MSTRG.13029.1.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13029.1.p2
Unique NameMSTRG.13029.1.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000101_pilon:414018..426985-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13029.1.p2 ID=MSTRG.13029.1.p2|Name=MSTRG.13029.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12968bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000101_pilon:414018..426985- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ACCTCTGCTCCCGCCCGCCTTCAACTACCACTCCCAGGGACACTCGGTTT CGAAACAACGGTATGTGCTGCGCAAAATCTGCTTTTCAAAATCGTACCCT TACAGTGCAGCTCATAATGGTAATGGCTGAAAAGGTACCATTTCAGTGCA TTTTCTCTTGATTTACCCAACCCTTTGCGTGAAAGAAGAAGCTTGGGAAA TTTTCTGTTTCAAAGAAAACTGAGAAAATTATTCTTGTCAGCTGTAATCA TCAGACAATAGAAACTTAACAAACGAGAAGTAAAAACCTTTCTTTTTAAT TTGTTTTAAAATTCGACCCTTGCAGTGCATTCTCACAGACACACACTCTT ACAGTGCATTTTGAGATGCTGAAAACCCCACCCTTAAGCGCGGCACATGG CGTAGGCCAGATCATATATAAGTGCTCCCCCCGGGCTACCACTACATCAA CTTTTAATCTCACTGACAATCCAAATAATGTTTACTGATTTGGACTAAAC CGAAATTTTGATGAGATGTGGGAAAAGGAAACTAATGTAGTTATTTTATA AACTTTTAGCTGAAGGAGACAATCCATCTTTGGCAAAATGTTATGTAACA CAGTACAAAATCAATGCTAAAGACCACCCTACCTATAATCTATCACAGCA TTTTGATGATGTTGCTGATAAAATAAGTAAATCACATTGTTTTTGAATTG ATTTTATATTATAGTAATCCTGAATACATAATTGGGTTGATTTGGGTGTT TTACAAAAACTATAAGTTTGGTTTGAAAAACAACAAATCACACAAATGAA TTTAATTTTAAAAAGTGATTTGTTTCAAAAAACAAGACAAAGGTTTTTGA AAAAGACACCAGTCTAGTAACATATAATATAGTATCTCAATATAATCTCC AGTTGAGACAAAAATGATAGAACTTGAATTATATCAGTTTTGTGAAAATA TATTCAGCAGTAGAAATATTATATCAAATAAAAAATTGAAACAAATTGCA GAAATTGGAAAATGAAAATCAGAAATGAAGATGAGAATTTTTTCGTAGAA TTGGTATCACCATTTTCATAAAGAAATATGTTCAGTCTTAAAACGTGATC AAAAAATATTATTTCAAAAAATTTGGTTTTAAACTTTTGTCTGATTGACT AGAAAAACCCCGGGCCTTTTTTATATTTGGTTAAAACCATCCGTGGTTAA AACTGAGTATAAACAAGTATAAGTCAATTAGTGAATTTTCTTTTTCATTA TTCATCTTCACTTTCCAATTTTTCAAGTTTTTTTTATTTAATACACTCCA TTCCATTCCTCCTCAACAAAACTAATTCAAAAGTTGCGGTCTTTTTTGTT TCACCTCCAGATTATTTGGAAACTACTTTTAGTAACGGTTAAGAGTTTTT TCTTAAATTTAATCTTTCAGTTTTTCATTCATTCAGAAAAAGAAACTACA GAGAAGAATGGGAAAGTTTACATCCATTGTATTGGAGGTATAAGCAGGTA GGGTAATGTAACCATCATTTTTCGTCCCTAATCTCCCAACTTTTTCCTTG TGAATAGCAAAATCGAGATCTTGAATATAATTGATAAAAGTCATTATTGT