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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000100_pilon:566703..576846- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12940.1.p2 ID=MSTRG.12940.1.p2|Name=MSTRG.12940.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10144bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100_pilon:566703..576846- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATTCAAGATGGCTGACGCAAGGGGAGCTTTTTTCTGAACTCGGGAAGCAA
ACCTTTCACTTTGTAAGTATCGGGATGCGTGTAATCTGTAAGACAGCAAG
ATTGTACGTCGAGTAAACGTTTTTGTTAATTTGTTAGAATATCTTGAATC
GTACCTTAAGGCTTTTTATTTAAGAAAAAGTTGATATTTATTTTAAAAAG
GGAGGCTGGGGAATAGCCAGACGGTGTCAATCGAGCAACTTCGAACAAAA
ATTGCAATCGAACCAATCGAACCAATCGAACGTAATCAAACGCGATCGAA
TAATTGCGATTCGATTGTCGAACGTAATCGAATCTCAATCGAACGGCCGA
TTCCTGGGTAATATTCGATTGTGTTCGATTGCGTTTGAGTAAGGTTTAGA
TTGGTTCGATTGATAGTTGAACTATATTCGATTGTTGAATAATCTTCGAT
TTCGTGCGATTAGGTTTATGTTTGATGAGTTTGATTAAATTAAATTGGAT
CACTCCGTTAGGGCTTTTTAGCGGGCGGCCGAGTGCTTAAGTACCGTAAC
CAAAGCGAATAAAATCTAATATAATTGAATCAATCGAACGTAATCGAATA
CAATCGAACGTAATCGAATACAATCGAACGTAATCGAAGCAATCAAACAG
CAAATCCTAGGTAATATTCGATTGCGATTCGATTGCGTTCGACAATCGAA
TTGAAATTATTTGATTGCGTTCAATAGACCCCTTTCATGTGATGTCATAT
CTTTTGGATTACCTTGCTTAGCCTAAATAAAATATATTACAAATTTGGAT
GATAGAGGCTATATGCCTCCAACTTTGCCTCCGAATTCTGTCTCTTTTAT
TCCAGATTTTGTTAAAAAAGACCATACAGAAAAGAAGACTAATCGAGACA
ATCAAAACATGCTGAAAAAATTATGAAAGGGGTCTATTGCGTTCAATTGA
TTCGGCGTTCGATTCGTTCGATTCGTTCGATTGACACCGTCTGGGAATAG
TTTTGAATTTTTTTTATTAGTAGATACCGTGAGAGGTCCTAAAGCCGACA
GCCCAGCCTAATTCCGACCCCCCAAATAACTGTTATGAAAAAAAATTCTA
TGTTTACAAACATTCCCTCTCCAAGTTGAACGATAAACTATTGCTAGAAC
TCTCGAAACAAAACATCTAACAAGATAGCTGTAATGTCAAGATGTCAATT
AATGTAATTAAAAAGTTCGAGTTGTAAAAATAATTACCTTTTATTCTGGA
TCAGTTGCTCATGTTTAAAACGATAACAGTTTTGTAATAAAAGTGACTTG
TGCGGGAAAAATACGAAACAACTTGGACTGGTTTCCATCAAGAAACAAAC
AGACTAAATTGTAAAAATGGCGCGAAGTTGAAAAAAGGGCGGATGCGGTA
GCACTAATTTGAATAACAAACATCGAATCAATGAGGCGGCAACTATCAAC
GCCCTCTTTACCACTTATAAGTCAGGATGTTTATTTACGGAAGGCCCGCA
ATCGGACAGCTCTTCATTTAAGTGTACTCTTTGACGACATATATTATCTT
