MSTRG.12921.22.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12921.22.p1
Unique NameMSTRG.12921.22.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000100_pilon:346362..362922-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12921.22.p1 ID=MSTRG.12921.22.p1|Name=MSTRG.12921.22.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16561bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100_pilon:346362..362922- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TAATGAGGTCTAATTTTAACAGTTTAGCAGGGCATATAATGTTAAAATCC AAAATCTTTACATAGGTGTTTCAAGTAAGAATCTAGAATGGGTTAAATAC ACTTATTACCCTTAGCGGAAATACCTGGAAAAGTCTTGGCAACGGCGTCA AGTTAAAAAGTACTTTTGTGAAAATTTAAGACAACTTAGTAGATTGAAAT CTTTAACCATCTTCCAGGTGTCATCAAACGAGTGGCCAAGTTTATTGGTA CAGAGGAATATTCAGATGATCAAATAGCAAAACTTGTAGAGCATACATCT GTGGATAAAATGAGAGCCAACCCAATGGTCAATGGGACTGGATCAATTGA TGTAATTATTTTTAAACCATCAATTTGATAATGAGTCTGAGTAAAAGTTA AATTCTTTATGGATATTTTTAATCAATTATGCTTTTAAGATTTTTGCAAT CAAGGGGGGGTACAGCTGCAGGGTACACCCACAGCCAGGTGGACTGGTAG TGTCTTATTTTGAATTTCATTTATTACCAGGGGTGGGTGGGGCATTTCAA CTCATTTTAAGCAAGCATCTGGTACTGATTTTGGTATTTGGTGGGTAAAA TAGGTAAAAATGGTAAAAATTTATCAATTTTTGCAAATCCGAAAAAAATT CCGTAAAAATTAGATTTCATTTTAAGTTCACGATTTTGGTGAGGTGAAAT TGACTGCTAGGTATTACAGGGTACTTTTGCAGAGTTATTTAGCCATATTT TCCTTGGTGACCAGCTTCCAAATAGGAGGTAGAGGTCCCTTTTTTCTTCA AAAAAAGTTGGTACCTTAAACTATCTAAGATATCTATTACAAATCTTTTT GAAAATCAGGTTTATTACCCCCTGTTGCAATGGTTTTTCTAGTAAAACAG CTATGGTATAGCTGTAGTTTGTTTTACTGAAAGAATGGGCTAATTATAGT 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TCAACCATCATGTTCTAACTACTAACTACACTGGTGATTTACAAACCATC GCAGAGATCATGTTACAGGATGTAGGACCTGTCAATGCACCCTTCTTTAC ACATATCCTGAGCTACTGGAACCAACGAGAAAATCCAAATCTTTTGATTG TTCACTATGAAGAGATGCAAAAGGATATAACTGGTGAAAATTTCTTTTGA ATTTGTTTTTAATGAGGTCTAATTTTAACAATTTAGCAGGCCATGATAAT GTTAAAATCCAAAATCGTTACATAGGTGTTTCAGGTAAGAATCCAGAATG GGTTGAATACACTTATTACCCTTAGCGGAAATACTTGGAAAAGTCTTGGC ATCAAATTAAAAAGTACTCTTGTGAAAATTTAAGATAACTTAGTAGATTG AAATTTTTAACCATTTTCCAGGTGTGATCAAACGAGTGGCCAAGTTTATT GGTACAGAGGAATATTCAGATGATCAAATAGCAAAACTTGTAGAGCATAC ATCTGTGGATAAAATGAGAGCCAACCCAATGGTTAATGGGACTCGACCAA TTGATGTAATTGTTTTTAAACCCATCAATTTCATAATGAGTCTGAGTAAA AGTTCTTTATGGATATTTTTAATCAAAGATTTTTACAATCAGGGGGAGTG TACAGCTGCAGGGTACAGACCCACAGCCAGGTGGACTGATGGTGTCTAAT TTTGAATTTCATTTATTACCAGGTTCTATATTTGGGGTGGGTGGGCCATT