MSTRG.12920.5.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12920.5.p1
Unique NameMSTRG.12920.5.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000100_pilon:326669..344156-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
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>MSTRG.12920.5.p1 ID=MSTRG.12920.5.p1|Name=MSTRG.12920.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=17488bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100_pilon:326669..344156- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CATGTAATATTAACATATTTTCAGTTGTCCTTTAATAATTTCATTTTGTT TGACCAGAAATTGTATGATTTTGCATTACAGCAATTAACAAGGGAAATCT TAGAACTTGGATTATATATACAAGATCCGCGAAACTTTTTCATTATGAAC ATCATCCACAACTTGACTTTTCAGATTTTAAACAAAAATTAAAAAATAGA TAAATGAATAAAAGAAAGCTTCAAGATGGATAGTGAAATGGCAAAGAAGA CATTTGAGCTGCAAAACAATATTGAGACTGTCAATACAGTGGACGAGATT TATAAATATAGTCAAGAACAACAGCAAGAAATACTATCAAGAAAACCATG GACTAAAGAGTATATTATCTGATTATTTCCTTTTTGGACCTACCTCCGGG TACCCCGGTGGAGGTTCTATAAATTAACCCATGTCCGTTCGTTCGTCCGT TCGTTCGTTCGTCCGTCCGTCTGTTACCAGCTTTTCTCAGGATTGGCTCA TTAGTTTTTTCTGATTTTTTGCACAATGATGCAAAATGGCAATGCCCAGA ACGTGACGGAGCCCGATTTTTGAGAAAAAATTTATTTGGGCAAATTTGGC CCAAAAACTACCTAAAAATAGGGTTTTTTGGACTTTGTGCAAAATCCTGT CATTACTTTTTTCTGATTTTTTGTACAAAGATGGAGGGCAAGATTTTCTA AAGAATGGCTGAAGTGGTTTTTCCTGCAAAATTCTTATTCGCCTTAAAAG ACGGATTTTCGTATTTCGGGGAAATTCCCTTTAACCAAATAAGAAAATGT AGCTTTTCTCAATGTTGACTCATAATTTTTCTCTGATTTTTTGCACAATG ATGCAAAATGGCAATGCCCAAAATCTGACGGAGCCAGATTTTTAAGGAAA ATTTTTTTGGGCAAATTTGGGCCAAAAACAGCTTAAAAGGTTTTTTGGGC 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000100_pilon:326669..344156-

>MSTRG.12920.5.p1 ID=MSTRG.12920.5.p1|Name=MSTRG.12920.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=9960bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000100_pilon:326669..344156- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTGCAAGTTGAACATCGAAGCACTGAATGGTTTGATGAGCCAAGTTTTAA
AGAACCAGCTATTCAACAATGTCGGGTGTAGAGAATGAGTATCTCGTGGT
ATGAGTTATGCTGAAAATTGGGATAAGAAGGATGAGCCAGGGAAACTACA
GAAAGCTAATAAGGATTGAATGCTGATTATGTGACGAATCAGATTCTTGA
