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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000101_pilon:48729..57131+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12991.25.p1 ID=MSTRG.12991.25.p1|Name=MSTRG.12991.25.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8403bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000101_pilon:48729..57131+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
agaatctgTACAAAATTAAGAGGAAACGAGATGTTACTGTTCTTTTTGTT
CATGTTGATGAACATGGTCGTCACCACTTCGGCTTTCGGTAAGtgagata
ccttatcggggaaaacttcgtcggggaaaagtgacgaaattttggacaag
tgacgaatattttcctcgacgaaaattttccccggccttaatgcgtttac
taactaccagcaagtgacgaatttttccccgacaaagtTTTTCCCTATAA
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ctcaaaaatttttttgtgcttgttacatgatatttatttctgattggttc
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AGTATAGTTTGACAAGTAACAAGGGCGGTAGCGTAGGCGGTTGGCGAAAC
ATTTGTCTAGAAGAGCAGATTTTTGTGAGACAGCAATTATCCATGATATT
ATGAATTCAGATTCATACCTTATAAAGGTATCGAGAGAGAGAGTGGCTCT
TGAATACTCGAATACTTCTCACCCTACCCAAGTTTCTCAATACTTTAGAA
TAGATAACTTTTCAAAGAATCTATCGGGTGCGCTACAAAAAAGTTTccct
ctttgaaactaattttctcgaaatctaaaaattttaaaagaaccattcct
atttcgtTGGAAAGAACaaagataaaattaaattttgatgggtcattaat
taatttcgattcattagatcaaaagttatgcgcaattgaataaaaaagtt
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atttctggggggcaaatttgggccaaaaactacctaaaaataaggttttt
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ttttcgcttttttggggaaattcccttttaccattttcctgttagcagct
tttctcgggattggctcattatttttttttaattttttgcacaatgatac
aaaatagcaatgcctgaaaagtgacggagcccgatttttgaaaaaaattt
ctggggggcaaatttgggccaaaaactacctaaaaataaggttttttgga
cttggtgcaaaattgcttcattagcttttcttgattttttgcagaaagat
agagtgcaaggtaccctaaaatgtggctgaagtaatttttctcggaaaaa
ttttttttttgtcgtcaaatacggattttcgcaaatttgggccaaaaact
acctaaaaataaggttttttggacttggtgcaaaattgcctcattagttt
ttcctgatttttggcagaaagatggagtgcaaggcaccctaaaatgtggc
tgaagtaatttttctcggaaaattttttttcgtcgtcaaatacggatttt
cgcaaatttgggctaaaactacctaaaaataaggttttttggacttggtg
caaaattgcttcattagtttttcctgatttttggcagaaagatggagtgc
aaggcaccctaaaatgtggctgaagtaatttttctcggaaaatttttttt
cgtcgtcaaatacggattttcgcaaatttgggctaaaactacctaaaaat
aaggttttttggacttggtgcaaaattgcttcattagtttttcctgattt
ttggcagaaagatggagtgcaaggcaccctaaaatgtggctgaagtaatt
tttctcggaaaattttttttcgttttaaaaattttcaaaaaaagacgacc
aagttacacaatgataaaagaaaataaatcagacgtttttgcattgttct
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tttaatctgattttgatcaacaggtaggtccattcagcatgttgcttgtt
attttaaatttggcaattacaatagcctttacatgattaagagtattttt
