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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000101_pilon:82423..86682- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12994.1.p1 ID=MSTRG.12994.1.p1|Name=MSTRG.12994.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4260bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000101_pilon:82423..86682- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTGTGTGACTGATGATTTTAGTTTTTCAAGACAATATCTGTTCCCGTCAT
AGATTGAAAAAAAATAAAATGGAAAATGAGAATGAAGAAAGTGTGATTGC
GATACCAAAGGTTGAGAAACCATTGCAACAATTATCTGTCAATGGACCTG
GGCTTCATCAACATGATATACTTGAATCAGAAGTCTTCTGTTTGTCTTCA
CGTCCAGACATTTTAAATGGAATGATGAAATCACTCTCCTCGTTGAGACA
AGATGAGTCATTATGTGACGTTACATTGATTGTTGGTAGCACGTCTATCA
AAGCTCATAAAATTGTGCTTGCAGCAGCTACACCTTATTTCAATGCTATG
TTTACTAATCAGATGCTAGAGAGCTCTTTACAAGAAGTGACTATCCAAGA
ACTCGATGCTCAATGTATTGTTGAACTTGTCAATTTTATTTACGGTGAAA
ACCTTATTGTGAGGACTGAGAATGTACAAAATTTATTGTCGGCTGCTTCG
CTGTTACAAATAACATGTGTTAAAGATGCCTGTGTAAGCTTCCTAATGAA
GAAATTACATCCAGAGAATTGTTTAACTGTCCGCCATTTAGCAGATATGT
ATTCGGCTGCTGAACTTCTACAAGCTGCTAATTCTTTTCTTGACAAAAAT
TTTGTGGATGTTTCACAATGTAATGAATTTTTGCAGTTGCAGTTTGATGA
TTTGGCTGAACTGATCAAGAAAGATGATTTGAATATTCGGTCTGAGGAGC
AAATTTTCGAAGCTGTGCTTTCTTGGGTGAAAACAGATTGTGAAGGACGG
AAAGGACATTTACCAGAACTGTTAAAATACGTCCGATTACCACTGTTGTC
ACCTCAATATTTAAGTGATCGAGTGTTGTCTGAAGAGATCATTCGTAGCA
ATATTGTGTGTAGAGATCTAATCGATGAAGCAAAAGACTTCATGTTAATG
CCTGAACGCAGAAAACATTTAAAAAGTGAACGCACTTTACCTAGACGTTG
TAGCGAGGCGGCTGGTTTGATTTATATTGTTGGTGGTTTAACGTCTTCTG
GCGAATCGTTATCCACTGTCGAAAAGTATGATACAATCTTAGGGAAATGG
ACACCAGTTTTACCGATGGCTATACAAAGGAGTAGAGTGGGTGTGGCAAT
CTTGGATGGGAAATTGTATGCTATTGGCGGTTTCGATGGTAACGTACGGT
TGAATGATGTGGAAAGATATGACCCCAATACAAACAGGTATGTTAGTTGT
CAATGAAATTGACATACATATTTTAATAATTCTTTTTGCTTCTATTTGAA
AAGGGTTAACAGCCTACTGTTTGGTAAGAAGTTTCCCTTGTGGTAGTGAA
GGAAAAGTGAATATCTTACCTAGTATGTTACTCTTTGAAGTTTTCAAAAG
ATTGAAAATAAAAAGAAACTTCTATTTCTGAACCACAATATTTTCGGGCA
ATACCTCATATTATATATAGTTCTTGCTTTTGCACATATCAACTGTCCAA
GATCTAGACCAAGTCTAGGGTCATTGACTTCCCTTCAACTAAGAATTATA
CTTGTATTCATGATATGCACCATTGCAATGTCTTCTGACATTACATCACG
AACCCAACAGCTGATTGGTTGTGAGTGATGTAAAATCAGTCAATACGTCA
CTTGCAACCAATCAGCTGTTGGGTCCGTGGAAGACATTGCAATGGTGCAT
ATCATGAATTATAACATGATCTTTTTTTCTTTTGTCAGTTGGAAGAAAGT
