MSTRG.12853.16.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12853.16.p1
Unique NameMSTRG.12853.16.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000099_pilon:622689..634326-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12853.16.p1 ID=MSTRG.12853.16.p1|Name=MSTRG.12853.16.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11638bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000099_pilon:622689..634326- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TCTTGAATTTTCTGACTTTGCCCCAAAAATGACTGTTGACGCCCTACCCT
AATATTGGTCCATAGATATATAATGCTAACCAAATCCTGTACAGAAGGAA
GCAATAAAAAAACAAACAAAGAATCTCTTTCTAAATTAACTAGAATAACT
ACCTCTAGCCGATCATCCAACCATTTTGATTGATGTAAGTGTGAGATTGA
TTGTGATAGTCTCAATTCGTTAATGGATATCAATAAAGTAGACTACTCTG
TGGTAAGTTCTTTATGTTCTTTATTGTCATATGATTTTTTCATTCGTTTA
TTAATATGCTACATTTCTATAAAGAAAGTTTTGGGCATTTTTCTAATTAT
GATGATTTTTAATAGTTGCAGATAATAAATCAAAGATTTATACTAACTAA
ATTTAAAATTGTTAGTTTGCTGATGATGATCAACGCAGAAGAAGGTTGTG
AAAGTATTGGTAAAAAAACTGTTTTTGTTTTTTCTGTTTCGTATATATAC
TAACTAAATTTAAAAAATGGCACAATTTTCTACTTTTCTTTTTACACCAA
GATTGATACGCAGAAGAAGTGGAATGAAACTGCCAGTAGCCGAATAAATA
TTTGCCTTTTCTACTTCTGTACTAGATATTTTCTACATTAAGAAGAAATT
TCAAAGATGGTTATATAGCAAAATATGAGAAACGATTAGAGCAACTGCAA
GCAATTTATGGACTGGTTGTGGATCATCAAGAAGAATTTCATGATGCTGG
ATACAAAGATTTGAGAAAAGTATCATTTTTTGAAAAACTCTCTCACATTT
TTTTGCATAAGCGAAATAATGTTTGCAGTCTTAATGATTTGCCTTAACAT
ATATATAATAAACATTTCATTTTTGGCTTACTTTGACGTACAAAATATGG
TAAAATGGGTTTGGAAACAAATTTAGCTATAAGATAATAGATAACATTCT
CAGGGAATTTGCCAATTTGGTTTTTTCTGCAATGTTTTTGAAGAGTATAT
GAGGTTGGTGGGTAGTTTTGGGAAAATAGCAAGAGGAGTTTGAGCAGTGG
TTGGGGGATGCTCTGAGGCTCAAAGCTGGGGTTCTAGGGTGACAGAGCCC
CCTAACAAAGTCTGAAATGACCCTAAGACCAAAAAGGAGCTAAAGAAAAT
GTAACTAACATGAATAAAAATTAGGAAAGAAGGCTGTAAGCCTTAGCTGG
ATAAAGTGAAAAAGTAAGCTTCAGAATGATATGTGGAAACTACGAAATGA
CCAGTAATTACCGCTATTTGCTGCACTGGAAGACCCTATATAGAAGACCC
TTATAAAAGGATTTTTTTAAGAAAGCGATGGCTCATACATTCCCAGTGTT
TTTAAATATTGTAAATGATGTCTTAAAGTGTCATACTTTAATAAAAAAAT
TGTCAATGATTATTTTAGCCAACAACTGAAGCCTGCTTTGCAGATACCCA
