MSTRG.12946.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12946.1.p1
Unique NameMSTRG.12946.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000100_pilon:636722..649975-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12946.1.p1 ID=MSTRG.12946.1.p1|Name=MSTRG.12946.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13254bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100_pilon:636722..649975- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTCTATTTATATTTTCAGTTAAAAAATTAAAATAGCATAACAATGAAGAG
ATATTGGGCATCGATTTTCTGGCAATTCTTGGCATACATTTTATGGATTT
GTTTTTTTCATTTTGTGATTGGGAAATTCCACGTTGATGTAAGAATGCCA
ATTTTATATTTAAAATCGATTTTGTGATCACACTCTTATCAAATAAATGA
TTTCTTATTTGTAAGTGAGAAATAGCGCTGGAAAGGCAAGACTGATAGTT
CTTTATCTAAAATATAGCTTGTCTACAGGCTTTCATCCTTAAGCTCTCTC
TCTTTAATAATTTTCACTTCCCAACATAGCTTTGACTCCCCTTCTGAAAG
GAGTGGTAGGGGCGGTCCTAAAATTCGCTTAAAGAGAGTTTAAAAGAGAA
GGTTTTTAAAAATTTAGTAATACAGTAGAGAAAGTTCTTCAAAATTGTGG
AATAAGGGTTTAGATAATTTTATAACAATGATGGCGTTAGCAGAGTTTGT
TATTTTTTTACAGGACCAGTCTTACTTGTATACTAGCAAACTTGCTCTTG
CTACATGAGTCACTTTTCAGATTGAAAAAAATATTCATTTGTTGAAACAG
TTGCTTTCAGATTATTATCGTCTCCACTTATTTCGTTTAGAACGCAGGAC
ACTTTCCAGTTGATGAGGATGATATGGGAATACGTTTTTGTAAGTCGCGA
GCATGAGTATCAGAATAAATACATCACTCAGTTTATTAGCTAAATATTTT
AGAAACAGACTTTGCAAACTATTTGGTAGCATCTTAGAAGAAATTATAAA
TGGTAGTAAATAGAATATTAATAGCGATAAAGGTGGGTTTGTTTCACCAA
AGACAAATAAAATAAATAGAATAACATTGTTCACTTTTATTAAGACCTCT
AGATTGTTGTTGTTCAAAAAGTTTAGAATTCAGTCTATGATTTAAATCAT
ACAAACAGGCGTTTTTTATTTTCATTTTTTTTTCAGTCGTGACAGTTACG
AACAATTTGAATAAGAAAATTCTGGTGTCCACAGGTAAAGCACCAGAGTG
TTGTTGGAAGGTGGATGACGATGAAACTGATTGCGAGGTTGGTACTTAAG
ATACCTTAAGTTGATAAATTTTGGCGGGGATTAAATTTCCAATTCGCCAA
ATTAAATCCCCGCCAAATTTTACGAAATTGATCTATCGCCAAATTAAATC
CTCGCCAAAAATCGTATTTTGGCCAATTCCAAGCGCCATTGAATGTTTTT
CTAACAATACCAACCTGTTTATTATACAACGCTTGGAAAGTTATGACCCA
AAATAAAAACACTGCACAGCTTTGACTCAGAATTTAACCTTACTTAAATG
AAAATTATACCACCGTCTCTGGAATTTATACTTTTATTTTAATGTTATTA
CAGTCGATGGTATTGGTCGGAGGATTTGAAAAAGAAATTGATGGCAAAAC
AAGCAAAAACATGTCTTTCATGTTCTCGAATTTGGTAATCACGTTCGATT
CTTTAAATGTTTTTCATAATGGAAAAAGAGAAATTATCACTGAGATTAGT
CCTAGTGTTCTTATTTTTAGGTATCACACACATTTTAGGTTTCATATCAA
ATTCTCCTTACTTTGGCTTTAATCGTCTGATTTTTAGCAATTCAAGGATC
AGTTTTCATAAATTGTTTTTATTTTTTGGCGTTTTAAGTCTCATTGTATT
TATTAAGAAGATAATGTATTTAGGATAAGTGATTTGAGCATGTTAATAGT
TTTATTTTTACATAAGTGTTCCTGTTTCATATCAGACACATATTGTCTTC
CTATTGTTATATTATGCTGATACAAGCAAAAATATTTTTCTTTTCCTTTT
TCTAACCAATCTCGCTCTACATCCGTGTCGATCCAATGTGAAAAAGCTTG
