MSTRG.1279.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.1279.1.p1
Unique NameMSTRG.1279.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000006_pilon:1179209..1190888+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.1279.1.p1 ID=MSTRG.1279.1.p1|Name=MSTRG.1279.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11680bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:1179209..1190888+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
caaaacaaagcAACAAATCACAAAATGGTGGTTAGAAACTGAagtatttt
ctctatttttaatcttttctgtatttttattccactttacaaatggtaca
gtttattttGTAAGTAAGTATTTCTATCTGTATTGtctttcattggtcta
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cttctgtcatcttgttttGAATAGCTTTTGGTAGCTAAGGAAAAATGTGG
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CCAGCATTGCAATAATCATCAGTCAACTGCCAGTCTAGGCCATGACCAGT
GCCaccaaaacgtttcactttttagaattgattttggtcaatttgagggt
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TTGCCCTATCTACACCGTAGCAGATAAACATTTATAATGTAGCACGggct
ttaaaataaaaatgaatgaaCGAAGTaaaaaaaCACAGGTGGtgacaaga
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CCTCCgcccaaattttgttttgatttttggatcAATATATCATCTTTGAC
CTGCTCTATCTATTGCTCATAGTTAGAATTTGCGGATTTTGTTTGTTGGT
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ggcaaaattgtaagccctgaaaattcatgattttggggggtcttcaaaat
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aaattccctgttttttccacaaatttcccaatttttgaccataaaattgt
ctataacttttgatctagaaaagttgagactttgatataatacatttttt
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CCATgatattcaaaaaactttataacatTTAAAAGCTGTCTTTTTGACCA
GATGGTactaatcaataaatcaaaCGACCAGTTATCAATCAAATTTGAGt
actaaaatttcaaagaaattgtgAGTTTTATTCGATCACtttttttGTAA
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tccacggagccaacagctgattggttgaaagtgacgtattgactgatttt
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acattgcagtggtgcatatcatgaatagacctttttttaaagaggcagcc
atgttgaataattatgtactccagcataaaaacaatgatacagccattca
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tttttatgctggagtacataattattcaacatggctgcctctttaaaaaa
ggtctatgctGACAACCCTCTTCTTAtttcaacacccttctttagagata
ggaataataggaaggtcagaatcgctggtggaaactatttttttgtttgt
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TGTCTCCGGCTTTGGCAGGTAGTaatgttttggttgttttcgatggaaaa
