MSTRG.12774.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12774.1.p1
Unique NameMSTRG.12774.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000098_pilon:400899..409480-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12774.1.p1 ID=MSTRG.12774.1.p1|Name=MSTRG.12774.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8582bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000098_pilon:400899..409480- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ACAACGCGATGTCCGTCCAAGTTGCAGCAGCCGAAAAATCTGATCAATCG
ACTGAATGTTGGATTTTGGTTTTCGTGAGATTAAATTAAGTTTCTCCTTT
TTTCAAGTTTGATTATTCATTTGATTTTAGGTCAAAAGCCTTGTGATCAT
TAAAGAAAAGCAGAATGGATTTCGAAGGAGCTAGCAATAACATGAAAGCA
TTTTTAACCCATTACTACTCAATGTTTGAGGCAAATAGAGAAGCTTTAGC
CGGATTTTTTGTAAGTTAAAGGGGATAATCAGATGGTTTGTAATATTTGA
GATGTGGGATCCTTCTATTGACCTGAGCAAAATCTCAAATTATTTTTGCC
TAACTATTTTTCCAAAGTCGAGATATTTAAGTTAAAAGTTTTTGGCTTTT
AGGATAAAAACAAATAGAATTTTGATATCTTTAAAATACTTTAAGGTCTT
ACTGTAAGTTGGTCTAGTGTCTAATGTCAACATTCCTTTTCTAATTCCGA
CACCCTTTTTAGAGATTGAAAAATAAGAAGATTAGAAGCGCTGATTAAGA
CCAGTTGGGTATTTAATACCTTAAAGGAAGAAATTTTGGCGGAAAGAAAA
TTTGGCGGATTTGGCGGATTTGACTGAAATCCGCCAAATTAAGTTCCCGC
CAAAATTTCTTTTTCCGCCAGCCGCCAAATTAAATTCCCGCCAAATTAAA
CATTTTGAAAATATGATCTCTTTTAAGATGTTTTTGCTATTTTTTAGTTT
TTTCGTCCATCCGCCAAATTAAATTCCCTCTGAAAAAACTTTTTTGGCCA
TCCGCCAAATTAAATTCCCGCAAACTGTTGCTGCTAAACAGCAATTTTTT
CAAAGATAAAATGCCAAGTCAGCAAATTGGGTTGTCCTTATTAGGGTAAC
AGTATAAGGTGTTTGAAAATTGTATAATAACATAGAGGAAAAGGTTTTTC
AGATTTTTAAAAGTGATTTTTATAATTTTTCGTTGCTCAAAATGGAAGGC
TGTGGATTGGTGTTCATTTGTTTTGAAATTTTGCTGCTTTGATTGGTCAG
TCATTTGATGGCTATGCAAGTGCCGTAGTATAGTGGTAGTCGACCTTGGC
TTCTGTGCAGGCGGCCAGGGTTCGATTCCCACTCACGGCAGTTCACTTGG
CAAGTGAACGTTCCTTCGCCCGGGTCAACCCATGCCATGTGAGGGGAATT
GGGTAGTCAGTTCAAGGTGCTGACGGGACGCTCATTAGCAGTTACATCAA
AATGCCTCGAAAATGTCAATATGAAAATTGCGTAATCAGAGAACGTATGT
CTCGCTCATTATAAAAAGGCCGAGACAAACTTTCAATAATTGGATTGTAA
CATCGAGTTAAGTCTCTTTTGTTAAGTCACCAGGGGGTAAATAAAACAGA
CCTTGATACATTTATCATTTGTTTCAACTTGACCATTTGTTTAAAACTCA
