MSTRG.12921.13.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12921.13.p1
Unique NameMSTRG.12921.13.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000100_pilon:345700..383461-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12921.13.p1 ID=MSTRG.12921.13.p1|Name=MSTRG.12921.13.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=37762bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100_pilon:345700..383461- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTTTGAAAATTTGAGCTCTAGATTGCTTGAAAATGCACTCAAAACATGCA CTTATAAGACAATTATGACAAATTAAAAAAGAAAAACTTTGCGTTTTGCA AAATAACCGTTTAAAAATTATTAGGGACATAGCCCCCTCATTATGTAGGT GTCACTTTGTCAATATTTAGGGTTGATGATTTGTCCTTGCACTTGTTCTG AAAACAACCATACCTTAGGCTCAAAAATTGACTTTCAAAATCAGACCCTT GCCTCACAGTGTAGAAATAGGCTACGAAATTTAACACCCTTACAATGCAG AAACGGATAAAAAGTACCCCCTTACTTACAGTGCATCATTCTTTTCATCA GACCTGTTCAATGAAACACCTCCCTTTCAAAAAGGTAATTTTTGAGACAT ACAGATGGGAAATATACCTGATATACACATGTTAAATGAATAATTTAGTT AATTTCCTTCCTTACAAAAGAAGAATTCACTTCATTTGAAAATTTTCAAA GGAACAAGGTAATTTGCTACCCTTACAGTGCATGTACAGCTAAAAACGTA CCTTTAGAGTGCAGCACTGGTCAAAACCCTTACGATGCACTAGCTGAACC TTTAAAAAACCGACCCTTAAGTGCCACATCTTTCCTATCTACAGGGTACG TCACGAAAATGTTTCTTTCTTTAAAGTGAATTTTATTGAGGTCTAAAGAT TTTTAAGAGAACCATTCCTTTCTATGATAAAGAAGACAGATAAAGTTAAA TTTAGGACCTGGTAGTATGTCAGTAGTATACTGAAGAAGAGTTTTTCACT CAACTGGTTGGCAAGAAAATTACCCTAAGCGAAATTAAGTATAAATAATA TTTACACGTCTTTGCCAACCATTCTTATATAGCAATTTGAAATTAGATTT AAACAAAAAAAAAACAATGGAAATTAAACAAATACCAATCAACAATGAAG ATTTGCAGAGGTTTAGCAATCATTGTCATACATTTAAAGATCATCCCTTG AGTATGTTGGAACCATACCATCAAGTCTTTCCATCATTTTATATGGATCA CCACAAATCATTTCAAGAAGCTGAAGTTTATGAAGATGATGTTTGGATTT GCACTTTCCCAAAATCAGGTAGAACTAATGGGTGCTTATTTTGTGTATTT ACAGCTTGAATTACAAGCTTTTTCCATATGGCAAATAATGTTCTCTTGTG TCAGTTTAATCCAACTCTCCTTTTACAAAGGTTTTGGATTCAACTTTGTA AATGAAACCTTTTTACTTCATGAGTGTATATTGAAGCCGGCATCCTAGGT ATGTGAAGCTTTGAATAAGTGAAACCGATTACTGTCAGGTTCTACTATTA CAGCAAAATTATAATTGTCTAAAGTTTTTGTAGATGTTTTGAATTTAGGA AAACGATGATTTAGAGGAATAAAATGTGTTGAATTCTAATATAAGAAAGA TCAAGTATTTCTAAAGGATTTACTATTCTTTACTTTTCCAGGAACCCGCT GGATGCAAGAAATCGTCTCTTGTCTGAGGAATGGCATAGATTTTGAGAAA GCAAAATCAATTCCTCTAGACTTTAGAGTACCTTTCTTTGAGTAATGTTT TTTTTATTTATTAAAAGTATTGGCTGAAATTCTTGGGTTGAACTAAATGG GAAATATCATCACTGAAGATAAGATTGAAACAGAAAAGATTAACAGAATG ATAATCACAATCAACTCAACTTTCTTTACTCAATAAGGATCAATGGTCTA