MSTRG.12921.8.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12921.8.p1
Unique NameMSTRG.12921.8.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000100_pilon:339710..377375-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12921.8.p1 ID=MSTRG.12921.8.p1|Name=MSTRG.12921.8.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=37666bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100_pilon:339710..377375- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CATCATTCTTTTCATCAGACCTGTTCAATGAAACACCTCCCTTTCAAAAA GGTAATTTTTGAGACATACAGATGGGAAATATACCTGAGACCTTTAAAGT GAATTTTATTGAGGTCTAAAGATTTTTAAGAGAACCATTCCTTTCTATGA TAAAGAAGACAGATAAAGTTAAATTTAGGACCTGGTAGTATGTCAGTAGT ATACTGAAGAAGAGTTTTTCACGCAACTGGTTGGCAAGAAAATTACCCTA AGCGAAATTAAGTATAGATAATATTTACACGTCTTACCCTAGCAATTTAA AATTAGATTTTAAACAAAAAAAAACAACAACAATGGAAATCAAACAAATA CCAATCAACAATGAAGATTTGCAGAGGTTTAGCAATCATTGTCATACATT TAAAGATCATCCCTTGAGTATGTTGGAACCATACCATCAAGTCTTTCCAT CATTTTATATGGATCACCACAAATCATTTCAAGAAGCTGAAGTTTATGAA GATGATGTTTGGATTTGCACTTTCCCAAAATCAGGTAGAATTAATGGGTG CTTATTTTGTGTATTTACAGCTTGAATTACAAACTTATTCCATATGGCAA ATAAGTTCTCTTGTGTCATTTTATCCCGACTCTCCTTTGGCATAGGTTTG GGATTGATCTTTGTAACTGAAACCTTTTTACTTCATGAGTGCATATTGAA GCCGGCATCTTAGGTATGTGAAGCTTTAAATAAGTGAAAGCAATTGCTGT CAGGTTTAACTATTACAGCAAAACTATAATTGTCTTGTTTTGAATTTAGG AAAACGATGATTTAGAGTAATAAGAAGTGTTCAATTCAAATATAAGAAAG ATCAAATCATTAGTATTTCTGAAGGATTTACTATTCTTTACTTTTCCAGG AACCCGCTGGATGCAAGAAATTGTCTCTTGTCTGAGGACTGGCTTGGATT 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GAGTATGTTGGAACCATACCATCAAGTCTTTCCATCATTTTATATGGATC ACCACAAATCATTTCAAGAAGCTGAAGTTTATGAAGATGATGTTTGGATT TGCACTTTCCCAAAATCAGGTAGAATTAATGGGTGCTTATTTTGTGTATT TACAGCTTGAATTACAAACTTTTCCCATTATGGCAAATAATGTTCTCTTG TGTCAGTTTAACCCGACTCTCGTTTGACAAAGTTTTTGGATTCATCTTTG TAAATGAAACCTTTTTACTTCATGAGTGTATATTGAAGCCGGCATCCTAG GTATGTGAAGCTTTGAATAAGTGAAACCGATTACTGTCAGGTTCTACTAT TACAGCAAAACTATAATTGTCTAGAGTTTTTGTAGATGTTTTGAATTTAG GAAAACGATGATTTAGAGGAAATGTTGAATTCTAATATAAGAAAGATCAA GTATTTCTAAAGGATTTACTATTCTTTACTTTTCCAGGAACCCGCTGGAT GCAAGAAATCGTCTCTTGTCTGAGGAATGGCATAGATTTTGAGAAAGCAA AATCAATTCCTCTAGACTTTAGAGTACCTTTCTTTGAGTAATGTTTTTTT TATTTATTAAAAAGTATTGGCTAAAATTCTTGGGTTGAACTAAATGGGAA ATATCAACAGTGAAGATAAGATTAAAACAGAAAAGATTAACAGAATGATA