MSTRG.12765.3.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12765.3.p1
Unique NameMSTRG.12765.3.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000098_pilon:284322..304439+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12765.3.p1 ID=MSTRG.12765.3.p1|Name=MSTRG.12765.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=20118bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000098_pilon:284322..304439+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TCGAAAAAGCAGCGAAGAGAGCTCTGTGTGGAAATCAGACTCATGTAAGA GTACTTCCAGTAAATTAGAATTAACATCGAAGGGAGGATAAGAAAAGTAT GCAGTGTactgcaaaatatcaaaaaggtatattatatttttgtcatcctt ttttttttaaatccttttactacatttttaattttcaattttaatccAAT AAATTGGACTCACAATTTGTGTTGGTAATAGATTTGATCAAGAAATAGGT AGGTTAATAAAGTGGAATGAATCGAGATACACAATTAGTTTTCGACATTG ACATTTTATTCAATGTTGATGATTTTGATCTCAGTTTGGTTAGCTATTTA GATTAGGTTGTGCTAATAAGCACAAAAAGGGAATCGATTTATTTTCCTAT GAACTTAATTGCGAAATGggataagaattttttcaaaaaccaaaaattac aGTTCAAAACAATGTTGAAAGTAGACGCTAAAACAGAGtttttattattc ttataaacgCGGTTTCGTAACGGCTAGTTAGTATTTGCATGCCAGAAATA GAATTGGTCACGTGATTAGAGATTCTAAAGCGCTTTAAATGCCGACCAGG TTGTCCCATTGAATGTTTATTTGACAATTTTGTTTAGTCTGTTTCAGTGT TTATATGTTAATGGTTGCCAATAGTAACTAAGAATTAGGGCTTGGGTAAT CAGAACAGGGAAGTCTTAATTTTCCATGTTTTGGGAATCAAAAAGGTTTT CAAGAAAGTAATTTAAGGGAAAGATGGCTGAAGAAGAAGTTGcttacgct ttttttataagaacaaactatataagaacataaggtttcggtAGCCGAAA TCTTAGATCAAGTTAAggatattttaaggctttgggggcTCAAAACAact gttttcttaggaaaatggacaaacaTACTcaagaaatgctgaaaataaga 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GGTTGATAGAAATGCACAATGGCAACAACTTTCTTCTCCTTCAGCATCAG
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AAGGAATATTATGGAGTAGCCAAGCTAAGTATTGTTGCTACAAATAAACT
GTCTGGAACAGACGATACAACTGGATCTACGCCCAGCTTTGTTTACATTC
TGATTGAGCCAGAAGAAGTTAAACCAAGGTTTAATGGAACTGCACCTGCA
ATTTTCTTCACCATTGACGAGGATAGCCCATGTCAATCTTTCCAGcCTTC
CAAGATGAATTCCAGTTATTCTAGCTTGAAAATGAATACCTTTGACTTTG
ATGAAAGCAAATTTACATCGTATATGAGTGAAATTGATGCCGACAAGTTT
GGCATGTTTAAAAGCAATGTGGAAATGAGAAACAACTATACTCAAGGGGC
ATGGTTGAGACGTGCAGCATCTGGAAGTGGACGTTGGTTTTATACGACCA
ATGGTAAAAAGAAGCCATTTGAACAATCGTGGGCAAAAACCAGGAAAGTG
GCAGAGATCTCGAACTTTGCATTATGCTTCGTGCCTGCACCTGATGTTTT
TGGCTTTGTGGAGCTTCTCATTTCTCCAGCATTTATTGTTGGTAAAGGTA
AAGGAAATGATAAAGGACAAGGAAAGGATGGAATCATATATGGTGACCAA
GAATATAAACTGGTTATTAAGATCAGAGATATTAATGATCGTCCAATTAT
CAAGGATCCAAAACTAGATGTCAAAGCATTACCATACAATATGAGTGGAT
TCTCTAACACTGGATTTCAAGTATCTCAATTATTGGAAAAGAGTAGCCGT
GGAAAAAAGAGATCAGTCTTCGCTGATAAGGATGGTGATACACTAGgtAT
TGCTGTTATCTCTGCTAAAAACACTTCATACGGTTCATGGGAATACAAAT
GTGGTGGAGGATCCTGGACACCAATGGACATCCAATACAATCCACCGTTG
AGAAAACTAAATCACACTGTCCTTCTTCTAACACCTACCGACTCGATTCG
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agaaaaatattcagTTACAAGTGTTGGCTTGGGATCAAACCGATAATCAA
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CAGGTTTCGTTTTGAAGATCGACGTTTGTGGAACTTGTGGTGGAGATGGA
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TCAGCTAAAAAATCACGTGACCCCGATGGTGCAAGTTTCGAAACAACTTC
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CACGTTTTGGACGTCCAGTTATTTGACTCCAGCACCACCAGCGCTGGCTC
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AGCAGTTGGGTTACGGACGGTGTGGAAACACCCTCGGATGCTTCTTTCCA
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GGAGTCGTCAAACAATCAGGGGAAATTGAAATGAAGGTTGATAGAAATGC