cagtaactaataaatataaatgttgaaactgaagggtcgaaagggtttaa
aatcttcatcaaaatcaatttagtTTACTTTTACCAGAATTTTCCTCAGG
TTTTTGGTGCTAGACTGGATCGAGGGGTtaattactcgaaaaaatctcgt
acacttcttagaaaaatcacaaaaaaatcacaaaaaaaatcaaaaaatca
caaaaaaatcaaaaaatcacaaaaaatcacaaaaaaatcacaaaaaatca
aaaaatcacaaaaagtcacagaaaaatcaaaaaatcacaaaaaaatcaca
gaaaaatcaaaaaatcacaaaaaaatcacaaaaaaatcaaaaaatcacag
aaaaaatcaaaaaatcacaaaaaaatcacaaaaaaatcaaaaaatcacaa
aaaaatcaaaaatcaaaaatcatttcgtacgcttttttcgaagtgattta
cccctcggactggataaagtctgtaagactggatctacctcgaaacccat
ttttgatgtatctttatgaattttaccagatttgttggcctttttcgacg
aattttcttcttttcattgaaattcaatcttcctttataATAACAGAAGA
TCATTTAGACAggtaattataatttttaatgactgaaacgaaactGCTGA
TGCAtcgtaattatgcttctgtttaatttgataggtcgatttttaacttt
ttcgtgcactttctgaaagtaacttttttattcaattgagcataactttc
gatctaatgaaccgaatttaataaatgacccatcaaaatttaagtttatc
tttcttctttccaatggaataggaatggttcttttaaaattttcagattt
cgagaaaataagttttaaagagagaaacttttttgtggcgcacccggtac
ttTATTGGACAAAACTTATTTGGCCCTAAGTgattaaattttggcttggt
gactaaaattagtgtcgactaaaaatttgggccgactaaaaagtttataa
ttaagctttccttaaccCACTTTTTATATCGGTATTActttaacaaaaga
atttacgAATATACAGTTTTTAGTCGGCCTtgattattagtcggccctga
gtgactaaattttgacgaggtgactaaaattagggccgactaagttttgg
ccgataatgTATTTGAATGTTTCTTCTACTTCTCATAGATTGTGGTAGCA
GTGTGAAAGGTGTGAAGATTATCGGCTGTTATAAGAGGTCGCCAAAAGTT
TTCGACCACTTGTTAGTGGAAAGCTTCCTCAATGAAGATATGATGTGTGA
ATGTGCAATCAAGGCTCAAGAGAATGGCGACATTGCATTCGCTGTTTCTG
ACTATCAAGCTTGTCTTGCTACCAAAGATCAAGCAGGGTatgcaaagatt
ttgaaagataatacaCCTGTGACCCATACTTATGATTGtatcaataatta
ttttgaggATTGTAGACCTGGTCAGCAATGTTTTGGTAATAACTACTATG
AGTATATCTATGAACTGCCCAAGAAACAAACTGAAACTACCACAACACAA
GCTCCAATCAAAACAACTGCTACACCAACTCAAAGTCAGTAATACAATTA
TGCATTTCAAGTGTCAGAAATTCTTTGTCTAGGCTTGAATTATTGTTTTA
CAATTTTAAacctgaaaaaatatttatcaagagttatagtgatttctttt
gaaagtaaTCATGTATAGGTAGGGCAAGAAGCTAAAATAGAATAAATACA
CACTTCATAGCAAAgtgtattttaactttttacttgtgaaaataaattta
tttttttgacatcTATTATCCCTCTTTCCGTTCCTTTGAAACTCACTCTG
AATATTAAATTTTGCATTAAATTTATCGCCATTCTAGTTAACGGTGGTTG
GGGAGAATGGACGAAACCAACTCCTTGCAGCAAGTCATGTGGAGGCGGTA
AAACAACAAGGTCAAGAAAATGCGACAACCCAGCTCCTGCTCATGGTGGG
AAAGATTGTGAAGGCTCCGATACCGAAACGAGAGAATGCAACACTTTTGA
ATGCCCAAAGAAACCAGGTATATTTTTCTTGCTAAGAATGATTTTGTAAA
ACGCACGTTCGTAAACTCGACTATACCTATTTGGAACAATCCCCCTAAtg
caataaaacaaaccaaatgtctccttaatttCAAATCAGTTTTGATACGT
CACATTTTCTGTCAGAACATGTTGTTACTAGTtcttgttcttttcttttt
attcttgcTTAATTgccgtattactttgaataaacgtcCCGGGCGTTATG
ATCAAGAATTCGTAAATATAGAAATAACAAAATAGCAATTCtaaaaatgt
gatggagcccaattttcgaaagtaAATATTATTTCTTATCACCAGAttaa
gaaatgtcccaaaaaaagagGTTTTCCAGGAATtcctcgagattttctca