AAATACATAATCTTTTCTCATTTTAGTTTATCAGCCGTCTTTAATAACGC AGAAAAGGTACTCAAAATTAGGGGTTCTTCTTGCAAAACAGGAGCTGAAC TTGTTAATCATACACTTCGACCAAGGACAATAAAAACCCATCTCAGCTAT GAAATGTTGCCTCCAAAGATTCATGAAAAAGGTGCCAAGGTACCAGAACT TATTTTTAGCTGATAAAGGGATTCGATTGAAATAGTTTGATTTTTTTATG TTAAAAATTCCAAAATTCCAAACCAATGCAAATGATTTCTATTCAGATGA TCAATGTAATACGAAACCCACGTGATGTTTGTGTATCATTTCTCAACCAT CATGTTCTGACAGAAAACTACACTGGTGATTTACAAACCATCGCAGAGAT TATGTTACAGGATGTAGGACCTATCTATGCACCTTTCTTTACACATATCC TGAGCTACTGGAACCAACGAGAAAATCCAAATCTTTTGATTGTTCACTAT GAAGAGATGCAAAAGGATGTAACTGGTTAAAATTTCTTTTGAATTTGTTT TTAACGAGGTCTAATTTTAACAGTTGAGCAGGGCATATAATGTTAAAATT GTTACATGGGTGTTTCAGGTAAGAATCCAAAATGGGTTGAATACACTTAT CACCCTTAGCGGAAATACCTGGAAAAGGTTTGGCAACGGCGTCAAGTTAA AAAGTACTTGTGTGAAAATTTAAGATAACTTAGTAGATTGAAATCTTTAA CCATTTTCCAGGTGTCATCAAACGAGTGGCCAAGTTTATTGGTACAGAGG AATATTCAGATGATCAAATAGCAAAACTTGTAGAGCATACATCTGTGGAT AAAATGAGAGCC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000100_pilon:345700..383461-

>MSTRG.12921.13.p1 ID=MSTRG.12921.13.p1|Name=MSTRG.12921.13.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4770bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100_pilon:345700..383461- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTGTCATCAAACGAGTGGCCAAGTTTATTGGTACAGAGGAATATTCAGAT
GATCAAATAGCAAAACTTGTAGAGCATACATCTGTGGATAAAATGAGAGC
CATGATCAATGTAATACGAAACCCACGCGATGTTTGTGTATCATTTCTCA
ACCATCATGTTCTAACTACTAACTACACTGGTGATTTACAAACCATCGCA
GAGATCATGTTACAGGATGTAGGACCTGTCAATGCACCCTTCTTTACACA
TATCCTGAGCTACTGGAACCAACGAGAAAATCCAAATCTTTTGATTGTTC
ACTATGAAGAGATGCAAAAGGATATAACTGGTGCCAAGTTTTTCAGCCGT
CTCTTATAACGCAGAAAAGATACTCAAAGGTTATGGTTCTTCTTGCAAAA
CTGGAGCTGAACTTGTTAATCATACACTTCGACCAAGGACCATAAAAACC
CATCTCAGCTATGAAATGTTGCCTCCAAAGATTCATGAAAAAGGAACCCG
CTGGATGCAAGAAATTGTCTCTTGTCTGAGGACTGGCTTGGATTTTGAGA
AAGCAAAATCAAGTCCTCTAAGCTTAAGAGTACCTTTCTTTGAATGGAAA
TTAAACAAATACCAATCAACAATGAAGATTTACAGAGGTTCAACAGTGAC
TGTTATACATTTAAAGAGCATCCCTTGAGTATGTTGGAACCATACCATCA
AGTCTTTCCATCACTTTATATGGATCACCACAAATCATTTCAAGAAGCTG
AAGTTTATGAAGATGATGTTTGGATTTGCACTTTCCCAAAATCAGGTGTC
ATCAAACGAGTGGCCAAGTTTATTGGTACAGAGGAATATTCAGATGATCA
AATAGCAAAACTTGTAGAGCATACATCTGTGGATAAAATGAGAGCCATGA
TCAATGTAATACGAAACCCACGCGATGTTTGTGTATCATTTCTCAACCAT
CATGTTCTAACTACTAACTACACTGGTGATTTACAAACCATCGCAGAGAT
CATGTTACAGGATGTAGGACCTGTCAATGCACCCTTCTTTACACATATCC