TACTAGAATAGGAGCAAGGTGTCATGTAATACATAATAATTGTAATATAC
GTCATCTATTTGTATTCTTATCATGTAATATATAATATAATGTAATATAC
GTCGTCTATATGTATCCTTACACAAAGTCCTGGCCCCGCAATCAAGCCAA
GTGCCCGTGTAAAGTAATAGAAACCAGGCTTGATTACGTAACGTTTCAAA
ATGAGCACGCTCGTACTTAGACCTCTTTTATATTCTCGTGTGCTTTGGAA
AATCAAAACATCTCGTTACTTTTTATGATGCTTTTACTACTGTTGTCATT
TATGAAGTTGTGCATATTGGAATAAAAAAATATGTTTTGTTATAAGAAGC
AATCATTGTTATTTGGTTCAATTGGTTCAATGTATCAAATCTCTCAGTTT
AGTTGACACTTTGGTATCTTCGTTGCGTCACAGCGAAAGGTTTGTTTTTA
TTTTAGTTTGTATCTTTGAAAGAACCCATCGGCTTTAGGCTGGGCTGTCG
GCTTTAGGACCTCTCACGGTACTCCAGCCAGTTCTCTGCCTGGTCCAGTC
TGGTGGGAATTTCAAAAAAAAATAATTCCATTTTGCTCTCTCATAAGCAG
TGAGGCTGGAACTTCGATTTTTGAGGATTACGATTTTACCAGTTTTTTAG
CGATTTTTGCCTGGCTAACCCAAATCTCGCAACCTCTTGATGGAAATTAG
AGTTTTTCAGCGTTCCGAAAAAAACGCAGAGCAGAAATCTTTTCATCTTC
ACAGGATCGATTCTCAACAACAAAACACATCTTTTGGTCTTTGGGTTTGT
CTCTGATGTTTTTCCTTCAAAGAATATTGATCACTTTCCTTTTATTAGTT
TTCCCCTCTAGCGCGCAAGAAAAAAATGATTAGCTCGCGTTTTCGCGCAG
GCGAATGAAGATGAGGCGGCAATCTTGCACTGAGGGTGCTACTTAGTTTG
CGCCCACGATAGAATGGTCTAAACACGGGGGTATTTCAAATGATAAATTA
TGTCGTTCTGTAAGTGTTTATTTCCTAAGAGATATCACAAAAGCAAGTGA
CATTTACATGGTTGATCCTTATAAAGTTGATCTGACGGTTTGTTGTGAAA
AAAATTGACCCCCGTGTTGGTTTTATAGCCTATCTTTTTGGATTTGTGAG
AAGACAAATGTTATTGTAAAAAAAAGTCATTTGGAAGTAATCATACCCTT
TCCAGGGACCAACATTTTTTAAGTCAGAATTCATTGCCAGTAATGCCGCA
GCGTGGTTTGAAACCTTGCTGGTGGTTGTTGTAGGTCTGGTGGAAAATGT
GATTTATTTCTGAATATAAACATTACTGCAGCTATAATATTTTCTTTATT
TTGACAAACAAAAGGTTCAAGGTTTGTTTACTTTTTATTTTACTGCATTT
CTCTGTCTTATTCTGCTGTAGTAGGCAATTGAAAACTCCTGATTTTTTGT
TTTTGTCAGTGCTCGCTCGGCAGCCATTTTGAATTTTTTTTTTCAACGTC
TGTACTCGGCAATTTCGTGACCTCTACAGAATCAACGATTTTGCCTGAGG
GGAACAGCAGTGCCCAAGGCGTCGAGTATGCCCTTGGCACAGTGACAAGC
TGTTACTAGCAACCCTGACCCTACCTAACTGTTAGTTAATCAATTCCAAA
CAACAAAACCCCCGGAAACACAGAATCCGCTAGGGCAGGATTTAGTCGCT
TCTCGTTTTTCCTCCAAAGAATATCAATCACTTTCCTTTTCCCCTTGAGC
GCGCGAGAAAAAAATGATTAGCTCGCGTTTTCGCGCGGGCGAGCATACAT
AAATTTAAATATATGGTTAAATAAAAAACAGATGATAACAGTTCTGTTTA
TTCCTTAAACCCCCAGGAAAAGTTTTTTGCTGACTTAGCTATTTTACAAA
TCTTGGAAAAAAACTCCCATAGGAATTCCGATACCTAACCCGATTGGTTA
