MSTRG.12936.5.p2 (mRNA) -

Overview


Name	MSTRG.12936.5.p2
Unique Name	MSTRG.12936.5.p2
Type	mRNA
Organism	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000100_pilon:473764..546563+
coding sequence from alignment at sc0000100_pilon:473764..546563+

mRNA from alignment at sc0000100_pilon:473764..546563+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR

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>MSTRG.12936.5.p2 ID=MSTRG.12936.5.p2|Name=MSTRG.12936.5.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=72800bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100_pilon:473764..546563+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TGTTCATGATAATCTGTAAGATATTACAAGTTtgatttttgcagtttttg
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000100_pilon:473764..546563+

>MSTRG.12936.5.p2 ID=MSTRG.12936.5.p2|Name=MSTRG.12936.5.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=24063bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100_pilon:473764..546563+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGATGCTACAGACTTAGACGCAGTTTTAGAAAACATCTGTCTTCTTAT
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ctaaaaaactgaaaaaacatGGCTCTAAAGAAGGTTTGTTTTTGGTTCGT
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aGGGCGTGTCTCCCATCATCAAATATTCAAGaacaAGAATTTATACGGTA
TCGAACATGGCCCACAATTCAATTCTTTGGAACTTTTAATCGAAGCTTAC
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CAAAAACTTTTATCGAAAACTCAAAATCCAATAGAAACAAACACAACGCT
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GTGAACGTATTTCCAAATATGACCTCTTCAACGAACCTGCTGATTACCTT
CCGATTGAGATGTTCGACACACGATCTGATTACATTGAACAAACCAGGAA
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CTGATCTCCAAGGCTGGGTTTTCGTAAAAGCCTTCGATAAACAAAAATGG
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CAAATGTTTTTGCACGACTTCAGAACGTCATCTGATTGGCTGGATGTCTG
GATTCAGATTCGCTAAATATGGTCAACAGCTGTACACGAACTTTCGAGAG
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actaaaaaactgaaaaaacatGGCTCTAAAGAAGGTTTGTTTTTGGTTCG
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aaGGGCGTGTCTCCCATCATCAAATATTCAAGaacaAGAATTTATACGGT
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CCATAGTGGAGCTGTCGAGGGCGCTGActtcagtttgaaaaaagcttGCC
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CTTCTTATTGAAGATATGGAAGAAAATATTAACGAAACAAAGaaAAGCCG
ACAAAAACTTTTATCGAAAACTCAAAATCCAATAGAAACAAACACAACGC
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TCACCTAAATCAACAGCGCCCACCCCACCCAGTCGACCACGTGACACTCC
GCCCGTCATCCGCCACGACTTTACACACAAAAGCACGAGTGAAATGGAGC
CGTTTGAAACTTCCCATATCGCATCAATAGACAATGCCGTTCATTATGAT
GAATTACAAAAAGCAAAAGAAGCATCGGAAAGTAAAAACAATATCATTAA
GCATCCATTAAACGATCACAGAGGTCGAAGATTGTGTTGCTCAGCCGAAA
ATTCACCCATATTGAGTCGTAGTATGATTTCAAGGCAGAATGTACCTTCA
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AAAGCCGGTGTTTTCAAAGCCTGGACGTCATTTCAGCTAGCCTGGAAAAT
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GAGTGAACGTATTTCCAAATATGACCTCTTCAACGAACCTGCTGATTACC
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AACGTTCGCAGAAGCTCTTTGCTTAGGTCAATCATGACAGCTGATCAAAC
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GGAAGAAACGTTTCCTCCGAATCAAGGATAAGATTGTGTATACTTGTGAA
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ATCCTCACTGTTTCTGTATTATTCCTAAAGTGGTGACTTCTTGGCATGAA
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CCGCCCGTCATCCGCCACGACTTTACACACAAAAGCACGAGTGAAATGGA
GCCGTTTGAAACTTCCCATATCGCATCAATAGACAATGCCGTTCATTATG
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AAGCATCCATTAAACGATCACAGAGGTCGAAGATTGTGTTGCTCAGCCGA
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CAAAGCCGGTGTTTTCAAAGCCTGGACGTCATTTCAGCTAGCCTGGAAAA
TCGCACACGTGAGagggatggcggaaaaaattgCACTTATAATTGAAGAA
CATATAAGTGACTTACATATAAAACGCTTAATTGAGGACCACGAGATTAT
TCATAAAGTGACTACAAACTGGGCACCAGACTCCAACAATGTTCTTGTAA
TGAGTGAACGTATTTCCAAATATGACCTCTTCAACGAACCTGCTGATTAC
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TGGAAGAAACGTTTCCTCCGAATCAAGGATAAGATTGTGTATACTTGTGA
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GctactaaaaaactgaaaaaacatGGCTCTAAAGAAGGTTTGTTTTTGGT
TCGTGAAAGTAACTCAACACATGGTAACCTCGTTCTGACGGTGATTACaa
aaaaaGGGCGTGTCTCCCATCATCAAATATTCAAGaacaAGAATTTATAC
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GCTTACCATAGTGGAGCTGTCGAGGGCGCTGActtcagtttgaaaaaagc
ttGCCCTATATAA

Gene-mRNA-Prot

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.12936	MSTRG.12936	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.12936.5.p2	MSTRG.12936.5.p2-protein	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


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Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000100_pilon	genome	sc0000100_pilon:473764..546563 +

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MSTRG.12936.5.p2 (mRNA) -