ATGTCCAATGAACATCCGTCGAAGTGCAGTAGGAGCTGCAGTGTTGGCGA
ATAAGATCTATGTTGTGGGTGGATATGATGGTAATTCGTCATTGAACAGT
GTGGAATGTTATGATTCTGAAATGAACCAATGGAAATTCGTTGCGTCCAT
GTCAACGTTGAGAAGTGCAGCTGGTGTCACCTCGCTCAATGGTATGTGCT
CTTTTCCTTTAGTTTTCTTTGTTTTATTGATGTCGGTCTAGATCTTTGAC
TGTGGAATCTTGATTTCCATGGCACTTTATGTAAAAATACTACTGTTTAG
ATTTGTGTTAAGATGAAGATTTCACCATTTTGCATCACTTCAGCTAGAAT
TCAAAAAAGTCGCTGTAATTTTCTTTTTGGATATTGATTTTTGGTTAGGT
GAGGCTAATCTAATTTGTTGTTTTACGGGCCAAGCTATCCAAAAAAGAAT
GTCCGTCGGTCGGCGAAAAAATAAAAATAAAAGTATAAAATCTCCCAAAC
AAAAACTACTTCCTCTTGACAAAAATGCGAAGTAAAAAATAAAAAGACAA
TAAAAATGTCGAATTCATGGATAAATTGAAAAATTGAACATAAAATTGGA
AAAGCTACCAAAAGTTTGAAAATTTGGCAGTCTGTAAGGCAATGAAAATA
AAAATGTACTACCAAAATCAATTACATTTTTATTTCGGTTTTGAATATCA
GGTTCGGTCAGGCCCGTAAAACAACTAACCAAATTTTGGTCTCGCCTTAC
GGAATTTTCATGAAAAAGACGCAACTGTGAGTAGGTATTTAATATACTTT
TTGTGATTCATCTATGGTATTCTTTATTTTTCAATTTCTCAGGTAAACTG
TACAGTGCTGGTGGCCACGATGGTTTGACCATATTTTCTTCAGTTGAAGC
TTACGATAGCACGCTCCGTCAATGGCGTCTTGTCGCTCCTATGTCCGTCA
GAAGATGTCGTCTCGGACTTACCGTTCTTAACAGCCGTATTTACGCGACG
GGGGGTTACGATGGATCCTCGTTTCTAAGCTCAGTCGAATATTACGATAT
TTGTAACGACCAATGGATTTACGTTGCACCGATGACGAAACGTCGTAGCC
GAGTATCCTCGGTCACTCTCGGTGGCAAAATTTTCGCTGTCGGAGGATAT
GACGGAGCAACAAACTTGAGCACTATAGAGACTTATGATCCGTGGGCGAA
TGAATGGACTTCGGAGACAGAGATGGGTATGCATGACGGTGGTGTGGGCG
TGGGCGTTTTACCACGTTTAACTTGAGCAATGCATCAAAGCGAAACCTAT
ATTCGAAGTTATTATTTGATGTATCGGGATGCATTTTAGCTTGTGGATAT
TAAACCAACGGAAAATTTAATAACATTGTCCTTGTTCGGAAACAGACTTT
TTCTTTACGTTTGTATTGGAACAGAATTTCCAGTGACATTTAAAGATTAT
AATCGGACAAGATCTATTCGGAAAAGTTTAATTTCCAATCATGAACGTCT
GTTGTATTACCAACAATAACATTACAGTTCACTGTTTTTATTTTTTATAC
GTGTTTGATTGATTATGTTTACATTCATTATGTGTACAGCATAACCTAAA
CTACTATGTTTTTTTTTTTCGAGTTAAAATTATCTCAAAAGCGCATTCTC
ATTTTTTTCGCATATAATTCAATAATACAATTGTCAACAACAGGCATGTC
GGGACATTTAATGCAAATAATCTTTCCAATTTAGCGATTTCTGTAGGTTT
TGACGTTTATTACGGCCCTAATAGCACAACGCTATGCAAACGTCATAATT
ATTACTTTTAACATTTGACCGAAATTCAATCCCACAATCCTTTTCATCAT
GATTTGTTATGCGTTTTGTATTGGCAATAAGTGTAATTGACTTACAAAAG
CACTTAATGCAAAGGATGATGGGACTAAAACTCGGGCAAACAGTAATTTT
GATGTCTATTTTTAGAAACACTGCGGTATGCTATTGGCTATGGGTGATTA
CGAGTGGGCTTAAAAGGAGTCTATAAGTTATGTCGGTATAAGTGCGAAAA
TGATTTCATATGGTCCCTTTAAAAACTATATTTCATTTTTACTTTATATT
TGTGAATTGTTGTTGCATGATAGATACCTCGTGCGATGAGATACAACCGA