TCTATCAGAAAAACTGGAACAATCAATATCTCAGGTACTACTCGCTAGAG
GTTTCATACTTCAAGTCAGCACTGGATCAAAAGTTGTTAGATTCTCTTTG
GAACAAATACTGGATCAACACTCTTTCCTCTTCTACCTTATTCACGGGTT
ACAAACCTCCAGATGAAAGTCCCTCTGAATATCAAACCATCCCATTAAAT
AAAATCGAAGACTTTGGCGTTCATTGTAAACAATTGATCCAACGAGAACT
ATTTCAGCTGGCAAAGTGAACATGGGTGCATTTCGTACATATCCGAAGGT
TGGACGTTTAGAAAATGCGATCGGTTGGTACCATTCACATCCTGGGTACG
GATGCTGGCTTTCTGGTATCGATGTGTCCACACAAATGGTCAACCAACAG
TTTCAAGAACCATTTGTAGCTATCGTTGTGATGCATGCACGATCAGGAGG
GACACTGGAAGTCATGGGTTTGATGTTAGGGAAAGTTGACGGAGACACCA
TGATCGTGATGGATGCCTTTGCATTACCCGTTGAAGGGACTGAGACGAGA
GTCAATGCACAAGCTGCTGCTTATGAATACATGACACAATATATCGAATC
TTCAAAATCTTCCGCATTACTTCAAGAATATCAAAGTATCAGCTCTTGCA
TTACTGAAGATGATGGATAGTGAAATGGCAAAGAAGACATTTGAGCTGCA
AAACAATATTGAGACTGTCAATACAGTGGATGAAATTTATAAATATAGTC
AAGAACAACAGCAAGAAATACTATCAAGAAAACCATGGACTAAAGATTGC
AAGTTGAACATCGAAGCACTGAATGGTTTGATGAGCCAAGTTTTAAAGAA
CCAGCTATTCAACAATGTCGGGTGTAGAGAATGAGTATCTCGTGGTATGA
GTTATGCTGAAAATTGGGATAAGAAGGATGAGCCAGGGAAACTACAGAAA
GCTAATAAGGATTGAATGCTGATTATGTGACGAATCAGATTCTTGATCTA
TCAGAAAAACTGGAACAATCAATATCTCAGGTACTACTCGCTAGAGGTTT
CATACTTCAAGTCAGCACTGGATCAAAAGTTGTTAGATTCTCTTTGGAAC
AAATACTGGATCAACACTCTTTCCTCTTCTACCTTATTCACGGGTTACAA
ACCTCCAGATGAAAGTCCCTCTGAATATCAAACCATCCCATTAAATAAAA
TCGAAGACTTTGGCGTTCATTGTAAACAATTGATCCAACGAGAACTATTT
CAGCTGGCAAAGTGAACATGGGTGCATTTCGTACATATCCGAAGGTTGGA
CGTTTAGAAAATGCGATCGGTTGGTACCATTCACATCCTGGGTACGGATG
CTGGCTTTCTGGTATCGATGTGTCCACACAAATGGTCAACCAACAGTTTC
AAGAACCATTTGTAGCTATCGTTGTGATGCATGCACGATCAGGAGGGACA
CTGGAAGTCATGGGTTTGATGTTAGGGAAAGTTGACGGAGACACCATGAT
CGTGATGGATGCCTTTGCATTACCCGTTGAAGGGACTGAGACGAGAGTCA
ATGCACAAGCTGCTGCTTATGAATACATGACACAATATATCGAATCTTCA
AAATCTTCCGCATTACTTCAAGAATATCAAAGTATCAGCTCTTGCATTAC
TGAAGATGATGGATAGTGAAATGGCAAAGAAGACATTTGAGCTGCAAAAC
AATATTGAGACTGTCAATACAGTGGATGAAATTTATAAATATAGTCAAGA
ACAACAGCAAGAAATACTATCAAGAAAACCATGGACTAAAGATTGCAAGT
TGAACATCGAAGCACTGAATGGTTTGATGAGCCAAGTTTTAAAGAACCAG
CTATTCAACAATGTCGGGTGTAGAGAATGAGTATCTCGTGGTATGAGTTA
TGCTGAAAATTGGGATAAGAAGGATGAGCCAGGGAAACTACAGAAAGCTA
ATAAGGATTGAATGCTGATTATGTGACGAATCAGATTCTTGATCTATCAG