ATCACAATCAACTCAACTTTCTTTACTCAATAAGGATCAATGGTCTAAAA TACATAATCTTTTCTCATTTTAGTTTATCAGCCGTCTTTAATAACGCAGA AAAGGTACTCAAAATTAGGGGTTCTTCTTGCAAAACAGGAGCTGAACTTG TTAATCATACACTTCGACCAAGGACAATAAAAACCCATCTCAGCTATGAA ATGTTGCCTCCAAAGATTCATGAAAAAGGTGCCAAGGTACCAGAACTTAT TTTTCGCTGATAAAGGGATTCGATTGAAATAGTTTGATTTTTTTTATGTT AAAAATTCCCTGATTTTGATTTTTTTTAACCAATGCAAATGATTTCTATT TAGATGATCAATGTAATACGAAACCCACGTGATGTTTGTGTATCATTTCT CAACCATCATGTTCTGACAGAAAACTACACTGGTGATTTACAAACCATCG CAGAGATTATGTTACAGGATGTAGGACCTGTCAGTGCACCTTTCTTTACA CATATCCTCAGCTACTGGAACCAACGAGAAAATCCAAATCTTCTGATTGT TCACTATGAAGAGATGCAAAAGGATATAACTGGTGGAAATTTCTTTTGAA TTTGTTTTTAGCGAGGTCTAATTTTAACAGTTGAGCAGGGCATATAATGT TAAAATCGTTACATAGGTGTTTCAGGTAAGAATCCTGGAAAAGTCTTGGC AACGGCGTCAAGTTAAAAAGTACTTTTGTGAAAATTAAAGATAACTTAGT AGATTGAAATCTTTAACCATCTTCCAGGTGTCATCAAACGATTGGCCAAG TTTATTGGTACAGAGGAATATTCAGATGATCAAATAACAAAACTTGTAGA GCATACATCTGTGGATAAAATGAGAGCCAACCCAATGGTCAATCAGACTG GATCACTTGATGTAATTATTTTTAACCCCATCAATTAGATAATGAGTCTG AGTAAAAGTTAAATTCTTTATGGATATTTTTAATCAACTATCATTTTAAG ACTTAAGAATCAGGGGGGGGGCACAGTCGCAGGGTACAGACCCACAGCCA GGTGATGGTGTCTAATTTTGAATTTCATTTATTACCAGGTTCTATATTTG GGGTGGGTGGGCCATTTCAACTCATTTCAAGCAAGCATCTGGTACTGATT TTGGTATTTGGTGGGTAAAATGGGTAAAAATGGTAAAAATTTATCAATTT TGGCAAATCAGAAAATGATTCTATAAAAATTAGATTTCATTTTAATTTCC GGATTTTGAGTTCTCCCACATTTTGGTGTGGTGAAATTGACTGCTAGGTA TTACAAGGTACCTTTCCAGAGTTATTTAGCCATACTTTCCTTGGTGACCA GCTTCCAAATAGGGGACGGAGATCTTTTTTTTCTACAAAAAAAGTTGGTA CCTTAAACTAAAAAGGGGGTGGTGGTATCTAAGACAAATCTTTCTGAAAA TCAGGGTCAGTACCCTGTGGCTGTACAATGATATTTCTAGTAAAACAGCT ATGGTATAGCTGGAGTTTGTTTTATTGAAAGAACGGGCTAATTATAATGA CATCCCTTTATTTGAATTGGATGAATGAAACGTTTTAATTGTTTTTTTTA CCGTTGCTTCTTTCTTCAATTTTAGAAACTAAAGGCATCAATGAAGAATG AGCAAAAAGGAAGTTTTATCAACACTGGGAAAACAGGAGGATGGAAAATC AAACTCACTGAAGAAACTATTGAGAGGTTTAAAAAATGGGAAGAGAAATG GTTGAAAGACACTGGATTGTTGTTTGCTTACGAAGTTTAATTTTTTTAAT AACACATAAATTTTAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000100_pilon:339710..377375-

>MSTRG.12921.8.p1 ID=MSTRG.12921.8.p1|Name=MSTRG.12921.8.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5958bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100_pilon:339710..377375- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAACTAAAGGCATCAATGAAGAATGAGCAAAAAGGAAGTTTTATCAACAC
TGGGAAAACAGGAGGATGGAAAATCAAACTCACTGAAGAAACTATTGAGA
