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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000097_pilon:370808..374945- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.12703.1.p1 ID=MSTRG.12703.1.p1|Name=MSTRG.12703.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4138bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000097_pilon:370808..374945- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGATATCAGTATGGTGCAGACAAAAATACAGTTTGTCTAGACTTTGGATG
TAGTATTTTGTGTGAGAAGCAGTGCTCCTTTCCCAAAGTCTAAAGCAAGT
TTTCTTGGTATTTGTAGCTACTGTATTATCAAAATGTTCAGGTTTTTATT
GTTTATGGTATTTCTCGTCAGTGCTTCTTGTAAGTTCAAATACAGACTCG
ATTATTTTGAAATTTCATACAATTTTGTACGATCTGTGAAACAATGAAAA
ACAAGAATTGAATCATTTTCGATTTTTGGCTTGGACATACCTGGCGAATG
TGACGATCGGACCTGGTTGTTCAGTTAAAACATTCAAAACTGCGTGCCCT
TTTGAAAACGAAAGTGAAAGCGATTGGGTTCTCTAATGTTTATGTTTGTG
ATTGGCTTTTGATTTTGGTATAATTGTTTTGCTTTAACCAATCGCCGCGC
TCAAAACCTCATTTAATATTCATCTCAAATCTGAATTAAAAAGATCAACG
CGGTGCGCCGACTTATCTGGTACTCGATGTAGAAATTTTCTTCCGACACG
CTAAAGCTCTGAAGGTCGGGAAAATTTTAACTGGTACTCGATGTGGAAAT
TTTCTTCCGACACGCTAAAGCTCTGAAGGTCGGGAAAATTTTAACATCTG
GAACCTTTGGGTTACCATTTTTCATTTTTCTGTAAGGTTTCTCAGGCAGC
AGAGATTTTCATGCTAAATTCAGTCGGGTGCAACTGCTGGTCAAGCAAAA
AGTGTAAGGACAGCTAGACACGACTGTGATGCGGTACATCAAACGATGAC
TACTATAGGTCTCCGATGGTGATATTGGCCCGCTCCTTCAGAGCTTTAGC
GTGGGCGGCCGCCAATACACCATCGGAATATCAGATAATGCGCCGACCTG
AGCAATTTGTCTTACGGAGCCATGGCCTTAAAAATAAAATATGTGCTGCG
CCAGAAGAATCATTGTCTGTGCACAGACCCAGTATCTACATCTAATTTCA
AAATTCATTGCTGTAGAGAGTTTGTTGTCACTGTTTTTTTTTCGTTTGAG
ATTTTTCAAACCGACCGCTGCGATGGAGTGTTGATGAGAGAGGGGAGACG
ACGAAAAAGTGTTGCTATTTATAACACAGAGGTTTTCGTACGGAAATTTT
TTGTCAAACAGACAATGCGCACAGAGTGTACTACGAAGCGATAAACGTGA
GATACAGTCTGGTACAGAGTAGAGTAATCAGAATCTGTTCGAAGATTAGG
TTTTTGCCTGTCCTTTTGAAAATAAGATTACGTAACGTGATCTGGAAAAT
ATTATGTCATATTTCTTATTGATACAGATCGTGTGTACGGCTATGTTTCC
AAAAGTTCGCTTCACATTTAATTCAAACACATCAAATTGTCAAAAGTTCG
GATAGTGGAGGTGTGGCACAGTAATTCAAAAACAAGATGAAAGCCAAGAT
GGCTGTGATCATGAACTACACGTTTTTCATATAAGAACATCCAAAAGTTT
TGAAGCCTCCGGATGTTCTTAACCTTTTGAGTTTTAAGTCTGAAAATGTT
CTTAACATGTTCTTATTTTTACCATTTTTCGAGCTTTTTTGCCCCTTTTC
CAAAGAAATCGGATGCTTTAGAGTCCATAAAGCCTTAAAATGTTCTTAAC