AAAAACTGGAACAATCAATATCTCAGGTACTACTCGCTAGAGGTTTCATA
CTTCAAGTCAGCACTGGATCAAAAGTTGTTAGATTCTCTTTGGAACAAAT
ACTGGATCAACACTCTTTCCTCTTCTACCTTATTCACGGGTTACAAACCT
CCAGATGAAAGTCCCTCTGAATATCAAACCATCCCATTAAATAAAATCGA
AGACTTTGGCGTTCATTGTAAACAATTGATCCAACGAGAACTATTTCAGC
TGGCAAAGTGAACATGGGTGCATTTCGTACATATCCGAAGGTTGGACGTT
TAGAAAATGCGATCGGTTGGTACCATTCACATCCTGGGTACGGATGCTGG
CTTTCTGGTATCGATGTGTCCACACAAATGGTCAACCAACAGTTTCAAGA
ACCATTTGTAGCTATCGTTGTGATGCATGCACGATCAGGAGGGACACTGG
AAGTCATGGGTTTGATGTTAGGGAAAGTTGACGGAGACACCATGATCGTG
ATGGATGCCTTTGCATTACCCGTTGAAGGGACTGAGACGAGAGTCAATGC
ACAAGCTGCTGCTTATGAATACATGACACAATATATCGAATCTTCAAAAT
CTTCCGCATTACTTCAAGAATATCAAAGTATCAGCTCTTGCATTACTGAA
GATGATGGATAGTGAAATGGCAAAGAAGACATTTGAGCTGCAAAACAATA
TTGAGACTGTCAATACAGTGGATGAAATTTATAAATATAGTCAAGAACAA
CAGCAAGAAATACTATCAAGAAAACCATGGACTAAAGATTGCAAGTTGAA
CATCGAAGCACTGAATGGTTTGATGAGCCAAGTTTTAAAGAACCAGCTAT
TCAACAATGTCGGGTGTAGAGAATGAGTATCTCGTGGTATGAGTTATGCT
GAAAATTGGGATAAGAAGGATGAGCCAGGGAAACTACAGAAAGCTAATAA
GGATTGAATGCTGATTATGTGACGAATCAGATTCTTGATCTATCAGAAAA
ACTGGAACAATCAATATCTCAGGTACTACTCGCTAGAGGTTTCATACTTC
AAGTCAGCACTGGATCAAAAGTTGTTAGATTCTCTTTGGAACAAATACTG
GATCAACACTCTTTCCTCTTCTACCTTATTCACGGGTTACAAACCTCCAG
ATGAAAGTCCCTCTGAATATCAAACCATCCCATTAAATAAAATCGAAGAC
TTTGGCGTTCATTGTAAACAATTGATCCAACGAGAACTATTTCAGCTGGC
AAAGTGAACATGGGTGCATTTCGTACATATCCGAAGGTTGGACGTTTAGA
AAATGCGATCGGTTGGTACCATTCACATCCTGGGTACGGATGCTGGCTTT
CTGGTATCGATGTGTCCACACAAATGGTCAACCAACAGTTTCAAGAACCA
TTTGTAGCTATCGTTGTGATGCATGCACGATCAGGAGGGACACTGGAAGT
CATGGGTTTGATGTTAGGGAAAGTTGACGGAGACACCATGATCGTGATGG
ATGCCTTTGCATTACCCGTTGAAGGGACTGAGACGAGAGTCAATGCACAA
GCTGCTGCTTATGAATACATGACACAATATATCGAATCTTCAAAATCTTC
CGCATTACTTCAAGAATATCAAAGTATCAGCTCTTGCATTACTGAAGATG
ATGGATAGTGAAATGGCAAAGAAGACATTTGAGCTGCAAAACAATATTGA
GACTGTCAATACAGTGGATGAAATTTATAAATATAGTCAAGAACAACAGC
AAGAAATACTATCAAGAAAACCATGGACTAAAGATTGCAAGTTGAACATC
GAAGCACTGAATGGTTTGATGAGCCAAGTTTTAAAGAACCAGCTATTCAA
CAATGTCGGGTGTAGAGAATGAGTATCTCGTGGTATGAGTTATGCTGAAA
ATTGGGATAAGAAGGATGAGCCAGGGAAACTACAGAAAGCTAATAAGGAT
TGAATGCTGATTATGTGACGAATCAGATTCTTGATCTATCAGAAAAACTG
GAACAATCAATATCTCAGGTACTACTCGCTAGAGGTTTCATACTTCAAGT