ttagctTTAATTCTAAaaggtttttctaattttgaattttaaatgtgGTT
TTCTATTGATTAGGGCCATAAATATCTTTATCCTCTCTTAAGTAAATCAT
TACTTCGATAATTGAAAGTAAAAAacaaattcattttcttttctagtTAA
CGGTGGTTGGGGAGAATGGACGAAGCCAACTCCTTGCAGCAAGTCATGTG
GAGGTGGAACAACAACAAGGTCAAGAAAATGCGACAACCCAGCTCCTGCT
AATGGAGGGTGGAATTGCGAAGGCTCTGGTACCGAAACCCAAAAATGCAA
TACTAATGAATGCCCAAAGCAAGCAGGTATATTATCTAAGTTCGGCTGTT
ATATTTTTACTTAAACTGTTTGATTATTAGATGTGATTGTATTTTGTAGA
ATATCAATGAAGCTTCATTCAACTTTATCACGTCCTACTGgctaatttat
tttgaaaatatcgcATCCATAGGTAACAAACCGAAAAACTGTCTGATGAA
ATACCATTAgttaaattattgaaaatttatcaacatagtttttaattttt
tctagttAACGGTGGTTGGGGAGAATGGACGAAACCAACTCCTTGCAGCA
AGTCATGTGGAGGCGGTAAAACTACAAGGTCAAGAAAATGCGACAACCCA
GCTCCTGCTCATGGTGGGAAAGATTGTGAAGGCTCCGATACCGAAACGAG
AGAATGCAACACTTTTGAATGCCCAAAGAAACCAGGTATATTTTTCTTGC
TAAGAATGATTTTGTAAAACGCATGTTCGTAAACTCGACTATACCTATTT
GGAACAATCCCCCTAATGcaataaaccaaaacaaatatCTCCTTAATTTC
AAATCAGTTTTGAAACGTCACATTTTCTGTCAGAACATGTTGTTACTAGT
TCTTGTCCTGTTCTTTTTATTCTTGCTTCATTgacgtattactttgaata
aacgccccgggcgttaTGATCAAGAATTCGTAAGTacagaaacaacaaaa
tagcaattcccaaaatgtgatggagcccacTTCTCGACagtaaatattat
tttttatcacCAGATTAAGAAATGCCCCaaaaaaaGAGGTTTTCCAGGAA
TTCCTCGAGATTATCTCATCAGCTTTAATTCTAaaggtttttctaatttt
gcaTTTAAAATGTGGTTTTTGCCAcagcaggaagcctaaagcttccgagg
atggcattcatagcttcacgcataaggaagttgggcaaacatctcataat
tttgcgcacgtttttcagtattttagttccgggtAATTGGTGAaccggta
acattcttagcttgactgtatttctattattttattatcattaaaaacac
ttttccggatttttttttatctgattatccattttcaaagctctatatgt
ctttttttattacctcagggagtcgaatttagggaaattccttttttgtt
gggaaattccctatttacaccacaagtagttattaaccgcactgagcaac
gcaaattagaaatttttatcctttcaaaaatttgtcgtttgactattaca
gtaaaatggcagtttagtacagtagcgtttagtatgatTAAACAAACCAT
aatataccattattttggtaataaaagagatgacaaaaaaaaaacagata
aataactttaCCTTACctctataagaagatatctatgagatggacacaaa
ttgctaacatttgtagactaaattttgcttcagatgagatgccattctaa
cagaagtaacGGCTATCTGTAACTCtgtaacatttctttccaaattcaac
aatttatttgatcgttcttctgcgatggcattttaatgaaaattatggct
agtcTATTGATTAGTGCCATAAAAATATCActtatttcaaatgaaatacc
GCGTAATATCATCGACTAATTATTGATTGATGtcagttaattttttttct
ttatcctcTCTTAAGTAAATCATTACTTTAATTATTGAAAGTAAAAAACA
AATTCCTTTTCTTTTCTAGTTAATGGTGGTTGGGGAGAATGGACGAAGCC
AACTCCTTGCAGCAAGTCATGTGGAGGTGGAACAACAACAAGGTCAAGAA
AATGCGACAACCCAGCTCCTGCTAATGGAGGGTGGAATTGCGAAGGCTCT
GGTACCGAAACCCAAAAATGCAACAGTAATGAATGCCCAAAGCAACCAGG
TATATTATCTAAGTTCGGCTGTTATATTTTTACTTAAACTGTTTATTAGA
TGTGATTGTATTTTGTAGAATATCAATGAAGCTTCATTCAACTTTATCAC
GTCCTACTTgctaatttattttgaaaatatcgcATCCATAGGTACCGAAC
CGAAAAATTGTCTGATAAAATACCATTAgttaaattattgaaaatttatc
agcaaagtttttaattttttctagttAACGGTGGTTGGGGAGAATGGACG
