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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000101_pilon:102419..131681+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12995.5.p1 ID=MSTRG.12995.5.p1|Name=MSTRG.12995.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=29263bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000101_pilon:102419..131681+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) tttttaagtcAAATTATTTGGTATTAATATGTTTAAAGAATTGATCAAAT
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GAATAACACAGTGGCATATCCACGGGGGGATGGGCGGTTCtcccaaaaaa
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GAAGTCTTCAATACATAGTCTAGCGACAGTTTAATAGAAAAGGTGCCAGC
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ATTTGTTCTGTAATTGAATTGATGATTGGATTACAAAGAATCGGAATTCC
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GTTATGGTGATCATGGACCCTATAGCAACTCTCTTTACTATCGAGGCATC
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AAAACAAACCAATGTGTGAGTGATTTATAGATGCCCATGTGCTTGCTTCG
GAATCTGTAAAGCTTTACTATTACTTAGttgggcccccagcggtttgtgt
taatgcgtgaaaatccattttttattgcgtgaatgcgtgaatctgccctg
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CCTTTTAACCTAATCCATCGTCAAATAGGAGATCTACCTAAAGGGTTTAA
GCGCCAGTTCTACAGACAGGATGTGATGTGATGTACCACAGATGCAAGGT
AttgtaaaaacacacaaacgtATAACCCCAGAACTCATATCAATTGAAAA
AAGTGGACTAAAAAACCATCTCGAtgataaaaaaagagatttgcCATTCC
CGTTAGCACTTAGCCCCTTCAAGCTCCCCACCTGCTAAGAAATTCTCAAC
GGTTTATTGATgctacaggggtgtaaaaataaaaatgacgatTATTTAGT
TTTGCTTGATGACACCGATGGTTTCTTTGTAGCTGCCTGCTACGTAAGCG
AACTAGATGAAGCGAATCTGTAATGAACTAGATTACCCTTGTGGGTCAAT
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AATTTCAATCAGTATTTCAGAGCATgatttctagccttcggcttataTTT
CATTGCTATTGCTTTATACTCTACAATAAATCCTACATAACACATTACTC
AGTaaaatttcagactttttagTATTAAGCGAAAAGAATGTTCAGCTCGA
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tttaagttttgtacggtcaaattttaggcatttttcacggttttcggttc
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cattttatgacttttttgtaagcaaaaaagttgttcagcatgaaaaaccc
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AAGTTATAATTCTTCCGTCAAAACCATTAAAGGGGTCATTTGTACCGGAT
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tcgttttcaaaatcgtccaggatagactttttaagacctgggtttccata
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ggaaaatcggggaaatttattctgaaaatcggaaaatcggggaaatttct
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gaaagtaaaattggcccGCACTCAatatcccgtaatcttgatataggagt
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aagaccaaatTATGtgagataaattttaaaatcttgcaatttttttcgct
cgcttcgctcgcaataaaatTCTTTCACAATCtgccaatacactcttctc
gagatgcataaataaGCATTGCAGGTCTcgttttcaaatattgttgCCTA
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AATGCCCATTTTTCTGCcgtgaatacagttgacgctctctaaattGACGT
TCTACTCTTTGATTAGCTCCCATTTTGGATCCATTGGCGTTTTGACAGGG
GGCCATGCCTCCCAAAGTTGAGCTTTTTTGaacgccaaaatcttgaaatt
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cgccccccacagTGAGGATAGCGCTAAACttgaatttcccactgtaaatc
