MSTRG.1288.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.1288.2.p1
Unique NameMSTRG.1288.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000006_pilon:1366788..1380898+

Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.1288.2.p1 ID=MSTRG.1288.2.p1|Name=MSTRG.1288.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14111bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:1366788..1380898+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000006_pilon:1366788..1380898+

>MSTRG.1288.2.p1 ID=MSTRG.1288.2.p1|Name=MSTRG.1288.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5004bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:1366788..1380898+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GACGATGGAGTAGGCAATGTATGCGAATCTGGTCAACATATCATGGCAAG
TGGTTCAGGAAAAGCTGCCGAAGCTTACAGATGGTCGAAATGCTCCTCTG
ATTATCTTCAAGGTTTTTTAAGaaagaaccaatcaaattgcttGGATCAC
TTCACATCACAATCATCGAATCGTGAAAACCTGGAACTGTATGGGAATGC
TGGTAATGTATACGACGTGGATAGTCAATGTCAATTCGTTCTCGGTGATG
GAGCAAAAGCCTGCTACCAAGCCGATAAAGACCAAATTTGTTCAGAATTG
ATGTGTTTACATCCAATCTACAGTAACTGTACCAAAACAAGGAAACCTGC
TTTAGATGGAACAAGCTGTGGCAAAGACTTGTGGTGTCAGACAGGAGTTT
GTGTGAAGAAGGGTGTACGTGATGACTTGGTCATTGATGGTGGTTGGAGC
CCAtggaaagattacgtcatttgcTCACGAACTTGTGGTGGTGGCGTAAG
CTATCGCGAACGTGTCTGCGACCAACCGaggtattttttttcatgtaCGG
TCGCCATGTGTCTTAAGTGAggggataaaaatatcaactttgaacttcat
ccaagatcttggattgtcgtcatggttacgtttctctgcgttgattgcgc
gctgaatagaaattctggattggtcggcacaggtcgatatatgatttcgg
cctgtgcttttcacgGGTTGACGTATACAGGAGGTATGTGTGACGGCGAT
CGCTCCGTTGCTGTCATCAAAGCGGATGGTTTCAATGCTGCTTTCTCATT
GGCTCATCAAATCGGTCACAGCCTTGGTATAGAGGACGATGGAGTAGGCA
ATGTATGCGAATCTGGTCAACATATCATGGCAAGTGGTTCAGGAAAAGCT
GCCGAAGCTTACAGATGGTCGAAATGCTCCTCTGATTATCTTCAAGGTTT
TTTAAGaaagaaccaatcaaattgcttGGATCACTTCACATCACAATCAT
CGAATCGTGAAAACCTGGAACTGTATGGGAATGCTGGTAATGTATACGAC
GTGGATAGTCAATGTCAATTCGTTCTCGGTGATGGAGCAAAAGCCTGCTA
CCAAGCCGATAAAGACCAAATTTGTTCAGAATTGATGTGTTTACATCCAA
TCTACAGTAACTGTACCAAAACAAGGAAACCTGCTTTAGATGGAACAAGC
TGTGGCAAAGACTTGTGGTGTCAGACAGGAGTTTGTGTGAAGAAGGGTGT
ACGTGATGACTTGGTCATTGATGGTGGTTGGAGCCCAtggaaagattacg
tcatttgcTCACGAACTTGTGGTGGTGGCGTAAGCTATCGCGAACGTGTC
TGCGACCAACCGaggtattttttttcatgtaCGGTCGCCATGTGTCTTAA
GTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1288MSTRG.1288Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1288.2.p1MSTRG.1288.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1288.2.p1.exon1MSTRG.1288.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1288.2.p1.exon2MSTRG.1288.2.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1288.2.p1.exon3MSTRG.1288.2.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1288.2.p1.exon4MSTRG.1288.2.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1288.2.p1.exon5MSTRG.1288.2.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1288.2.p1.exon6MSTRG.1288.2.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000006_pilongenomesc0000006_pilon:1366788..1380898 +