MSTRG.13032.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13032.2.p1
Unique NameMSTRG.13032.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000101_pilon:480110..494162-

Legend: exonpolypeptideCDS
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>MSTRG.13032.2.p1 ID=MSTRG.13032.2.p1|Name=MSTRG.13032.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14053bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000101_pilon:480110..494162- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GATTGGAATAAGCGGGGGGTTGGAAAAACTCTCAAAACTTAATAAGCGGG GGGTTGGAATAAAAATGTCCTGGGTGGAAATTTTTTGAAAAGGAGGCTAA TACAGCAGAATTAGGATAAAAGAGGGGAACTTTCAAAAACATTTTCCCAA AAATTAATTAGCGGGGGGCGGCTATTAGGTACCCGAGAGTACTTAAGAAA CTCTGTCTTTTTTCACAGATTTAGCAATATCTTAAACAATCCTGCATTGA TGCCAAAACACAGCAGGAACAAGAAAACACATTCCATAAATATTTTTACA CATATCTTGATTTTGCTGGTTTGTTTTCTACCAAAAAAGCAGTTGAAAAC AAAACTAAACAAGGCAAAGTGGGCCCACTAGTTGAGATGTGTCAAATACC ACCTGTTCAACTATAAAATTGATTTTTCTTGCAAAACCAGCAACTACTCT TTTAGGTTTCAAAGAAACGCCCCTCCCCCCACTTGTAAAAAAATTACATA GGTTATTTACTTTTTATTTTTATACAATCTTATAATTTGTATGTATGGAT AATGGGTCTTAGGACCTTTTGATACTTAAAATATAGATAGATAGATAGAT AATTAGATTTTGGAAAATTTTCCAACCCCCTGACCTTATTAGGACTCACT AGGATAAAATTTTTAAGAATATTTTCAGCTTTCCAAATAAAGTTTCCTTA TTTTTGTCTAAACAGCTTGATTTTAGCCTACATTTTGCCTTATTTTTGGG TTTTCAGAAGTAAATTTGCAAGCCTCTGCCAATTAGCCCCCTCCCCCTGC AGCTGAAATTGTTCTTTGAAAATTTTCCACACTTTATTTCTTTCTCATGC ATGAAAACTTTCTTCAAAGATCACATTTTTTGGATTTTTCCCGCATATTC AAAATTTTGTTTCCCTTTATTTTCTGAAAAAAAATTCAGTTTAGACAGGA 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CCATACTGATTGAGCATACTCTAAATGTGGTCGTACAAAGGTGGTATAAA GTGTCTGGAATACGTGAGGACTAGGGTCTTGAAATCCTCTTTTGAGCAAT CCCAACATAGAATTAGCTTTGTTTACTTGCTTAGCGATATGTTCTTCAAA TGAAAGATCTGAGTCTATCAAAATACCGAGATCTTTTTCTGTGAAGACAT GTTCAAGTTGCTCTCCATTTAGTTGATACGGGTGTGCATGCTTTATGTTC TCGAATTACTATCGTTAAAACGTGGCATTTGTCGGGGTGGAATTTCAACA GCCACTCATGGGACCATCTTTCAAGTGCTTCAATGTCATGTTGTACGATT AAGGAGTCAAGAATGGAATTGATTTCCTTTATAATCTTCGTGTCGTCTGC AAACAAGAAAATGCTTGATAGAACATGTTCTGGTAGGTCATTAATATAAA TAACAAAAAGCAGAGGACCGAGCACGCTTCCTTGAGGAATGCCACTTATC ACTGGATCTAAAGATGATTTTGCACCATTAACACTCACTAATTGCTTGCG GTTCGATAGAAAAGATTTGATCCAGTTCAGAATTAATTCGTTTATCCCGT AGCGTTCTAGTTTCATCATAAGTCTTCGATGGGGTACCGTGTCAAATGCC TTGGCAAAGTCGAAGTATATGCAGTCGACCACTTCACTTTTTGCAGTTGA TTCGCAACAAATATCTATAAGGAGATAAGCTGTGTGACTGTTGACCTTTT GTTGATGAAACCGTATTGCTTGTTCGATAAAGCTCTTCGCTGATAAGGTG TTCCATGATATGTTTTCGTATCATTGTTTCCATCAACTTACAGACTACTG