MSTRG.12732.18.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.12732.18.p1
Unique NameMSTRG.12732.18.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000097_pilon:926674..977493-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.12732.18.p1 ID=MSTRG.12732.18.p1|Name=MSTRG.12732.18.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=50820bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000097_pilon:926674..977493- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTCGGATTAAACTTTATCTTGTTTTTAATACACATCACATTGAATCTTTT CTCTTAGGACAATAGAAAAATAAATGTATATAGCTGGGGAATGATGTTGT TGAAAACCTTTTCAACTTTACTAATACTTGTATTATGCACTTCTTACATT GTTGCTAAAGGTGAGTTGATCATAGAATGGGTTGTCGTGTAAAGTAAACA AAGATTCCCTGAAAATTGACAAAGCTGATGTTTGAAAAAAACTTCTATAT ATTATTACGTTAAACATGCGTGTTCAACATTTAGTAAAAAGTTTTTGAAA ATATAAGAAATCTCTACAAAGCCTCCTCTACATGGCCTTGAACCATTATC TTTCTGCATCTAGGCTGATTCTGTACCACTAGACTAATTTTGGGTTGCAC GTATACAACTTTCTATCCAAGAAATTTCTTTTTATTCCATTTTATAGTTG CACCCAGCCACAAGAAGGATAGTCATGAGAAGTTAGCAAAAGGAATTCAC GAGAATGGCAAAAAGAAGTCTTATGCCTCTCATGTTATGTCCGCAGGAAG TGTGTATCCCCTTCATGGTGAGCACGAGTCATATTACCCAGACTTCAATT TTCATCACAAAACTCATGATATTCCAAATGAGAATGAGTTGAGCCTCATG ATAACTGGGCATAAACCAAAAAAAGCAAATGGAGTCAGTCTTGTAAACAT TGCCAAAGAAGCAGCCACCAAGGCTCTTAATGGAAAGGTTATTCCAAACG ATGATGCAGACAAGTTAGGTATGATTTTTTGCTTCCAAAACAAAAAGGTT TTACTCTCAAAAGTTTTCACAACTTTTCTTTATTTGAAACTTAGAAATCT TTATATAAAACAAAGTTCTTTGAGTTAAAACAAACATTATACCTATTTGA AAGAAAATCTTTTTCTCACCAAAGTCTTGTCAATGTTTTAAAGAAGTAAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000097_pilon:926674..977493-

>MSTRG.12732.18.p1 ID=MSTRG.12732.18.p1|Name=MSTRG.12732.18.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=24840bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000097_pilon:926674..977493- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CAAGGTGGTAGCAGTGCTGCTAGTGGTTCAAGCAGCGCAAGTAGTAGTTC
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GGCATGTCAGGTTATGGTATCGAGAACATTAACCAACACGTCGAGAATCT
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TTACGCTGCAGCTATTTACCACGACAATGGGTTGCTGCAGTTCGATTTCG
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ATACCGTGCTGGCATGTCAGGTTATGGTATCGAGAACATTAACCAACACG
TCGAGAATCTTGAGGATGACGTTCAACCAGTAATGGTGCACCATGGCCAT
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TTATCCAACTTATGAGATCCCTGTGCATGGAGATGTCGTCTCTGAGAAAG
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TCATGGAGGTCATCATGGGCATCATCTTGATGGCTGTTGATGTGCATTGT
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GGCCACCATGTCGGTGGTATTGGTTTATCTGAAGGAGAACTGACTGGGCA
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GGAATGGGAACTGATGGTGATTTTGCAGTCCACCATGGAGGTATTCACCA
TGGTCTCTCTACATTGTAAAATACTTCTTGGAACAGAAGAATGAGCCACG
TGTTGGACAGTTCTGGCGATACATCAATATGACCATCGTCATCACCGACA
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GGCATCATTGTTCATGCTGTTGGATGGGCTGATGAGAAGGTCGAATGCAC
AATTCAACGCTGGGGTTTCAAGTATCAAAGAAACTGCTGGCAAAGAATCT
GACTCGGGTGCTGCCATGAAAACTGCTCTTATGAATCTGGTCTTTGTTGT
CGATATGAAAGAACCAAACCCTAAAGAAGAGAGTGGGCGTTTAGTGTACA
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GGTAACCATGTCGGTCTGGTTGGTTATGGATATGATGAAGCCAAAAAAGA
AGGCTGGGATCTAGAAAAGTTTGGATTACAAGGACAGCAAAGCTGATAAA