TTGTTCTAAAAATTTTGGCCATCGAAGCCTTATGCTCTTATAAGAAGAAC
GTGTACTTTTTCTGTTGAAATTTTTTCTGTCAACTTATTCTTTTGAATGC
ATTTTTGAACTAATTCTTTCTTTTCTTAGATGCACAAGGTCAATGCGGAG
TGTCAGACAAAGTTCGTCGAAAACGAATTGTTGATGGAAGTGATGCTACA
CCTGGCGCTTGGCCCTGGATTGTCTCCATTAAACGGCATGGCCTTCATCA
GTGCGGTGGCACTATTTTGTCAAAAACAAAGGTGTGTTCGGTGTTCATAA
AACTATTTAAAGAAAAACTTTTCAATAAACTCCCTGGACTATGCTAAGAC
AAGTCATTATATAATTAATAAGCCCAAAGTCGAAGAAAAGTCGTAAAGAG
TTCCGAAAAGGTTTGAGGTTCTCCTTTGAGACTCTACCACCGATTTTTAA
CGTATACCACCTTCACGGCTGTAAACTCTGCGCAAATATCTGTTCTTGCC
TTTGTTATCCCTGTAACGGACGATAACACCATCTATAAATGCCATCTTCG
AATAAACGCCCCCGCCCCCTCTAGGCATTTTTACATCTCTAAAAAGATAA
AGAAAATGTAAAACAACGTTCCCTTTTCACGTTTACTTTAAGTTACCTTC
GTTAAAGAATATTTAATAAATGCCCCCTTTTTTTAAACGCTCTCCTCGAA
TAAACACCCCCGAAATCCAGGGCGTTTTATTCTAAGTAATGCGGTAATTT
GATTATTTTTGCACACATTAATCCAAGTGAAACGGTAAAAAAGCGCCGTC
TTTATTTCCAAAAAAAAGTTTTTGCCCTTTTTTATACCGGCCATTAATCC
ACCCCCATCCGAAAAATAATGCCAATGAGGGTCTGTGAGGAAAAAGATCT
CCTAATTTTCCAACCACCTATCATGGAGTAAAGTATGCTAAAAATATTGA
ACCTTCGTGAAATGAAGGTCATTAATGGAAAAAGGATGTAGCGAATCATA
ATCCAGTTCCGAAATTCGAACAGAAATTTAATCGGGTAATTACTGACCCA
AATCAAAACTTTTTTTCCATAGATTTTGACAGCAGCTCATTGTTTCGACC
CAGACGAAGTGATGGAGGGCGTGACTATTCCTGTTGGACCTGAGGATTTT
AAGGTAATCGCTGGTGCGCACGACATTGATAAAGAAGAAAAGGACCAACA
AGTAATGAAAGTTAAAAAGTTTGCCTTGCACCCAGAATACAATAAAAACA
ATGTCAATTCTCCTGACCTTGCTATAATTGAATTATCGGGAGAATTAACA
TTTAATGAAAGAGTGAATGCAGCTTGTCTACCAAAGAAAGATACTCGTCC
AGATGAAGGAACAAATTGTTATATTCTTGGTAAGGATTCTACCAGGGGGT
TACTCGGCCAATAATTCTTTTAGCCGTAATGGTATATTTATAAATCTTAA
ATAATAAATCTGCCATATTGAATTTCCATTTTAAATCTCAGAAATAATTT
TGTTTTCACGTCATTTTCCAGCCATCTTGAATTTTAATTCTCAAAATTAC
CCTTCGGGCCAAACTATGGTTGACCCTAGCGGTGTCACTAAAGGCTGATC
TCCACTTGCGCGCGCTTCGATCGCACTTTTTCGAGCAAAGCTTCCACGCT
ATTGGTCAAAAGAAAAATGAAGCAACTCCGTTGGCGCGATCTGACGTAAC
GGTTGAAAAAAGTTGAAGTGTGTTGAACTTTTTTTTCGAGCGCGCTACAT
TTTTATGGAGTAATTTTTTTTCCAAGCAAAAAGGATTGAAGCCAAAAAGT
GCGATCGAAGCGCGCGCAACTGTAGAGCTCAATAAGGAATACTACCCACT
AAAATGTAAAAGCCAGAGTAAAGTCTTGAAATGTAATGCCATTCTTTTGA
CAGGCTGGGGACATACCAAGCTAGATGCATTAAGAGGTGCTGAGAAATTA
CAAGAAGCTGAAGTCCCTGTCAAGAAATATCTCAAAGACGTTGATCAAAT
CCATGTAGGATTTCCTGATAAAAAAGATGGAAATGGCGCCGCATGCAAAA