AAGTTAGACTTACGGGGCGATAGTTAATAGCAAGGTTGCGTGCTCCTTTG TTTTTATAGATTGGTGTCACATATGCTAGTTTCCAGTCACTAGGTAAGTT 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CATTCGTATGTTGGAAAAGGAATGAATCACGTAATGCTTCCAGGAATTGC TCTTCTTTACTTTCCTCTACATGTGGGCTTGTCCAGTTCTTCCAATTAGT TGGAAAATTGAAGTCGCCAATGATGCAACGATGCGTGTATCTCTTATCTT CTGATATAATTCGTAAGAGCTGGTTAAGATTGGCATTATTTTCTCCAGAG TTTGATTGATTCGTTGGACTGCGGTAGACGCATGCAAAGCAAAGCATATC TTTTCCAGTCAGACGTACTTCAATGATGCACGCCTCCTCCAGTGCTACAG GACATTCAATGTCAACTGTAAGGTGGTCTACACTGGTATGTCCTAGGATG ACGATACCACGTCCTGTATTGTTCTCAGTATTGGTGTGGTTTACGACTGT GTATCCATCAATTAGATATTCGTGAATTTTCCATCTTTCACCGTTCTTTG GTTTGACTTCACAGATTGCAATAAAATGTGGATATTCTTTTGTTATGAGC TCTTCTAGTTGTAGTTTTTTCATTGTTGTTAGCTGGTCGGCATTTGTATA CATAATTTTTATTTCCGAAATTGTGTTTGATTGGTTCTCGTTTTTGTTTT TTGATACTTGTTTATGCGTTTCTCTTGTTTTTATTGGTGGTTTGCGACTT TGATCTTCTTCAGGTAAAAGCCGTTTTTTGAGTTGCCTCTCACACGATAG ATATAGGTTTCTGATTTCTCTTGTGAGTTTCTTGTTTTGGCTTCTGTTGA GAGTACCTTGAATTGTTTTCTTTCATCAGGGGTGAGATCCTCAGTAACGC TAATGCCTTTGTACGTCGCGTTATCCTTCAGTGCTGTAAGATTGCCAAGT AAATTCCATTTATCAGACTCATCGTTAAGAGAGACTAACAATGGACGTTT CTTTCCTTCTTCCTCCTTACCCAATCTTGCTACACGTTTGATAAGACTGC 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GATTTGGGATGCTAGATGTAACCGCAAGAATGGCTACAACATTCCTGTCA AAACAATAAGTGGAGGACATGTCTTGCCAGTCAAAGAATCAAATGCATTG ACAGGTTCTGGGAAAAAGAGAAGATCAAGACGTAACTCGATGTTCCAGGC TGTAAGTGAAAAATAATCCTTTGTCATTCCGTATCAGGGAATGTTTTAAA AATATATTGATAACTCGTCGACTGATCCACAAATTTTTCGTTTTGGAATT TACCTTTTCGATTCATTGATGTAATTCTACGAATAAGATTTCCCTTCAAA CAACTGACAATTCAATAGAGGCTTTCATATTTTGTCAGTTAGTTAACGTA AAGACTCTTCAAGAAAAAATTTTACATGGGGGATGGAGGATATTTAGTCC GGGGGGTAGCAAAAAATCATCAAAATTTGCCTTGTCCGGGGGATAAATTT GCTCTATCCGGGGGTAATTTGGGGTGTCCGGGGGTCAGCAGATGCTTGTC CGGGGGGTAAAACCTAATGTCCGGGGGGCCAAAAGTCACCCTGTTCGGGG GGTTAATCACTTAAAATTGTTTATATCCTCCATCCCCCATGTACAATTTT TTTCTGGGAGAGCCCATTATGGAAGCAAAAGCCAGAATTCGTAGAGACGA ATACACATGTCCTTACACAAATACAACATTTGCTTTTATAATGGTGAAAT TAGTGTAACTTAATCAAACTCGAAATCTCTCTTGTCATTATATCTGGAGG ATGGGTTAGTTTCCTTTAAAATACCTTTATTTTTCAAGTAGATCCGATCA GCGCCCCGTTTGTTTGTTCTTCTTCAGGATGCTAAAGCTAGCGTAACATC TGCCATCTTCTTGGGCTCCAAAACAGTGATATCAGCAGGTGCATGTGATG GTGTGATCAAACAGTGGGATCTACGCAAGTCTTATGCAAACATCAAAGGA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000101_pilon:480110..494162-