tgataagaaacttaagtttacaagtgtcatttagtttttgctggcggATA
GATGGCATGATCCTGGATGCCTTCCCTAACTGAATATGATCGAAAGAAAT
CGAACAGTAATCAAAATgatcgaacaaatcgaacgataggtgtttgatta
ccaaaccaaatcgaacagtcatcaaGCCGAGAAATTCTGGTAAagttcaa
ttagtttgattgATGTTCAATGTATTTGATTTATAGTTTTCATTCACAAA
TCATTTCACAGCGCATGAACAACTCTTTTCTGCTAATCCAACTATCGTTG
GGGATCGTTTAGGCTAGAGCTGTTGCGCTAGCAATAActggaaccatttg
agctacaaaaaaaTTGGTTGAACTTAATCAAATTGCGACaagtaatcgaa
ctttaatcgaacTGAAGATTTTTCGGTATAGTTCGATCGCTGTTCAATTA
GGTTCGGTAATCTAACACCTAATTGTTCGATTTCTTTCGATGGTTCAATT
ACGAAAATCGGTTTGATAGGGTTTTGGTTGGCATCTCCTGGAAAATGGTA
GAAagaagaaaatgccataatttAGAGTCAAATGAGAATGTCACCACTGC
AATCGATAGGTTGTAACTGACCaccttcgattattatcgatcattattga
ttactttgatCACAATCAAACATTCAGTTAGTACCATCTggttttgattt
cccaaacattatTCGTCTTAAGCGTtaacttccacaataatttaggTAAT
TTAAACTGTTGATCAGTCAGCTTGGGAAAAactgtgtgttttgtttttga
gcCCTCATATTCAGTCAGGATCATCATTACGTCGTTCATATGACCAAaat
aaaggttcaatctcaaaacatgtgtcttggaaaattggaaatcttgcaat
tctgttctacctttgagattggcctttttgtcttATGAAAAACATTGACT
ATTTctctacatgaaaaaagggcCATCTTaaatctcaaagatgaccacca
cagtaaaaatttaaaatttgtaaggtactaattttgagatttttaacttt
tagtcATGTGAACAACAATATATAATATTGTATAATTATTATAGGCGTGT
TTTTGTCATACTTTCAAAcaactaaaacaatccggggggtGTGTGTCGAA
GCAACACAGAATGTTCTTAAAGTAAAGAAGTAttttttggcattgacaat
cagaTATTTCCTTAAATCAAGATAtacaaaatatcaattttgcatttgtg
aaaaataaagatatagaaATCAATGATggattaatattacatacttttag
gtttatttgtaaaaattgtACATTGACAAATTTGGTCCTCCATTATTCTT
actgtcaagtcaggatcgaatTTGACGTCACCAAGAATAAAAAAGGATTT
TATCAGTTTATGCTTATATTAATTTGTGGGATATTCTATTTGAAGCGCAA
GCACTTTTCGTGGACTAGTTGGAGTAACCTTTTGCTCGATGGATTAATGG
TAATTTTTCATCCTCATTATCTtttaaatgaagcacaaccaaaaaatgaa
aatttcagaaagttGCTAGTAAACGATTCtgtaaattgacaaaattgatg
atgataactttttttCAGTCAGCCAAAATGCttgtattgggggttctagt
cttgagctTTTAGACATGCGGGATTGCAgtgtttgggtaaacgagacaaa
gtttgaaaaaagctggTATTTTGATGGACTTCCGCACTTTGTGATGCACT
GATAATGCATAAAAAAGCACATTATTGGTAAAAACACATGTATTAGTGGT
ACTGAGTAGTATTAAAATCTCActacgttcgggctattttgaaatgtttt
caataaaCCTctgggttattaatcccaaatcaccctctaaaccatgttat
tactagtacaaatcgAACAGTAATCAAACTTCACCGAATCTTCAAACTGA
TTACTGTTTGATTTATAGATTTTCTGTTCAATTAATTTCGGTTAATGTAG
TACAAGTACAAGTACAAGTGGTTCAAACATCAACAGCGAAACAGATTAGA
TGATAGATTAGAAAACgctggtcattaaaattgtGCACTGCAAGAATGGA
