MSTRG.12921.12.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12921.12.p1
Unique NameMSTRG.12921.12.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000100_pilon:345698..362340-

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12921.12.p1 ID=MSTRG.12921.12.p1|Name=MSTRG.12921.12.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16643bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100_pilon:345698..362340- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GGTATTTGGTGGGTAAAATAGGTAAAAATGGTAAAAATTTATCAATTTTT GCAAATCCGAAAAAAATTCCGTAAAAATTAGATTTCATTTTAAGTTCACG ATTTTGGTGAGGTGAAATTGACTGCTAGGTATTACAGGGTACTTTTGCAG AGTTATTTAGCCATATTTTCCTTGGTGACCAGCTTCCAAATAGGAGGTAG AGGTCCCTTTTTTCTTCAAAAAAAGTTGGTACCTTAAACTATCTAAGATA TCTATTACAAATCTTTTTGAAAATCAGGTTTATTACCCCCTGTTGCAATG GTTTTTCTAGTAAAACAGCTATGGTATAGCTGTAGTTTGTTTTACTGAAA GAATGGGCTAATTATAGTGACATCCCTTAATTTGAATTGGACGAATAAAA CGTTTTAATTGTTTTTTTTAACCGTTGCTTCTTTCTTCAATTTTAGAAAG TAAAGGCGTCAATGAAGAATGAGCAAAAAGGAAGTTTTATCAACACTGGG AAAACAGGAGGATGGAAAAACAAACTTTGTGAAGAAACTATTGAGAAGTT TAAAAGATGGGAAGAGAAATGGTTGAAGGACACTGGATTAATGTTTACTT ATGAAGTTTGATTTTTTATTTAATATCATTTATTTAATTTTTTAGTTTAT AGCATTTTACAATTATTTTTTAAAAGATTTAAACTTTTTTTTGTTTCAGC ATTTTTCCAAATTGGGCTGAATGGGGGGAAGTTTAGGAAAACAATATAAG ATTTGTTTATTGGTCACATGAGATTACCTTTCCTATCTGCCGGGTATGCC ACAAAAATGTTTTTCTCTTTAAAGTGGATTTTATTGAGGTCTAAAGATTT TTAAGAGAACCATTCCTTTCTATGAAAAAGAAGACAGAAAAAGTTAAATT TAGGACCTGGTAGTATGTCAGTAGTATACTGAAGAAGGGTTTTTCACTCA AATGGTTCACAAGAAAATTACCCTAAGCGAAATTAAGTATAGATAATATT TACACGTCTTACTCTACGAACGATCCCTATAAAGCAATTTAAAATTAGAT TTAAACAAAAAAAGAACAATGGAAATTAAACAAATACCAATCAACAATGA AGATTTGCAGAGGTTTAGCAGCCATTGTCATAAATATAAAGATCATCCGT TGAGTATGTTGGAACCATACCATCAAGTCTTTCCATCTTTTTATATGGAT CACCACAAATCATTTCAAGAAGCTGAAGTTTATGAAGATGATGTTTGGAT TTGCACTTTCCCAAAATCAGGTAGACTTAATGGGTGCTTATTTTGTGTAT TTACAGCTTGAATTACAAACTTTTCCCATATGAAAAATAATTTACCCTTT TATCAGTTTATCCCGACTCTCCTTTGACATGTTTGGGATTGATCTTTGTA AATGAAACCTTTTTACTTCACGAGTGCATATTGAAGCCAGCATCTTAGGT ATGTGAAGCTTTAAATAAGTGAAACCAATTACTGTCAGGTTTTACTATTA CAGCAAAACTATAATTATCTAAAGTATTTGTAGATGTTTTGAATTTAGGA AAACGATGATTTAGAGGAACCAAATATATGTTCAATTCCAAATTCCAATA TAAGAGAGATCAAACCATTAGTATTTCTAAAGGATTTACTCTTCTTTACT TTTCCAGGAACCCGCTGGATGCAAGAAATTGTCTCTTGTCTGAGGAATGG CTTGGATTTTGAGAAAGCAAAATCAAGTCCTCTAGACTTAAGAGTACCTT TCTTTGAGTAAATATCTTTTTTTTATATTTAGAAGTATTGGCTGAAATTC TTGGGCTGAACTAAATAGGAAATATCAAAACTGAAGATAAGATTGAAATA