TCGCAAATGGAGAAGGTAGCCACTAAAGATCAAGAGGATAAGAACGATTA
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TGTCCTTATTGTGATCACTGACTCAAGTGCAGAAGATGATGTTGAAAAGC
CAGCTCAAGCTCTCCGTGATGGTTCTGTCAACATTTTCGCCATTGAACTT
ACGATTCGGCCGGCGTGAAGAACGAATTGAGTCGTATTCAACTCCCTGGT
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CTTTGATCGAACAACTCGCGATTGGGTGTACAAGGTGGTAGCAGTGCTGC
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CTGGAGGCTTCGCTGCCGGTGGTGGTGGTGGTTTTGGTGGAGGCGGTGGC
TTCGGAGGAGGCGGCGGAGGTGGTGGTGGAGGCTGTATGGTGCCTGCTGA
TGTCGCTTTCCTCTTTGATGCGTCGAAACTGGGTGATAAAAAAGAAGAAT
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GTTGCTGCAGTTCGATTTCGAAAAGACTTTTCGATAAAGCCTACTTGAAG
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CATGACGATGCTTATGTACAAGGTTTAACACATGGTCATGATTTGGCAGG
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CACCATGGAGGTATTCACCATGGTCTCTCTACATTGTAAAATACTTCTTG
GAACAGAAGAATGAGCCACGTGTTGGACAGTTCTGGCGATACATCAATAT
GACCATCGTCATCACCGACAAAGCATTGGATGGATCGTATGAAGATGAAT
CGAAGAAATTGAGAGATCATGGCATCATTGTTCATGCTGTTGGATGGGCT
GATGAGAAGGTCGAATGCACAATTCAACGCTGGGGTTTCAAGTATCAAAG
AAACTGCTGGCAAAGAATCTGACTCGGGTGCTGCCATGAAAACTGCTCTT
ATGAATCTGGTCTTTGTTGTCGATATGAAAGAACCAAACCCTAAAGAAGA
GAGTGGGCGTTTAGTGTACATTCAGAACTTCCTCAAAAGTACAGTTGCCG
GACTCGGTATTTCGGAAATGGGTAACCATGTCGGTCTGGTTGGTTATGGA
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AGGACAGCAAAGCTGATAAATCGCAAATGGAGAAGGTAGCCACTAAAGAT
CAAGAGGATAAGAACGATTATCACGTGTTCGAAGTGGAGCTCGAAAACTT
GTTAGGTGCTCAAGGACCTGTCAAGCATCCCAAAGTATTGGCTAGAGTGA
TCCCTGATCATATTTGCCGATGTCCTTATTGTGATCACTGACTCAAGTGC
AGAAGATGATGTTGAAAAGCCAGCTCAAGCTCTCCGTGATGGTTCTGTCA
ACATTTTCGCCATTGAACTTACGATTCGGCCGGCGTGAAGAACGAATTGA
GTCGTATTCAACTCCCTGGTACAAAAGGAAAGAAAATGGGTGAAGGATTG
AAAGTGGTTAAAGAACAAATCTTTGATCGAACAACTCGCGATTGGGTGTA
CAAGGTGGTAGCAGTGCTGCTAGTGGTTCAAGCAGCGCAAGTAGTAGTTC
CAGTTGGTCCTCTGGTGGTGCTGGAGGCTTCGCTGCCGGTGGTGGTGGTG
GTTTTGGTGGAGGCGGTGGCTTCGGAGGAGGCGGCGGAGGTGGTGGTGGA
GGCTGTATGGTGCCTGCTGATGTCGCTTTCCTCTTTGATGCGTCGAAACT
GGGTGATAAAAAAGAAGAATACTTCCAAAGATATATCGCCTTTGCTAAAC
AAGTTGTTGACTTCCATCCACCAAGTCTCGAAGGATACCATTACGCTGCA
GCTATTTACCACGACAATGGGTTGCTGCAGTTCGATTTCGAAAAGACTTT
TCGATAAAGCCTACTTGAAGAAACTCGGAGTTTGGGAAGAATACCGTGCT
GGCATGTCAGGTTATGGTATCGAGAACATTAACCAACACGTCGAGAATCT
TGAGGATGACGTTCAACCAGTAATGGTGCACCATGGCCATGGTCATCACC
ACGCCCATAATCATGATTTCGAACCAAACTTCAAATTCCATTATCCAACT
TATGAGATCCCTGTGCATGGAGATGTCGTCTCTGAGAAAGATGCCAAGAA
AATTGCTTGCAGTTGACCATCATGACGATGCTTATGTACAAGGTTTAACA
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TGGAGGAGGCGTGGGCGTTCATGGCGGTTATGGTGGTGTAGATGTGGCAG
GTCTCGGTGGATATGTCGGTACTGGTCACCATTTCCATCATCATGGAGGT
CATCATGGGCATCATCTTGATGGCTGTTGATGTGCATTGTAACAATGGTG
CGGCAGCTGTTGGAGGTTATAGCCATGGCATTGCTGGTGATAATCTTGCC
AGCTATCTTGGAGGTGCTCTTGGAGGCAATGGACACGGTCATGCTGGTGA
TCTCGGATATGGAGATCTGGGACATGGTTTAGTTGATGCTGGCCACCATG
TCGGTGGTATTGGTTTATCTGAAGGAGAACTGACTGGGCATTCTGATCTA
CTAAATGGTCTTGGTGGTGTTAATGGATTGTTGAGTGAACAAGGAGTTGC
CAAGGAACATGCAGATAGCGTCGGTATCCCTTTTAGTGCTGGAATGGGAA
CTGATGGTGATTTTGCAGTCCACCATGGAGGTATTCACCATGGTCTCTCT
ACATTGTAAAATACTTCTTGGAACAGAAGAATGAGCCACGTGTTGGACAG
TTCTGGCGATACATCAATATGACCATCGTCATCACCGACAAAGCATTGGA
TGGATCGTATGAAGATGAATCGAAGAAATTGAGAGATCATGGCATCATTG
TTCATGCTGTTGGATGGGCTGATGAGAAGGTCGAATGCACAATTCAACGC