GGATACAAGCAAATACTATAAGCCGAACACATCAAAcataaattgaaata
atttctcAATTTGATTACTGTTTAATTTGGTTTGGTAATTGAACAGTTAG
CGTTCGataagttcgattaagtttgattacaagttcgattgtttgattgt
ttggttGACATCACCTGGATAGACCCTTTTCTCAGTTTTTAACAAAATAG
CGATTATTTTTTGGGTAGTCCTGCCTTTTTACAAATAACACAAATTTTCA
CCCTACAAAGATATCTGTTGGTGTAAAATGATGgattttttcttagaaaa
actaTATATTTGACTTAAATATATACGCTTCAAATTTAGATATATTTGAG
CCATTTGTATTTTGAATGtatgatgaaaatttcaaataaaaacagtgCCC
CAATCAGAATTTAAGACCTTTTTCAGCCAAACCGTTATTTTGCATAAAAT
CCCTCTGCTAGAGACAATAACAAGTCAACTTGTTCTGTGGCCAAAATTTT
atctaccgggtgtgccacaaaaaagtttctctctttgaaactgattttct
cgaaatctaaaaattctaaaagaactATTCCTATTTcatcagaaagaaga
aagataaacaaacttaaattttgatgggtcatttattgaattcgattaAT
TAGATCGAGAGTTATGCTccatttaataaaaataaagtaactttcagaaa
gtacttgaaaacgttaaaaatcagcttatcaaatttttattttagaatgG
GCAATTGCAACAGCCTTTACATGATTTAGAGCATTcttcagtaactaaac
acataagTTTTGatactgaagggtcgaaagggtttaaaatctttatcaaa
gtcaatttattttacttttaccgaaattttcctcagatttttggctctag
actggataaagtttatgtaaggctggatgtacctcgaaacccatatttga
tgcaTTTCTATGAATTCTgccagattttttggcttttttcaacaaatttt
cttccttattgaaattcaaccttcctttatatataCAACAAAAgttcatt
tagacagctaattattatcattttcaatgactgaaacgaaaatactgatg
catcatATAGTTATACTTctatttaatttgataggtcgattttcaacgtg
tttgagcactttcagaaagtaacttttttatccaattgagcataactttc
gatctaatcaaccgaatttgataaatgacccatcaaaatttaagtttatt
tttcttctttccaacaaAATAAGAatgattctttaaaaatttttagattt
cgagaaaattagtttaaagagagaattttttttgtggcgcaccggGTAGT
TTCTGACTTTCAAAGATTCAAAGTAGCTAAAAATCTAATCTAGAAATGCC
AAAAATTGTGACTTTCCAAACCATCAGCCCTACTGGTGGCTCGCGATTTA
GGCTTGTATAACACCCACAGTACAGCTTACAGCGAGATGGAAAAGGGTTA
ATacaaaacttacatgcataattggctaTATTAATGTGTAATCTCGCAGA
AGAAAGAAGATTAAATTTGCATCTATTGAAGACTATATACCTtttaaggg
aataaatttttgcggggattatatttcgggAATTTCCGCGAATTTCGCCT
TTTTCGCAAAATATAATCCCTTGCGAAAACTTTCAAACTCTCATAAATTG
GCGAAATTTAATCcttgcaaaaattaagttttttacgCTGAAAATTCTaa
gttttttgataaaattcagaaacaattATTTAGACTGCTTGTAATACCAT
ACCAAGATCAGTTCGATTTtaggtactttaaatcgcttggggagtggCAT
ATTTCTATACCAAATATTTTAGATTCAAGTAAATAGAATCACAGAGTgct
caagaaaattcgaaaaaatttgggcaaaatatCAAGATAATCAATTGTGT
AGGTCCTTAataattttaattcaatttaacATACATGCTACATAGAACAT
TGTTTCATGTTGGTGcaatcttcaggcaatgcaGTGCGTTgtagatttta
tcaaaaataaaatgatataaaatatttgaaataaaatctacaGTACAATA
CAATGCAGTATTGCAATAAGATTGCGCAAGCATGAAACACTGTGTAGCag