ATTTCAGAACAGCTTCAAGAAAGTCATAATGGCAGATAATTTTAAAAGTT
TCTGAAGAAATGTGTGTAATTTATCAATGTTGATTGATGGCTTGTTGATT
CTTTAAAGAAAAAAGACAACAGGTATAGCTTTTTCTAATCCTGGAATATC
GAGGTTCCAGCTACACTTAGTTTGCGACCAAATGTTTTTGAACCCAGAAA
AGTCGTACAAAAAGAAACCTCTGGAGACTTTCTTTTAATAGTTATCTTCC
TTGACCTATTTGCCAAAAAGAATCTGAACGATTTAAGCTTGCAGTCGTGC
AGAAGCTCAAAAACAACCCCATTTTTTACTGAAAAAGTCGCTAAAAAGAC
AAGACATTGACCTTAAATCTTTTTGCAGTGATAGTATTTTGAGAAAAAGT
TATTTATGATGTCAGATTAAATCCATTGCTCGCTTATTTTGATTCTCTTC
TCCTGTAATCTTCCTCCCTACTTGATTTGAATTGAATATGCTACAACGTA
CACACCAGGAAATCAAGGTATTAGAAAAAACAACAGTCATCAAAATGTAG
GGAGTAGATGCTGCAAATTAATTTGTACCTTTCACTAATTTATACTTTAT
AAAATTTCTTTTTTTAAAGATCAATCAAATTATTCAATATTTCATTTTTA
ATTAACTAAAAAATTATGTGAAAAAAAACTGCTTCTGTTAGTTTTTTGGA
TAATAGTGAGAAATTTAACATTTGTAGAACACAGTCATTTCATTTTATTT
CCTAACCTTACCAAGGTAATCTAAAAATTCAGGTCTTTGGTTGTATTTGG
ATTTTATCTTAACTAGGATGTTGATCGCTATTTTATTTTTTTGCTACTTA
CTTTGTATCCTTCTCAGGATTTGGCGTTTTAGGGGAGGTTACCATAACGT
ATCCTTATTTTAAAATAATCCCTCGGACTGGCAGTCAATAAACCTTTTGT
TTTTAAGGAATGCTTTATTACAAGAGTTGTTCTCTTTCATTCATTCCTTT
TCAAGTCTTATCTTCTCCTAGTTTCTTATCTTTATCAACCCAAGACTCCT
TAGGGTTTCGATCAGTTTGCAACTTTTGTTGTTTTTCTATTAATTTGCTA
CAGTCTCTAGAAAACGATTTAGATTTTCAACCTTCTATCTTATCTGTAAC
ACCTTAATTTTCTTGAAGTGCAAAAATCTAAAAATGTACTATGTATCCTG
GTTCGAATTCCAGCACTATCCATAATCCACCAATGGGTTATAACACTCGC
CCTTCTGAATACGATGACCAGATATTTGAAGAGCACTCAAGATATCAGGT
TCAATCTTCGAGAACAAACCCTACAAATAATGTCAATACTGGACCTCATC
AATCATATTATGATCACTTATACCCAACCACAAATCCCATGAGGCGGACT
GTTAGTGAATATGATCATTTTTCGTCATATAATCATCATTCACAACAACA
ACAACAACAACAACAACTTCAATCATCTTTATCGTATGATTCTTATGTTG
CTGAGCAACTTTACAAACAACAGAACTGTATCAAATATTTAAACCAAGCT
ATAAAATCCTCAAAGGAATACTTAGCAGAAATTGAGCATCAAATGCTTAT
TAAGGAAGATGAACTTTCACAGTTGAATCGAATTCAAAAGAATCCATCAG
AACAGGATATTGTGGATATAAAAGCTGAAATAAAAAACCTTAGGTACTCC
GTCCAAAATCTTTTTTGTGATGAGATGGGTGGACCAGAACCACAGCCAAC
AACACCAACAAGTCCTACAAACCAAAGGCTACCGTCATCTTCCGCCCAAT
ACAGTACAGCAAGGACATATGATAATTATGGAAATTTTACTGGTGCGAGA
TTCCAATCAATACCTTTGGAAAGCCCTACCTCAAGACTATTGAGGAATCC
TATCGATGATTCTCTTGTTTCTTCACATCAGCAATAAGTTTGTTTTTCAT