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gattataagaacaattcactTCTGGAATTTCCCTGCTTCTTGGCACCaga
aaatcagcagaaaatatGATGCAGGTGGGTGATgtgaacagaaaattttt
tcattagCCACCATAGCTACCTCTTTTACTTTGTCTCACAATTATCTACT
TTTCAAACTGATATCTTCCTGAGTGCACTAGATGTTAAGGCACACTAGAA
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GCAAACACCATTGACTTCAAAGCCCCAAGGGCTGGAtccgaaactcctgg
atggaaaatgaaTCCAATTATCTCCTATCCAATAGGTGTAacccagattg
aaagtaaaaccttTCACCGGATTTAGAAAAATATGccacttaaaaacaaa
aggctagattcaatctgtcattctaAATGTGGCGCAAATCTTACATAAGG
CTTCACTTtctcttgcttgagaaaggttacagattcatctctagcccctt
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aaatagtgaaaaaatcTCAGAAAAGTCAGGACAAGATTCTTAAGGAGAGG
TTTATATTGTATCCAAATAAGCTGCCTGAAATATATAGCTTCGCCTATAC
AGGGTGTTATAGCTGGAATTGGCATTCCTAGAACTTCTCTGCTTTAAAGA
CGGAGGGGTACAGGATCAGATATACAGCTTTCAAACGCCTATGTCAGCgt
ttaattgaaaaatttctaataTTGCTGATTTCTGTTGATGTCAGCAAAAT
CCAAACAATAATTTTTGCCGAAATACTCCTCATAATGTTTTAAAATGCTG
GTCCAAATTTCACTTCAAACaagagttattcaaaaaactagTTTTACTGG
cgttaacatttttttaatttttccacaatatcttttggctgaaaaaaata
ataacaataaatcCATTTCCCTAATCTATATGATATATCAATACGCTCCT
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GTGGCgaatagtttttttttgcagaCTGAGGGTTCTATACCATAGTGTAT
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TTTGACTGCTGAACTGAATCAAACAGTTATCAGCATTGTAAAGTTGGTAA
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GGATTTTGAACCTTGAAAATGGCATAAAGGTACTACTAATATCTGATATA
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ACGTATATTCTCTATGTTTGCCAAAAGTCATTTCTTTAGCAataaacaat
gataaaaagaaaattgtactATTGTGACGTAGCAgtttctaatttttatt
ttcaatttctagTTATCCATTAGCAACTATTGTTTCAGcataaaaagctt
ttttataaggCATTTAAATAATGCACTTTAAGAGGCtcattataaaaaag
cTtttatgTAGCGTTTGCTATTCATGCTTGCAAAAATAAGCTAAAACCAC
ATTAAAATATcgtgaaaaattataaatactCAAACTTTTGTCCCTgccga
aaataatcagaaaagtaaatcctcactgcaaaatactgtgctattttttc
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AGGCAGCAGCTGCATTTAACATCAATGTCGGAAGTTTTCAGGACCCATCT
TCAGTTGAAGGGCTTGCTCACTTTCTTGAACATAGTTagtgataattttt
ttctttcatttttgttgtCTGATTATTAAATAGTAGTTTTGATTCAGGTT
TTGGTCTTTACAACTATATTTCCATATAATTGTggtgtatttatttttca
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TCTAAGACTTTCCCagagattttttaaattgattccttattgttttattc
ttttcatAGACTGTGTTCTATTTTCATGCTCAGCCAGAAGGATTTGAAGG
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ATCTCAATGTCTCTAATGGGATCAAATTCTTctcattaaataaaaaaagt
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TCTATTTTCTATTTATCTGCCGagagtgctcgatgatatcagagcttgtt
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TTTCTTACAACCTTTTAGATTATCTTGAATAATGGAGacgttttgaatat
tttgtacTCTAATAGCCATTTACCCCTTTTTCAACAGAATTCAACGAGGC
ACTTCCAGATGATTATAATCGTTTGGAACAGCTTTTTTGCCATATGGCAA
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TTTTTAATATAACatcatttttttaactttagctCGTCCTCAAATTAGTC
CCAAATTTTTTAACTATATCTGattttcttctaataattgatattttcaa
tatccctttttccctttattttctatattttaggCAACAAGGAATCGATT
ATAAATAGACCGAAGGCTAAGGTTTCTTATGCATTTTATACTCAGTTAAG
CCCAAAAAATCTCTACCTTTAAATGGAATCGTTGATTGAAGTAATTAAAC
TAGATTGAAGGCaattgatttattgaaattcgATTATCTAACCAACTTGA