ttgcaaatattttaaattgaatcaaaattatttttgaaaaggacCTACAC
AATTGATTAAAAGGTTGTTCTAAATCAAAATGACACCTAAATTAAAGTTT
TTGTCCCTGAGGGAATTGTCATCATGCGCTTACCAACTTCAAgttttgac
atggattcatgtattCATGTACCTCGATTTTCGTCAGCATTTCATGTTCT
TTCCGCTGGagccatcagattttgaatattttcaaaaatataatattctt
gcccagccacctgatgaccccatctggcaggtggccaggtggtaaaattt
ggtgttactgtttaaaattaagttttagaccctctaaggatcatctgtgc
caaatttcatgcttttatcaccatctgaagtattcttatgTTTTATGTGC
TAACGGACCTCACTAATAAGAGCTTTTTTGCATCTAAAAGGAACTTAAAA
CtcaatgaaagaaattttcaatcatttcagAAAAATGTCAACCAAAATTA
GCTATCCCTGATTGAGCAGCCTTTAGGTTGCAATTGCGGGTAAATacctt
taaaagaaatttttcaaatttggaaagaattaatttttaaaacatggcCT
GTTAGTTTGTCATCCTTATTTTTTCAGCTGAGAAGCAAATTCAGCAAACT
TTTGAGGCAGTTCTTCAAACTTGCCAAGATGGGGCAGGGTGCAGGGCTTT
TTGGTTTCTTCATCTTGTATAGATGTCAAAtctcaaataaatttataaac
tttttgactgaaatctttcaaatttgtattcaaattttctgaaagcATTT
ATCAGCAAGAAGctatattttaaaactttcatgAGGGAATCATATATAAA
TTTAAGCTATTGTGGTAGATTTTCCTTGTCAGGACCATGatattgttgat
tttgaaatatttaaaattactAAGAGCTCTAtgaggaaaaaaaaaagaag
tgttTAAGCACATTTTAAAGAGCTCAATCATAtagcttttcttttttaat
tgaaaaaggCATACATTTGTGAactcataatttttgaaattattttagtt
taaaagaaattgttataattttgaAGCAGGGAAATAAATATTCATTGCTG
TTTTTAGACTATTAATATCCCTCTCTTTTGATCTGAAATCTTTCAATGGA
GCCACGCCTAACATTTAGACTTTAATgtattaattttaaaataatgtaGT
GGTTTGCACGAGATGTTCATTATCAACAGGATCTTAAAATGAATAGTGAT
TTGTCTGCAATGTCTTATTTATAAAGGTGAGTTTCGATTTCTATAATATA
CTTTTTTATGGATACGGtttttttGTACCAAATTTGCATGTTTCATTTTC
TAACATGGTGATAACATCATATTTTATTCTGAGATTCAGCGAAACTTAAA
AGAATGTAATTTACAATATTTGATGATTAGGACTTCTATTATGTCATCAT
AAGTTTTTGATGTCATCTTTTGTTACTATAATTACTACAGTTTAAACAAT
TTATTGCTTTGCCATGGAAACGTGATGCTCTCTATAAAACATGCATTCTA
TTAAGAGAACAGTTAAAAACAATCTTTTTAGTTTCAATTATTTATGCCTT
TAACTCACTCACTTTCTCTCTGTTAATAGTTGACTTGTTATCTTATTTCA
GAAGATATCTCTTGATGGCTGGACaggcatttttaaagaaaaatctgCTC
ACTATCgctttgtttttgttgaatattgaaaatgtgtttGTCTCACGTCC
ACCAATATTCTGGGATCCCTACCATAAATTGTAAGTAGTTCAATTTCTTA
TCAAATATCTTTGTGATATCCAAGTTTAACTTTGTTTTATTAACCTTCCT
TTTTGTCTTAATTTTAGGTTTTCCTGCAAGGATCCTATTGTGAATGtgaa
agaaaatgatttgttGAAATTTGTATGCGCAGATAAAGATATCTCGTCCA
AACCAAATGCACATTCTTCAACCCTTCACGAAGTAGCTTATCTTCTAGAC
TACACAAAAGAACAAGAATATGAAAATTGTGATGCTAGAAGTGGGTTAAA
TGAAAGACATCTATttgtacaaaagaaattattttcattattaggAGATA
CTCATTTCAGTtgacttaaaaattttaaaataagtcTTAATTTGGTGAAA