GGTTTAAAAAATGGGAAGAGAAATGGTTGAAAGACACTGGATTGTTGTTT
GCTTACGAAGTTTAAGTGTCATCAAACGAGTGGCCAAGTTTATTGGTACA
GAGGAATATTCAGATGATCAAATAGCAAAACTTGTAGAGCATACATCTGT
GGATAAAATGAGAGCCAATCCAATGGTCAATCAGACTGGATCACTTGATA
TGATCAATGTAATACGAAACCCACGCGATGTTTGTGTATCATTTCTCAAC
CATCATGTTCTAACTACTAACTACACTGGTGATTTACAAACCATCGCAGA
GATCATGTTACAGGATGTAGGACCTGTCAATGCACCCTTCTTTACACATA
TCCTGAGCTACTGGAACCAACGAGAAAATCCAAATCTTTTGATTGTTCAC
TATGAAGAGATGCAAAAGGATATAACTGTTATTCAGCCGTCACTAATAAC
GCAGAAAAGGTACTCAAAGCTACGGGCTCTTCTTACAAAACAGGAGCTGA
ACTTGTTAATCATACACTTCGACCAAGGACAATAAAAACCCATCTCAGCT
ATGAAATGTTGCCTCCAAAGATTCATGAAAAAGGTGCCAAGGAACCCGCT
GGATGCAAGAAATTGTCTCTTGTCTGAGGAATGGCATGGATTTTGTGAAA
GCAAAATCAAGTCCTCTAGGCTTAAGAGTACCTTTCTTTGAATGGAAATC
AAACAAATACCAATCAACAATGAAGATTTGCAGAGGTTTAGCAATCATTG
TCATACATTTAAAGATCATCCCTTGAGTATGTTGGAACCATACCATCAAG
TCTTTCCATCATTTTATATGGATCACCACAAATCATTTCAAGAAGCTGAA
GTTTATGAAGATGATGTTTGGATTTGCACTTTCCCAAAATCAGAAACTAA
AGGCATCAATGAAGAATGAGCAAAAAGGAAGTTTTATCAACACTGGGAAA
ACAGGAGGATGGAAAATCAAACTCACTGAAGAAACTATTGAGAGGTTTAA
AAAATGGGAAGAGAAATGGTTGAAAGACACTGGATTGTTGTTTGCTTACG
AAGTTTAAGTGTCATCAAACGAGTGGCCAAGTTTATTGGTACAGAGGAAT
ATTCAGATGATCAAATAGCAAAACTTGTAGAGCATACATCTGTGGATAAA
ATGAGAGCCAATCCAATGGTCAATCAGACTGGATCACTTGATATGATCAA
TGTAATACGAAACCCACGCGATGTTTGTGTATCATTTCTCAACCATCATG
TTCTAACTACTAACTACACTGGTGATTTACAAACCATCGCAGAGATCATG
TTACAGGATGTAGGACCTGTCAATGCACCCTTCTTTACACATATCCTGAG
CTACTGGAACCAACGAGAAAATCCAAATCTTTTGATTGTTCACTATGAAG
AGATGCAAAAGGATATAACTGTTATTCAGCCGTCACTAATAACGCAGAAA
AGGTACTCAAAGCTACGGGCTCTTCTTACAAAACAGGAGCTGAACTTGTT
AATCATACACTTCGACCAAGGACAATAAAAACCCATCTCAGCTATGAAAT
GTTGCCTCCAAAGATTCATGAAAAAGGTGCCAAGGAACCCGCTGGATGCA
AGAAATTGTCTCTTGTCTGAGGAATGGCATGGATTTTGTGAAAGCAAAAT
CAAGTCCTCTAGGCTTAAGAGTACCTTTCTTTGAATGGAAATCAAACAAA
TACCAATCAACAATGAAGATTTGCAGAGGTTTAGCAATCATTGTCATACA
TTTAAAGATCATCCCTTGAGTATGTTGGAACCATACCATCAAGTCTTTCC
ATCATTTTATATGGATCACCACAAATCATTTCAAGAAGCTGAAGTTTATG
AAGATGATGTTTGGATTTGCACTTTCCCAAAATCAGAAACTAAAGGCATC
AATGAAGAATGAGCAAAAAGGAAGTTTTATCAACACTGGGAAAACAGGAG
GATGGAAAATCAAACTCACTGAAGAAACTATTGAGAGGTTTAAAAAATGG
GAAGAGAAATGGTTGAAAGACACTGGATTGTTGTTTGCTTACGAAGTTTA
AGTGTCATCAAACGAGTGGCCAAGTTTATTGGTACAGAGGAATATTCAGA
TGATCAAATAGCAAAACTTGTAGAGCATACATCTGTGGATAAAATGAGAG
CCAATCCAATGGTCAATCAGACTGGATCACTTGATATGATCAATGTAATA
