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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000006_pilon:1615560..1621445- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.1309.2.p1 ID=MSTRG.1309.2.p1|Name=MSTRG.1309.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5886bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:1615560..1621445- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTTGAATTTGATACACCAACTGTTATATGTGCTCACATAAATGCTAGAC
AACTTAATTACCTGTTATCTTGTTGATATGATAAATAATATTCTTTTGGA
TGAAAATGGCTCAAAATCTTTCAAAGAAAATCAAGATTACCAAATTCCTA
CTTTTATCTTACATCATTTTATTCTTTGTAAGTTTTGTTTATTGTCCCTT
TCACTTTCATATTTTCCAAAAAAAAATTACTGAAACCCACAGTAAATAAC
TTAAAATTTCATAAAAAAGAGTAAGAAACATGAGTGCTTGTTACATTTTA
TCTGAAAATTACTCTATCGGTTCAATATTTTAGTTACTTGGATCAGCACT
GTTAGTACTAGCCATGGAAAGTAGATTTGGAAAGCAAGATTATATCACAG
TCACTGAAAAAGTCAGTTATATCACTGGATACATGGCAGCAAACACCTTC
TGTATTATCATTGGTGTGATCATGGTGATTGTTAGTTTCTTTGGATGTTG
TGGTGTCATTGCAGAACATTCAATAATGGTTCTTGTTGTAAGTTCAACTG
ATTTTTTGTTCATACACAGCTATTTGGTCTTAAATGATTTTATCAAATAA
CTAAACGCTCACCCTATTTTCACTTTTGCCCTTCTGGATTTGACTGGTTT
AAAAATCAGTTGGAATAAAATTGAACATCAAGTATTTTGTCTGTAGTGGC
TTTGTATTTAAAAACTCAAGATGTTTGTAATGAAAGGGAGAGATGAAATC
TGTTAAGTAATCAAAGTTCTTTCACAGAATTTTTTTTCTCTCATCTTATC
AGGCAAAATGATCTTATGTTGCTTTTAACCAAAGAACTATTTTATATGTG
AGTTGAATCAGTAATGAATCACTCTTCATCGCAGGGGCTCCATTTAAATC
AAAACTTTATCAATTCCTGCTAAGTTGTTTGAATATTTCTTGACAATATT
TTTCTAATCCTCTTTGAAGGGTCTACTTGTTATGTTTTCCCTCACGTTAC
ATTTTATATCATCCTCTCTCCATCTTAGTGTGGTTTTATGAAAATGATGA
ATTAAAAATAGTCCTCTTTCTTATGTGAATGTATATTGTAAGTTCTAGTA
CTGTTTTGTTTCAAAGATGTTCTGGTCTAGTACTTTGGTCAAATTTTCTT
TCTTTATAGCTTTTCGTCTTCATGGCAATTATTTTCATCTTTGAAATGGC
CATTTGTATATACGGGTTTGCTAAAAGTGATCAGGTAAAGCTTCTCAAGA
ATGTGATATATCAAACAATAACAAATCTTATAATCACATTTTATGTCTAC
TCTATGCTAACATTTAATGTCAACTAGCTTAATGCTCTAAACTGATTTAC
CAAAAGGACATGATTTCTCTCTAATCAACTGAAAACTATCAGTTGTTTAG
GATTTTGTGTTTTCTCTGGTATTACTGTCTCGGTGTTTATTAGATATTTT