GTTGTATATTGAAATTAAATTACTACTTATTCATTTCTCTTAGATCATGA
CAACGTATTACTGAACTGCACATCAAAATATATGGTTACACAACACCGGA
TCACCCAAAATGCTCTTTCACCTGACGCACCTTCTTTCACACCTGGAAAA
ACCTATTATGTGATAGGTAATAAACATTtcctaaaaaatctttttacaaa
atgaaaaagtataGAAACTATTTGCTAAAGGTCAGAAATTAAATGAATTG
ATGCCATCAAAGTTTCTCATTGAAATTCGAATTATTTCTCTTTTCAAATA
GCTCCAAGTTATCGTACAAGCAACATGATTAATAACATGGTTGGTGGAAG
TTGCAATGACACATCTGATGGTGGATATCATTTAAAGCTGAAAGTCCATG
TTTGTACTgatcaagaaattcaagatggTGATTGCAAGTTATGTGAAAGT
GAAGGCTGCTATTATGAAGGTCAGTTGTTTATTAGTCATTTTAAGTCTTa
ctgtcaaaaaaatttgtttcctACTGACAGTTTTTCATTCTCATGCAATT
GTTAGGTTGACAATTTTGGTAGAAATATGATGAAAACCTGTCCTTGCatt
cacattatcattgaaaaaaacttttcttttccctTACAGCTTGTGGCAAG
CAATGTGACGATTGGATTGATCCTGTCGATAATGACTGTTACAAACAAAG
ACTATGCAACAATACACTTTTAAATACACAGTTTAAAGAATATGAAAAGA
TTGACAACTGTCAAATCTCTAATAACCCTGCTGTTACAACAGGTACTTTA
AGCACAACAGGTGCTTTAAGCACAACTGGAAGTGTCAGCACTGTTTACAC
TGTTAGTACACTCAGCAGCACCAGCACCACAAGTTCAAGTTCAACCAGTT
CAGTCACAGTCAGTCCTGTTCCAGGTAACTCAGTCAGTAATAATAAGTAA
TCTAAAAGCTTTGTTTATATGCTTAAAAGCTAGGTAGCACTTTGACAGTA
AACTTATTCTTGAGGTATTTGCCCAGTATGATGTGTatttatattgaaaa
ttttagtaacagactttttcaagttttagtaAACTTTAGATAACTGGATA
AATTGAGTTGTTTTAGTTTACCTTGTACGTCCTTTTTCTTTCAGGTaaaa
aaaCTGGCGAGGAAAATAATAAGGATGACTCATACAAATACATGGGCATC
GGTATTGCATTTGCATTGATTGTAGGTCTCGTTCTTGGCCTGGTCATTAG
TAAATGGCATTATGGGAAAAAACGTCAGGAGAATTTTGTGGGTAAGTTCC
CTTAAATTCTTTGCAttcttaaatatttctttttatatatgAGCTGACCA
GTGCTCAATTAAGCCAATTATATATAGATAAATAGGAAAGTAGGAAAATT
GGTAGAGGTACTTTTACCACAGCTAATACTTTTAATTAATATGACTTATA
TTGTCTTGACACAGGTTACGTCATCCGTTTTTTAGatagaatttcttttt
ctttcatttcagacATAGAAAGGAATAACTCCAAGCATAGCCATATCAAC
GAAGGCTTTCAATATGACAATCGTAAAAGTAAAGTCACAAATTAAAATCA
TCAGTCCCTTCtataatatttatttcattttttagaaatgttgataataa
aaatttgtaaatatttttcttttgagcaTATTATTTATAAGATGTTGATA
GTAGACCAAATTTATTTTACCACGTTAAAATTCTGCattattctattttt
attttgatatctGAAACAGTATATTGTATTACCCTATGTGTATTTTAtat
gttgtattttttttttatcgcTTTAATAAAATGTTTTAGCTTGATTTCTA
TTCCCTTTTGAAAGTATGCAAAAGTATGGCATACTTCTTtcttctgaaaa
taaaaagcttCGTTATATTATGCTTTCATAGTCAAAAGACTTTCGCAAAT
TCCTCATTTTTTGATCtatgaaatttagaaattgtTATTGCTCTAAGTTG
AGGGCTATGGTACTACAGATCTTTCTGTTGAGTGGGTAGTTGGATGAGTA
AAATAATTCGATTTACATGTGTGTGAGTTTCGTTATCTTTATGTATTTCC
