MSTRG.12921.21.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12921.21.p2
Unique NameMSTRG.12921.21.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000100_pilon:346362..383461-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12921.21.p2 ID=MSTRG.12921.21.p2|Name=MSTRG.12921.21.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=37100bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100_pilon:346362..383461- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTTTGAAAATTTGAGCTCTAGATTGCTTGAAAATGCACTCAAAACATGCA CTTATAAGACAATTATGACAAATTAAAAAAGAAAAACTTTGCGTTTTGCA AAATAACCGTTTAAAAATTATTAGGGACATAGCCCCCTCATTATGTAGGT GTCACTTTGTCAATATTTAGGGTTGATGATTTGTCCTTGCACTTGTTCTG AAAACAACCATACCTTAGGCTCAAAAATTGACTTTCAAAATCAGACCCTT GCCTCACAGTGTAGAAATAGGCTACGAAATTTAACACCCTTACAATGCAG AAACGGATAAAAAGTACCCCCTTACTTACAGTGCATCATTCTTTTCATCA GACCTGTTCAATGAAACACCTCCCTTTCAAAAAGGTAATTTTTGAGACAT ACAGATGGGAAATATACCTGATATACACATGTTAAATGAATAATTTAGTT AATTTCCTTCCTTACAAAAGAAGAATTCACTTCATTTGAAAATTTTCAAA GGAACAAGGTAATTTGCTACCCTTACAGTGCATGTACAGCTAAAAACGTA CCTTTAGAGTGCAGCACTGGTCAAAACCCTTACGATGCACTAGCTGAACC TTTAAAAAACCGACCCTTAAGTGCCACATCTTTCCTATCTACAGGGTACG TCACGAAAATGTTTCTTTCTTTAAAGTGAATTTTATTGAGGTCTAAAGAT TTTTAAGAGAACCATTCCTTTCTATGATAAAGAAGACAGATAAAGTTAAA TTTAGGACCTGGTAGTATGTCAGTAGTATACTGAAGAAGAGTTTTTCACT CAACTGGTTGGCAAGAAAATTACCCTAAGCGAAATTAAGTATAAATAATA TTTACACGTCTTTGCCAACCATTCTTATATAGCAATTTGAAATTAGATTT AAACAAAAAAAAAACAATGGAAATTAAACAAATACCAATCAACAATGAAG ATTTGCAGAGGTTTAGCAATCATTGTCATACATTTAAAGATCATCCCTTG AGTATGTTGGAACCATACCATCAAGTCTTTCCATCATTTTATATGGATCA CCACAAATCATTTCAAGAAGCTGAAGTTTATGAAGATGATGTTTGGATTT GCACTTTCCCAAAATCAGGTAGAACTAATGGGTGCTTATTTTGTGTATTT ACAGCTTGAATTACAAGCTTTTTCCATATGGCAAATAATGTTCTCTTGTG TCAGTTTAATCCAACTCTCCTTTTACAAAGGTTTTGGATTCAACTTTGTA AATGAAACCTTTTTACTTCATGAGTGTATATTGAAGCCGGCATCCTAGGT ATGTGAAGCTTTGAATAAGTGAAACCGATTACTGTCAGGTTCTACTATTA CAGCAAAATTATAATTGTCTAAAGTTTTTGTAGATGTTTTGAATTTAGGA AAACGATGATTTAGAGGAATAAAATGTGTTGAATTCTAATATAAGAAAGA TCAAGTATTTCTAAAGGATTTACTATTCTTTACTTTTCCAGGAACCCGCT GGATGCAAGAAATCGTCTCTTGTCTGAGGAATGGCATAGATTTTGAGAAA GCAAAATCAATTCCTCTAGACTTTAGAGTACCTTTCTTTGAGTAATGTTT TTTTTATTTATTAAAAGTATTGGCTGAAATTCTTGGGTTGAACTAAATGG GAAATATCATCACTGAAGATAAGATTGAAACAGAAAAGATTAACAGAATG ATAATCACAATCAACTCAACTTTCTTTACTCAATAAGGATCAATGGTCTA AAATACATAATCTTTTCTCATTTTAGTTTATCAGCCGTCTTTAATAACGC AGAAAAGGTACTCAAAATTAGGGGTTCTTCTTGCAAAACAGGAGCTGAAC TTGTTAATCATACACTTCGACCAAGGACAATAAAAACCCATCTCAGCTAT GAAATGTTGCCTCCAAAGATTCATGAAAAAGGTGCCAAGGTACCAGAACT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000100_pilon:346362..383461-