TGTTCGGTTATGTTTATGATAATTTTTGGTTTTGGTGGTCAATTTTGAAT
TACCTTAAGTGAAGAAATTTTTGCGGAATTTAATTTCGCAGTTTTTTGAC
AAACCCACAAAATTAAATTCTGTGAAACATAAATTTTTTCAAGATTTGAA
AAAGCATCTTTAAAATTGGTCATTTTAGGCCAAAATAGGCCATATTATGA
ACAAAAAATTCTCTCAACTTCAATATTGAATTCTGTGAAACTTCCAAATT
TTGAGCTGTGAACTGCAAGATTAAATTCCGCGGAAAATTTCTTCCCTTAA
GGTATTATTTAAGTTTTGGTGAATGTTTTATGATGAGGTCTGAATAAGAC
AAAGCTCAAATTTCTTTTGTGGGATCATTTATTTATTGCAGAACCAGAAA
TATGCCAACATTAAAGTCTCAACCTGAATTTACCGTTTCACACTTAAAAT
TTTGGGATGAATATTTTCCATAGGATCATTTTGATTGGTATAAGGTATAA
TTTTAGAGTAGTTTTTACTTTGTAGATTATTCGCACTTTCATACTTATAC
TTATAATCTGTTATAATTAACATTTTAGAATTGCTTCAATGAAGCTGTTA
TTAAAAGAATTGGCATTGCTTACATTTTAACAATGCTCACTCATGTGAAT
ATACTTTATAAATTTAAATTGAATATATTTTATACCTTATTTTTAGATTA
ACATTTTTTATTTCGTAAAACTTTTGTTTATTTAGTGTCGTGATTTTTTA
TTATTTTCATTTTCTTTTATTCAAATACATTGTAGATTTTGTTTTGTTTT
TCTTTGCCTTTTCTTCGCCTTCTTATCCTGGTTTTGTTGCCATTTTTGAT
TTTCTAAGATTTACAGTATTTATTTTACAGTATTTTCTCAAATAACTTTC
TTTACATATTCGTTTATTTATTTACAGATGAAATAATAAGAAGTACGAAA
GAATAATAACAACAAAGTCTAAACAATGGCTGATGCTGAGTATGACCAGG
CAAGGATGCATGGGAATCGTTCTCCAACAAGACAACACGTGTATGAGAAT
GTACACAGTTTTCAACGCCCACTTCCGCCAACAATACCAAACAGGACAGG
TTCACGAGTTGATAACATTTCATCTCCAGAACATACTTCTTATTTCACAA
ACATTCAACAACAACAACTTAATCAATCACACGATGGGCTTCGTACACGT
CATGATGGCTGGTCTGAGCAACCACCTTCCTATCAAGAAGTAGTCCCGTC
ACCTAACCAACGTAAATCGTTAGATGAAAGTTTGAATCGTCATGTACAAG
CTAACGTCAATAATACTACTAGTAATGCTTCAAATTTTGTACGCCAACAC
AGGCGTGGACGTAGTGACGAGGTAGCACGTTGTTTTGAAGGAACACCTAG
TGTTCCACGGACTTCTCGATTTGGCTCACCACCATTAATGCGAGCTAACC
ATATGATGCATTCACAAAGCACTACGTCTTTGGATCAACAACACCCACAC
CACCACGCGCACTCATTACACCATAGTGCATCCATTGATAATGCAGCTGT
ACAATCGATACTAAATGAAAAACTTTACCAACAGAATACTGTTTATGTTA
ACTTAACAACTGGGATTACTTTATCCCAACGAAAATTGAAAGAACTAGAA
AATGAAGTAGAGCAACGTGAAAAAGAGCTCAATAAATTGTTATCAGTCCA
AATGAACCCCACTGAGAAAGATTATAGACATTTGAAAGGAGAGGTCGCCA
TTTTACACCAAGAAATTGCGCAAATGTATAATGAATGTGATAAAATGAAC
ATTTCAATTGATCCAACAAATAGTCATTTCGCTCCACCACAACGCCAGTA
TCCGCAAATGCCGCCTCAACCACCTGTACCCAACATTCACACACCATCTC
CGCGCAACAATATGTCTGGCAATGTGTTATTTCCAAATTCACAATTAACA
