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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000098_pilon:410903..432244+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12775.3.p1 ID=MSTRG.12775.3.p1|Name=MSTRG.12775.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=21342bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000098_pilon:410903..432244+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
tatatttatCATCCTGATCACATCACCAAAATCACATTTGTTCACAATGA
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TTTACTCGACAGGTAAGTCAATTGTTCTACAATGCCTTTTAGACAAtgta
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gggaaaaaacaaaagaaatcaaacataatataaaatttcatcataaacaa
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CAAGGGTTCTAAATAAAACTCAAATCTTCTGATTGGgggtaattttatat
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ttttccggtctgtaccttgttgacctgtgacctgcaacctgtgacctgcg
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tcacttcgtttagagctttttagcgtgaaCGGCCGAGCGCTACATAATCA
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TGGTTATAACTCTTGACTGCTTGCTCTAGCGGGCTGAAAATTTACACAAT
CGTCCAGCAAGGCAGGGTGATGTGATATTCCTAAGAAACAGAATTAAAAG
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aaaaatgccccAATCGTCTTCAGATTccactgaaaaatatatttgatgcC
AAAACTTTCATGAAAGGGTAAGGTTTTTGTATGTAATTGACCAAGGCCTA
ATTGAGAGCAGGCTTTCCTGGACATTTCATTATATTATAATACAGTATTT
CTAGATTCAAAGTTGAGCCAAAAGTAGATGATATGTATCTGACTATTGTT
AATCTCGTATTGtcatatgtgactccccaagcgattttaagTGCCTATGA
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CTTTCTTTGTCTTCATTTTGTACTCAATCTATTctgtctttaaaaatctt
tttttttttaacaaaaagacTCCCTGTCCCCTGTTTGTATTTCCCTTGCA
AAAAAGACACCCCCTGACTTAGTTTAGCCTCTTCTTTAATTATTTCTTCT
TCCTGACTAAGCACATACCAGCacatacccctgtctcactttGATCTCTA
TGAGCTGATCCAACTTTGATTTCCTTGTAGCgaaaagacacccctgtctc
tcttTGACCTCCTTTATATTCTAGATATTCTGTGTCCTTGGAAACTATAA
GTTACCCCAACCTCAATTTGACCCGCCTGTTTGACCCTCTTCTGTTTTAC
AATCTCTGTTCTTTATTTCATATACCGTTTGTTTACGACCttctattctc
aacttcagttgagttagaatctgagaatgtgtgtctgtctgtgtgtctgt
ctgtgtgtatgtcccaaaactttggggcagcctggagacttcaaaaattg
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TTTCGGCTCTGGGATTTAAAGGGGTTATCCCattggaagaaagtggaaga
gTTAAATTTCTTTGGACTTATCTTTTCAGGCATATTGCTATTGGATTCAC
TGAGGATGGAAGATATTTGTTGACTTATGTTTCTAACATTAAGTTTCAAT
TATCAGACACTTCTGTTTGCTCTTATCAATATGTCCtgcattggtggaaa
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GTCCTTCCGTCCGTCCATCTGATGcattttctcaggattggctctttcga
attttctgatttttttcacaatgatgcaaaatgataatgccCAAAATCTG
AGAGAGCcagatttcaaaaacaaaattctgactgaaatgtgccggaaaaa
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TCGAgtccaaatttttgagaaaagctTTTTCCTGCCAGAAATACTTTAGG
CGtgcaaactttcgcgagcagaaactttcaatTCAGCATTGCGGACGAAG
TAAAactcagaataaaaacatactggtttaaaatatttcgctctctctta
gagcatcttcagtttttttgaataacaaagacgtttaacaattatattta
acgacgctagaacggcattacaatgacttcttcagTTTTTGACGTCACGG