ATCTAATCTTTAACAAAAGTACTTTTTCTCAAATGAATGAAGAGTTGATC
TGTGCAGGAACACCaattatttttatattaaaataattcattcattcaaa
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TGAAAGAATTAAGGAAATTCTTTGAAACCTACTATTTGACCTGCCAAACT
AGTTTAGCTATCATTTCAACAGGTAATTCTATCTTTGATTTTAAATATCC
CCATAAAAAATATCCTACTCATATGCAGCAATGTATTATGTTTTTTAGTG
TATCCAGGCAACTTAATCAATTTCTACATAGTTGATTCAGGTAGAAAAAC
ACTTATTTTTGAGCAGCGGTGCATTGCACTCATAATAACAGAATATAAAT
TTCttagttttaaaattattttaggaATTATTTAGAGATCAGTattaaaa
tctaattaaaatCCTATTATTTCAGAATCTTTGGACACCTTAGAAGAATg
gtgcaaaaaatatttctcaggTTTAGGAAAAAGGtatttatacatttttc
aaatcttcaaaataaagaggataagaaaatataaactttttgtagCAACT
TTTCTGTATTTCCCCCCAATAAGTACCACTCTATAAAGTTAAAGAGTGGC
ATGACTCgaatcaaaaactttaaaaaagcgAAACCCTTTATAGTAAGTGC
TACACCTCAAAAGCACAACTTGTTAGAATGGTCTAGGCTTTGACTAACCA
TAATTTACATTTCCATagatttttgtccttttttaaCCTGTATAAGAGAT
AACAAGCAATCGTGGCCAAACTGTCGCCAGCTGTACCATTTCAAAATATG
AAGTACCTTAAATAACCAAGGCCATGGGGGACACAAGTTAGTGCTCTTAA
TTTGAACACAGTTGTCTTTGGAAAGTGCACCACCCTCCAATAGGCTGGCC
CCGTCCTCTAATAAGCACCATCCACTAAAGAGCGCCttactttacttttt
cttgaatGTATAAAGAGATGACACTGTAATCTGTTTTTCATATCATAATA
ATTGTTTGTATTTACTTTTGTAGTACTTCAGATTACCAACTTTTGATGTT
TGTATATGTTTAGCATAAAAACTTATcctctttttcatttcatcatttat
CAGGAACTCTGTATCAGTCCAAAAGTTATACTCAAAACCATTCCAGGTAA
TTTTTGTGgcatttcttcaaaaatccaaagaaagtgttttttttcaaaat
atcagaggTAATAATATTAAATTTCACTTTGTAATTCGGACTAGCTGAAG
TATTATACAATTATTATTTTCTCTCTTGTAGAACCCTTTCGAATTGGAAA
AGTTTCATAAAATATACTACGGTATGATGTTTCCAAATTGCTTCTGTATG
CTTTTAGTTTTACTTGTCTGTTTCCTGGGGTGAGGTTTCTTGTCTAATAT
ATAATCATCTTTTCTAAAATTGATCTTTTAAAACTAGGTTATGTTTGAAC
AAAGGCTGGCTCTGTCCTGGCTTGACTTAGCCCACTGTTTGGCTCCTTTT
CGTTTTTACAATTCTCCATCGCATTACCTTTTTATTAAATCCTGAGTCAT
CCTTCCATTAACCTGGAACTAAGTCTCAAGAATTGGTAATGAACtatttc
tcgtatttttgtttattttttccctgtacttttcttattttacttccttt
tctatttccattctatatttatcattaggtaggtccaatgTGCATTGTGT
TTGTTCTCTTTATAGTAAAACCAGTTGCAGACCAAAATTTATTACAATTG
GAGTGGATCATATCAAGTGACCTGAAGGATTATGGGTAGAGGTTTATTAG
TTTTTACTTAAAGTATCAGTATTAAAATTCATGTGTTTTTACCGCCTCAA
TTTCCAatttcaaatattaaaaaaaatcagatgGTTATGTCAAATAATAA
AGTCCAGTTTGCTCAAAAAACTAATACTAATAAAATATCTCTCATTCTTT
TAAGGTCATCCCCAACGGATTACATAGTTTGGTTATTAAATCACAAGTCG
AAAGGAAGTTTGCACCCTTGTCTACTTAATAGGTTTGTgccatttttggt
caatttcgaaagattaaaaaaagattattttgtaTATATCTTTGAAATTG
AGTAAGAAAATGCTGAGATTAGTTATTGAACTAAGCAATAAACATCTGTT
TGATCATAGAATTTTCATCATCTGTTCTTGTACCTTTTAGAGGATACATA
TCTAGTCTTTGTGCTAGCTGTAATCGTAGAGAAGACTATGCTGAATTTTA
CATGGACCTTTATTTGACCAACTCTGGCATTGGTCACATAGAAGAGGTAT
CATTGATATATATTTCTTTCTTGATTAACcttacaggaaaaaatcttaaa
aatccatgtatgcaaaatagtaaaaaactttcttagCCTTGGGATTTTTG
TTAGCTTACATGACAAGGCTTGTGATTGGTTCCTTCGGGATGTTTTGGGC
AAAACAGTTTTTCGTATGTTCGAGTGAACTTGATACAAGCTAAATTACAT
TATATGAGTGAACGAAAAGAGTCTATCACTACATTTCCACCCTGCCtgga
agtgcttgggattcgaacacagtccattacGGTGCAAGTCTATGATCGAA
ACCTTCATACTACCAATTAACAGAATGTTAGTAAGATAAAGTGATAGCAT
TATCCAGATAGTGAGTGAATGTATACTAAGGTTATCGTtatacatctgca
atttgagctttactaagctcattttATACCTTAAACTATTTAGATTGTGA
TTTTGATCTTTCAATACCTTGCAATGTTGAAAAGAGATGGGCCATCAGAA
AGGTAGCTCGAATTCGATGTTTTTATTTGTATGTTTTTACTAATGATATG
