MSTRG.13023.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13023.2.p1
Unique NameMSTRG.13023.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000101_pilon:330227..353373-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13023.2.p1 ID=MSTRG.13023.2.p1|Name=MSTRG.13023.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=23147bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000101_pilon:330227..353373- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GCTTTAAAGAATAAAGGCCAACTTAGTAATGAGACTTTCCAAAACATAAA CATAAATGGTAGACCCAAGCTACCGGACGAAGTTTAGAGAAGACAGTTCC ATCCAATTTTCTCACACATTTTCTCCTTCAAGACATTCAAAGTTTGAAAG GTAAGAATATCTTTACGTTATTAGGGTGGTCAGGCCAAAATTTTCCCCTC AAATTTTGAAAGCCAAACTAATTTTATTTGAAAGTCCTTACCTTTGTGAG AAAAATGAGGGGTCATTTGTTAAAATTGGTTTCTTACTTTTACTAGTATT CCTAATTAGGAATCTTATTCTTAATTAGGAAGAAAAAAATTCCTAATTAG GAAGAAATATTTAAAAGTTTAATATCTCTGAAACAAGCTACATTCGCAAA TTCAAAGTATGACCAATAGATTCGGTATACCAAATATGATAACTGTGCAA AAAATTGAAAAATTTCATTCGCGGATGGATTATTAACGCCCCAAAAAAAT AATTCCAAATTAGGAATTAAACGAACTGCTGTTTGTATTATCACAAAGAA AAACAGAAAGTGAGTTTCCCGCATTTTATAAATAAGATGTCAATTTAGGA ATTTACTACTGGGAAAAGTGAAGCTTTTTCTAGGGATTATAGCTCGGTCC CCCGAGCAAGTCAAGAGCTCAATCTTTCTTTCCCACCTAAATGGAATGGT AAGAATCTTATGAAGTACTTTTTAACGTGCGATTTTTTCTATTTTTGGAG AAAATCTAGGTATCACGCCAAAAATGGCGGATGAAATCTAGTCTTCCGTG TGGCTGGGCGTGAGGAGTTTTGCTGGCGCGGTCTGAAAATCGGCCCGATG ACTGTTAAACTTTAGCCTATCGCTAATGAGCTGGAAATGATAGCTAAAAA CAAATTTTACCAATGAAAAGCTGAAACCCTTAGCTTTCCAACCATATATG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000101_pilon:330227..353373-

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TAAAACGAACAGCAAGCTTCGATGGCAGCGATCATTCGTCCGGACGTGGT
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TGATCCGGTACCAATTATTACCGCTGTCATAAGTATGCCGGTCAGTGAGG
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GCTCTGGTCATGACGACAATTGTGCTGGTAGCTCTTGACAATGCAGAAGT
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CTCAACCATAAATCTAAAGGATATAAAGCTTAGGTAGTGGGCCAGCAAAA
CTGGCATTTGAAATGCATTCACCCATAGTTGGATTGGAGAGAGTTGGCAA
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GATGTGGATTACCGGATCACTATCGCTTGTCGAGATGCCAAAGTCTACAT
GTTGAAAAATCAGTGGTGACGTGTATGGACACATTGATGAAGAGTTCCAG
TGATGAAGGATCAATCAGTTGTCTTGTTGTAGGCTCTGAAAGTAAAGAAG
TTTTCATCCTTGATCCTGAAGCATTCACCATATTAAGCAAGGTTATTGAA
TCTACCACCTGAAGAAATTGAAGCTTTCGCAGCAGTACACAAACACACCC
CTCTGAAAAAGCAGAGATGATGTCGGATCGTCTGGATTGACTGTTCGATC
TTTAAAGTGAATCCCATAGAGAAAGATTTGTGGAACCAATCAAAAGAGGA
GATGATTGATATTGCAATGTTGTATGAAATGCTCGCTTCTGTCAGCTATT
GCTGTTGCGTCTGGACCATTCATTTATATCTACAAAAATTTGAGACCATA
CTTCAAATTTTCACTTCCACTTGGTGATGCACATCTGTCATGTCTGAGAG
CGCCATCATTGATTTACCAACAGCTGTAGCCACTTTTCATATGGATACAA
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TGCATCGAGGTGATCCGGTACCAATTATTACCGCTGTCATAAGTATGCCG
GTCAGTGAGGCCATGGTCGTCGTATAGGTACCTCTACTACTACCAGGCAT
TGCATACACTTATGAAACATTTGTCGAATGCATCACAGAAAACGCTGTCT
CTGATAAAATCAAGGTTCAAGGCATAGGACCAGGTTTCAAGTTGATCATG
TCAGTTCAAAACACTTCATCCTCCTCACCTTCTACAGATCTTCTCCTTAC
TTTCATGGCCGATCATAAATTATATAAAATTGCTAAACCTAGTATTCAGA
AATGCATCAAGTGTTTCAATCAGATTTATTCAAAATACGACTGAATGCAG
CGCGTTCATTGGTCAAAACCATTCAAACAAGCTCTAACCCAGTATCTTCG
TCTTTTGATGACCCACTCAAATTATCTGCTCAGCTACGCCTGTTTCACAA
TTAGCTAAGATACCCATACCACGGAAAACGAAATTATTTGTCGATCAAGC
TTTACGTGAAAAGGAATGCGCCAAAGGCGGTGGTTTGATAGTGAAGATAT
TAAAACGAACAGCAAGCTTCGATGGCAGCGATCATTCGTCCGGACGTGGT
TCATGGTATGAAATTCGGACGTTTCGGGAGAGAGGATGGTGCTCTGGTCA
TGACGACAATTGTGCTGGTAGCTCTTGACAATGCAGAAGTACGAATATAT
AGGGATAAAGTACTGGCTAGTACACTTCATACGCAGGGTAAGAAGTTATG
GGCGAACCATTTACCAGCGCAAATCACCACTATGTCTACTCTCAACCATA
AATCTAAAGGATATAAAGCTTAGGTAGTGGGCCAGCAAAACTGGCATTTG