TTGCATTTTACTTAGTTAAGGGATCGTTTAGAATCTACATACCTAAAAAA
CATTCAAGCTCTTTATACCAATGACACTTGGAGTCAACATGCGGCAGCTA
TCGACAATTTTCAAAGGAATAAACAATGTTGCGGTTACCACGGTATTGAG
GATTGGGACGATTCACATTTCATGAAGGAAAATGGTCATTATCCAATATC
ATGCTGTAAAGAGTTGAATTGTTCCATAGAAGCAGTTAGATCATATAAAA
AGGCGCATTTCTACCAAAAAGTAAAGTTGATTTTGATCCTCACTACCTTT
AGATTTTAAAACAATGAACAGCATTTTTACTATCCAGATATTTGATGTGT
AAATCTCAAAAGGAAGTTTTCTTTTGATTACTGTCTTTGTCATGCCTTCT
CACTCCATCAATTTTCATATTTTTTGCTTTAGGGGTGCTTTAAAGAAGTG
GTTAAATGGTTGACTAGGAATATGGAGATTATTGGTATCGTCAATTTAAC
CTTTGGCATTCTTCAGGTAACATCCATTAGATTCAATTTCCAAAAAGGTT
TGAAAACTAAGACTTCCATTTCAGTGTCCTGAAAATATTTGGTTTTCTTG
ATGATTGATTATTTTGCTGGATTTTTCTACTGATATTTTAGCAAAACCTG
TTTTTCACGCTAAGGCTAAAATGACAAAGAGGTGAAAAGTAAACACATAC
ATTTGGCAGATTTTGTGGGGTTAAGTTGAAGCCACAAAGTTGAATATCGA
CCAAATTTTTAAAATCTAATACCAGATTCTCTCTGCCATTTGTTCTTTGA
AATCATGAGTTATATTCAGGTTATATTTTAGTGAAACAGTTCTGTGTATA
TTAAATCCTTGTGGAGAATTACAATAACTTCCTGATAACAATCACATCAT
CTTAGCATCACATTCAGAAATCTCTTGAAGAAATTGATCAATTAACTATT
TTTCTTTTGCTTTCTTAGATATTTGGCATGGTGTTGACAATGATTTTATA
TTGTTTCGTCAAAGATATGCTTGTTATTACTTCCTGAGTGAAGGAGTTTT
TAAACAAACTATTGCTGTTAAACAATTTTTGAGAAGTTGACAAATGTGTA
TCTTGAGGCTTCAATGTTTTGAAAGAGTATAACTTATCACTTAATAATGG
TTTAGCTGATATGTAGGTTCAACCAGTGTTTTTATAACAGTCTGTAAAAT
ATCTAATCCATTTTCATTTGTTTTTACAGATAAAATCAGTAGTAAAAAAT
AAACGTAATAGAAATGTCGAAATCTTGTTCATGTTTGAAGTACCTTCTCT
TCATTTTCAACTTCTTGTTCTTTGTAAGTAAATTGTAATAACCAAATGAG
ACAGATATCTATCCGTATCTTCTTATATTTTCTTGTAATTTTATACTACC
ATGTAGTCAAGGTGTATTCAATACCTTCTTTTGATAAAGGTGGTTGTGCT
TTCTTGTTCTTGTTGAATTATCTGGTTTTTCTTTCCTAACAGTTGATTGG
CTGTGCCATCCTTGGACTTGGAATATGGTTGAAAGTTGAGAAAGGTGATT
ACGTAGACATCTCCCAATATGATTACCTGTCAGCAGCAAATGTGGCAATC
GCTATTGGTTCTGTTATTCTGGTCGTTTCATTTCTTGGATGTTGTGGCTC
CATCAAAGAAATTGCTCCTATGTTGATCGCAGTAGGTTCAAATTCCCACT
TAGTGATATTTTGCTGTCTTTTTTATTTTACATTAATGATGATGAAATAT
TTATTAGTCATTTATTTTTCTGCTTTTTACTGTCCCATTATTCATCAGAT
ATTACACACAAGTATCTTTTTGACAATTTATTCTCTCTTTTACGACTAGA