GATATTCAAAAGATTAACAGAATGATAATCAACTCAACTTTCTTTGTAGG CAATAAGTATCAATGGTCTAAAATAAATAATCTTTTCTCATTTTAGTTTT TCAGCCGCCTCTAATAGGGTAGAAAAGGTACTCAAAGCTGCAGGTTCTTC TTGCAAAACAGGAGCTGAACTTGTTAATCATACACTTCGACCAAGGACCA TAAAAACCCATCTCAGCTATGAAATGTTGCCTCCAAAGATTCATGAAAAA GGTGCCAAGGTACCAGAACTTGTTTTTAGTTGATAAAGGGATTCGATTGA AATAGTTTGATTTTTTTATGTTAAAAATTCCCTGATTTTGATTTTTTAAC CAATGCAATGATTTCTATTCAGATGATCAATGTAATACGAAACCCACGCG ATGTTTGTGTATCATTTCTCAACCATCATGTTCTAACTACTAACTACACT GGTGATTTACAAACCATCGCAGAGATCATGTTACAGGATGTAGGACCTGT CAATGCACCCTTCTTTACACATATCCTGAGCTACTGGAACCAACGAGAAA ATCCAAATCTTTTGATTGTTCACTATGAAGAGATGCAAAAGGATATAACT GGTGAAAATTTCTTTTGAATTTGTTTTTAATGAGGTCTAATTTTAACAAT TTAGCAGGCCATGATAATGTTAAAATCCAAAATCGTTACATAGGTGTTTC AGGTAAGAATCCAGAATGGGTTGAATACACTTATTACCCTTAGCGGAAAT ACTTGGAAAAGTCTTGGCATCAAATTAAAAAGTACTCTTGTGAAAATTTA AGATAACTTAGTAGATTGAAATTTTTAACCATTTTCCAGGTGTGATCAAA CGAGTGGCCAAGTTTATTGGTACAGAGGAATATTCAGATGATCAAATAGC AAAACTTGTAGAGCATACATCTGTGGATAAAATGAGAGCCAACCCAATGG TTAATGGGACTCGACCAATTGATGTAATTGTTTTTAAACCCATCAATTTC ATAATGAGTCTGAGTAAAAGTTCTTTATGGATATTTTTAATCAAAGATTT TTACAATCAGGGGGAGTGTACAGCTGCAGGGTACAGACCCACAGCCAGGT GGACTGATGGTGTCTAATTTTGAATTTCATTTATTACCAGGTTCTATATT TGGGGTGGGTGGGCCATTTCAACTCATTTCAAGCAAGCATCTGGTACTGA TTATAGTATTTAGTGGGTAAAATGGGTAAAAATGGTAAAAATTTATCTGT TTTGGCAAATCAGAAAAAAATTCTGTAAAAAATCAGATTTCATTTTAATT TCACGATTTTGGTGAGGTGAAATTGACTGCTAGGTATTACAAGGTACTTT TCCAGAGTTATTTAGCCATATTTTCCTTTGTGACCAGCTTCCAAATAGGA GACGGAGATCCTTTTTTTCTACAAAAAAAGTTGGTACCTTAAACTATATA AGATATCTAAAACAAATCGTTCTGAAAATCAGGTTAAGTACCATGTGGCT GTACCCCCTGTTGCAATGATATTTATAGTAAAACAGCTATGGTATAGGTG GAGTTTGCTTTATTGAAAGAATGGGCTAATTATATTGACATCCCTTTATT TGAATTGAATCAATAAAACGTTTTAAATGTTTTTTTAACCGTTCTTTCTT CAATTTTAAAAACTAAAGGCATCAATGAAGAATGAGCAAAAAGGAAATTT TATCAACACTGGGAAAACAGGAGGATGGAAAAACAAACTCACTGAAGAAA CTATTGAGAGGTTTAAAAAATGGGAAGAGAAATGGTTGAAAGACACTGGA TTGTTGTTTGCTTACGAAGTTTGATTTTTTTATAACACATAAATTTTAGC AATTTTACGAAGATCATAGTTTTTATATTTTTATTTTTTTATAGAAATTT TAAAAAGTGCTTTCTATTATAAATTGGGCTTAGATTGGTCTTACATTTTA 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AATTATTGTTAAAAAGGAAAATGAGATATCAATGAAGTATTTGACACAGA TGTAAAGTAGTCTGAATTACATTCATAAATTTAATATTTTCAAAGGCTAT ATGTTTGACCTTCATGCATTTAAAAATCATGAGTGTCAGATATTTGCCAC CGAATATGAAGAGCGTTTGACTAACATCATCATAAGCCCCCCCCCATGAG CAATCTATTTGCTATTGTTTATCGGTTTTTCTTTCGGTAGGTTGGACGTT TAGAAAATGCGATCGGTTGGTACCATTCACATCCTGGGTACGGATGCTGG CTTTCTGGTATCCATGGCTTTGCAGCAGGTTTTAGGTGCCCCCTAAGAAT