AACATCTGGTACACTTCTTTCGCGTATCCGTGGCAGTCTTTGTTGAGACC
TGATGGAGCCAGAGTTTGGAGTCTGCACATCCATTTATCTTCGGCTCGTT
CTCTTTCTGCGGAGGATGAAAAGTCACTTTCTAGGATCATCACCTCAAGG
TCAGCAAAGGAGTGGTCGCGATGGAAATGTTCTGCCAACTCTGAATTTTT
CGGTCTCTTTCCAATGTCGTAGCGGTGCTTTGAAAAACGCGTTGACAAGG
CTTCTCCTGTGTGACCAACGTACAACTTGTCATGGATCTTGCATCTGGCT
GCATACACAACGTTCTTCGTTTTGCAGCTACCACCATTGGTTACACGTTT
AGTGATACCATCTTCGTCTGCACATGGCATCCAGCTCTCAGACACCTATC
ATCACTTCTTCGTCAAAACTTCAACATGGTCAAAAACGACATCACCTTAT
CCACCGTCTTCCCTTCAACTCCAACAGTCGCCTTCCGCCGCCGAAAAACA
ATCGCCAACAAAATCGTGCGAAATGATATCTTGGAAAGACCACCACGTCA
AAACACCACGAAACCGTGTGGTAAATGCAAGCTATGCCCGAACATTGTCA
CCCAGTCAGAAATCACTCACAATGGTATCACTAAACGTGTAACCAATGGT
GGTAGCTGCAAAACGAAGAACGTTGTGTATGCAGCCAGATGCAAGATCCA
TGACAAGTTGTACGTTGGTCACACAGGAGAAGCCTTGTCAACGCGTTTTT
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GAACATTTCCATCGCGACCACTCCTTCGCTGACCTTGAGGTGATGATCCT
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tttcgcaagcataaactttcgcgaatcaggacgtaaaattgagaattttc
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ATAGTTGTTATAAAGTTTCTGTATTACTCCAGGCTATTTCTCTAACTAAA
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tggatttttggggtgtttaaaagaagggggcgtttatttgataAGTTATG
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TATTATTTGAATATAAATATGTCAATTTAGGGATGTAGAAATGGGTCAAA
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CTTCATATTATACTTCCTTACTGCTACCTGTTTCAAATAAATGCCCCtcc
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TGAAACGGTATATTATTATCCTTTTTCAGTACGGATTCTCAAAGCAATGG
AAGAATGTGTTATGTATCAATCGTCCCTAAATATAACAAGAAGAAACCTG
AACAGAATCAATATAGTGTCCATTTCAAATATGAACTGTTACCACCTCAT
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TATTTTCTTGCGAATCAGGAAAGGATATACAGACAAGATTGTGTTACTGC
CAGCAACGCCAACAAGACGTGCTTGCAAACCAAAGCAACATAGATGTCAA
TTATGACGACTCGACTGATTATATTTCATTCATAAATCAAGGATTTAATA
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ACAGTTGAAGAATAGTTATGAACACAGATGCTTTCGACATGCTGATAAAG
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tttcgcatagcgaaagtattacgatcgtctttcgcggcggcggtgtaatg
aaaaatttagaaaacgaaagtagttgaaacttctagaacattctcgaagA
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GCAAGTGCTAGGTAGGTGGAACCAAGCATTCGTAAACATTCTTGTTTTTT
AAAATGGCGGATTCGATCATGCTGTCAGACTTGCTctggatttttgtatt
tttatcatgtttttgatgtttttagagtacttaaagaggtttatatttgt
tttagcatagtattttatgtttgtgtagttagtaaatgcACCAATGAAGT
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acaaatacagacaaacacaacagacaggtatgatcttcatttttacaggt
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TTTACTTAGCACTTAGTATTTCACAGAAGAATTCATAGCAGGGGGTGTCA
ATCTATAAGTGATAGAAGCTACCTTTTGATGTGTTAATTGTCAATCGATG
AGCGATGACTAATTATAATAACTAACCGATTGATTGGATGTCGATCGATT
TCGATAATCGATACTATTCTAACCGATAATAGATTAGTTTTTTAATCGAT
TGGACTCGATTGGCTGTCAATTGTGATCAATATCGAACATCTTTATTATA