GCCTCCTAAATATTTGGGGTAGGTAAAATATGTTCAAAGAAATTCATACT
TTTCCAACCCGGCCAATCTTTAAAAAAGAAGCGAACAATAAAATGTAATT
ACCCTTTCCAAATAAACCTCTTCGGTGGCGAGCGTAGTCTACTCTGACGT
AATTGTAAAATTTATGTAATGGGAGTTTGACATAGTAATGTAATGTTGTT
TGGGGAATTATGAAGTTCTCTGGGATTTCGATTGCATTTATTCAGGTTGA
TTTTTTATGACTTCTAATGGTACTTTTTCTAACGAGTTTGATTACTCTGT
TCTCACACTTATGTCTTTTTTTTTCGCGTCCTTTTCCGTGATTACTTTTA
TTTATATTTTTAAAGACAGGTAAGAAGGCATATTGATGTAACTGATTAGT
AAGCGTCTATAGTTGCGAGAATAGGCCTCTAAAGCCTCCTGCAACTCAAC
CAAATAGAAATAGAAATAGAAGTTTCCCTCCACTGATGCAAGTTACCCGA
CTTCACAGTACAACTTTAGAGCTAGCCTGTCTTTTATGACTATTTTAACT
AATGACAACTTTTCAAAAAAACCTCAAATAATGACAACATCGTGTGGCAG
GTTTTTGAACTTGCAGGCAGCTTACACGTAAACATAACATTTAATAGACC
TTTTTGCCTTTCCATCCGCCATATTGAATTGTATGCAAAAATTATGGTGG
CCGAATTGCTGTGGTGAAATTCCCTTAAAAAGTATGCAAAACATATGCAA
AAAGAAAGTATTAATATAAAACTTACATGCATAATTGGCATATATTAAAG
TGTAATCTTGTAGAAGAAAGATTAAATTTGCTTCTTTTGAAAACTAGAAA
TAATCAAATTTGCTCATCTCTTAGAACAAGCACTTCAAAAACCATAACAT
TAGACATAAACTCAAGCTGAAAAATCACCTGCAAAGGTACAAAAATAATC
CTTATTTGGCTGACAATAAATTATTCTCCTGGGAATAGAACCGCCAAACG
ATCAAATCAAAAAATTTATCTGCTGAATGTGTGACATCATAATTACTGCT
TTCAGTTTGCGTGTTTTGACAGTTTGATGTGTAACTCCGTCTTGGTGGAA
TTTTTTGATGGCATGAAAACAGAATATGCAATGTCTTTAAGAACAAATTT
CTAAAAGGCTTTTGTTGTTCTGTAAATATTTCTTTTTGGATTAAGAAAAT
CCATCTTTTATTGTTCTAATGATTATAATATTTCTTTATAAGATGCTTTG
TTGTCTTTTTAATCTTTGTGTATATTTGCATATTTTCCAATTAAATCCAA
CCACGGCTTTTTCGTTCCTCCATTTTTGCATACAATTCAAGATGGCGGAT
AGAAAGGTGAAAAGGTCTATCCCATTGGCCTAACATAAAAAGCTCTAAAA
TAATATGTGAAAAGATCCTGTATCAATGCCAAGGAACAGCCAGAAAGAGA
ATTTTGCTAGTCTGAATTCCAATAAAAAGCAGTTGAAAAATAAACTAAAC
AACAAAGCACAGTGGACCTACTAGTTGGGAGGGTGTCAAATACCACATGT
TCAATAATAAAAAATGACAATAGCAATTTTTAGTTGTAAACTTTTTTACT
TTTCTGCTGATTCAGCATTTCATTGTTGAAAAAATTGTCGTTATCAACAA
TAATTGCTTAAAAGAGCAATAATTGCAGTTTTTATCTTAAATACCCAACT
GTAAACTTAATGATAACATTCACTCTTGAAAATAGGTACTTTTGAGTCTA
ATAGCAGTATTCCTTCTGAAAATTGTTTAAAGTAGATTGTGAGCAAAGCG
AGAATGAAAACCTTTTGGATTTTAACCCAGTCCAAGACTGCCAAAATAGA
GATTTAGAAAGATAGGCTCAATGAACTTTGCTAACACGTTTTAAACCCCC