AATACTAATGTTGTTAAACAGCATTACATGGAAATCGTTGTTCTCATTGT
TAACAATTGCAGGCATATGATCAACGACTAGAGGCAACCCAATTAAGTCA
TCTTCAAATCTTTGCAACCTTCAATTGAAAGAAAGAATGAAACACTCCCG
ATTCATAAAGCTTTACTTTTATTTAGTTCTTTGTGTTACTGGTGATCATA
TTTTTGCTGGAAATTGCTATCGGTATTTTCGCTTATGTCCAGAAAGACGA
TGTAAGTAAAGACTATTACTGTTTGACTGTCTTTGAACTGTTCTTGTTGT
ACGACTTCAATCCTTCATAATGGGCTCTTCCAGGAAAAATCGGGTAAGGG
GGTGGAGGATAAGTTGTCCAGGGGTCCGAAAAAATGTTCTAAAAATTGCT
TTGTCCAGGGGGTAAATCTGCGATGCTAGTAAATTTTTATGTCCAGGAGA
TTAAATTGATGATTGTTCATGGGTATAATCCATGTCCATGGGTTTAAAAA
TGAAAATGCCCAGGGGTAATTCCCACCCCCAATGAACGGATTTTTTCTGG
AAGACCTCATATTTATGTTGATTCACAATACCACAAACTACCTAGTGAAT
ATGTCTTCTAAAGTTAATTCTTTTGCCCTGATTATTTGGAATTAGTTTGC
AACTAGGACATTCTCATTCCAACCCCATCGTTTATAGATTTGGTTTGATT
TGATTTCGTTTGATAGATTACTTATTCCAATCCTCCTGCGTTTTCAAAAG
TTTTACAATCTGGAAATCTTGCTGAAAATCTGGATTCAAAGTGTACTGTG
TTTGGACAAAGACATAACAGTAGCTATATAAACATTAACTTGATTTCATT
TTTTAGTTGGAAACAGAACTGCAGAAGGATTTGACTCAAGCAATGCTGAA
TAAATATGGTGAATCTGGTGAAGGTGGTTTGACTAAGGCTGTAGATGATT
TTCAAAGAGATTTTCATTGTTGTGGCATTGATATATATACTGATTGGAGG
GGTTCTAAATACTATCAAAAGTTTGGTAAATTTCCGCAAACTTGTTGTAC
AGATGGACTAACAAAGGCATGTCCCACTGAGGTTGTTGCTGAATGGCATC
GTGTTTACAAGCCTGAAGTAAGTGTTTTTAATGGGATAGTTTTACTCTAC
TTCCTGTTAGCATAGCTTTAGATTTTTTTTCTTTTAAAAATAATTACTAT
CTTATTGAAACTTAACCTATTGCAAATTGGTTCAGACTTTTGCATTTCAT
TTAATATTCAACATTTTATTATTTTTGTAGGGATGTTACATCAAGCTGAA
AGATTTCTTGAAAGATAATTTCCTTTATATTGGAGTCACTGCAATCGTCT
TTGCAATATTCCAGGTAAAAGAAAAAATGCTGAGTTTGTCAATAGTTTGA
AATTTGTTCATCATTTTGTGAAGCAATTTTTGTAGAAAAAAAGCATCATG
ATATAAAGTTATTTTTAAAGTTCTTTAAGATTTCTCTTGATGTACTTAAA
ATTTGATTCCAGATAATACATCAGTAAATACCATTCAATAAAGCTTCATA
GATTGACTTCAGATTCCGCAATTTTTTTCTTTATAGGTACTGGGAATGAT
ATTTTCAATGATTCTTTACCGAAGCATTCGATGAGGAAAATAATGGAGAG
AGAAAATTGTCTGTATTGCATTGTTCTGGAAACAGATGACGATGGTATTG
GAAGGATAGTGATTGTATCTTGCTGCTCCTGGTGAGGCATGCAGACTCCA
GGCTATTGGTGGTCATATGTTTGGTTGACTATGTTAAGATGGAGATATTG
TATTGGCCAGAAAGTTTAACATATTAAATGCTGGTTTGATTTGAATTACT