AAACCAACTCCTTGCAGCAAGTCATGTGGAGGCGGTAAAACTACAAGGTC
AAGAAAATGCGACAACCCAGCTCCTGCTCATGGTGGGAAAGATTGTGAAG
GCTCCGATACCGAAACGAGAGAATGCAACACTTTTGAATGCCCAAAGAAA
CCAGGTATATTTTTCTTGCTAAGAATCATTTTGTAAAACGCACGTTCGTA
AACTCGACTATACCTATTTGGAACAATCCCCCTAAtgcaataaaacaaac
caaatgtctccttaatttCAAATCAGTTTTGAAACGTCACATTTTCTGTC
AGAACATGTTGTTACTAGTTCTTGTCCTGTTCTTTTTATTCTTGCTTAAT
TGCCGTATTActtaataaacgccccgggcgttaTGATCAAGAATTTGTAA
ATatagaaacaacaaaatagcaattcccaaaatgtgatggagcccacTTT
TCGACAGTAAACATTATTTCTTATCACCAGAtcaagaaatgtcccaaaaa
aagagGTTTTCCAGGAATTCCTCGCGATTTTCTCATTAGCTTTAATTCta
aggtttttttaattttgaatttgaaatgtgGTTTTCTATTGATTAGGGCC
ATAAAAATAtcacttatttaaaaaaaaaatactgtgtAATATTATCGGCT
AATTATTGATTGATGTCagttaattctttttctttatccTCTCTTAAGTA
AATCAATACTTTAATTATTGAAAGTAGAAAACAAATTCCTTTTCTTTTCT
AGTTAACGGTGGTTGGGGAGAATGGACGAAGCCAACTCCTTGCAGCAAGT
CATGTGGAGGTGGAACAACAACAAGGTCAAGAAAATGTGACAACCCAGCT
CCTGCTAATGGAGGGTGGAATTGCGAAGGCTCTAATACCGAAACCCAAAA
ATGCAACACTAAGGAATGCCCAAAGCAACCAGGTATATTATCTAAGTTCG
GCTGTTATATTTTTACTCAAACTGTTTGATTATTAGATGTGATTGTATTT
TGT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000101_pilon:48729..57131+ >MSTRG.12991.25.p1 ID=MSTRG.12991.25.p1|Name=MSTRG.12991.25.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3444bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000101_pilon:48729..57131+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTACTGTTCTTTTTGTTCATGTTGATGAACATGGTCGTCACCACTTC
GGCTTTCGATTGTGGTAGCAGTGTGAAAGGTGTGAAGATTATCGGCTGTT
ATAAGAGGTCGCCAAAAGTTTTCGACCACTTGTTAGTGGAAAGCTTCCTC
AATGAAGATATGATGTGTGAATGTGCAATCAAGGCTCAAGAGAATGGCGA
CATTGCATTCGCTGTTTCTGACTATCAAGCTTGTCTTGCTACCAAAGATC
AAGCAGGGTatgcaaagattttgaaagataatacaCCTGTGACCCATACT
TATGATTGtatcaataattattttgaggATTGTAGACCTGGTCAGCAATG
TTTTGGTAATAACTACTATGAGTATATCTATGAACTGCCCAAGAAACAAA
CTGAAACTACCACAACACAAGCTCCAATCAAAACAACTGCTACACCAACT
CAAAttAACGGTGGTTGGGGAGAATGGACGAAACCAACTCCTTGCAGCAA
GTCATGTGGAGGCGGTAAAACTACAAGGTCAAGAAAATGCGACAACCCAG
CTCCTGCTCATGGTGGGAAAGATTGTGAAGGCTCCGATACCGAAACGAGA
GAATGCAACACTTTTGAATGCCCAAAGAAACCAGTTAACGGTGGTTGGGG
AGAATGGACGAAGCCAACTCCTTGCAGCAAGTCATGTGGAGGTGGAACAA
CAACAAGGTCAAGAAAATGTGACAACCCAGCTCCTGCTAATGGAGGGTGG
AATTGCGAAGGCTCTAATACCGAAACCCAAAAATGCAACACTAAGGAATG
CCCAAAGCAACCAGGTATATTATCTAAGTTCGGCTGTTATATTTTTACTC
AAACTGTTTGAATGTTACTGTTCTTTTTGTTCATGTTGATGAACATGGTC
GTCACCACTTCGGCTTTCGATTGTGGTAGCAGTGTGAAAGGTGTGAAGAT
TATCGGCTGTTATAAGAGGTCGCCAAAAGTTTTCGACCACTTGTTAGTGG
AAAGCTTCCTCAATGAAGATATGATGTGTGAATGTGCAATCAAGGCTCAA
GAGAATGGCGACATTGCATTCGCTGTTTCTGACTATCAAGCTTGTCTTGC
TACCAAAGATCAAGCAGGGTatgcaaagattttgaaagataatacaCCTG