AGCGAGTAGTTATAATTTCCTCACTATATCTATAATTTAGGTAGTATGAT CAGGTATGATAATACATGCATTTTTTTATAAGAATACACTTTATAAATAA ATGTCCAATGAAAATGGCCAAAAACTTAAGAATATGCTAAGAATATCACC ATCATGGAATTTGGCAGATAAACCTAAGAATTCCATTTTTAGAGCATGCT CAATTATAAATTGTCAATTACCCCCAAGTAAGCCTCACTCCTTTCACAAA AATGACATTCTATCCTTGAGACGTATGTACTTATGTTAAATCTAGTCTGA ATTAGGATCTTAACCTAAGAATACTGTAAGAATATTTTAGAATGATTTTC CCAAAAAAGTTGAGAGATGAAATGGATTTACACCATTCTTATAAAAAAAG CGTGTATATAAACTATAAATTTGACGAATTCTTTGTTTTCCAAAAAGTAG TAGTGGCAAAAAAGTGAAATGAATGAAGTTTCCAGGGTTTACTTTCAAGT AAAAAGATCTCTAATTTTCGAATCTTTTTGTTTCCCCTCAACAGGGCTCC TTCCCTGACCTTGGCGTACTTGATGAAGCATGAAAAAATGACGTTAGTAG ATGCTCACGAACTTGTTAAGAGTAAACGGACGTTCGTACGACCGAATCTC GGTTTTTGGAAACAATTGATTGACTATGAATTGAAGTTGTTTGGTTCAAA CACAGTCACTGTAATGAACCACGGGAAAAGTAAGTTTTCAAATACTCTTG TAATATATCTTATCGTCAACATGAAGAATATGAGCAATCTGATTGGCTAA AAACGCGTACATAAATGCTATATTTCTTATTATTCAAGTTGACGATAAAC CAGATATCACACTTTAACTTATAACACTGTAACTCGTACCATAATGGATA TATTTTTCTCGCCTAAAGGCTCGGAAAGTATGACGAAATATCTGAACTCG AAAAATATATCGCATATTGTACTCGGTACCGTGCGATAACTATTACTTCT GAATGTTACGGTCCAAAAGAAAGGGATGGTTTAAAGAAATTATTAATATG ATTGGAGAGTGGGTTTACAATTTAATATCTTCGGGTGACGCAAGAATAGT AGGGTTATTTAAACAGAAGCGTTACGGGTGCCGAACTGTGCCATCGGATC GGCTAAACTTCTCACCTTCATGATTCCTAAATATGGTTTTTCAAAGCTAC ACACGTGTCGATCCGCAAATATAGTATAGGGTTGACCTGATGCTGTTTCC GTACTGTATACGTGTTCGTAAAGTCGGAATGGAATACACTCTTCTCGAGA TGCATAAATTTATTGTTGTCCTCGTTTTCAAACAGATTTTATTGCTATAA AATTACATATTCACAATGATAATTGTGTTGTTTACACCTCATGAGACATT TTGAAATTCAAGTACTTTTGTTTTAGATATAATGTTTGCCTTTTGGGAAT TTAAATTGGTTTAAATGTATAATTTCATAGCAATGAAATACAATGAAATC TGTTTGAAAACGAGGACAACAATAAATTTATGCATCTTGAGAAGAGTGTA TTGATTTATAGAAATGTTGTCATTGATACAACCCTTACAATTTAATTTCT GGAATTGAAAAGTCTATAGAATCGCTTTGAGAATTGATATTGTAATGTGT ATATCTATTAAATGGATGTCCACTGAAAAGAATTCGTCCCAAATACATTT TGACAAAAATAAACTATCTAGAATTTAATTTCGACACTTATCTTCTACGG GAAGACGATTGAAACTCAGGAAAATCCCACTTATATAGAAATGTTTACTT TTTCGTTACGAAAATAGAGCGGAGGAGATCAAAGCTGTAGAATTATTTTT ATTAAACCGCTTTCCTATCATATATCTACTTTTTTTACGTTTCAGCTGAG TATGCAAGTGTTTATGCAAAAGATTATCAAAATATGGTGACCTGAGAATG CTAGCTGTGTAAAAAGAAAACATCACAAAATTTGATCCGACAACATTGTT CTTAAAGGTCAAGTAATATTGATATCTATAAGGAAATGTAAGAAATACAA TAATAATATATCATTGTGTGTAGATATCAGATATCATATTCTTGCTTTAA