ATTGTGGATTGGAAAGTTTTTGAATTCAAAGTGAATAAAAATGAACTATC
AAAAACTGTTAAAAAAATGTTTTGGGTGTTGGAAGTGAAAATTTATTGAG
AAAATAATACAATCTACTTCACTATTTCATTGGTTTTTAATTGTTTTTAG
TTTTCATATATATTTTTTTAATTTTGATTTATTAAACTTATTTAGATTCA
TACCATGTCACTATCAAAATGTGTAAAAGTATCTATTATTGATTTTTGTC
TTTAAATACTTGTGCTGTTTTCATAAAATATGAACTAATCTTTTATATAT
TTTTTATTTCCACTTATCTTTAAGTCGGCTACTGTAAATATCATTTTTCT
GCTTTTTATCAAAAATTCTGTTTATTTTTATTAAGGTAATATTTATTACA
TTTGATTATATAATTCAAAAGTATCAAAAGATTTTCCACCTTTCTTCAAT
TTTGTTTATAATGTAGATTTTAACTTCGATTTTAAGCTTCCTTTATTATT
TGGGATGACACTTCATGGTGCTACAATAATTCCTGGATCCTCCTTTCTGT
ACCTAAACCTTTTCACTGGAATTTTATAATGTATATTTAATGAGATGATT
ACTTGATATATTTTTTGGTCACGATTTGTTCTTATCGCAATCGTTTAGCC
TTACATTGTTTTTCACTTCATATTTGTCGAAGGTTCAAACAGCTGAACAT
AAATAAGTATGCAATCAGCTAGCTATTGTAAATCCC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000006_pilon:1615560..1621445- >MSTRG.1309.2.p1 ID=MSTRG.1309.2.p1|Name=MSTRG.1309.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4302bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:1615560..1621445- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTACTGGGAATGATATTTTCAATGATTCTTTACCGAAGCATTCGATGAGG
ATGTTACATCAAGCTGAAAGATTTCTTGAAAGATAATTTCCTTTATATTG
GAGTCACTGCAATCGTCTTTGCAATATTCCAGTTGGAAACAGAACTGCAG
AAGGATTTGACTCAAGCAATGCTGAATAAATATGGTGAATCTGGTGAAGG
TGGTTTGACTAAGGCTGTAGATGATTTTCAAAGAGATTTTCATTGTTGTG
GCATTGATATATATACTGATTGGAGGGGTTCTAAATACTATCAAAAGTTT
GGTAAATTTCCGCAAACTTGTTGTACAGATGGACTAACAAAGGCATGTCC
CACTGAGGTTGTTGCTGAATGGCATCGTGTTTACAAGCCTGAATTCTTTG
TGTTACTGGTGATCATATTTTTGCTGGAAATTGCTATCGGTATTTTCGCT
TATGTCCAGAAAGACGATTTGATTGGCTGTGCCATCCTTGGACTTGGAAT
ATGGTTGAAAGTTGAGAAAGGTGATTACGTAGACATCTCCCAATATGATT
ACCTGTCAGCAGCAAATGTGGCAATCGCTATTGGTTCTGTTATTCTGGTC
GTTTCATTTCTTGGATGTTGTGGCTCCATCAAAGAAATTGCTCCTATGTT
GATCGCAATGTCGAAATCTTGTTCATGTTTGAAGTACCTTCTCTTCATTT
TCAACTTCTTGTTCTTTGTACTGGGAATGATATTTTCAATGATTCTTTAC
CGAAGCATTCGATGAGGATGTTACATCAAGCTGAAAGATTTCTTGAAAGA