GGCAACCATACGTTACCAACGAATTACCATAAAACCATCAGCGACCCATC
ACCAGACCATTCAGGGTCTTTTCAACAAACACCTGAACTTTTTCGAAGTC
AATCAACAATACCAAGGCGGCCACCGCCCTCTTCACCTAATCCACGCCCT
GTGACGTTGATTCAATCGCCTACGCCAATTTCTCATCCGTTGGGAAGTCC
AACCAAAACTTCTGCTCAGGAAGAAGTTAATGAAAATGAACATTGGCTTT
GCCCAACATGTACTTTTAAAAATTTGTTAGTTCCTGAATGTGAAGTGTGT
TGCACTCGTAGGCCACCTGTGGTAGGATTAAATGACTCTTTGACTGGTGG
TAGTCAAGGTGCTATGCCAATGCAAAGACTATGAATGAAGTATTTTTTAT
CCAATTTGAAAAAAAGGAGACATATGAATTTTGTTTTTGAAACACTCCAC
TTTTAAAAGGATTTGTTATTTAAAACTGAAAAATGAGATACTGTGAGTTC
TAATTGATTGATTCCTGGCACATTTTTATAAGCAAAATGTTAAAGAATGG
TGTTTCTTTAGTCCTATTAAATTCCAATGTTGATTTTTTGCTCGAGTAAT
GCTTATAAAGATTGTGTCCAGTTATCAATATACTTTTTCTTCAAATACAT
CAACTTTTGCTGTACAAAAAGGGCTTTTTTCTAAACTTTCCCATTGTCAT
ATGACGTCAAATGTCATTACATACACAATCCTAAGAGAATCAAACATTTT
GACGTCATTCAACTCGAACCCAAACCCCTAGATGATGCTAGGGTCGATAG
GTGTTTAGCCTGAGGAGTATTTTCATTTTGGAGCTTCAAAATAGGTTCAA
GGTTGCACCACCAACAGATTCCCATAAATATACAATTTTTTGAAGAAATT
AAATTTTTCGACTTTTCATTTCATGCAGTCTAGGTTCATTAAGTCTTTTT
AAAAGATTTTTGATAAAGCTTCAATATCAATGCTTCTGTGTCTAAAATTT
TAAGTCTTGATCAAAAGCAAATAGAATTTATTAATCACAATCAAACTGAG
GAGACGCTTGTTGGTAGTGCATACCTCAATAAAGTTTTTCTCATGAAATG
AAACCCAAATTCTAATGGTTATGTATTTTTAGCAGTATTCGAACAATCTG
CATTGAAAGCAAGAGACTGTTTTAATAGAATTTTGAATTAGATTGCTATT
TCTGCTCTTTGAAAAAATCTAAGAACCATTAACTTTTTCAGATTAGATCA
AAATTATCATCCAGTCAAACACAAAAATCAGCAAAACAACTCTGATATGA
TACTTTCATTTCCAATTGTTGTTATCTTTTAATTTGATAACAATCCACTT
ATAAATATATTTTCAACAAGCACAAGAAATCAATCTAATTCGAATTCAAC
TAATACAGTCTTTTTGTTTCCACTACAGATTAGTTTGAGAGAGAATTAAG
TTTAAATATTCTAGCGGTCATTTTAATATTTTTCTGAGGATACATAGAAG
TGTTTTTCAAAAATTATTTACATTTTGAAGACATTTTAATATTTTTATAT
ATACCTCAAAATGTTATAAGGAAAACCTTTTTTTCGAGCTTGACCTCTAG
TTTTTATTAAAATTTATCAAACTTCTGAGCCGAATATATATCTCTGATAC
CGGTAATACACATACTAAAGTCTGTTTTCAAAAGTATGTGGGCACTTCAC
TTTTTAAAAGATTCTTCCAGTGTCCATCTAGATGATATATTAAAAAGTCG
TACACCGTTGAAAAGATATTTCTGAGGAAAATAATGCTAAAGATTAAAGA
AAACTTGAAAATTTGAGGAATGAATATAAAAAAAGAAGGTTGTTCTTCTT
CGTTGGAAAATTATGATATGACACTTCAGAATGTCTGTTCCTTGCTTATT
TCAAATCTATGTACAGATTTTTCAGCCCAGTGCAGTAGGATTTAAACAGC