TCAACTCATTTCAAGCAAGCATCTGGTACTGATTATAGTATTTAGTGGGT AAAATGGGTAAAAATGGTAAAAATTTATCTGTTTTGGCAAATCAGAAAAA AATTCTGTAAAAAATCAGATTTCATTTTAATTTCACGATTTTGGTGAGGT GAAATTGACTGCTAGGTATTACAAGGTACTTTTCCAGAGTTATTTAGCCA 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ATAGTTTTTATATTTTTTTAATTTTTATAGAAATTTTAAAAAGTGGCGCT TCTATTATAAACTGGGCTTACATTGATGTTACATTTTATTTTTAAGATTC GTAAAAACCTTTGCTCTAAAGCTAAAGGAGACTTTTTATTTTACCATGCT CTGACAGGTGCCTAAATATGGGGCTTTGTTTGTTAATTTTTATTTATCTT CAAAATATTGATTTTTGTTAAAGTTCATCACCTATACAGTGTGTCCCATA AAAGCAGATAAATTTTAATATAAATTAAGATCCTCATAATTTATGCCAAA CTGTATAATTCGTATACTTCGTAATTCAGTCTCAAAAACCTGAATATTGA TTGAACAGAGAATTGTAACCTTATTTCAATTATTCTAAGCCCTTTTTCAG GACACACTGTATAATTGAGTGCAAGACTCGTTTAGGTTTTTCATGTAATA TTAACATATTTTCAGTTGTACTTTAATGATTTCATTTTGTTTGACCAGAA ATTGTATGATTTTACATTACAGCAATAAACAAGGGAAATCTTAATATTTG GATTATATATACAAGATCCCCGAAACTTATTCATTATGAACATCATCCAC AACTTGATTTTTCAGACTTTAAACAATAAACAAAAAATAGATAAATAAAT AAAAGAAAGCTTCAAGATGGATAGTGAAATGGCAAAGAAGACATATGAGC TGCAAAACAATATTGAGACTGTCAATACAGTGGATGAAATTTATAAATAT AGTCAAGAAAAACAGCAAGAAATACTATCAAGAAAACCATGGACTAAAGA GTATATTATCTGATTATTTCCTTTTTAATCCTTCAAAACTTTTGTACACA ATATATCTGTGGAAACTTCAAATGTCCTGACTCATAGGTTTTGCTCATTG TCGATATTTGATCACCCATCTCATATTCCTTCTTTGTAGTCCGCATTATT TCAAGAATATCAAAGTATCAGCTCTTGCATTACTGAAGATGGTAAGCTAT TGACTTTTAAAGTGACATTGGGATCTCCCTGTATTTCCTCCAATGGTTCC AACACATTTGGAGCGATCTTCATCTTAATTATCCTAATTGTTCCCACAAT CTCTTGATTCGTATAGTACACTATAAGAACAATCCTGAAGATATACTTTT TCTTGAAAAATATACATTTGTATCCAGATTTTCTGTGAAAACTAAGTTAC AGCAGCTAATACGATGGCAAATTTTACCCCCACTGCACCTATAATTTCTA TAAGCCTTGTTTTCGTAGAAAAGCTGATATGGTCCATTTAACCATATTGT TTTCATAATCATTCATTATCACCAGGTAATGCATACACGATCAGGGGGGA CACTGGAAGTCATGGGTTTGATGTACGTAGGGTAAAGTTGACGGAGACAC CATGATCGTAATGGATGCCTGTGCATTACCCGTTGAAGGGACTGAGACGA GAGTCAATGCACAAGCTGCTGCTTATGAATACATGACACAATATATCGAT TCTTCAAAATCTGTGAGTTTCATGCTTACAGAAATTATTGTTAAAAAGGA AAATGAGATATCAATGAAGTATTTGACACAGATGTAAAGTAGTCTGAATT ACATTCATAAATTTAATATTTTCAAAGGCTATATGTTTGACCTTCATGCA TTTAAAAATCATGAGTGTCAGATATTTGCCACCGAATATGAAGAGCGTTT GACTAACATCATCATAAGCCCCCCCCCATGAGCAATCTATTTGCTATTGT TTATCGGTTTTTCTTTCGGTAGGTTGGACGTTTAGAAAATGCGATCGGTT GGTACCATTCACATCCTGGGTACGGATGCTGGCTTTCTGGTATCCATGGC TTTGCAGCAGGTTTTAGGTGCCCCCTAAGAATTCAGGTGACCCCTAAGAT TTAGGTAACCCTTGGTTGCCAAATATTTTAGGTGAACCCTAAGCCAATGA CATGTCAATTTTTTTTCGAAAATCCTTTTCAAACAATCAAACAAATACAA