AAATGCATTCACCCATAGTTGGATTGGAGAGAGTTGGCAAAACTCTCGTT
GTTGGATGTATGGACAAGACTATCACTTGTTTCACGACGAAGCACAGTGT
CAAAAGTGTGCCGGTATTCATTGATGTTTCCGGATTGTTTGATGTGGATT
ACCGGATCACTATCGCTTGTCGAGATGCCAAAGTCTACATGTTGAAAAAT
CAGTGGTGACGTGTATGGACACATTGATGAAGAGTTCCAGTGATGAAGGA
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TGATCCTGAAGCATTCACCATATTAAGCAAGGTTATTGAATCTACCACCT
GAAGAAATTGAAGCTTTCGCAGCAGTACACAAACACACCCCTCTGAAAAA
GCAGAGATGATGTCGGATCGTCTGGATTGACTGTTCGATCTTTAAAGTGA
ATCCCATAGAGAAAGATTTGTGGAACCAATCAAAAGAGGAGATGATTGAT
ATTGCAATGTTGTATGAAATGCTCGCTTCTGTCAGCTATTGCTGTTGCGT
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TGATCCGGTACCAATTATTACCGCTGTCATAAGTATGCCGGTCAGTGAGG
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ACCCATAGTTGGATTGGAGAGAGTTGGCAAAACTCTCGTTGTTGGATGTA
TGGACAAGACTATCACTTGTTTCACGACGAAGCACAGTGTCAAAAGTGTG
CCGGTATTCATTGATGTTTCCGGATTGTTTGATGTGGATTACCGGATCAC
TATCGCTTGTCGAGATGCCAAAGTCTACATGTTGAAAAATCAGTGGTGAC
GTGTATGGACACATTGATGAAGAGTTCCAGTGATGAAGGATCAATCAGTT
GTCTTGTTGTAGGCTCTGAAAGTAAAGAAGTTTTCATCCTTGATCCTGAA
GCATTCACCATATTAAGCAAGGTTATTGAATCTACCACCTGAAGAAATTG
AAGCTTTCGCAGCAGTACACAAACACACCCCTCTGAAAAAGCAGAGATGA
TGTCGGATCGTCTGGATTGACTGTTCGATCTTTAAAGTGAATCCCATAGA
GAAAGATTTGTGGAACCAATCAAAAGAGGAGATGATTGATATTGCAATGT
TGTATGAAATGCTCGCTTCTGTCAGCTATTGCTGTTGCGTCTGGACCATT
CATTTATATCTACAAAAATTTGAGACCATACTTCAAATTTTCACTTCCAC
TTGGTGATGCACATCTGTCATGTCTGAGAGCGCCATCATTGATTTACCAA
CAGCTGTAGCCACTTTTCATATGGATACAAATGAACCACGCTCTCCAGAT
GAAGCTTAAAGTCTACAAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13023MSTRG.13023Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13023.2.p1.exon21MSTRG.13023.2.p1.exon21Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13023.2.p1.exon20MSTRG.13023.2.p1.exon20Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13023.2.p1.exon19MSTRG.13023.2.p1.exon19Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13023.2.p1.exon18MSTRG.13023.2.p1.exon18Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13023.2.p1.exon17MSTRG.13023.2.p1.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13023.2.p1.exon16MSTRG.13023.2.p1.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13023.2.p1.exon15MSTRG.13023.2.p1.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13023.2.p1.exon14MSTRG.13023.2.p1.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13023.2.p1.exon13MSTRG.13023.2.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13023.2.p1.exon12MSTRG.13023.2.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13023.2.p1.exon11MSTRG.13023.2.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13023.2.p1.exon10MSTRG.13023.2.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13023.2.p1.exon9MSTRG.13023.2.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13023.2.p1.exon8MSTRG.13023.2.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13023.2.p1.exon7MSTRG.13023.2.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13023.2.p1.exon6MSTRG.13023.2.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13023.2.p1.exon5MSTRG.13023.2.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13023.2.p1.exon4MSTRG.13023.2.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13023.2.p1.exon3MSTRG.13023.2.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13023.2.p1.exon2MSTRG.13023.2.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13023.2.p1.exon1MSTRG.13023.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13023.2.p1MSTRG.13023.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000101_pilongenomesc0000101_pilon:330227..353373 -