AAGTATTTAGGAAAATGGCACCtctatcaaatcaaaatattttatttatg
agAACCTCAAAAGGATCTGATTCATCAATCATTCTCTTTATGTCCTGATT
CAATTTTAAGATTCATAATATATTTATGATTtatatagaaaaaaggatat
aaaaattagactactgtactgtatgtggaa

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000006_pilon:1179209..1190888+

>MSTRG.1279.1.p1 ID=MSTRG.1279.1.p1|Name=MSTRG.1279.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6741bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:1179209..1190888+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTGGACaggcatttttaaagaaaaatctgCTCACTATCgctttgtt
tttgttgaatattgaaaatgtgtttGTCTCACGTCCACCAATATTCTGGG
ATCCCTACCATAAATTGTTTTCCTGCAAGGATCCTATTGTGAATGtgaaa
gaaaatgatttgttGAAATTTGTATGCGCAGATAAAGATATCTCGTCCAA
ACCAAATGCACATTCTTCAACCCTTCACGAAGTAGCTTATCTTCTAGACT
ACACAAAAGAACAAGAATATGAAAATTGTGATGCTAGAAATCATGACAAC
GTATTACTGAACTGCACATCAAAATATATGGTTACACAACACCGGATCAC
CCAAAATGCTCTTTCACCTGACGCACCTTCTTTCACACCTGGAAAAACCT
ATTATGTGATAGCTCCAAGTTATCGTACAAGCAACATGATTAATAACATG
GTTGGTGGAAGTTGCAATGACACATCTGATGGTGGATATCATTTAAAGCT
GAAAGTCCATGTTTGTACTgatcaagaaattcaagatggTGATTGCAAGT
TATGTGAAAGTGAAGGCTGCTATTATGAAGCTTGTGGCAAGCAATGTGAC
GATTGGATTGATCCTGTCGATAATGACTGTTACAAACAAAGACTATGCAA
CAATACACTTTTAAATACACAGTTTAAAGAATATGAAAAGATTGACAACT
GTCAAATCTCTAATAACCCTGCTGTTACAACAGGTaaaaaaaCTGGCGAG
GAAAATAATAAGGATGACTCATACAAATACATGGGCATCGGTATTGCATT
TGCATTGATTGTAGGTCTCGTTCTTGGCCTGGTCATTAGTAAATGGCATT
ATGGGAAAAAACGTCAGGAGAATTTTGTGGacATAGAAAGGAATAACTCC
AAGCATAGCCATATCAACGAAGGCTTTCAATATGACAATCGTAAAAGTAA
AGTCACAAATTAAATGGCTGGACaggcatttttaaagaaaaatctgCTCA
CTATCgctttgtttttgttgaatattgaaaatgtgtttGTCTCACGTCCA
CCAATATTCTGGGATCCCTACCATAAATTGTTTTCCTGCAAGGATCCTAT
TGTGAATGtgaaagaaaatgatttgttGAAATTTGTATGCGCAGATAAAG
ATATCTCGTCCAAACCAAATGCACATTCTTCAACCCTTCACGAAGTAGCT
TATCTTCTAGACTACACAAAAGAACAAGAATATGAAAATTGTGATGCTAG
AAATCATGACAACGTATTACTGAACTGCACATCAAAATATATGGTTACAC
AACACCGGATCACCCAAAATGCTCTTTCACCTGACGCACCTTCTTTCACA
CCTGGAAAAACCTATTATGTGATAGCTCCAAGTTATCGTACAAGCAACAT
GATTAATAACATGGTTGGTGGAAGTTGCAATGACACATCTGATGGTGGAT
ATCATTTAAAGCTGAAAGTCCATGTTTGTACTgatcaagaaattcaagat
ggTGATTGCAAGTTATGTGAAAGTGAAGGCTGCTATTATGAAGCTTGTGG
CAAGCAATGTGACGATTGGATTGATCCTGTCGATAATGACTGTTACAAAC
AAAGACTATGCAACAATACACTTTTAAATACACAGTTTAAAGAATATGAA