TGAGCTACTGGAACCAACGAGAAAATCCAAATCTTTTGATTGTTCACTAT
GAAGAGATGCAAAAGGATATAACTGGTGCCAAGTTTTTCAGCCGTCTCTT
ATAACGCAGAAAAGATACTCAAAGGTTATGGTTCTTCTTGCAAAACTGGA
GCTGAACTTGTTAATCATACACTTCGACCAAGGACCATAAAAACCCATCT
CAGCTATGAAATGTTGCCTCCAAAGATTCATGAAAAAGGAACCCGCTGGA
TGCAAGAAATTGTCTCTTGTCTGAGGACTGGCTTGGATTTTGAGAAAGCA
AAATCAAGTCCTCTAAGCTTAAGAGTACCTTTCTTTGAATGGAAATTAAA
CAAATACCAATCAACAATGAAGATTTACAGAGGTTCAACAGTGACTGTTA
TACATTTAAAGAGCATCCCTTGAGTATGTTGGAACCATACCATCAAGTCT
TTCCATCACTTTATATGGATCACCACAAATCATTTCAAGAAGCTGAAGTT
TATGAAGATGATGTTTGGATTTGCACTTTCCCAAAATCAGGTGTCATCAA
ACGAGTGGCCAAGTTTATTGGTACAGAGGAATATTCAGATGATCAAATAG
CAAAACTTGTAGAGCATACATCTGTGGATAAAATGAGAGCCATGATCAAT
GTAATACGAAACCCACGCGATGTTTGTGTATCATTTCTCAACCATCATGT
TCTAACTACTAACTACACTGGTGATTTACAAACCATCGCAGAGATCATGT
TACAGGATGTAGGACCTGTCAATGCACCCTTCTTTACACATATCCTGAGC
TACTGGAACCAACGAGAAAATCCAAATCTTTTGATTGTTCACTATGAAGA
GATGCAAAAGGATATAACTGGTGCCAAGTTTTTCAGCCGTCTCTTATAAC
GCAGAAAAGATACTCAAAGGTTATGGTTCTTCTTGCAAAACTGGAGCTGA
ACTTGTTAATCATACACTTCGACCAAGGACCATAAAAACCCATCTCAGCT
ATGAAATGTTGCCTCCAAAGATTCATGAAAAAGGAACCCGCTGGATGCAA
GAAATTGTCTCTTGTCTGAGGACTGGCTTGGATTTTGAGAAAGCAAAATC
AAGTCCTCTAAGCTTAAGAGTACCTTTCTTTGAATGGAAATTAAACAAAT
ACCAATCAACAATGAAGATTTACAGAGGTTCAACAGTGACTGTTATACAT
TTAAAGAGCATCCCTTGAGTATGTTGGAACCATACCATCAAGTCTTTCCA
TCACTTTATATGGATCACCACAAATCATTTCAAGAAGCTGAAGTTTATGA
AGATGATGTTTGGATTTGCACTTTCCCAAAATCAGGTGTCATCAAACGAG
TGGCCAAGTTTATTGGTACAGAGGAATATTCAGATGATCAAATAGCAAAA
CTTGTAGAGCATACATCTGTGGATAAAATGAGAGCCATGATCAATGTAAT
ACGAAACCCACGCGATGTTTGTGTATCATTTCTCAACCATCATGTTCTAA
CTACTAACTACACTGGTGATTTACAAACCATCGCAGAGATCATGTTACAG
GATGTAGGACCTGTCAATGCACCCTTCTTTACACATATCCTGAGCTACTG
GAACCAACGAGAAAATCCAAATCTTTTGATTGTTCACTATGAAGAGATGC
AAAAGGATATAACTGGTGCCAAGTTTTTCAGCCGTCTCTTATAACGCAGA
AAAGATACTCAAAGGTTATGGTTCTTCTTGCAAAACTGGAGCTGAACTTG
TTAATCATACACTTCGACCAAGGACCATAAAAACCCATCTCAGCTATGAA
ATGTTGCCTCCAAAGATTCATGAAAAAGGAACCCGCTGGATGCAAGAAAT
TGTCTCTTGTCTGAGGACTGGCTTGGATTTTGAGAAAGCAAAATCAAGTC
CTCTAAGCTTAAGAGTACCTTTCTTTGAATGGAAATTAAACAAATACCAA
TCAACAATGAAGATTTACAGAGGTTCAACAGTGACTGTTATACATTTAAA
GAGCATCCCTTGAGTATGTTGGAACCATACCATCAAGTCTTTCCATCACT
TTATATGGATCACCACAAATCATTTCAAGAAGCTGAAGTTTATGAAGATG
ATGTTTGGATTTGCACTTTCCCAAAATCAGGTGTCATCAAACGAGTGGCC
AAGTTTATTGGTACAGAGGAATATTCAGATGATCAAATAGCAAAACTTGT