>MSTRG.13032.2.p1 ID=MSTRG.13032.2.p1|Name=MSTRG.13032.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=8775bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000101_pilon:480110..494162- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CAGTCCCTATTCATACTGTACCTTTCCCAGGATCTGGCCCTCGTGTTCAT
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AGCTGATGAAGATGGACACGTTAAACTTTTAGACACTCGAAAGACCAAAA
ATAATTCCCTTATTAAAGGTTGCCTTGCCACCTTTCGTTGCAAGGTTCAG
TGAAAATTTTCCATCCAAGATAATCAATGGATTTACGTCCAGTACTCATG
ATGAGTATCCTATTGAAGGAGAAATGGGGTTCAATTTGACCCTGGAATGG
CTATCTACCTGTCTACTGGCAAGAAGCTACAGTTCATTAGTCGCCAACTC
CAGTATGTCACGTATCTATGCTGTGTGTGCCAATGATGTCGTTTATGAAT
ACTCCACCACCAACAATGCCACAGTACCGATGGCTACTTATAAAAATCAC
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TGCTAAAGCTAGCGTAACATCTGCCATCTTCTTGGGCTCCAAAACAGTGA
TATCAGCAGGTGCATGTGATGGTGTGATCAAACAGTGGGATCTACGCAAG
TCTTATGCAAACATCAAAGGAGAACCAGTCCCTATTCATACTGTACCTTT
CCCAGGATCTGGCCCTCGTGTTCATGACATGTTTGTAACTGGTGCTAGGG
ACGGTAAGATCATGATTTGGGATGCTAGATGTAACCGCAAGAATGGCTAC
AACATTCCTGTCAAAACAATAAGTGGAGGACATGTCTTGCCAGTCAAAGA
ATCAAATGCATTGACAGGTTCTGGGAAAAAGAGAAGATCAAGACGTAACT
CGATGTTCCAGGCTATCACAGCCTCAGGTGATCAAACAGCTCGCTTATGG
GACGTTGAAAAAGCAGAAACAACAGCCATTTTCAGAGGTCATACATGCAG
CTTGAAATCTGTCGCTGTAGCACCTCATTGTAAAGAGTGGTCAGCCCATT
CAAATGCAGTCTTTGATATGGCTTGGGTACAAAATGAATCCAAAATGGTA
TACTTTCTGGAAATATGCTTGGTGTAGCTGATGAAGATGGACACGTTAAA
CTTTTAGACACTCGAAAGACCAAAAATAATTCCCTTATTAAAGGTTGCCT
TGCCACCTTTCGTTGCAAGGTTCAGTGAAAATTTTCCATCCAAGATAATC
AATGGATTTACGTCCAGTACTCATGATGAGTATCCTATTGAAGGAGAAAT
GGGGTTCAATTTGACCCTGGAATGGCTATCTACCTGTCTACTGGCAAGAA
GCTACAGTTCATTAGTCGCCAACTCCAGTATGTCACGTATCTATGCTGTG
TGTGCCAATGATGTCGTTTATGAATACTCCACCACCAACAATGCCACAGT
ACCGATGGCTACTTATAAAAATCACGTGGTCAAATCATTTTATGTCAAAG
CTGCTCTTTCCCCTGATGATAGGGATGCTAAAGCTAGCGTAACATCTGCC
ATCTTCTTGGGCTCCAAAACAGTGATATCAGCAGGTGCATGTGATGGTGT
GATCAAACAGTGGGATCTACGCAAGTCTTATGCAAACATCAAAGGAGAAC
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GACATGTTTGTAACTGGTGCTAGGGACGGTAAGATCATGATTTGGGATGC
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GAGGACATGTCTTGCCAGTCAAAGAATCAAATGCATTGACAGGTTCTGGG
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AGGTGATCAAACAGCTCGCTTATGGGACGTTGAAAAAGCAGAAACAACAG
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TGAAAATTTTCCATCCAAGATAATCAATGGATTTACGTCCAGTACTCATG
ATGAGTATCCTATTGAAGGAGAAATGGGGTTCAATTTGACCCTGGAATGG
CTATCTACCTGTCTACTGGCAAGAAGCTACAGTTCATTAGTCGCCAACTC
CAGTATGTCACGTATCTATGCTGTGTGTGCCAATGATGTCGTTTATGAAT