ATTTGTGATCAGAGAGTGTGGCGATGGTAATTAACTTTTATTTAAGAATT
ATGTTCTCATATTTAAGTTTATGAAGTCTATTTTTGTCAGTTTGAATATG
CAATTAATTTCAATTTGATGATTTATCACAAAGATTAACGTAAAGTAATA
AAAGTATGAATTGATTTTAAATTTTCCAAGATATTTTGAAACAACTTGAA
TAGGACCTTTGAAGGTTTGTGATTGTGATTGAAGATCAGAAGTTTTGCAA
ATGTCAATTTCTTTTGCAGCAATAAAAGCGTTCAAAACATGGATGAAGCC
GGAAAATATATCAACAGATCTTTTAAACATGCAACATTCAGCCAAGATAC
TCCATGATCCATTGGGTGTTGTTTTGGTTATGGGTGCTTGGAATTATCCT
GTTCAACTTTGTTTTATTCCGCTCATTGGTGCTATTGCTGCAGGTGTGAT
GTCATCATTGAACTATTACTTATGTAATCTTTAGTCCTATAAGGCTTTTC
AAAACTGGATATACGTGTCAATTTTTTACTTCATTGAATTGTGTCAGAAC
ACCCGTTCCAAAAACCCAAAACATTGGTAAAGTTGAATAATGGGAGATTT
CTTATCACTTTTTGGTAAAGCTTTATCAGTGGCTAGTTTGTTGTTTGGTA
ATTTTTTGTCTAAAGAATGAACATAGAAAAGATATGTCATACAGTGTTCA
CTGTGCAACCTGCGAATACGTAAAACGCTTTTTCCTTTCTAGGTAATTGT
GTGATTATCAAACCTTCGGAACTTTCAATACATACTACTGACTCGATGAC
AAAACTGATTGAACAATATCTAGACCCTGTGAGTATTCATCACACAGTTA
TTTTCTTTAAATGAGAAAACGAGTCTTAATTTGGACAAAATTTAAGAATC
GATTCAAATAAAACTTTGATTTCAGAATTGTCCTAAAAGTCATTTATTTA
AAGTATAAATCTATGGATCTTTTAAGTCCTGAAACAAAGTACAGCATAAA
CATTTTAACCCTAACTGCATCTGTCCAGGCACAAACTCTTCAAAAATAGT
AGTAAGTGAAAGTGGGCATAACAGTTGGAAGATTATTTTTGCAATACGAA
AATTGCCACCACAAATATATTTTCAGAAAATGGCGCTCTATTACTAAAAA
CTAAAAAAACTTTTTTGGAAAATGTTTCTTTTGATTCTGCTTAGGATATT
GTTCAAGTAGTAAACGGTGGAGTAGAAGAAACAACAGAACTTTTGAAAGA
ACGTTTCGACAAGATTTTCTTCACTGGTAGATCCTTCTGTTGGAAAGATA
ATCATGAAGGCTGCCTCTCAATATTTAACTCCTGTTGATTTGGAATTAGG
TGGCAAATGGTGAGACTTTAAAAACATTAATGATATCTCAAGATTTCTTT
TTGTACTCATTGGAAAGCAAAATTGTGAATTTTTTGATAAAATTGCATTA
TCTGAAAAGGTTTTCTTTGTTTACTAGTGGAAATTCGTTTTATAAGCCTG
TTATCAGGAAAAAGTAAGTATTCATAAAAGAAGGAAGGTTGATTTACAGG
ATACCAGTAATGCTCTCAGTAATAGACTTATGACTTAATCGATTAAAAGT
AGGAATTTTTAGCCGGAACGATAACCGTCAATGGCACTTTGAAGAGAGTG
CCTGATAAAACATCACTCAAATTGCGTGATATTATCAGCTCGACTGAAAT
TGTCCTTTGTAATGTTTTACTTTTATATCTTTCTCTTTCAATTTCAGTCC
AGCCATTGTTGATGAGACATGCGATATGCAGCTCGTAGCAAACCGCATTT
CATGGGCTAGATATACCAATGCTGGCCAGGTAAACATTCGTTGATAATTG
AGAGTGATAAAGGTACCCTTCTCGAGTTTCAAAAAGATTTGTAAAAGCTT
AGAAATTGAAAAGGATAATATGTTCTTTAATTTGAACTAAAGCTTTGGAA
AAATTTCTCATTTGGTGTACGTAAGAAATGCTCAAATGGACTTTGATTTG