TCAGGTGACCCCTAAGATTTAGGTAACCCTTGGTTGCCAAATATTTTAGG TGAACCCTAAGCCAATGACATGTCAATTTTTTTTCGAAAATCCTTTTCAA ACAATCAAACAAATACAACAGTTAGTTTATTTTATTGCTAAATAGAATAA ATGCCCTAAGAAATAAGAGATTAGCTAACTACTGAAGGTTTATGCTAGAT TATCGAGGTTTTGTAAGTCAGGGTGCAGATCCCTAGCCAGACAGATTTTT TATCTAAGTAAATGCAACAGGATTGAAAAATTTTTACAGATCAGTGCCGT AGGAAGCATTTTCATATTAAGGGGGCTGAAGTTTAGTGAGACCGCGAGGG CCAACCATGGTTTGGGCCGAGGGGGAAAATTTTGAAAATTTGAGCTCTAG ATTGCTTGAAAATGCACTCAAAACATGCACTTATAAGACAATTATGACAA ATTAAAAAAGAAAAACTTTGCGTTTTGCAAAATAACCGTTTAAAAATTAT TAGGGACATAGCCCCCTCATTATGTAGGTGTCACTTTGTCAATATTTAGG GTTGATGATTTGTCCTTGCACTTGTTCTGAAAACAACCATACCTTAGGCT CAAAAATTGACTTTCAAAATCAGACCCTTGCCTCACAGTGTAGAAATAGG CTACGAAATTTAACACCCTTACAATGCAGAAACGGATAAAAAGTACCCCC TTACTTACAGTGCATCATTCTTTTCATCAGACCTGTTCAATGAAACACCT CCCTTTCAAAAAGGTAATTTTTGAGACATACAGATGGGAAATATACCTGA TATACACATGTTAAATGAATAATTTAGTTAATTTCCTTCCTTACAAAAGA AGAATTCACTTCATTTGAAAATTTTCAAAGGAACAAGGTAATTTGCTACC CTTACAGTGCATGTACAGCTAAAAACGTACCTTTAGAGTGCAGCACTGGT CAAAACCCTTACGATGCACTAGCTGAACCTTTAAAAAACCGACCCTTAAG TGCCACATCTTTCCTATCTACAGGGTACGTCACGAAAATGTTTCTTTCTT TAAAGTGAATTTTATTGAGGTCTAAAGATTTTTAAGAGAACCATTCCTTT CTATGATAAAGAAGACAGATAAAGTTAAATTTAGGACCTGGTAGTATGTC AGTAGTATACTGAAGAAGAGTTTTTCACTCAACTGGTTGGCAAGAAAATT ACCCTAAGCGAAATTAAGTATAAATAATATTTACACGTCTTTGCCAACCA TTCTTATATAGCAATTTGAAATTAGATTTAAACAAAAAAAAAACAATGGA AATTAAACAAATACCAATCAACAATGAAGATTTGCAGAGGTTTAGCAATC ATTGTCATACATTTAAAGATCATCCCTTGAGTATGTTGGAACCATACCAT CAAGTCTTTCCATCATTTTATATGGATCACCACAAATCATTTCAAGAAGC TGAAGTTTATGAAGATGATGTTTGGATTTGCACTTTCCCAAAATCAGGTA GAACTAATGGGTGCTTATTTTGTGTATTTACAGCTTGAATTACAAGCTTT TTCCATATGGCAAATAATGTTCTCTTGTGTCAGTTTAATCCAACTCTCCT TTTACAAAGGTTTTGGATTCAACTTTGTAAATGAAACCTTTTTACTTCAT GAGTGTATATTGAAGCCGGCATCCTAGGTATGTGAAGCTTTGAATAAGTG AAACCGATTACTGTCAGGTTCTACTATTACAGCAAAATTATAATTGTCTA AAGTTTTTGTAGATGTTTTGAATTTAGGAAAACGATGATTTAGAGGAATA AAATGTGTTGAATTCTAATATAAGAAAGATCAAGTATTTCTAAAGGATTT ACTATTCTTTACTTTTCCAGGAACCCGCTGGATGCAAGAAATCGTCTCTT GTCTGAGGAATGGCATAGATTTTGAGAAAGCAAAATCAATTCCTCTAGAC TTTAGAGTACCTTTCTTTGAGTAATGTTTTTTTTATTTATTAAAAGTATT GGCTGAAATTCTTGGGTTGAACTAAATGGGAAATATCATCACTGAAGATA AGATTGAAACAGAAAAGATTAACAGAATGATAATCACAATCAACTCAACT TTCTTTACTCAATAAGGATCAATGGTCTAAAATACATAATCTTTTCTCAT TTTAGTTTATCAGCCGTCTTTAATAACGCAGAAAAGGTACTCAAAATTAG GGGTTCTTCTTGCAAAACAGGAGCTGAACTTGTTAATCATACACTTCGAC CAAGGACAATAAAAACCCATCTCAGCTATGAAATGTTGCCTCCAAAGATT CATGAAAAAGGTGCCAAGGTACCAGAACTTATTTTTAGCTGATAAAGGGA