TTTCTAGATGAACCTCAACCTTTTCAAAAATTTCCCCCTTTCTACAAGAA
ATTCCCCCCACTTTATGTGATTTTCAGGACATCCCTCCCCTTCTATGAGG
GTTTGCGAACTATGCTTTAAGCTCAATACTATTGATAATTGCCAGTTTAG
AATGTGTACTTTTTGCCCTGTCTATTCTAATTGTAGGGGTAGGCAGAGAG
TTTGTCCTCAAAATCTTCCCTTGAAACAGATTTTAAAAAGACATCATTCA
CATCATTCACTGTTAGAATAGGAAAGTCATAAAGTTGGTTGTCTAAACCA
GAGCCTTGCAAGTAAATGTCTGACCCATCTGTTTTTTATTTCTTTTAGGA
TGGCAATTCAATCTTTACATTTGAATCAGATGTACTACTTGGACAACAAA
ATATAATTAAACATTTAATAGTATGTATTGTTTTATTTGTTTGTTTTATG
TTGTCATGTTTATGTTTATGTTTCTTTTCTTTTTTGTTGATGTATAATAG
TACAATGTGTACTTAGCTCGAGGCTAATCAATATCAACTTTTGATTACAA
ATCTATCTAAAAGGTCGAAAAGGTTGATGCTCAAAATCAATTATTATTTA
CAAATTAATTTAAATTCAATCAATAAACCCAACGTCACAGATAAAGGTGC
AACAGTTTCGGCAAGGACAAGTAGTGGGTCCCCATTGCTTGATTTCTTTT
TTAAATTCATCTATGTTTTTAAGTTTTTTAAAGTCATCTGGAAGGGTAGC
CCAGATTTTAGGTCCCAAGAAAGCTATTTCACTTTCAACTATTCTACTAC
AAAAGGAATTCCTTTTTCTTGTTTTGATCGTTTTGAACGTTCTGATTCAT
TGAGTTTTGACTTAAATAGCTCTGTGGATAAAGATTGAATTGCTCGTTGA
TGGAAAGTGGAACCATTGTCAAGTTTCAACAGATCTTCGAATGATGAGTT
GTAGTCTGAGTAAACGATTCTCAAGCATCTTTTATTATGTAGATTGTTGA
TTTTATCTTCTAGAGCCCTGCTATGAAACATCCATATGAGAGGACAGTAA
TCAAAGTGGCATTTAATGAAAGAACTCATTAAGTGTTTCTTTTTTTTCTA
AACTGACATATGTGCTCATTCTGGCTACTCTTGTCTCCCGAATAGACGGG
GGGTGTCCGAATAATTTTTAACTGATATGAATTTCAACATCAAAAAAAAA
CTTTAACAAATGAACACGTAAAATAAGAGCCAATACTAACAAAAAGGAAA
ATTTGACAAGTTTAAGGTCTATCTACACTAATAATATATTGAATTATTCA
AATTTAATTAGCGGGGGGATGGATTTTTTTTTTCTTAACAATTAGCGGGG
GACGTCTATTCGGGAGACAAGAGTAAGGCGGTTATTTTCAAACGAGCTTT
CTTGCAAAGATTTTCTATATGCGATTCAAACGTCAAGAGATTATCAAAGG
TTTCTCCAAGAATCTTTGACGTTTTTTATCGTCGTTGACAGTTTCCTCTC
TAATATTTAGATAGAGCGAATCGTCAATGATGCTAACTATTAGCTGACAT
TTGTCAGCATTGCCAACCATTTGCATAATTCGCGATCTTAGTGTCTTTAA
TGTTGAAAAAGAGGTCAGAGATATAAATATTGAAAACCAGAGGGCCAAGG
ATGGATCCCTGGGGCTGGGGAACACCATCCTTGATCTTGATCCAGTTACT
CAGTTCGTTGCCTATTTTCTAGATAACTCTTGACTAACCTAGTGGAAAGG
TCACGGAATCCGTATGCATTGATCTTTGCTACAAGTAATTTGTGTCAGAC
ACATGCAATCAAAGGCCTTAGATAAGTTGATGAGCAGTGTCCCAAAAACA
TCTTTCTTGTCATTGGCTAGCTTCCAGAGCTCTTCCATTGGGAGAAGCGA