AATTTACATGTGAATATACCACCTGTAATATACTTTTAAAAAATGTTACA TAAAATTTTACATTATTAATTTCTAGTGCAGTTGGTCCTAGTTTTGATCT CATGCAAAGATAATTATTATTTCCCAAAATTAGAAAATCGAATTAATTTC AATAAGTCCTTCGTAAGTCTTTATACTACTCTTAACTTCTATATTCAGGA ATATTGTTTAAAGTTTCTCTCAAAGCGGTGTATGGGTATAAAAACATTTA GTAAATTTATTAAAGTTATAAAATAACTAAATTATTTGTTATTAGTTAAA CTAATTAATTTTATCTATGCCGCTTTCTCAGTTCGATCAGCGATAAATTT GTCGACTTGTCCTTCCACAATGAACATGGGTACATCACCTAACGTACACA ACATTGTATGAAATTCACCCAAATTGAATTTCTTACCCAAGCTCTCTTCT ACCTTCTTACGGAAACTCTCAAACTTATCGAGGCCGTATTGATAGGCAAG AGACTGAGCCGGTAGCGAGATATACCGGTCGACTTCAACTTGGCATTCTA AGGCATCCATTACACAATTATCTAGCATGAATTGGTAAGCCTTCTCTCTC GACCATCCATACAAATGGAGACCAACATCCACCACATAACGACAAGCTAA TTCCATATCTCTTGAAATATTACCAATATAATCATAATCATCGTCATAAA GTCCTAGATCATGACCGATATGTTCTGCATAAGTAGCCCAACCTTCATGA TAAGCTGACTTCATACCAACGTGTGCCGGTAGATCCCAGTATCTCAATTC ATCCGCGAAACGTCGGTAATCACGAAGGTCGGATTCTGCGGCAAGAGCAA GTTGGATATGATGACCTGGTAAAGCTTCGTGAAGAATGATGGCTGGAATG TCATACTTTTTTCTGCTTTTTGGTGAATATGTGTTCAAAATGAAGAGCCC TGGTCGATCTTTCTCTAGATCTCCTGCAATGTAGGCTCCTGCAACATATT CTTTCTCGATTTCCACGGGTGCTGGAACGATTTTGTAGGGCATTTTTGGA AGCTTGGAAAAGACTTTCGGCAAAAGGCTGTAAATGCGTTCACTTTCCTT TTCGTAGACTTCCATCATCTCTTCGCGTGATGAAAAGGAGAATTTTGGAT CTGTTCTCAGGTATTCGATGAATTCACGTCGTGTACCTTGGAACCCGACT TTCTTCTGTTGCTCTTCAAGTTTCTTTGTCAGCACTTCAAGTTTTTCGTA TCCTGACTTGAAGATCTTTTCGGCGTTCATGTCAGAGCCAGTGTGGAATT GTACGTATGCCTCATAGGTTGCTGGTCCGTTTGGTAGTGTTCCAACGCCA ATCCCTGGACGTGCTTTTGGTACGTATTGGTTGCGCATGAAGTCAGAAAG GCGTTTGTAAGCAGGTAAGGCGTAATCTCCGATAACTTCTTTTGCTTCTT TGACGATTTCGGCCCAGTCTTTATCGCTCATTCCAGATGGTTTGGTTTTG AAAGGTACAAACAGGCCAGATTCGGTGACAGGCTTTTGGCTGACTTCTAA CAATGAATCGGGGTACGGCTCAACAGTTTTGATGTAAGCCGTTTTACCAA GACGTATTCCTTCAGTCATCAGTTCGATTGTTTGGCTGATTTGACGTGGG AAATGACGAATTCGAGCCAGAATCTTCTGAAAGTCATTCTTTGTCTCTTT GAGCATCCAAGATAAGAGAAGGGGGAATCGGATGTGAGGCCCATCGATCT GGTTCAAAGGGCAGAGATAAGTCTGATGGGTCAATCCTTCAAGAAATGTT TCAGTATCATGCTGAAGATAATCTAAATGAATTTGACATTCATTTGATGG AGGGGTTTTCTCGGCCAATTTGCGGATTTTGTGAGCTTCTGCTAACCATG TTTTGGCATCATCTCTACGTCGAAGATATCCGTTTAAACTCATGTCCATT AATCGGTCATCGTGTTTGTGCTCTCCAACGAATGTGGCGAATTCCGGAAT 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TGGCAAATGACAGTGTAAATAAGTTCTTCCGTTTTTTGACTATTTGAAGT