AATCGATGGAAAATCGATCACAATTACAATTGATAGCCAGTCGAGCTTCC
CATAAAATCTTGATTATCGATTGTCTATCAATTATCGAAATCAAACGATA
TCCAATCCATTGATTATTTATTGATTAGTCAtcgattggaaaaagttatc
GATTGAGAGTCTGGCATGTTGGATTGGCGCTTCGTGGGATAGTGGTCATT
GGACCTTGGCAgttacaaaaacattttgttcaaccaccttcacttcaaga
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ggctttcagccttgcactccatcacagagcctatttgagatattttacta
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TTATGCTAATTATGACATTAAGGAAGGCTCAATTACattatagtcaggta
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ATGTAGATACTTTAATTACCTTTCAAACTAATTCTCAGCACCAAGTTATA
TTAAAGTAGAAAGTTATGTACCGTTAGAATTGGAATGATATATTagagag
gccccccagcggtttgcgtgatggcgtgattgggacttttttcttgcgtg
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ACTAAAATGTTCACATTTGGGTGACAATAAAGCTCTAGCCCCGTTCTATT
TATTGCATTCTATTAATGGTGACAGGGGGATACTTAGGCATAAATAGGTG
CCAGGTATGTGCTGATGCACACAAGGTTTGGTTTTTAACCTTCCCAAGTC
TCTGAATTATTTAAGGTacgaaaaacttgaaaagtcataaaaatctcTAA
GAGTCACATTTTCGCCTTGTCTCTGTAACTGTAAGGGTAACTTTATTCTC
TATTTTGTCTATGAATAATCAAAGactttgcgaaattttcgactcttGAG
TCGTCttgtatttttgttgttttctaccCTGCACCATATATGGCTAGGTA
CTAAAATGACTCTTTAGAAGGTCCAGTGTGATAGTGGTCAAGTGGTAGCA
TGCTTGAATACTTGCTGTCGATCAGTCAGTGATGGTAAACATCTGTCACA
GGTCAGTAGATGTTATGTTAAGGTAACTACAATACAATATCTCTCCAATA
AAACAATGAACAATATCTCTCCAATAAAACAATGAACAGTATTTATTCAA
TAACACAAGTAACGTTAActataaaacaataaaacaatgTACAATTTCAC
TTGTATAATTCCAAGCTCCTCCACAACCATTATTTTGTTAGTTATTGGTA
GTCTAAAGGTAAAAGTATCACTATGGATTCTTGagattaatgattttttt
ttttacctttttcaaaTCGTATACCCTTCTTGGGAATGTCCTGAAAACTT
CAGGGTCATTGCATAAGTATTTGGGTTACATGAAGCACTTTAGTGCACTT
AGATGCTATAAAAATCGGTCCAGACCGATCGGCCAAAAAGCGGTCAAATA
TCGGCTTTTTAGCTGCCAAGATTTCACTTTTACCGTTCCCGCCTCTATTT
CTATCGGCTATGGATTGGCCACTCTTGTTTCACTTTTGAGGCGATTTTTG
CGGCTTTGCCGATCGGGCTAAAGTCCGGTAAGAAGGCTGGGTCTATGCGT
TTGCCGGCAAcgaaagaataaaaacaatcattttttagttcattctttct
ttctttcataaAGATCAAATTAAAGACAACTGATAGAATTATACAACTGC
AATAAAAGGATTGACAAAAGAACTTCTTTTTATAAACCATTATATTTCTG
AAGCAAGACCGTTCCTTTGCTTTGTGGTCTTCATTTGTACTCAATTTATT
CTgtctttattctttttttaacgAAAAGATCCCCTGCCCCAATACGAtcc
ccggggggtactagggttgcgagacggggaggggggggtgtgccgcccaa
ctttcgaactttggacccttaccgggactaaaaaggagaaaacaaaggaa
aattttgggaattttacgacccttagcgggacaaatttgaccaattttga
ccaaatttcgatctttcagggggtagaaagttgaaatttttgccgaccct
tagcgggactttggaaatccctCGTAAAAAGACAACCCTGTCTCAGTTTG
ACCCAGGCAGAAATGGATGTTGCGATTTTTGTCATCTCAAAAAAGAAGCC
GTTGCATTGTTTTCCGCGCGCGTTCTATTTTGTGCCAATCAAAATGCGTC
ACGTCACGCAttcgaaaaaattcgaaaatgttgcaatcaaaacGAAAAGT
GTTTCATTTGTGactttggctttgaaaagaaaacatgaaCTCTATagaaa
ctaaaattaaaaaaatattgtgaTTATTTCATCGCAACATTTCAAACAAC
TTCTGGAAAAGATCGAAGAACATTTATAAAGTTAATTAAATTGAGATATA
GAAATTGAATGACTTTCTTGtcttcgaaattcagttttcgaaggaagcct
tttatctttatttttatcaatggtgattcatttttggacataaaaaactc
ccaaggataactagtaagtttttatttattttggagatgaaaaatgccaa
aagaaAACGAGAGAAGAAACAAAGTCTCAGCGATTTTGTAAGAAGaagga
atttcttttttaaagtagCGCTATATAGCAATATTTAAAAATTAGGCTGC