TGTTTGAGTGGAATATCCTTTCCTAAAACCACATTGTTGTTCATCAAAGT
AGTGTTCAAAGTATTCTGATAAGCTTTAAATTTTTTTTCATGGGGCAAAT
GATAGATAGTGGAAAATATCATTCTTTGCCACAGAAAGTCATGTGACATC
TTTTTCAACCAATAAGATTTAATAATCTCAAGGGTAAAACAAACACTATG
GTTTAACTCACTAAAAGATTATGTTTACTGAAAACACATAATTAATCTTT
AGTAAGTGTTCTGTTGTACCCCAGTTCTGACGTCATGCCGTGGCGAAGAA
TTGTTACAAATTTGTATACCAATACAGAATAACTAGGAAAAAATAAGGAA
TTTAATATACATAAAATCTTATAGAGTTCTAAAAACTGTTTGGAACCTCT
GTATATCAGGTTTAATTTATGGTTTATTCAAGAGTGATTAAAAAGTTTAT
AAAAATAACTTCAAATAGTGCTCCGCAACACATACGTCATAATTATTACT
TTCACTTTTTTTGACATTTGTACTAGTTGCAATCCAATTCAATGCGGTAA
GATACGTGCAAGCTGTTATATACCTTTTGTCAAATGATGCAATTAACGTG
TAAAAGAGATCAACGCAAAGGTTGATGGGATAGGAACTCGTACAAGCACA
TCGAGAGTAATGATTATGTCAAAAATAAAATCTATTTTTAGATTCCAGCG
TGGTGCGTTATTGGGACTTTGTGATTTTTTATAAACAATTTAATTTTTAG
TATTTTTGGCTTTTACCTTGAAAGATTTGATGGTTCCTTCAAAATGATAC
ATCAAGATATTTTTTGTTACAATTTTTTTCGTTATGTTTTAGGGCTTACC
TTTCAAAACAGTTAAATTCATACCGTCTACAGTTGATACTCACCCAACAA
TTTACAATGGATATTTCACTACAGTAGTTGGACAGCTAAAGGTAAATCAG
TGACGAGTTCTTCATAATTTTTATTTTTGAGGGTAACAGTTACTCAAAAT
GTAAAACAATCTTCCATTAAGCCAACCGTATTACTTCAAATAAACTCCCC
CTTCTTTTAAACTCCCTGTCGAGTGTCATGGTGCGCCAGGCCAGTTGAGG
CTGGGCCCACGACAACAATATTTATACTTAAAGTTTTTTCCCGGATATCG
ACCTGACTGCCGTGAGAAGATAGGAGTTGGAGTTCATGGAGTAGATTGAG
GGAGCAGACACAAAGGTTAAGTTAATTTCTATCAATACCTCATGAAATAT
CCAAACATAAAGTGGCATAAACATAAATCCAATAAAGTTCAACATGTTGA
GAGGTCGGGAACGCACTATTGACTGGCCAGCGTCAATTTCAAACAAACTC
TTTACTCTCTCCTCCTGGTACCTGGATCTCTTCTCATGTCGATTAACACG
GTACTCCCGACGGGAGGGCTTGCCTTGTCCAAGGCTTAAGGTGAAGTGTT
TTCTCTCCTAATAAATTCCCTATCTAACGTACTCAATGTGAGCTTCCATT
CAATGGTTACCATGACAACTAATGTAAATATAAAAATGGTGGACCCTGCC
CTCATGACAGCCCCCTCGAATAAACGCTCCTCCTTTAGAGAACAAATTTA
AATAAACACCCCCTCAAATAAATGCTCCTTCGAATAAACGCCACCCTCCT
AGAAGGGCGTTGCAGTAAAGAAGTGTATAATATAGAAAAACTGAGATATA
CAACAATAATTGTATTCCAACTGGTTTTGACCAATTTCACATCTCTAAAT
TGACTCGAAAAATAGAATTAAGGTAAAATAAAGCTTTAAACGCCCCCTCT
AATAAAGGCCTATCATAAAATTCAAAGAATTTATTCAAAGTAATACAGTA
TTCGGCTAAGGCCAAATTAGTTTCTTGCTCTTTCAATCAAGCTGCTAGAA