TGAATTAAAATTGACGAGTAAGCAAACGATGTCACTCTATTATTTAAAAA
TAAAACCTTTAATAGAAAGATATTCTTTGTTTTCAGTACCCCCTAGATCG
TGTTGGTTCGTGCAAGTTTTATTTGAAAGAAGGGAAGGACAAGCAGTTTT
TGGTGCACGAAATGAAGTTTGACACTACTCCCACTAATGAAGACACAAGT
TCCTCTAGTAAGGGATTCGCATTTATTTGATACTTAGCTAAAAAAAGCCC
TAGAAATCTTCTTAAATTGATAGAATGGCCGTATGCATGTTGAATTGATA
TGGTCATCGTTTTGAATACTGAACGAAACTGAAAGAAGACTTTTTTTTAG
CTAGCACGCATGCTAAATTATTTTAAGGTCGTGTTACAAAAGTTTTATTT
TCAACATTTATGTAATTCTTTTCCTTTCAATGAGAAAAGGAGACAGTCAA
GTTATTGATTCCCTTCAATTCAATTCTATTTTACTTGAAGCTATGCTTAC
TTATACTTTAAAGGAAAAAACATGCATCGAAGAAACTTTCGCCATACGCG
AAAGTTAATTCCTGCGAAATATTGTCAGATTTGTCATTCGCGAAAATTAA
TTTTCGCAAAATATGGTCAAATTTTGTCATTCGCGAAAGTCAATTTTCGC
AAAATACATATAGTTGAATGGAAATTGAAAGTAAATTCCCAAAATTTCAC
GATTTTTTTGCCTCGCGAACCTTTCTTCTGCGAAAGAATCTTTATATCAA
GAAACTTAAATAAAAGTTTTATTAAAGTTCCTTCTTGGTTATATTTATGG
TGCCTTTCTCTCGTATTAATAGCTGTGTATGGAGGAGGTGGTAACCAGTT
TTACAAGGCGTGTGATACTGTTGATAATGTAAGTCTAATTCATGTCAAAT
TTATGATACATTATCGAGTTACCATTTTATTTATAAAACAAGAAGATCAC
TATAGTGTTAGGGTGAGATCAAGGGATCAGGTCCGGTTAGCGTGGTACAC
GGGTACAAACTATACTTGTGAAAGCTACAACTATACTTTGTACCCGAAAC
TATTTTACTGACCAGATCGAATTCACTAGTATACTTTGTACCCATTACAA
GTATACTTTACACCCGCGATCAACTATACTTTGTACCCTGATCAAATATA
CTTTACACCCGCGATCAAGTATACTTTGCACCCGCGATCAAGTATACTTT
GCACCCGCGAGCAAGTATACTTTGTACCCTGATCGAATATACTTTACACC
CGCGATCAACTATACTTTGTACCCTGATCAAATATACTTTACACCCGAGA
TCAAATATACTTTACACCCGCGATCAAGTATACTTTGCACCCGCGACCAT
GTATACTTTGTACCCTGATCAAATATACTTTGTAGCCATCACTAGTATAC
TTTGTACCCTGATCAAGTATACTTTGTACCCATCACTAGTATACTTTGTA
CCCTGAACAAGTACACTTTGTACCCATCACAAGTATACTTTGTCCCCGAT
CAAGTATACTTTGTACCCCGATCAAGTATACTTTGTACCCATCACTAGTA
TACTTTTTACCCTGATCAAGTATACTTTGTAGCCATCACTAGTATACTTT
GTACCCTGATCAAGTATACTTTGTACCCATCACTAGTATACTTTGTACCC
TGAACAAGTACACTTTGTACCCATCACAAGTATACTTTGTCCCCGATCAA
GTATACTTTGTACCCCGATCAAGTATACTTTGTACCCATCACTAGTATAC
TTTTTACCCTGATCAAGTATACTTTGTACCCATCACTAGTATACTTTGTA
CCCCTATCAAGTATACTTTGTACCCTGATCAAGTTTACTTTACACCCGAG
ATCAAGTATACTTTGCACCCCGAACAAGTACACTTTGTACCCATCACAAG
TATACTTTGTCCCCGATCAAGTATACTTTGTACCCATCACTAGTATACTT
TGTACCCTGATCAAGTATACTTTGTACCCATCACTAGTATACTTTGTACC
CTGAACAAGTACACTTTGTACCCATCACAAGTATACTTTGTCCCCGATCA
AGTATACTTTGTACCCCGATCAAGTATACTTTGTACCCATCACTAGTATA
CTTTTTACCCTGATCAAGTATACTTTGTACCCATCACTAGTATACTGTGT
ACCCCTATCAAGTATACTTTGTACCCTGATCAAGTTTACTTTACACCCGA
GATCAAGTATACTTTGTACCCTGAACAAGTACACTTTGTACCCATCACAA
GTATACTTTGTCCCCGATCAAGTATACTTTGTACCCATCACTAGTATACT
TTGTACCCCTATCAAGTATACTTTGTACCCCTATCAAGTATACTTTACAC
CCATGATCAAGTGTACTTTGTCAAACGCCTAATGATGCCATCGTGCTGGC