TTTACATTTTTGGGATCCGAGACACCCACGTGACTTTGGCATTTGAATGT
CTGCTGCCAGCTGCTGTCAGCTGCTGTCTGCCTTGCTTCTTCCAAGCTAA
GCTGTTTGTGTTGCTGCAGGTCTGCCATATCTCTTCAACTATATGCCCTC
TCTTAGGATAGTATCAAAATGTTGGATGTTTTGACAACAGTTTTAACTTG
TTTTTTACTTTTGTTTTTATAGCCTGACCCTGAGGATGAACCACGGCGTT
CTGTAACCGGATATTATAGGATTCAAAATTTTTGGTTTTGGCCAAATTTT
TTAAATAAATGGCGGAGAATAAATACTCCCTTTTTCTTTTATCCTTTGAA
GGGCAAAGTCAAAATGTCAAGTTCCTAGCTTTGCTCTGATCCAGGATTAT
CTTGAATGCAATTTTAGAGGGATCCCGTCGTCCGGGATGGGCATCATGTC
ATGTTGAGGAAGAGATAGAGGGCAGGGACCTCTCGAAAACAAAAGTGTCC
TGGAATTATGATCTGGTGGATGTATCAAAAACTTCTTTCTTCTATTTTTC
ACTTTTTATGAGGTGACTTTGTGTCCAAAATCTCTTTATGGACACTGATT
TTTGGAGATGCAGGGGAAACCAGCCGGTATATATAATCCTGCTTTTTTAA
AAGTTCACAAAGACCACCGTGAACGTAAGTTTAAAATATATTGCAAAATG
AAAAAAATAACACACATGTTGCGTTGTTACAGACTTCCCGCTTGTTTATC
TTGTATCCACTGAAGTGTACCAGACGTCAGCGCTCGATAGGATCGATCAT
CGGAACGGCTCGATGCTTAGAATGCAACCCCCTGGCTTTTAGGGAGGGGC
TAGAACCTAAAGTTCTGGCTGGGGGCTCTTTTTCCCTAAGATCAGGGGGG
GGGGCTACTTACTCAAGGGGGGGGGGGCTATTTGTTTAGGTCTGTTGACT
GGGGGCTAACCTAACAACTTTTATCTCATTAAATTATTTTCTTGTTTTTT
CTTTATAAGTTCTGATAGGTTAGTTCTATTATTCTTTAACTTTTATTTTT
CTAGTTTATTTTGCTAGCTTTTTAATAAGCTTTTTGATAGTTACAGTTTT
TAAATTCTGAAGAGTTCAGATTTTTAAGCATAAATTGAAATTTTTTTTTG
TATTTTGGTAGGGGGCTGTCTATTTCGAATTTTGGTGGGGGCTAAATCTC
AGGGGGGGGGGCTTCAACCCCTCTGCACTCTCTATGTGATATCTGGCCTG
TATTTTCACTTACTGTTAAATCTCTTTGACAACAAATTTGTTTTGATAAC
TCCACCAAGTTTATCAATCCATACTTTCTGTCATAACATGTCACGATAAT
TTCACTGATAGCGCGCCCTTTTTAACTTTTTGTTTTCATTCAAAATGACC
CGACGCCGATTGGAGAATTATAGAACGGCCACTGCCTAACCGTCTATCGC
CGATGGGATTAACAAATAACAAGTGTGTAACTTGCTGCGCGAGTGATGTC
AAACAATCCATCGTTTCCCCACTAATTTGATCTTCTTCGTTCCAGACATT
TGCGTGTGTTCCACTACGGATTTTTTCATATTCCGATTTGAAAGCCTACT
TGGTGCGAAAGAGAAATCATGTATTTTTTAATACGCCGTTCATTAACTCA
AATCAAATGACTTTGAGGTTTGGTGAAATGGTAGCTGAATTGCCATCCCA
TAATTTGTCAGAATTGAATTGAATTGAATATATTTTTCGTTGCAACACAG
TAGGATACTCCCAAAAAAAGGAGATTACTCTAACACAATGGGGAACCTTG
AAGAAACTGAAAAATTGTTACAGAACTAAAGAAAAAAAATGAATAAATGA
TTATCAAGTGCCCAAGTTCAGGAGTTGCCATAAAGCCGTTATGGTAATAA
CCGGGAGGGCACATTGCTATACATTGTAAATGATTATCATAATATTTTAA