CAGCACTGGATCAAAAGTTGTTAGATTCTCTTTGGAACAAATACTGGATC
AACACTCTTTCCTCTTCTACCTTATTCACGGGTTACAAACCTCCAGATGA
AAGTCCCTCTGAATATCAAACCATCCCATTAAATAAAATCGAAGACTTTG
GCGTTCATTGTAAACAATTGATCCAACGAGAACTATTTCAGCTGGCAAAG
TGAACATGGGTGCATTTCGTACATATCCGAAGGTTGGACGTTTAGAAAAT
GCGATCGGTTGGTACCATTCACATCCTGGGTACGGATGCTGGCTTTCTGG
TATCGATGTGTCCACACAAATGGTCAACCAACAGTTTCAAGAACCATTTG
TAGCTATCGTTGTGATGCATGCACGATCAGGAGGGACACTGGAAGTCATG
GGTTTGATGTTAGGGAAAGTTGACGGAGACACCATGATCGTGATGGATGC
CTTTGCATTACCCGTTGAAGGGACTGAGACGAGAGTCAATGCACAAGCTG
CTGCTTATGAATACATGACACAATATATCGAATCTTCAAAATCTTCCGCA
TTACTTCAAGAATATCAAAGTATCAGCTCTTGCATTACTGAAGATGATGG
ATAGTGAAATGGCAAAGAAGACATTTGAGCTGCAAAACAATATTGAGACT
GTCAATACAGTGGATGAAATTTATAAATATAGTCAAGAACAACAGCAAGA
AATACTATCAAGAAAACCATGGACTAAAGATTGCAAGTTGAACATCGAAG
CACTGAATGGTTTGATGAGCCAAGTTTTAAAGAACCAGCTATTCAACAAT
GTCGGGTGTAGAGAATGAGTATCTCGTGGTATGAGTTATGCTGAAAATTG
GGATAAGAAGGATGAGCCAGGGAAACTACAGAAAGCTAATAAGGATTGAA
TGCTGATTATGTGACGAATCAGATTCTTGATCTATCAGAAAAACTGGAAC
AATCAATATCTCAGGTACTACTCGCTAGAGGTTTCATACTTCAAGTCAGC
ACTGGATCAAAAGTTGTTAGATTCTCTTTGGAACAAATACTGGATCAACA
CTCTTTCCTCTTCTACCTTATTCACGGGTTACAAACCTCCAGATGAAAGT
CCCTCTGAATATCAAACCATCCCATTAAATAAAATCGAAGACTTTGGCGT
TCATTGTAAACAATTGATCCAACGAGAACTATTTCAGCTGGCAAAGTGAA
CATGGGTGCATTTCGTACATATCCGAAGGTTGGACGTTTAGAAAATGCGA
TCGGTTGGTACCATTCACATCCTGGGTACGGATGCTGGCTTTCTGGTATC
GATGTGTCCACACAAATGGTCAACCAACAGTTTCAAGAACCATTTGTAGC
TATCGTTGTGATGCATGCACGATCAGGAGGGACACTGGAAGTCATGGGTT
TGATGTTAGGGAAAGTTGACGGAGACACCATGATCGTGATGGATGCCTTT
GCATTACCCGTTGAAGGGACTGAGACGAGAGTCAATGCACAAGCTGCTGC
TTATGAATACATGACACAATATATCGAATCTTCAAAATCTTCCGCATTAC
TTCAAGAATATCAAAGTATCAGCTCTTGCATTACTGAAGATGATGGATAG
TGAAATGGCAAAGAAGACATTTGAGCTGCAAAACAATATTGAGACTGTCA
ATACAGTGGATGAAATTTATAAATATAGTCAAGAACAACAGCAAGAAATA
CTATCAAGAAAACCATGGACTAAAGATTGCAAGTTGAACATCGAAGCACT
GAATGGTTTGATGAGCCAAGTTTTAAAGAACCAGCTATTCAACAATGTCG
GGTGTAGAGAATGAGTATCTCGTGGTATGAGTTATGCTGAAAATTGGGAT
AAGAAGGATGAGCCAGGGAAACTACAGAAAGCTAATAAGGATTGAATGCT
GATTATGTGACGAATCAGATTCTTGATCTATCAGAAAAACTGGAACAATC
AATATCTCAGGTACTACTCGCTAGAGGTTTCATACTTCAAGTCAGCACTG