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GTGGTCAAATCATTTTATGTCAAAGCTGCTCTTTCCCCTGATGATAGGGA
TGCTAAAGCTAGCGTAACATCTGCCATCTTCTTGGGCTCCAAAACAGTGA
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TACTTTCTGGAAATATGCTTGGTGTAGCTGATGAAGATGGACACGTTAAA
CTTTTAGACACTCGAAAGACCAAAAATAATTCCCTTATTAAAGGTTGCCT
TGCCACCTTTCGTTGCAAGGTTCAGTGAAAATTTTCCATCCAAGATAATC
AATGGATTTACGTCCAGTACTCATGATGAGTATCCTATTGAAGGAGAAAT
GGGGTTCAATTTGACCCTGGAATGGCTATCTACCTGTCTACTGGCAAGAA
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ACCGATGGCTACTTATAAAAATCACGTGGTCAAATCATTTTATGTCAAAG
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CAGTCCCTATTCATACTGTACCTTTCCCAGGATCTGGCCCTCGTGTTCAT
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TAGATGTAACCGCAAGAATGGCTACAACATTCCTGTCAAAACAATAAGTG
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AGCTGATGAAGATGGACACGTTAAACTTTTAGACACTCGAAAGACCAAAA
ATAATTCCCTTATTAAAGGTTGCCTTGCCACCTTTCGTTGCAAGGTTCAG
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ATGAGTATCCTATTGAAGGAGAAATGGGGTTCAATTTGACCCTGGAATGG
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GGGGTTCAATTTGACCCTGGAATGGCTATCTACCTGTCTACTGGCAAGAA
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GACATGTTTGTAACTGGTGCTAGGGACGGTAAGATCATGATTTGGGATGC
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ATAATTCCCTTATTAAAGGTTGCCTTGCCACCTTTCGTTGCAAGGTTCAG
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CTATCTACCTGTCTACTGGCAAGAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13032MSTRG.13032Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13032.2.p1MSTRG.13032.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13032.2.p1.exon9MSTRG.13032.2.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13032.2.p1.exon8MSTRG.13032.2.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13032.2.p1.exon7MSTRG.13032.2.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13032.2.p1.exon6MSTRG.13032.2.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13032.2.p1.exon5MSTRG.13032.2.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13032.2.p1.exon4MSTRG.13032.2.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13032.2.p1.exon3MSTRG.13032.2.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13032.2.p1.exon2MSTRG.13032.2.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13032.2.p1.exon1MSTRG.13032.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000101_pilongenomesc0000101_pilon:480110..494162 -