TTCGATTGAAATAGTTTGATTTTTTTATGTTAAAAATTCCAAAATTCCAA ACCAATGCAAATGATTTCTATTCAGATGATCAATGTAATACGAAACCCAC GTGATGTTTGTGTATCATTTCTCAACCATCATGTTCTGACAGAAAACTAC ACTGGTGATTTACAAACCATCGCAGAGATTATGTTACAGGATGTAGGACC TATCTATGCACCTTTCTTTACACATATCCTGAGCTACTGGAACCAACGAG AAAATCCAAATCTTTTGATTGTTCACTATGAAGAGATGCAAAAGGATGTA ACTGGTTAAAATTTCTTTTGAATTTGTTTTTAACGAGGTCTAATTTTAAC AGTTGAGCAGGGCATATAATGTTAAAATTGTTACATGGGTGTTTCAGGTA AGAATCCAAAATGGGTTGAATACACTTATCACCCTTAGCGGAAATACCTG GAAAAGGTTTGGCAACGGCGTCAAGTTAAAAAGTACTTGTGTGAAAATTT AAGATAACTTAGTAGATTGAAATCTTTAACCATTTTCCAGGTGTCATCAA ACGAGTGGCCAAGTTTATTGGTACAGAGGAATATTCAGATGATCAAATAG CAAAACTTGTAGAGCATACATCTGTGGATAAAATGAGAGCCAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000100_pilon:345698..362340-

>MSTRG.12921.12.p1 ID=MSTRG.12921.12.p1|Name=MSTRG.12921.12.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3060bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100_pilon:345698..362340- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTGTCATCAAACGAGTGGCCAAGTTTATTGGTACAGAGGAATATTCAGAT
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CATGATCAATGTAATACGAAACCCACGCGATGTTTGTGTATCATTTCTCA
ACCATCATGTTCTAACTACTAACTACACTGGTGATTTACAAACCATCGCA
GAGATCATGTTACAGGATGTAGGACCTGTCAATGCACCCTTCTTTACACA
TATCCTGAGCTACTGGAACCAACGAGAAAATCCAAATCTTTTGATTGTTC
ACTATGAAGAGATGCAAAAGGATATAACTGGTACTCAAAGCTGCAGGTTC
TTCTTGCAAAACAGGAGCTGAACTTGTTAATCATACACTTCGACCAAGGA
CCATAAAAACCCATCTCAGCTATGAAATGTTGCCTCCAAAGATTCATGAA
AAAGGTGCCAAGTTATTCAGCCGTCACTAATAACGCAGAAAAGCTATTCT
TTACTTTTCCAGGAACCCGCTGGATGCAAGAAATCGTCTCTTGTCTGAGG
AATGGCATAGATTTTGAGAAAGCAAAATCAATTCCTCTAGACTTTAGAGT
ACCTTTCTTTGAGTGTCATCAAACGAGTGGCCAAGTTTATTGGTACAGAG
GAATATTCAGATGATCAAATAGCAAAACTTGTAGAGCATACATCTGTGGA
TAAAATGAGAGCCATGATCAATGTAATACGAAACCCACGCGATGTTTGTG
TATCATTTCTCAACCATCATGTTCTAACTACTAACTACACTGGTGATTTA
CAAACCATCGCAGAGATCATGTTACAGGATGTAGGACCTGTCAATGCACC
CTTCTTTACACATATCCTGAGCTACTGGAACCAACGAGAAAATCCAAATC
TTTTGATTGTTCACTATGAAGAGATGCAAAAGGATATAACTGGTACTCAA
AGCTGCAGGTTCTTCTTGCAAAACAGGAGCTGAACTTGTTAATCATACAC
TTCGACCAAGGACCATAAAAACCCATCTCAGCTATGAAATGTTGCCTCCA
AAGATTCATGAAAAAGGTGCCAAGTTATTCAGCCGTCACTAATAACGCAG
AAAAGCTATTCTTTACTTTTCCAGGAACCCGCTGGATGCAAGAAATCGTC
TCTTGTCTGAGGAATGGCATAGATTTTGAGAAAGCAAAATCAATTCCTCT
AGACTTTAGAGTACCTTTCTTTGAGTGTCATCAAACGAGTGGCCAAGTTT
ATTGGTACAGAGGAATATTCAGATGATCAAATAGCAAAACTTGTAGAGCA
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GCGATGTTTGTGTATCATTTCTCAACCATCATGTTCTAACTACTAACTAC