TATAGTAAGAACAATAATAATGAATATAAAAAATATTTTTACTTTTATTT
TGTGACAATTTCTTTGACTAGTTTTTTTGAAAAGTCCTTCCTGTTACACC
ACCCACCCTATCCTATCCTGGGAAAACACACTAAGTTCACGCAAAAATGG
CAATTGAACCAATCAAACATAATCGAACGCGATCAAATAATTGTGATTCC
TGTTGAACGTAATCGAATCTCAATCGAATATCCAATTCCTGTGCAATATT
CTATTGTGTTCGATTGCGTTTGAGTAAGGTTAGACTTGTTTGATTGATAG
TTGAATATGTTCAATTGGTTCAATTGATTGTCAATTACATTCGATTAATC
TTCGATTTTGTTCGATTACAATTATTTTCGATGAGTTTGATTACGTGTTT
GGTTGCAATTAAATTGAATCACTCTATTAGAGTTTTTTAGCTTGGGCGGC
AGAGCGCTCAAAGGGGAACTCAACAAATTTTGGATTTTTTTGTTTCTATC
CTGAAATGGTTTGTTTCAACGATAAATCAAAATTTCAAGGTTGCAACTCT
TCTTTCACTCTAAAAATTTGTTTAATGAGCTTTTAAAAAGAGGCTCCCCT
CTACTAAAATGAAATTGTTTATCAAATAAAAAAGACGCACTTTCAGCTGT
TTTATGACGTAGTCGCATTCAGAAAGAGGAAGATGCTTATCTTCTCAGGC
TAAAAATCAGTGAAGACAGGCCCTTCAGTAGAGGGTTTGTGATTAAATTT
TTGTGTTTCTTGTTGGATTTTTTATTGTTATTCAGCTAAATCACCCACAA
TTCACCAGGAATACTTTTCTATGTATTTATTTCTTGTTTAAAACAGAACT
CTGAAAACATACTGTAGTCATAACTGAATTTGCTCTGTTTTCTGAATACG
GTGACGTCATAATCCAAAGAGAAGTCGATCTTTTTTAAAAAGAAAGGGGG
TGATTTTTTGGACATATTTTTAACTGAAGTTAAGAGAGATTTTTCATGAT
TTTTATTTGAGAGATCGAACCTATATACTTTCTTTCTCATTTTTATACTT
AATATTACCAAAAATCAGGAAAAAAATAAAAATTAAAAATTTGTTGAGTT
CCCCTTTAAGTTCCGTACGAAAGCCAATAAAATCTAATACAATTGAACCA
ATGACATGTAATCAAAGCAATCGAACGGCAAATCCTGGGTAATATTCGAT
TGCATTTCGATTGCATTCGACAATCGAATTACAATTATTCGATTATGTTC
AATTGCGTTCAATTGATTTGTTGATTGACACGTCTGGGTATTTGTCTAAA
TATAATTTTGTAGCTAAAGATTTTCGTTCATCAGTATCAAGGTTGTGAAA
ATGATTTTGTGTCAGGATGATTTATTAGTAACTCATTCCATTGTTTTGAC
GAAAGACGAGAGAAAGAGTCCTAAATTGGTGGTTTTGACCGTTGAAAGTT
TTAGTTGTTTAAAAGCTTTGCCCCTGGTGCCAGTTTTGTGATGGAGAGTT
GATAGGACATCAGACGGAAGATTGCCCTGGAGGTATTTTTTAATATATAA
GATATTTATTACTTTCACTTGATCAAAGATTTTGAGTAATTTAAGCTCAG
CAAACAGGGGAGTGGCCAGAAGTTCTTGGCTCACTAAACGTCATAAGTCT
TAGTGCAGTGTTTTGAAGAGTAAGAATTCTAGGTATATGTGATAGTATTG
TCACGCAGTCCCCAGAGTTGACTAGCATAGCGAACATGAGAGGCAAAAAT
TGTATGATAAATGGTTTGAAGGATGTGAATTGGAACATAGTGACGAAGTT
TGGATATTGCCCCATTTGCCCTTTTCAATTTTGAAGCAACAAAGGAAGTA
TGAACCTTCCAGTTTAGATGATTGTCAAGGCGAGCACCCAAATACTTCAC
ACTCTTACTTGGTGATAGGATTTTCCCGCAAATCTTAATTCTTGGAATAC