AAGCTAGAGAGGGATCGTCAACATTTTCCAGGCAATTAAGAGTGATGTTT
AAAGATTCGCGCCACATCTCGGATGATGAATCTAGAACTTCCTTTGGTTT
TTTGCGCTTCACATTTTTCAAATGTTGCTTCCAACCAAGGGTTGAATGAA
AAGCACGCGTGTTGCACTACTTATGGAGAAAATAAATGGCTTCGATTCCT
TAATATAAGATTCCGCTCTAGCCTTTAGCTATATCTCATTTTGTCTCGTG
TACCCAGAACAAAGAATATTAGATTATTAAAGTAGGACAATAGATAATAC
CATAATAATTGTAAATATATTTGAATTTTTAGCCCAATAATAATTTATCA
TTTAGCGGAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000101_pilon:82423..86682- >MSTRG.12994.1.p1 ID=MSTRG.12994.1.p1|Name=MSTRG.12994.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5589bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000101_pilon:82423..86682- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTAAACTGTACAGTGCTGGTGGCCACGATGGTTTGACCATATTTTCTTCA
GTTGAAGCTTACGATAGCACGCTCCGTCAATGGCGTCTTGTCGCTCCTAT
GTCCGTCAGAAGATGTCGTCTCGGACTTACCGTTCTTAACAGCCGTATTT
ACGCGACGGGGGGTTACGATGGATCCTCGTTTCTAAGCTCAGTCGAATAT
TACGATATTTGTAACGACCAATGGATTTACGTTGCACCGATGACGAAACG
TCGTAGCCGAGTATCCTCGGTCACTCTCGGTGGCAAAATTTTCGCTGTCG
GAGGATATGACGGAGCAACAAACTTGAGCACTATAGAGACTTATGATCCG
TGGGCGAATGAATGGACTTCGGAGACAGAGATGGGTATGCATGACGGTGG
TGTGGGCGTGGGCGTTTTACCACGTTTAACTTGATTGGAAGAAAGTATGT
CCAATGAACATCCGTCGAAGTGCAGTAGGAGCTGCAGTGTTGGCGAATAA
GATCTATGTTGTGGGTGGATATGATGGTAATTCGTCATTGAACAGTGTGG
AATGTTATGATTCTGAAATGAACCAATGGAAATTCGTTGCGTCCATGTCA
ACGTTGAGAAGTGCAGCTGGTGTCACCTCGCTCAATGATGATTTTAGTTT
TTCAAGACAATATCTGTTCCCGTCATAGATTGAAAAAAAATAAAATGGAA
AATGAGAATGAAGAAAGTGTGATTGCGATACCAAAGGTTGAGAAACCATT
GCAACAATTATCTGTCAATGGACCTGGGCTTCATCAACATGATATACTTG
AATCAGAAGTCTTCTGTTTGTCTTCACGTCCAGACATTTTAAATGGAATG
ATGAAATCACTCTCCTCGTTGAGACAAGATGAGTCATTATGTGACGTTAC
ATTGATTGTTGGTAGCACGTCTATCAAAGCTCATAAAATTGTGCTTGCAG
CAGCTACACCTTATTTCAATGCTATGTTTACTAATCAGATGCTAGAGAGC
TCTTTACAAGAAGTGACTATCCAAGAACTCGATGCTCAATGTATTGTTGA
ACTTGTCAATTTTATTTACGGTGAAAACCTTATTGTGAGGACTGAGAATG
TACAAAATTTATTGTCGGCTGCTTCGCTGTTACAAATAACATGTGTTAAA
GATGCCTGTGTAAGCTTCCTAATGAAGAAATTACATCCAGAGAATTGTTT
AACTGTCCGCCATTTAGCAGATATGTATTCGGCTGCTGAACTTCTACAAG
CTGCTAATTCTTTTCTTGACAAAAATTTTGTGGATGTTTCACAATGTAAT
GAATTTTTGCAGTTGCAGTTTGATGATTTGGCTGAACTGATCAAGAAAGA
TGATTTGAATATTCGGTCTGAGGAGCAAATTTTCGAAGCTGTGCTTTCTT
GGGTGAAAACAGATTGTGAAGGACGGAAAGGACATTTACCAGAACTGTTA