GGTTAACCCCTTCGGTTATTGATGAAAAATTATCAAAAATTGATTTCGAC AAGTTGTTATTTTGGCAAATTCTCTGAATTCGTCAATATTATTGCTCGTC AAAATACGTTTGCCTAAGATGATCTAGGATTGATATGCGGATTATAAATT AATTTATTACATATTCATGATTTAAAATTTAGCATCATATTTTATTTATT TTGTATTATTTATATGGAAATGATTTTAAAAATGAATTCGCAAGCAAAAT AATATTTTTATAAATGTCCCACTCACTGCCATTGGAAGTTTTCGAGAATA TCTTTTTTTGCATGATATAGTTGACCTAATCATCATTCCTGTTTACACCT GATTAGCATTCCTCTTGGCTTCTGATGCTCATCCTCTAGTGAAAAGAGTT TCTCATAGTATTCTTATAGGAAGTATATCTAAAGAGGTAGCTCACTATAA GAAAGCCAAAAAGCTTTTGGTGAAATAATTTGAAGTCTGTGTCAAAAAAG TATGTTTTTTTATTTTTGGTCATAGCTTTCTAAAAAGTGGTTGTATAATA AAATATTTAGTATCGTTG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000101_pilon:414018..426985-

>MSTRG.13029.1.p2 ID=MSTRG.13029.1.p2|Name=MSTRG.13029.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2580bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000101_pilon:414018..426985- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTGAGTATGCAAGTGTTTATGCAAAAGATTATCAAAATATGGTGACCTGA
GGCTCCTTCCCTGACCTTGGCGTACTTGATGAAGCATGAAAAAATGACGT
TAGTAGATGCTCACGAACTTGTTAAGAGTAAACGGACGTTCGTACGACCG
AATCTCGGTTTTTGGAAACAATTGATTGACTATGAATTGAAGTTGTTTGG
TTCAAACACAGTCACTGTAATGAACCACGGGAAAAAAAAAGAAACTACAG
AGAAGAATGGGAAAGTTTACATCCATTGTATTGGAGGTATAAGCAGCTGA
AGGAGACAATCCATCTTTGGCAAAATGTTATGTAACACAGTACAAAATCA
ATGCTAAAGACCACCCTACCTATAATCTATCACAGCATTTTGATGATGTT
GCTGATAAAATAAATGAACCTTGTTGCAGAAATTTTTGATAATCTATTTC
TGGGAAGTGCCGCTGCAAGAACTAAGTCATTTCTCAAAGATAATGACATT
ACATTGGTGATTAATGCTGAGTATGCAAGTGTTTATGCAAAAGATTATCA
AAATATGGTGACCTGAGGCTCCTTCCCTGACCTTGGCGTACTTGATGAAG
CATGAAAAAATGACGTTAGTAGATGCTCACGAACTTGTTAAGAGTAAACG
GACGTTCGTACGACCGAATCTCGGTTTTTGGAAACAATTGATTGACTATG
AATTGAAGTTGTTTGGTTCAAACACAGTCACTGTAATGAACCACGGGAAA
AAAAAAGAAACTACAGAGAAGAATGGGAAAGTTTACATCCATTGTATTGG
AGGTATAAGCAGCTGAAGGAGACAATCCATCTTTGGCAAAATGTTATGTA
ACACAGTACAAAATCAATGCTAAAGACCACCCTACCTATAATCTATCACA
GCATTTTGATGATGTTGCTGATAAAATAAATGAACCTTGTTGCAGAAATT
TTTGATAATCTATTTCTGGGAAGTGCCGCTGCAAGAACTAAGTCATTTCT
CAAAGATAATGACATTACATTGGTGATTAATGCTGAGTATGCAAGTGTTT
ATGCAAAAGATTATCAAAATATGGTGACCTGAGGCTCCTTCCCTGACCTT
GGCGTACTTGATGAAGCATGAAAAAATGACGTTAGTAGATGCTCACGAAC