CAGTTAGTTTATTTTATTGCTAAATAGAATAAATGCCCTAAGAAATAAGA GATTAGCTAACTACTGAAGGTTTATGCTAGATTATCGAGGTTTTGTAAGT CAGGGTGCAGATCCCTAGCCAGACAGATTTTTTATCTAAGTAAATGCAAC AGGATTGAAAAATTTTTACAGATCAGTGCCGTAGGAAGCATTTTCATATT AAGGGGGCTGAAGTTTAGTGAGACCGCGAGGGCCAACCATGGTTTGGGCC GAGGGGGAAAATTTTGAAAATTTGAGCTCTAGATTGCTTGAAAATGCACT CAAAACATGCACTTATAAGACAATTATGACAAATTAAAAAAGAAAAACTT TGCGTTTTGCAAAATAACCGTTTAAAAATTATTAGGGACATAGCCCCCTC ATTATGTAGGTGTCACTTTGTCAATATTTAGGGTTGATGATTTGTCCTTG CACTTGTTCTGAAAACAACCATACCTTAGGCTCAAAAATTGACTTTCAAA ATCAGACCCTTGCCTCACAGTGTAGAAATAGGCTACGAAATTTAACACCC TTACAATGCAGAAACGGATAAAAAGTACCCCCTTACTTACAGTGCATCAT TCTTTTCATCAGACCTGTTCAATGAAACACCTCCCTTTCAAAAAGGTAAT TTTTGAGACATACAGATGGGAAATATACCTGATATACACATGTTAAATGA ATAATTTAGTTAATTTCCTTCCTTACAAAAGAAGAATTCACTTCATTTGA AAATTTTCAAAGGAACAAGGTAATTTGCTACCCTTACAGTGCATGTACAG CTAAAAACGTACCTTTAGAGTGCAGCACTGGTCAAAACCCTTACGATGCA CTAGCTGAACCTTTAAAAAACCGACCCTTAAGTGCCACATCTTTCCTATC TACAGGGTACGTCACGAAAATGTTTCTTTCTTTAAAGTGAATTTTATTGA GGTCTAAAGATTTTTAAGAGAACCATTCCTTTCTATGATAAAGAAGACAG ATAAAGTTAAATTTAGGACCTGGTAGTATGTCAGTAGTATACTGAAGAAG AGTTTTTCACTCAACTGGTTGGCAAGAAAATTACCCTAAGCGAAATTAAG TATAAATAATATTTACACGTCTTTGCCAACCATTCTTATATAGCAATTTG AAATTAGATTTAAACAAAAAAAAAACAATGGAAATTAAACAAATACCAAT CAACAATGAAGATTTGCAGAGGTTTAGCAATCATTGTCATACATTTAAAG ATCATCCCTTGAGTATGTTGGAACCATACCATCAAGTCTTTCCATCATTT TATATGGATCACCACAAATCATTTCAAGAAGCTGAAGTTTATGAAGATGA TGTTTGGATTTGCACTTTCCCAAAATCAGGTAGAACTAATGGGTGCTTAT TTTGTGTATTTACAGCTTGAATTACAAGCTTTTTCCATATGGCAAATAAT GTTCTCTTGTGTCAGTTTAATCCAACTCTCCTTTTACAAAGGTTTTGGAT TCAACTTTGTAAATGAAACCTTTTTACTTCATGAGTGTATATTGAAGCCG GCATCCTAGGTATGTGAAGCTTTGAATAAGTGAAACCGATTACTGTCAGG TTCTACTATTACAGCAAAATTATAATTGTCTAAAGTTTTTGTAGATGTTT TGAATTTAGGAAAACGATGATTTAGAGGAATAAAATGTGTTGAATTCTAA TATAAGAAAGATCAAGTATTTCTAAAGGATTTACTATTCTTTACTTTTCC AGGAACCCGCTGGATGCAAGAAATCGTCTCTTGTCTGAGGAATGGCATAG ATTTTGAGAAAGCAAAATCAATTCCTCTAGACTTTAGAGTACCTTTCTTT GAGTAATGTTTTTTTTATTTATTAAAAGTATTGGCTGAAATTCTTGGGTT GAACTAAATGGGAAATATCATCACTGAAGATAAGATTGAAACAGAAAAGA TTAACAGAATGATAATCACAATCAACTCAACTTTCTTTACTCAATAAGGA TCAATGGTCTAAAATACATAATCTTTTCTCATTTTAGTTTATCAGCCGTC TTTAATAACGCAGAAAAGGTACTCAAAATTAGGGGTTCTTCTTGCAAAAC AGGAGCTGAACTTGTTAATCATACACTTCGACCAAGGACAATAAAAACCC ATCTCAGCTATGAAATGTTGCCTCCAAAGATTCATGAAAAAGGTGCCAAG GTACCAGAACT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000100_pilon:346362..362922-