AGTCCATCTGTCTCCAAGGGGAACGAAAAATAACAAACTCAGTTTTGCTA
GCATTCAAGGAAATTTGTTGACATTAAGCCAACTGACTAAGACTCTGAGA
TCAGCATTGACCCTCTCACAAAGACTCCATACAGTTTTTGAAAAGTTTAG
TAAATGAGTATCATCAGCAAAATGATATGTTTCAGAGGTTCTTATACAGC
AGTGAAGATCGTTTATATACAACAAGAACAGCAGAGGACCCAAGGCTGAA
CCCTGAGGAACTCCATGATTAATAGGTATTAAGGGAATTCGAGCCTGCAA
GAGAAACATACTGGGAGCAGTTAGTGAGGTAAGATCGGAACCTGTCGTTG
ACAATGCGTCTGACTCCGTAGTGATGGAGTTTTTCAAGTAAAATTTCGTG
ATCAACTGTGTCGAAAGCTTTTTGTAGATCAACAAATACACCACATGCAA
ACTTACCATTGTCACGATAGTTTCGGATATTGATGAGTGTATGCTCAGTA
GAGTGAGCCTTACAAAAACCAAATTGTTGAGTGTAGATTTGATTATGATG
TTCAAGAAAGTCAGAGAGACGTGAATACATCACTTTCTCTAAAAGAATTT
TTCAATGTTAGATAAAAGTGAAATTGGCCTATAATTAGAGACTTCAAGGG
GAGAGTCTTTATGTTTGAAGACAGGCACAACTTTAGATATTTTGAGAATG
GAAGGAAAAATACCACTGAGAAAGAAGTAGTTTATTAGCGCCAATATTGG
CACAGAATATCAAGTCTTAAAAGTTTAAGGATTTTTATAGGAATACTATG
AGGACAACTTGCTTTACTGCTTAAGAAAGAGCCAATCACCTTCGCGATTT
CTTGATAAGTGGTTGGTGCTAAGAGGATGGAATGCAGATTTGGATCTTTC
ATGGAACTGCTGAAGTGATTGTAAGAAGGGGGCATTTTTTCACGAATAGA
ATCAGCAATAGTAGTGAAAAAATCATTGAGAAGGAATTGGCTACTTTCTC
AGGATCTGATGTCAAAGAGTCACCTATGATGATTGAAATAAGTGATTCTG
AGTTAGCCCTTGTTGAGATTATATCACGAACACCAGACCAGACTTTTCTA
GAGTTTTTAGAATGGAAATCAAAATATCTGATGTAGTGGTTTTACTTACT
AATACTACGCCTAGTCAAAGTGACTGTTATATTTCGATATCTACGATAAA
GTTCATAGAGTCGATCTTTGGACTCCTTAGTTTTAATTTCTTAATGGTCA
CGTTTTTTAATTGACTTCAAAATTCCTGGCGTTATCTATGGTTTTGTTTT
TGATCTAACTTGATGTTTGGTAAGCTTGGCTGTGGGTAGATGTCTCTTCA
CAAATACCTTCACTTTGTCATTAAAAATATTGAAACAGGAGTCTGGATTA
TGACCAAATCTCAAAAAAAGGTGTCCCAATCAACTTCAAGAAAATCCAGA
ATAAATTCTTCTCGGTTGAAACGAGACCAGTCTTGCTGAAAAAAAGTATT
ATCTTCACCGGGAAACTTACTTATGAATTTGAAAATTATAGAACTGATGT
CTCCTAAATAAACCTTTTCAAACAACAGTATATGGAAAGAAAAAAAATTG
AAGAAAGGAATTTATCTTCAAAATTGGCCAAATCTCTCACTTAAAGTCCA
ATTACTAGAAAAAAAGACTATTTTTGAACAGCTGACAGGCCCCACTAGTA
GTTTACTCCCTAGCCAAGATAGATCAGGTCGTTTTGCTCTTCAAAAATTG
TCTGCCAACTAGCCGAGGGTTGGCTAACTAGCCTAGCATAGTACGGTCTT
TCCAATGCAGTCATTTGAACAGGATCCTTCATAAAATTAGTTTCTGGCAT
AAAAGAAAAATATCAGAATTAGCCACAGAATGACATGCAAAGTTCCATCT
GAAATTTGGATAGTTTTTAAAGAAATTGGCTCGTCAGCCAACCATAAGAC