ATTAGCTCCCATTTGAAATGTCATTTTGAGCCAAGGAATTCCTTTTTGGC
ATTTCAAGTCAAACAAAAGAACCAAAACAGAGAAAAAAAAATTTTTTATG
TGTGCACGTTTTTCATTCAGTCTTTTCTATATATTGTAAAATTTGCAAGA
TTTGCCGTAGCCTAGCCTTACAGCAAAAAGGTTTCAGTCATAATGAGTGC
ACTTTTTGAGAGATTACATAGCTATTTATTGTTTAATCTGTCAAAATTGA
ACTTGAGGGAATCAACTTTTCATCAATGACTCTAAAATATTAATTTTTCG
AAATACCATGACAGAAAATACAATGGAAAAGCTATTAAAATCGAATCCTT
TATGAGAATGCAAAATGCCAGTAGGCTTTTAACGTGTTTAATTTTATTCA
AGTGGCTAAAATATTTGCAGTTCAATATCACTACTCTTTTGAAATGATCT
ACATACATGTGTATGGTACTTGGTCCCAATAAAAAAATACTTTACAAAGA
AGTCCTATGAAAATTCTGAACTCCACTTTGCTTTATGTGTGCACTCTTTT
TTGCTATCATGTGTCAGTCTCTAATAATTAGAATAATTCCCGTGAGAGTA
GTTTCAGTATGGTAACAATAATAGTGCACATTTAAAGCGAATCGGCTTTA
TGTATAAAAAAAGTAAAAGATAGGTATGTTTTCATAGTTTAGGGATTTGT
CCTATTTTTCACAAAATATATATTTTAAAAACTTCTAGAAAGATCAAGGA
AGTATTCGAGTACAACTTGCACTGAAAGCACGCTCTCGAATATTAGAAGA
AAACAATATAATCAAACACGTGCGTGTTTATATTCATTTGCATAATTAGC
TTGTAAAAAGCAGTCCCCGAAAGAATCTTTTACAATTTCCCCATAGAAAC
AGATATTGTACTCGGCCAAGTACCATCCCACTTTATTGCAGCGGATTCCT
TTTTTCTGACAAATCCATCTTTTGGCACGCTGTTCAGCTAGATGACTGTT
GCCTTGGTATAAATCAACAGTATTGGATACCGCAATATTCGGTTGAATAT
TAAAATTTGTCTCACTGAAGACCATACTCCCTTGAGCAATGGGTAGAACC
CATGCTCTATCAGCATTTGAGTATCGGTCATCTTTATTGTGGAGAAGATA
TCCCGTGCGTTTGTTTGGTTGCGTTAGTATCAAAATATCGTGGTTTTCAT
TCTTCTGGCATTTCTTTAGAGTTGAAACTTTCACATGAATTCCAGGGCCT
CCGATGATTGGAGGATGTCTCACCAAATACGCTTGACATTGTTCTCTCAA
ATGCTTTACATGATCACCCGTTACCAACTCTGTTTGCAGGGTTTGAGCAG
CAATGGCCTACAAATAGTATCCGATATTGGATACAGTTCGCCCATAGGAA
ATAGAAATAGAGTAGTAAAAAGAACTTCATATAATAGTAGGGGGCAAGCC
TGGAGTTCCGTGACATATTTTTAGGACCTAGCCATTTTTAGTCTATCTGG
TCTATCCCAAAGAACATTGTATTATAACATATTTTTGAGAGGGAGGATGC
GGATAAGGCCCAGGAAAACTATTTAAGACCAAAATAGTGACGCAATAGGC
AAAACTGCAAGGGAAAATGAATGAGGGGTAGGAAAACAGCTGAGTTTCAG
AAGTCAAAATAAACGAAATTGATTAATATATTCTGGAAGAGCATGAAATT
CTGAGCAAATAAACGTATTACAACTGATCTCTTACTCAACCACACAAAGA
AATACAGCCATTTTAAAACCAGCGACCTGTCAGCCAGCTCTACAGTACTG
TGATTTGACGTCAAATCTTGTCTTGATCGAACTGACGTCGGAATATGTTT
TTAACTTCAAACTTTTTTAGTTCAGTTTGAGCTAGAATCTCAGAATGTTT
GTTTATGAGTTTGTTTGTTTGTTCGCAAACTTTAGAACAGTGTAGAGAAC
GGTATAATTGGTTTACGGAGCTGAAATTAGGGGTAGTTTTTTTAGTGTAC
AACGCAGATTTTTACAAAGATGGGGAGCTCTACCGTTTGGAAATGACAAA
ATCGCGATTGTCCACTTTTTGCAAGGTCAAGGATTGCTGAGTATCGTGAA
AGCCTGTCCAGGATGCAATTCTAACATGCGTTTCGAGCGACACGACCAAT
GTTGTGATGGATATCGGTGGTGAGTTATACTATTACGTATATTACACTTT
TTTGTTGTTAAAAATAATTTAGTGTGTGTGATATTCAGTTTGATATTCGA
AATTCACTTTTAGCTCTACGAAGGAGGGCAGTCATCTGCTTGATTTCTAA
ACCTCTAAAGATGTTAACCATCATTTCCATCAAGAATGGTCGCTTTCCAT