TAATTTCCTTTATATTGGAGTCACTGCAATCGTCTTTGCAATATTCCAGT
TGGAAACAGAACTGCAGAAGGATTTGACTCAAGCAATGCTGAATAAATAT
GGTGAATCTGGTGAAGGTGGTTTGACTAAGGCTGTAGATGATTTTCAAAG
AGATTTTCATTGTTGTGGCATTGATATATATACTGATTGGAGGGGTTCTA
AATACTATCAAAAGTTTGGTAAATTTCCGCAAACTTGTTGTACAGATGGA
CTAACAAAGGCATGTCCCACTGAGGTTGTTGCTGAATGGCATCGTGTTTA
CAAGCCTGAATTCTTTGTGTTACTGGTGATCATATTTTTGCTGGAAATTG
CTATCGGTATTTTCGCTTATGTCCAGAAAGACGATTTGATTGGCTGTGCC
ATCCTTGGACTTGGAATATGGTTGAAAGTTGAGAAAGGTGATTACGTAGA
CATCTCCCAATATGATTACCTGTCAGCAGCAAATGTGGCAATCGCTATTG
GTTCTGTTATTCTGGTCGTTTCATTTCTTGGATGTTGTGGCTCCATCAAA
GAAATTGCTCCTATGTTGATCGCAATGTCGAAATCTTGTTCATGTTTGAA
GTACCTTCTCTTCATTTTCAACTTCTTGTTCTTTGTACTGGGAATGATAT
TTTCAATGATTCTTTACCGAAGCATTCGATGAGGATGTTACATCAAGCTG
AAAGATTTCTTGAAAGATAATTTCCTTTATATTGGAGTCACTGCAATCGT
CTTTGCAATATTCCAGTTGGAAACAGAACTGCAGAAGGATTTGACTCAAG
CAATGCTGAATAAATATGGTGAATCTGGTGAAGGTGGTTTGACTAAGGCT
GTAGATGATTTTCAAAGAGATTTTCATTGTTGTGGCATTGATATATATAC
TGATTGGAGGGGTTCTAAATACTATCAAAAGTTTGGTAAATTTCCGCAAA
CTTGTTGTACAGATGGACTAACAAAGGCATGTCCCACTGAGGTTGTTGCT
GAATGGCATCGTGTTTACAAGCCTGAATTCTTTGTGTTACTGGTGATCAT
ATTTTTGCTGGAAATTGCTATCGGTATTTTCGCTTATGTCCAGAAAGACG
ATTTGATTGGCTGTGCCATCCTTGGACTTGGAATATGGTTGAAAGTTGAG
AAAGGTGATTACGTAGACATCTCCCAATATGATTACCTGTCAGCAGCAAA
TGTGGCAATCGCTATTGGTTCTGTTATTCTGGTCGTTTCATTTCTTGGAT
GTTGTGGCTCCATCAAAGAAATTGCTCCTATGTTGATCGCAATGTCGAAA
TCTTGTTCATGTTTGAAGTACCTTCTCTTCATTTTCAACTTCTTGTTCTT
TGTACTGGGAATGATATTTTCAATGATTCTTTACCGAAGCATTCGATGAG
GATGTTACATCAAGCTGAAAGATTTCTTGAAAGATAATTTCCTTTATATT
GGAGTCACTGCAATCGTCTTTGCAATATTCCAGTTGGAAACAGAACTGCA
GAAGGATTTGACTCAAGCAATGCTGAATAAATATGGTGAATCTGGTGAAG
GTGGTTTGACTAAGGCTGTAGATGATTTTCAAAGAGATTTTCATTGTTGT
GGCATTGATATATATACTGATTGGAGGGGTTCTAAATACTATCAAAAGTT
TGGTAAATTTCCGCAAACTTGTTGTACAGATGGACTAACAAAGGCATGTC
CCACTGAGGTTGTTGCTGAATGGCATCGTGTTTACAAGCCTGAATTCTTT
GTGTTACTGGTGATCATATTTTTGCTGGAAATTGCTATCGGTATTTTCGC