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GACGAGGATAGCCCATGTCAATCTTTCCAGcCTTCCAAGATGAATTCCAG
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GGACACCAATGGACATCCAATACAATCCACCGTTGAGAAAACTAAATCAC
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GCAAGTTTCGAAACAACTTCTTACAGTTGGCAGATATTGACGAGAGAAGG
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CCAATTCACTGTTGATGCTGGTTCACCACCAGAGCTTGAACTAACTCAAT
TTACTGAGCTTCAAAATCCATCGGAAAGAATGAAAATCTTAGCCAAGACT
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GGGCGGGAACTTTAGACGAGGATACAACTTATGATGTCACAGTTACCGTT
AGCAACAGTGGAGCAACATCTGAATCTGTAACCACATTCATAACAAACTC
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TTTCCACCAAATTTGCTTTAACTGCATTGGAAACGCATGGTTGGTTCGAT
CCCGATGGTGATGAGTTGGTGTATGAATGTGGGGTGATTAAGGACGGTGT
TGAAATTCCTTTACGTCAATTCCAATCCGATAAATCATTCACTGATATCG
TCCTTGAAAAAGGATCACAAGAAATGTACATCAAAAGTTGTGATTCTTAT
GACGCATGCGCGACAGAGACGCTGACGTTGACAGTTGACCCTGTGGTTGT
GGACGATGCGTTTCGTTCATCTGTTGATAATGAACGAATCAAACTTCGTG
ATATGAAACTCTTCTCTGAATCATCTGGTATTGCAAAAACTGGTCTTAAA
GTATTGCTCAGTAGCTTAAACAGTCCATCAAGACGTCGAAGGCGTAGAAG
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CCATCTCCACACAGACTAGTTCCCTAGAGGATCATTTGACCGCTTATGAG
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ATCGCCAGAACTCCCACTCAGATTGAAGCGGGTTTGAAATCATTCGACAA
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CCTATCTCTCATCTGCAACTCGGCAAACACAGCGTATGTGTCTTAGCAAA
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GCTGTGATGATTGCACCACTAAACCTTCTTATGTGGACTTGAGAGAATTG
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TGCTTGTGTTGCTTCATTCCAATATCCAAACGATCTGTATGCATCAAGTT
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AGCACCACCAGCGCTGGCTCGTTAAATGTCACCACTGTCTCTGGTGGAAT
TGATCTCCATATTCACGTTACCAAGGAAACTAATAATACTTATAAATGTT
TACGCTGGCACAACGATTCCAGCAGTTGGGTTACGGACGGTGTGGAAACA
CCCTCGGATGCTTCTTTCCAAAAGAACTCTTTACCATACGTCTTATGTCG
ATTGACCACTATGGCACCTGTTGCTCTATTTGAAGGACCAGAACGTATTG
AACCTACAAGCTCAAGCATCAGTACCATGGCTTTCTCCTCCAGTATTTCA
CCATCAGCAAGCCTCAATAACTCCATGATGTCAACTGCAGTCGTCCCAAC
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CCAACTGTACTGATCAAGCTGTCAAAACAAGCAAAAGCTCAATTCAGCAA
CAAATTGCTGACAAACTGAACATCAGCAAAAATACAATGACCAATTTTAC
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AATAACCTTAATATCACTGTAGCTGGACAAGTCTTATCTGTTAACCAATC
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CCCCGCCCACGGAAGATACAGATGAACTCAGTGGTGGAGCAATAGCTGGT
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TTTCATGTGTTGTAAGAAAAACACCAGGAAAGATAATCAGATTGAACCCA
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TCGCCGTAAatggATGAGACAAAAAGACTAACAAGTTATTTGTTTATATT
CGGAGCACTTTTTGCTCTTGTATTGGCTTCGAATCACAATAAATGGAACG
GATGGAATCCGGAACAACATCCGCATGCTTTCGGATACACTGACCAAGAT
GGAAACTGCCAATGTGGTGGTAGTTCTCGAATGTCTGATATGTCGATGTT
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GCCTCTCAAGCTATGCAGCAAATGAATTCTTGTGCTGAGAATTCCTCATG
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GCATGTCAGCATCAATGTCTGCATCGGCATCAGCAagtatttcatcatca
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CAATGTTGCTGCTTCAAGTATGATTGCAAGCAGTAGTGGTAGCATCTCAC
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CGAAGAGAAAACAAAGATCTGCCAAAATTAGTATTGAACAGACAATCCGT
AGAGATTAGAGCATCACAAAAACTCATATTGAAAGCTAAAGCAAAGCTCC
