatt
gattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattga
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tgattgattgattgagtttgattgttgattgattgattgttcttgtttcg
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TAGAGAATAATCAAGTTAAGAAGAAATTAGTAAGTCGATCGGTCGATCGA
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GGTGTCATCTCAACgaaagaaattatcatcaaaacgaatataaaaatgaa
aatgaaaatgtgaatatgaggttttcttttctttgtgcGTGTGatattaa
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AATATTGAACATCTTCCATCCTTCACTTTCCTTTGTCTTcagttttttcg
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ATTTCGACTGGCTGATAATGAGGATGGAATAATTTTTGTTAGAGGGTGAA
CGACCGACCGACCGTAGTAAAGAGAATCGAAAAGAGCAAAGCAATcatga
aaatgggaaaattcaaagaaaattcgcttcttttcaatatttttcatcat
taaatCCAAGAATATAATCTGAAGCGACGTGGGTGtttttttATTGTGTC
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TTCAATTTGCGTAGGTGTTTCATAGCAGTTTAGAGGCTCTGTTTATTAGT
TCTACTGGCTGTCTGAACGAATCAGTTGCCGGCTGAACCTTCTGAACAAA
AGGACCAAGAAGTTGTGTGGTTTTTGTTAGCTTTTAAGGTTGTCTGGCAA
GGAAAGAATCTGCCATAACTTCATTTCATAATATCTCAGTATAACGCTTT
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TACTCCCACGAGAGTTGAGATTTATTACTAGGCTGGGTATGAATGTCGTC
CAAAATTAGCTGTTATCGTTATGACCtatagtgttttttttaatccaTAG
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GGATTTCGGATTTCAAtaataaaaatacattttcattcggaagatttttt
tttaattcctgGTTTTGAACTTTTACAGTAATCCTTCAGAAGCTCagttt
tctgtttcaaagaaattcatgtctaaaaactaattttaatcTGTGAAAAG
AAGGATGTAACTTGACAGTTTAAGGTTTAAATATCTTCAATTTTGCAACC
TTAAAGTCGTGTTTTTATCAATAGAAAGGTTAAGCAAAGGTGAAACCTTT
CTCTACTATGGTTAAGCTCTTTTTATCGTTTTGTGAGAAGCTCAAACTAA
GACTTCGGTCGTTTAATaaagaaagtttctttttttaaagggacataaca
gtacttgcgaaatttgtaaacaaactgtatgcagtggatacaaaatcaaa
acaaatgtcacatgtcaaaataaaaaatcaaaccaaatatggctaatttt
gattgttcacttattttacaagtttattttggacacgtgattttaattgt
tctctataatgacacgtggttcttGCAATGTTTacaattttactacttta
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TTTCAGTGCAGTACGAATGCTTTATTTGCCCAAAAAGTTCTCCAACACcc
aatattttcttgaaaatttcgaTTGGAAATCTTTAATTGAGATTTTGGCG
AAAATGATTTCTTCGAATGATCGGTTATGGACGAAAGTATTTTAGCTAAT
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TAAAATTGTTGATGAAAATCTTAGTAAATGATCAAAAGATTTaaatagac
cttatcagagtttttgatttttctaagacagcaatgcattgtgggattgt
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ataaaaaacacggATAAGATCTATTTAGCGccaaacaactttttttttcg
gacacactgTATATGCATATAGTGTTCCATTCCCTGTTCGTCATAGAACT
GACGAATTTTCAACACATTTCCAAGGGGAATGTCTACTGCAATTTATATT
CCACACATCTGCATTTCTTAACtccttatgaaaaaaatcttccctttttt
ttttcaaagttcgtGGTCAGACGGTTgtgaaatgaaaacaaagaaagaag
aagacgaagaaaagagtgaaaagaTAGAGGTggattttcagcaaaaaaag
gGGATAATTTGATGATTAAATTTAATATTGTCGCCATATTTGTATGTGTA
TACAGGTGTATTTTCTTGCTTTAAGAATGATAGTCGTTGTCGAAAtagta
aaagttttcttttgctctgttcaaaaaagaaactGGATTCAATTTAGTTC
AGTTAGTTTTCTCTTTTTGGAGTTGGAAACCGTATGAAACCTACACTACT
TTTTCGCCGACTAAATATACTGTTGTTAATGACAGGGCTACGTTTCATTT
CTGGGAAAGGGCTATTTTATGGCATTTAGGCGGTGAAAAGGGGTCAAATT
TTCTCCTGTGTGGAAAACCCCATAATTATTTTGGCCCATCCGTTTCCATT
TTCGTTCGTTGTACCCTACAGATAAAAACTTTCCTAAGCTCTGTTCAACA
CTGCGGAATTTCTCTTGAATAAATGTTTATTTGTTTTAATGTCTGATTAA
AATGAGTTTCATCTCCCAAAGATGAGCGGATGAACTCCATTTTGAGTCGG
AAAGGAAACTTGTTTAGCTGTGGTGCATTTAGTTTTGTAAAGTTTGTCGA
AGTCTGCCGGAAATGTAGTTGCGGTTGAGGTTGTGTTATAGCGAATGTTG
GCAGTTTTTATTTACCTTGTACTTTTCTGCAAGCGTTTGCTTTCATTTTT