TCTTCTAAATGTATAGACTCTTCTGGCATAAAAAAGCAAGCATTTTTTAT
CACATCTCCTCCGTATATTGGTCCATAGATATATAATGCTAACCAAATCC
TGTACAGAAGGAAGCAATCAAAAACAAACAAAGAATCTCTTTCTAAATTA
ACTAGAATAACTACCTCTAGCCGATCATCCAACCATTTTGATTGATGTAA
GTGTGAGATTGATTGTGATAGTCTCAATTCGTTAATGGATTTCAATAAAG
CAGACTACTCTGTGGTAAGTTCTTTATGTTTTTTATTGTCATATGATTTT
TTCATTCGTTTATTAATATGCTACATTTCTATAAAGAAAGTTTTGGGCAT
TTTTCGAATTATGATGATTTTTAATAGTTGCAGATAATAAATCAAAGATT
TATCTACTAAAAATTTCAAATTGTTAGTTTGCTGATGATGATCAACCCAG
AAGAAGGTTGTGAAAGTATTGGTAAAAAACTGTTTTTGTTTTTTTCTGTT
TCGTATATATACTAACTAATATTAAAAAATTGCACAATTTTCTAATTTTC
TTTTTACACCAAGATTGATACGCAGAAGAAGTGGAATGAAACTGCCAGTA
GCCGAATAAATATTTGCCTTTTCTACTTCTGTACTAGATAGTTTCTACAT
TAAGAAGAAATTTCAAAGATGGTTATATAGCAAAATATGAGAAACGATTA
GAGCAACTGCAAGCAATTTATCGACTGGTTGTGGATCATCAAGAAGAATT
TCATGATGCTGGATACAAAGATTTGAGAAAAGTATCATTTTTTGAAAAAC
TCTCTTACATTTTTTGCATAAGCGAAATAATGTTTGCAGTCTTAATGATT
TGCCTTAACATATATATAAACAATTCATTTTTGGCTTACTTTGACGTACA
AAATATGGTAAAATGGGTTTGGAAACAAATTTAGCTATAAGATAATAGAT
AACATTCTCAGGGAATTTGCCAATTTGGTTTTTTCTGCAATGTTTTTGAA
GAGTATATGAGGTTGGTGGGTAGTTTTGAGAAAATAGAGAGAGGAGTTTG
AGCAGTGGTTGGGGGAAGCTCTGAGGCTCAAAGCTGGGGTTCTAGGGCGA
CAGAGCCCCCTAACAAAATCTTGAAGTCTGAAATGACCCTAAGATAAGCT
AAACACCCATTTTGGTTTAAAAAAGGAGCTAAAGAAAATGTAACTAACAT
GAATAAAAATTAGGAAAGAAGGCTGTAAGCTGGATAAAGTGAAAAAGTAA
GCTTCAGAATGACATGTGGAAACTACGAAATGACCAGTAATTACCGCTAT
TTGCTGCACTGGAAGACCCTATGGAAGCACTGGAAGACCCTATATAGAAT
ACCCTTATAAAAGGCTTTTTTTAAGAAAGTGATGGCTCATACATTCCCAG
TGTTTTTAAATATTGTAAATGATGTCATACTTTAATAAAAAAATTGTCAA
TGATTATTTTAGCCAACAACTGAGGCCTGCTTTGCAGATACCCAATTTGT
GAACAGAGAGTGTGGTGATGGTAATTAACTTTTATTTAGGAATTATGTTC
TCACATTTAAGTTTATGAAGTCTATTTTTGTCAGTTTAAATATGCAATTA
ATTTCACTCTGATGATTTATCACAAAGATTAACGCAAAGTAATAAAAGTA
TGGATTGATTTCAAATTTCCCCAGATATTTTGAAACAACTTAAATAGGAT
CTTTGATTCTCCTGAAATTTTGAAAGTTTGCGATTGTAATTGAAGATCAG
AAGTTTTGCAAATGTCAATTTCCTTTGCAGCAATCAAAGCGCTCAAAACA
TGGATGAAGCCGGAAAATATATCAACAGATCTTTTAAACATGCAACATTC
AGCCAAGATACTGCATGATCCATTGGGTGTTGTTTTGGTTATGGGTGCTT
GGAATTATCCTGTTCAACTTTGTTTTATTCCGCTCATTGGTGCTATTGCT