TTATGTCCAGAAAGACGATTTGATTGGCTGTGCCATCCTTGGACTTGGAA
TATGGTTGAAAGTTGAGAAAGGTGATTACGTAGACATCTCCCAATATGAT
TACCTGTCAGCAGCAAATGTGGCAATCGCTATTGGTTCTGTTATTCTGGT
CGTTTCATTTCTTGGATGTTGTGGCTCCATCAAAGAAATTGCTCCTATGT
TGATCGCAATGTCGAAATCTTGTTCATGTTTGAAGTACCTTCTCTTCATT
TTCAACTTCTTGTTCTTTGTACTGGGAATGATATTTTCAATGATTCTTTA
CCGAAGCATTCGATGAGGATGTTACATCAAGCTGAAAGATTTCTTGAAAG
ATAATTTCCTTTATATTGGAGTCACTGCAATCGTCTTTGCAATATTCCAG
TTGGAAACAGAACTGCAGAAGGATTTGACTCAAGCAATGCTGAATAAATA
TGGTGAATCTGGTGAAGGTGGTTTGACTAAGGCTGTAGATGATTTTCAAA
GAGATTTTCATTGTTGTGGCATTGATATATATACTGATTGGAGGGGTTCT
AAATACTATCAAAAGTTTGGTAAATTTCCGCAAACTTGTTGTACAGATGG
ACTAACAAAGGCATGTCCCACTGAGGTTGTTGCTGAATGGCATCGTGTTT
ACAAGCCTGAATTCTTTGTGTTACTGGTGATCATATTTTTGCTGGAAATT
GCTATCGGTATTTTCGCTTATGTCCAGAAAGACGATTTGATTGGCTGTGC
CATCCTTGGACTTGGAATATGGTTGAAAGTTGAGAAAGGTGATTACGTAG
ACATCTCCCAATATGATTACCTGTCAGCAGCAAATGTGGCAATCGCTATT
GGTTCTGTTATTCTGGTCGTTTCATTTCTTGGATGTTGTGGCTCCATCAA
AGAAATTGCTCCTATGTTGATCGCAATGTCGAAATCTTGTTCATGTTTGA
AGTACCTTCTCTTCATTTTCAACTTCTTGTTCTTTGTACTGGGAATGATA
TTTTCAATGATTCTTTACCGAAGCATTCGATGAGGATGTTACATCAAGCT
GAAAGATTTCTTGAAAGATAATTTCCTTTATATTGGAGTCACTGCAATCG
TCTTTGCAATATTCCAGTTGGAAACAGAACTGCAGAAGGATTTGACTCAA
GCAATGCTGAATAAATATGGTGAATCTGGTGAAGGTGGTTTGACTAAGGC
TGTAGATGATTTTCAAAGAGATTTTCATTGTTGTGGCATTGATATATATA
CTGATTGGAGGGGTTCTAAATACTATCAAAAGTTTGGTAAATTTCCGCAA
ACTTGTTGTACAGATGGACTAACAAAGGCATGTCCCACTGAGGTTGTTGC
TGAATGGCATCGTGTTTACAAGCCTGAATTCTTTGTGTTACTGGTGATCA
TATTTTTGCTGGAAATTGCTATCGGTATTTTCGCTTATGTCCAGAAAGAC
GATTTGATTGGCTGTGCCATCCTTGGACTTGGAATATGGTTGAAAGTTGA
GAAAGGTGATTACGTAGACATCTCCCAATATGATTACCTGTCAGCAGCAA
ATGTGGCAATCGCTATTGGTTCTGTTATTCTGGTCGTTTCATTTCTTGGA
TGTTGTGGCTCCATCAAAGAAATTGCTCCTATGTTGATCGCAATGTCGAA
ATCTTGTTCATGTTTGAAGTACCTTCTCTTCATTTTCAACTTCTTGTTCT
TT
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000006_pilon | genome | sc0000006_pilon:1615560..1621445 - |
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