caacattgcaatgtcttctggtCAGATGTATTGACTACTTACATTACATC
ATATCATGAtaaacccaacagctgattggttgcaagtgagtTATTTTCAG
TCTCCTTATGCTGAGCAACTAGTTGCAATAGTTAACTATTATATCCATCT
AGATCTAACAAGACATAATATTTCCTCAATTCAAATCTTTAGGATTTTCA
ACGAGATAAGACAATCAACAGAAATAGCCTTTCGATATGTAGAACCGGTG
AGTTTTTCGAACTGATACAAATAGCATTTAGTAACATTTCATATGATTGT
TCATATTAAAGGTCGACTTTTATTGGCTCGAATACTTTGGAGATTATAAT
AATTGGTGATCAATAATTTCCCATAATACATTTTTGTCATGGCTTTTTAT
GCAATTATTTTTCCTTGAAGAAAGTTGGgaaaagtttgattaatttAATT
GTGGTTGATGAGGAATTTTGAGTACTTTTCTTCTCCctcactttttttca
ggaagaACCCGAAGATCTGGTTGAAAACATTGTTGTGGACATGCAGGTGT
CTTTGTTAATCTTTGCTTgcctttttttttacttttcaaactAATACACA
TTGTAACTCTCCTACGTAGCTTGAgaggttgaattttgatttcatgGAAA
TTGCTTCATGTAAATCTCATTTATGGTAAACCTTATCTAAAAtacaaatc
gaacgtttgctacAATGAAGGCAGGAATTACGTATCTTAACCAAACATAA
AAAACCTGTACAACCAGTAGTTATATTTGTACACGGATTTTCGTTTTAGC
ATTACCCTGAAGAGCATTGGATCAAAGGAAAATATGGAGCATTTTCCTAC
AAACCAGAGGTAAATATATTGAATTTGATGCAGTTAGGAATCTTCACTTG
CAGTCTCGTAGATCACGAGGACCATTTACTACTATACTAATTAATAGTTA
TCATAATAGTTTGAGTGAAAAGCGAGAAATAATTTTACGATAGCTCGATA
GCATAGTTTTTTCcgtaaaatattagaaaaaatcTGGAACGATATTTTGG
TTGACACTAAGTTTGCTTTATATTTGCAAAAATCGtatgaatatattttt
gattgtcaTTTGTAATCTATTGAAGAAAACACATTAAATATTCTACCTAT
CAGGTCATTGCAGAGATGTTGAACATGTTAACAGCCGAAACAGTTAACAT
CGTCATCTCTTCAAAAATACTTCAACATCTGGCTGAAGAGGAAACTGAGC
CATGGTTCAAAACGGAATACTCCATCAAAGGTAATCTCATTTTGATAGAA
AAGAAGAAGATCTCCATTATGTAGTTTTCACACTTGCCTTACCAGATTGA
GGTAGCAATTCTACTTTCTTTGCATTGTTCTCATTTTCCCGTGGCGTTGG
GAAGGACTTCTTTGGAACAACCAGCTCTCAGTTGATCATTGTGGGTTTTA
TTTGGCATGCCACCTAATGTAGAGTCATGTATTGGCTCCCGTAGGACAAG
TTCTGAAGACAACCCATTTTTACGTTGTTAGCAGTGACCATTAAACCGAA
AACGTTGTTCGGGAATTGCCGATGTTATGCGAGGTATCTTGCAGTAAAGT
TCCAAATTATTGTTTTTCCAGAATGCATCCACTGCTACCCTAAGCATCAC
CGCATAAGAGATATCCATCCTTTTCCGAATTGATGGTATTGGTTagacaa
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GAAGAATCGGCCG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000101_pilon:102419..131681+ >MSTRG.12995.5.p1 ID=MSTRG.12995.5.p1|Name=MSTRG.12995.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=34122bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000101_pilon:102419..131681+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGTTTAAAGAATTGATCAAATCTCCAAGTGATTATCGCGACTACAGGAT TTTGAACCTTGAAAATGGCATAAAGGTACTACTAATATCTGATATAAACC ACAAGGATGATGGTTTGAAAAAGGACAGAAAGGAAACAAAAGAAGCAGCA GCTGCATTTAACATCAATGTCGGAAGTTTTCAGGACCCATCTTCAGTTGA AGGGCTTGCTCACTTTCTTGAACATAtggtttttATGGGAAGTGAAAAAT ATCCAGCAGAAAACGATTTCTCGGCATATTTGAAGCAACATGCAGGAGAT TCTAATGCTTAcacagattatgaaaatACTGTGTTCTATTTTCATGCTCA GCCAGAAGGATTTGAAGGTGCTCTAGACAGATTTGCACAATTTTTCATCA ATCCATTACTGTTAGAAGACGCTGTTGGCAGAGAGATCAAAGCAGTCGAT AGTGAATTCAACGAGGCACTTCCAGATGATTATAATCGTTTGGAACAGCT TTTTTGCCATATGGCAAAGAAAGACCATCCTTTATCAAGTTTTTTATGGG gCAACAAGGAATCGATTATAAATAGACCGAAGGCTAAGGGTATTGATGTC ATGAAAGAATTAAGGAAATTCTTTGAAACCTACTATTTGACCTGCCAAAC 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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
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