ATGATTCTGGAGGTCCATTGATGTGCAAAAACAAAGAAAAAAAGTGGGTT
GTTGAAGGTGCTCTGAATTGGGGTAATTGTCAAGATAACAGCGTTTACAC
ACCGGTGGCTAAGTACGTGGACTGGATAGAGAAAAATATCTAAATCATTT
GATTAGAAACTCATTATGTGAATAAAATAAAAATTTGTTTGAAATTTCGT
TACAAGTTATTTAGACTTTACGAAAATTCACCGTTCAACGAAACTTTTCA
CAAGAAGAATTTGATGATTTCTATCAGTTTTGAAAAAAAGCGTCCAAAGA
ACTTAAATAATGTTTCTTGCGCTAAGTAATTTTGACTCAAGATTTATTCC
AGTATCTTGCATATCAATTTTTGGAAAATTTTTGTTTCAGTTTTATCCTC
TTATGTTATATTTTCAACAAAAGACATTTTTATTAAAC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000097_pilon:370808..374945- >MSTRG.12703.1.p1 ID=MSTRG.12703.1.p1|Name=MSTRG.12703.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3180bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000097_pilon:370808..374945- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GCTGGGGACATACCAAGCTAGATGCATTAAGAGGTGCTGAGAAATTACAA
GAAGCTGAAGTCCCTGTCAAGAAATATCTCAAAGACGTTGATCAAATCCA
TGTAGGATTTCCTGATAAAAAAGATGGAAATGGCGCCGCATGCAAAAATG
ATTCTGGAGGTCCATTGATGTGCAAAAACAAAGAAAAAAAGTGGGTTGTT
GAAGGTGCTCTGAATTGGGGTAATTGTCAAGATAACAGCGTTTACACACC
GGTGGCTAAGTACGTGGACTGGATAGAGAAAAATATCTAAATTTTGACAG
CAGCTCATTGTTTCGACCCAGACGAAGTGATGGAGGGCGTGACTATTCCT
GTTGGACCTGAGGATTTTAAGGTAATCGCTGGTGCGCACGACATTGATAA
AGAAGAAAAGGACCAACAAGTAATGAAAGTTAAAAAGTTTGCCTTGCACC
CAGAATACAATAAAAACAATGTCAATTCTCCTGACCTTGCTATAATTGAA
TTATCGGGAGAATTAACATTTAATGAAAGAGTGAATGCAGCTTGTCTACC
AAAGAAAGATACTCGTCCAGATGAAGGAACAAATTGTTATATTCTTGATG
CACAAGGTCAATGCGGAGTGTCAGACAAAGTTCGTCGAAAACGAATTGTT
GATGGAAGTGATGCTACACCTGGCGCTTGGCCCTGGATTGTCTCCATTAA
ACGGCATGGCCTTCATCAGTGCGGTGGCACTATTTTGTCAAAAACAAAGA
TGTTCAGGTTTTTATTGTTTATGGTATTTCTCGTCAGTGCTTCTTGCTGG
GGACATACCAAGCTAGATGCATTAAGAGGTGCTGAGAAATTACAAGAAGC
TGAAGTCCCTGTCAAGAAATATCTCAAAGACGTTGATCAAATCCATGTAG
GATTTCCTGATAAAAAAGATGGAAATGGCGCCGCATGCAAAAATGATTCT
GGAGGTCCATTGATGTGCAAAAACAAAGAAAAAAAGTGGGTTGTTGAAGG
TGCTCTGAATTGGGGTAATTGTCAAGATAACAGCGTTTACACACCGGTGG
CTAAGTACGTGGACTGGATAGAGAAAAATATCTAAATTTTGACAGCAGCT
CATTGTTTCGACCCAGACGAAGTGATGGAGGGCGTGACTATTCCTGTTGG
ACCTGAGGATTTTAAGGTAATCGCTGGTGCGCACGACATTGATAAAGAAG
AAAAGGACCAACAAGTAATGAAAGTTAAAAAGTTTGCCTTGCACCCAGAA
TACAATAAAAACAATGTCAATTCTCCTGACCTTGCTATAATTGAATTATC
GGGAGAATTAACATTTAATGAAAGAGTGAATGCAGCTTGTCTACCAAAGA