>MSTRG.12921.21.p2 ID=MSTRG.12921.21.p2|Name=MSTRG.12921.21.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1422bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100_pilon:346362..383461- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTATCAGCCGTCTTTAATAACGCAGAAAAGGTACTCAAAATTAGGGGTT
CTTCTTGCAAAACAGGAGCTGAACTTGTTAATCATACACTTCGACCAAGG
ACAATAAAAACCCATCTCAGCTATGAAATGTTGCCTCCAAAGATTCATGA
AAAAGGTGCCAAGGTACCAGAAGAACCCGCTGGATGCAAGAAATCGTCTC
TTGTCTGAGGAATGGCATAGATTTTGAGAAAGCAAAATCAATTCCTCTAG
ACTTTAGAGTACCTTTCTTTGAATGGAAATCAAACAAATACCAATCAACA
ATGAAGATTTGCAGAAGTTTAGCAACCATTGTCATACATTTAAAGATCAC
CCCTTGAGTATGTTGGAACCATACCATCAAGTCTTTCCATCATTTTATAT
GGATCACCACAAATCATTTCAAGAAGCTGAAGTTTATGAAGATGATGTTT
GGATTTGCACTTTCCCAAAATCAGTTTATCAGCCGTCTTTAATAACGCAG
AAAAGGTACTCAAAATTAGGGGTTCTTCTTGCAAAACAGGAGCTGAACTT
GTTAATCATACACTTCGACCAAGGACAATAAAAACCCATCTCAGCTATGA
AATGTTGCCTCCAAAGATTCATGAAAAAGGTGCCAAGGTACCAGAAGAAC
CCGCTGGATGCAAGAAATCGTCTCTTGTCTGAGGAATGGCATAGATTTTG
AGAAAGCAAAATCAATTCCTCTAGACTTTAGAGTACCTTTCTTTGAATGG
AAATCAAACAAATACCAATCAACAATGAAGATTTGCAGAAGTTTAGCAAC
CATTGTCATACATTTAAAGATCACCCCTTGAGTATGTTGGAACCATACCA
TCAAGTCTTTCCATCATTTTATATGGATCACCACAAATCATTTCAAGAAG
CTGAAGTTTATGAAGATGATGTTTGGATTTGCACTTTCCCAAAATCAGTT
TATCAGCCGTCTTTAATAACGCAGAAAAGGTACTCAAAATTAGGGGTTCT
TCTTGCAAAACAGGAGCTGAACTTGTTAATCATACACTTCGACCAAGGAC
AATAAAAACCCATCTCAGCTATGAAATGTTGCCTCCAAAGATTCATGAAA
AAGGTGCCAAGGTACCAGAAGAACCCGCTGGATGCAAGAAATCGTCTCTT
GTCTGAGGAATGGCATAGATTTTGAGAAAGCAAAATCAATTCCTCTAGAC
TTTAGAGTACCTTTCTTTGAATGGAAATCAAACAAATACCAATCAACAAT
GAAGATTTGCAGAAGTTTAGCAACCATTGTCATACATTTAAAGATCACCC
CTTGAGTATGTTGGAACCATACCATCAAGTCTTTCCATCATTTTATATGG
ATCACCACAAATCATTTCAAGAAGCTGAAGTTTATGAAGATGATGTTTGG
ATTTGCACTTTCCCAAAATCAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12921MSTRG.12921Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12921.21.p2MSTRG.12921.21.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12921.21.p2.exon9MSTRG.12921.21.p2.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.21.p2.exon8MSTRG.12921.21.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.21.p2.exon7MSTRG.12921.21.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.21.p2.exon6MSTRG.12921.21.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.21.p2.exon5MSTRG.12921.21.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.21.p2.exon4MSTRG.12921.21.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.21.p2.exon3MSTRG.12921.21.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.21.p2.exon2MSTRG.12921.21.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.21.p2.exon1MSTRG.12921.21.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000100_pilongenomesc0000100_pilon:346362..383461 -