AAATACGTCCGATTACCACTGTTGTCACCTCAATATTTAAGTGATCGAGT
GTTGTCTGAAGAGATCATTCGTAGCAATATTGTGTGTAGAGATCTAATCG
ATGAAGCAAAAGACTTCATGTTAATGCCTGAACGCAGAAAACATTTAAAA
AGTGAACGCACTTTACCTAGACGTTGTAGCGAGGCGGCTGGTTTGATTTA
TATTGTTGGTGGTTTAACGTCTTCTGGCGAATCGTTATCCACTGTCGAAA
AGTATGATACAATCTTAGGGAAATGGACACCAGTTTTACCGATGGCTATA
CAAAGGAGTAGAGTGGGTGTGGCAATCTTGGATGGGAAATTGTATGCTAT
TGGCGGTTTCGATGGTAACGTACGGTTGAATGATGTGGAAAGATATGACC
CCAATACAAACAGGTAAACTGTACAGTGCTGGTGGCCACGATGGTTTGAC
CATATTTTCTTCAGTTGAAGCTTACGATAGCACGCTCCGTCAATGGCGTC
TTGTCGCTCCTATGTCCGTCAGAAGATGTCGTCTCGGACTTACCGTTCTT
AACAGCCGTATTTACGCGACGGGGGGTTACGATGGATCCTCGTTTCTAAG
CTCAGTCGAATATTACGATATTTGTAACGACCAATGGATTTACGTTGCAC
CGATGACGAAACGTCGTAGCCGAGTATCCTCGGTCACTCTCGGTGGCAAA
ATTTTCGCTGTCGGAGGATATGACGGAGCAACAAACTTGAGCACTATAGA
GACTTATGATCCGTGGGCGAATGAATGGACTTCGGAGACAGAGATGGGTA
TGCATGACGGTGGTGTGGGCGTGGGCGTTTTACCACGTTTAACTTGATTG
GAAGAAAGTATGTCCAATGAACATCCGTCGAAGTGCAGTAGGAGCTGCAG
TGTTGGCGAATAAGATCTATGTTGTGGGTGGATATGATGGTAATTCGTCA
TTGAACAGTGTGGAATGTTATGATTCTGAAATGAACCAATGGAAATTCGT
TGCGTCCATGTCAACGTTGAGAAGTGCAGCTGGTGTCACCTCGCTCAATG
ATGATTTTAGTTTTTCAAGACAATATCTGTTCCCGTCATAGATTGAAAAA
AAATAAAATGGAAAATGAGAATGAAGAAAGTGTGATTGCGATACCAAAGG
TTGAGAAACCATTGCAACAATTATCTGTCAATGGACCTGGGCTTCATCAA
CATGATATACTTGAATCAGAAGTCTTCTGTTTGTCTTCACGTCCAGACAT
TTTAAATGGAATGATGAAATCACTCTCCTCGTTGAGACAAGATGAGTCAT
TATGTGACGTTACATTGATTGTTGGTAGCACGTCTATCAAAGCTCATAAA
ATTGTGCTTGCAGCAGCTACACCTTATTTCAATGCTATGTTTACTAATCA
GATGCTAGAGAGCTCTTTACAAGAAGTGACTATCCAAGAACTCGATGCTC
AATGTATTGTTGAACTTGTCAATTTTATTTACGGTGAAAACCTTATTGTG
AGGACTGAGAATGTACAAAATTTATTGTCGGCTGCTTCGCTGTTACAAAT
AACATGTGTTAAAGATGCCTGTGTAAGCTTCCTAATGAAGAAATTACATC
CAGAGAATTGTTTAACTGTCCGCCATTTAGCAGATATGTATTCGGCTGCT
GAACTTCTACAAGCTGCTAATTCTTTTCTTGACAAAAATTTTGTGGATGT
TTCACAATGTAATGAATTTTTGCAGTTGCAGTTTGATGATTTGGCTGAAC
TGATCAAGAAAGATGATTTGAATATTCGGTCTGAGGAGCAAATTTTCGAA
GCTGTGCTTTCTTGGGTGAAAACAGATTGTGAAGGACGGAAAGGACATTT
ACCAGAACTGTTAAAATACGTCCGATTACCACTGTTGTCACCTCAATATT
TAAGTGATCGAGTGTTGTCTGAAGAGATCATTCGTAGCAATATTGTGTGT
AGAGATCTAATCGATGAAGCAAAAGACTTCATGTTAATGCCTGAACGCAG
AAAACATTTAAAAAGTGAACGCACTTTACCTAGACGTTGTAGCGAGGCGG
CTGGTTTGATTTATATTGTTGGTGGTTTAACGTCTTCTGGCGAATCGTTA
TCCACTGTCGAAAAGTATGATACAATCTTAGGGAAATGGACACCAGTTTT