AAGATACTCGTCCAGATGAAGGAACAAATTGTTATATTCTTGATGCACAA
GGTCAATGCGGAGTGTCAGACAAAGTTCGTCGAAAACGAATTGTTGATGG
AAGTGATGCTACACCTGGCGCTTGGCCCTGGATTGTCTCCATTAAACGGC
ATGGCCTTCATCAGTGCGGTGGCACTATTTTGTCAAAAACAAAGATGTTC
AGGTTTTTATTGTTTATGGTATTTCTCGTCAGTGCTTCTTGCTGGGGACA
TACCAAGCTAGATGCATTAAGAGGTGCTGAGAAATTACAAGAAGCTGAAG
TCCCTGTCAAGAAATATCTCAAAGACGTTGATCAAATCCATGTAGGATTT
CCTGATAAAAAAGATGGAAATGGCGCCGCATGCAAAAATGATTCTGGAGG
TCCATTGATGTGCAAAAACAAAGAAAAAAAGTGGGTTGTTGAAGGTGCTC
TGAATTGGGGTAATTGTCAAGATAACAGCGTTTACACACCGGTGGCTAAG
TACGTGGACTGGATAGAGAAAAATATCTAAATTTTGACAGCAGCTCATTG
TTTCGACCCAGACGAAGTGATGGAGGGCGTGACTATTCCTGTTGGACCTG
AGGATTTTAAGGTAATCGCTGGTGCGCACGACATTGATAAAGAAGAAAAG
GACCAACAAGTAATGAAAGTTAAAAAGTTTGCCTTGCACCCAGAATACAA
TAAAAACAATGTCAATTCTCCTGACCTTGCTATAATTGAATTATCGGGAG
AATTAACATTTAATGAAAGAGTGAATGCAGCTTGTCTACCAAAGAAAGAT
ACTCGTCCAGATGAAGGAACAAATTGTTATATTCTTGATGCACAAGGTCA
ATGCGGAGTGTCAGACAAAGTTCGTCGAAAACGAATTGTTGATGGAAGTG
ATGCTACACCTGGCGCTTGGCCCTGGATTGTCTCCATTAAACGGCATGGC
CTTCATCAGTGCGGTGGCACTATTTTGTCAAAAACAAAGATGTTCAGGTT
TTTATTGTTTATGGTATTTCTCGTCAGTGCTTCTTGCTGGGGACATACCA
AGCTAGATGCATTAAGAGGTGCTGAGAAATTACAAGAAGCTGAAGTCCCT
GTCAAGAAATATCTCAAAGACGTTGATCAAATCCATGTAGGATTTCCTGA
TAAAAAAGATGGAAATGGCGCCGCATGCAAAAATGATTCTGGAGGTCCAT
TGATGTGCAAAAACAAAGAAAAAAAGTGGGTTGTTGAAGGTGCTCTGAAT
TGGGGTAATTGTCAAGATAACAGCGTTTACACACCGGTGGCTAAGTACGT
GGACTGGATAGAGAAAAATATCTAAATTTTGACAGCAGCTCATTGTTTCG
ACCCAGACGAAGTGATGGAGGGCGTGACTATTCCTGTTGGACCTGAGGAT
TTTAAGGTAATCGCTGGTGCGCACGACATTGATAAAGAAGAAAAGGACCA
ACAAGTAATGAAAGTTAAAAAGTTTGCCTTGCACCCAGAATACAATAAAA
ACAATGTCAATTCTCCTGACCTTGCTATAATTGAATTATCGGGAGAATTA
ACATTTAATGAAAGAGTGAATGCAGCTTGTCTACCAAAGAAAGATACTCG
TCCAGATGAAGGAACAAATTGTTATATTCTTGATGCACAAGGTCAATGCG
GAGTGTCAGACAAAGTTCGTCGAAAACGAATTGTTGATGGAAGTGATGCT
ACACCTGGCGCTTGGCCCTGGATTGTCTCCATTAAACGGCATGGCCTTCA
TCAGTGCGGTGGCACTATTTTGTCAAAAACAAAGATGTTCAGGTTTTTAT
TGTTTATGGTATTTCTCGTCAGTGCTTCTT
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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| sc0000097_pilon | genome | sc0000097_pilon:370808..374945 - |
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