AAATACTTGGAAATATTCTGAAATTGAAAAAATTTGGTCAGTCCTTTAAA
ATGTCTTTCTAGGGGAAGGGGTGGACGATTTTTTTCGAAATTCAAAAATC
TGCAATTTTAGAAATCTTTCAGACTCCAAATAAGGTATTTTGTGCTGTAA
ATTTGATGACCTATCCTTTGAGATGCTTATGTTGTAGCCATGATTTTAGA
TGCTTTGAAATTTTAGACTTCAAAAGTGTATTCCTCAGAAAATAATTTGA
AAAAAAAATTTAAACTCATCCTGGTTTCATGTAACCCATTTCTCAAAACT
ACAGAAAAGGTGAATTAGCAGATAAAATGCTTAAAATATTGTGCTCAGAA
AGAGACATTAAAAAGCTTCAATACTGTTTTTTCAATACAACATGAATATT
AATTCAAAATGTTAAAAGTAACTGACTGAAAACGAAATCAAGTTTCCGTG
TATGTTAATTAAAGAGATAATGTCTTTTTACTCTGGTGCACTATTCCCAA
ATAGATTTTTTTTAAGTAGGAAGTTCAGTAGGTACTACTTTCAGAAAACT
GTCACTCCTAGGGCCAACCATGGACAAAGGCTCCAAAACAAGTTTGAAAA
GCAAAAAAATAAATATGCAGAAGTTTTGGGCTTGGAAATTTTGTGCAGGA
CCTCAAACAGACTAAAAAGAAAGCTTTTGTTGTAACCTTTTAATTTTTCA
GACTGATGATGATCCACCTCACGGCTTTGCGCAATCATTTCATGTTAAAG
TTGACGGACAAAATCCAATAATATTAAACAGTGTATTTAGGCTAAATATT
CACAATGGATAAACCAAATGATGAGGGACTTGGTGTATTGCTTGTTTTAC
TGGATGGATCAATAAAATCAACTCCCCAGTAATTGGTGGACTGGACTGTT
ACTGTTTCCTAGCTCAATAAGATCTAACTAAAAAATATTTTTCATATTAT
TGTTTATAGTAGTCTTTTATCTTTCTTTTTTTTTACTTATTTCTAAACTC
TTTCTTTGTTGATTCTTTAAACTAGATTTATGAATACATTGCCACTGTTT
TGTTGTTGGATAGTAGCACTGATATTGAAAATCTTCTAGACTAGATTAAC
AAGATATCATTTAGAATAACATAGTATTTTATACAACCAAAAAAATATTA
TTTTAAAAACGATTTTGCTTTGGTTTCAGAGACCACCAAGCAACAATAAT
TTAATATTTTGAGAAGCTTTAAATTGATTATGTCTGTGTGTGGTCCGTGA
GAAGAGGAAATCTTTTATCAATGCTAGAAGCTAGAAAATTAAAAAGAATA
TATTGCTCTTTTTCTACAATTTTCTGAATATTCATTAGTTATTCAATTGC
AATATTTCATACATAGACCACCCATGAGAATTACAACTATAAACTATAAT
ATAGGTCATTGTAAATTACTCGTCTGGCGAGC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000098_pilon:400899..409480-

>MSTRG.12774.1.p1 ID=MSTRG.12774.1.p1|Name=MSTRG.12774.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1512bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000098_pilon:400899..409480- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ACTGATGATGATCCACCTCACGGCTTTGCGCAATCATTTCATGTTAAAGT
TGACGGACAAAATCCAATAATATTAAACAGTGTATTTAGGCTAAATATTC
ACAATGGATAAGGCTTACCTTTCAAAACAGTTAAATTCATACCGTCTACA