TGCAGTGGTGGTACTACTTTGATCGGATTAAATTTCGCGAGATTAAATTT
AGCAAGCCAAAAAATTCGTGAAATTTTTTGGATTTAATTTCGCGAGTCAG
CAATTTGAAAAATTTCGCGTTGATTCAATTTAGCGTGTAAGGCATTTATT
TCCCAAAAAAATTACACTTTTACGTACAATTTTTCACGGTTTTGAGTTAA
TTTATTAATTATTAATTAGTATTAATGTTTACGCACCTTAACACTGCGCA
TAATTTCGGTATTAAAGTTCACGTATTTTCGGGCCTCTGCGCGAAATTGC
ACGAAAATTAGTACGCGCGAAAATTAGTACCTTCTTTGTAATTTTACTAA
AAGGTTGTTGTTTGATTTACATTGAAGCTTAAAATATAGAAAGATTAGAT
CATAAAAGTTTTCTACAAAAAGAGTCTTCTAGAATGAGTCATGGTCCTCA
CATTACAAATTTCTCTTACAGGAGATGCAATAGCCGTCCTTGTAGAGATT
CAATGAGGCTGAGAGAAGGCACAATCTTTGCGAGTTGGCAAAGAGTATCT
CTTCCGGACCTGTATTTTACCATCTATTTGTGGGCCAACAAAGTTTCAAT
GACCAAAACAACCAACATCGTCGGCATCAGAAAGGAACACACGATCAAAA
TGTTCCAGTTGTTGCAGCAGGTCTGTACGAATCGTCTGCAAGCCAACCCG
ATAACTGTGGGTGGTGGTGGGCCAAACTTCGTGGTGCAAATTAACAAAAG
TCAATTCCAACACGTTCAAAGGGTATGTTAATTATATTGGTATTGAATAG
TAATGTTGCTCAATGGCAAGCTTTCTTTCGGGGGATTAATTTTGGAATCT
CTAGTTTGACCCCCACAGTTCAGCTTTATCAGAAATTCAACTGTTCCTAA
TCAGCCTATTTCATAGGATTCGTGTTTTCAGTACATGATTTTGGGAATAA
TCTGTACACGTAGACAATTTTAAGATCACTCCATCGATTCAATCATTTGT
TTTACAATTCAGTTGAAAAACTTTGGCTAAACAAATTTTCTTTCAGCTGT
AGATTCTTTTTTTTATGAAATTTATTAAGGAAATAATACTCTGAAATCCG
AATTTGTTGAATTCTAGCTAGATTTGATTTCCAATCATAATTTCTAGGGA
AGAGTCGGAAGAAGAAGACAACCTGTTTGGGTATTTGGGTTGGTGGATAC
GCGTTTCACCCGAGCCAGAGGTTATATGGAGATTGTCAACCGTCGAAACC
GTCCCACTTTAGTGAATGTTATCAATAATGTTCTTAACCCAAACACTGTC
GTCCACAGCGACCGGTGGCCGGCTTACCATCGGTTGCGACAGTTTGTTCC
AAATTGTGTACAACACGACATTGTCAACCACACCTACCATTTTGTGGATC
CTCAAACTGGTGCACACACACAAGTAAGACCATGTGCCTAGTCTAAATTT
TCTTTACTAGGTTTGCGGAATGACGGGCATGTGCCGCCCGACTTTTGCCC
TTTAGAGGGAATGAAATCAAGGCTTTTTAGTGCTGGTGCTGGTGTTTTTC
TAGATATATATTAAAAATAGCAATTAAAATCTAATTTCAAAACTCATGTA
TTCACTTTCAGAATATCGAATCATATTGGAACATATTTAAATTGAAGCTT
AAGGCAATGGAGGGAATCCAGCTCCAATTCCTAACTAGCTACATGGAGGA
ATTTATGTGGAGGTAACTTCTTTGATTTTATTTGCATTAAAATAGCTTTT
TTCGGAACTCATATTTTAATATTAAACAGTTGTTAGCGTTTAACAATCGA
GGTTTTATGCGTTTTTGTTACATCCTTCTCTATGCAAACCTTGAACGGGT
TTTCGCTGGGTTTTACGTTATGTTTCACCATAAAGTCATTAAACTATCAA
GCAGTTTTGTTAAGATTTCATCAAATAAAGTCAAAATGTTTCGAATCATT
TCAAAAATTTTAACAGCAATCTTGTTAGATTCTACCCTTGGGGTAAAGAG
AGTTGACGCTTCAGTAGTTGTCTAGAAAATTGTTCAAACTAATTTTAAAC
GTATTCTTGTTGTTTTAAGAGATTGGTATGGATTGAATACTCCATTTTGA
CCACATCATCAATCGCATAAATATTGACTATCCCATAGATGATAGAGTTG
AGACAACGTTGTAAATCTTTGTATTTTTTATAACTGAAGGATTCTTTTTT
TGAATTTTTTGAACATCTTTTTCACAGAACAAAGAAAACATGCCAAGTAA
TTCATTGTTTTGCTTGTTATAATTTTCTCTATTTTTTGGTGTTTGTTAAT
TTAGAAACGGGACATTTAAAAGAGAAGGGGAATATTTTGGTCCGTAAAAT
TGATTTTGGCACGAAGCGGGGGGACAGTCGCTTGTATTGTCCGAGTTATA