GATCAAAAGTTGTTAGATTCTCTTTGGAACAAATACTGGATCAACACTCT
TTCCTCTTCTACCTTATTCACGGGTTACAAACCTCCAGATGAAAGTCCCT
CTGAATATCAAACCATCCCATTAAATAAAATCGAAGACTTTGGCGTTCAT
TGTAAACAATTGATCCAACGAGAACTATTTCAGCTGGCAAAGTGAACATG
GGTGCATTTCGTACATATCCGAAGGTTGGACGTTTAGAAAATGCGATCGG
TTGGTACCATTCACATCCTGGGTACGGATGCTGGCTTTCTGGTATCGATG
TGTCCACACAAATGGTCAACCAACAGTTTCAAGAACCATTTGTAGCTATC
GTTGTGATGCATGCACGATCAGGAGGGACACTGGAAGTCATGGGTTTGAT
GTTAGGGAAAGTTGACGGAGACACCATGATCGTGATGGATGCCTTTGCAT
TACCCGTTGAAGGGACTGAGACGAGAGTCAATGCACAAGCTGCTGCTTAT
GAATACATGACACAATATATCGAATCTTCAAAATCTTCCGCATTACTTCA
AGAATATCAAAGTATCAGCTCTTGCATTACTGAAGATGATGGATAGTGAA
ATGGCAAAGAAGACATTTGAGCTGCAAAACAATATTGAGACTGTCAATAC
AGTGGATGAAATTTATAAATATAGTCAAGAACAACAGCAAGAAATACTAT
CAAGAAAACCATGGACTAAAGATTGCAAGTTGAACATCGAAGCACTGAAT
GGTTTGATGAGCCAAGTTTTAAAGAACCAGCTATTCAACAATGTCGGGTG
TAGAGAATGAGTATCTCGTGGTATGAGTTATGCTGAAAATTGGGATAAGA
AGGATGAGCCAGGGAAACTACAGAAAGCTAATAAGGATTGAATGCTGATT
ATGTGACGAATCAGATTCTTGATCTATCAGAAAAACTGGAACAATCAATA
TCTCAGGTACTACTCGCTAGAGGTTTCATACTTCAAGTCAGCACTGGATC
AAAAGTTGTTAGATTCTCTTTGGAACAAATACTGGATCAACACTCTTTCC
TCTTCTACCTTATTCACGGGTTACAAACCTCCAGATGAAAGTCCCTCTGA
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AACAATTGATCCAACGAGAACTATTTCAGCTGGCAAAGTGAACATGGGTG
CATTTCGTACATATCCGAAGGTTGGACGTTTAGAAAATGCGATCGGTTGG
TACCATTCACATCCTGGGTACGGATGCTGGCTTTCTGGTATCGATGTGTC
CACACAAATGGTCAACCAACAGTTTCAAGAACCATTTGTAGCTATCGTTG
TGATGCATGCACGATCAGGAGGGACACTGGAAGTCATGGGTTTGATGTTA
GGGAAAGTTGACGGAGACACCATGATCGTGATGGATGCCTTTGCATTACC
CGTTGAAGGGACTGAGACGAGAGTCAATGCACAAGCTGCTGCTTATGAAT
ACATGACACAATATATCGAATCTTCAAAATCTTCCGCATTACTTCAAGAA
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CAAAGAAGACATTTGAGCTGCAAAACAATATTGAGACTGTCAATACAGTG
GATGAAATTTATAAATATAGTCAAGAACAACAGCAAGAAATACTATCAAG
AAAACCATGGACTAAAGATTGCAAGTTGAACATCGAAGCACTGAATGGTT
TGATGAGCCAAGTTTTAAAGAACCAGCTATTCAACAATGTCGGGTGTAGA
GAATGAGTATCTCGTGGTATGAGTTATGCTGAAAATTGGGATAAGAAGGA
TGAGCCAGGGAAACTACAGAAAGCTAATAAGGATTGAATGCTGATTATGT
GACGAATCAGATTCTTGATCTATCAGAAAAACTGGAACAATCAATATCTC
AGGTACTACTCGCTAGAGGTTTCATACTTCAAGTCAGCACTGGATCAAAA
