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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000097_pilon:575762..586691+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12715.4.p1 ID=MSTRG.12715.4.p1|Name=MSTRG.12715.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10930bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000097_pilon:575762..586691+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ccaggctaataGTATGGTGGAAATAGACAAGGTATGTCAGCATTACACAA
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GTTTAATGCTTTATTCGTGAAAAGTATATTGATTAGCCGAATCAGGTCTG
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ATGAACAGTGAAGATTACTgtttaaagtctgttcacgataagtgtgcact
cttttctcctttacctataacttttgaaggcattcttcaatctttataaa
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GCTCTTACTCCATAGCCCTGATCAGAATAAAATTCATGTCTAGTTAATAT
TTCAAGCTTATTTTTaagggttttgttttgttggacctaccccggagGTC
CTTTAGATTAACTggatgttcgttcgttcgttcgttcgcttTTTGGACTT
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tttttggacctacctccgggtagcCCGGTGGTTCTccagattggctcatt
agttttttctgattttttgcacaaagatgcaaaattgcaatggccaaaat
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CATCACGTTTAAGTGCGCCTAACTCCTTTTTCCCTCTCTTTCATTCAAAT
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ACTGACCCATAGCTGGTGGGtggttttttttctcaaaataaatttgaatt
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AGCACAGTGTGCTAAAAATAAAGGGTGGTGTTCTGAAttgatgaacaaaa
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GAATTTGGTCCAAGGAGGGGTAGGGTCACTCAAGTAAAACGGGACTTTCT
TATGTATACCTTCTGTAATGGCCTTTTGATTGATAGCAAGATAATAACAT
ACTAAAAATGCGAATTTGATTATCTATTACAGTGTGCCATGCTGAGATGA
ATGCAATCATGAACAAAAATTCTGCTTCTGTCAAGAATTGTACCATATAT
GTAGCTCTTTTTCCTTGCAATGAATGTGCAAAGCTCATTGTCCAATCTGG
AATCAAGGAAGTTGTTTATTACTCAGCAAAAAATGGTGAATCTATGGAAG
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GTGAAGTGTgtgatgcatagccctcttttggcgtcaatgcaatgtcttct
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TACTGTACCATTTCTATTCTTAAGACTTATTTTTGGTCAATTCTTTtgga
attcaaaattgaaattatcatTCAAAGGTTTTAATTTGAGCCTCAATTTT
AGGACAATTACATATTATTATCAATTCTTTTGAGAATAATTGAGAAGTTT
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agaaaaattagtGATCGATTTTTCTGTcatcaataaaaacaaatctcAAC
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TATTGTATTCTATTTGATTCTTGAAAAGAAGTATATGGACTCAAAatcgg
ggggggggtggaggtaGTTAAGCAAATGGAGGGTGTGGGTATGTACCCTT
TAGGGTACTTTTTTGAAAGTCCCAccaagggttggaaaaatcaaaaaatc
aaatttgaaataaaaaataggaaaatttcaactttttgcccccggaatca
tcaaaatttggtcaaatttgtcccaataaaGGGTCTCctttttttcctcc
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cgtcagctcgcaaccctagtacccctaCGGGActcaaaaagtcttttttt
ttgacatttttaaagttttatattGTCATTAATTAGTGTATAAATTAGTG
GAATGTAAATAAAGTTTGTTGTAATTCGAT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000097_pilon:575762..586691+ >MSTRG.12715.4.p1 ID=MSTRG.12715.4.p1|Name=MSTRG.12715.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=618bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000097_pilon:575762..586691+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAATGCAATCATGAACAAAAACTCTGCTTCTGTCAAGAATTGTACCAT
ATATGTAGCTCTTTTTCCTTGCAATGAGTGTGCAAAGCTCATTGTCCAAT
CTGGAATCAAGGAAGTTGTTTATTACTCAGCAAAAAATGGTGAATCTATG
GAAGCTAAAGCATCCCGAAGAATGTTTGAATTGGCTGGGATTAAGTACAG
GCAGCATATtcctaaagaagaaaaattagtGATCGATTTTTCTGTcatca
ataaaaacaaatctcAACCAACTGGCATGAAGGCTTCAGCTACAGCTATG
AGGAGATGAATGAATGCAATCATGAACAAAAACTCTGCTTCTGTCAAGAA
TTGTACCATATATGTAGCTCTTTTTCCTTGCAATGAGTGTGCAAAGCTCA
TTGTCCAATCTGGAATCAAGGAAGTTGTTTATTACTCAGCAAAAAATGGT
GAATCTATGGAAGCTAAAGCATCCCGAAGAATGTTTGAATTGGCTGGGAT
TAAGTACAGGCAGCATATtcctaaagaagaaaaattagtGATCGATTTTT
CTGTcatcaataaaaacaaatctcAACCAACTGGCATGAAGGCTTCAGCT
ACAGCTATGAGGAGATGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000097_pilon | genome | sc0000097_pilon:575762..586691 + |
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