CCCATGTACAAGTGGACTTCTAGGGGGTACCAAGTGTCCAGGTACCGAGT
TATTTGTGTTTGGGTCTCAAGCAGACTTGTAGGGAGTACCATGTGAACTT
GTAGGGGACACCAAGTGGACTTGTAGGGTATACCTAATGGACGTGTGTTT
AGGAATTAAAAAAATTGACGTTAAGTTTTACCTTTTTTAAGCCGATCCTT
ATTGCACCAAAAGACAAGGGCGTGCGCAAAAAGGGTCGATTAGGATATTC
AAAAGCATAGCAGTCGGCTAATAGTACACCAAAAATTACAAGCAAAATTG
GTTAAAAACTTATCTCTTCGAATTTTGTTTTTTCATAAACATTTTAATGA
AAGTTCGTAAAGTAAGTTCGAAAATTCGTAATTAAAGACCAGAGACATGA
AATGAAATCTTAAACAATGTTTCGTCCTTAAGTCTGGCTAATAGCATATG
TGGTTCAAGCCACATACCTTGTAACATCATTTCACTCTATCCACTGGTTT
GAGAGAAATTCGATTGTCAAGTTGTGCACTCGAGTTTTACTGACCATAAC
TGATTTATTGCGGATTCTGTGGATATAAAGTATACTTGACCAGGGTACAA
AGTATACTTGATCGGGGTACAAAGTATACTATTGCCGGGTACAAAGTATA
CTTGATCATGGGTACAAAGTATACTTGACCATTGGTACAAAGTATAGTTG
ATCACGGGTACAAAGTATACTTGACCATTGGTACAAAGTATACTTGATCA
CGGGTACAAAGTATACTTGATCGGGGTACAAAGTATATTAGTGACGGGTA
CAAAGTGTATTTGACCATGGGTACAAAGTATAATTGATCATGGGTACAAA
TTATACTTGATCGCGGGTGTAAAGTATATTTGATCAGGGTACAAAGTATA
GTTGATCGCGGGTGTAAAGTATATTTGATCAGGGTACAAAGTATACTTGC
TCGCGGGTGCAAAGTATACTTGATCGCGGGTGTAAAGTCTATTTGATCAG
GGTACAAAGTATAGTTGATCGCGGGTGTAAAGTATATTTGGTCAGGGTAC
AAAGTATACCAGTGAATTCGATCTGGTCAGTAAAATAGTTTCGGGTACAA
AGTATAGTTGTAGCTTTCACAAGTATAGTTTGTACCCGTGTACCACGCTA
ACCGGACCTGATCCAGATCAAGTATATAAGTGCATAATCTTTCCTTGGTG
AGAAAGCTTGCCGAAGATTTCGAAACACTGGTTACAACTCGAATTTCTGT
TCTCTAGTAGCTTCTACTTACTATCTACACTAAAAATCATTCATATGTTT
TTTTCTCTCTTTGCAGAACATTCGTAACAGTTGCAAGCCATTCGATTGTT
CGGCCAAGTATAATGGATTTCGGAATTACTACAACAAGGTGACAAAACGA
TGCGAACCAGTATTTACATGCGCCACACCGCTTGGTGACGATGATTTACC
TGATTCGGTGAGTTATCCCAACATTTTTCACAATGTTTTATAATTTTTCA
TAATTTTTGAGACGGAGGTGAAATTACCTCATTTTAACGTATCGGCAATT
TATACAATAGAAAGAACAACTTTTCTGTCTTTTCGGCGCCGCGCGATCAC
AAATTTTAAGAACTTGTCTTGTTCATTCTGCTTCGTCAGCATAAGGGCGC
GGCCTTTAATAGAGAAAAATGCAGGTAAAAGAAGGAGCTACGGTTGACGT
GATTGTGGAAAGTGGTTTTGGTTGCGACTTTTTTCAAGTACCATTTTAGA
CAAAACTGACGCATCTTGAACATACATTGACAATTTACTTTTGTGAAAAG
ACCAAACAATCTCGAAAATTGCGAAAACCTTCTGTTCGCGAAAGTTTGAA
CGCTTTAAGTTATTAAAATTCCTTTCGTTTTACTCTTCTCAGCCTTTCTG
AAATTTTGCCCTCTGAGGTCTTGGGTTTTAGATTGTAGAATTTTCACAGC
GTCTTCAGTATAAATCCTAACTTATTGGCTACAATGTATTTAACAATAAT
ATCAAGTCGATATAATATCGAATGTTGTATCTTTATTTAACCCATTTTCA
AAGGCTTGCCAGGTCTTTATCGCTCTTTGATTTTGTGTGACAAGTTTTAC
AATTCCCTTGACAGGCATTTGATATGGATTTCAACAGTTGTAAATCGTTA
GAGCCGAAAATGTCAAAAGAGGAAGAAGAAGCAGCCCAAAATTTGATGAA
TAAAAGCCCGTTGCAAAAAGAAATAAATCAGTACGCTGATATCAATGCTG
AAGAGGTATTGAACCAAAAATTTATGATTGCACCGAAAGTTACCTTAAGT
GGATAAATTTTCGCGTGGACTTTTTCGCGAATCGAGGATCTTAATTTTTG