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CCCGAGGCTCATCATCCCTGCACAATCACTAGCCGGTGGAAGCAGTTATA
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GATGAAGTTAAAATCACTGTCAAAGAAACCCCTTTGGTTGCGAGAATTTC
CGGACGTCAAACTGTTGGCCAAGCAGGAACCATGAAACTTTCAGCTAAAA
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TGGAGCCAGGACAATACAAAGCAACCTTAACTTACCGCGTTGGTAGTTCT
CGTAAAGCAGAATCAGATTTCCAATTCACTGTTGATGCTGGTTCACCACC
AGAGCTTGAACTAACTCAATTTACTGAGCTTCAAAATCCATCGGAAAGAA
TGAAAATCTTAGCCAAGACTAAAAGTCAACTTGCTATTACTGCAGAACCT
GAATGGGTCGTCTCTAATGGTGTTGAAGGTACACGTAAGGGCGGCAAGAG
GCGTAGTTTGTACATAATCGGGGCGGGAACTTTAGACGAGGATACAACTT
ATGATGTCACAGTTACCGTTAGCAACAGTGGAGCAACATCTGAATCTGTA
ACCACATTCATAACAAACTCAAGACCAATCGCAGGTGCAATTTCAATTGA
ACCAACCAATGGAACAGAATTTTCCACCAAATTTGCTTTAACTGCATTGG
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GGGGTGATTAAGGACGGTGTTGAAATTCCTTTACGTCAATTCCAATCCGA
TAAATCATTCACTGATATCGTCCTTGAAAAAGGATCACAAGAAATGTACA
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TTGCAAAAACTGGTCTTAAAGTATTGCTCAGTAGCTTAAACAGTCCATCA
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ATCATTTGACCGCTTATGAGACAGGTCAATATAACTTTGAACAAGATCCA
TCCTCAAGAACATTGTATTTGGATTCACTTGCACAATTTACGACATGTGG
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TGGAAATAATTGAACCTTTGATCGCCAGAACTCCCACTCAGATTGAAGCG
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CCAGCAAGCTGCCAAACAATCCTATCTCTCATCTGCAACTCGGCAAACAC
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AAGTAATTGGACTAAACTTGGCTGTGATGATTGCACCACTAAACCTTCTT
ATGTGGACTTGAGAGAATTGAAAACACAATTCAGTAATGATTATACGTGT
GGTGATGAACAATGTTCTGGTGCTTGTGTTGCTTCATTCCAATATCCAAA
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ACCACTGTCTCTGGTGGAATTGATCTCCATATTCACGTTACCAAGGAAAC
TAATAATACTTATAAATGTTTACGCTGGCACAACGATTCCAGCAGTTGGG
TTACGGACGGTGTGGAAACACCCTCGGATGCTTCTTTCCAAAAGAACTCT
TTACCATACGTCTTATGTCGATTGACCACTATGGCACCTGTTGCTCTATT
TGAAGGACCAGAACGTATTGAACCTACAAGCTCAAGCATCAGTACCATGG
CTTTCTCCTCCAGTATTTCACCATCAGCAAGCCTCAATAACTCCATGATG
TCAACTGCAGTCGTCCCAACACTCTCGCCACAAAACTACCCACGTGCTGT
ACAATTTTCGTTCCCATTCTCCAACTGTACTGATCAAGCTGTCAAAACAA
GCAAAAGCTCAATTCAGCAACAAATTGCTGACAAACTGAACATCAGCAAA
AATACAATGACCAATTTTACAGTGTCATGCGGTAGTATCGTGATCTACTA
CATTCAAACACACGACAGCAGTATAACCGCCCAGCAAGCAGTCACCCTCC
TGCAAAACGCCATCACTCAAAATAACCTTAATATCACTGTAGCTGGACAA
GTCTTATCTGTTAACCAATCTTCATTGATGGTAACAATCCAAACGCCCAA
TTATGCTATTACAACAACCGCCCCGCCCACGGAAGATACAGATGAACTCA
GTGGTGGAGCAATAGCTGGTATTGTtattggagttttgatattcaTCATC
ATTGTAGCCGTTGTGGTTTATTTCATGTGTTGTAAGAAAAACACCAGGAA
AGATAATCAGATTGAACCCAATGAAAATGACGTCGAATTAAGAGgAAAAT
CGAATCGCGCTTATCAAGGATCGCCGTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12765MSTRG.12765Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12765.3.p1MSTRG.12765.3.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12765.3.p1.exon1MSTRG.12765.3.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.12765.3.p1.exon3MSTRG.12765.3.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12765.3.p1.exon4MSTRG.12765.3.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.12765.3.p1.exon10MSTRG.12765.3.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12765.3.p1.exon11MSTRG.12765.3.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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