ACCGATGGCTATACAAAGGAGTAGAGTGGGTGTGGCAATCTTGGATGGGA
AATTGTATGCTATTGGCGGTTTCGATGGTAACGTACGGTTGAATGATGTG
GAAAGATATGACCCCAATACAAACAGGTAAACTGTACAGTGCTGGTGGCC
ACGATGGTTTGACCATATTTTCTTCAGTTGAAGCTTACGATAGCACGCTC
CGTCAATGGCGTCTTGTCGCTCCTATGTCCGTCAGAAGATGTCGTCTCGG
ACTTACCGTTCTTAACAGCCGTATTTACGCGACGGGGGGTTACGATGGAT
CCTCGTTTCTAAGCTCAGTCGAATATTACGATATTTGTAACGACCAATGG
ATTTACGTTGCACCGATGACGAAACGTCGTAGCCGAGTATCCTCGGTCAC
TCTCGGTGGCAAAATTTTCGCTGTCGGAGGATATGACGGAGCAACAAACT
TGAGCACTATAGAGACTTATGATCCGTGGGCGAATGAATGGACTTCGGAG
ACAGAGATGGGTATGCATGACGGTGGTGTGGGCGTGGGCGTTTTACCACG
TTTAACTTGATTGGAAGAAAGTATGTCCAATGAACATCCGTCGAAGTGCA
GTAGGAGCTGCAGTGTTGGCGAATAAGATCTATGTTGTGGGTGGATATGA
TGGTAATTCGTCATTGAACAGTGTGGAATGTTATGATTCTGAAATGAACC
AATGGAAATTCGTTGCGTCCATGTCAACGTTGAGAAGTGCAGCTGGTGTC
ACCTCGCTCAATGATGATTTTAGTTTTTCAAGACAATATCTGTTCCCGTC
ATAGATTGAAAAAAAATAAAATGGAAAATGAGAATGAAGAAAGTGTGATT
GCGATACCAAAGGTTGAGAAACCATTGCAACAATTATCTGTCAATGGACC
TGGGCTTCATCAACATGATATACTTGAATCAGAAGTCTTCTGTTTGTCTT
CACGTCCAGACATTTTAAATGGAATGATGAAATCACTCTCCTCGTTGAGA
CAAGATGAGTCATTATGTGACGTTACATTGATTGTTGGTAGCACGTCTAT
CAAAGCTCATAAAATTGTGCTTGCAGCAGCTACACCTTATTTCAATGCTA
TGTTTACTAATCAGATGCTAGAGAGCTCTTTACAAGAAGTGACTATCCAA
GAACTCGATGCTCAATGTATTGTTGAACTTGTCAATTTTATTTACGGTGA
AAACCTTATTGTGAGGACTGAGAATGTACAAAATTTATTGTCGGCTGCTT
CGCTGTTACAAATAACATGTGTTAAAGATGCCTGTGTAAGCTTCCTAATG
AAGAAATTACATCCAGAGAATTGTTTAACTGTCCGCCATTTAGCAGATAT
GTATTCGGCTGCTGAACTTCTACAAGCTGCTAATTCTTTTCTTGACAAAA
ATTTTGTGGATGTTTCACAATGTAATGAATTTTTGCAGTTGCAGTTTGAT
GATTTGGCTGAACTGATCAAGAAAGATGATTTGAATATTCGGTCTGAGGA
GCAAATTTTCGAAGCTGTGCTTTCTTGGGTGAAAACAGATTGTGAAGGAC
GGAAAGGACATTTACCAGAACTGTTAAAATACGTCCGATTACCACTGTTG
TCACCTCAATATTTAAGTGATCGAGTGTTGTCTGAAGAGATCATTCGTAG
CAATATTGTGTGTAGAGATCTAATCGATGAAGCAAAAGACTTCATGTTAA
TGCCTGAACGCAGAAAACATTTAAAAAGTGAACGCACTTTACCTAGACGT
TGTAGCGAGGCGGCTGGTTTGATTTATATTGTTGGTGGTTTAACGTCTTC
TGGCGAATCGTTATCCACTGTCGAAAAGTATGATACAATCTTAGGGAAAT
GGACACCAGTTTTACCGATGGCTATACAAAGGAGTAGAGTGGGTGTGGCA
ATCTTGGATGGGAAATTGTATGCTATTGGCGGTTTCGATGGTAACGTACG
GTTGAATGATGTGGAAAGATATGACCCCAATACAAACAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000101_pilon | genome | sc0000101_pilon:82423..86682 - |
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