CGGGGACATGATTTTGCGTCCTGATAATCTTACTAACACGTTTTTAAGAT
GCGTGAAGTACTAGTGACCTTTGTACACAAAATTAAAAACATAGAAAATG
TCACATGTAAACAAAAAACAATCTTTTCTATTGTTTGATACATTTGTTTT
GACACATGTTTCGTTTAACGAAACTCTCGAGCAATGTGTACATTTTACCA
AATAGATCCCCCATATATCGAACGGCAATGAGGGCACTCTATTAGAGTAT
TAGAGCAGAATTTCCCCTATTTGTGAAAAAAGCAAAATTGAGACAACACT
TGCCTTCAATCTTTAATTAAAAAAAACAAGGTCTCAAGGGACAAGTAAAA
CTCTTCGAGGAGTCATTTGAACTACAGATACTTTACTGTTCCTTTAACAC
CTGATTCCCTTGTTACAAAGCTTACAAACTTACTCAATTTTATTCCTTTT
TATGATTTTAGATTGTGTTGAGTTGTAAGAACGGTTATCAGGAAGATAAC
CATTGCCGTTGCAACAGAGGATGGAAGACAGTATCAAAGAAAACTAAAGA
TGGAGCTCTTACGATGGACTGGTGTTCCAAAAAAGTCCCGATCATACCCT
CTAAAGCCACTCCTACTGCTAGATGGACTGTCTTCGGGGTATGTCACTTT
ATTCCCAAAATTCAAAGCAATGTTCTCTTTCCTGGGAAGCAAAGAATACT
TTTTACGCCAAACCAAGTTATAATAACGTCTCACTTATTCGATGGTGGTC
AAAATCGCTATCCTTGCTATGAAGTCTGACTAGAAATAATCTGCAGCAGA
GACAAAAAAGGCTGTAATTTTTTAAATAATGCGAATAAGGCGAATTAAAT
TTTCTCAAGAAGAAAAGAAAAGTCAAATAAAGATGAAAAACGAAAAAGAT
AAATTTTGTCTCTTTTGTTTCCGTTGCAGATTGTTTTGAGCAGACTTCAG
CTTTTTGTGGTCAAAAAATTGTTTTCATTGTCAAAGGTTTAGTACATATA
ATTTTTACTTGATGTATTTTTCCCAGATGCTGACCATAGCAACCATCGGG
TTCCTTGTTTTGATTGGCTATCTGTGGTGGAGATGGTTCCTGGGTGATAT
GGTGCGAGATTATCTTGAGCGTCGTCGCAGCGCCGCCGCGAAGGAGGTTT
ATTCTGATAGCGAAGGAGAAGGTGAACACTCTCCTACACAGGGAAAGTCT
CAGAAACGACAAGATTATTCTGATGAAGAAGAGGATGAGTACGGTGACCT
TTACAGTGAATACTAAGACCATGTTCACATACTGTGGTTCCTCTTCGCAC
TGAAACAAAATGAAGCCATTCTATTGGTTAAGTTCAAGTTTTACGTCACT
TATAAACAAGGGCTGTACATAACTTGCCAAAGCAAATCATGCAAGTAAAA
TCTTATGTACAGGTCTACGATATTGCATTGAACGGTCTAAATAAACACTT
GCTTAACCTCGCTAATAGAATGACTTTATTTCTTTTCGGAGCTAAACGGG
ACCGTTACACGTGCAGGCATGGTCTATGTTAAATCTGGACATGACATTCT
ATAATAGACGTTCGGACAGATTATGATGTCTTTCGATGGGAAAGCGCAAG
TATTTTTACCATGGATGTTCTCGAGACTTGCGTCTCCGAAACTTTCAAAC
AAAACTTAGATACGATATGATTAAGCAGACAATGGATTTCTACTCTATGT
TTTAACTTGTAATTTTTATATATTCTGTATTATATTTTTCCAAAGATTTC
CTATTATATTTTTTCTGACAAATATTCTTTTTATTCAAACTTCTAAAATT
GCAATTTTCATTATTATACATACCTATTTACAGCAACTCTAGTTGTTAAG
TAGC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000100_pilon:636722..649975-

>MSTRG.12946.1.p1 ID=MSTRG.12946.1.p1|Name=MSTRG.12946.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6678bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100_pilon:636722..649975- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCTGACCATAGCAACCATCGGGTTCCTTGTTTTGATTGGCTATCTGTG
GTGGAGATGGTTCCTGGGTGATATGGTGCGAGATTATCTTGAGCGTCGTC
GCAGCGCCGCCGCGAAGGAGGTTTATTCTGATAGCGAAGGAGAAGGTGAA
CACTCTCCTACACAGGGAAAGTCTCAGAAACGACAAGATTATTCTGATGA