GTTGTTAGATTCTCTTTGGAACAAATACTGGATCAACACTCTTTCCTCTT
CTACCTTATTCACGGGTTACAAACCTCCAGATGAAAGTCCCTCTGAATAT
CAAACCATCCCATTAAATAAAATCGAAGACTTTGGCGTTCATTGTAAACA
ATTGATCCAACGAGAACTATTTCAGCTGGCAAAGTGAACATGGGTGCATT
TCGTACATATCCGAAGGTTGGACGTTTAGAAAATGCGATCGGTTGGTACC
ATTCACATCCTGGGTACGGATGCTGGCTTTCTGGTATCGATGTGTCCACA
CAAATGGTCAACCAACAGTTTCAAGAACCATTTGTAGCTATCGTTGTGAT
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AAGTTGACGGAGACACCATGATCGTGATGGATGCCTTTGCATTACCCGTT
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GAGCCAAGTTTTAAAGAACCAGCTATTCAACAATGTCGGGTGTAGAGAAT
GAGTATCTCGTGGTATGAGTTATGCTGAAAATTGGGATAAGAAGGATGAG
CCAGGGAAACTACAGAAAGCTAATAAGGATTGAATGCTGATTATGTGACG
AATCAGATTCTTGATCTATCAGAAAAACTGGAACAATCAATATCTCAGGT
ACTACTCGCTAGAGGTTTCATACTTCAAGTCAGCACTGGATCAAAAGTTG
TTAGATTCTCTTTGGAACAAATACTGGATCAACACTCTTTCCTCTTCTAC
CTTATTCACGGGTTACAAACCTCCAGATGAAAGTCCCTCTGAATATCAAA
CCATCCCATTAAATAAAATCGAAGACTTTGGCGTTCATTGTAAACAATTG
ATCCAACGAGAACTATTTCAGCTGGCAAAGTGAACATGGGTGCATTTCGT
ACATATCCGAAGGTTGGACGTTTAGAAAATGCGATCGGTTGGTACCATTC
ACATCCTGGGTACGGATGCTGGCTTTCTGGTATCGATGTGTCCACACAAA
TGGTCAACCAACAGTTTCAAGAACCATTTGTAGCTATCGTTGTGATGCAT
GCACGATCAGGAGGGACACTGGAAGTCATGGGTTTGATGTTAGGGAAAGT
TGACGGAGACACCATGATCGTGATGGATGCCTTTGCATTACCCGTTGAAG
GGACTGAGACGAGAGTCAATGCACAAGCTGCTGCTTATGAATACATGACA
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TTATAAATATAGTCAAGAACAACAGCAAGAAATACTATCAAGAAAACCAT
GGACTAAAGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12920MSTRG.12920Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12920.5.p1MSTRG.12920.5.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12920.5.p1.exon10MSTRG.12920.5.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12920.5.p1.exon9MSTRG.12920.5.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.12920.5.p1.exon4MSTRG.12920.5.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.12920.5.p1.exon2MSTRG.12920.5.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12920.5.p1.exon1MSTRG.12920.5.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000100_pilongenomesc0000100_pilon:326669..344156 -