AAGATTGACAACTGTCAAATCTCTAATAACCCTGCTGTTACAACAGGTaa
aaaaaCTGGCGAGGAAAATAATAAGGATGACTCATACAAATACATGGGCA
TCGGTATTGCATTTGCATTGATTGTAGGTCTCGTTCTTGGCCTGGTCATT
AGTAAATGGCATTATGGGAAAAAACGTCAGGAGAATTTTGTGGacATAGA
AAGGAATAACTCCAAGCATAGCCATATCAACGAAGGCTTTCAATATGACA
ATCGTAAAAGTAAAGTCACAAATTAAATGGCTGGACaggcatttttaaag
aaaaatctgCTCACTATCgctttgtttttgttgaatattgaaaatgtgtt
tGTCTCACGTCCACCAATATTCTGGGATCCCTACCATAAATTGTTTTCCT
GCAAGGATCCTATTGTGAATGtgaaagaaaatgatttgttGAAATTTGTA
TGCGCAGATAAAGATATCTCGTCCAAACCAAATGCACATTCTTCAACCCT
TCACGAAGTAGCTTATCTTCTAGACTACACAAAAGAACAAGAATATGAAA
ATTGTGATGCTAGAAATCATGACAACGTATTACTGAACTGCACATCAAAA
TATATGGTTACACAACACCGGATCACCCAAAATGCTCTTTCACCTGACGC
ACCTTCTTTCACACCTGGAAAAACCTATTATGTGATAGCTCCAAGTTATC
GTACAAGCAACATGATTAATAACATGGTTGGTGGAAGTTGCAATGACACA
TCTGATGGTGGATATCATTTAAAGCTGAAAGTCCATGTTTGTACTgatca
agaaattcaagatggTGATTGCAAGTTATGTGAAAGTGAAGGCTGCTATT
ATGAAGCTTGTGGCAAGCAATGTGACGATTGGATTGATCCTGTCGATAAT
GACTGTTACAAACAAAGACTATGCAACAATACACTTTTAAATACACAGTT
TAAAGAATATGAAAAGATTGACAACTGTCAAATCTCTAATAACCCTGCTG
TTACAACAGGTaaaaaaaCTGGCGAGGAAAATAATAAGGATGACTCATAC
AAATACATGGGCATCGGTATTGCATTTGCATTGATTGTAGGTCTCGTTCT
TGGCCTGGTCATTAGTAAATGGCATTATGGGAAAAAACGTCAGGAGAATT
TTGTGGacATAGAAAGGAATAACTCCAAGCATAGCCATATCAACGAAGGC
TTTCAATATGACAATCGTAAAAGTAAAGTCACAAATTAAATGGCTGGACa
ggcatttttaaagaaaaatctgCTCACTATCgctttgtttttgttgaata
ttgaaaatgtgtttGTCTCACGTCCACCAATATTCTGGGATCCCTACCAT
AAATTGTTTTCCTGCAAGGATCCTATTGTGAATGtgaaagaaaatgattt
gttGAAATTTGTATGCGCAGATAAAGATATCTCGTCCAAACCAAATGCAC
ATTCTTCAACCCTTCACGAAGTAGCTTATCTTCTAGACTACACAAAAGAA
CAAGAATATGAAAATTGTGATGCTAGAAATCATGACAACGTATTACTGAA
CTGCACATCAAAATATATGGTTACACAACACCGGATCACCCAAAATGCTC
TTTCACCTGACGCACCTTCTTTCACACCTGGAAAAACCTATTATGTGATA
GCTCCAAGTTATCGTACAAGCAACATGATTAATAACATGGTTGGTGGAAG
TTGCAATGACACATCTGATGGTGGATATCATTTAAAGCTGAAAGTCCATG
TTTGTACTgatcaagaaattcaagatggTGATTGCAAGTTATGTGAAAGT
GAAGGCTGCTATTATGAAGCTTGTGGCAAGCAATGTGACGATTGGATTGA
TCCTGTCGATAATGACTGTTACAAACAAAGACTATGCAACAATACACTTT
TAAATACACAGTTTAAAGAATATGAAAAGATTGACAACTGTCAAATCTCT
AATAACCCTGCTGTTACAACAGGTaaaaaaaCTGGCGAGGAAAATAATAA
GGATGACTCATACAAATACATGGGCATCGGTATTGCATTTGCATTGATTG
TAGGTCTCGTTCTTGGCCTGGTCATTAGTAAATGGCATTATGGGAAAAAA
CGTCAGGAGAATTTTGTGGacATAGAAAGGAATAACTCCAAGCATAGCCA