AGAAGAGGATGAGTACGGTGACCTTTACAGTGAATACTAAATTGTGTTGA
GTTGTAAGAACGGTTATCAGGAAGATAACCATTGCCGTTGCAACAGAGGA
TGGAAGACAGTATCAAAGAAAACTAAAGATGGAGCTCTTACGATGGACTG
GTGTTCCAAAAAAGTCCCGATCATACCCTCTAAAGCCACTCCTACTGCTA
GATGGACTGTCTTCGGGGCATTTGATATGGATTTCAACAGTTGTAAATCG
TTAGAGCCGAAAATGTCAAAAGAGGAAGAAGAAGCAGCCCAAAATTTGAT
GAATAAAAGCCCGTTGCAAAAAGAAATAAATCAGTACGCTGATATCAATG
CTGAAGAGAACATTCGTAACAGTTGCAAGCCATTCGATTGTTCGGCCAAG
TATAATGGATTTCGGAATTACTACAACAAGGTGACAAAACGATGCGAACC
AGTATTTACATGCGCCACACCGCTTGGTGACGATGATTTACCTGATTCGC
TGTGTATGGAGGAGGTGGTAACCAGTTTTACAAGGCGTGTGATACTGTTG
ATAATTACCCCCTAGATCGTGTTGGTTCGTGCAAGTTTTATTTGAAAGAA
GGGAAGGACAAGCAGTTTTTGGTGCACGAAATGAAGTTTGACACTACTCC
CACTAATGAAGACACAAGTTCCTCTAATGGTATTGGTCGGAGGATTTGAA
AAAGAAATTGATGGCAAAACAAGCAAAAACATGTCTTTCATGTTCTCGAA
TTTGATGCTGACCATAGCAACCATCGGGTTCCTTGTTTTGATTGGCTATC
TGTGGTGGAGATGGTTCCTGGGTGATATGGTGCGAGATTATCTTGAGCGT
CGTCGCAGCGCCGCCGCGAAGGAGGTTTATTCTGATAGCGAAGGAGAAGG
TGAACACTCTCCTACACAGGGAAAGTCTCAGAAACGACAAGATTATTCTG
ATGAAGAAGAGGATGAGTACGGTGACCTTTACAGTGAATACTAAATTGTG
TTGAGTTGTAAGAACGGTTATCAGGAAGATAACCATTGCCGTTGCAACAG
AGGATGGAAGACAGTATCAAAGAAAACTAAAGATGGAGCTCTTACGATGG
ACTGGTGTTCCAAAAAAGTCCCGATCATACCCTCTAAAGCCACTCCTACT
GCTAGATGGACTGTCTTCGGGGCATTTGATATGGATTTCAACAGTTGTAA
ATCGTTAGAGCCGAAAATGTCAAAAGAGGAAGAAGAAGCAGCCCAAAATT
TGATGAATAAAAGCCCGTTGCAAAAAGAAATAAATCAGTACGCTGATATC
AATGCTGAAGAGAACATTCGTAACAGTTGCAAGCCATTCGATTGTTCGGC
CAAGTATAATGGATTTCGGAATTACTACAACAAGGTGACAAAACGATGCG
AACCAGTATTTACATGCGCCACACCGCTTGGTGACGATGATTTACCTGAT
TCGCTGTGTATGGAGGAGGTGGTAACCAGTTTTACAAGGCGTGTGATACT
GTTGATAATTACCCCCTAGATCGTGTTGGTTCGTGCAAGTTTTATTTGAA
AGAAGGGAAGGACAAGCAGTTTTTGGTGCACGAAATGAAGTTTGACACTA
CTCCCACTAATGAAGACACAAGTTCCTCTAATGGTATTGGTCGGAGGATT
TGAAAAAGAAATTGATGGCAAAACAAGCAAAAACATGTCTTTCATGTTCT
CGAATTTGATGCTGACCATAGCAACCATCGGGTTCCTTGTTTTGATTGGC
TATCTGTGGTGGAGATGGTTCCTGGGTGATATGGTGCGAGATTATCTTGA
GCGTCGTCGCAGCGCCGCCGCGAAGGAGGTTTATTCTGATAGCGAAGGAG
AAGGTGAACACTCTCCTACACAGGGAAAGTCTCAGAAACGACAAGATTAT
TCTGATGAAGAAGAGGATGAGTACGGTGACCTTTACAGTGAATACTAAAT
TGTGTTGAGTTGTAAGAACGGTTATCAGGAAGATAACCATTGCCGTTGCA
ACAGAGGATGGAAGACAGTATCAAAGAAAACTAAAGATGGAGCTCTTACG
ATGGACTGGTGTTCCAAAAAAGTCCCGATCATACCCTCTAAAGCCACTCC
TACTGCTAGATGGACTGTCTTCGGGGCATTTGATATGGATTTCAACAGTT
GTAAATCGTTAGAGCCGAAAATGTCAAAAGAGGAAGAAGAAGCAGCCCAA
AATTTGATGAATAAAAGCCCGTTGCAAAAAGAAATAAATCAGTACGCTGA
TATCAATGCTGAAGAGAACATTCGTAACAGTTGCAAGCCATTCGATTGTT
CGGCCAAGTATAATGGATTTCGGAATTACTACAACAAGGTGACAAAACGA