CGAAACCCACGCGATGTTTGTGTATCATTTCTCAACCATCATGTTCTAAC
TACTAACTACACTGGTGATTTACAAACCATCGCAGAGATCATGTTACAGG
ATGTAGGACCTGTCAATGCACCCTTCTTTACACATATCCTGAGCTACTGG
AACCAACGAGAAAATCCAAATCTTTTGATTGTTCACTATGAAGAGATGCA
AAAGGATATAACTGTTATTCAGCCGTCACTAATAACGCAGAAAAGGTACT
CAAAGCTACGGGCTCTTCTTACAAAACAGGAGCTGAACTTGTTAATCATA
CACTTCGACCAAGGACAATAAAAACCCATCTCAGCTATGAAATGTTGCCT
CCAAAGATTCATGAAAAAGGTGCCAAGGAACCCGCTGGATGCAAGAAATT
GTCTCTTGTCTGAGGAATGGCATGGATTTTGTGAAAGCAAAATCAAGTCC
TCTAGGCTTAAGAGTACCTTTCTTTGAATGGAAATCAAACAAATACCAAT
CAACAATGAAGATTTGCAGAGGTTTAGCAATCATTGTCATACATTTAAAG
ATCATCCCTTGAGTATGTTGGAACCATACCATCAAGTCTTTCCATCATTT
TATATGGATCACCACAAATCATTTCAAGAAGCTGAAGTTTATGAAGATGA
TGTTTGGATTTGCACTTTCCCAAAATCAGAAACTAAAGGCATCAATGAAG
AATGAGCAAAAAGGAAGTTTTATCAACACTGGGAAAACAGGAGGATGGAA
AATCAAACTCACTGAAGAAACTATTGAGAGGTTTAAAAAATGGGAAGAGA
AATGGTTGAAAGACACTGGATTGTTGTTTGCTTACGAAGTTTAAGTGTCA
TCAAACGAGTGGCCAAGTTTATTGGTACAGAGGAATATTCAGATGATCAA
ATAGCAAAACTTGTAGAGCATACATCTGTGGATAAAATGAGAGCCAATCC
AATGGTCAATCAGACTGGATCACTTGATATGATCAATGTAATACGAAACC
CACGCGATGTTTGTGTATCATTTCTCAACCATCATGTTCTAACTACTAAC
TACACTGGTGATTTACAAACCATCGCAGAGATCATGTTACAGGATGTAGG
ACCTGTCAATGCACCCTTCTTTACACATATCCTGAGCTACTGGAACCAAC
GAGAAAATCCAAATCTTTTGATTGTTCACTATGAAGAGATGCAAAAGGAT
ATAACTGTTATTCAGCCGTCACTAATAACGCAGAAAAGGTACTCAAAGCT
ACGGGCTCTTCTTACAAAACAGGAGCTGAACTTGTTAATCATACACTTCG
ACCAAGGACAATAAAAACCCATCTCAGCTATGAAATGTTGCCTCCAAAGA
TTCATGAAAAAGGTGCCAAGGAACCCGCTGGATGCAAGAAATTGTCTCTT
GTCTGAGGAATGGCATGGATTTTGTGAAAGCAAAATCAAGTCCTCTAGGC
TTAAGAGTACCTTTCTTTGAATGGAAATCAAACAAATACCAATCAACAAT
GAAGATTTGCAGAGGTTTAGCAATCATTGTCATACATTTAAAGATCATCC
CTTGAGTATGTTGGAACCATACCATCAAGTCTTTCCATCATTTTATATGG
ATCACCACAAATCATTTCAAGAAGCTGAAGTTTATGAAGATGATGTTTGG
ATTTGCACTTTCCCAAAATCAGAAACTAAAGGCATCAATGAAGAATGAGC
AAAAAGGAAGTTTTATCAACACTGGGAAAACAGGAGGATGGAAAATCAAA
CTCACTGAAGAAACTATTGAGAGGTTTAAAAAATGGGAAGAGAAATGGTT
GAAAGACACTGGATTGTTGTTTGCTTACGAAGTTTAAGTGTCATCAAACG
AGTGGCCAAGTTTATTGGTACAGAGGAATATTCAGATGATCAAATAGCAA
AACTTGTAGAGCATACATCTGTGGATAAAATGAGAGCCAATCCAATGGTC
AATCAGACTGGATCACTTGATATGATCAATGTAATACGAAACCCACGCGA
TGTTTGTGTATCATTTCTCAACCATCATGTTCTAACTACTAACTACACTG
GTGATTTACAAACCATCGCAGAGATCATGTTACAGGATGTAGGACCTGTC
AATGCACCCTTCTTTACACATATCCTGAGCTACTGGAACCAACGAGAAAA