ACTGGTGATTTACAAACCATCGCAGAGATCATGTTACAGGATGTAGGACC
TGTCAATGCACCCTTCTTTACACATATCCTGAGCTACTGGAACCAACGAG
AAAATCCAAATCTTTTGATTGTTCACTATGAAGAGATGCAAAAGGATATA
ACTGGTACTCAAAGCTGCAGGTTCTTCTTGCAAAACAGGAGCTGAACTTG
TTAATCATACACTTCGACCAAGGACCATAAAAACCCATCTCAGCTATGAA
ATGTTGCCTCCAAAGATTCATGAAAAAGGTGCCAAGTTATTCAGCCGTCA
CTAATAACGCAGAAAAGCTATTCTTTACTTTTCCAGGAACCCGCTGGATG
CAAGAAATCGTCTCTTGTCTGAGGAATGGCATAGATTTTGAGAAAGCAAA
ATCAATTCCTCTAGACTTTAGAGTACCTTTCTTTGAGTGTCATCAAACGA
GTGGCCAAGTTTATTGGTACAGAGGAATATTCAGATGATCAAATAGCAAA
ACTTGTAGAGCATACATCTGTGGATAAAATGAGAGCCATGATCAATGTAA
TACGAAACCCACGCGATGTTTGTGTATCATTTCTCAACCATCATGTTCTA
ACTACTAACTACACTGGTGATTTACAAACCATCGCAGAGATCATGTTACA
GGATGTAGGACCTGTCAATGCACCCTTCTTTACACATATCCTGAGCTACT
GGAACCAACGAGAAAATCCAAATCTTTTGATTGTTCACTATGAAGAGATG
CAAAAGGATATAACTGGTACTCAAAGCTGCAGGTTCTTCTTGCAAAACAG
GAGCTGAACTTGTTAATCATACACTTCGACCAAGGACCATAAAAACCCAT
CTCAGCTATGAAATGTTGCCTCCAAAGATTCATGAAAAAGGTGCCAAGTT
ATTCAGCCGTCACTAATAACGCAGAAAAGCTATTCTTTACTTTTCCAGGA
ACCCGCTGGATGCAAGAAATCGTCTCTTGTCTGAGGAATGGCATAGATTT
TGAGAAAGCAAAATCAATTCCTCTAGACTTTAGAGTACCTTTCTTTGAGT
GTCATCAAACGAGTGGCCAAGTTTATTGGTACAGAGGAATATTCAGATGA
TCAAATAGCAAAACTTGTAGAGCATACATCTGTGGATAAAATGAGAGCCA
TGATCAATGTAATACGAAACCCACGCGATGTTTGTGTATCATTTCTCAAC
CATCATGTTCTAACTACTAACTACACTGGTGATTTACAAACCATCGCAGA
GATCATGTTACAGGATGTAGGACCTGTCAATGCACCCTTCTTTACACATA
TCCTGAGCTACTGGAACCAACGAGAAAATCCAAATCTTTTGATTGTTCAC
TATGAAGAGATGCAAAAGGATATAACTGGTACTCAAAGCTGCAGGTTCTT
CTTGCAAAACAGGAGCTGAACTTGTTAATCATACACTTCGACCAAGGACC
ATAAAAACCCATCTCAGCTATGAAATGTTGCCTCCAAAGATTCATGAAAA
AGGTGCCAAGTTATTCAGCCGTCACTAATAACGCAGAAAAGCTATTCTTT
ACTTTTCCAGGAACCCGCTGGATGCAAGAAATCGTCTCTTGTCTGAGGAA
TGGCATAGATTTTGAGAAAGCAAAATCAATTCCTCTAGACTTTAGAGTAC
CTTTCTTTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12921MSTRG.12921Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12921.12.p1MSTRG.12921.12.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12921.12.p1.exon5MSTRG.12921.12.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.12.p1.exon4MSTRG.12921.12.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.12.p1.exon3MSTRG.12921.12.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.12.p1.exon2MSTRG.12921.12.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12921.12.p1.exon1MSTRG.12921.12.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000100_pilongenomesc0000100_pilon:345698..362340 -