TATCAACGAAGGCTTTCAATATGACAATCGTAAAAGTAAAGTCACAAATT
AAATGGCTGGACaggcatttttaaagaaaaatctgCTCACTATCgctttg
tttttgttgaatattgaaaatgtgtttGTCTCACGTCCACCAATATTCTG
GGATCCCTACCATAAATTGTTTTCCTGCAAGGATCCTATTGTGAATGtga
aagaaaatgatttgttGAAATTTGTATGCGCAGATAAAGATATCTCGTCC
AAACCAAATGCACATTCTTCAACCCTTCACGAAGTAGCTTATCTTCTAGA
CTACACAAAAGAACAAGAATATGAAAATTGTGATGCTAGAAATCATGACA
ACGTATTACTGAACTGCACATCAAAATATATGGTTACACAACACCGGATC
ACCCAAAATGCTCTTTCACCTGACGCACCTTCTTTCACACCTGGAAAAAC
CTATTATGTGATAGCTCCAAGTTATCGTACAAGCAACATGATTAATAACA
TGGTTGGTGGAAGTTGCAATGACACATCTGATGGTGGATATCATTTAAAG
CTGAAAGTCCATGTTTGTACTgatcaagaaattcaagatggTGATTGCAA
GTTATGTGAAAGTGAAGGCTGCTATTATGAAGCTTGTGGCAAGCAATGTG
ACGATTGGATTGATCCTGTCGATAATGACTGTTACAAACAAAGACTATGC
AACAATACACTTTTAAATACACAGTTTAAAGAATATGAAAAGATTGACAA
CTGTCAAATCTCTAATAACCCTGCTGTTACAACAGGTaaaaaaaCTGGCG
AGGAAAATAATAAGGATGACTCATACAAATACATGGGCATCGGTATTGCA
TTTGCATTGATTGTAGGTCTCGTTCTTGGCCTGGTCATTAGTAAATGGCA
TTATGGGAAAAAACGTCAGGAGAATTTTGTGGacATAGAAAGGAATAACT
CCAAGCATAGCCATATCAACGAAGGCTTTCAATATGACAATCGTAAAAGT
AAAGTCACAAATTAAATGGCTGGACaggcatttttaaagaaaaatctgCT
CACTATCgctttgtttttgttgaatattgaaaatgtgtttGTCTCACGTC
CACCAATATTCTGGGATCCCTACCATAAATTGTTTTCCTGCAAGGATCCT
ATTGTGAATGtgaaagaaaatgatttgttGAAATTTGTATGCGCAGATAA
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1279MSTRG.1279Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1279.1.p1.exon1MSTRG.1279.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1279.1.p1.exon2MSTRG.1279.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1279.1.p1.exon3MSTRG.1279.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1279.1.p1.exon4MSTRG.1279.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1279.1.p1.exon5MSTRG.1279.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1279.1.p1.exon6MSTRG.1279.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1279.1.p1.exon7MSTRG.1279.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1279.1.p1.exon8MSTRG.1279.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1279.1.p1.exon9MSTRG.1279.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1279.1.p1MSTRG.1279.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000006_pilongenomesc0000006_pilon:1179209..1190888 +