TGGGGTTTCAAGTATCAAAGAAACTGCTGGCAAAGAATCTGACTCGGGTG
CTGCCATGAAAACTGCTCTTATGAATCTGGTCTTTGTTGTCGATATGAAA
GAACCAAACCCTAAAGAAGAGAGTGGGCGTTTAGTGTACATTCAGAACTT
CCTCAAAAGTACAGTTGCCGGACTCGGTATTTCGGAAATGGGTAACCATG
TCGGTCTGGTTGGTTATGGATATGATGAAGCCAAAAAAGAAGGCTGGGAT
CTAGAAAAGTTTGGATTACAAGGACAGCAAAGCTGATAAATCGCAAATGG
AGAAGGTAGCCACTAAAGATCAAGAGGATAAGAACGATTATCACGTGTTC
GAAGTGGAGCTCGAAAACTTGTTAGGTGCTCAAGGACCTGTCAAGCATCC
CAAAGTATTGGCTAGAGTGATCCCTGATCATATTTGCCGATGTCCTTATT
GTGATCACTGACTCAAGTGCAGAAGATGATGTTGAAAAGCCAGCTCAAGC
TCTCCGTGATGGTTCTGTCAACATTTTCGCCATTGAACTTACGATTCGGC
CGGCGTGAAGAACGAATTGAGTCGTATTCAACTCCCTGGTACAAAAGGAA
AGAAAATGGGTGAAGGATTGAAAGTGGTTAAAGAACAAATCTTTGATCGA
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AGCAGCGCAAGTAGTAGTTCCAGTTGGTCCTCTGGTGGTGCTGGAGGCTT
CGCTGCCGGTGGTGGTGGTGGTTTTGGTGGAGGCGGTGGCTTCGGAGGAG
GCGGCGGAGGTGGTGGTGGAGGCTGTATGGTGCCTGCTGATGTCGCTTTC
CTCTTTGATGCGTCGAAACTGGGTGATAAAAAAGAAGAATACTTCCAAAG
ATATATCGCCTTTGCTAAACAAGTTGTTGACTTCCATCCACCAAGTCTCG
AAGGATACCATTACGCTGCAGCTATTTACCACGACAATGGGTTGCTGCAG
TTCGATTTCGAAAAGACTTTTCGATAAAGCCTACTTGAAGAAACTCGGAG
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TCAAATTCCATTATCCAACTTATGAGATCCCTGTGCATGGAGATGTCGTC
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TGGTGGTGTAGATGTGGCAGGTCTCGGTGGATATGTCGGTACTGGTCACC
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TGACTGGGCATTCTGATCTACTAAATGGTCTTGGTGGTGTTAATGGATTG
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GAGAGATCATGGCATCATTGTTCATGCTGTTGGATGGGCTGATGAGAAGG
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TTAGTGTACATTCAGAACTTCCTCAAAAGTACAGTTGCCGGACTCGGTAT
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GTTGAAAAGCCAGCTCAAGCTCTCCGTGATGGTTCTGTCAACATTTTCGC
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12732MSTRG.12732Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12732.18.p1.exon22MSTRG.12732.18.p1.exon22Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.12732.18.p1.exon20MSTRG.12732.18.p1.exon20Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.18.p1.exon19MSTRG.12732.18.p1.exon19Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.18.p1.exon18MSTRG.12732.18.p1.exon18Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.18.p1.exon17MSTRG.12732.18.p1.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.18.p1.exon16MSTRG.12732.18.p1.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.18.p1.exon15MSTRG.12732.18.p1.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.18.p1.exon14MSTRG.12732.18.p1.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.18.p1.exon13MSTRG.12732.18.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.12732.18.p1.exon8MSTRG.12732.18.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.12732.18.p1.exon6MSTRG.12732.18.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.18.p1.exon5MSTRG.12732.18.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.12732.18.p1.exon4MSTRG.12732.18.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.12732.18.p1.exon1MSTRG.12732.18.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.12732.18.p1MSTRG.12732.18.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000097_pilongenomesc0000097_pilon:926674..977493 -