TGCGAACCAGTATTTACATGCGCCACACCGCTTGGTGACGATGATTTACC
TGATTCGCTGTGTATGGAGGAGGTGGTAACCAGTTTTACAAGGCGTGTGA
TACTGTTGATAATTACCCCCTAGATCGTGTTGGTTCGTGCAAGTTTTATT
TGAAAGAAGGGAAGGACAAGCAGTTTTTGGTGCACGAAATGAAGTTTGAC
ACTACTCCCACTAATGAAGACACAAGTTCCTCTAATGGTATTGGTCGGAG
GATTTGAAAAAGAAATTGATGGCAAAACAAGCAAAAACATGTCTTTCATG
TTCTCGAATTTGATGCTGACCATAGCAACCATCGGGTTCCTTGTTTTGAT
TGGCTATCTGTGGTGGAGATGGTTCCTGGGTGATATGGTGCGAGATTATC
TTGAGCGTCGTCGCAGCGCCGCCGCGAAGGAGGTTTATTCTGATAGCGAA
GGAGAAGGTGAACACTCTCCTACACAGGGAAAGTCTCAGAAACGACAAGA
TTATTCTGATGAAGAAGAGGATGAGTACGGTGACCTTTACAGTGAATACT
AAATTGTGTTGAGTTGTAAGAACGGTTATCAGGAAGATAACCATTGCCGT
TGCAACAGAGGATGGAAGACAGTATCAAAGAAAACTAAAGATGGAGCTCT
TACGATGGACTGGTGTTCCAAAAAAGTCCCGATCATACCCTCTAAAGCCA
CTCCTACTGCTAGATGGACTGTCTTCGGGGCATTTGATATGGATTTCAAC
AGTTGTAAATCGTTAGAGCCGAAAATGTCAAAAGAGGAAGAAGAAGCAGC
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TCTGATAGCGAAGGAGAAGGTGAACACTCTCCTACACAGGGAAAGTCTCA
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AGATGGAGCTCTTACGATGGACTGGTGTTCCAAAAAAGTCCCGATCATAC
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AAGCCATTCGATTGTTCGGCCAAGTATAATGGATTTCGGAATTACTACAA
CAAGGTGACAAAACGATGCGAACCAGTATTTACATGCGCCACACCGCTTG
GTGACGATGATTTACCTGATTCGCTGTGTATGGAGGAGGTGGTAACCAGT
TTTACAAGGCGTGTGATACTGTTGATAATTACCCCCTAGATCGTGTTGGT
TCGTGCAAGTTTTATTTGAAAGAAGGGAAGGACAAGCAGTTTTTGGTGCA
CGAAATGAAGTTTGACACTACTCCCACTAATGAAGACACAAGTTCCTCTA
ATGGTATTGGTCGGAGGATTTGAAAAAGAAATTGATGGCAAAACAAGCAA
AAACATGTCTTTCATGTTCTCGAATTTG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12946MSTRG.12946Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12946.1.p1.exon9MSTRG.12946.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12946.1.p1.exon8MSTRG.12946.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12946.1.p1.exon7MSTRG.12946.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12946.1.p1.exon6MSTRG.12946.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12946.1.p1.exon5MSTRG.12946.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12946.1.p1.exon4MSTRG.12946.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12946.1.p1.exon3MSTRG.12946.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12946.1.p1.exon2MSTRG.12946.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12946.1.p1.exon1MSTRG.12946.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12946.1.p1MSTRG.12946.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000100_pilongenomesc0000100_pilon:636722..649975 -