GCAGGTGTGATGTCATCACTGAACTATTACTTATGTAATCTTTAGTCCTA
TAAGGCTTTTCAAAACTGGATATACGTGTCTATTTTTTACTTCATTGAAT
TGTGTTCCAAAAACCCAAAACATTCGTAAAGTTGAATAATAGGAGATTTC
TTATCACTTTTTGGTAAAGCTTTATCAGTGGATTATTTGTTGTTTGGTAA
TTTGTTGTCTAAAGAATTAACATAGAAAAAGTATGTCAAACAGTGTTCAC
TGTGCAACCTGCGAATATTTAAAACGCTTTTTCCTTTCTAGGTAATTGTG
TGATTATCAAACCGTCGGAACTTTCAATACATACTACTGAGTTGATGACA
AAACTGATTGAACAATGTCTCGACCCTGTGAGTATTCA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000099_pilon:622689..634326-

>MSTRG.12853.16.p1 ID=MSTRG.12853.16.p1|Name=MSTRG.12853.16.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2505bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000099_pilon:622689..634326- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTAATTGTGTGATTATCAAACCGTCGGAACTTTCAATACATACTACTGAG
TTGATGACAAAACTGATTGAACAATGTCTCGACCCTGTGAGTATTCAATC
AAAGCGCTCAAAACATGGATGAAGCCGGAAAATATATCAACAGATCTTTT
AAACATGCAACATTCAGCCAAGATACTGCATGATCCATTGGGTGTTGTTT
TGGTTATGGGTGCTTGGAATTATCCTGTTCAACTTTGTTTTATTCCGCTC
ATTGGTGCTATTGCTGCAGCCAACAACTGAAGCCTGCTTTGCAGATACCC
AATTTGTGATCAGAGAGTGTGGCGATGATATTTTCTACATTAAGAAGAAA
TTTCAAAGATGGTTATATAGCAAAATATGAGAAACGATTAGAGCAACTGC
AAGCAATTTATGGACTGGTTGTGGATCATCAAGAAGAATTTCATGATGCT
GGATACAAAGATTTGAGAAAAATGGATATCAATAAAGTAGACTACTCTGT
GGTAATTGTGTGATTATCAAACCGTCGGAACTTTCAATACATACTACTGA
GTTGATGACAAAACTGATTGAACAATGTCTCGACCCTGTGAGTATTCAAT
CAAAGCGCTCAAAACATGGATGAAGCCGGAAAATATATCAACAGATCTTT
TAAACATGCAACATTCAGCCAAGATACTGCATGATCCATTGGGTGTTGTT
TTGGTTATGGGTGCTTGGAATTATCCTGTTCAACTTTGTTTTATTCCGCT
CATTGGTGCTATTGCTGCAGCCAACAACTGAAGCCTGCTTTGCAGATACC
CAATTTGTGATCAGAGAGTGTGGCGATGATATTTTCTACATTAAGAAGAA
ATTTCAAAGATGGTTATATAGCAAAATATGAGAAACGATTAGAGCAACTG
CAAGCAATTTATGGACTGGTTGTGGATCATCAAGAAGAATTTCATGATGC
TGGATACAAAGATTTGAGAAAAATGGATATCAATAAAGTAGACTACTCTG
TGGTAATTGTGTGATTATCAAACCGTCGGAACTTTCAATACATACTACTG
AGTTGATGACAAAACTGATTGAACAATGTCTCGACCCTGTGAGTATTCAA
TCAAAGCGCTCAAAACATGGATGAAGCCGGAAAATATATCAACAGATCTT
TTAAACATGCAACATTCAGCCAAGATACTGCATGATCCATTGGGTGTTGT