TTGTTAAGAGTAAACGGACGTTCGTACGACCGAATCTCGGTTTTTGGAAA
CAATTGATTGACTATGAATTGAAGTTGTTTGGTTCAAACACAGTCACTGT
AATGAACCACGGGAAAAAAAAAGAAACTACAGAGAAGAATGGGAAAGTTT
ACATCCATTGTATTGGAGGTATAAGCAGCTGAAGGAGACAATCCATCTTT
GGCAAAATGTTATGTAACACAGTACAAAATCAATGCTAAAGACCACCCTA
CCTATAATCTATCACAGCATTTTGATGATGTTGCTGATAAAATAAATGAA
CCTTGTTGCAGAAATTTTTGATAATCTATTTCTGGGAAGTGCCGCTGCAA
GAACTAAGTCATTTCTCAAAGATAATGACATTACATTGGTGATTAATGCT
GAGTATGCAAGTGTTTATGCAAAAGATTATCAAAATATGGTGACCTGAGG
CTCCTTCCCTGACCTTGGCGTACTTGATGAAGCATGAAAAAATGACGTTA
GTAGATGCTCACGAACTTGTTAAGAGTAAACGGACGTTCGTACGACCGAA
TCTCGGTTTTTGGAAACAATTGATTGACTATGAATTGAAGTTGTTTGGTT
CAAACACAGTCACTGTAATGAACCACGGGAAAAAAAAAGAAACTACAGAG
AAGAATGGGAAAGTTTACATCCATTGTATTGGAGGTATAAGCAGCTGAAG
GAGACAATCCATCTTTGGCAAAATGTTATGTAACACAGTACAAAATCAAT
GCTAAAGACCACCCTACCTATAATCTATCACAGCATTTTGATGATGTTGC
TGATAAAATAAATGAACCTTGTTGCAGAAATTTTTGATAATCTATTTCTG
GGAAGTGCCGCTGCAAGAACTAAGTCATTTCTCAAAGATAATGACATTAC
ATTGGTGATTAATGCTGAGTATGCAAGTGTTTATGCAAAAGATTATCAAA
ATATGGTGACCTGAGGCTCCTTCCCTGACCTTGGCGTACTTGATGAAGCA
TGAAAAAATGACGTTAGTAGATGCTCACGAACTTGTTAAGAGTAAACGGA
CGTTCGTACGACCGAATCTCGGTTTTTGGAAACAATTGATTGACTATGAA
TTGAAGTTGTTTGGTTCAAACACAGTCACTGTAATGAACCACGGGAAAAA
AAAAGAAACTACAGAGAAGAATGGGAAAGTTTACATCCATTGTATTGGAG
GTATAAGCAGCTGAAGGAGACAATCCATCTTTGGCAAAATGTTATGTAAC
ACAGTACAAAATCAATGCTAAAGACCACCCTACCTATAATCTATCACAGC
ATTTTGATGATGTTGCTGATAAAATAAATGAACCTTGTTGCAGAAATTTT
TGATAATCTATTTCTGGGAAGTGCCGCTGCAAGAACTAAGTCATTTCTCA
AAGATAATGACATTACATTGGTGATTAATG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13029MSTRG.13029Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13029.1.p2MSTRG.13029.1.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13029.1.p2.exon5MSTRG.13029.1.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13029.1.p2.exon4MSTRG.13029.1.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13029.1.p2.exon3MSTRG.13029.1.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13029.1.p2.exon2MSTRG.13029.1.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13029.1.p2.exon1MSTRG.13029.1.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000101_pilongenomesc0000101_pilon:414018..426985 -