GATCCAACAAAGCTGCTACTTTTCGTTGTTCGTTTTTGTACGTTGAAGTT
TTTGCTGGCATCTCAAATAAAAGTTgcaaaatatttcctttttgtgaaaa
tgtaaAGTCAACATAACATCGACTTGCAAACAAAACAGTGTTCGAAATCC
AGCAACTTGCATCTGATATTGATTAGAGGGTTTAGCTCAATCGGTTGTTT
AGTAGTGATGTTTAATaaatggagaaattttcaatggTTGAGTACGCTGT
TCTTATATTTTTGGCAATCTCAATTCGCTCTTGTGCTATTCTTATTTTTA
GTTCTTAAATCTGAGTGATCAGGAAGAAGATATAGTTTCAGCTCGGGTAA
TGAGTTTTGTTACAAGGggtaaaaatcatattttccatttcatttttcag
gtTGCAAATAATCAGTCACCATGTTGTCCTTCATTCCTCATCAAAACAAC
TTCCTCGCCTCGATGTCCTTCTTACAACATGCTTTAAGCTTGCCTCGCCT
ACCATTCAACATGTTCAACGACCCTGGGTTGCTTCATTTCAGCATCATCG
CTACCATAGCAACAATCGCCATTATTGCAAACATTTACCTCGTCACTTAC
ATCATGCGAACTAAAACGACGCCTATCTGCAAAAACTCTTGTTATGGATA
TTACCTGCTACATATCTCTTTTTTGGATATCTTAGCATCAACTTTAGCGA
TTCTGTTATCCATAAATACACACGCGGCGGTGAAACCATCTAGCTCATCA
ATGAGTTGGATTTCTTTGAATGGACATTATTTGAACCATATTTTTTGTGG
TGTTGTCCACAGTACTATTGCATTGATGCTTTACCAGAAATTCCTCTGTT
TACGTAAATCTTCACATAAACGAAAAGCGTTTCTTTAAACTTGAAGCTGA
GCTTATCCTTGACGTGGTGCTGGGCGGTCGGAAGCGTACTCCCAGAGATC
ATTGTATATAAAAATGCAATCGAGGAAGAAGATAGAGAAAACAGTTCATG
TTTGATCGTTTATAATCGTTTTATTAATTATCGTTCCGTTTTTAATGATC
GGCTATTATCGAATCAGTATTCTTCGATTACGAACGTGTGAAAGCGTTTT
ATTATTGAAACGGAGTCGTGAATACCGCAAATTCGCTTCCGTTTGCTTAC
TTTTATCGATAGCCCTGGTGGCTTGTAATCTACCCAAGTATTTATATCAT
CTTTTACAAATGATGAATAAGGAAGGAAAAATTGATttctcattttctga
aaaactgcAGACAATCTTTGATACGATTTCCTGGCTTTATTTACCATTTA
TACCGCTTATTTACTGTCTAACTTACCGGATTTATAAACGCAAAGCCAAG
TTACCGGACCTGAgcaataataataacaacaacaacatcagcGCACTGCT
TGAATCCAAATTCCTCTCCATGGCGGCTACTCCGACACCAACCTCATTAA
CGACGTCGCGGAGCCAATCGGTACCAAATTTCGACCCTAGGAGACGCTCC
TTGTTTGATAGACGTAAGAGTAATAGCAGTGTTGAGGATATCTTGGATAT
TTGTTCGCGAAGGTTCTCAGCACCGAACGTGGAAGTGAACCCTGAGCTTC
TCTCGTCCTGTATGCTGACTTTAGAATCTATCTATGAGGCGAACAGGAAA
AAGAAATCACTTTTCAGACAAGCATTGAGACGGTTCAGTGGGAATCCGAC
TGATAGtgtcgatgacgtcagcatgatGTCATCACAAGATTCGATCCCAT
TTCCCCATGTTGTACATCGATTGAATCAAGGCGGGCAAAGTCCTTTGAAA
GAGGATTGAAATGTGCATCATATGGTAGAAATGTTTCGCAGGTGCAATGT
GATTATTCTACCTATTCCTTatgttttcaagtttttaagtGCGACGGCGA
CGGCACTCATCACAGACAACGCTAGATAGCGGAAATACGGTAGCTATCAT
TTGTGAAATTGTAAACTGTTGAGTGCGTCATCAATCTATCTTAAAGTGAT
ACCTATGTTGTATACACTATAGATTTTGAATTGTAAATATTATTGTACAT
AATTGAATTTATTATTCTAAGGATTATATATATGAAATagaatttcaaac
ttttattcGTTTTACCCTCCGCTTTTGTCTTTAAACTTTACATCGTCATT
TCTTTTCCAGTATAGCTagcatttttttcatattttac Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000102_pilon:802497..816984+ >MSTRG.13124.1.p2 ID=MSTRG.13124.1.p2|Name=MSTRG.13124.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=468bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000102_pilon:802497..816984+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTGTCCTTCATTCCTCATCAAAACAACTTCCTCGCCTCGATGTCCTT
CTTACAACATGCTTTAAGCTTGCCTCGCCTACCATTCAACATGTTCAACG
ACCCTGGGTTGCTTCATTTCAGCATCATCGCTACCATAGCAACAATCGCC
ATTATTGCAAACATTTACCTCGTCACTTACATCATGCGAACTAAAACGAC
GCCTATCTGCAAAAACTCTTGTTATGGATATTACCTGCTACATATCTCTT
TTTTGGATATCTTAGCATCAACTTTAGCGATTCTGTTATCCATAAATACA
CACGCGGCGGTGAAACCATCTAGCTCATCAATGAGTTGGATTTCTTTGAA
TGGACATTATTTGAACCATATTTTTTGTGGTGTTGTCCACAGTACTATTG
CATTGATGCTTTACCAGAAATTCCTCTGTTTACGTAAATCTTCACATAAA
CGAAAAGCGTTTCTTTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000102_pilon | genome | sc0000102_pilon:802497..816984 + |
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