TTTGGTTATGGGTGCTTGGAATTATCCTGTTCAACTTTGTTTTATTCCGC
TCATTGGTGCTATTGCTGCAGCCAACAACTGAAGCCTGCTTTGCAGATAC
CCAATTTGTGATCAGAGAGTGTGGCGATGATATTTTCTACATTAAGAAGA
AATTTCAAAGATGGTTATATAGCAAAATATGAGAAACGATTAGAGCAACT
GCAAGCAATTTATGGACTGGTTGTGGATCATCAAGAAGAATTTCATGATG
CTGGATACAAAGATTTGAGAAAAATGGATATCAATAAAGTAGACTACTCT
GTGGTAATTGTGTGATTATCAAACCGTCGGAACTTTCAATACATACTACT
GAGTTGATGACAAAACTGATTGAACAATGTCTCGACCCTGTGAGTATTCA
ATCAAAGCGCTCAAAACATGGATGAAGCCGGAAAATATATCAACAGATCT
TTTAAACATGCAACATTCAGCCAAGATACTGCATGATCCATTGGGTGTTG
TTTTGGTTATGGGTGCTTGGAATTATCCTGTTCAACTTTGTTTTATTCCG
CTCATTGGTGCTATTGCTGCAGCCAACAACTGAAGCCTGCTTTGCAGATA
CCCAATTTGTGATCAGAGAGTGTGGCGATGATATTTTCTACATTAAGAAG
AAATTTCAAAGATGGTTATATAGCAAAATATGAGAAACGATTAGAGCAAC
TGCAAGCAATTTATGGACTGGTTGTGGATCATCAAGAAGAATTTCATGAT
GCTGGATACAAAGATTTGAGAAAAATGGATATCAATAAAGTAGACTACTC
TGTGGTAATTGTGTGATTATCAAACCGTCGGAACTTTCAATACATACTAC
TGAGTTGATGACAAAACTGATTGAACAATGTCTCGACCCTGTGAGTATTC
AATCAAAGCGCTCAAAACATGGATGAAGCCGGAAAATATATCAACAGATC
TTTTAAACATGCAACATTCAGCCAAGATACTGCATGATCCATTGGGTGTT
GTTTTGGTTATGGGTGCTTGGAATTATCCTGTTCAACTTTGTTTTATTCC
GCTCATTGGTGCTATTGCTGCAGCCAACAACTGAAGCCTGCTTTGCAGAT
ACCCAATTTGTGATCAGAGAGTGTGGCGATGATATTTTCTACATTAAGAA
GAAATTTCAAAGATGGTTATATAGCAAAATATGAGAAACGATTAGAGCAA
CTGCAAGCAATTTATGGACTGGTTGTGGATCATCAAGAAGAATTTCATGA
TGCTGGATACAAAGATTTGAGAAAAATGGATATCAATAAAGTAGACTACT
CTGTG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12853MSTRG.12853Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12853.16.p1MSTRG.12853.16.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12853.16.p1.exon5MSTRG.12853.16.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12853.16.p1.exon4MSTRG.12853.16.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12853.16.p1.exon3MSTRG.12853.16.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12853.16.p1.exon2MSTRG.12853.16.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12853.16.p1.exon1MSTRG.12853.16.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000099_pilongenomesc0000099_pilon:622689..634326 -