TGACCCATACTTATGATTGtatcaataattattttgaggATTGTAGACCT
GGTCAGCAATGTTTTGGTAATAACTACTATGAGTATATCTATGAACTGCC
CAAGAAACAAACTGAAACTACCACAACACAAGCTCCAATCAAAACAACTG
CTACACCAACTCAAAttAACGGTGGTTGGGGAGAATGGACGAAACCAACT
CCTTGCAGCAAGTCATGTGGAGGCGGTAAAACTACAAGGTCAAGAAAATG
CGACAACCCAGCTCCTGCTCATGGTGGGAAAGATTGTGAAGGCTCCGATA
CCGAAACGAGAGAATGCAACACTTTTGAATGCCCAAAGAAACCAGTTAAC
GGTGGTTGGGGAGAATGGACGAAGCCAACTCCTTGCAGCAAGTCATGTGG
AGGTGGAACAACAACAAGGTCAAGAAAATGTGACAACCCAGCTCCTGCTA
ATGGAGGGTGGAATTGCGAAGGCTCTAATACCGAAACCCAAAAATGCAAC
ACTAAGGAATGCCCAAAGCAACCAGGTATATTATCTAAGTTCGGCTGTTA
TATTTTTACTCAAACTGTTTGAATGTTACTGTTCTTTTTGTTCATGTTGA
TGAACATGGTCGTCACCACTTCGGCTTTCGATTGTGGTAGCAGTGTGAAA
GGTGTGAAGATTATCGGCTGTTATAAGAGGTCGCCAAAAGTTTTCGACCA
CTTGTTAGTGGAAAGCTTCCTCAATGAAGATATGATGTGTGAATGTGCAA
TCAAGGCTCAAGAGAATGGCGACATTGCATTCGCTGTTTCTGACTATCAA
GCTTGTCTTGCTACCAAAGATCAAGCAGGGTatgcaaagattttgaaaga
taatacaCCTGTGACCCATACTTATGATTGtatcaataattattttgagg
ATTGTAGACCTGGTCAGCAATGTTTTGGTAATAACTACTATGAGTATATC
TATGAACTGCCCAAGAAACAAACTGAAACTACCACAACACAAGCTCCAAT
CAAAACAACTGCTACACCAACTCAAAttAACGGTGGTTGGGGAGAATGGA
CGAAACCAACTCCTTGCAGCAAGTCATGTGGAGGCGGTAAAACTACAAGG
TCAAGAAAATGCGACAACCCAGCTCCTGCTCATGGTGGGAAAGATTGTGA
AGGCTCCGATACCGAAACGAGAGAATGCAACACTTTTGAATGCCCAAAGA
AACCAGTTAACGGTGGTTGGGGAGAATGGACGAAGCCAACTCCTTGCAGC
AAGTCATGTGGAGGTGGAACAACAACAAGGTCAAGAAAATGTGACAACCC
AGCTCCTGCTAATGGAGGGTGGAATTGCGAAGGCTCTAATACCGAAACCC
AAAAATGCAACACTAAGGAATGCCCAAAGCAACCAGGTATATTATCTAAG
TTCGGCTGTTATATTTTTACTCAAACTGTTTGAATGTTACTGTTCTTTTT
GTTCATGTTGATGAACATGGTCGTCACCACTTCGGCTTTCGATTGTGGTA
GCAGTGTGAAAGGTGTGAAGATTATCGGCTGTTATAAGAGGTCGCCAAAA
GTTTTCGACCACTTGTTAGTGGAAAGCTTCCTCAATGAAGATATGATGTG
TGAATGTGCAATCAAGGCTCAAGAGAATGGCGACATTGCATTCGCTGTTT
CTGACTATCAAGCTTGTCTTGCTACCAAAGATCAAGCAGGGTatgcaaag
attttgaaagataatacaCCTGTGACCCATACTTATGATTGtatcaataa
ttattttgaggATTGTAGACCTGGTCAGCAATGTTTTGGTAATAACTACT
ATGAGTATATCTATGAACTGCCCAAGAAACAAACTGAAACTACCACAACA
CAAGCTCCAATCAAAACAACTGCTACACCAACTCAAAttAACGGTGGTTG
GGGAGAATGGACGAAACCAACTCCTTGCAGCAAGTCATGTGGAGGCGGTA
AAACTACAAGGTCAAGAAAATGCGACAACCCAGCTCCTGCTCATGGTGGG
AAAGATTGTGAAGGCTCCGATACCGAAACGAGAGAATGCAACACTTTTGA
ATGCCCAAAGAAACCAGTTAACGGTGGTTGGGGAGAATGGACGAAGCCAA
CTCCTTGCAGCAAGTCATGTGGAGGTGGAACAACAACAAGGTCAAGAAAA
TGTGACAACCCAGCTCCTGCTAATGGAGGGTGGAATTGCGAAGGCTCTAA
TACCGAAACCCAAAAATGCAACACTAAGGAATGCCCAAAGCAACCAGGTA
TATTATCTAAGTTCGGCTGTTATATTTTTACTCAAACTGTTTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000101_pilon | genome | sc0000101_pilon:48729..57131 + |
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