AGAGCATACATCTGTGGATAAAATGAGAGCCATGATCAATGTAATACGAA
ACCCACGCGATGTTTGTGTATCATTTCTCAACCATCATGTTCTAACTACT
AACTACACTGGTGATTTACAAACCATCGCAGAGATCATGTTACAGGATGT
AGGACCTGTCAATGCACCCTTCTTTACACATATCCTGAGCTACTGGAACC
AACGAGAAAATCCAAATCTTTTGATTGTTCACTATGAAGAGATGCAAAAG
GATATAACTGGTGCCAAGTTTTTCAGCCGTCTCTTATAACGCAGAAAAGA
TACTCAAAGGTTATGGTTCTTCTTGCAAAACTGGAGCTGAACTTGTTAAT
CATACACTTCGACCAAGGACCATAAAAACCCATCTCAGCTATGAAATGTT
GCCTCCAAAGATTCATGAAAAAGGAACCCGCTGGATGCAAGAAATTGTCT
CTTGTCTGAGGACTGGCTTGGATTTTGAGAAAGCAAAATCAAGTCCTCTA
AGCTTAAGAGTACCTTTCTTTGAATGGAAATTAAACAAATACCAATCAAC
AATGAAGATTTACAGAGGTTCAACAGTGACTGTTATACATTTAAAGAGCA
TCCCTTGAGTATGTTGGAACCATACCATCAAGTCTTTCCATCACTTTATA
TGGATCACCACAAATCATTTCAAGAAGCTGAAGTTTATGAAGATGATGTT
TGGATTTGCACTTTCCCAAAATCAGGTGTCATCAAACGAGTGGCCAAGTT
TATTGGTACAGAGGAATATTCAGATGATCAAATAGCAAAACTTGTAGAGC
ATACATCTGTGGATAAAATGAGAGCCATGATCAATGTAATACGAAACCCA
CGCGATGTTTGTGTATCATTTCTCAACCATCATGTTCTAACTACTAACTA
CACTGGTGATTTACAAACCATCGCAGAGATCATGTTACAGGATGTAGGAC
CTGTCAATGCACCCTTCTTTACACATATCCTGAGCTACTGGAACCAACGA
GAAAATCCAAATCTTTTGATTGTTCACTATGAAGAGATGCAAAAGGATAT
AACTGGTGCCAAGTTTTTCAGCCGTCTCTTATAACGCAGAAAAGATACTC
AAAGGTTATGGTTCTTCTTGCAAAACTGGAGCTGAACTTGTTAATCATAC
ACTTCGACCAAGGACCATAAAAACCCATCTCAGCTATGAAATGTTGCCTC
CAAAGATTCATGAAAAAGGAACCCGCTGGATGCAAGAAATTGTCTCTTGT
CTGAGGACTGGCTTGGATTTTGAGAAAGCAAAATCAAGTCCTCTAAGCTT
AAGAGTACCTTTCTTTGAATGGAAATTAAACAAATACCAATCAACAATGA
AGATTTACAGAGGTTCAACAGTGACTGTTATACATTTAAAGAGCATCCCT
TGAGTATGTTGGAACCATACCATCAAGTCTTTCCATCACTTTATATGGAT
CACCACAAATCATTTCAAGAAGCTGAAGTTTATGAAGATGATGTTTGGAT
TTGCACTTTCCCAAAATCAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12921MSTRG.12921Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12921.13.p1MSTRG.12921.13.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12921.13.p1.exon6MSTRG.12921.13.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.13.p1.exon5MSTRG.12921.13.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.13.p1.exon4MSTRG.12921.13.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.13.p1.exon3MSTRG.12921.13.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.13.p1.exon2MSTRG.12921.13.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.13.p1.exon1MSTRG.12921.13.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000100_pilongenomesc0000100_pilon:345700..383461 -