TAGTTTGCGAATCAAACTCAGCTCgaggatttatttattttgttgatcaa
tgttaaacaaattttagaactttgagtgatatttgttatttttataagaa
ttctaAACTAATTCACATGCGAAAATTGCTTATATCCGTACGTCAATCTG
AGATTTTAGAAAAGTCACACGAAACTTCAGAGGACCTGGTCGTaagaaaa
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ttttatcttctttctcCAGGGGTATGTGGGGAAAATCGGCTCCAAATTAT
TATTTCTCTGCAAGCTTTTTGTGTGTAACTTCAGTTTTCACAAGCAAGAA
TTTTTCTGCTTCTGAAAAGTGACAAATcccaagaaaaatcaaaatcaaaa
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CCAATGAAATCGCTAGAATCTTACTTATTTATATATTGTAacgttttaat
ttaatatttaattactatattcttgagaaaaaaaaattgagaatcttact
gatgcgcGATAATTGTGCCTTCTCCTTGACTAAGCACATGCCCCTGTCTC
ACCTCCTTTATATTCTCGATATTTTGTTTATCCTTCGAAACTATAAGTTA
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tttggttggttgggacccaaataacataaatctaagatatttttggatat
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TTTCGGGccattttgcttggaaaaaaaatctaaaacctgctgtgttggtg
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CAGAAAACTTTATGAACACAGAGCTTCAAAAGAGAGAAGACATAAGCAAA
CGATTTGTTTCCCTCAAAGACTATGACATGCAATTTATTGAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000098_pilon:410903..432244+ >MSTRG.12775.3.p1 ID=MSTRG.12775.3.p1|Name=MSTRG.12775.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1272bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000098_pilon:410903..432244+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTGTTATGTATCAATCGTCCCTAAATATAACAAGAAGAAACCTGAACA
GAATCAATATAGTGTCCATTTCAAATATGAACTGTTACCACCTCATCCAC
CATTTCTGACCACTATatctttgaaaagaaagaatGTTATACTTTTAAAT
TCTGGAGATATGTTGTTTGCCATTCTGATACCTGAACCTTCAAGTTTATT
TTCTTGCGAATCAGGAAAGGATATACAGACAAGATTGTGTTACTGCCAGC
AACGCCAACAAGACGTGCTTGCAAACCAAAGCAACATAGATGTCAATTAT
GACGACTCGACTGATTATATTTCATTCATAAATCAAGGATTTAATACAAT
AAATGATAACGATTCGCAAACATCCCTTCCTGACTCACCTTTTGATTGTA
TGACAACTGTAATACCATGTGCAATTACTACAGTTGATGGTTTGATACAG
TTGAAGAATAGTTATGAACACAGATGCTTTCGACATGCTGATAAAGGAGA
AATGTCCAAATGTGACTTCTTCGTGAATCAAGCTCAATTGGATGCAGAAA
ACTTTATGAACACAGAGCTTCAAAAGAGAGAAGACATAAGCAAACGATTT
GTTTCCCTCAAAGACTATGACATGCAATTTATTGAGATGTGTTATGTATC
AATCGTCCCTAAATATAACAAGAAGAAACCTGAACAGAATCAATATAGTG
TCCATTTCAAATATGAACTGTTACCACCTCATCCACCATTTCTGACCACT
ATatctttgaaaagaaagaatGTTATACTTTTAAATTCTGGAGATATGTT
GTTTGCCATTCTGATACCTGAACCTTCAAGTTTATTTTCTTGCGAATCAG
GAAAGGATATACAGACAAGATTGTGTTACTGCCAGCAACGCCAACAAGAC
GTGCTTGCAAACCAAAGCAACATAGATGTCAATTATGACGACTCGACTGA
TTATATTTCATTCATAAATCAAGGATTTAATACAATAAATGATAACGATT
CGCAAACATCCCTTCCTGACTCACCTTTTGATTGTATGACAACTGTAATA
CCATGTGCAATTACTACAGTTGATGGTTTGATACAGTTGAAGAATAGTTA
TGAACACAGATGCTTTCGACATGCTGATAAAGGAGAAATGTCCAAATGTG
ACTTCTTCGTGAATCAAGCTCAATTGGATGCAGAAAACTTTATGAACACA
GAGCTTCAAAAGAGAGAAGACATAAGCAAACGATTTGTTTCCCTCAAAGA
CTATGACATGCAATTTATTGAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000098_pilon | genome | sc0000098_pilon:410903..432244 + |
|