TCCAAATCTTTTGATTGTTCACTATGAAGAGATGCAAAAGGATATAACTG
TTATTCAGCCGTCACTAATAACGCAGAAAAGGTACTCAAAGCTACGGGCT
CTTCTTACAAAACAGGAGCTGAACTTGTTAATCATACACTTCGACCAAGG
ACAATAAAAACCCATCTCAGCTATGAAATGTTGCCTCCAAAGATTCATGA
AAAAGGTGCCAAGGAACCCGCTGGATGCAAGAAATTGTCTCTTGTCTGAG
GAATGGCATGGATTTTGTGAAAGCAAAATCAAGTCCTCTAGGCTTAAGAG
TACCTTTCTTTGAATGGAAATCAAACAAATACCAATCAACAATGAAGATT
TGCAGAGGTTTAGCAATCATTGTCATACATTTAAAGATCATCCCTTGAGT
ATGTTGGAACCATACCATCAAGTCTTTCCATCATTTTATATGGATCACCA
CAAATCATTTCAAGAAGCTGAAGTTTATGAAGATGATGTTTGGATTTGCA
CTTTCCCAAAATCAGAAACTAAAGGCATCAATGAAGAATGAGCAAAAAGG
AAGTTTTATCAACACTGGGAAAACAGGAGGATGGAAAATCAAACTCACTG
AAGAAACTATTGAGAGGTTTAAAAAATGGGAAGAGAAATGGTTGAAAGAC
ACTGGATTGTTGTTTGCTTACGAAGTTTAAGTGTCATCAAACGAGTGGCC
AAGTTTATTGGTACAGAGGAATATTCAGATGATCAAATAGCAAAACTTGT
AGAGCATACATCTGTGGATAAAATGAGAGCCAATCCAATGGTCAATCAGA
CTGGATCACTTGATATGATCAATGTAATACGAAACCCACGCGATGTTTGT
GTATCATTTCTCAACCATCATGTTCTAACTACTAACTACACTGGTGATTT
ACAAACCATCGCAGAGATCATGTTACAGGATGTAGGACCTGTCAATGCAC
CCTTCTTTACACATATCCTGAGCTACTGGAACCAACGAGAAAATCCAAAT
CTTTTGATTGTTCACTATGAAGAGATGCAAAAGGATATAACTGTTATTCA
GCCGTCACTAATAACGCAGAAAAGGTACTCAAAGCTACGGGCTCTTCTTA
CAAAACAGGAGCTGAACTTGTTAATCATACACTTCGACCAAGGACAATAA
AAACCCATCTCAGCTATGAAATGTTGCCTCCAAAGATTCATGAAAAAGGT
GCCAAGGAACCCGCTGGATGCAAGAAATTGTCTCTTGTCTGAGGAATGGC
ATGGATTTTGTGAAAGCAAAATCAAGTCCTCTAGGCTTAAGAGTACCTTT
CTTTGAATGGAAATCAAACAAATACCAATCAACAATGAAGATTTGCAGAG
GTTTAGCAATCATTGTCATACATTTAAAGATCATCCCTTGAGTATGTTGG
AACCATACCATCAAGTCTTTCCATCATTTTATATGGATCACCACAAATCA
TTTCAAGAAGCTGAAGTTTATGAAGATGATGTTTGGATTTGCACTTTCCC
AAAATCAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12921MSTRG.12921Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12921.8.p1MSTRG.12921.8.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12921.8.p1.exon6MSTRG.12921.8.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.8.p1.exon5MSTRG.12921.8.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.8.p1.exon4MSTRG.12921.8.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.8.p1.exon3MSTRG.12921.8.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.8.p1.exon2MSTRG.12921.8.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.8.p1.exon1MSTRG.12921.8.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000100_pilongenomesc0000100_pilon:339710..377375 -