>MSTRG.12921.22.p1 ID=MSTRG.12921.22.p1|Name=MSTRG.12921.22.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1422bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100_pilon:346362..362922- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTATCAGCCGTCTTTAATAACGCAGAAAAGGTACTCAAAATTAGGGGTT
CTTCTTGCAAAACAGGAGCTGAACTTGTTAATCATACACTTCGACCAAGG
ACAATAAAAACCCATCTCAGCTATGAAATGTTGCCTCCAAAGATTCATGA
AAAAGGTGCCAAGGTACCAGAAGAACCCGCTGGATGCAAGAAATCGTCTC
TTGTCTGAGGAATGGCATAGATTTTGAGAAAGCAAAATCAATTCCTCTAG
ACTTTAGAGTACCTTTCTTTGAATGGAAATTAAACAAATACCAATCAACA
ATGAAGATTTGCAGAGGTTTAGCAATCATTGTCATACATTTAAAGATCAT
CCCTTGAGTATGTTGGAACCATACCATCAAGTCTTTCCATCATTTTATAT
GGATCACCACAAATCATTTCAAGAAGCTGAAGTTTATGAAGATGATGTTT
GGATTTGCACTTTCCCAAAATCAGTTTATCAGCCGTCTTTAATAACGCAG
AAAAGGTACTCAAAATTAGGGGTTCTTCTTGCAAAACAGGAGCTGAACTT
GTTAATCATACACTTCGACCAAGGACAATAAAAACCCATCTCAGCTATGA
AATGTTGCCTCCAAAGATTCATGAAAAAGGTGCCAAGGTACCAGAAGAAC
CCGCTGGATGCAAGAAATCGTCTCTTGTCTGAGGAATGGCATAGATTTTG
AGAAAGCAAAATCAATTCCTCTAGACTTTAGAGTACCTTTCTTTGAATGG
AAATTAAACAAATACCAATCAACAATGAAGATTTGCAGAGGTTTAGCAAT
CATTGTCATACATTTAAAGATCATCCCTTGAGTATGTTGGAACCATACCA
TCAAGTCTTTCCATCATTTTATATGGATCACCACAAATCATTTCAAGAAG
CTGAAGTTTATGAAGATGATGTTTGGATTTGCACTTTCCCAAAATCAGTT
TATCAGCCGTCTTTAATAACGCAGAAAAGGTACTCAAAATTAGGGGTTCT
TCTTGCAAAACAGGAGCTGAACTTGTTAATCATACACTTCGACCAAGGAC
AATAAAAACCCATCTCAGCTATGAAATGTTGCCTCCAAAGATTCATGAAA
AAGGTGCCAAGGTACCAGAAGAACCCGCTGGATGCAAGAAATCGTCTCTT
GTCTGAGGAATGGCATAGATTTTGAGAAAGCAAAATCAATTCCTCTAGAC
TTTAGAGTACCTTTCTTTGAATGGAAATTAAACAAATACCAATCAACAAT
GAAGATTTGCAGAGGTTTAGCAATCATTGTCATACATTTAAAGATCATCC
CTTGAGTATGTTGGAACCATACCATCAAGTCTTTCCATCATTTTATATGG
ATCACCACAAATCATTTCAAGAAGCTGAAGTTTATGAAGATGATGTTTGG
ATTTGCACTTTCCCAAAATCAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12921MSTRG.12921Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12921.22.p1.exon3MSTRG.12921.22.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.22.p1.exon2MSTRG.12921.22.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.22.p1.exon1MSTRG.12921.22.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12921.22.p1MSTRG.12921.22.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000100_pilongenomesc0000100_pilon:346362..362922 -