CAAAAAACTTACCTCGAAAGGCTTTTATCCGAGAAATCTCGATGCAAGGT
TAAGTGTCGTCTCATGAATTTTCTAACCAGTATGAAAAATCTTCATTTTT
CTATTTTTTCAAAAATCTTTGATAGAAGAAAAATATCTTTTCAACTGTAC
ACAATTTTTTTAATATAGCATAGGGGCGTCCAGAAATTATTCAAAAAGCA
AAGTATCCACAACCTTTTGAGACAGACTTTTTAGAAAATATTCTACTTTT
TTGGTGAGATAATGGCTCTTTGCAACATTTTTGAAGAAAAACAATTTTGC
TATTTTAGCCTCTTGTAAATATAATCTAATAACAATCTCTCGTGCGCTAT
CTTTTCAAAATTTCCGATCGTAGTTTCGATGTTCACAAAATTTGCTGCCA
AACCTTTATACTCACAACCTTTAATGATACAGAGTTAACGTAGTCGTTGT
GGTTATAAATAAGGAGCCAGGAATATCTCCATAAATAAGAGCTAATTCCT
GGACAAGTTTAGCTTTGCTTCTATAAACAGCGAAAGGGTTATGTTGTTAT
TCGGCTGGGAAGATTTTCAGAGCGGAAATTGACTTTCTGAAGACAAATTT
TGGATGAAAAATTGAAAGTCAAACATCAGATTCATTATATTTCTTATCTT
TGAACTGGGCAAGGATCATAATTTTAGCCCGGGTTTTTCAAATGAAATTT
GTGTTCTGAAAACATGAGAATTTAGGAATAAAAATAAAGTGTTCTTCTTT
ATTCCTTTGTGTATAAATTGATATTTTGAATTACTTTTCTAAAT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000100_pilon:566703..576846- >MSTRG.12940.1.p2 ID=MSTRG.12940.1.p2|Name=MSTRG.12940.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=705bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100_pilon:566703..576846- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGTTATAACACTCGCCCTTCTGAATACGATGACCAGATATTTGAAGA
GCACTCAAGATATCAGGTTCAATCTTCGAGAACAAACCCTACAAATAATG
TCAATACTGGACCTCATCAATCATATTATGATCACTTATACCCAACCACA
AATCCCATGAGGCGGACTGTTAGTGAATATGATCATTTTTCGTCATATAA
TCATCATTCACAACAACAACAACAACAACAACAACTTCAATCATCTTTAT
CGTATGATTCTTATGTTGCTGAGCAACTTTACAAACAACAGAACTGTATC
AAATATTTAAACCAAGCTATAAAATCCTCAAAGGAATACTTAGCAGAAAT
TGAGCATCAAATGCTTATTAAGGAAGATGAACTTTCACAGTTGAATCGAA
TTCAAAAGAATCCATCAGAACAGGATATTGTGGATATAAAAGCTGAAATA
AAAAACCTTAGGTACTCCGTCCAAAATCTTTTTTGTGATGAGATGGGTGG
ACCAGAACCACAGCCAACAACACCAACAAGTCCTACAAACCAAAGGCTAC
CGTCATCTTCCGCCCAATACAGTACAGCAAGGACATATGATAATTATGGA
AATTTTACTGGTGCGAGATTCCAATCAATACCTTTGGAAAGCCCTACCTC
AAGACTATTGAGGAATCCTATCGATGATTCTCTTGTTTCTTCACATCAGC
AATAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000100_pilon | genome | sc0000100_pilon:566703..576846 - |
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