GTTGATACTCACCCAACAATTTACAATGGATATTTCACTACAGTAGTTGG
ACAGCTAAAGGATGGCAATTCAATCTTTACATTTGAATCAGATGTACTAC
TTGGACAACAAAATATAATTAAACATTTAATAATGGATTTCGAAGGAGCT
AGCAATAACATGAAAGCATTTTTAACCCATTACTACTCAATGTTTGAGGC
AAATAGAGAAGCTTTAGCCGGATTTTTTACTGATGATGATCCACCTCACG
GCTTTGCGCAATCATTTCATGTTAAAGTTGACGGACAAAATCCAATAATA
TTAAACAGTGTATTTAGGCTAAATATTCACAATGGATAAGGCTTACCTTT
CAAAACAGTTAAATTCATACCGTCTACAGTTGATACTCACCCAACAATTT
ACAATGGATATTTCACTACAGTAGTTGGACAGCTAAAGGATGGCAATTCA
ATCTTTACATTTGAATCAGATGTACTACTTGGACAACAAAATATAATTAA
ACATTTAATAATGGATTTCGAAGGAGCTAGCAATAACATGAAAGCATTTT
TAACCCATTACTACTCAATGTTTGAGGCAAATAGAGAAGCTTTAGCCGGA
TTTTTTACTGATGATGATCCACCTCACGGCTTTGCGCAATCATTTCATGT
TAAAGTTGACGGACAAAATCCAATAATATTAAACAGTGTATTTAGGCTAA
ATATTCACAATGGATAAGGCTTACCTTTCAAAACAGTTAAATTCATACCG
TCTACAGTTGATACTCACCCAACAATTTACAATGGATATTTCACTACAGT
AGTTGGACAGCTAAAGGATGGCAATTCAATCTTTACATTTGAATCAGATG
TACTACTTGGACAACAAAATATAATTAAACATTTAATAATGGATTTCGAA
GGAGCTAGCAATAACATGAAAGCATTTTTAACCCATTACTACTCAATGTT
TGAGGCAAATAGAGAAGCTTTAGCCGGATTTTTTACTGATGATGATCCAC
CTCACGGCTTTGCGCAATCATTTCATGTTAAAGTTGACGGACAAAATCCA
ATAATATTAAACAGTGTATTTAGGCTAAATATTCACAATGGATAAGGCTT
ACCTTTCAAAACAGTTAAATTCATACCGTCTACAGTTGATACTCACCCAA
CAATTTACAATGGATATTTCACTACAGTAGTTGGACAGCTAAAGGATGGC
AATTCAATCTTTACATTTGAATCAGATGTACTACTTGGACAACAAAATAT
AATTAAACATTTAATAATGGATTTCGAAGGAGCTAGCAATAACATGAAAG
CATTTTTAACCCATTACTACTCAATGTTTGAGGCAAATAGAGAAGCTTTA
GCCGGATTTTTT
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12774MSTRG.12774Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12774.1.p1MSTRG.12774.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12774.1.p1.exon4MSTRG.12774.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12774.1.p1.exon3MSTRG.12774.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12774.1.p1.exon2MSTRG.12774.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12774.1.p1.exon1MSTRG.12774.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000098_pilongenomesc0000098_pilon:400899..409480 -